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ESCEULA DE CIENCIAS
LABORATORIO PROCESOS BIOLÓGICOS II
GUÍA DE LABORATORIO
PROCESOS BIOLÓGICOS II
PARA MEDICINA VETERINARIA
II SEMESTRE 2023
UNIVERSIDAD VIÑA DEL MAR
ESCEULA DE CIENCIAS
LABORATORIO PROCESOS BIOLÓGICOS II
6. Los estudiantes que lleguen atrasados antes del término del control, podrán ingresar
y rendir el respectivo control de laboratorio (solo se aceptará un atraso en el semestre), los
estudiantes que no tengan su delantal NO PODRÁN INGRESAR AL LABORATORIO, lo cual
implica no rendir el control respectivo siendo calificado con nota 1.0 (uno coma cero).
9. EVALUACIONES:
II SEMESTRE 2023
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METABOLISMO AERÓBICO(B)
06 AL 10 NOVIEMBRE
NRC
BIOLOGÍA MOLECULAR (B)
13 AL 17 NOVIEMBRE
NRC
BIOLOGÍA MOLECULAR (B)
20 AL 24 NOVIEMBRE
NRC
PRUEBA GLOBAL DE LABORATORIO
27 NOVIEMBRE TODOS LOS NRC
II SEMESTRE 2023
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LABORATORIO PROCESOS BIOLÓGICOS II
LABORATORIO N° 1. CUANTIFICACIÓN DE PROTEINAS
I. OBJETIVOS.
1. Preparar una curva de calibrado para la determinación de proteínas en solución.
2. Determinar la concentración de proteínas en una muestra problema aplicando la ley
de Lambert y Beer.
II. QUIZ.
Al iniciar el laboratorio deberá rendir una prueba de entrada (quiz) cuyas preguntas se
basan tanto en el fundamento teórico como en el procedimiento experimental de este
laboratorio.
Las proteínas son macromoléculas que desempeñan un rol básico en la función y estructura
celular. Los análisis de ciertas proteínas y enzimas que circulan en la sangre se emplean
extensamente con propósitos de diagnóstico.
El método de Folin Lowry puede ser aplicado tanto a material seco como a soluciones de
proteínas. Es un método cuantitativo muy sensible, tanto así que se pueden medir muestras
que contengan alrededor de 5µg de proteínas fácilmente. El color formado por el reactivo
de Folin se debe a la reacción de la proteína con el cobre en solución alcalina y la reducción
del Cu+2 a Cu+1 por los residuos de tirosina y triptófano de las proteínas.
II SEMESTRE 2023
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LABORATORIO PROCESOS BIOLÓGICOS II
Tubos (mL)
Reactivos Blanco 1 2 3 4 5 MP
Reactivo Cuproalcalino 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0
Solución BSA (1.0 mg/ml) 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 ---
Tabla Nº1.
B. Medición de Absorbancia.
- Lea las absorbancias de los tubos de la curva de calibrado y muestra problema en
el espectrofotómetro a 650 nm (nanómetros) utilizando para calibrar la muestra blanco.
- Registre los datos de absorbancia en la tabla Nº 2.
C. Registro de datos.
- Calcule las concentraciones de patrón en cada tubo de su curva de calibrado según
la ecuación:
V1 x C1= V2 x C2
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NOMBRE INTEGRANTES:
…………………………………………………………………………………………………………………………………………………….
…………………………………………………………………………………………………………………………………………………….
NRC: ……………
1. Calcule las concentraciones de patrón en cada tubo de su curva de calibrado según la ecuación e
indique la absorbancia obtenida para cada una de ellas: (5 puntos)
V1 x C1= V2 x C2
Pendiente (b):………………….
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LABORATORIO PROCESOS BIOLÓGICOS II
1. ¿Qué unidades tiene el coeficiente de extinción calculado? ¿De dónde las obtiene?
2. ¿Por qué debió calcular las concentraciones de patrón para cada tubo?
