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13652958, 2021, 6, Descargado de https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/mmi.14686 por Cochrane Colombia, Wiley Online Library el [22/03/2023]. Consulte los Términos y condiciones (https://onlinelibrary.wiley.com/terms-and-conditions) en Wiley Online Library para conocer las reglas de uso; Los artículos de OA se rigen por la Licencia Creative Commons aplicable
Recibido: 11 noviembre 2020 |Revisado: 18 enero 2021|Aceptado: 19 enero 2021
DOI: 10.1111/mmi.14686

ARTÍCULO DE INVESTIGACIÓN

PaeA (YtfL) protege del estrés de cadaverina y putrescina en


SalmonelaTyphimurium yE. coli

Yumi Iwadate|Rouhallah Ramezanifard|Yekaterina A. Golubeva|Lucas A. Fenlon|


James M. Slauch

Departamento de Microbiología, Universidad de


Illinois en Urbana-Champaign, Urbana, IL, EE. UU. Abstracto

SalmonelayE. colisintetizar, importar y exportar cadaverina, putrescina y espermidina para

Correspondencia mantener los niveles fisiológicos y proporcionar homeostasis del pH. Tanto los niveles
James M. Slauch, Departamento de intracelulares bajos como los altos de poliaminas confieren fenotipos pleiotrópicos o letalidad.
Microbiología, Universidad de Illinois en
Urbana-Champaign, 601 S. Goodwin Ave, Aquí, demostramos que la proteína de membrana interna PaeA (YtfL) previamente no
Urbana, IL, 61801, EE. UU. caracterizada es necesaria para reducir las concentraciones citoplasmáticas de cadaverina y
Correo electrónico: slauch@illinois.edu
putrescina. Nosotros identificamospaeacomo un gen implicado en la supervivencia de la fase
La dirección actual estacionaria cuando las células se cultivaron inicialmente en medio ácido, en el que producen
Luke A. Fenlon, Departamento de Medicina
Interna, Facultad de Medicina de la Universidad cadaverina. Elpaea el mutante también es sensible a la putrescina, pero no a la espermidina ni a
de Utah, Salt Lake City, UT, EE. UU. la espermina. La sensibilidad a la cadaverina externa en fase estacionaria solo se observa a pH >

Información de financiación
8, lo que sugiere que las poliaminas deben desprotonarse para difundirse pasivamente en el
Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades citoplasma celular. En ausencia de PaeA, los niveles de poliamina intracelular aumentan y las
Infecciosas, Número de concesión/premio: AI123381
células pierden viabilidad. La degradación o modificación de las poliaminas no es relevante. La

expresión ectópica del conocido exportador de cadaverina, CadB, en fase estacionaria suprime

parcialmente lapaeafenotipo, y la sobreexpresión de PaeA en fase exponencial complementa

parcialmente uncadBmutante cultivado en medio ácido. Estos datos apoyan la hipótesis de que

PaeA es un exportador de cadaverina/putrescina, reduciendo niveles potencialmente tóxicos

bajo ciertas condiciones de estrés.

PALABRAS CLAVE

cadaverina, poliaminas, putrescina,Salmonela, fase estacionaria

1|INTRODUCCIÓN que posteriormente se acidifican y maduran en fagolisosomas tras la


entrega o producción de varios efectores antimicrobianos, incluidos el
Salmonella entericaes un importante patógeno transmitido por los alimentos superóxido y el óxido nítrico (Slauch, 2011). No tenemos una comprensión
que causa aproximadamente 1,2 millones de infecciones cada año en los completa de los sistemas adicionales de tolerancia al estrés necesarios
Estados Unidos (Scallan et al., 2011). ingeridoSalmonelacolonizan el epitelio del paraSalmonelasobrevivir y replicarse dentro de los macrófagos.
intestino delgado e inducen diarrea inflamatoria e invasión bacteriana, lo que Las poliaminas se encuentran en los tres dominios de la vida. Interactúan

lleva a la diseminación sistémica (Darwin & Miller, 1999; Tsolis et al., 1999; Wallis con moléculas cargadas negativamente, como ácidos nucleicos y fosfolípidos.

& Galyov, 2000; Zhou & Galan, 2001). El mas serio SalmonelaLa enfermedad De hecho, se estima que más de la mitad de las poliaminas en la célula existen

resulta de esta infección extraintestinal (Feasey et al., 2012; Pegues & Miller, en complejos de poliamina-ARN (Miyamoto et al., 1993). Fisiológicamente, las

2010), cuyo sello distintivo es la capacidad deSalmonelapara sobrevivir en poliaminas se han implicado en numerosos procesos celulares en bacterias,

macrófagos (Burton et al., 2014; Fenlon & Slauch, 2014). Los macrófagos como el crecimiento en condiciones anaeróbicas, la síntesis de sideróforos, la

engullen bacterias en fagosomas, síntesis de peptidoglicanos, la formación de biopelículas,

Microbiología Molecular.2021;115:1379–1394. wileyonlinelibrary.com/journal/mmi |


© 2021 John Wiley & Sons Ltd 1379
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motilidad de enjambre, resistencia al estrés oxidativo y resistencia al estrés Salmonelano puede sintetizar espermina (Tabor & Tabor, 1985). La
ácido (Chattopadhyay et al., 2003, 2009; Kurihara et al., 2009a; Michael, 2018; cadaverina y la putrescina se pueden degradar a succinato a través de la
Park et al., 1996). Las poliaminas también afectan el ensamblaje de los vía de degradación de la lisina (Knorr et al., 2018; Schneider & Reitzer,
ribosomas, el inicio de la traducción y la fidelidad de la traducción (Igarashi & 2012). En contraste conmi.coli,Salmonella entericano tiene la segunda
Kashiwagi, 2015, 2018). De hecho, se ha propuesto que las alteraciones en los ruta de degradación de putrescina mediada por PuuABCD (Schneider &
niveles de poliamina afectan la traducción de un subconjunto de proteínas Reitzer, 2012). La espermidina se convierte en N-acetilespermidina
críticas para la fisiología celular general y la respuesta al estrés (Igarashi & mediante SpeG (Fukuchi et al., 1995), pero no se conoce ningún otro
Kashiwagi, 2015, 2018; Sakamoto et al., 2020). mecanismo de degradación.
La espermidina y la putrescina se encuentran ampliamente en las La cadaverina es exportada por el antiportador lisina:cadaverina CadB

bacterias (Michael, 2018).Salmonella entericayE. colise encuentran entre (Soksawatmaekhin et al., 2004), la putrescina es excretada por el antiportador

las bacterias que también producen cadaverina (Chattopadhyay et al., ornitina:putrescina PotE (Kashiwagi et al., 1997), y la espermidina es excretada

2009; Gale & Epps, 1944; Park et al., 1996).Salmonelatiene sistemas para la por MdtJI (Higashi et al., 2008). Más recientemente, Hassan et al. AceI

captación, exportación, síntesis y degradación de poliaminas (Figura 1). identificado enAcinetobacter baumanniicomo exportador de cadaverina/

Salmonelasintetiza cadaverina a partir de L-lisina mediante la lisina putrescina (Hassan et al., 2019). El homólogo putativo enSalmonela(

descarboxilasa LdcC expresada constitutivamente (Yamamoto et al., STM14_3648) no se ha caracterizado. El transportador ABC PotABCD importa

1997), o la CadA inducible por ácido (Gale & Epps, 1944; Park et al., 1996) preferentemente espermidina y también puede transportar putrescina

(ver más abajo). La putrescina se sintetiza a partir de larginina por SpeA y (Igarashi et al., 2001), mientras que el transportador ABC PotFGHI

SpeB oa partir de L-ornitina por SpeC o el inducible SpeF (Michael, 2016; aparentemente es específico para la putrescina (Igarashi et al., 2001). PlaP es un

Tabor & Tabor, 1985). La espermidina se sintetiza a partir de S-adenosil-L- simportador de putrescina:protón (Kurihara et al., 2011).Salmonelano codifica el

metionina descarboxilada y putrescina por SpeE (Bowman et al., 1973; importador de putrescina PuuP identificado enE. coli(Kurihara et al., 2009b).

Tabor & Tabor, 1987).

periplasma

Maceta GRAMOHIF aPAG


por favor PAG
opestaña CD SOY
Citoplasma
L-arginina

Habla

L-lisina L-ornitina agmatina

ldc CadA SpeF Especificaciones SpeB

SpeE
cadaverina putrescina espermidina

PatA
PatD SpeE SpeG
PatA
GabT
PatD
GabD Aminopropilo GabT N-acetilo
CsiID cadaverina GabD espermidina
LhgO

- cetoglutarato succinato
+ succinato
Citoplasma

dB
California PaéA S T M14_3 648? PAG
ote dtJI
METRO SOY
periplasma

FIGURA 1Vías conocidas del metabolismo de las poliaminas enSalmonella enterica. Las líneas azules representan vías sintéticas, las líneas verdes
representan vías de degradación o modificación y las líneas naranjas representan vías de transporte.
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En condiciones ácidas in vitro, el sistema de resistencia al estrés ácido un Δ en el marcomsracepa en medio LB de pH 5 no tamponado con nitrito

dependiente de lisina CadAB se induce transcripcionalmente. CadA (LB5N) o sin nitrito (LB5) y se midió su crecimiento y supervivencia. Como se

descarboxila la lisina para producir cadaverina, que es secretada por CadB muestra en la Figura 2b, c, todas las cepas mostraron un mayor retraso cuando

(Park et al., 1996). Durante este proceso, se consume un protón y se se cultivaron LB5N, pero no hubo una diferencia general en el crecimiento

produce un dióxido de carbono, y se secreta la diamina protonada, que hasta la fase estacionaria entre las cepas. Después de la entrada en fase

ayuda a neutralizar el pH citoplasmático (Park et al., 1996). Dentro del estacionaria, el Δpaeael mutante perdió viabilidad durante 24 horas cuando se

fagosoma del macrófago,Salmonelaestá expuesto a estrés ácido, pH 5 a cultivó en medio LB5. El efecto fue mayor cuando las células crecieron en LB5N.

