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PRÁCTICA DE LABORATORIO #1: CUANTIFICACIÓN EXPERIMENTAL DE

PROTEÍNAS Y AZÚCARES REDUCTORES.

Murcia Valencia Valeria


Pérez Duque Joselyn

Universidad Icesi
Facultad de Ingeniería
Departamento de Ingeniería Bioquímica.
Laboratorio de Biocatálisis
Santiago de Cali, Colombia
(10 de septiembre 2022)
valeria.murcia1@u.icesi.edu.co
joselyn.perez1@u.icesi.edu.co

catalítica de esta proteasa, muestran que es


1. Introducción capaz de hidrolizar proteínas como la
En la presente práctica de laboratorio se caseína y la hemoglobina a altas tasas.
empleó la técnica de espectrofotometría con También, algunos estudios preliminares han
el fin de determinar proteínas totales de una indicado que derivados de Arginina tales
solución inicial de BSA por el método de como BAEE (benzoyl-L-arginine ethyl
Bradford (se realizó por duplicado, dos ester) y BAA (benzoyl-L-argininamide) son
diferentes experimentos) con una longitud los mejores sustratos para la enzima, entre
de onda de 595nm; también, se aplicó tal otros varios ésteres y amidas (Inagami &
técnica para la cuantificación de azucares Murachi, 1963). Sin embargo, el ritmo de
reductores a partir de disoluciones de hidrolisis del BAEE es moderado
glucosa para el método DNS a 540nm. comparado con sustratos como la caseína.
Adicionalmente, se evaluó la absorbancia de
dos muestras problema: extracto de levadura En adición, esta enzima es empleada tanto
y enzima proteasa. en la industria farmacéutica como en la
industria alimenticia. Por un lado, se emplea
La Bromelina es una proteasa que se para la modulación del crecimiento tumoral,
clasifica, según la IUBMB (International quemaduras de tercer grado, mejora de la
Union of Biochemistry and Molecular acción antibiótica y como fármaco para el
Biology), como una enzima de clase tratamiento sistémico oral de enfermedades
hidrolasa. Sin embargo, tal denominación es inflamatorias (Benucci et al., 2011). Por otro
genérica ya que se han logrado caracterizar lado, se utiliza como ablandador de carnes,
dos tipos (Lago et al., 1996): la primera, fue en el tratamiento de pescados y otros
extraída y purificada a partir del tallo de la productos marinos. Asimismo, en ocasiones
planta Ananas comosus, llamada como es empleada a nivel de laboratorio con el fin
“stem bromelain” con número EC 3.4.22.32; de fabricar peptonas (que forman parte de
la segunda, está presente en el fruto de la algunos medios de cultivo), aminoácidos y
misma planta, por tal razón es llamada como péptidos y en el estudio de proteínas (Lago
“fruit bromelain” con número EC 3.4.22.33. et al., 1996).

Estudios cinéticos, donde evalúan la acción


2. Materiales y método
extracto de levadura y la enzima proteasa
3. Resultados y discusión por duplicado, de lo que se obtuvo:

Tabla 3 Absorbancia y concentración de


Tabla 1 Concentraciones de solución de proteína para las muestras problema
albumina bovina (BSA)
Extracto de
Concen Enzima proteasa
levadura
tración
de BSA 0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 Absorb Concentr Absorb Concentr
(mg/m ancia a ación ancia a ación
L) 595 nm (mg/mL) 595 nm (mg/mL)
Volume 0,11125 0,13944 0,817 0,72865
n 20 40 60 80
100
solución 0.00 0.0 0.0 0.0 0.0
0.00 Tabla 4 Concentraciones de glucosa para la
BSA 0 0 0 0
(µL) construcción de curva de calibración de
Volume DNS.
n de 80 60 40 20 Concentra
100
agua 0.0 0.0 0.0 0.0 0.00 ción de 0. 0. 0. 0. 1. 1.
0.00 0
destilad 0 0 0 0 glucosa 2 4 6 8 0 4
a (µL) (mg/mL)
Volume Volumen
100 10 10 10 10 100
n total stock de 10 15 20 25 35
0 00 00 00 00 0 0 50
(µL) glucosa 0 0 0 0 0
(µL)
Tabla 2 Resultados de absorbancia Volumen 15
50 45 40 35 30 25
obtenidos de soluciones de albumina con de agua 0
0 0 0 0 0 0
método de Bradford. (µL)
Volumen 50 50 50 50 50 50 50
Muestra total (µL) 0 0 0 0 0 0 0
Concentració Promedi
n (mg/mL) 1 2 o
Tabla 5 Absorbancia de soluciones de
0.2 0.110 0.247 0.1785
glucosa (método de DNS).
0.4 0.469 0.333 0.401
0.6 0.829 0.858 0.843 Concentración Absorbancia
0.8 0.914 0.996 0.955 (mg/mL) obtenida
1.0 0.919 0.955 0.937 0,2 0,102
0,4 0,201
Con el fin de determinar la concentración de 0,6 0,368
proteínas para las muestras problemas,
0,8 0,484
extracto de levadura y enzima proteasa, se
utilizó la función tendencia en la hoja de 1 0,54
cálculo Excel, donde las dos matrices de 1,4 0,872
valores conocidos corresponden a la
concentración de BSA y la absorbancia a
595 nm de las muestras por duplicado de
soluciones de albúmina y la matriz para la
que se hallarán las concentraciones (valor
desconocido) son las absorbancias del
3.1. Datos y cálculos ve afectada por imprecisiones del desarrollo
del proceso. Un error personal es el
Figura 1 Curva de determinación total de incorrecto uso de la micropipeta, al ser
proteínas para el Método de Bradford tantas repeticiones (en total 12 muestras) es
probable que en algún momento no se haya
1,2 extraído el volumen indicado, también pudo
Absorbancia a 595 nm