4. ¿Por qué los métodos utilizados le permitieron calcular la concentración de la muestra problema?
II SEMESTRE 2023
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LABORATORIO PROCESOS BIOLÓGICOS II
I. OBJETIVOS.
El propósito de esta práctica es evidenciar presencia de proteínas en una muestra
problema.
II. QUIZ.
Al iniciar el laboratorio deberá rendir una prueba de entrada (Quiz) cuyas preguntas se
basan tanto en el fundamento teórico como en el procedimiento experimental de este
laboratorio.
Introducción:
Las proteínas son biomoléculas formadas básicamente por carbono, hidrógeno, oxígeno y
nitrógeno. Pueden además contener azufre y en algunos tipos de proteínas, fósforo, hierro,
magnesio y cobre entre otros elementos.
LOS AMINOÁCIDOS
Los aminoácidos se caracterizan por poseer un grupo carboxilo (-COOH) y un grupo amino
(-NH2).
EL ENLACE PEPTÍDICO
Los péptidos están formados por la unión de aminoácidos mediante un enlace peptídico. Es
un enlace covalente
que se establece entre
el grupo carboxilo de un
aminoácido y el grupo
amino del siguiente,
dando lugar al
desprendimiento de
una molécula de agua.
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II SEMESTRE 2023
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En la conformación beta los aminoácidos no forman una hélice sino una cadena en forma
de zigzag, denominada disposición en lámina plegada.
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1. Especificidad.
La especificidad se refiere a la función; cada una lleva a cabo una determinada función y lo
realiza porque posee una determinada estructura primaria y una conformación espacial
propia; por lo que un cambio en la estructura de la proteína puede significar una pérdida
de la función.
2. Desnaturalización.
Consiste en la pérdida de la estructura terciaria, por romperse los puentes que forman dicha
estructura. Todas las proteínas desnaturalizadas tienen la misma conformación, muy
abierta y con una interacción máxima con el solvente, por lo que una proteína soluble en
agua cuando se desnaturaliza se hace insoluble en agua y precipita.
La desnaturalización se puede producir por cambios de temperatura, variaciones del pH,
etc. En algunos casos, si las condiciones se restablecen, una proteína desnaturalizada puede
volver a su anterior plegamiento o conformación, proceso que se denomina
renaturalización.
MATERIALES
Tubos de ensayo Solución de HCl concentrado
Mechero Solución de CuSO4 al 1%
Vasos de precipitados NaOH al 20%
Gradilla Alcohol etílico
Pipetas Clara de huevo o leche
Solución de albúmina al 1%
Entre las reacciones coloreadas específicas de las proteínas, que sirven por tanto para su
identificación, destaca la reacción del Biuret. Esta reacción la producen los péptidos y las
proteínas, pero no los aminoácidos ya que se debe a la presencia del enlace peptídico CO-
NH que se destruye al liberarse los aminoácidos.
El reactivo del Biuret lleva sulfato de Cobre (II) y NaOH, y el Cu, en un medio fuertemente
alcalino, se coordina con los enlaces peptídicos formando un complejo de color violeta
(Biuret) cuya intensidad de color depende de la concentración de proteínas.
MÉTODO
- Colocar en un tubo de ensayo 3mL de solución de albúmina al 1-2%.
- Añadir 4-5 gotas de solución de CuSO4 al 1%.
- Añadir 3mL de solución de NaOH al 20%.
- Agitar para que se mezcle bien.
- Observar los resultados.
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I. OBJETIVOS.
El propósito de esta práctica es evidenciar presencia de lípidos y carbohidratos en una
muestra problema.
II. QUIZ.
Al iniciar el laboratorio deberá rendir una prueba de entrada (Quiz) cuyas preguntas se
basan tanto en el fundamento teórico como en el procedimiento experimental de este
laboratorio.