5.5. sin embargo, elcadBAlos genes permanecen reprimidos y el No hubo efecto sobre la viabilidad en fase estacionaria cuando el paeael

citoplasma se vuelve ácido (Chakraborty et al., 2015). Mantener el mutante se cultivó en medio LB de pH 7 (LB7), con o sin nitrito (Figura 2d, e).

citoplasma ácido es importante para mejorar la regulación al alza Introducción de un plásmido de baja copia que codifica PaeA (pWKS30-paea) en

prolongada de lassrABsistema de dos componentes, que regula el sistema elpaeamutante complementó el defecto de supervivencia en LB5N (Figura 2f).

de secreción SPI2 tipo III y sus genes efectores (Chakraborty et al., 2015), Estas observaciones revelaron que paea,que codifica una supuesta proteína de

necesarios para la supervivencia en el fagosoma (Jennings et al., 2017). No membrana interna no caracterizada, es importante para la supervivencia en la

está claro si existen otras razones paraSalmonelapara reprimir los genes fase estacionaria cuando las células se cultivan en medio LB de pH 5,

responsables de la producción de poliaminas en el fagosoma, y si esto especialmente en presencia de nitrito.

afecta aún másSalmonelavirulencia. Aunque la pérdida de viabilidad en fase estacionaria en elpaeamutante

Estamos interesados en las rutas metabólicas importantes para la depende del crecimiento inicial a pH 5, este fenotipo se ve reforzado por el

supervivencia deSalmonelaen el fagosoma. Nos enfocamos en la región nitrito, lo que sugiere que el óxido nítrico podría estar involucrado en la

genómica que codificaytfL. Estudios previos enmi.colidemostró queytfK ySra. A, sensibilidad. Para probar esta hipótesis, determinamos si los secuestrantes de

codificado a ambos lados deytfLson importantes para la tolerancia al estrés óxido nítrico o las metionina sulfóxido reductasas, importantes para la

relacionado con nitratos y nitritos, respectivamente (Iwadate & Kato, 2017; St tolerancia al estrés por óxido nítrico (St John et al., 2001; Vine & Cole, 2011),

John et al., 2001). Se sabe que la adición de nitrito aumenta el estrés ácido tenían algún efecto sobre el fenotipo. Como se muestra en la Figura S1a,b,

(Muhlig et al., 2014). Eliminamos estos genes e investigamos la supervivencia de ninguno de los mutantes de deleción simple o quíntuple de los genes

mutantes en medio ácido con nitrito. Aunque ninguno de los mutantes mostró secuestradores de óxido nítrico,hmpA, norW, hcp, nrfA, ynirBD, ni los mutantes

defectos en el crecimiento, encontramos queytfL es responsable de la de deleción simple o cuádruple de los genes de metionina sulfóxido reductasa,

supervivencia de la fase estacionaria cuando las células se cultivan en medio msrA, msrB, msrC,ymsrpq, mostró pérdida de viabilidad en fase estacionaria en
ácido con nitrito. Análisis posteriores mostraron que, en el ytfLmutante, las estas condiciones, ni las mutaciones afectaron al fenotipo causado por la

poliaminas cadaverina o putrescina pueden acumularse en altas deleción depaeaen estos fondos. Las cepas que carecían de la óxido nítrico

concentraciones en el citoplasma, provocando la pérdida de viabilidad en la dioxigenasa HmpA, el eliminador primario de óxido nítrico en presencia de

fase estacionaria. La explicación más sencilla es que YtfL actúa como oxígeno (Gardner & Gardner, 2002), crecieron hasta una CFU más baja a las 12

exportador de poliaminas, aunque no podemos descartar algún efecto h después de la incubación en medio LB5N y, por lo tanto, la proporción de CFU

indirecto sobre las concentraciones de cadaverina/putrescina. Hemos (CFU en 36 horas después de la incubación/CFU a las 12 horas después de la

renombrado elytfL genepaea, paraPAG olya míomi exportar incubación) fue más alto que el de tipo salvaje, pero elpaeaderivado aún perdió

viabilidad en fase estacionaria. Estos resultados sugirieron que los

secuestrantes de óxido nítrico y las metionina sulfóxido reductasas no son


2| RESULTADOS responsables de la supervivencia en la fase estacionaria cuando las cepas se

cultivan en LB5N. Por lo tanto, aunque la adición de nitrito al medio mejora la


2.1| AΔpaeamutante pierde viabilidad en estacionario paeafenotipo en fase estacionaria (Figura 2b,c), parece ser un efecto indirecto y
cuando se cultiva en medio LB de pH 5 con nitrito no dependiente del óxido nítrico per se.

El óxido nítrico es producido por los macrófagos (MacMicking et al., 1997)


y se sabe que es importante para controlarSalmonelainfección
(Chakravortty et al., 2002; Vázquez-Torres et al., 2000). AmbosytfK ymsra 2.2|ElΔpaeael mutante es sensible al sobrenadante de
se han implicado en la resistencia a las especies nitrogenadas reactivas cultivos en fase estacionaria cultivados en medio LB
(Iwadate & Kato, 2017; St John et al., 2001). Elpaea(ytfL) el gen se pH5 con nitrito
encuentra entreytfKymsra(Figura 2a). Los datos transcriptómicos sugieren
quepaease transcribe tanto de su propio promotor como a través de la Luego abordamos la pregunta de por qué la pérdida de viabilidad en la fase

lectura delmsrapromotor, con un aumento en la transcripción cuando estacionaria en el Δpaeala tensión se observa sólo cuando las células se cultivan

Salmonelase está replicando en los macrófagos (Kroger et al., 2013; en LB5 pero no en LB7. Primero, preguntamos si la diferencia inicial en el pH de

Srikumar et al., 2015). En condiciones ácidas, el nitrito se convierte en los medios altera el pH en la fase estacionaria y, por lo tanto, la supervivencia

óxido nítrico in vitro (St John et al., 2001). Para ver el efecto de las del Δpaeacepa. Como se muestra en la Figura S2a–d, todos los cultivos de LB sin

eliminaciones depaeaoseñoraAsobre la sensibilidad al nitrito en tampón alcanzaron un pH de ~8,8 independientemente de la cepa, el pH inicial

condiciones ácidas, cultivamos de tipo salvaje, un Δpaea::Cm tensión, o o la presencia de nitrito. Esto es como se esperaba en LB,
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(a) ytfK paea (ytfL) msra

(b) 0 (C) 0
1 1.E +10
1 1.E +10

Tipo salvaje Tipo salvaje


10
1.E +099 ∆msra 100 9
1.E + 9
∆msra
∆paea
UFC 10
1.E +088
***
*** 100 8
1.E + 8 ***

UFC
10
1.E +077
100 7
1.E + 7

∆paea
10
1.E +066
100 6
1.E + 6

***

100+55
***
10+055
1.E 1.E

LB5 LB5N
10
1.E +044
100 4
1.E + 4

0 12 24 36 48 0 12 24 36 48
Tiempo (h) Tiempo (h)
(d) (mi)
1010 Tipo salvaje 10 1.E +10

Tipo salvaje
∆paea ∆paea
109 100+99
1.E

∆msra ∆msra
108 100 8
1.E + 8
UFC

UFC
107 100 7
1.E + 7

106 100 6
1.E + 6

105 100 5
1.E + 5

LB7 LB7N
104 0+044
1.E

0 12 24 36 48 0 12 24 36 48
Tiempo (h) Tiempo (h)

NS
(F) **
1.E1+10
0 10
1.E+09
1.E1+088
12h
LB5N
UFC

1.E+07
36h
1.E1+066

1.E+05
1.E1+044
peso ∆paea ∆paea
pWKS30 pWKS30 pagpaea

FIGURA 2El Δpaeamutante pierde viabilidad en fase estacionaria cuando crece en medio pH 5 LB. (a) Elpaealugar geométrico (a escala). (be) Las células se
cultivaron en pH 7 LB (LB7), pH 5 LB (LB5), o cada medio con nitrito 2 mM (LB7N, LB5N). Después de 12, 24, 36 y 48 horas, las diluciones apropiadas se sembraron
en placas de glucosa LB para determinar las CFU. Símbolos: cuadrados, tipo salvaje; círculos, Δpaea; triángulos, Δmsra. (f) Supervivencia en fase estacionaria de las
cepas indicadas que contienen el vector o pWKS30-paeaplásmido cultivado en LB5N. Los valores se informan como media±desviación estándar, dondenorte=3. Sin
emparejartlas pruebas comparan la cepa de tipo salvaje con Δpaeacepa o como se indica en el panel F. (NS No significativo, *pag< .05, **pag< .005, ***pag< .
0005). Cepas utilizadas: 14028, JS2430, JS2431, JS2452, JS2453 y JS2454

dado el hecho de que los péptidos son la principal fuente de carbono, lo que indicó que el ΔpaeaLa cepa es sensible a algún compuesto en el medio de
resulta en la liberación de amoníaco (Sezonov et al., 2007). Así, el efecto del pH cultivo producido cuando las células se cultivan en LB5N.
inicial del medio sobre la supervivencia de los Δpaeatensión en la fase Para comprender mejor la toxicidad del sobrenadante de cultivos LB5N en

estacionaria no se debe a ninguna diferencia en el pH del medio de la fase fase estacionaria, examinamos el efecto del pH del sobrenadante durante la

estacionaria. incubación en fase estacionaria. de tipo salvaje o ΔpaeaLas células en fase

