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Las bacterias aerobias obligadas solo pueden vivir en un medio con oxígeno. En ausencia de oxigeno
mueren.
Las bacterias anaerobias obligadas solo pueden vivir en un medio que no posea oxígeno, el oxígeno
es tóxico para estos organismos. En presencia de oxigeno mueren.
La convivencia entre estas dos bacterias en un mismo medio se debe a un factor abiótico: aireación.
- Los microorganismos usan la fase acuosa (aire → agua → microbio).
- El nivel de humedad afecta a la disponibilidad de oxigeno en el suelo:
Suelos saturados de agua más tendencia a anaerobiosis: solubilidad del oxígeno en agua es baja.
Suelos secos: alta disponibilidad de oxígeno, pero necesidad de agua para su metabolismo.
- Mineralización de la materia orgánica hasta CO2 es más eficiente en aerobiosis.
- El suelo puede tener muchos microambientes diferentes, incluso los suelos bien aireados pueden
tener microambientes anaeróbicos.
Atmosfera del suelo: el suelo y el aire están en contacto directo, la composición de la
atmosfera del suelo dependerá del tipo de suelo, de la actividad microbiana y de las plantas.
- Compuesto xenobiótico: deriva del griego xeno ('extraño') y bio ('vida'). Un xenobiótico es una
sustancia química que se encuentra dentro de un organismo que no se produce naturalmente o se
espera que no esté presente dentro del organismo.
Los microorganismos se adaptan después de haber estado en contacto con los suelos expuestos a
plaguicidas: suelos con una historia de aplicación de pesticidas su vida media es considerablemente mas
corta que los que no se ha realizado ninguna aplicación. Los plaguicidas que se consideraron no
biodegradables se convierten en biodegradables después de varios años.
El suelo es un buen medio para aislar microorganismos que degradan los pesticidas.
Aislamiento de microorganismos del suelo: población microbiana de una muestra de suelo se cultiva
en agitación constante en matraces con un medio rico en sales minerales utilizando un pesticida (o mezcla
de plaguicidas) como única fuente de carbono.