Doctorado en Epidemiología

Seminario de Investigación II
Primera entrega
Daniel Alejandro Buitrago Medina
Estudiante Cohorte 9

1. Título: Vigilancia para la salud pública de las zoonosis basada en ciencia de

datos y su relación con la crisis climática en Antioquia: modelo de análisis
epidemiológico de leptospirosis y accidentes ofídicos

2. Pregunta de investigación: ¿Cómo diseñar y desarrollar un modelo de

monitoreo y análisis de la vigilancia en salud pública de la Leptospirosis y los
accidentes ofídicos integrando las variables de cambio climático, para prevenir
y controlar la presentación en Antioquia?

3. Objetivo general: Diseñar un modelo de monitoreo y análisis de la vigilancia

en salud pública de la Leptospirosis y los accidentes ofídicos integrando las
variables de cambio climático en Antioquia.

4. Objetivos específicos:

 Describir extensión, variedad y naturaleza de la evidencia alrededor del

cambio climático y su influencia en la distribución de Leptospirosis y
Accidente ofídico.
 Caracterizar la presentación, distribución de Leptospirosis y Accidentes
ofídicos en Antioquia durante el periodo de estudio.
 Describir la evolución del cambio climático en Antioquia durante el periodo
de estudio
 Determinar el efecto del cambio climático en la presentación y distribución
de Leptospirosis y Accidentes ofídicos en Antioquia en el periodo. 2000 –
2020
 Desarrollar un modelo de análisis rutinario de la presentación de
Leptospirosis y accidente ofídico en el que se incluyan variables
relacionadas con el cambio climático (precipitación, temperatura, humedad,
entre otras) usando ciencia de datos (machine learning).

5. Hipótesis
La hipótesis se plantea únicamente para el objetivo debido a que los otros
objetivos no corresponden con estudios de tipo analítico.
Hipótesis de investigación: Existe una correlación espacio-temporal entre las
variables climáticas (temperatura, precipitación, humedad relativa) y la tasa de
presentación de leptospirosis y accidente ofídico
6. Tipo de estudio
Desde el enfoque empírico analítico, se realizarán 4 estudios secuenciales y
relacionados. Las características generales se plantean a continuación:
Objetivo específico 1. Diseño Cuantitativo, corresponde a una revisión de literatura
tipo “Scoping review (Revisión de alcance)”, en la que se realizará la descripción
de tipo de documentos científicos, tipo de población estudiada, tipo de variables
climáticas estudiadas, diseños de análisis e impacto en las tasas de Leptospirosis
y accidente ofídico. Para llevar a cabo el estudio se siguieron las directrices
actuales de revisión de alcance (1, 2) y la guía PRISMA (3). Este abordaje permite
mapear los estudios que analizan el impacto de las variables climáticas en la
presentación de enfermedades zoonóticas, así como, los métodos utilizados para
este fin.
Objetivo específico 2 y 3. Diseño cuantitativo, corresponde a un estudio
observacional de carácter descriptivo retrospectivo. Mediante el uso de las
variables relacionadas con clima y las enfermedades, se describirá de forma
retrospectiva la variación – tendencias de las variables climáticas (relacionadas)
en el departamento de Antioquia por municipio y las tasas de incidencia
municipales semanales. Este estudio permite observar los cambios en las
variables de interés durante el tiempo.
Objetivo específico 4. Diseño Cuantitativo, corresponde a un estudio
observacional, ecológico, de carácter retrospectivo. En particular el abordaje
pretende ser un estudio de correlación espacio-temporal, en el cual, se
correlaciona las exposiciones de tipo ambiental (clima) con la tasa de presentación
de las enfermedades, en este caso se tendrá en cuenta la variación espacial y
temporal de las enfermedades. Este estudio es el más adecuado para determinar
los impactos de las variaciones de las variables climáticas en la tasa de incidencia
de las enfermedades.
Objetivo específico 5. Diseño cuantitativo, corresponde a un estudio de asociación
- predicción con Machine learning (aprendizaje automático), con él se pretende
crear y utilizar algoritmos matemáticos para que una máquina aprenda de forma
autónoma a realizar una tarea (análisis) sin necesidad de programación
específica, en él se utilizan grandes cantidades de datos para entrenarse y son
capaces de realizar predicciones y tomar decisiones en función de patrones que
han sido detectados en los datos durante el entrenamiento.
7. Población
Para el objetivo 1:
Pregunta formulada mediante el esquema CoCoPop