En segundo lugar, preguntamos si era el crecimiento de Δpaeacepa en estacionaria cultivadas en LB7 se suspendieron en las soluciones

LB5N o el medio resultante que confirió pérdida de viabilidad en fase sobrenadantes de LB5N con pH ajustado y se incubaron durante 24 horas a 37

estacionaria. Para hacerlo, cambiamos las células y los medios de cultivos que °C. Como se muestra en la Figura 3c, el efecto tóxico del sobrenadante en el Δ

crecieron en LB7 o LB5N (Figura 3a). Como se muestra en la Figura 3b, el Δpaea paeaLa cepa se observó sólo cuando el pH estaba entre 8,5 y 9,5. También
las células perdieron viabilidad cuando se suspendieron en medio comprobamos si la toxicidad del sobrenadante es dosis-dependiente. Como se

acondicionado a partir de células cultivadas en LB5N, independientemente de si muestra en la Figura 3d, el efecto tóxico del sobrenadante LB5N se observó con

el Δpaealas células se cultivaron inicialmente en LB5N o LB7. Estos resultados poca pérdida de actividad cuando se diluyó al 20 %.
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FIGURA 3El Δpaeael mutante es sensible al (a) Sobrenadantes


sobrenadante de cultivos en fase estacionaria
desarrollados en medio LB de pH 5 con nitrito. (a) Crecimiento Crecimiento

El tipo salvaje y Δpaea las cepas se cultivaron Medio Medio


durante 12 h en LB7 o LB5N. Las células se LB7 LB5N
eliminaron por centrifugación y el sobrenadante
de los cultivos de tipo salvaje se filtró. Las células
peso peso
se lavaron y suspendieron en el sobrenadante
Células Células
indicado (tiempo 0) y se incubaron a 37 °C
durante 24 horas. Las UFC se determinaron a las
0 y 24 horas con los resultados que se muestran
en el panel B. (b) Las células son de tipo salvaje o
Δpaeacepa cultivada 12 h en LB7. El ∆paea ∆paea
sobrenadante proviene de un cultivo LB5N de Células Células

tipo salvaje que se mezcló 1:1 con solución salina


que contenía tampón MES 100 mM (pH 5,5 o 6,0),
12 horas 12 horas
tampón MOPS (pH 7,0, 8,0 u 8,5) o tampón CAPS Culturas
Células Flotante Células
Culturas
(pH 9,0 o 9,5) . Las UFC se determinaron a las 0 y 24 horas a 37°C
24 h. (c) El Δpaealas células se suspendieron en
solución salina tamponada con CAPS de pH 9,0 (b)1010
que contenía el porcentaje indicado de
Relación de UFC (24h / 0h)

sobrenadante LB5N de tipo salvaje. Símbolos: 100.1-1


cuadrados, tipo salvaje; círculos, Δpaea. Los
valores se informan como media±desviación 01.01-2

estándar, dondenorte=3. Sin emparejartlas ***

pruebas comparan la cepa de tipo salvaje con la 0.0101-3 ***


Δpaeacepa. Para panel D, emparejadotlas
0.00101-4
pruebas comparan cada condición con 0% de
LB7 LB5N LB7 LB5N Sobrenadante WT
sobrenadante (*pag< .05, **pag< .005,

+-+-+-+- paeaGenotipo de células


*** pag< .0005). Cepas utilizadas: 14028 y
JS2430 LB7 LB5N Condiciones de crecimiento celular

(C) (d)
1.E1
+ 0000 100
1.E-01 Tipo salvaje
1.E1-02-2 10-1
Relación de UFC (24h / 0h)

**
Relación de UFC (24h / 0h)

1.E-03
1.E1-04-4
** **
10-2
1.E-05
1.E1-06-6
∆paea 10-3
1.E-07 ** **
***
∆paea
1.E1-08-8 * ** *
1.E-09 10-4
5 6 7 8 9 10 0 20 40 60 80
pH % (v/v) de sobrenadante en tampón

en solución salina tamponada de pH 9. La actividad se redujo significativamente con el 10 % Tampón pH 9, en fase estacionaria Δpaeacélulas. Como se muestra en la
de sobrenadante y se perdió por completo con el 5 % de sobrenadante. Figura S3, la adición de lisina al cultivo inicial aumentó significativamente
la toxicidad del sobrenadante resultante. Ninguno de los otros 19
aminoácidos tuvo ningún efecto. Cuando se agregó lisina al medio
2.3|La toxicidad del sobrenadante depende de la acondicionado, en lugar del cultivo inicial, no se observó el aumento de la
producción de cadaverina inducible por ácido toxicidad del sobrenadante (Figura S3). Estos resultados implicaban que
un compuesto elaborado a partir de o con lisina es responsable de la
En un intento por determinar qué compuesto en el sobrenadante era toxicidad del sobrenadante.
responsable de la toxicidad, preguntamos si la suplementación con algún EnSalmonela, la lisina juega un papel importante en la tolerancia al
aminoácido en particular en el cultivo original afectaría la producción del estrés ácido; La descarboxilación de lisina en cadaverina mediada por
compuesto tóxico. Cultivamos células de tipo salvaje hasta la fase estacionaria CadA neutraliza el pH citoplasmático (Park et al., 1996). Presumimos que
en LB5N en la que agregamos uno de los 20 aminoácidos al 0,4%. Luego la adición de lisina en LB5N mejora la producción de cadaverina y este
probamos el efecto de los sobrenadantes resultantes, diluidos 1:20 en proceso es necesario o responsable de la acumulación de la
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1384 IWADATEET Al.

la cepa de tipo salvaje; la supervivencia de Δpaeacepa en presencia de


Relación de UFC (24h / 0h)
1010
cadaverina 0,75 mM igualó a la cepa de tipo salvaje en presencia de
cadaverina 7,5 mM. Estos resultados indicaron que la eliminación depaea
100. 1-1
aumenta drásticamente la sensibilidad a la cadaverina en fase
estacionaria. Estos resultados también apoyan la suposición de que se
0.1001-2
trata de cadaverina producida por tipo salvaje opaeacepas cultivadas en
*** ***
LB5N que es la sustancia tóxica en el sobrenadante del cultivo.
0.01001-3
peso ∆paea∆cadBA∆cadBA peso ∆paea∆cadBA∆cadBA Salmonelasintetiza putrescina y espermidina, así como cadaverina (Tabor &
∆paea ∆paea
Tabor, 1985). NiSalmonelanimi.colisintetizar espermina (Tabor & Tabor, 1985),
Sobrenadante de tipo salvaje ∆cadBAFlotante
pero pueden encontrar espermina en el medio ambiente. Determinamos si un Δ

paeaLa cepa es sensible específicamente a la cadaverina o, más ampliamente, a


FIGURA 4 ElcadBASe requieren genes para la toxicidad de
las poliaminas. Como se muestra en la Figura 5c, cuando la fase estacionaria de
flotante. Los sobrenadantes son de tipo salvaje o ΔcadBA cepa cultivada en
LB5N. Las cepas indicadas se cultivaron en LB7, luego, las células se tipo salvaje y Δpaeacepas fueron tratadas con putrescina a pH 9, el ΔpaeaLa

suspendieron en un total de 5 ml de tampón CAPS (pH 9,0) que contenía el cepa mostró una pérdida dramática de viabilidad en relación con el tipo salvaje
sobrenadante indicado (4 ml) y se incubaron a 37 °C durante 24 h. Los valores de una manera dependiente de la concentración. De manera análoga a lo que
se informan como media±desviación estándar, donde norte=3. Sin emparejart
se observó con cadaverina, la cepa de tipo salvaje también fue sensible a la
las pruebas comparan las cepas de tipo salvaje e indicadas en la misma
putrescina, pero solo a concentraciones más altas. Estos resultados indican que
condición (*pag< .05, **pag< .005, ***pag< .0005). Cepas utilizadas: 14028,
lapaeael mutante muestra una mayor sensibilidad tanto a la cadaverina como a
JS2430, JS24304 y JS2456
la putrescina en concentraciones similares y en grados similares.
compuesto tóxico en el sobrenadante. Por lo tanto, hicimos un ΔcadBA cepa y

