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SÍNTESIS DE PROTEÍNAS PRINCIPIOS DE BIOLOGÌA

MOLECULAR

Introducción

Una proteína es una cadena larga de aminoácidos unidos por enlace peptídicos. Esta
característica determina la estructura tridimensional de las proteínas que son
importantes para el desempeño de sus funciones. Constituyen la mitad de la materia
viva de la célula y corresponden a las biomoléculas más versátiles y diversas. Los cinco
elementos presentes en la mayoría de proteínas naturales son: carbono (C), nitrógeno
(N), oxígeno (O), hidrógeno (H) y azufre (S).

Existen más de 3000 clases de proteínas y cada una lleva a cabo funciones
especializadas. Las proteínas se encuentran constituidas por una cadena de aminoácidos,
que comparten un átomo central de carbono, unido a cuatro diferentes grupos químicos:
grupo amino (NH2), grupo carboxilo (COOH), átomo de hidrogeno, grupo variable
denominado cadena lateral o grupo R.

La síntesis de proteínas es un proceso anabólico por el cual se secretan proteínas a partir


de los veinte aminoácidos esenciales, este proceso tiene lugar en los ribosomas, dentro
del citoplasma celular. Aquí se transcribe el ADN en ARN.

La síntesis de proteínas comprende: transcripción del ADN con formación de ARNm,


fuga del ARNm a los ribosomas, activación de los aminoácidos con ATP, formación de
complejos aminoácido-ARNtransferentes y traducción del ARNm o mensaje. Algunos
de estos procesos se desarrollan simultáneamente.

1. La transcripción, se realiza dentro del núcleo de las células eucariotas, es la


formación de ARN, tomando como molde un segmento de ADN de una de las
cadenas de manera que se forma una cadena lineal de ribonucleótidos o ARN cuya
secuencia es complementaria a la del molde. Los nucleótidos de Adenina (A) se
transcriben como uracilo (U).
Fig. Esquema de la biosíntesis de las proteínas regido por el ADN, a través del ARNm. Un
segmento de una de las cadenas de ADN sirve de molde para formar ARN, es la transcripción. El ARNm se coloca en
la superficie de los ribosomas llevando el mensaje que es su secuencia de bases. Mientras tanto, los aminoácidos aa
ganan energía por reacción con el ATP, activándose. Cada aa activado se une a sus ARN transferentes, existiendo
hasta 4 para cada aa, pero siempre los mismos; así surgen los complejos aa ARN transferentes. Ëstos se mueven a los
ribosomas en los que ciertos tripletes de cada complejo, los anticodones, reconocen tripletes complementrio del ARN.
Los codones, señalados con --- se unen por puentes de H codón y anticodón, ubicando el tespectivo aa. Los aa
contiguos se unen formándose cadenas polipeptídicas según la secuencia de bases del ARNm: traducción del
mensaje. Conforme un aa se une a otro su ARNt que lo carga se separa del codón y retorna al citoplasma a transportar
más monómeros. La síntesis de proteínas se detiene cuando en el mensaje aparece un codón de parada o mudo.

Salvo en las bacterias, la transcripción forma un ARN precursor que se recorta antes de
funcionar como ARN mensajero, transferente o ribosómico.

Las enzimas que intervienen en la formación de ARN son las trnascriptasas o


polimerasas de ARN dependientes de ADN, precisan Mg++ (activador). Se fijan al ADN
que se transcribe y producen el polirribonucleótido por unión de ribonucleótidos.

Los segmentos de ADN transcritos son genes, su orden de bases es la información


genética que determina la secuencia de las bases del ARN. Sobre un conjunto de
estructuras nominadas ribosomas se coloca el ARN denominado mensajero cuya
secuencia de bases constituye el mensaje genético según la cual será la secuencia de
aminoácidos en una cadena polipeptídica (gracias a una clave).
Cabe recalcar que, dado que el mensaje resulta de la transcripción, es complementario al
gene (ADN) transcrito. En general, la transcripción puede expresarse de la siguiente
manera: un segmento de cadena de ADN molde (gene) ARN

Fig. Esquemas que ilustran la transcripción.- Segmentos de una cadena cualquiera de ADN, o genes,
sirven de molde para la incorporación de ribonucleótidos trifosfatos libres, que al unirse linealmente ( eliminando
pirofosfato PP) constituyen la molécula de ARN que puede actuar como ARN mensajero, transferente o ribosómico.
La materia prima son ribonuclótidos trifosfatos libres, de U, G, C y A (ricos en energía) que al unirse eliminan
pirofosfato PP, por lo que cada nucleótido en el ARN poseen un solo P (como en el ADN). En la síntesis de ARNm
interviene la trancscriptasa, con Mg++ como activador. En células procariotas el ARN está listo para funcionar como
mensajero, pues no sufre modificaciones, en las eucariotas se recorta.

