Universidad San Francisco de Quito

Name: Mishell Montenegro T.

Code: 212473
DEBER BLAST

De las 6 secuencias dadas:

1) ¿Averiguar de que son esas secuencias? Planta, hongos, animales, etc.
2) ¿Averiguar cuál es el posible gen de cada secuencia?
3) ¿Qué función puede tener el gen descrito?
 

Secuencia 1

1 ACACAACACA TACATCTATA CATTGAAAAC AAAATAGTAA TAATCATCAT
 51 GGCTAAGTTT GCTTCCATCA TCACCCTTAT CTTCGCTGCT CTTGTTCTCT
101 TTGCTGCTTT CGGTGAGTAA TAATGTTCTT ATTGGAAATG TGTTTAAATG
151 TAATTTTAGT TTATTTGATA ATTATTCTTG ACTGATGTAT GCATATATAT
201 GCAGACGCAC CGGCAATGGT GGAAGCACAG AAGTTGTGCG AGAAGCCAAG
251 TGGGACATGG TCAGGGGTTT GCGGAAACAG TAATGCATGC AAGAATCAGT
301 GCATTAACCT TGAAGGAGCC AAACATGGAT CATGCAACTA TGTCTTCCCA
351 GCACACAAGT GTATCTGTTA CGTCCCATGT TAAATCTACC AATAATCTTT
401 GGTGCTAAAT CGTGTGTATT TTACATAAAA TAAGTCTCTG TCACTCTATG
451 AGTAACTTTA TGACATGCAT ATTTCTGTTT TAATGTTTAT TTTCCCGTTG
501 TTGTTACAAT AATATAAAAA TAATTTATGT

1) Planta
2) El posible gen es PDF1.2, su locus tag es AT5G44420.
3) Su función es ser un gen de defensa. Codifica una defensina vegetal sensible al
etileno y al jasmonato

Secuencia 2

AGACACAGTACTAGAAAAGAATGTAACAGTAACACACTCTGTTAACATTCTAGAAGACAATTTGCCCAAACC
AAAGCTTAGTTTCCCTTCTTGGTGATCAAAGGGAATCTGAGAATATTGCTAATCCCATGCAGACGCACCGGC
AATGGTGGAAGCACAGAAGTTGTGCGAGAAGCCAAGGGCATCGGGGTGAAGGATGAGTACGCGTTAACCACC
CGCACAGGACCCAGCCATGTCAAGCTGGGCGACTATGTCTTCCCAGCTCACAAGTGTATCTGTTATTTCCCT
TGTTAATTCCATAAACTCTTCG

1) Animal (bonobo, chimpancé pigmeo)

2) NFKBIZ
 3) Forma la proteína NFKB inhibidor zeta. Grupo de proteínas que ayudan a
controlar muchas funciones en la célula, como el crecimiento y la supervivencia.
Estas proteínas también controlan las respuestas inmunitarias e inflamatorias.

