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Ricardo Felm er D .
Bioquím ico, Ph.D .
Genómica en calidad de carne bovina
Escrito en el ADN
Mérito Genético
Genómica en calidad de carne bovina
Mejoramiento genético animal (MGA).
Consiste en aplicar principios biológicos, económicos y matemáticos, con el fin de aumentar
la frecuencia de aquellos genes relacionados con caracteres que consideramos importantes
en una población de animales para maximizar su mérito genético.
Difusión
El MGA involucra procesos de •Inseminación Artificial.
evaluación genética y difusión del •Ovulación múltiple y transferencia
material genético seleccionado. embrionaria (OMTE).
Evaluación •Fertilización in vitro.
•Evaluación genética individual •Clonación.
•Evaluación de la performance
propia, crías y pedigree (DEPs).
•Evaluación molecular.
Genómica en calidad de carne bovina
Abuelo
Paterno
Padre
Abuela
Paterna
ANIMAL DESCENDENCIA
Abuelo
Materno
Madre
Abuela
Materna
Evaluaciones de productividad:
Producción de leche.
Pruebas de progenie.
•Gran nº de animales.
•Seleccionar reproductores.
•Hacer los apareamientos de prueba.
•Esperar a que las crías nazcan y crezcan.
•Enviarlas al matadero para su evaluación.
$
Genómica en calidad de carne bovina
Mejoramiento genético animal (MGA).
•Biología molecular.
•Genómica. Cambio en los objetivos de
Mejoramiento:
•Mejores Instrumentos
de medición etc. •Características de la carne como el
área de músculo en diversos cortes.
•La dureza o terneza de la carne.
•Contenido de grasa de la carne.
•Tipo de ácidos grasos de la carne etc.
Genómica en calidad de carne bovina
Marcadores Moleculares
(MM)
“Valor Mejorante”
(Breeding Value)
Genómica en calidad de carne bovina
Rasgos cualitativos simples
Genotipo = Fenotipo
Género (XY = macho,
XX = hembra).
Normal
Activo Inactivo
knockout
Genómica en calidad de carne bovina
Rasgos cualitativos simples
Ejemplos de mutantes naturales del gen GDF-8 (Miostatina inactivada naturalmente).
Raza Piedmontesa
Raza Ternera Asturiana
•Generalmente primero se
identifica el QTL y luego el gen o
los genes responsables.
Genómica en calidad de carne bovina
Rasgos cuantitativos complejos
2º Identificación de distintos alelos de ese gen (o QTL).
Generalmente el cambio
de nucleótidos provoca
POLIMORFISMO un cambio de aminoácido
a nivel de la proteína
ocasionando diferencias
en el fenotipo.
ANIMAL 1 Alelo B
Fenotipo B
Gen Proteína Fenotipo
Genómica en calidad de carne bovina
Rasgos cuantitativos complejos
•Identificar los diferentes alelos del gen y seguirlo en la descendencia.
2 Estrategias DIRECTAMENTE
POLIMORFISMO
Rojo
Genómica en calidad de carne bovina
Rasgos cuantitativos complejos
•Identificar los diferentes alelos del gen y seguirlo en la descendencia.
2 Estrategias DIRECTAMENTE
SNP (Single nucleotide polymorphism)
Alelo A o polimorfismo de un solo nucleótido.
AA AA AA Aa aa aa aa
PCR-RFLP
POLIMORFISMO
Alelo a
Genómica en calidad de carne bovina
Rasgos cuantitativos complejos
•Identificar los diferentes alelos del gen y seguirlo en la descendencia.
2 Estrategias DIRECTAMENTE
“GAS”
SELECCION ASISTIDA POR EL
GEN
Genómica en calidad de carne bovina
Rasgos cuantitativos complejos
•Identificar los diferentes alelos del gen y seguirlo en la descendencia.