comprobaron la toxicidad del sobrenadante tras el crecimiento de esta cepa en En contraste con lo observado anteriormente, el tipo salvaje y Δpaealas
LB5N. Como se muestra en la Figura 4, el sobrenadante de la ΔcadBAel cultivo cepas fueron igualmente sensibles a la espermidina y la espermina de una
no tuvo ningún efecto sobre la supervivencia del Δpaeatensión en fase manera dependiente de la concentración, siendo la sensibilidad
estacionaria. Tenga en cuenta que el ΔcadBAΔpaeacepa permaneció sensible al aproximadamente igual en grado a la observada con la cepa de tipo salvaje
sobrenadante del cultivo de tipo salvaje. Por lo tanto, el sistema CadAB se tratada con cadaverina (Figura 5d,e). Estas observaciones se correlacionan con
requiere para la producción del compuesto tóxico, pero no está involucrado en las similitudes y diferencias estructurales en estos cuatro compuestos (Figura
la sensibilidad de un Δpaeamutante per se. 5f), y sugieren que elpaeamutante no es simplemente sensible a las poliaminas,
Los resultados anteriores sugieren que la cadaverina, producida y sino más específicamente a la cadaverina y la putrescina.
exportada por CadAB, es tóxica para el Δpaeamutante en fase estacionaria. Por El efecto tóxico del sobrenadante en Δpaeadependía del pH
lo tanto, medimos los niveles de poliamina en los cultivos mediante LC/MS (Figura 3b). Probamos si la toxicidad de la cadaverina también
(Figura S4a). Las células produjeron muy poca espermidina, depende del pH. Como se muestra en la Figura 5g, el ΔpaeaLa cepa
independientemente de las condiciones de cultivo o del tiempo de incubación. es sensible a la cadaverina solo cuando el pH de la solución osciló
La producción de putrescina osciló entre 0,3 y 0,6 mM, de nuevo en gran entre 8,5 y 9,5. La sensibilidad muy reducida de la cepa de tipo
medida independiente del pH del medio. Por el contrario, la cadaverina fue salvaje también dependía del pH, solo se observó a pH 9,5. En
inferior a 0,5 mM en LB7, pero aumentó a >2 mM en LB5 con un aumento ausencia de cadaverina, las tasas de supervivencia del Δpaeay las
adicional cuando las células se cultivaron en LB5N durante 24 horas. Este cepas de tipo salvaje en soluciones de pH creciente eran
aumento de la producción dependía de CadAB. indistinguibles. Así, como se vio para los sobrenadantes tóxicos, la
sensibilidad a la cadaverina depende del pH.
También medimos las sensibilidades de tipo salvajeE. colicepa
2.4|ElΔpaeala cepa es sensible a la cadaverina y la MG1655 y un Δpaeacepa a cadaverina y putrescina. Como se muestra en
putrescina, pero no a la espermina ni a la espermidina a pH 9 la Figura complementaria S5, la eliminación depaeaenE. coliresultó en una
mayor sensibilidad a la cadaverina y la putrescina, pero no a la
Para probar directamente la hipótesis de que Δpaeason sensibles a la espermidina y la espermina. Estos resultados sugieren que se conserva la
cadaverina en fase estacionaria, agregamos cadaverina en varias función de PaeA en la tolerancia a las poliaminas.
concentraciones al tampón de pH 9 y monitoreamos la viabilidad del tipo Proponemos que la dependencia del pH está relacionada con el pKa
salvaje y Δpaeacepa. Como se muestra en la Figura 5a, el Δpaea la cepa fue de los grupos amino de cadaverina (pKa = 10,25 y 9,13). Bajo estas
sensible a cadaverina 0,5 mM. La sensibilidad aumentó de manera dependiente condiciones básicas, una fracción de los grupos amino de la cadaverina se
de la concentración, alcanzando un máximo en concentraciones de cadaverina desprotona, lo que la deja sin carga y permeable a la membrana.
de 2,5 mM o superiores con una pérdida logarítmica de 8 en la viabilidad. Este Teóricamente, a pH 9, se desprotona el 2,7% de la cadaverina. A medida
fenotipo se complementó cuando PaeA se expresó a partir de un plásmido que la cadaverina ingresa al citoplasma bacteriano, se protonaría y
(Figura 5b). La cepa de tipo salvaje también mostró sensibilidad a la cadaverina cargaría. Si es cierto, esto implica que (1) la toxicidad es causada por
en fase estacionaria, pero solo a concentraciones más altas. De hecho, el Δpaea cadaverina en el citoplasma y (2) el transporte al citoplasma es pasivo. La
cepa es ~ 10 veces más sensible en comparación con putrescina se comportaría de manera similar.
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(a) (b)
100 100 ∆paeapagpaea
1.E-01 cadaverina
1.E-1002-2 1.E-1001-1 pWKS30 de tipo salvaje

Relación de UFC (24h / 0h)


Relación de UFC (24h / 0h)
1.E-03
***
*

Relación UFC (24h/0h)


1.E-1002-2
1.E-1004-4

Relación de UFC (24h/0h)


1.E-05 ** Tipo salvaje 1.E-1003-3 *
1.E-1006-6 **
1.E-07 ** 10-4
*** 1.E-04 ** ∆paeapWKS30
1.E-1008-8
***
** * ∆paea
10-5 cadaverina
1.E-09 1.E-05
0 2.5 57.5 10 0 0.25 0.5 0.75 1
Cadaverina (mM) Cadaverina (mM)
(C) (d
1.E+10000 1.)E+1000 0

1.E-01 * putrescina 1.E-01 espermidina


*
1.E-1002-2 1.E1
- 002-2
Relación de UFC (24h / 0h)

Relación de UFC (24h / 0h)


1.E-03 1.E-03
10-4
1.E-04
***
Tipo salvaje 1.E1 *

Relación UFC (24h/0h)


- 004-4

1.E-05 *** 1.E-05 * Tipo salvaje


1.E-1006-6 1.E1
*** ***
- 006-6
∆paea
1.E-07 ** ∆paea 1.E-07
1.E-1008-8 1.E1
- 008-8

1.E-09 1.E-09
0 2.5 5 7.5 10 0 2.5 5 7.5 10
(mi) Putrescina (mM) Espermidina (mM)
1.E+10000
(F)
H2norte NUEVA HAMPSHIRE2
1.E-01 espermina cadaverina
Relación de UFC (24h / 0h)

1.E-1002-2

1.E-03 hn
NUEVA HAMPSHIRE
2
Relación UFC (24h/0h)

1.E-1004-4 putrescina
2

1.E-05 Tipo salvaje H


1.E-1006-6 ∆paea norte
NUEVA HAMPSHIRE2

H2norte
1.E-07 espermidina
1.E-1008-8 H
1.E-09 norte
NUEVA HAMPSHIRE2

0 2.5 5 7.5 10 hn2 norte

Espermina (mM) Hespermina


(gramo) (h)
1.E+10000 1.E+10000
1.E-01 1.E-01
Relación UFC (24h/0h)

Relación de UFC (24h / 0h)

1.E-1002-2 Tipo salvaje 1.E-1002-2


Relación UFC (24h/0h)

**
Relación de UFC (24h / 0h)

1.E-03 1.E-03
1.E-1004-4 *** 1.E-1004-4
1.E-05 1.E-05
1.E-1006-6 1.E-1006-6
1.E-07 1.E-07 Tipo salvaje
1.E-1008-8
cadaverina ∆paea 1.E-1008-8
Sin poliaminas ∆paea
1.E-09 *** 1.E-09
5 6 7 8 9 10 5 6 7 8 9 10
pH pH

FIGURA 5El Δpaeamutante es sensible a cadaverina y putrescina, pero no a espermidina y espermina. Las cepas indicadas se cultivaron durante 12 h en
LB7, luego se suspendieron en 5 ml de tampón CAPS (pH 9,0) que contenía la cantidad indicada de (a y b) cadaverina, (c) putrescina, (d) espermidina o (e)
espermina y se incubó a 37°C durante 24 horas. (f) Estructura de cadaverina, putrescina, espermidina y espermina. ( g ) El efecto del pH en la
supervivencia del tipo salvaje y Δpaeacepas mutantes en presencia de cadaverina 0,625 mM y (h) en ausencia de cadaverina. Símbolos: cuadrados
abiertos, tipo salvaje; círculos abiertos, Δpaea; cuadrados cerrados, vector pWKS30 que alberga de tipo salvaje; círculos cerrados, Δpaeaque alberga el
vector pWKS30; triángulos cerrados, ΔpaeaalbergandopaeapWKS30-placZ-paea. Los valores se informan como media±desviación estándar, dondenorte=
3. Sin emparejartlas pruebas comparan el tipo salvaje y Δpaeapresiones (*pag< .05, **pag< .005, ***pag< .0005). Cepas utilizadas: 14028, JS2430, JS2452,
JS2453 y JS2454

2.5|Evidencia de cadaverina o putrescina citoplásmica introducción de un pWKS30-cadBplásmido en un ΔpaeaLa cepa suprimió


