UNIVERSIDAD REGIONAL AMAZÓNICA

INGENIERÍA EN BIOTECNOLOGÍA

UNIDAD 4
Tema 4.1. Microbiología del Suelo. Degradación
de compuestos carbonados.

Dr. Roldán Torres Gutiérrez

roldan.torres@ikiam.edu.ec
1
Sumario

✓ El suelo como medio de cultivo natural.

Microorganismos presentes en el suelo. Métodos de
estudio.

✓Ciclo del carbono. La materia orgánica en los suelos.

Metabolismo de las fuentes de carbono. Biodegradación
de compuestos carbonados. Evolución del dióxido de
carbono en los suelos como medida de la degradación de
los compuestos carbonados.

2
EL SUELO COMO MEDIO DE
CULTIVO NATURAL

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El Suelo
• Está formado por constituyentes sólidos, líquidos y
gaseosos comprendidos en los grupos siguientes:
- Partículas minerales
- Restos de plantas y animales
- Agua
- Gases
- Microorganismos

El suelo es un medio de cultivo ideal pues contiene todos los

nutrientes orgánicos e inorgánicos que requieren la inmensa
mayoría de los microorganismos.

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Microbiología del suelo
• Tiene como objetivo el estudio de la población microscópica del mismo,
la participación que tiene en las numerosas transformaciones que
ocurren en este y la importancia que posee esa población para la
nutrición de las plantas.
• El suelo fértil es un complejo ecosistema que contiene entre un millón y
un billón de microorganismos por gramo. Las bacterias son el grupo más
abundante.
• Los microorganismos en el suelo realizan diferentes funciones, entre
ellas:
- Degradación de compuestos carbonados.
- Producción de sustancias promotoras del
crecimiento vegetal.
- Solubilización de fósforo, azufre y otros
compuestos.
- Fijación de nitrógeno.

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Microorganismos presentes en el suelo

• Bacterias
• Hongos
• Actinomicetos
• Algas
• Protozoos

Penicillium www.dehs.umn.edu

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Microorganismos presentes en el suelo

• Microorganismos autóctonos o nativos: son característicos de

cada suelo en particular y se encuentran siempre en ese suelo.
• Microorganismos zimógenos: son los que se desarrollan bajo la
influencia de tratamientos específicos del suelo. Ej.: adición de
materia orgánica, fertilización y aeración.
• Microorganismos transitorios: comprenden los introducidos en el
suelo intencionalmente, por ejemplo, los abonos bacterianos, y los
que no se introducen intencionalmente, como los agentes
patógenos que causan enfermedades a las plantas y los animales.

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Métodos de estudio

• Conteo de microorganismos.
- Conteo microscópico total. Ej.: Conteo directo sobre
portaobjetos
- Conteo de viables. Ej.: método de las diluciones decimales y
siembra en placa de Petri.
• Aislamiento y cultivo en el laboratorio. Se emplean medios de
cultivo selectivos para cada grupo microbiano.

• Análisis fisiológicos y bioquímicos.

• Análisis Moleculares.

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Objetivos del estudio de microorganismos del suelo

• Determinar la composición y estructura de las comunidades

microbianas.

• Evaluar los cambios que se producen en dichas

comunidades en respuesta a diferentes factores ambientales.

• Determinar el papel funcional de los

diferentes tipos de microorganismos que integran la
comunidad.

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Aislamiento y cultivo en el laboratorio

Bacterias colonia

Extensión en superficie de agar.

Dilución en agar.
Agotamiento por estrías.

El crecimiento que esta origina, en

medio de cultivo sólido, es una masa
de células fácilmente visible que
recibe el nombre de colonia.

Cultivo puro: es aquel que contiene un sólo tipo de microorganismo y que

procede generalmente de una sola célula.

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Aislamiento y cultivo en el laboratorio

Siembra por extensión con espátula de Drigalski

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Aislamiento y cultivo en el laboratorio
Siembra por estrías en medio de cultivo sólido

12
Aislamiento y cultivo en el laboratorio
Siembra por dilución en agar

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Aislamiento y cultivo en el laboratorio
Siembra en medio de cultivo líquido

Siembra en tubos de
ensayo

Siembra en medio de cultivo sólido en

plano inclinado

Siembra en medio de cultivo

semisólido

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Hongos filamentosos. Aislamiento y cultivo
• Aislamiento directo.

• Cámara húmeda.

• Dilución en agar.

• Siembra directa de un cultivo crecido

• Microcultivos.

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Hongos filamentosos. Aislamiento y cultivo
Siembra directa de un cultivo crecido

Fusarium

Aspergillus
16
Hongos filamentosos. Aislamiento y cultivo
Microcultivo de hongos

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Tipos de medios de cultivo
• Medio selectivos:
contienen uno o más
agentes que inhiben el
crecimiento de algunos
microorganismos y
permiten el crecimiento
de los microorganismos
deseados.
• Medios diferenciales:
permiten el crecimiento
de varios tipos de
microorganismos y
permiten hacer visibles
las diferencias entre
ellos.

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Tipos de medios de cultivo
• Sintéticos: contienen compuestos
orgánicos e inorgánicos puros en una
fórmula química exacta.