El proceso de transcripción es complejo, en esencia ocurre así: por acción enzimática se


abre una determinado segmento de la doble hélice de ADN en las zonas a transcribir -
gene- por rotura de los puentes de H y una de las cadenas de ADN de los segmentos o
genes que se transcriben sirven de molde para que se ubiquen linealmente
ribonucleótidos trifosfato libres, atraídos por las bases complementarias del ADN
molde, con las que establecen enlaces de H. Simultáneamente se unen linealmente
dichos ribonucleótidos- monómeros- eliminándose pirofosfato. Aparece así una cadena
de ARN complementaria al molde. Véase fig. esquemas que ilustran la transcripción
transcripcón…).

Aunque ambas cadenas de ADN se transcriben ( no en su totalidad) la síntesis de un


cierto ARNm particular por ejemplo AUUCAUGGG (que rige una cadena polipeptídica
dada) involucra siempre el mismo segmento de ADN o gene. Cuando éste, sirve de
molde para generar ARN, es decir cuando se transcribe, se dice que el gene se expresa o
está activo.

Concluido el encadenamiento de ribonucleótidos o transcripción, se enrolla de nuevo el


ADN que se ha transcrito –por acción enzimática- y la molécula de ARN se separa del
filamento de ADN molde. En las bacterias dicho ARN se encuentra listo para funcionar;
mientras que en las eucariotas el ARN naciente producto de la transcripción se trata de
un ARN precursor, pues antes de que entre a funcionar como mensajero, transferente o
ribosómico experimenta ciertas modificaciones postranscripcionales, principalmente
eliminación de ciertos nucleótidos (intrones), apareciendo así el ARN maduro,
funcional. Luego:

En bacterias: ADN molde Polimerasas de ARN Mg++ ARNm, ARNt o ARNr

En eucariotas: ADN molde Transcriptasa Mg++ ARNm, ARNt, o ARNr precursor

ARNm, ARNt o ARNr precursor Modificación postranscripcional. Recorte ARNm, t, r maduro

Es decir que excepto en bacterias el ARNm precursor es recortado en varios segmentos


eliminándose los intrones; los nucleótidos restantes se empalman entre ellos, son los
exones, generando así ARN maduro, funcional, listo para su traducción a proteína. En
consecuencia el ARNm que codifica cadenas polipeptídicas o proteínas- se traduce- es
el conjunto empalmado de exones que constituye el ARNm maduro.

Por intrones se entiende las secuencias de ADN que corresponden (complementarias) a


las eliminadas en el ARN precursor, y por exones los nucleótidos del ADN no
eliminados en el segmento de ARN correspondiente.

Aunque mediante el proceso de transcripción se forman las tres clases de ARN, dada la
mayor importancia del ARNm, sino se expresa lo contrario, se entenderá que se trata de
la síntesis de éste. Ciertos segmentos de ADN (genes) se transcriben para ARNm, otros
para ARNt y otros para ARNr.

El proceso de transcripción del ADN no se debe confundir con su duplicación, en ésta


se desenrolla todo el ADN, participan desoxirribonucleótidos (libres), las dos cadenas
sirven de molde, se sintetizan dos cadenas, etcétera.
Debe precisarse que el inicio de la transcripción ( en una cadena de ADN) y el fin de la
misma, son indicados por ciertas proteínas que se unen a ciertas secuencias de bases del
ADN o señales, reconocidas por la ARN polimerasa, que deberá unirse a éstas. Ciertos
compuestos, denominados represores genéticos impiden esta fijación de la enzima con
tales señales bloqueando así el inicio de la transcripción o su culminación, lo cual
finalmente detiene la síntesis proteica.

Se conocen proteínas que reprimen la transcripción y otras que la activan; interviene por
tanto en la expresión génica cuyo fin es la síntesis de proteínas. Se trata de un control a
los genes.

El mensaje se coloca sobre la superficie de los ribosomas para ser traducido a estructura
primaria.

2. El ARNm formado fuga del núcleo, principal lugar de su síntesis, a la superficie de


los ribosomas.