alta como base para la toxicidad parcialmente su sensibilidad a la cadaverina en comparación con la Δpaea
cepa que alberga el vector pWKS30. La supresión de la cadBAgenes en el Δ
Para distinguir aún más si PaeA protege a la célula de la cadaverina paeamutante resultó en una mayor sensibilidad a la cadaverina (Figura
citoplasmática o de la cadaverina extracitoplasmática, verificamos si S6b). Introducción del pWKS30-cadB plásmido suprimió esta sensibilidad
la expresión exógena de la bomba de salida de cadaverina CadB adicional en el Δpaeacepa (Figura S6b). Estos resultados apoyan la
suprime la sensibilidad. Como se muestra en la Figura S6a, el conclusión de que la célula es
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sensible a la cadaverina intracelular. La pérdida del exportador de cadaverina CadB PaeA podría desempeñar algún papel en la degradación de
aumenta la sensibilidad, mientras que la expresión ectópica de CadB suprime cadaverina. El Salmonelael genoma codifica ortólogos paraE. coliproteínas
parcialmente la sensibilidad. PatA, PatD, GabT, GabD, CsiD y LhgO, que se sabe que están involucradas
PaeA protege el citoplasma de cadaverina y putrescina. Presumimos varios en la degradación de cadaverina a succinato (Knorr et al., 2018) (Figura 1).
mecanismos para la tolerancia a la cadaverina. PaeA podría (1) prevenir el flujo Construimos un ΔpatAΔPatDΔcsiD-csiRcepa (Δdeg) que carece de todos los
de entrada, (2) promover el flujo de salida, (3) promover la degradación o genes involucrados en la degradación de cadaverina y monitoreó la
modificación, (4) o afectar la toxicidad per se. Nos propusimos probar estas sensibilidad a cadaverina en esta cepa y en un isogénicopaeamutante
diversas hipótesis. Como se muestra en la Figura S8, la cepa Δdeg fue resistente a cadaverina
La dependencia del pH de la sensibilidad tanto a la cadaverina como a 1 mM. Esto muestra que no es simplemente la degradación de cadaverina
la putrescina implica que se requiere la desprotonación del compuesto. La lo que protege a las células de tipo salvaje. Eliminación depaeaen el fondo
interpretación más sencilla es que se requiere la desprotonación de las de degradación defectuosa confirió sensibilidad. Cabe señalar que Δdeg Δ
poliaminas para su entrada pasiva en la célula a través de la membrana paea cepa exhibió una mayor sensibilidad a cadaverina que Δpaeacepa
citoplasmática. Aunque teóricamente es posible que PaeA bloquee de (Figura S8). Presumiblemente, esto se debe a que la concentración de
alguna manera esta entrada pasiva, es difícil imaginar un mecanismo cadaverina es mayor en ausencia de degradación.
molecular para tal acción. A continuación, examinamos si la modificación de cadaverina o
Una vez dentro de la célula, las poliaminas se protonarían. Luego podrían putrescina está involucrada en la tolerancia dependiente de PaeA. Se sabe
ser bombeados fuera del citoplasma. Una consecuencia potencial es un que la putrescina se convierte en espermidina por la propilamina
aumento del pH citoplasmático, que podría ser tóxico. De hecho, el aumento transferasa SpeE (Bowman et al., 1973); SpeE también puede convertir
del pH citoplasmático es la razón por la cual la cadaverina normalmente se cadaverina en aminopropilcadaverina (Bowman et al., 1973). El donante
produce y bombea en condiciones ácidas (Park et al., 1996). Un argumento en de propilamina, S-adenosilmetionina descarboxilada, lo fabrica SpeD
contra de este mecanismo de toxicidad es el hecho de que la sobreproducción (Markham et al., 1982; Tabor & Tabor, 1987). SpeG puede modificar aún
del exportador cadaverino CadB suprime la sensibilidad en elpaeamutante más la espermidina a N-acetilespermidina (Fukuchi et al., 1994; Matsui et
(Figura S6). Si la pérdida de protones del citoplasma fuera tóxica, el CadB al., 1982). Construimos un ΔvelocidadΔspeGcepa que carece de esta vía de
debería exacerbar la sensibilidad. Para probar más directamente los efectos de modificación de poliaminas y determinó el efecto de la eliminación de la
la cadaverina, monitoreamos el pH intracelular de tipo salvaje y Δpaeacepas paeagen en este fondo sobre la sensibilidad a la cadaverina. Como se
durante el tratamiento con cadaverina. Utilizamos una proteína fluorescente muestra en la Figura S8, la eliminación depaeaen el dvelocidadΔspeGLa
verde (GFP) que responde al cambio de pH (Arce-Rodriguez et al., 2019). cepa aún aumentó la sensibilidad a la cadaverina, lo que sugirió que no se
Confirmamos la respuesta al pH incubando las células en soluciones salinas requiere la vía de modificación de la cadaverina y la putrescina. En
tamponadas a varios pH en presencia de ácidos y bases permeables a las conjunto, estos resultados muestran que PaeA actúa independientemente
células, equilibrando así el pH intracelular y extracelular. Como se muestra en la de las vías conocidas de degradación o modificación, y sugieren que la
Figura S7a, la GFP sensible al pH expresada en tipo salvaje y Δpaealas cepas cadaverina (o putrescina) per se es tóxica.
cambian uniformemente la fluorescencia en respuesta al pH. Como se muestra

en la Figura S7b, la incubación de tipo salvaje o Δpaealas cepas en tampón de

pH 9 durante 24 h aumentaron el pH intracelular de ~7,4 a 7,6. Las células 2.6|PaeA está involucrada en el eflujo de
permanecieron viables durante este período de tiempo. La adición de cadaverina y putrescina
cadaverina 0,2 mM no afectó la viabilidad ni el grado de alcalinización del

citoplasma durante este tiempo (Figura S7b,c). Cuando de tipo salvaje y Δpaea El locus STM14_3648 codifica una supuesta proteína de membrana interna
Las cepas se incubaron en presencia de cadaverina 0,5 mM durante 12 horas, la no caracterizada homóloga a la familia PACE de bombas de salida de
ΔpaeaLa cepa mostró una pérdida de viabilidad del ~75 %, mientras que el pH múltiples fármacos. Hasan et al. informó recientemente que las
intracelular fue de ~7,7, en comparación con un pH de ~7,6 observado en el tipo poliaminas eran el sustrato fisiológico para laAcinetobacterhomólogo AceI
salvaje en las mismas condiciones. El pH intracelular del Δpaeala tensión (Hassan et al., 2019). Aunque demostraron que laSalmonelaproteína no
finalmente alcanzó ~7,8 después de 24 horas. Tenga en cuenta que es difícil redujo los niveles de cadaverina cuando se expresó enE. coli, eliminamos
determinar la contribución de las células muertas a este cambio general en la STM14_3648 y probamos el efecto en nuestro ensayo. Como se muestra
fluorescencia. Sin embargo, dado que el pH intracelular en la mayoría de los en la Figura S9, la eliminación de STM14_3648 no tiene efecto sobre la
cultivos estaba finalmente por encima de 7,6 sin ninguna pérdida significativa tolerancia a la cadaverina ni en elpaea+o Δpaeaantecedentes.
de viabilidad, parece poco probable que el pequeño aumento del pH Para probar si PaeA está involucrada en la salida de poliaminas, medimos el

intracelular observado en el Δpaea cepa podría explicar la toxicidad de la nivel intracelular de cadaverina o putrescina después de un corto período de

cadaverina. Además, en el cultivo de tipo salvaje en el que las células tratamiento. Para evitar la complicación de la degradación, utilizamos la tensión

permanecieron viables, la adición de cadaverina no afectó significativamente el Δdeg. Cuando el Δdeg y Δdeg Δpaeacepas se trataron con cadaverina o

pH intracelular en comparación con el tampón solo. Teniendo en cuenta todos putrescina 5 mM, lapaeamutante comenzó a perder viabilidad después de 3 h.

nuestros resultados, concluimos que la sensibilidad a la cadaverina no se debe Sin embargo, hubo poca pérdida de viabilidad después de 1 h (Figura 6a). Por lo

a ningún efecto de la poliamina sobre el pH intracelular. tanto, recolectamos células 1 hora después del tratamiento. Las células tratadas

se lavaron y totalizaron cadaverina intracelular y


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(a) (b)
1.E1
+010
10 60
1.E+09
∆grados de control
**
** ∆grados∆ de controlpaea 50 cadaverina
18
1.E+08
** ***

Contenido de poliamina en las células a 1h


1.E+07 ****** cadaverina ∆grados
40 putrescina

n mol / mg peso seco


1.E1
+ 06
6 putrescina ∆grado

30 *
UFC

***
1.E+05
1.E1 4
+ 04
20
1.E+03
* putrescina
1.E1 2
+ 02 ∆grados∆paea
10
Cadaverina ∆grados∆paea
1.E+01 Tratamiento 24h
1.E1
+ 000 0
0 6 12
Tiempo (h)
18 24 +-+-+-+- paea
Antes Control cadaverina putrescina
tratamiento Agregado Agregado

(d) (mi)
Washingtons h
(C) ∆grados de control
1010
1.E+10 35 35
∆grados∆ de controlpaea
1.E+09 * 30 30
1.E+1088 ** ** cadaverina ∆grados

en cultivo completo (µM)


* * ** *

en cultivo completo (µM)


putrescina

Contenido de cadaverina
∆grado
1.E+07 25 25

Contenido de putrescina
1.E+1066 *** 20 20
UFC

1.E+05
1 4
1.E+04
* putrescina ∆grados∆paea
15 15
1.E+03 Cadaverina ∆grados∆paea 10 10
***
1.E+1022 5 5
1.E+01 1h Tratamiento
0 0
1.E+1000
0 6 12 18 24
Tiempo (h)

paea+ paea+

FIGURA 6Las concentraciones intracelulares de cadaverina y putrescina aumentan en el Δpaeamutante después de un tratamiento breve con cadaverina
o putrescina. Elpaea+o Δpaeacepas que carecen de todos los genes conocidos para la degradación de cadaverina y putrescina
(Δgrado = ΔpatAΔPatDΔcsiD-R) se cultivaron durante 12 h en LB7, luego se suspendieron en 5 ml de tampón CAPS (pH 9,0) con o sin 5 mM de cadaverina o
putrescina y se incubaron a 37 °C. (a) Las UFC se determinaron en los puntos de tiempo indicados. (b) El contenido intracelular de cadaverina y putrescina se
determinó en el punto de tiempo de 1 hora. La espermidina fue < 0,15 nmoles mg–1y la espermina fue < 0,25 nmoles mg–1en todas las celdas. Estos datos se
vuelven a trazar en la Figura S10. (c) Una hora después del tratamiento inicial, las células se lavaron y se resuspendieron en 5 ml de tampón CAPS (pH 9,0) y se
determinaron las CFU en los puntos de tiempo indicados. (d) Contenido de cadaverina en cultivos completos de tipo salvaje (medio y células) inmediatamente
después de retirar cadaverina o (e) putrescina, y después de 24 horas de incubación. Símbolos: Cuadrados, Δdeg; círculos, Δgrado Δpaea; marcadores rellenos de
negro con líneas negras, control; marcadores abiertos con líneas discontinuas, tratamiento cadaverino; rotuladores rellenos grises con líneas grises, tratamiento de
putrescina. Los valores se informan como media±desviación estándar, dondenorte=3. Sin emparejartlas pruebas comparan las cepas indicadas con la cepa original
en el mismo tratamiento (*pag< .05, **pag< .005, ***pag< .0005). Cepas utilizadas: JS2464 y JS2465