• Complejos o no sintéticos: Contienen al

menos un ingrediente que no está
químicamente definido.

• De propósitos generales: crecen un

amplio número de microorganismos.
Usualmente no son sintéticos.

• Enriquecidos: contienen un complejo de

sustancias orgánicas tales como sangre,
suero, hemoglobina o factores de
crecimiento especiales.

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Análisis moleculares

• A partir de la década de los ochenta se produjo una

revolución espectacular en el conocimiento de la diversidad
microbiana en suelos debido a la incorporación de
novedosas y potentes técnicas de estudio, que no requieren
del cultivo previo de los
microorganismos.

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Análisis moleculares
• Objetivos:
- Comparación de proteínas y enzimas,
- Composición de ácidos nucleicos (% G+C),
- Hibridación de ácidos nucleicos,
- Secuenciación de ácidos nucleicos.
• Métodos:
- Reacción en cadena de la polimerasa,
- Análisis de ARN ribosomal,
- Determinación del contenido de G+C en el ADN nuclear,
- Secuenciación,
- Métodos electroforéticos, etc.

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Análisis moleculares

• Permiten diferenciar distintos grupos de microorganismos.

• Determinar la composición de las comunidades microbianas.

• Cuantificar la abundancia de microorganismos

específicos.

• Se pueden analizar genes funcionales clave en procesos

importantes en suelo tales como la desnitrificación, nitrificación,
fijación de nitrógeno, oxidación de metano, etc.

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CICLO DEL CARBONO

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Ciclo del Carbono

1-Dióxido de carbono en la atmósfera, 2-Fábricas/centrales térmicas, 3-Depósito

calizo, 4-Respiración de las raíces, 5-Descomposición, 6-Depósito de combustibles
fósiles (carbón, petróleo, gas natural...), 7-Emisión del suelo y respiración de los
organismos, 8-Respiración de los animales, 9-Respiración de las plantas, 10-
Asimilación por las plantas, 11-Respiración de las algas y animales acuáticos, 12-
Fotosíntesis de las algas, 13-Restos vegetales.

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 Fuentes de Materia Orgánica

• Restos de plantas y animales

• Restos de deyecciones de los animales

• Abonos orgánicos

• Compuestos orgánicos incorporados al suelo junto con los

abonos y plaguicidas

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Fuentes de Materia Orgánica
• Restos de cosechas
Constituidos por una variada gama de sustancias carbonadas.
El tiempo de descomposición está relacionado con:
- el tipo de compuesto,
- su abundancia,
- estructura química,
- condiciones físicas, químicas y biológicas del suelo.

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Compuestos carbonados

• Celulosa
• Hemicelulosa y poliurónicos
• Lignina, quitina y lignocelulosa
• Almidón, dextrina, inulina y glucógeno
• Elementos solubles en agua tales como: azúcares,
aminoácidos y ácidos alifáticos
• Elementos solubles en éter o alcohol como: grasas, aceites,
ceras, resinas, pigmentos
• Proteínas

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Importancia de la descomposición de compuestos carbonados en el suelo

• El ciclo del carbono está en el primer lugar de importancia

ya que es el principal componente de la materia orgánica y
la fuente energética más importante.

• El anhídrido carbónico en la atmósfera es aportado en un

85% por microorganismos heterótrofos al descomponer la
MO.

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Cómo se descomponen los compuestos ricos en carbono

• Hidrólisis de los compuestos más complejos seguida por la

utilización de los productos resultantes y obtención después
de otros productos finales.
• Junto a la asimilación, puede presentarse el fenómeno de
INMOVILIZACION.
• Se utiliza parte del carbono de la materia orgánica en
procesos respiratorios y fermentativos (RESPIRACION DEL
SUELO).
• El desprendimiento de anhídrido carbónico puede ser
medido e indica el nivel de actividad microbiológica y la
biomasa del suelo.

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Ejemplos de degradaciones
• Descomposición de los azúcares
- Reacciones hidrolíticas.
- Participan fundamentalmente hongos y levaduras.
• Descomposición del almidón
- Reacciones hidrolíticas.
- Obtención final de CO2 y H2O.
- Microorganismos participantes
Bacterias: Bacillus, Clostridium y Pseudomonas.
Actinomicetos: Nocardia y Streptomyces.
Hongos: Aspergillus y Fusarium.

Aspergillus

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Ejemplos de degradaciones

• Descomposición de la quitina
- Reacciones hidrolíticas.
- Enzimas : quitinasa y quitobiasa.
- Microorganismos.
Bacterias: Bacillus, Pseudomonas.
Hongos: Fusarium, Trichoderma, Mucor.
Actinomicetos: Nocardia, Streptomyces.

Bacillus

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Ejemplos de degradaciones
• Descomposición de la celulosa
- Reacciones hidrolíticas
- Intervienen varias enzimas
- Microorganismos
Bacterias aeróbicas, anaerobias y termófilas
Mixobacterias: Cythophaga
Actinomicetos
Hongos filamentosos
Protozoos: Hartmanella

Hartmanella

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Ejemplos de degradaciones

• Factores ambientales del suelo que influyen en la

descomposición de la celulosa.
1. Aireación.
2. Humedad.
3. Temperatura.
4. pH.

33
Bibliografía
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Muchas Gracias
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