Tarea de Biofísica - Efectos Estocásticos y Deterministas

Nombres:

Escobar Sherlyn
Males Josue
Carrasco Anabeth
Rodriguez Emilia

NRC:9677

Tema: Explorando los efectos estocásticos y deterministas en los sistemas biológicos

Descripción de la tarea: Como estudiantes de biofísica, se les promueve a investigar y

analizar los efectos estocásticos y deterministas en los sistemas biológicos. Esta tarea
requiere una comprensión profunda de los conceptos de estocasticidad y determinismo, así
como su aplicación en la biología y la física.

Instrucciones:

Investigue y describa los fundamentos teóricos de los efectos estocásticos y deterministas

en los sistemas biológicos. Explique cómo estos conceptos se relacionan con los procesos
biofísicos y la evolución de los organismos.

Los efectos estocásticos y deterministas son dos conceptos fundamentales en la comprensión

de los sistemas biológicos. En términos generales, los efectos estocásticos se refieren a los
fenómenos aleatorios o impredecibles que pueden ocurrir en un sistema, mientras que los
efectos deterministas se refieren a los fenómenos predecibles y gobernados por reglas o leyes
específicas. (Cardona Arboleda, O. D., 2001)

En los sistemas biológicos, los efectos estocásticos y deterministas desempeñan papeles

importantes en varios aspectos de la biología, incluyendo la expresión génica, la
diferenciación celular, el desarrollo embrionario, la respuesta a estímulos ambientales y la
evolución de los organismos.(Crespo Navia, S. R. , 2006)

En el nivel de la expresión génica, se ha demostrado que existen variaciones estocásticas en

la producción de proteínas a partir de los mismos genes en una población de células. Estas
variaciones estocásticas pueden deberse a factores aleatorios en la transcripción y traducción
de los genes. Estudios como el de Raj y van Oudenaarden (2008) han concluido que los
efectos estocásticos en la expresión génica pueden afectar la función celular y contribuir a la
diversidad fenotípica.(Raj, A., & Van Oudenaarden, A.,2008).

En el contexto de la diferenciación celular y el desarrollo embrionario, tanto los efectos

estocásticos como los deterministas desempeñan papeles importantes como la diferenciación
celular,en donde, las células madre pueden seguir diferentes trayectorias de diferenciación, y
esta decisión puede estar influenciada tanto por factores deterministas , como las señales
bioquímicas del entorno celular, como por factores estocásticos, como la aparte en la
expresión génica. Los efectos estocásticos en la expresión génica pueden modular la
diferenciación celular en el desarrollo embrionario de la mosca de la fruta. J., 2009)

En relación con la evolución de los organismos, los efectos estocásticos y deterministas

también juegan papeles cruciales. Los efectos estocásticos, como las reacciones aleatorias,
pueden generar genéticamente en una población, así el sustrato para la evolución por
selección natural. Además, los efectos deterministas, como la selección natural y la deriva
genética, pueden dar forma a la distribución y frecuencia de los alelos en una población a lo
largo del tiempo. (Nowak, M. A., 2006).

Seleccione y analice al menos dos ejemplos de sistemas biológicos en los que los efectos
estocásticos o deterministas sean prominentes. Puede considerar ejemplos como la
expresión génica, la señalización celular, la dinámica de poblaciones o cualquier otro
sistema biológico relevante. Discuta cómo los aspectos estocásticos y deterministas
influyen en el comportamiento y la función de estos sistemas.

Expresión génica

La expresión génica es un proceso intrínsecamente estocástico, con aleatoriedad en la

transcripción y traducción que conduce a variaciones de célula a célula en los niveles de
ARNm y proteínas. Esta variación es observable en una amplia gama de organismos, desde
microorganismos hasta organismos multicelulares, y su manifestación depende de los
parámetros biofísicos que rigen la expresión génica y la configuración de la red genética. La
expresión génica estocástica tiene consecuencias significativas en la función celular,
pudiendo ser beneficiosa o perjudicial según el contexto. Algunas situaciones en las que esto
se manifiesta incluyen la respuesta al estrés, el metabolismo, el desarrollo, el ciclo celular, los
ritmos circadianos y el envejecimiento. (Raj & van Oudenaarden, 2008)

