Pseudogenes

¿Qué son?
Un pseudogén es una secuencia de ADN que se asemeja a un gen activo, pero a través del
curso de la historia evolutiva ha sido inactivado. Un pseudogén, entonces comparte algunas
secuencias de ADN con un gen activo. Pero debido a que ha mutado, es generalmente
inactivo y realmente no hace mucho, excepto estar allí y nos proporciona información sobre
la historia evolutiva de la familia de genes o del organismo.
Historia
Antes se pensaba que las regiones no codificantes del genoma humano en general no eran
funcionales y eran "basura", o ADN sin propósito. Hoy en día, los científicos admiten que
la terminología del ADN basura está lejos de ser cierta, ya que estudios recientes indican
que tienen algunas funciones reguladoras. El primer pseudogen se informó para el ADN 5S
de Xenopus laevis , que codifica para el ARN 5S de tipo ovocito, en 1977, y se informaron
y describieron varios pseudogenes para una variedad de especies, incluidas plantas, insectos
y bacterias. Actualmente, se estiman aproximadamente veinte mil pseudogenes, lo que es
comparable al número de genes que codifican proteínas (alrededor de 27000) en humanos.

Funciones
Estudios recientes apoyan la idea de que los pseudogenes actúan como elementos
regulatorios en el genoma, modificando a sus “primos” que codifican para proteínas.
Además, varios pseudogenes pueden llegar a transcribirse en ARN, y algunos muestran un
patrón de activación específico de cada tejido. El transcrito del pseudogen puede ser
procesado en pequeños ARN de interferencia que regulan a las secuencias codificantes vía
ARNi. Un descubrimiento notable fue encontrar que los pseudogenes son capaces de
regular a los supresores de tumores y ciertos oncogenes, por medio de la activación de
microARN específicos. En este hallazgo valioso se pudo notar que los pseudogenes a
menudo pierden su regulación durante la progresión del cáncer.

3
Tipos de pseudogenes
Se pueden clasificar en dos formas: sin procesar (estos se subcategorizan en unitarios y
duplicados) y procesados.
Los pseudogenes se producen por el deterioro de genes que se originaron por duplicación
en el curso de la evolución. Estos “deterioros” ocurren por distintos procesos, ya sea
mutaciones puntuales, inserciones, deleciones o cambios en el marco abierto de lectura. La
pérdida de la productividad o de la expresión debido a los eventos antes mencionados se
traduce en la producción de pseudogen no procesado. Los del tipo unitario son una sola
copia de un gen parental que pasa a ser no funcional. Los pseudogenes no procesados y los
duplicados mantienen la estructura de un gen, con los intrones y los exones. En contraste,
los pseudogenes procesados se originan por eventos de retrotransposición. La
retrotransposición ocurre por la reintegración de un ADNc (ADN complementario, el cual
es una copia reversa de un transcrito de ARN mensajero) en cierta zona del genoma. La
secuencia de doble cadena del pseudogen procesado se generan por un ARN simple cadena
generado por la ARN polimerasa II.

Conservación de mutaciones
Varios pseudogenes tienen ciertas mutaciones conservadas en diferentes especies. Se
exploró la conservación de pseudogenes en humanos, chimpancés, ratones, ratas, perros y
vacas. Los pseudogenes de diferentes especies tienen mutaciones puntuales e incluso tipos
específicos de mutaciones en ciertas ubicaciones de genes. Se cree que las mutaciones
compartidas en diferentes organismos dependen de la ascendencia común o la ascendencia
evolutiva.
El lugar de inserción de un pseudogen determina su evolución. Se seleccionarán las
inserciones perjudiciales y se perderá el pseudogen; sin embargo, los pseudogenes con otras
mutaciones no perjudiciales persisten y evolucionan con el tiempo. Los pseudogenes
procesados evolucionan más rápidamente que sus parálogos funcionales y experimentan
una deriva genética con mutaciones, deleciones e inserciones aleatorias. Los pseudogenes
establecidos pueden pasar a la siguiente generación y pueden duplicarse parcialmente para
dar un segundo pseudogen. Por lo tanto, los pseudogenes proporcionan una poderosa
herramienta para los estudios filogenéticos para investigar la evolución del genoma.

Perspectiva evolutiva
Los genomas de los organismos también evolucionan y los genes tienen la propiedad de
cambiar y originarse de novo. Distintos mecanismos median estos procesos, entre ellos está
la duplicación génica, fusión y fisión génica, transferencia lateral de genes, etc. Una vez
que se origina un gen, este representa un punto de partida para que las fuerzas evolutivas
puedan actuar. La duplicación génica origina una copia donde, generalmente, el gen
original retiene su función y la copia – que no está bajo la presión selectiva de mantener
dicha función inicial – puede mutar libremente y cambiar de función. Alternativamente, el
nuevo gen puede mutar de tal forma que termine siendo un pseudogen y pierda su función.