Secuencia 3

ATGGGGGTTGGCAGGCAGCAGAGAGGCCCCTTTCAAGGTGTTCGGGTAAAGAACTCAGTGAAGGAACTCC
TGTTGCACATCCGAAGTCATAAACAGAAGGCTTCTGGCCAAGCTGTGGATGATTTTAAGACACAAGGTGT
GAACATAGAACAGTTCAGAGAATTGAAGAACACAGTATCATACAGTGGGAAAAGGAAAGGGCCCGATTCG
TTGTCTGATGGACCTGCTTGCAAAAGGCCAGCTCTGTTGCATTCCCAATTTTTGACACCACCTCAAACAC
CAACGCCCGGGGAGAGCATGGAAGATGTTCATCTCAATGAACCCAAACAGGAGAGCAGTGCTGATCTGCT
TCAGAACATTATCAACATTAAGAATGAATGCAGCCCCGTTTCCCTGAACACAGTTCAAGTTAGCTGGCTG
AACCCCGTGGTGGTCCCTCAGAGCTCCCCCGCAGAGCAGTGTCAGGACTTCCATGGAGGGCAGGTCTTTT
CTCCACCTCAGAAATGCCAACCATTCCAAGTCAGGGGCTCCCAACAAATGATAGACCAGGCTTCCCTGTA
CCAGTATTCTCCACAGAACCAGCATGTAGAGCAGCAGCCACACTACACCCACAAACCAACTCTGGAATAC
AGTCCTTTTCCCATACCTCCCCAGTCCCCCGCTTATGAACCAAACCTCTTTGATGGTCCAGAATCACAGT
TTTGCCCAAACCAAAGCTTAGTTTCCCTTCTTGGTGATCAAAGGGAATCTGAGAATATTGCTAATCCCAT
GCAGACTTCCTCCAGTGTTCAGCAGCAAAATGATGCTCACTTGCACAGCTTCAGCATGATGCCCAGCAGC
GCCTGTGAGGCCATGGTGGGGCACGAGATGGCCTCTGACTCTTCAAACACTTCACTGCCATTCTCAAACA
TGGGAAATCCAATGAACACCACACAGTTAGGGAAATCACTTTTTCAGTGGCAGGTGGAGCAGGAAGAAAG
CAAATTGGCAAATATTTCCCAAGACCAGTTTCTTTCAAAGGATGCAGATGGTGACACGTTCCTTCATATT
GCTGTTGCCCAAGGGAGAAGGGCACTTTCCTATGTTCTTGCAAGAAAGATGAATGCACTTCACATGCTGG
ATATTAAAGAGCACAATGGACAGAGTGCCTTTCAGGTGGCAGTGGCTGCCAATCAGCATCTCATTGTGCA
GGATCTGGTGAACATCGGGGCACAGGTGAACACCACAGACTGCTGGGGAAGAACACCTCTGCATGTGTGT
GCTGAGAAGGGCCACTCCCAGGTGCTTCAGGCGATTCAGAAGGGAGCAGTGGGAAGTAATCAGTTTGTGG
ATCTTGAGGCAACTAACTATGATGGCCTGACTCCCCTTCACTGTGCAGTCATAGCCCACAATGCTGTGGT
CCATGAACTCCAGAGAAATCAACAGCCTCATTCACCTGAAGTTCAGGAGCTTTTACTGAAGAATAAGAGT
CTGGTTGATACCATTAAGTGCCTAATTCAAATGGGAGCAGCGGTGGAAGCGAAGGATCGCAAAAGTGGCC
GCACAGCCCTGCATTTGGCAGCTGAAGAAGCAAATCTGGAACTCATTCGCCTCTTTTTGGAGCTGCCCAG
TTGCCTGTCTTTTGTGAATGCAAAGGCTTACAATGGCAACACTGCCCTCCATGTTGCTGCCAGCTTGCAG
TATCGGTTGACACAATTAGATGCTGTCCGCCTGTTGATGAGGAAGGGAGCAGACCCAAGTACTCGGAACT
TGGAGAACGAACAGCCAGTGCATTTGGTTCCCGATGGCCCTGTGGGAGAACAGATCCGACGTATCCTGAA
GGGAAAGTCCATTCAGCAGAGAGCTCCACCGTATTAG

1) Humano
2) NFKBIZ
3) Papel en las respuestas inflamatorias al LPS por su interacción con las proteínas
NF-B 

