BIOINFORMATICA

 La bioinformática es una disciplina en

plena expansión. Daba La gran
cantidad de información sobre ácidos
nucleicos y péptidos que han sido
secuenciados es tan voluminosa, que
su análisis requiere el empleo de
medios informáticos para analizarlos
siendo de gran ayuda y utilidad para el
avance de la Biología Molecular.
Aplicaciones Básicas y Funcionales

BASE DE DATOS DE SECUENCIAS:

• Recogen secuencias de ADN genómico, clonado, ARNm,
etc. Secuencias Genéricas (GenBank, EMBL, DDBJ), y
secuencias Especializadas (GeneCards, Cosmic, HGVS).

ANALISIS DE SECUENCIA
• BLAST, consiste en la comparación de una secuencia
problema con todas las secuencias de una base de datos
nucleotídica para identificar la secuencia y detectar
variaciones o mutaciones

DISEÑO DE CEBADORES
• Primer3, herramienta popular para diseñar
cebadores, sondas PCR convencional y
tiempo real.
 BASE DE DATOS DE SECUENCIAS

GenBank Base de
datos de secuencia
de nucleótidos, en
mi caso quería ver el
Dog cocker.
 Canis lupus familiaris isolate 1 breed Cocker
Spaniel from Sweden mitochondrion, complete
genome
 ANALISIS DE SECUENCIA BLAST

Utilice la secuencia
mitocondrial anterior.
Es una secuencia
enorme de 16730
nucleótidos
 DISEÑO DE CEBADORES Primer3
 Introduje una secuencia
cualquiera del genoma
mitocondrial del cocker
 Utilidades
Base de Datos de Secuencias
Se Almacena y constantemente actualiza la
información referente a secuencias genómicas
en GenBank, un índice de artículos científicos
referentes a biomedicina, biotecnología,
bioquímica, genética y genómica en PubMed,
una recopilación de enfermedades genéticas
humanas en OMIM, además de otros datos
biotecnológicos de relevancia en diversas
bases de datos. Todas las bases de datos del
NCBI están disponibles en línea de manera
gratuita, y son accesibles
 Análisis de secuencias
 BLAST es usado para encontrar probables genes
homólogos. Por lo general, cuando una nueva secuencia es
obtenida, se usa el BLAST para compararla con otras
secuencias que han sido previamente caracterizadas, para
así poder inferir su función. El BLAST es la herramienta más
usada para la anotación y predicción funcional de genes o
secuencias proteicas.

Diseño de Cebadores
 El softwarw es muy útil ya que diseña el oligonucleótido que
puede usarse como sonda interna, y analizar cebadores ya
existentes.
 BIBLIOGRAFIA
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MW549038.1?report=fa
sta
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/DQ480495.1?report=fa
sta
 https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#alnHdr_91702479
 https://primer3.ut.ee/cgi-bin/primer3/primer3web_results.cgi
 https://es.wikipedia.org/wiki/Centro_Nacional_para_la_Inform
aci%C3%B3n_Biotecnol%C3%B3gica
 https://es.wikipedia.org/wiki/BLAST