Los ribosomas son gránulos de ARN ribosómico y proteínas visibles solo al


microscopio electrónico (M.E.), formados por dos subunidades, en los que se fija el
ARNm permitiendo la formación de cadenas polipetídicas, pues sujetan el mensaje y
poseen la enzima para las uniones peptídicas.

Excepto en las bacterias, como se indicó, los segmentos de ARNm exones se empalman
entre ellos; el ARNm maduro resultante se dirige hacia los ribosomas y se ubica sobre la
superficie de varios de ellos para su traducción ( a proteína). A cada conjunto de
ribosomas asociados por una cadena de ARNm (que es lineal) se denomina
polirribosomas o polisomas.
Fig. Esquema de polisomas.- Se trata de ribosomas unidos por una molécula de ARNm. Cada ribosoma
consta de una subunidad mayor y otra menor, compuestas de proteínas y ARN ribosómico. Poseen la enzima para
unir aa mediante enlaces peptídicos. Los ribosomas bacterianos tienen menor densidad que los del resto de
organismos; los polisomas bacterianos no se forman al contacto con antibióticos como el cloranfenicol. Inhibiéndose
la síntesis de proteínas.

Ubicado el ARNm en los polisomas, su orden de bases o mensaje rige la estructura


primaria de una cadena polipeptídica o de una proteína. Se menciona entonces que el
ARNm se traduce a proteínas. El ARNm formado en mitocondrias y cloroplastos a
partir de su ADN se fija a los ribosomas de estos organelos.

3. Activación de los aminoácidos con ATP. Químicamente el ATP es un


ribonucleótido trifosfato rico en energía con la base adenina, el azúcar ribosa y tres
grupos fosfatos. Es la “moneda” con la que la célula “paga” sus actividades que le
permiten vivir, como la síntesis de proteínas. Se genera a partir de la energía de los
alimentos.

Los aa antes de unirse deben energizarse con ATP, reacción en la cual éste cede al
aminoácido un grupo AMP ( adenosínmonofosfato) originándose el aa activado ( o
aminoacil AMP). Participa la enzima activante o aminoacil sintetasa, a su vez activada
por Mg++.

aax + ATP Enzima activante para aax aax AMP* + PP


Mg++ aax activdo Pirofosfato inorgánico

La enzima activante o aminoacil sintetasa cataliza además la reacción de los aa con sus
correspondientes ARN de transferencia, reacción que sigue a la activación.
4. Reacción entre cada aminoácido activado y su correspondiente o propio ARN
transferente. El producto se lo denomina complejo aminoácido-ARN transferente o
aminoacil ARNt.

Los complejos aminoácidos-ARNtransferentes se mueven hasta la superficie de los


polisomas por atracción química entre bases del ARNm de los polisomas con ciertos
tripletes de bases complementarias de los ARN transferentes cargados de aminoácidos
(complejos aa-ARNt).

Cabe señalar que el ácido ribonucleico transferente o ARNt es soluble ( por lo que
también se abrevia ARNs) de pequeño tamaño y aunque monocatenario o de una hebra,
se dobla por el apareamiento de bases complementarias adoptando la forma de UNA
HOJA DE TRÉBOL. En una de las asas (incurvaciones) del “trébol” posee un triplete
consecutivo de bases no apareadas, el anticodón, que desempeña un importante papel en
la traducción del mensaje, reconociendo un triplete complementario en el ARNm
nominado codón (código genético o clave genética).

Fig. Esquema de la molécula de ARNt.-


Nótese su forma en hoja de trébol y el anticodón. Se complementan A con U.

Cada uno de los 20 aa activados –ricos en enertgía- se combinan con una o cuatro
moléculas de ácido ribonucleico transferentes (ARNt), propias para cada aminoácido.
Los complejos aminoácidos-ARN transferente resultantes poseen energía que fue
transferida desde los aa activados. Como se indicó estas sustancias se desplazan hacia la
superficie ribosomal. Atraídos por las bases del ARNm.
Al final, para un aax activado, la formación del complejo con su respectivo ARNt
podría resumirse del modo siguiente:

Tanto la activación de aa como la formación de complejos ocurre en el citoplasma o


zona extranuclear, en su citosol, que es el medio viscoso en que el que se hallan los
organelos celulares.

5. La última fase de la síntesis de proteínas es la traducción del ARNm a cadena


polipeptídica o proteína. Se trata de la unión de aa en los polisomas en una
secuencia que depende de la secuencia de nucleótidos del ARNm o mensaje, de
conformidad con una clave o código. Algunos autores consideran traducción desde
el momento en que los aa se activan.