2“EsEstrategias DIRECTAMENTE
un sitio de referencia en el ADN que puede caracterizarse en el
laboratorio y que da información sobre la constitución genética del
Identificando el polimorfismo del gen
animal antes de tener información productiva
responsable del
del mismo”.
cambio fenotípico.
INDIRECTAMENTE
Identificando un polimorfismo
cercano al gen de interés Microsatélites
12 repeticiones CA
CACACACACACACACACACACACA
POLIMORFISMO: nº de repeticiones CA
CACACACACACACACA
8 repeticiones CA
Alelo Alelo CA CA CA CA CA CA CA
CA CA CA CA CA CA CA CA CA CA CA CA CA CA CA CA CA
Paterno GT GT GT GT GT GT GT GT GT GT GT GT GT GT GT GT GT Paterno GT GT GT GT GT GT GT
17 Repeticiones 7 Repeticiones
Alelo CA CA CA Alelo CA CA CA CA CA CA CA CA CA CA CA
Materno GT GT GT GT GT GT GT GT GT GT GT GT GT GT
Materno
3 Repeticiones 11 Repeticiones
Padre Madre
17 7
3 11
17 17 3 3
11 7 7 11
Padre Hijo Hija Hija Hijo Madre
17 17
16 16
15 15
14 14
13 13
12 12
11 11
10 10
9 9
8 8
7 7
6 6
5 5
4 4
3 3
2 2
1 1
Genómica en calidad de carne bovina
Rasgos cuantitativos complejos
•Identificar los diferentes alelos del gen y seguirlo en la descendencia.
2 Estrategias DIRECTAMENTE
“GAS”
SELECCION ASISTIDA POR EL
GEN
“MAS”
SELECCION ASISTIDA POR
MARCADORES
Genómica en calidad de carne bovina
Rasgos cuantitativos complejos
Marcadores genéticos más usados actualmente en genética molecular.
Microsatélites
Microsatélites SNP
•Sabor (“Flavor”).
Terneza
Terneza:: Es el grado de resistencia al corte de la carne.
carne.
AMBIENTALES:
Sexo
Edad
Sistema de engorda.
Manejo pre y postfaena.
Genómica en calidad de carne bovina
Terneza
Terneza::
•La terneza de la carne ocurre por la degradación de proteínas estructurales del músculo por
acción de enzimas (proteasas), proceso llamado proteólisis.
•La enzima responsable del proceso de la proteólisis se llama Calpaína.
2 Calpaínas (µ-Calpaína y m-Calpaína) las cuales dependen del Ca2+ para su activación.
•La Calpaína degrada las proteínas de la fibra muscular
una vez que muere el animal, y eso es lo que ablanda la
carne.
•Hay animales con mayor expresión de la Calpaína que
otros, y por eso hay diferencias en la terneza.
Page et al., 2002, Page et al., 2004, Casas et al., 2005, White et al., 2005.
Genómica en calidad de carne bovina
Técnica: PCR-
PCR-RFLP (PCR
(PCR--Restriction Fragment Length Polymorphism)
Análisis del SNP 316 del gen CAPN1 (AF252504, Page et al., 2002)
Genotipo CC
Genotipo GG
Datos Fenotípicos:
RC = Resistencia al Corte (1d y 7d de maduración)
Medias y errores estándar de los genotipos del SNP 316 de CAPN1 en novillos.
GENOTIPO n % RC ± EE1
Monitoreo de la Tº
Insertar una aguja de durante la cocción
medición de Tº justo en (cocinar la carne
el centro del bistec. hasta los 40ºC, girar
y cocinar hasta los
70ºC).
Preparación de corte
Posicionamiento en el Grill para Medición
6,00 5,90 CG
5,63 5,52 GG
5,50
5,00
4,50 4,45 4,46
4,00
1 7 14
Días Postm ortem
Genómica en calidad de carne bovina
Subcutánea
GRASA Intermuscular
Intramuscular (Marbling)
A > marmoreo mejor calidad ya que tendrá mejor sabor y será más jugosa.