putrescina fueron medidos por LC/MS. También continuamos monitoreando la y de acuerdo con la Figura 6, el tratamiento con cadaverina 5 mM resultó en un

viabilidad en estas células después de eliminar la poliamina extracelular. Como aumento de 16 veces en cadaverina asociada a células en el Δpaeaversuspaea+
se muestra en la Figura 6b, elpaeacepa tenía un nivel 24 veces mayor de células. Incluso cuando tratamos elpaea+células con cadaverina 50 mM, los

cadaverina en comparación con la isogénicapaea+cepa. En las células tratadas niveles estaban por debajo de los observados a 5 mM en el Δpaeacepa. Niveles

con putrescina, el Δpaeacepa mostró un nivel de putrescina 16 veces mayor en en el ΔpaeaLas cepas mostraron una caída inicial en las concentraciones de

comparación con la isogénicapaea+cepa (Figura 6b). La figura S4b muestra que cadaverina celular inmediatamente después de lavar las células. Sin embargo, a

el ΔpaeaLa cepa también tenía niveles más altos de cadaverina intracelular las 3 h, los niveles intracelulares se mantuvieron constantes y

después del crecimiento en LB5 o LB5N. Como se muestra en la Figura 6d,e, significativamente más altos que los delpaea+células tratadas con cadaverina 5

tanto elpaea+y ΔpaeaLas cepas mostraron niveles generales similares de mM. Incluso a 50 mM de cadaverina, los niveles en elpaea+

cadaverina y putrescina en los cultivos totales después de lavar y suspender las las células cayeron a un nivel de referencia aparente. Proponemos que la caída del

células en tampón de pH 9. Estos resultados sugieren que PaeA no está contenido de cadaverina intracelular inmediatamente después del lavado se deba a

involucrada en la degradación o modificación de cadaverina y putrescina, sino una pérdida inespecífica. El hecho de que las concentraciones intracelulares

que aumenta la salida de cadaverina y putrescina del citoplasma. permanezcan altas en elpaeamutante es consistente con un papel de PaeA en el flujo

La Figura 6c muestra que las células tratadas continuaron perdiendo de salida de cadaverina. El hecho de que elpaea+las células tratadas con cadaverina 50

viabilidad después de eliminar cadaverina o putrescina extracelular. O el daño mM continuaron perdiendo viabilidad al mismo ritmo que el Δpaea las células tratadas

letal se había producido en 1 h o la concentración intracelular permaneció alta. con 5 mM sugieren que las altas concentraciones iniciales pueden causar daños que

Supervisamos la cadaverina intracelular a lo largo del tiempo después del finalmente son letales.

tratamientopaea+o Δpaeacepas con varias concentraciones de cadaverina y Luego preguntamos si la expresión ectópica de PaeA suprime el defecto de

lavando las células después de 1 h. Como se muestra en la Figura S11c crecimiento conferido por cadaverina producida endógenamente.
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(a) LB7 (b) LB5 (C) LB5N


101 101 101
pWKS30 de tipo salvaje
****

pW de tipo salvaje KS30 pW de tipo salvaje KS30


∆cadBApag WKS30

sobredosis600
sobredosis600

sobredosis600
10
10 ∆cadBApW KS30 1010 ∆cadBApWK S30 1010
∆cadBpWK S30 ∆cadBpWKS 30
*** ∆cadBpW KS30
∆cadB∆paea ∆cadB∆paea
∆cadB∆Pensilvania eApWKS30
***
pWKS30 pWKS30 ***
******
010.1
-1 01.01-1 01.01-1 ***
0 12 24 36 0 12 24 36 0 12 24 36
Tiempo (h) Tiempo (h) Tiempo (h)

(d) LB5N (mi) (F)


100 ***
11001 300
∆cadB∆paé ApagcadB ∆cadB∆paea ∆cadB∆paea

Cadaverina en sobrenadante (µM)


∆cadB LB5N LB5N
80 250

(n mol / mg peso seco)


***
pagcadB ***
***
∆cadB cadaverina en celda 60 200
** pagpaea *
sobredosis600

***
101 0 ∆cadB∆paea 150
***** 40 ***
pagpaea
*** 100
* ∆cadBpWKS30 20 **
∆cadB∆paea 50
**
pWKS30 0 ***
10. 01-1 0
0 12 24 36
Tiempo (h)

3 horas 24h 3 horas 24h

FIGURA 7expresión ectópica depaeasuprime parcialmente el defecto de crecimiento de un ΔcadBmutante en medio ácido. El tipo salvaje, ΔcadBA, ΔcadB
, y ΔcadBΔpaeaLas cepas que albergan el vector pWKS30 se cultivaron en (a) LB7, (b) LB5 o (c) LB5N (NaNO 1,5 mM2). (d) El ΔcadBy ΔcadBΔpaeacepas que
albergan pWKS30, pWKS30 PlacZ-cadB, o pWKS30 PlacZ-paeaplásmido se cultivaron en LB5N (NaNO 1,5 mM2). Símbolos: rombos cerrados, tipo salvaje
pWKS30; asteriscos cerrados, ΔcadBApWKS30; círculos cerrados, ΔcadBpWKS30; círculos abiertos, ΔcadBΔpaeapWKS30; triángulos cerrados, ΔcadB
pWKS30PlacZ-cadB; triángulos abiertos, ΔcadBΔpaeapWKS30PlacZ-cadB; cuadrados rellenos, ΔcadBpWKS30PlacZ-paea; cuadrados abiertos, ΔcadBΔpaea
pWKS30PlacZ-paea. (e) contenido de cadaverina en el sedimento celular o (f) sobrenadante del ΔcadBΔpaeacepa que contiene los plásmidos indicados
cultivados durante 3 horas o 24 horas en LB5N (NaNO 1,5 mM2). Los valores se informan como media±desviación estándar, dondenorte=3. Sin
emparejartlas pruebas comparan las cepas indicadas con la cepa pWKS30 de tipo salvaje (ac) o una cepa isogénica correspondiente con pWKS30 (de) (*
pag< .05, **pag< .005, ***pag< .0005). Cepas utilizadas: JS2452, JS2457, JS2458, JS2459, JS2460, JS2461, JS2462 y JS2463

Como se muestra en la Figura 7, las cepas eliminadas paracad AB,cadB, ocadb producido endógenamente por CadA en el ambiente ácido, de acuerdo con

paea creció esencialmente como el control de tipo salvaje en LB7 y LB5, sin PaeA que actúa en el eflujo de cadaverina. De hecho, como se muestra en la
pérdida significativa de viabilidad en la fase estacionaria. Sin embargo, cuando Figura 7e,f, la cantidad de cadaverina intracelular en la cepa que expresapaea

las células se cultivaron en LB5N, lacad ABmutante mostró un defecto de ectópicamente es 7 o 9 veces menor que en la cepa que alberga el vector

crecimiento significativo, aunque la cepa finalmente alcanzó la misma OD final después de 3 y 24 h de crecimiento en LB5N, respectivamente, con un aumento

600. Estos resultados sugieren que el nitrito exacerba el estrés ácido concomitante de cadaverina encontrada en el sobrenadante. Estos resultados

normalmente contrarrestado por CadAB, como se señaló anteriormente sugieren que PaeA está involucrada en el eflujo de cadaverina en condiciones

(Muhlig et al., 2014). Por el contrario, ni el ΔcadBni el ΔcadBΔpaea fueron fisiológicas. Nótese que la concentración total de cadaverina producida en el

capaces de crecer en LB5N. El hecho de que elcadBmutante mostró un defecto cadB+cepas complementadas es mayor, probablemente debido al hecho de que
de crecimiento más grave en LB5N que el ΔcadBAmutante sugiere que el CadB es un antiportador de lisina:cadaverina, lo que aumenta la cantidad de

defecto no es solo la falta de tolerancia adecuada al estrés ácido, sino también sustrato para la producción de cadaverina.

el resultado de la producción de cadaverina mediada por CadA intracelular, que

aumenta cuando las células se cultivan en LB5N versus LB5 (Figura S4b).