La clave genética consiste en tres bases consecutivas del ARNm o CODÓN que
determinan la ubicación de un cierto aminoácido –siempre el mismo- en una cadena
peptídica en formación. Por ejemplo en la fig. biosíntesis de las proteínas regidos por el
ADN, a traés del ARNm, se observa que las claves genéticas para los aa aspártico y
lisina son guanina-adenina-uracilo o GAU y tres adeninas o AAA, respectivamente. En
la tabla del código nótese que ciertos aminoácidos pueden tener hasta cuatro codones
(códigos). Se dice que el ARNm se traduce a estructura primaria según la clave.
Tabla.- Código genético: codones que especifican un aminoácido determinado
Cada secuencia de tres bases en el ARNm o codón determina la incorporación de un cierto aminoácido en la cadena
polipeptídica en formación.

En términos generales para armar una proteína (cierta secuencia de aminoácidos) cada
ARNt portador de un cierto aa, siempre el mismo, es decir cada complejo aa-ARNt llega
a los polisomas donde el anticodón reconoce al triplete complementario en el ARNm o
codón y los aa se enlazan formándose la cadena. El orden de los aa – estructura
primaria- depende del orden de las bases en el ARNm.

Se detectan tres eventos básicos en la traducción del mensaje genético (ARN) iniciación
de la cadena polipeptídica, alargamiento y finalización.

El inicio de la traducción da un triplete consecutivo de bases en el ARNm situado en la


superficie de los ribosomas llamado codón de iniciación, generalmente AUG, que atrae
al complejo metionina-ARNt cuyo anticodón o triplete complementario al codón de
iniciación es UAC, estableciéndose enlaces débiles (puentes de H) entre ellos. Así, el
ARNt, portador de metionina gracias a su anticodón reconoce el triplete
complementario o codón del mensaje y coloca al aa en el ribosoma; el ARNt es como
un enchufe que permite colocar el aa.

El alargamiento de la cadena polipeptídica ocurre porque otro aa, transportado por su


ARNt propio, se coloca en la superficie ribosomal merced al sistema de reconocimiento
registrado entre las tres bases que integran el anticodón y las tres complementarias del
ARNm o codón. Cada codón es una clave genética o código que determina el aa
específico que debe incorporarse en una cadena polipeptídica en formación.

En consecuencia, cada complejo aa-ARNt se coloca en la superficie ribosomal por


reconocimiento del anticodón con su codón o triplete consecutivo complementario del
mensaje genético. Cuando dos complejos aa-ARNt se hallan juntos en el ribosoma la
peptidil transferasa de éste los une mediante el enlace peptídico.

Para la lectura del mensaje o traducción los ribosomas deben moverse a lo largo de éste:

Las tres bases consecutivas del ARNm


(codón) responsables de la incorporación
de un determinado aa en la cadena
polipeptídica en formación se conocen
como código genético o clave genética
para ese aa. Ver tabla del código genético.
Cuando los ribosomas en su
desplazamiento a lo largo del hilo de
ARNm encuentran ciertos codones que no
identifican ningún aa en la cadena
polipeptídica, con lo que su síntesis
termina. Es la finalización de la
traducción. Los códigos de terminación,
que no se traducen, se denominan mudos o
de parada y son UGA, UAG, UAA.

En el código, cada triplete consecutivo del ARNm se dice que especifica o codifica un
cierto aa. Por ejemplo, ya que el código para fenilalanina es UUU (vèase tabla de
código) dondequiera que este codón se encuentre a lo largo de la cadena de ARNm
situada en los ribosomas, atraerá a un anticodón AAA cuyo ARNt transporta
fenilalanina, aa que se unirá con otro mediante enlace peptídico. Por lo tanto, la clave o
secuencia del mensaje UUU se traduce como fenilalalanina.

Algunos autores denominan incorrectamente código genético a la secuencia total de


nucleótidos del ADN. De ser así sería distinta la clave genética de las diferentes
especies; y en realidad es universal, la misma en todas.

El proceso descrito de pasar la secuencia de ribonucleótidos del ARNm a secuencia de


aminoácidos es el de la traducciòn, como se lo ha expresado. Pero finalmente también la
secuencia de aa o estructura primaria de la cadena polipeptídica resultante constituye la
traducción. Así el fragmento de mensaje siguiente: UUUGUUACUAAG, se traduce
fenilalanina-valina-treonina-lisina, de acuerdo al código genético (ver tabla de código).
Por lo anterior:

Orden de bases en el ARNm Traducción Orden de aa en la cadena polipeptídica

Concluida la síntesis de una cadena polipeptìdica ésta, se libera al citosol cuando el


último aa se disocia de su ARNt. Si la proteína consta de más de una cadena, se
asocian. Cada proteína se pliega de conformidad con su estructura primaria, adoptando
una configuración propia (“estructura tridimensional”). Después, algunas experimentan
alguna modificaciòn química antes de cumplir su función.