Secuencia 4

ATGCCGGGTTCCCGACGCGTCCGTCCGCGCCTAAGGGCGCTGCTGCTGCTACCGCCGCTGCTGCTGCTCC
GAAGCGGCCACGCGAGCGACCTGACCGTGGCCGTGGTGCTGCCGCTGACCAACACCTCGTACCCGTGGTC
TTGGGCGCGTGTAGGGCCGGCGGTGGAACTGGCTCTCGGGAGGGTGAAGGCTCGGCCGGACTTGCTGCCG
GGTTGGACGGTCCGTATGGTGCTGGGCAGCAGCGAGAACGCGGCGGGCGTCTGCTCCGACACCGCTGCAC
CGCTGGCCGCGGTGGATCTCAAGTGGGAGCACAGCCCCGCGGTGTTCCTGGGCCCCGGCTGCGTATACTC
TGCTGCCCCGGTGGGACGCTTCACCGCGCACTGGCGGGTGCCGCTGCTGACGGCTGGCGCCCCGGCTCTG
GGCATCGGGGTGAAGGATGAGTACGCGTTAACCACCCGCACAGGACCCAGCCATGTCAAGCTGGGCGACT
TCGTGACGGCGCTGCATCGACGGCTGGGCTGGGAGCACCAGGCGCTTGTGCTCTATGCAGATCGGCTGGG
CGACGACCGGCCGTGCTTCTTCATAGTGGAGGGGCTGTACATGCGGGTGCGTGAGCGACTCAACATCACA
GTAAATCACCAGGAGTTCGTCGAGGGCGACCCGGACCACTACACCAAGCTACTGCGGACCGTGCAGCGCA
AGGGCAGAGTTATCTACATCTGCAGTTCTCCGGATGCCTTCAGGAATCTGATGCTTTTGGCCCTGGATGC
TGGCCTGACTGGGGAGGACTATGTTTTCTTCCACCTGGATGTGTTTGGGCAAAGCCTTCAGGGTGCTCAG
GGCCCTGTTCCCAGGAAGCCCTGGGAAAGAGACGATGGGCAGGATAGGAGAGCCCGCCAGGCCTTTCAGG
CTGCCAAAATTATTACTTACAAAGAACCCGATAATCCTGAGTACTTGGAATTCCTGAAGCAGCTAAAACT
CTTGGCTGACAAGAAATTCAACTTCACCATGGAGGATGGCCTGAAAAATATCATCCCAGCATCCTTCCAT
GACGGGCTCCTGCTCTATGTCCAGGCAGTGACAGAGACTCTGGCACAGGGGGGCACTGTCACTGATGGAG
AGAACATCACTCAGCGGATGTGGAACCGAAGCTTCCAAGGTGTGACAGGATACCTGAAAATTGATAGAAA
TGGAGATCGGGACACTGATTTCTCCCTCTGGGATATGGACCCCGAGACAGGTGCCTTCAGGGTTGTCCTG
AACTTTAATGGTACTTCCCAGGAGCTGATGGCTGTGTCAGAACACAGATTATACTGGCCTCTGGGATACC
CACCTCCTGACATCCCTAAATGTGGCTTTGACAATGAGGACCCAGCCTGCAACCAAGACCACTTTTCCAC
ACTGGAGGTTCTGGCTTTGGTGGGCAGCCTCTCTCTGGTTAGCTTTCTGATCGTGTCTTTCTTCATATAC
AGGAAGATGCAGCTGGAAAAGGAGCTGGTCTCAGAGTTGTGGCGGGTGCGCTGGGAGGACTTGCAGCCCA
GCAGCCTGGAGAGGCACCTTCGGAGCGCTGGCAGTCGGCTGACCCTGAGTGGGCGAGGCTCCAATTATGG
CTCCCTGCTAACCACGGAGGGCCAGTTCCAAGTCTTTGCCAAGACAGCATACTATAAGGGCAACCTCGTG
GCTGTGAAACGTGTGAACCGGAAACGCATTGAGTTGACACGAAAAGTCCTGTTTGAACTTAAACATATGC
GGGATGTGCAGAATGAGCACTTGACCAGATTTGTGGGAGCTTGTACCGACCCTCCCAACATCTGTATCCT
CACAGAGTACTGTCCCCGTGGGAGCCTACAGGACATTCTAGAGAATGAGAGTATTACCCTGGACTGGATG
TTTCGGTACTCACTCACCAATGACATTGTCAAGGGAATGCTCTTTCTACACAACGGGGCCATTGGTTCCC
ATGGGAACCTCAAGTCATCCAACTGCGTGGTAGATGGACGTTTTGTGTTAAAGATCACAGACTATGGGCT
CGAGAGCTTCAGAGACCCGGAGCCAGAGCAAGGACACACCCTCTTTGCCAAAAAACTGTGGACTGCACCT
GAGCTCCTGCGAATGGCTTCCCCACCTGCCCGTGGCTCCCAAGCTGGGGATGTCTACAGTTTTGGTATCA
TCCTTCAGGAAATTGCCCTAAGAAGTGGGGTCTTCTATGTGGAAGGTTTGGACCTCAGCCCAAAAGAGAT
CATTGAGCGTGTGACTCGGGGCGAGCAGCCCCCATTCCGACCTTCCATGGATCTGCAGAGCCACCTGGAG
GAACTGGGGCAGCTGATGCAGAGGTGCTGGGCAGAGGATCCTCAGGAGCGGCCACCCTTTCAACAGATCC
GCCTGGCGCTGCGCAAGTTCAACAAGGAGAACAGCAGCAACATCCTGGACAACCTGCTGTCACGCATGGA
ACAGTACGCCAACAACCTGGAGGAACTGGTAGAGGAGAGAACACAGGCTTATCTGGAGGAGAAGCGCAAA
GCTGAGGCCCTGCTTTACCAGATTCTGCCTCACTCTGTGGCTGAGCAGCTGAAGAGAGGCGAGACAGTCC
AGGCTGAGGCATTTGATAGTGTTACTATCTATTTCAGTGATATCGTGGGCTTTACAGCTCTTTCAGCAGA
GAGCACACCCATGCAGGTGGTCACCCTGCTCAATGATCTGTACACCTGTTTTGATGCTGTCATAGACAAC
TTTGATGTGTACAAGGTAGAGACCATTGGTGATGCTTACATGGTGGTATCAGGGCTCCCAGTGAGGAATG
GACAGCTCCATGCCCGAGAGGTAGCCCGAATGGCACTTGCACTGCTCGATGCTGTACGCTCCTTCCGCAT
CCGCCATAGGCCCCAGGAACAGCTGCGCTTGCGCATTGGAATTCACACAGGTCCCGTGTGTGCTGGTGTG
GTAGGGCTAAAGATGCCCCGATACTGCCTCTTTGGAGACACAGTCAACACAGCTTCAAGAATGGAGTCTA
ATGGGGAAGCCCTCAGGATCCACTTGTCTTCGGAGACCAAGGCTGTGCTGGAAGAGTTCGATGGTTTTGA
GCTGGAGCTCCGAGGTGACGTGGAAATGAAGGGCAAAGGCAAGGTTCGAACCTATTGGCTCCTCGGGGAG
CGGGGATGCAGCACTCGAGGCTGA