Lípidos:
Los lípidos son biomoléculas orgánicas formadas básicamente por carbono, hidrógeno y
oxígeno, este último en porcentajes mucho más bajos. Además, pueden contener fósforo,
nitrógeno y azufre. Es un grupo de sustancias muy heterogéneas que sólo tienen en común
estas dos características: Son insolubles en agua Son solubles en disolventes orgánicos,
como éter, cloroformo, benceno, etc.
Los lípidos se clasifican en dos grupos, atendiendo a que posean en su composición ácidos
grasos (Lípidos saponificables) o no lo posean (Lípidos insaponificables).
A. Lípidos saponificables
1. Simples
Acilglicéridos
Céridos
2. Complejos
Fosfolípidos
Glucolípidos
B. Lípidos insaponificables
1. Terpenos
2. Esteroides
3. Prostaglandinas
ÁCIDOS GRASOS.
Los ácidos grasos son moléculas formadas por una larga cadena hidrocarbonada de tipo
lineal, y con un número par de átomos de carbono. Tienen en un extremo de la cadena un
grupo carboxilo (-COOH).
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• Solubilidad. Los ácidos grasos poseen una zona hidrofílica, y una zona lipofílica. Por
eso las moléculas de los ácidos grasos son anfipáticas, pues, por una parte, la cadena
alifática es apolar y por tanto, soluble en disolventes orgánicos (lipofílica), y por otra, el
grupo carboxilo es polar y soluble en agua (hidrofílica).
• Químicamente, los ácidos grasos son capaces de formar enlaces éster con los grupos
alcohol de otras moléculas. Cuando estos enlaces se hidrolizan con una base como el NaOH,
se rompen y se obtienen las sales de los ácidos grasos correspondientes, denominados
jabones, mediante un proceso denominado saponificación.
SAPONIFICACIÓN.
Las grasas reaccionan en caliente con el hidróxido de sodio NaOH descomponiéndose en:
glicerina y ácidos grasos. Éstos se combinan con los iones sodio o potasio del hidróxido para
dar jabones, que son en consecuencia las sales sódicas o potásicas de los ácidos grasos. En
los seres vivos, la hidrólisis de los triglicéridos se realiza mediante la acción de enzimas
específicos (lipasas) que dan lugar a la formación de ácidos grasos y glicerina.
MÉTODO
- Colocar en un tubo de ensayo 2mL de aceite y 2mL de NaOH al 20%.
- Agitar enérgicamente y colocar el tubo al baño María de 20 a 30 minutos.
- Pasado este tiempo, se pueden observar en el tubo 3 fases: una inferior clara que
contiene la solución de NaOH sobrante junto con la glicerina formada, otra
intermedia semisólida que es el jabón formado y una superior lipídica de aceite
inalterado.
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CARBOHIDRATOS.
Los carbohidratos (azúcares) son compuestos orgánicos que contienen carbono, hidrógeno
y oxígeno en relación 1:2:1. Los carbohidratos biológicamente más importantes son los que
contienen 4, 5, 6 y 7 átomos de carbono (designados como C4, C5, C6 y C7).
Las pentosas son azúcares de 5 carbonos (C5) que forman el esqueleto de los ácidos
nucleicos.
A su vez, las hexosas, azúcares de 6 carbonos (C6) son los monómeros de los polímeros de
la pared celular y de las reservas de energía.
ACTIVIDAD N°3.
MÉTODO
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LABORATORIO N° 4.
I. OBJETIVOS.
El propósito de esta práctica es determinar el efecto del pH y la temperatura sobre la
reacción catalizada por la enzima Fosfatasa, y determinar su naturaleza ácida o básica.
II. QUIZ.
Al iniciar el laboratorio deberá rendir una prueba de entrada (Quiz) cuyas preguntas se
basan tanto en el fundamento teórico como en el procedimiento experimental de este
laboratorio.