El ARN desempeña un papel importante en la regulación de distintos procesos celulares y su

desregulación se relaciona con varias enfermedades, una de ellas es el cáncer. Ciertas
enfermedades están marcadas por la heterogeneidad fenotípica, que normalmente es
impulsada por la estocasticidad intrínseca de la expresión génica (Kumar, et ál., 2018)

Diferenciación celular

La diferenciación celular es un proceso importante en los organismos vivos. La

diferenciación se basa en gran medida en decisiones binarias, en las que las células madre
eligen uno de dos linajes específicos. La cinética de diferenciación tiene componentes tanto
deterministas como estocásticos. (Bose & Pal, 2017)

Generalmente la manera en que las células toman un destino particular es considerada

determinista, es decir, las células adquieren su destino en virtud de su linaje o de su
proximidad a una señal inductiva de otra célula en una dirección específica. Sin embargo, en
algunos casos, las células pueden elegir estocásticamente una u otra vía de diferenciación, sin
tener en cuenta el entorno o la historia, es decir, de manera aleatoria. (Losick & Desplan,
2008)

Los mecanismos intrínsecos podrían inducir la heterogeneidad de las células madre si estas
toman decisiones aleatorias en el momento de cada división celular. Por ejemplo, cada célula
madre puede elegir entre muchos destinos, incluida la autorrenovación, la diferenciación , la
apoptosis y la migración. La evidencia de procesos estocásticos, proviene del análisis de la
diferenciación de precursores de los linajes mieloide y linfoide. Un ejemplo son los
precursores mieloides multipotentes que generan precursores más restringidos de forma
aparentemente aleatoria. (Muller, et ál., 2002)

Dinámica de poblaciones

Estudios sugieren que la estructuración de las comunidades se rige por factores tanto
estocásticos, como deterministas. Se considera procesos estocásticos como el nacimiento, la
muerte, la colonización, la inmigración, la especiación y las limitaciones de dispersión. Por
otra parte, se cree que la composición de la comunidad también se rige por factores
deterministas como las interacciones entre especies (la competencia, sintrofia y depredación)
y la diferenciación de nichos. Existe una fuerte relación entre el medio ambiente y los rasgos
del taxón de acuerdo con la teoría tradicional basada en nichos. (Vanwonterghem, et al.,
2014)

Los procesos estocásticos son importantes en los modelos neutrales para que las comunidades
cambien con el tiempo, algunos parámetros pueden ser aleatorios mientras que otros pueden
no serlo. Estos procesos pueden provocar fluctuaciones aleatorias en el tamaño de la
población y afectar su viabilidad a largo plazo. La estocasticidad o aleatoriedad a menudo es
sólo una simplificación que hacemos cuando no podemos predecir exactamente el resultado
de un evento, suponiendo que algo es aleatorio nos permite describir convenientemente un
proceso en términos de probabilidad o posibilidad. (Harpole, 2010)

Compare y contraste los efectos estocásticos y deterministas en los sistemas biológicos.

Considere sus ventajas y limitaciones en la explicación de la variabilidad observada en
los fenómenos biológicos.

Las radiaciones ionizantes poseen diversas aplicaciones convenientes, pero logran provocar
efectos dañinos para la salud de las personas y el medio ambiente, los efectos biológicos
producidos por estos agentes y si ellos son benéficos o no para la salud humana constituye en
la actualidad una necesidad fundamental.
Los efectos estocásticos ocurren tras exhibiciones a dosis moderadas o bajas, los efectos
estocásticos no tienen umbral y son consecuencia del daño subletal en una o varias células
dañadas o muertas, este efecto estocástico son somáticos o hereditarios, son somáticos si se
manifiestan en el individuo expuesto y son hereditarios si se presentan en la descendencia del
individuo irradiado, el efecto estocástico somático es el cáncer y depende del tipo de célula
irradiada, el mecanismo del carcinógeno que lo induce y el tipo de cáncer que se origine.