1) animal (ratón)
2) Npr1, full name: natriuretic peptide receptor 1
3) Activa la actividad de la guanilato ciclasa. Se prevé que participe en varios
procesos, incluido el proceso biosintético cGMP.

Secuencia 5

1 ACACATACAT ATACATTAAA AACTAGGAAT TAGTAGTGAT CATGGCTAAG TTTGCTTCTA

61 TCATTGTCCT TCTCTTCGTT GCTCTTGTCG TTTTTGCTGC TTTCGAAGAA CCAACAATGG
121 TGGAAGCACA GAAGTTGTGT CAGAGGCCAA GTGGGACATG GTCAGGAGTC TGTGGAAATA
181 ATAACGCATG CAAGAATCAG TGCATTCGAC TTGAGAAAGC ACGACATGGG TCTTGCAACT
241 ATGTCTTCCC AGCTCACAAG TGTATCTGTT ATTTCCCTTG TTAATTCCAT AAACTCTTCG
301 GTGGTTAATA GTGTGCGCAT ATTACATATA ATTAATAAGT TTGTGTCACT ATTTATTAGT
361 GACTTTATGA CATGTGCCAG GTATGTTTAT GTTGGGTTGG TTGTAATATA AAAAAGTTCA
421 CGGATAATAA GATGATAAGC TCACGTCGCC AAAAAAA

1) Planta (rábano)
2) LOC108832239, también conocido como AFP2
3) Es un gen defensina tipo 2. Es un péptido antimicrobiano que proporciona
protección a una amplia gama de agentes patógenos.

Secuencia 6

1 ATACATTGAA AACAAAGTAG TAATAATCAT CATGGCTAAG TTTGCTTCCA
 51 TCATCACCTT TATCTACGCT GCTCTTGTTC TCTTTGCAGC TTTTGGTTAG
101 TAATGCTCTT ATAATATGAA TTAAAATGTA ATGTTCATTT ACATAACTAG
151 AGAGATGTAA CATACGCAGA AGTACCAACA ATGGTGGAAG CACAGAAGTT
201 GTGCGAGAAG CCAAGTGGTA CTTGGTCAGG AGTTTGCGGA AACAGCAATG
251 CATGCAAGAA TCAGTGCATT AACCTTGAAG GAGCAAAACA TGGATCTTGC
301 AACTATGTCT TCCCAGCTCA CAAGTGTATC TGTTACGTCC CATGTTAA

1) Planta
2) Esta secuencia no tiene ningún posible gen, solo se menciona que pertenece al
cromosoma 2 de Arabidopsis thaliana.
3) Al no codificar ningún gen, se desconoce la función del mismo.

Referencias:

BLAST: Basic Local Alignment Search Tool. (2023). Retrieved March 10, 2023, from

Nih.gov website: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#2442578352