El código genético es universal y degenerado por tener sinónimos.- el código


genético es universal: todas las especies usan los mismos tripletes del ARNm (codones)
cuando incorporan sus aminoácidos (aa) en cadena. Esto es, cada aa corresponde a los
mismos codones en todas las especies. No obstante, aunque un codón representa un solo
aminoácido, cada aa suele estar representado por varios codones, nominados sinónimos,
que suelen diferir en la tercera base, por lo que se dice que el código es degenerado.
Recuerde que existe códigos mudos o de parada.

Colinealidad.- Puesto que mediante la transcripción la secuencia de bases del ADN


molde determina la del correspondiente mensaje que se traduce, en último término el
ADN funcional (genes) rige la estructura primaria de una proteína (orden y número de
aa). Este principio fundamental se conoce en biología molecular como
COLINEALIDAD y se puede resumir así:

Orden de bases en ADN transcripción Orden de bases en ARNm traducción Estructura primaria de la proteína o
cadena polipeptídica

Sin embargo, la colinealidad es aplicable solo en bacterias dado que en el ADN de los
demás seres vivos existen intrones por lo que se traduce el ARNm maduro resultante de
la eliminación de exones, de manera que no existe una correspondencia total entre la
secuencia de nucleótidos del ADN que se transcribe y la del ARNm maduro que se
traduce.
Conclusiones sobre la síntesis de proteínas

- El ADN determina la secuencia de aminoácidos de una cadena polipeptídica o de


una proteína (estructura primaria, responsable en último término de las
características celulares). Sin embargo, el ADN no determina directamente tal
secuencia, sino a través del ARNm, que es una “copia en clave”, del ADN edificada
según el principio de bases complementarias, proceso denominado transcripción.
Dicho ARNm se ubica sobre ribosomas asociándolos en polisomas.

Mientras se sintetiza ARN, cada molécula de aminoácido gana energía reaccionando


con ATP y el aminoácido activado resultante (aa-AMP) se une a su correspondiente
ARNt originando complejos aa-ARNt que se desplazan a los polisomas por la
atrcción electroquímica entre tripletes anticodones del ARNt y codones
complementarios (tripletes consecutivos de nucleótidos del ARNm), tales uniones
son de A con U y C con G. En estas condiciones en los polisomas gracias a su
peptidiltransferasa, los aminoácidos contiguos se unen originando una cadena
polipeptídica, o una proteína, cuya síntesis se detiene cuando el mensaje presenta un
código mudo. Conforme se alarga la cadena se liberan los ARN de transferencia.

- En la etapa de la traducción se forma la cadena polipeptídica o cadenas de acuerdo a


la secuencia de ribonucleótidos del mensaje, esto se traduce en proteínas la
información genética transferida desde el ADN al ARN durante la transcripción.

- Un codón representa una clave genética o código genético (excepto los codones
mudos, que no codifican ningún aa). Así, los codones, GAU, AAA, GUU son las
claves de los aminoácidos aspártico, lisina y valina, respectivamente, lo que
significa que estos tripletes del ARNm permiten la integración o codificación de
dichos aa en una cadena polipeptídica. Sin embargo, para ciertos aminoácidos tiene
hasta cuatro codones que los codifican, son los códigos sinónimos. Ver tabla de
código genético.

- La biosíntesis de proteínas constituye la segunda función del ADN. Mientras que la


primera función del ADN es la de duplicarse o replicarse antes de iniciar la división
celular.
- Las proteínas son macromoléculas indispensables para el funcionamiento correcto
de la célula.
- El ADN codifica para el ARNm, el ARNm lleva la información necesaria para la
síntesis de las proteínas a los ribosomas, donde se sintetizan las proteínas.

Referencias bibliográficas:Biggs, Kapicka, Lundgreen. (2000). BIOLOGIA. La


dinámica de la vida. México: McGraw – Hill interamericana editores, S.A de C.V.

Ramírez, R, Urzúam, M., Camacho, A., Esqueviel, R., & Tsuzuki, G. (2015).
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STARR, Cecie: BIOLOGÍA, La unidad y la diversidad de la vida, 2010, 12ª.
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