 Tipo de participantes – Población (Pop)

Mundial
 Concepto - Co
Zoonosis – Leptospirosis y Accidente ofídico
 Contexto - Co
Cambio climático
 Tipo de fuentes
Búsqueda en las bases de datos de MEDLINE - Pubmed y BVS – Lilacs como
principales repositorios de búsqueda. Así mismo, se exploraron las bases de
EMBASE, y EPISTEMONIKOS utilizando combinaciones de los términos de
acuerdo con la estructura de la pregunta de investigación bajo el esquema PCC
(Población - Concepto – Contexto).
Búsquedas manuales tipo bola de nieve a partir de los artículos encontrados y
exploración de la literatura gris mediante Web of Science y google scholar a fin de
ampliar el alcance.
 Estrategia de búsqueda
Estrategia de búsqueda sistemática en las bases de datos relacionadas en el
anterior capítulo, de acuerdo con la estrategia definida (PCC) se identificaron los
términos de lenguaje controlado y texto libre que conducían a responder la
pregunta de investigación planteada.
PubMed
Cambio "Climate Change"[Mesh] - 26,639
Climático results
("Extreme Hot Weather"[Mesh]) ((("Climate Change"[Mesh]) OR (("Extreme
Clima extremo OR "Extreme Cold Weather"[Mesh] Hot Weather"[Mesh]) OR "Extreme Cold
- 147 results Weather"[Mesh])) OR ("Global
Calentamiento "Global Warming"[Mesh] - 4,060 Warming"[Mesh])) OR ("Greenhouse
global results Effect"[Mesh])
Efecto "Greenhouse Effect"[Mesh] - 6,001
invernadero results
Zoonosis "Zoonoses"[MeSH Terms] OR ((("Leptospirosis"[Mesh] OR "Weil
"Bacterial Zoonoses"[MeSH Disease"[Mesh])) OR ("Snake
Terms] OR "Viral Zoonoses"[MeSH Bites"[Mesh])) OR ("Zoonoses"[Mesh] OR
 Terms] - 18,772 results
"Leptospirosis"[Mesh] OR "Weil
Leptospirosis "Bacterial Zoonoses"[Mesh] OR "Viral
Disease"[Mesh] - 9,129 results
Zoonoses"[Mesh])
Accidente "Snake Bites"[Mesh] - 5,252
ofídico results
EMBASE
Cambio
climate change'/mj - 21045
Climático
extreme hot weather'/mj OR
Clima extremo
Cambio "'extreme cold weather'/mj - 147 #1 OR #4 OR
climático Calentamiento #5 OR #6
global warming potential'/mj - 28
global
#7 AND
Efecto
greenhouse effect'/mj - 5124 #14
invernadero
zoonosis'/mj OR 'zoonoses
Zoonosis
epidemiology'/mj - 7962 #10 OR #11
Zoonosis Leptospirosis leptospirosis'/mj - 8911 OR #12 OR
snakebite'/mj OR 'snake venom'/mj - #13
Accidente ofídico
14235

BVS
Cambio ( mh:("Climate
Climático Change"))
( mh:("Extreme
( mh:("Climate Change")) OR
Weather")) or ( mh:
( mh:("Extreme Weather")) OR
("Extreme Hot
Clima extremo ( mh:("Extreme Hot Weather"))
Weather")) OR ( mh:
OR ( mh:("Extreme Cold (( mh:("Climate Change")) OR ( mh:
("Extreme Cold
Weather")) OR ( mh: ("Extreme Weather")) OR ( mh:
Weather"))
("Greenhouse Effect")) OR ( mh: ("Extreme Hot Weather")) OR ( mh:
Calentamiento ( mh:("Global
("Global Warming")) ("Extreme Cold Weather")) OR ( mh:
global Warming"))
("Greenhouse Effect")) OR ( mh:("Global
Efecto ( mh:("Greenhouse
Warming"))) AND ((mh:("Zoonoses (mh:
invernadero Effect"))
("Leptospirosis" OR "Weil Disease")) OR
"Zoonoses"OR (mh:("Snake Bites")) )
Zoonosis "Bacterial Zoonoses"OR
(mh:("Zoonoses")) OR (mh:
"Viral Zoonoses"
("Leptospirosis" OR "Weil
"Leptospirosis" OR
Leptospirosis Disease")) OR (mh:("Snake
"Weil Disease"
Bites"))
Accidente
"Snake Bites"
ofídico