3|DISCUSIÓN
Como se muestra en la Figura 7d, la introducción de pWKS30 PlacZ-cadB en

ΔcadBy ΔcadB ΔpaeAcepas restauraron su crecimiento en LB5N. La introducción En el estudio actual, identificamospaea(ytfL) como gen implicado en la
de pWKS30 PlacZ-paeArestauró parcialmente el crecimiento de ambos ΔcadBy Δ tolerancia a cadaverina y putrescina en fase estacionaria. La explicación
cadB ΔpaeApresiones. Estos resultados sugirieron que PaeA reduce el estrés más simple para nuestros datos es que se requiere PaeA para el eflujo de
causado por la acumulación de cadaverina que es cadaverina y putrescina bajo ciertas condiciones que de otro modo
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conducir a una acumulación tóxica. Nuestros resultados confirman que susceptible a poliaminas que OmpC (Dela Vega & Delcour, 1996). Entre las

Salmonela, cultivada en medio LB de pH bajo, produce concentraciones cuatro poliaminas, la espermina es la más potente, seguida de la espermidina y

significativas de cadaverina a través de la vía CadAB y la excreta en el medio. la cadaverina, siendo la putrescina la menos efectiva (Dela Vega & Delcour,

Esta producción es independiente de PaeA y se exacerba al agregar nitrito al 1996). Sin embargo, la pérdida de la función de las porinas no es letal (Hall &

medio de crecimiento, por razones que no se comprenden. Un mutante que Silhavy, 1981). El exceso de poliaminas, como los niveles bajos, afecta los

carece de PaeA se vuelve sensible a cadaverina en fase estacionaria. El mutante procesos mediados por ARN, particularmente el inicio de la traducción de

también es sensible a la putrescina, pero no a la espermidina ni a la espermina. ciertos ARNm, lo que define el "módulo de poliamina" (Sakamoto et al., 2020).

La sensibilidad depende del pH y solo se observa a pH > 8. Esto se debe Ya sea como resultado de cambios en la expresión de genes específicos o de

presumiblemente a que la poliamina externa debe desprotonarse para que defectos más generales en la traducción, esto ciertamente podría ser letal. En

pueda difundirse pasivamente en el citoplasma celular. Es la cadaverina concentraciones subletales, el exceso de poliaminas confiere fenotipos

citoplasmática la que confiere sensibilidad. Esto está respaldado por varias particulares, que incluyen sensibilidad al peróxido de hidrógeno, alta

líneas de evidencia. Primero, podemos medir directamente el aumento temperatura y concentraciones normalmente subinhibitorias de kanamicina, en

significativo de cadaverina o putrescina intracelular en elpaeamutante En cepas que no pueden degradar putrescina o cadaverina (Schneider et al., 2013),

segundo lugar, uncadBmutante es sensible al crecimiento en pH 5 LB con y detención del crecimiento y lisis celular a baja temperatura en cepas con

nitrito. BorrandocadAsuprime este fenotipo, al igual que la expresión ectópica exceso de espermidina (Limsuwun & Jones, 2000). Tenga en cuenta que la

de PaeA. Por lo tanto, CadA está produciendo cadaverina intracelular que no se sensibilidad a las poliaminas depende de la fisiología general de la célula. Por

puede excretar, lo que le confiere sensibilidad. En tercer lugar, la expresión ejemplo, en nuestros experimentos, las concentraciones de putrescina

ectópica del exportador de cadaverina, CadB, en fase estacionaria suprime intracelular fueron relativamente altas en la fase exponencial; sin embargo, las

parcialmente lapaeafenotipo. Es la cadaverina o la putrescina per se las que son células crecieron normalmente, mientras que concentraciones similares de

tóxicas, en que la degradación o modificación no son relevantes. Tenga en cadaverina en la fase estacionaria fueron letales (Figura S4).

cuenta que, aunque descubrimos la función de PaeA en condiciones específicas, Nuestros datos sugieren que PaeA facilita la salida de cadaverina
parece probable que tenga un papel más amplio en la homeostasis celular. Las y putrescina, pero el mecanismo molecular no está claro. La proteína
poliaminas, producidas en respuesta a cualquier cantidad de condiciones de PaeA de 447 aminoácidos contiene tres dominios conservados que a
estrés u otra necesidad fisiológica, podrían acumularse hasta niveles menudo se encuentran juntos. Los 197 aminoácidos N-terminales
potencialmente letales cuando se satisface la necesidad o cambian las comprenden un dominio transmembrana de cuatro en la familia
condiciones. Este exceso de poliaminas debe eliminarse del citoplasma. DUF21 (PF01595), asociado con proteínas de transporte (Chen et al.,
2020). Se prevé que los dominios N-terminal y C-terminal estén en el
A diferencia de las células de mamíferos (Mandal et al., 2013), enSalmonela yE. citoplasma. El dominio transmembrana es seguido por dos dominios
coli, la síntesis de poliaminas no es esencial para el crecimiento y la supervivencia de repetición CBS en tándem (PF00571), que se sabe que se unen a
celular (Chattopadhyay et al., 2009). Sin embargo, bajo ciertas condiciones, como el ligandos con un grupo adenosilo, incluido ATP (Hirata et al., 2014).
crecimiento en un ambiente anaeróbico o en un 95% de oxígeno, los mutantes Los 100 aminoácidos C-terminales constituyen un dominio CorC_HlyC
incapaces de sintetizar poliaminas no pueden crecer o incluso perder viabilidad (PF03471). Esta estructura general es ciertamente consistente con
(Chattopadhyay et al., 2003, 2009). Como se muestra en la Figura 1, Salmonelatiene que PaeA sea un transportador. Sin embargo,2+/Co2+transporte,
múltiples vías redundantes para la síntesis, importación y exportación de poliaminas, como MpfA deBacillus subtilis(Pi et al., 2020), y MpfA de estafilococo
lo que sugiere queSalmonelacontrola los niveles de poliamina en respuesta a los aureus(Armitano et al., 2016). magnesio2+y las poliaminas tienen
cambios en el entorno externo y/o las condiciones dentro de la célula. A pesar de la funciones importantes como cationes que se unen a los ácidos
existencia de los sistemas de importación/exportación conocidos, nuestros datos nucleicos, aunque no son completamente intercambiables (Lightfoot
sugieren que la importación de cadaverina y putrescina en nuestros experimentos fue & Hall, 2014; Tabor & Tabor, 1985). Por lo tanto, no podemos
el resultado de la difusión pasiva de las especies sin carga en la célula, lo que explica la descartar que PaeA sea un transportador de iones que afecte
dependencia del pH, y que la exportación dependía en gran medida de PaeA . Estos indirectamente el eflujo de poliaminas. Sin embargo, es interesante
resultados pueden explicarse por el hecho de que ninguno de los sistemas conocidos que PaeA parece ser específico para cadaverina y putrescina, sin
de importación o exportación de poliaminas se expresa en fase estacionaria tardía en tener efecto sobre la espermina o la toxicidad de la espermidina, y
Salmonela (Kroger et al., 2013). que puede complementar parcialmente la pérdida de CadB en fase
exponencial. Se requerirán más análisis bioquímicos de PaeA para
Las poliaminas tienen efectos pleiotrópicos sobre las células. Muchos demostrar que es un exportador, definir el sustrato e identificar la
estudios han abordado la necesidad de poliaminas utilizandoE. colimutantes fuente de energía putativa. También necesitamos comprender mejor
defectuosos para la síntesis de poliaminas (Chattopadhyay et al., 2009, 2013, el papel fisiológico de PaeA. Los datos transcriptómicos sugieren que
2015; Chattopadhyay & Tabor, 2013; Igarashi & Kashiwagi, 2018; Keller et al., paease expresa en la mayoría de las condiciones, pero es más
2019). Los efectos del exceso de poliaminas sobre la fisiología celular son altamente inducida cuandoSalmonelase está replicando en los
menos conocidos. Enmi.coli, las poliaminas inhiben la función de los poros en macrófagos (Kroger et al., 2013; Srikumar et al., 2015). Análisis más
las porinas de la membrana externa OmpF y OmpC al unirse dentro de los detallado depaease requiere regulación.
poros desde el lado periplásmico (Dela Vega & Delcour, 1996; Iyer & Delcour, Las poliaminas también están implicadas en la patogénesis. El PaeA/YtfL de

1997). Aunque homólogo, OmpF es dos veces más Neumonía por Klebsiella, que es 91% idéntico a PaeA deS. enterica, es
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se informó que es responsable de producir un medio gastado que induce el introducido en un fragmento pWKS30 amplificado con YI_pWKS30-3 y
desmontaje de los microtúbulos del huésped en las células epiteliales del YI_pWKS30-10 por ensamblaje Gibson (NEBuilder® HiFi DNA
pulmón. Expresando el Klebsiellaproteína en unE. colicepa confirió el mismo Assembly). El producto resultante se transformó en DH5α. El
fenómeno (Chua et al., 2019). Aunque no identificaron el compuesto activo, las plásmido fue confirmado por secuenciación de ADN.
poliaminas están involucradas en el ensamblaje de los microtúbulos (Savarin et

al., 2010). Curiosamente, la mayoría de los estafilococos no sintetizan ni

metabolizan poliaminas (Anzaldi & Skaar, 2011; Joshi et al., 2011). De hecho, 4.2|Ensayo de supervivencia en fase estacionaria

estos organismos son muy sensibles a la espermina y la espermidina, pero no a

la cadaverina ni a la putrescina, y mostraron una mayor sensibilidad a pH Las células de cultivos en medio LB durante la noche se recogieron por

alcalinos (Joshi et al., 2011). La epidemiaS. aureusLa cepa MRSA USA300 posee centrifugación y se suspendieron en el mismo volumen de NaCl al 0,85%. Las

un "elemento móvil catabólico de arginina" que codifica una espermina/ suspensiones se diluyeron 1:25 en 5 ml de medio LB pH 5 sin tamponar con

espermidina acetil transferasa SpeG que puede desintoxicar las poliaminas que NaNO 2 mM2(LB5N) o sin NaNO2(LB5) o medio LB de pH 7 (LB7) e incubado

se encuentran en la piel y los tejidos inflamados, lo que se cree que contribuye durante 48 h a 37 °C en un tambor giratorio. Para las cepas que albergaban un

a su mayor patogenicidad (Anzaldi & Skaar, 2011; Joshi et al., 2011). plásmido pWKS30, se añadieron al medio 50 µg/ml de ampicilina. En los

Necesitamos determinar si PaeA juega algún papel enSalmonelaPatogénesis. tiempos indicados, los cultivos se diluyeron y se sembraron en agar LB

En conclusión, encontramos que PaeA está involucrada en la supervivencia complementado con glucosa al 0,1 % y se incubaron durante la noche a 37 °C

de la fase estacionaria cuandoSalmonelaestá expuesto a cadaverina o para determinar las CFU. El pH del medio gastado se determinó usando un

putrescina, pero no a espermidina y espermina. Además, demostramos que medidor de pH. Para curvas de crecimiento, OD600del cultivo se midió en un

PaeA reduce el nivel intracelular de cadaverina y putrescina durante el lector de absorbancia BioTek ELx808 en los puntos de tiempo indicados.

tratamiento. Estos resultados sugieren que PaeA está involucrada en la salida Cuando fue necesario, los cultivos se diluyeron en el medio de cultivo original.

selectiva de cadaverina y putrescina y esto es importante para la supervivencia

en condiciones de estrés específicas.