Moderadamente
Leve abundante “Prime”
Wagyu-Japonés
Genómica en calidad de carne bovina
Marmoreo:
Marmoreo:
¿Por qué es importante el Marmoreo?
40% 60%
ATCTTTCTTC
CTGTGTAGT
Alelo Materno
Materno Simplificado= C
TAGAAAGAAG
GACACATCA
Genotipo CC Genotipo TT
Genotipos para Leptina
St CT CC CC CT TT CT CT TT TT CT CC CC CC TT
Fenotipo Fenotipo
Genómica en calidad de carne bovina
•Las ondas penetran en los tejidos y son devueltas como ecos, los
cuales son captados por el mismo cristal, y transformados en una
pantalla como puntos de brillo.
Brete o Manga
Genómica en calidad de carne bovina
Aplicación del Ultrasonido en el mejoramiento genético.
genético.
Medidas tomadas por ultrasonido en los animales:
•Área del Ojo del Lomo (AOL)
•El AOL es el área de la sección transversal del músculo Longissimus Dorsi (LD) o músculo Dorsal
largo, a nivel del espacio intercostal entre la 12 y 13a costilla.
•La importancia de su estimación radica en que tiene una alta correlación genética positiva (0,5) con
el grado de musculatura de la carcasa.
•Se mide en cm2.
•Valores en novillos de 18 meses promedian 42cm2, rango 25- 100 cm2 dependiendo de la raza, sexo,
manejo alimenticio y otras condiciones ambientales.
Genómica en calidad de carne bovina
Aplicación del Ultrasonido en el mejoramiento genético.
genético.
?
Ultrasonido
•La GS es la profundidad del tejido graso y se mide sobre el AOL, a nivel del espacio intercostal entre la 12 y
13°costilla. Se mide a 3/4 de la longitud del AOL desde la espina dorsal.
•La GS es el indicador más exacto en la predicción de la composición de la canal, del porcentaje de algunos cortes y
del porcentaje de desgrasado; donde a un mismo peso del animal, a mayor GS menor rendimiento carnicero.
•Tiene una baja correlación genética (0,1) con el % de Grasa intramuscular y una alta correlación genética
negativa (-0,52) con el porcentaje de cortes minoristas.
•Los valores son expresados en mm, y para nuestras condiciones pastoriles estos varían entre 0 y 6 mm, con un
promedio de 3.3 mm. En animales de exposición algunos están sobre engrasados con valores de hasta 20mm de GS.
Genómica en calidad de carne bovina
Aplicación del Ultrasonido en el mejoramiento genético.
genético.
Medidas tomadas por ultrasonido en los animales:
• Marmoreo o Grasa Intramuscular
•El Marmoreo se refiere a la grasa que se encuentra dispersa entre las fibras musculares. Las imágenes
para estimar el porcentaje de grasa intramuscular son tomadas longitudinalmente (en forma // al animal)
a través de la 11-13ª costilla.
• La importancia de esta medida está en que es considerada como determinante de la palatabilidad de
la carne, dado a que imparte sabor, jugosidad y terneza a la carne.
•La raza, el sexo y el tipo de alimentación tienen un gran impacto en el marmoreo.
•Tiene baja correlación genética (0,10) con el espesor de grasa dorsal.
Genómica en calidad de carne bovina
Aplicación del Ultrasonido en el mejoramiento genético.
genético.
Medidas tomadas por ultrasonido en los animales:
• Marmoreo o Grasa Intramuscular
•El espesor de grasa subcutánea se mide en una imagen tomada desde la punta de la
cadera hacia la región caudal.
•Se mide en mm.
•Tiene correlación positiva con GS.
Genómica en calidad de carne bovina
Panel de marcadores
Selección genómica
Genómica en calidad de carne bovina
Evolución de la tecnología genómica:
genómica:
Pedigree tradicional
Padre
Madre del Padre
Padre de la Madre
Madre
Madre de la Madre
Genómica en calidad de carne bovina
Evolución de la tecnología genómica:
genómica:
Pedigree Genómico