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LABORATORIO PROCESOS BIOLÓGICOS II
PNFP → PNF + P
REACTIVOS 1 2 3 Blanco
p- nitrofenilfosfato de Na 0.02 M 0.4 0.4 0.4 0.4
Tampón pH= 3 2.0 - - -
Tampón pH= 6 - 2.0 - -
Tampón pH= 10 - - 2.0 -
Agua destilada 1.6 1.6 1.6 3.6
- Mezcle bien cada tubo y agregue 10µL de enzima a cada uno de ellos, excepto al
tubo Blanco.
- Mezcle bien y coloque los tubos en baño de agua a 38°C durante 10 minutos.
- Al finalizar la incubación, agregue 3ml de solución de Na2CO3 1,0M a todos los tubos.
- Déjelos enfriar y lea la absorbancia a 420nm, usando para calibrar el tubo blanco.
Mezcle bien cada tubo y agregue 10µl de enzima a cada uno de ellos.
- Mezcle bien y coloque los tubos a la temperatura de incubación correspondiente
por 10 minutos.
- Al finalizar la incubación, agregue 3mL de solución de Na2 CO3 1,0M a todos los
tubos.
- Déjelos enfriar y lea la absorbancia a 420nm, usando para calibrar el tubo blanco
del experimento anterior.
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Absorbancia [p-
TUBO Tiempo V0 Tº
p-nitrofenol nitrofenol]
1
2
3
Absorbancia [p-
TUBO Tiempo V0 pH
p-nitrofenol nitrofenol]
1
2
3
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LABORATORIO PROCESOS BIOLÓGICOS II
REPORTE DE LABORATORIO 4
EFECTO PH Y TEMPERATURA EN LA VELOCIDAD ENZIMATICA
1
2
3
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1
2
3
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LABORATORIO N° 5
METABOLISMO AEROBICO
I. OBJETIVOS.
El propósito de esta práctica es identificar la actividad de algunas enzimas específicas
presentes en el tejido animal como la Citocromo oxidasa y la Succínico deshidrogenasa,
mediante el uso de aceptores electrónicos coloreados e identificar el efecto inhibitorio de
algunas sustancias sobre este sistema enzimático.
II. QUIZ.
Al iniciar el laboratorio deberá rendir una prueba de entrada (Quiz) cuyas preguntas se
basan tanto en el fundamento teórico como en el procedimiento experimental de este
laboratorio.
IV. PROCEDIMIENTO.
- Mezcle bien el contenido de cada tubo e incube a 37ºC hasta cuando aparezca el
complejo coloreado.
- Anote y comente los resultados obtenidos en cada tubo.
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- Antes de agregar el extracto enzimático, deje los tubos incubando a 37ºC durante
10 minutos, y sin retirarlos del baño agregue el extracto enzimático, inmediatamente agite
bien y coloque el aceite mineral.
- Espere a que los tubos se decoloren.
- Comente los resultados obtenidos en cada tubo.
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I. RESPONDA:
Justificación del
color
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4. ¿Cuál es la función de la parafenildiamina? (1pto.).
Justificación
del color
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LABORATORIO N° 6
I. OBJETIVOS.
II. QUIZ.
Al finalizar el laboratorio deberá rendir una prueba (quiz) cuyas preguntas se basan tanto
en el fundamento teórico como en el procedimiento experimental de este laboratorio.
III. INTRODUCCION.
Sin lugar a dudas, los usos potenciales de la genética molecular en el campo de la ganadería
y agricultura, van mucho más allá de la producción de animales portadores de genes
exógenos, con relativa o mucha importancia comercial. La caracterización de genes que
codifican caracteres cuantitativos con importancia económica o de genes causantes de
enfermedades congénitas ha llegado a tener tanta o más importancia que la generación de
animales transgénicos.
Enfermedades infecciosas o parasitarias han arrasado más de una vez con la población
mundial, matando o debilitando a miles de habitantes. Por su parte las enfermedades
genéticas, aunque menos diseminadas, producen un resultado similar, afectando
poblaciones humanas y animales.