Los efectos deterministas contienen una dosis umbral por debajo de la cual no se produce
dicho efecto, pero si se supera el efecto es seguro produciendo reacciones tisulares, los
efectos determinísticos son más importantes en los tejidos y órganos, se deben a lesiones
celulares y pérdida de capacidad reproductiva, ocurren en dosis mayores que el umbral y su
severidad se incrementa con el aumento de la dosis, para las radiaciones de alto LET los
efectos determinísticos son similares que los de bajo LET.

Algunas ventajas serían permitir generar variabilidad en los fenómenos biológicos, lo que
puede ser beneficioso en términos de adaptación y evolución.

Comparación de efectos estocásticos y deterministas en los sistemas biológicos

Estocásticos Deterministas

No tienen umbral Si tienen umbral

Somáticos y hereditarios Somático

Los principales efectos estocásticos son Reacciones tisulares

hereditarios y carcinogénesis

Independiente de dosis Dependiente de dosis

Subletal Letal

Dosis-Efecto probabilístico Dosis-Efecto lineal

La aparición es tardía La aparición es inmediata o tardía

Proponga un experimento o un modelo computacional que permita investigar la
interacción entre los efectos estocásticos y deterministas en un sistema biológico
específico. Describa los pasos necesarios para llevar a cabo el experimento o desarrollar
el modelo, y discuta las posibles implicaciones y resultados esperados.

Se propone investigar a un grupo de personas no infectadas y si infectadas con enfermedades

que intervienen las altas dosis de radiación, cada grupo será diagnosticado parvula riamente
con un listado de preguntas de las enfermedades o hasta dónde puede llegar las enfermedades
de las altas dosis de radiaciones ionizantes, cabe recalcar que una mínima dosis de radiación
ionizante mata a las células sanas y no va a ver una mayoría de reparación de células y si la
cantidad de radiación es alta, va a ocasionar graves enfermedades dado el caso que puede
aparecer lesiones tisulares y deterministas, Esta investigación que es propuesta tiene como
objetivo evitar y controlar las radiaciones ionizantes.

Un paso seria si las personas que están siendo sometidas al experimento o siendo
cuestionadas, si conocen qué reacciones pueden recibir o a paso del tiempo pueden llegar a
tener, de igual manera si las personas conocen que es estocástico o determinista, si en el caso
de no conocer sobre el tema, va a ver explicaciones del personal capacitado para que haya un
mayor entendimiento con las personas que son cuestionadas.

Si el personal trabaja en una empresa que emite radiaciones ionizantes, preguntarle que
medidas de precaución el usa para trabajar ahí, y si el personal se encuentra en un estado de
embarazo se tendría que comunicar a la empresa dado el caso que la persona embarazada
puede trabajar máximo con 1 mGy y mantener cuidados muy estrictos

Otro punto sería reconocer las altas dosis led que serias deterministas, indicando que las altas
dosis led está desarrollado por protones, neutrones y cargas múltiples y si es de bajas dosis
led es estocástico, determinando que las bajas dosis led está constituido por electrones,
partículas gamma y rayos X .

A las personas infectadas con enfermedades por altas dosis de radiaciones ionizantes, se
capacitará para poder controlar cada enfermedad tales como podria ser el cancer, el cancer se
le puede tratar con quimioterapia, cirugía y radioterapia, ese es nuestro punto principal
formalizar un enfoque positivo para las personas infectadas y no infectadas sobre las altas
dosis de radiación, sepan que se puede evitar y controlar.

Por último se les puede capacitar sobre el tema de que trata estocástico y determinista, se les
indicará que estocástico no contiene umbral, es dependiente de dosis, son somáticos y
hereditarios y de que trata determinista, de igual forma se indicará que determinista no tiene
umbral, solo son somáticos, son independiente de dosis y es letal.

El enfoque propuesto para investigar la interacción entre los efectos estocásticos y

deterministas en un sistema biológico específico presenta varias ventajas. En primer lugar,
permite evaluar cómo las dosis de radiación ionizante afectan tanto a personas sanas como a
aquellas ya infectadas con enfermedades relacionadas. Esto proporciona información valiosa
sobre las posibles consecuencias y la gravedad de estas enfermedades en presencia de altas
dosis de radiación. Sin embargo, también existen algunas limitaciones en este enfoque. En
primer lugar, los estudios en humanos con exposición controlada a altas dosis de radiación
plantean preocupaciones éticas y de seguridad, por lo que se requerirían protocolos estrictos
para garantizar la protección de los participantes. Además, el enfoque propuesto se centra en
la radiación ionizante y enfermedades específicas relacionadas, lo que limita su aplicabilidad
a otros sistemas biológicos y enfermedades no relacionadas con la radiación.

