Ejercicios prácticos M5: Bioestadística con R Commander

Taller 2.10. EJERCICIOS ELECCIÓN TECNICA

ESTUDIO TRASPLANTE
Nos interesa estudiar qué factores pueden afectar el rechazo de un trasplante de hígado. Para ello,
disponemos información de 350 pacientes que se han sometido a un trasplante de hígado en dos
hospitales, durante el periodo 1997-2004, a los que se ha realizado un seguimiento post operatorio
de 6 años. Para investigar los factores asociados con el rechazo del trasplante contamos con
información tanto de los receptores como de los donantes.

Teniendo en cuenta que los pacientes fueron reclutados en dos hospitales diferentes, disponemos de
dos ficheros de datos en formato Excel, uno para los pacientes de cada hospital:
TRASPLANTE1.xlsx que dispone de n = 171 pacientes y TRASPLANTE2.xlsx con n = 179
pacientes. Ambos ficheros de datos recogen exactamente la misma información. A continuación, en
la siguiente tabla se resume los detalles acerca de las variables incluidas en las bases de datos:

Variable Descripción Formato

ID Número identificador XXX

TRASPLAN Status del trasplante 0 = No rechazo / 1 = Rechazo
SEXO_REC Género del receptor 1 = Mujer / 2 = Hombre
EDAD_REC Edad del receptor (años) XX
URGENCIA Urgencia del trasplante 1 = Muy Urgente / 0 = Programado
RETRASP Retrasplante 1 = Retrasplante / 0 = Único trasplante
T_FRIA Tiempo de isquemia fría (minutos) XXXX
T_CALIEN Tiempo de isquemia caliente (minutos) XXX
ALT_7D Ácido Alanine Transferase 7 días XXXX
después del trasplante
ALT_21D Ácido Alanine Transferase 21 días XXXX
después del trasplante
SEXO_DON Género del donante 1 = Mujer / 2 = Hombre
EDAD_DON Edad del donante (años) XX
ALT_DON Ácido Alanine Transferase del donante XXX
HOSPITAL Hospital de reclutamiento 1 = Hospital 1 / 2 = Hospital 2

1
Ejercicios prácticos M5: Bioestadística con R Commander

A partir de estos ficheros de datos realiza los siguientes ejercicios:

1. Dadas las dos fuentes de información, TRASPLANTE1.xlsx y TRASPLANTE2.xlsx,

impórtalas a R Commander y crea una única base de datos a la que llamaremos
TRASPLANTE.RData. Define de manera adecuada cada una de las variables de la base de
datos dependiendo de su naturaleza para que la base de datos esté lista para el análisis
estadístico. Explica los pasos que has seguido para realizar el ejercicio.

2. Crear las siguientes nuevas variables:

 Una nueva variable que clasifique a los receptores en los siguientes tres grupos de edad:
menor o igual de 45 años, mayor de 45 y menor de 55, y mayor o igual de 55 años. Esta
nueva variable la llamaremos EDAD3C. Explica los pasos que has dado para realizar el
ejercicio e indica cuantos pacientes hay en cada grupo de edad.

 Una nueva variable que indique la mejoría del nivel de Ácido Alanine Transferase de los
receptores del día 7 al día 21. Es decir, conocemos el nivel de esta variable en dos
momentos diferentes, día 7 y día 21, y sabemos que una menor puntuación es mejor.
Queremos saber cuál ha sido la mejoría o el cambio producido en ese periodo de 2
semanas, de forma que en esta nueva variable un valor positivo indique mejoría y uno
negativo indique empeoramiento. Explica los pasos que has dado para realizar el
ejercicio e indica cual es el valor mínimo y el máximo de la nueva variable.

3. Responde las siguientes preguntas:

 ¿Cuántos de los receptores de trasplante han sufrido rechazo? ¿Qué porcentaje suponen?

 ¿Qué porcentaje de los receptores y de los donantes son mujeres?

 ¿Cuál es la edad media y desviación estándar de los receptores?

 ¿Cuál es la edad media y su correspondiente intervalo de confianza del 95% de la edad de

los donantes?

 ¿Cuál es la mediana y el rango intercuartílico para el tiempo de isquemia fría y caliente?

 Describe gráficamente la variable EDAD3C.

4. Queremos estudiar si hay diferencias en el tiempo de isquemia fría dependiendo de si han

sufrido rechazo o no al trasplante. Para ello, estimar el valor medio del tiempo de isquemia fría
dependiendo del rechazo. Platea el contraste de hipótesis oportuno, escribiendo la hipótesis nula
y alternativa, y realiza el contraste mediante el programa estadístico. ¿Qué prueba has utilizado
para llevar a cabo este contraste de hipótesis? Describe los pasos que has dado para llevar a
cabo el ejercicio e interpreta los resultados obtenidos.

2
Ejercicios prácticos M5: Bioestadística con R Commander

5. Queremos estimar el nivel medio del cambio en el nivel de Ácido Alanine Transferase de los
receptores del día 7 al día 21. Además, queremos contrastar la hipótesis de si el nivel de la
mejoría se encuentra en 150 unidades. Plantea el contraste de hipótesis, describe los pasos que
has dado para realizarlo e interpreta los resultados.

6. Analiza si hay alguna relación entre el rechazo (variable TRASPLAN) y la variable urgencia del
trasplante mediante el análisis que consideres oportuno. ¿Existe asociación entre el hecho de
tener rechazo o no al trasplante y la urgencia del trasplante? ¿Qué prueba has utilizado para dar
respuesta a esta pregunta? Plantea el contraste de hipótesis, explica los pasos que has dado para
realizar el ejercicio e interpreta los resultados.

7. Analiza cómo influye la edad del paciente sobre el cambio en el nivel de Ácido Alanine
Transferase entre los 7 y los 21 días. ¿Podemos decir que la edad del paciente tiene algún efecto
estadísticamente significativo sobre mejoría del nivel de Ácido Alanine Transferase? Plantea el
análisis que consideres oportuno, describe los pasos que has dado para llevar a cabo el ejercicio
e interpreta los resultados obtenidos.

8. Queremos estudiar si hay diferencias en el cambio en el nivel de Acido Alanine Transferase que
los receptores han experimentado entre el día 7 y el 21 tras el trasplante dependiendo del grupo
de edad del receptor (EDAD3C). Para ello, estimar el valor medio de la mejoría del nivel de
Acido Alanine Transferase entre el día 7 y el 21 dependiendo del grupo de edad. Platea el
contraste de hipótesis oportuno, escribiendo la hipótesis nula y alternativa, y realiza el contraste
mediante el programa estadístico. ¿Qué prueba has utilizado para llevar a cabo este contraste de
hipótesis? Describe los pasos que has dado para llevar a cabo el ejercicio e interpreta los
resultados obtenidos.

9. Queremos estudiar si hay diferencias en el nivel de Acido Alanine Transferase del día 7 y el día
21 tras el trasplante. ¿Qué prueba has utilizado para llevar a cabo este contraste de hipótesis?
Plantea el contraste de hipótesis, describe los pasos que has dado para realizarlo e interpreta los
resultados.

10. Analiza cómo influyen conjuntamente el nivel del Ácido Alanine Transferase del paciente a los
21 días y la urgencia del trasplante sobre el rechazo del trasplante. ¿Podemos decir que el nivel
del Ácido Alanine Transferase a los 21 días tiene algún efecto estadísticamente significativo
sobre el rechazo al trasplante? ¿Y la urgencia del trasplante? Plantea el análisis que consideres
oportuno, describe los pasos que has dado para llevar a cabo el ejercicio e interpreta los
resultados obtenidos.