Estos hechos han convertido a las técnicas de genética molecular en herramientas
fundamentales para la detección de estas enfermedades no sólo en la especie humana, sino
que ahora han ingresado al mundo de la veterinaria.
FUNDAMENTO TEORICO.
REACCIÓN EN CADENA DE LA POLIMERASA.
PCR son las siglas en inglés de Polymerase Chain Reaction o Reacción en
Cadena de la Polimerasa. PCR es una técnica enzimática que permite la amplificación de
ácidos nucleicos (DNA o RNA), millones de veces. Esta técnica simula el proceso de
replicación que ocurre naturalmente en las células a la hora de sintetizar células hijas. Esto
hace que el PCR sea una técnica muy poderosa en amplios campos de la biología, las
ciencias, la medicina forense, la biotecnología, etc. La técnica de PCR fue desarrollada por
el Doctor Kary Mullis, que le valió el premio Nobel de Química en 1993.
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Habitualmente, los resultados de una reacción de PCR se visualizan (se hacen visibles) al
usar electroforesis en gel.
COMPONENTES DE LA PCR.
o El DNA a partir del cual queremos obtener una copia de un fragmento, puede
provenir de la extracción de varias fuentes biológicas o tejidos. El DNA o gen a
amplificar se define como “target” (diana). Este DNA se conoce como DNA molde.
o Una enzima capaz de generar una copia de DNA a partir del DNA molde: una DNA
polimerasa. (La DNA polimerasa que normalmente se utiliza en la PCR se llama Taq polimerasa,
por la bacteria tolerante al calor de la que se aisló, Thermus aquaticus).
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2. Hibridación o “annealing” (55- 65°C°): la reacción se enfría para que los cebadores
puedan unirse a sus secuencias complementarias en el molde de ADN de cadena
sencilla.
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Curva de
Denaturación inicial Ciclos sucesivos de PCR Extensión final
Para asegurarnos que la amplificación está operando sobre lo que debemos investigar, es
que se utilizan controles de la reacción de PCR, tal como se muestra en siguiente cuadro:
ELECTROFORESIS.
La electroforesis es una técnica analítica de separación de moléculas cargadas
eléctricamente debido a la diferente movilidad que presentan cuando son sometidas a un
campo eléctrico (el sufijo foresis significa "migración" o "movimiento", el prefijo electro nos
dice que estamos utilizando electricidad para hacer que las moléculas migren). Es un
método en biología molecular para analizar y separar fragmentos de ADN (u otras
macromoléculas, como ARN y proteínas) por su tamaño y carga. Las proteínas pueden tener
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carga neta positiva o negativa, los ácidos nucleicos tienen carga neta negativa debido a sus
grupos fosfato, de forma que la carga del ácido nucleico está condicionada por el número
de grupos fosfato.
Durante la electroforesis, el movimiento de las moléculas cargadas se hace a través de una
matriz porosa (o gel), que está inmersa en un medio acuoso. Bajo el campo eléctrico
aplicado, las diferentes moléculas de la muestra se mueven a través de la matriz a diferentes
velocidades, de forma que al final de la electroforesis las distintas moléculas se pueden
diferenciar como bandas separadas a distintas posiciones en la matriz. Dichas bandas se
detectan mediante tinción o autorradiografía, o pueden transferirse a una superficie
membranosa.
De los tipos de electroforesis existentes, la electroforesis en gel de
agarosa es el método más común y más utilizado.
La Estructura de la Agarosa.
En el caso de los geles de agarosa, se le añade bromuro de etidio, sustancia que se intercala
entre las bases del DNA y es fluorescente cuando se ilumina con luz ultravioleta. Tras la
electroforesis, se visualiza el gel con una lámpara de luz UV, y se verán las bandas
correspondientes a las muestras de DNA aplicado y los marcadores de peso molecular.