Para los objetivos 2 a 5:

 Población objetivo/referencia: Municipios y habitantes del departamento de
Antioquia durante los años 2013 a 2023

 Población de estudio: Municipios y habitantes del departamento de Antioquia

durante los años 2013 a 2023
 Muestra y muestreo: No se utilizará una técnica de cálculo de tamaño de
muestra dado que se incluirán todos los datos disponibles para el
departamento. No se utilizará una técnica de muestreo, se incluirá la
información de acuerdo con su disponibilidad y temporalidad en las bases de
datos oficiales del departamento y la nación.

 Criterios de inclusión
- Municipios del departamento de Antioquia
- Información sobre variables climáticas en el periodo 2013 – 2023
- Reporte al sistema de vigilancia nacional SIVIGILA los casos de
leptospirosis y accidente ofídico

 Criterios de inclusión
No se considera excluir información de ningún municipio.

8. Fuentes de información (primaria o secundaria)

 Para el objetivo 1:
La información proviene de fuentes secundarias, se describió en el punto anterior
Tamización y selección de artículos
Inicialmente se obtendrán los resultados de la búsqueda de las bases de datos,
los cuales serán cargados en el software Rayyan. A través de esta herramienta se
identificarán los artículos duplicados, que serán eliminados.
Posteriormente, se procederá a revisión de títulos y abstract a fin de clasificar en
incluidos los que cumplan con criterios del estudio, los rechazados como aquellos
que no están relacionados con el tema y los clasificados como “Maybe” que serán
aquellos en los que el abstract no aclara el alcance del artículo y que requieren un
proceso de tamización adicional.
Los artículos seleccionados como incluidos y maybe se descargarán en texto
completo.
Finalmente, los artículos incluidos se revisarán en texto completo, en donde se
realizará la última fase del tamización para dar selección a los que cumplan con
los objetivos del estudio y de esta forma proceder a la extracción de resultados.
 Para los objetivos 2 a 5:
Las fuentes de información corresponden esencialmente a fuentes secundarias de
información, las fuentes de información se describen en el cuadro de
operacionalización de variables para cada estudio. Bases de datos de SIVIGILA,
IDEAM y fuentes de información satelital de acceso abierto.
9. Variables
Para el objetivo 1.
Extracción de resultados
Para la presentación de los datos, la información contenida se consolidará en los
formatos de recolección de datos prediseñados (Anexo 2), los cuales incluirán
datos de identificación del articulo o documentos relacionados con la referencia
bibliográfica, frente al contenido, se especificará información relacionada con los
sujetos del estudio, mediciones, impactos del clima, entre otros. La matriz de
extracción de datos está disponible en el Anexo 2.
Para el objetivo 2 a 5:
Se anexa el archivo de Excel Anexo 3. Variables en el que se describe
Hoja 1. Caracterización de los casos
Hoja 2. Caracterización de casos de Leptospirosis
Hoja 3. Caracterización de los casos de accidente ofídico
Hoja 4. Estudio ecológico