Sugerencias adicionales

Todo el personal que será sometido hacía el experimento tendrá que aceptar todas las
condiciones que será propuesto, así para tener un favorecido y controlada investigación

Resultados esperados:

Se da por determinado positivamente, el trabajo realizado con las personas que fueron
cuestionadas, dado el caso que el personal está altamente capacitado para evitar y controlar
las enfermedades por las exposición por altas dosis de radiaciones ionizantes.

Entrega: Prepare un informe detallado que incluya todas las secciones mencionadas
anteriormente. Su informe debe estar basado en evidencias científicas sólidas y citar las
fuentes utilizadas. Asegúrese de presentar sus ideas de manera clara y coherente, y utilice
terminología biofísica adecuada.

BIBLIOGRAFÍA

Bose, I., & Pal, M. (2017). Criticality in cell differentiation. Journal of biosciences, 42(4),
683–693. https://doi.org/10.1007/s12038-017-9721-6

Harpole, W. (2010). Teoría neutral de la diversidad de especies. Educación de la Naturaleza .

Kumar, N., Zarringhalam, K., & Kulkarni, R. V. (2018). Stochastic Modeling of Gene
Regulation by Noncoding Small RNAs in the Strong Interaction Limit. Biophysical journal,
114(11), 2530–2539. https://doi.org/10.1016/j.bpj.2018.04.044

Losick, R., & Desplan, C. (2008). Stochasticity and cell fate. Science (New York, N.Y.),
320(5872), 65–68. https://doi.org/10.1126/science.1147888

Müller-Sieburg, C. E., Cho, R. H., Thoman, M., Adkins, B., & Sieburg, H. B. (2002).
Deterministic regulation of hematopoietic stem cell self-renewal and differentiation. Blood,
100(4), 1302–1309.

Raj, A., & van Oudenaarden, A. (2008). Nature, nurture, or chance: stochastic gene
expression and its consequences. Cell, 135(2), 216–226.
https://doi.org/10.1016/j.cell.2008.09.050
Vanwonterghem, I., Jensen, P. D., Dennis, P. G., Hugenholtz, P., Rabaey, K., & Tyson, G. W.
(2014). Deterministic processes guide long-term synchronised population dynamics in
replicate anaerobic digesters. The ISME journal, 8(10), 2015–2028.
https://doi.org/10.1038/ismej.2014.50

Paulsson, J. (2005). Models of stochastic gene expression. Physics of Life Reviews, 2(2),
157-175.https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1571064505000138

Cardona Arboleda, O. D. (2001). Estimación holística del riesgo sísmico utilizando sistemas
dinámicos complejos. Universitat Politècnica de
Catalunya.https://upcommons.upc.edu/handle/2117/93531

Crespo Navia, S. R. (2006). Programa de prevención terciaria a través del ejercio físico para
adultos mayores-Aplicado en la Unidad de Fisioterapia de la Caja de Salud de la Banca
Privada Regional La Paz (Doctoral
dissertation).https://repositorio.umsa.bo/handle/123456789/28374

Raj, A., & Van Oudenaarden, A. (2008). Nature, nurture, or chance: stochastic gene
expression and its consequences. Cell, 135(2),
216-226.https://www.cell.com/fulltext/S0092-86740801243-9

de la Fuente, J. (2009). La obsesión por la imagen. Gazeta de Antropología,

25(2).http://www.ugr.es/~pwlac/G25_59Jose_delaFuente.pdf

Nowak, M. A. (2006). Evolutionary dynamics: exploring the equations of life. Harvard

university
press.https://books.google.es/books?hl=es&lr=&id=YXrIRDuAbE0C&oi=fnd&pg=PR9&dq
=+%22Evolutionary+Dynamics:+Exploring+the+Equations+of+Life%22+de+Nowak+(2006
)&ots=R4ZoX-AKy7&sig=GDnNErGQpsfiShfGd_rlkIBirjs