Además, se cargará un marcador de peso molecular (fragmentos de DNA de tamaño
conocido). Estos marcadores nos van a informar que tamaño y que concentración tiene una
banda determinada. se puede calcular el tamaño aproximado del DNA en estudio.
Cuando el ADN se deposita en los pozos del gel debe mezclarse con un buffer de carga
(Tabla loading buffer) este permite:
1) aumentar la densidad de la muestra para depositarse en el fondo del pozo
2) teñir la muestra para facilitar su carga dentro del gel
3) identificar la distancia recorrida por las muestras:
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• Forma o conformación del ADN. El ADN súper-enrollado migra más rápido que el
ADN lineal.
• Concentración de agarosa. Al disminuir la concentración de agarosa, los poros del
gel son más grandes y las moléculas migrarán con mayor velocidad.
• Voltaje aplicado. Con voltajes bajos, la velocidad de migración de los fragmentos
de ADN es proporcional al voltaje aplicado.
• Buffer de electroforesis. La movilidad electroforética del ADN es influenciada por
la composición y la fuerza iónica del buffer de electroforesis. En ausencia de iones
(agua desionizada) la conductividad eléctrica es mínima y el ADN migra lentamente.
En un buffer con una fuerza iónica demasiado alta, la conductividad eléctrica es muy
buena, aún con voltajes moderados y se generan grandes cantidades de calor, lo que
podría fundir el gel y desnaturalizar el ADN.
PROCEDIMIENTO.
Equipo:
✓ Cámara horizontal de electroforesis con los accesorios correspondientes (molde
para hacer el gel, peine, cables para conectar a la fuente de alimentación).
✓ Fuente de alimentación o de poder.
✓ Transiluminador (fuente de luz ultravioleta).
✓ Equipo fotográfico que permita tomar fotos del gel.
✓ Muestras de ADN de diferentes tamaños y formas, a concentraciones conocidas.
Preparación del molde. Tomar el molde para hacer los geles y cerrar los extremos con los
topes para que no se salga la agarosa. Después colocar el peine para formar los pocillos
(descripción del proceso disponible en videos), y montar en soporte según imagen.
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I. PREGUNTAS DE DESARROLLO.
1. ¿En base a qué la electroforesis de agarosa separa moléculas?
EJERCICIO.
En una institución de protección de fauna silvestre han recuperado del cautiverio varias
aves de la familia de las psitácidas o Psittacidae (llamadas comúnmente loros o papagayos,
que incluye a los guacamayos, las cotorras y formas afines de América y África). Para el proceso
de identificación, recuperación y reproducción de las aves, el personal del centro necesita
saber el sexo de estas, sin embargo, no es posible hacerlo fenotípicamente porque esta
especie no presenta dimorfismo sexual (definido como las variaciones en la fisonomía externa,
como forma, coloración o tamaño, entre machos y hembras de una misma especie). Para identificar
el sexo se toma muestra de ADN a partir de la sangre o plumas, de 14 aves y se amplifica
por PCR el gen CHD (El gen CHD encontrado en aves, por ser altamente conservado y además estar
ubicado en cromosomas sexuales es un blanco casi universal para la identificación de sexo en aves).
Los genes CHD alteran la expresión génica posiblemente mediante la modificación de la
estructura de la cromatina, con lo que altera el acceso de la maquinaria transcripcional a
los genes diana.
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Se sabe que los machos tienen cromosomas ZZ (homocigóticos) y las hembras cromosomas
ZW (heterocigóticos), características que generan diferencias en los fragmentos
amplificados del gen CHD pues se conoce que el fragmento derivado del cromosoma W
siempre es más grande que el Z. Así, en los machos se obtiene una sola banda de ADN
amplificado luego de una PCR y en las hembras dos bandas de diferente tamaño
(correspondientes a los fragmentos derivados de Z y W, respectivamente). En la figura se
ilustra el resultado de la PCR:
Electroforesis en agarosa de la amplificación por PCR del gen CHD-W Y CHD-Z que permite sexar aves.
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