Anexo 1. Nombre de los 125 municipios de Antioquia. DANE

PROVINCIA CODIGO MUNICIPIO Nombre Municipio
05120 CÁCERES Cáceres
05154 CAUCASIA Caucasia
05250 EL BAGRE El Bagre
BAJO CAUCA
05495 NECHÍ Nechí
05790 TARAZÁ Tarazá
05895 ZARAGOZA Zaragoza
05142 CARACOLÍ Caracolí
05425 MACEO Maceo
05579 PUERTO Berrío Puerto Berrio
MAGDALENA MEDIO
05585 PUERTO NARE Puerto Nare
05591 PUERTO TRIUNFO Puerto Triunfo
05893 YONDÓ Yondó
05031 AMALFI Amalfi
05040 ANORÍ Anorí
05190 CISNEROS Cisneros
05604 REMEDIOS Remedios
05670 SAN ROQUE San Roque
NORDESTE
05690 SANTO DOMINGO Santo Domingo
05736 SEGOVIA Segovia
05858 VEGACHÍ Vegachí
05885 YALÍ Yalí
05890 YOLOMBÓ Yolombó
 05038 ANGOSTURA Angostura
05086 BELMIRA Belmira
05107 BRICEÑO Briceño
05134 CAMPAMENTO Campamento
05150 CAROLINA Carolina
05237 DON MATiAS Don Matias
05264 ENTRERRIOS Entrerrios
05310 GÓMEZ PLATA Gómez Plata
NORTE 05315 GUADALUPE Guadalupe
05361 ITUANGO Ituango
05647 SAN ANDRÉS San Andrés
05658 SAN JOSÉ DE LA MONTAÑA San José De La Montaña
05664 SAN PEDRO San Pedro
05686 SANTA ROSA de osos Santa Rosa De Osos
05819 TOLEDO Toledo
05854 VALDIVIA Valdivia
05887 YARUMAL Yarumal
05004 ABRIAQUÍ Abriaquí
05044 ANZA Anza
05059 ARMENIA Armenia
05113 BURITICÁ Buriticá
05138 CAÑASGORDAS Cañasgordas
05234 DABEIBA Dabeiba
05240 EBÉJICO Ebéjico
05284 FRONTINO Frontino
05306 GIRALDO Giraldo
OCCIDENTE
05347 HELICONIA Heliconia
05411 LIBORINA Liborina
05501 OLAYA Olaya
05543 PEQUE Peque
05628 SABANALARGA Sabanalarga
05656 SAN JERÓNIMO San Jerónimo
05042 SANTAFÉ DE ANTIOQUIA Santafé De Antioquia
05761 SOPETRaN Sopetran
05842 URAMITA Uramita
ORIENTE 05002 ABEJORRAL Abejorral
05021 ALEJANDRÍA Alejandría
05055 ARGELIA Argelia
05148 CARMEN DE VIBORAL Carmen De Viboral
05197 COCORNÁ Cocorná
05206 CONCEPCIÓN Concepción
05313 GRANADA Granada
05318 GUARNE Guarne
05321 GUATAPE Guatape
05376 LA CEJA La Ceja
05400 LA UNIÓN La Unión
05440 MARINILLA Marinilla
05483 NARIÑO Nariño
05541 PEÑOL Peñol
05607 RETIRO Retiro
05615 RIONEGRO Rionegro
05649 SAN CARLOS San Carlos
05652 SAN FRANCISCO San Francisco
05660 SAN LUIS San Luis
 05667 SAN RAFAEL San Rafael
05674 SAN VICENTE San Vicente
05697 SANTUARIO Santuario
05756 SONSON Sonson
05030 AMAGa Amaga
05034 ANDES Andes
05036 ANGELOPOLIS Angelopolis
05091 BETANIA Betania
05093 BETULIA Betulia
05125 CAICEDO Caicedo
05145 CARAMANTA Caramanta
05101 CIUDAD BOLÍVAR Ciudad Bolívar
05209 CONCORDIA Concordia
05282 FREDONIA Fredonia
05353 HISPANIA Hispania
05364 JARDÍN Jardín
SUROESTE
05368 JERICÓ Jericó
05390 LA PINTADA La Pintada
05467 MONTEBELLO Montebello
05576 PUEBLORRICO Pueblorrico
05642 SALGAR Salgar
05679 SANTA BaRBARA Santa Barbara
05789 TÁMESIS Támesis
05792 TARSO Tarso
05809 TITIRIBÍ Titiribí
05847 URRAO Urrao
05856 VALPARAISO Valparaiso
05861 VENECIA Venecia
05045 APARTADÓ Apartadó
05051 ARBOLETES Arboletes
05147 CAREPA Carepa
05172 CHIGORODÓ Chigorodó
05475 MURINDÓ Murindó
URABA 05480 MUTATA Mutata
05490 NECOCLÍ Necoclí
05659 SAN JUAN DE URABA San Juan De Uraba
05665 SAN PEDRO DE URABA San Pedro De Uraba
05837 TURBO Turbo
05873 VIGÍA DEL FUERTE Vigía Del Fuerte
05079 BARBOSA Barbosa
05088 BELLO Bello
05129 CALDAS Caldas
05212 COPACABANA Copacabana
05266 ENVIGADO Envigado
VALLE DEL ABURRA
05308 GIRARDOTA Girardota
05360 ITAGUI Itagui
05380 LA ESTRELLA La Estrella
05001 MEDELLÍN Medellín
05631 SABANETA Sabaneta