4.3|Ensayo de tolerancia medio gastado

4| PROCEDIMIENTOS EXPERIMENTALES Para preparar el medio gastado, se recogieron por centrifugación células de tipo

salvaje de cultivos de LB durante la noche y se suspendieron en el mismo volumen de

4.1| Cepas bacterianas y plásmidos NaCl al 0,85 %. A continuación, las suspensiones se diluyeron 1:25 en 5 ml de LB5N o

LB7 y se incubaron durante 12 horas a 37°C en un tambor giratorio. A continuación,

Las cepas y los plásmidos se describen en la Tabla S1. TodoSalmonelaLas las células se eliminaron por centrifugación (7.000gramo) y el sobrenadante se filtró a

cepas utilizadas son derivados deSalmonella entericaserovar través de un filtro de jeringa Millex-GP de 0,22 μm (Millipore). Para la preparación de

Typhimurium cepa 14028. Se construyeron deleciones con inserción células en fase estacionaria, se centrifugaron cultivos de medio LB durante la noche y

simultánea de casetes de resistencia a antibióticos usando recombinación las células se suspendieron en el mismo volumen de NaCl al 0,85%. Las suspensiones

mediada por λ Red como se describió previamente (Datsenko & Wanner, se diluyeron 1:25 en 5 ml de LB5N o LB7. Después de 12 h de incubación a 37 °C en un

2000; Ellermeier et al., 2002), con los criterios de valoración indicados. Las tambor giratorio, las células se recogieron por centrifugación (7000gramo) y se lavó

deleciones se verificaron mediante análisis PCR y luego se transdujeron a dos veces con NaCl al 0,85%. Las células de la fase estacionaria se suspendieron en el

fondos no mutagenizados utilizando el fago P22 HT105/1 int-201 (Maloy et volumen original del medio gastado preparado con o sin tampón MES 100 mM (pH 5,5

al., 1996). Todos los plásmidos se pasaron a través de una modificación de o 6,0), tampón MOPS (pH 7,0, 8,0 u 8,5) o tampón CAPS (pH 9,0 o 9.5). Cuando fue

restricción menos Pi +Salmonelacepa (JS198) (Ellermeier et al., 2002) antes necesario, los medios agotados preparados se diluyeron con NaCl al 0,85 %. Los

de la transformación en derivados de la cepa 14028. cultivos de 5 ml resultantes se incubaron durante 24 horas a 37°C en un tambor

E. coliLas cepas K12 utilizadas son derivados de la cepa MG1655. Las giratorio. Después de la dilución en serie, los cultivos, antes y después de la

mutaciones de deleción se construyeron usando recombinación mediada incubación, se sembraron en placas de agar LB complementadas con glucosa al 0,1 %

por λ Red (Datsenko & Wanner, 2000) y las mutaciones se transfirieron a y se incubaron durante la noche a 37 °C para determinar las CFU. La tolerancia al

fondos limpios mediante transducción P1 (Silhavy et al., 1984). medio gastado se calculó dividiendo las CFU después de 24 horas de incubación por

El pWKS30-PlacZpaeaEl plásmido se construyó amplificando el gen las CFU antes de la incubación.

paeA utilizando los cebadores ytfLF e ytfLR (Tabla S3). Tanto el


producto de PCR como el plásmido pWKS30 se digirieron con
enzimas de restricción EcoRI y XbaI (New England Biolabs) según el
protocolo del fabricante. Los fragmentos resultantes se ligaron con 4.4|Ensayo de tolerancia a la poliamina
ADN ligasa T4 (New England Biolabs) de acuerdo con el protocolo del
fabricante y se transformaron enE. colicepa DH5α. El plásmido fue Las células de la fase estacionaria, preparadas como antes, se suspendieron en
confirmado por secuencia de ADN. el volumen original de NaCl al 0,85 % con tampón CAPS (pH 9,0) con la cantidad

Plásmido pWKS30-PlacZcadBse construyó utilizando los cebadores indicada de cadaverina, putrescina, espermidina o espermina. Las reservas de

YIS_275-17 y YIS_275-18 para amplificar lacadBgen, que fue poliamina se prepararon primero a 20 mM en NaCl al 0,85 %.
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con tampón CAPS (pH 9,0). Para realizar el ensayo a pH variado, las células se la GFP sensible al pH, y a Cari Vanderpool y Jim Imlay por sus valiosos
suspendieron en el volumen original de NaCl al 0,85 % con tampón MES 100 debates. Este estudio fue apoyado por NIH subvención R01 AI123381
mM (pH 5,5 o 6,0), tampón MOPS (pH 7,0, 8,0 u 8,5) o tampón CAPS (pH 9,5). ). a JMSYI es apoyado por una JSPS Postdoctoral Fellowship for
Los cultivos se incubaron durante 24 horas a 37°C en un tambor giratorio. Research Abroad.
Después de la dilución en serie, los cultivos, antes y después de la incubación,

se sembraron en placas de agar LB complementadas con glucosa al 0,1 % y se CONFLICTOS DE INTERÉS


incubaron durante la noche a 37 °C para determinar las CFU. La tolerancia a la Los autores declaran que no existen conflictos de interés.
poliamina se calculó dividiendo las CFU después de 24 horas de incubación por

las CFU antes de la incubación. CONTRIBUCIONES DE AUTOR


YI realizó la investigación; YI, RR, YAG y JMS diseñaron la
investigación; LF realizó la caracterización inicial depaea (ytfL); YI y
4.5|Medición del pH intracelular JMS escribieron el artículo. Todos los autores aprobaron la versión
final del manuscrito.
Para obtener una curva de calibración, pH 7 LB fase estacionaria cultivada
en medio de tipo salvaje o Δpaealas células que albergaban pS2513-PHP DECLARACIÓN DE HABILIDAD DE DISPONIBILIDAD DE DATOS

se suspendieron a OD600= 0,4 a 0,5 en solución salina que contiene 50 mM Los datos que respaldan los hallazgos de este estudio están
de tampón MES (pH 6,0 o 6,5) o tampón MOPS (pH 7,0, 7,5, 8,0 u 8,5), cada disponibles del autor correspondiente a pedido razonable.
uno con 50 mM de benzoato de sodio y 50 mM de metilamina HCl e
incubados a 30 °C durante 10 min. La emisión de fluorescencia de PHP (λ ID ORCO

emisión= 515 nm) se registró en λexcitaciónde 405 nm o 485 nm con un lector James M. Slauch https://orcid.org/0000-0003-4634-9702
multimodo híbrido BioTek Synergy H1. La excitación relativa (R 405/485)
se representó frente al pH del tampón. Para medir el pH citoplásmico REFERENCIAS
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estacionaria que albergaban pS2513-PHP en 5 ml de tampón CAPS (pH estafilococo aureussupera su susceptibilidad única a las poliaminas.
Microbiología Molecular,82, 1–3. Disponible en: https://doi. org/
9,0) con o sin 0,2 o 0,5 mM de cadaverina. En el momento indicado, la
10.1111/j.1365-2958.2011.07808.x
emisión de fluorescencia de PHP (λemisión= 515 nm) se registró en λexcitación Arce-Rodríguez, A., Volke, DC, Bense, S., Haussler, S. y Nikel, PI
de 405 nm o 485 nm y el pH citoplasmático se calculó usando la curva de (2019) Determinación ratiométrica no invasiva del pH intracelular en
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mediante sonicación. Las muestras se aclararon por centrifugación y la Chakraborty, S., Mizusaki, H. & Kenney, LJ (2015) Un ADN basado en FRET
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células se rompieron mediante sonicación y el sobrenadante se aclaró mediante tationilespermidina sintetasa/amidasa: filogenia y efecto sobre la
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EXPRESIONES DE GRATITUD Las poliaminas estimulan el nivel de la subunidad sigma38 (RpoS) de Escherichia
Agradecemos a Thomas E. Kehl-Fie, Jacqueline Morey y Katie Frye por coliARN polimerasa, lo que da como resultado la inducción del sistema de
su ayuda con las mediciones del pH intracelular utilizando respuesta ácida dependiente de glutamato descarboxilasa a través de gadE
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