1 y = 1,0355x + 0,0416 ocurrir que se empleara la micropipeta en un


0,8 R² = 0,8645
ángulo inferior a 90° durante la aspiración o,
0,6
se pudo haber dispensado los reactivos de
0,4
0,2
manera muy rápida lo que generaría un
0 volumen alejado a lo requerido.
0 0,2 0,4 0,6 0,8 1
Concentración de BSA (mg/mL) En segunda instancia, la calidad de las
cubetas es un aspecto imprescindible para
esta técnica ya que es altamente sensible, las
Se presenta el promedio de la lectura de cubetas deben tener una limpieza adecuada
absorbancia a 595 nm por diferentes lo que conduce a obtener resultados más
concentraciones de BSA en mg/mL para las consistentes. Cuando se seleccionaron las 12
muestras 1 y 2. celdas para la experimentación se trató de
Según la bibliografía (Novales, 2010), el inspeccionaron y seleccionar aquella que no
coeficiente de determinación, a veces estuvieran astilladas, rotas o rayadas. Sin
también denominado como el R-cuadrado, embargo, la mayoría de las muestras tenían
nos indica el porcentaje de la variación total marcas que pudieron haber obstruido o
en la variable Y (para la practica el eje Y intervenido durante el proceso de
corresponde a las absorbancias) que la absorbancia. Además, algunas habían sido
regresión estimada es capaz de explicar, es empleadas por otros grupos previamente así
decir, como el porcentaje de la variación de que para lograr secarlas se tuvo que emplear
los valores de la variable dependiente que se un material no tan suave para su limpieza.
puede explicar con la ecuación de regresión.
De modo que, si se obtiene un coeficiente Figura 2 Curva de calibración de glucosa
próximo a la unidad, significa que el modelo para el método DNS
proporciona un buen ajuste de datos por lo
1
que se puede emplear con confianza para
Absorbancia a 540 nm

efectuar evaluaciones e inferencias acerca 0,8


y = 0,6291x - 0,0335
de la situación. 0,6 R² = 0,987

0,4
Para la evaluación de proteínas por el
método de Bradford, no se obtuvo un R- 0,2
cuadrado lo suficientemente cercano a 1, 0
comúnmente es aceptable cuando es mayor -0,1 0,4 0,9 1,4
o igual a 0,97. Así que, se puede analizar Concentración de glucosa (mg/mL)
cuáles aspectos posiblemente condujeron a
obtener tal valor. Se plantean los errores Se presenta la lectura de absorbancia a 540
experimentales y las condiciones del nm por diferentes concentraciones de
material empleado durante el ensayo, como glucosa en mg/mL.
agentes que influyeron en tal medida.
Se resalta que se obtuvo una correcta
En primera instancia, se le puede atribuir un práctica por DNS, es decir, la curva de
valor de R-cuadrado bajo a errores calibración obtenida funciona como modelo
experimentales debido a que es una medida para otras experimentaciones. Se llega a la
obtenida durante la experimentación que se presente conclusión debido al R-cuadrado
obtenido. errores personales cometidos, sino también
las condiciones ideales para que la reacción
Para el cálculo de la exactitud del Método de se lleve a cabo. Cabe destacar que la primera
Bradford para cuantificación de proteínas, muestra de la proteína se obtuvo una
se partió de la concentración real de proteína Absorbancia de 0,455 y en la segunda se
en el extracto de levadura 0.005-0.010 obtuvo 0,360. Se logra analizar que errores
mg/mL y la de la enzima proteasa 0.2-0.5 en dos pasos importantes durante el método
mg/mL. Para ello, se usó a la fórmula de de Bradford pudieron haber influido en la
exactitud 𝐸𝑎 = 𝑥̅ − 𝜇, de la que se discrepancia de los datos. En primer lugar,
obtuvieron los siguientes resultados: para la segunda muestra de la proteasa, no se
𝐸𝑎 (𝐸𝑥𝑡𝑟𝑎𝑐𝑡𝑜 𝑑𝑒 𝑙𝑒𝑣𝑎𝑑𝑢𝑟𝑎) realizó la debida homogenización por
= |0.0075 − 0.13944| reflujo empleando la micropipeta, aspecto
= 0.1319 que puede conducir a extraer solución que
Que en términos relativos corresponde a: sea “diferente” en comparación a la primera.
𝐸𝑎 0.1319 En segundo lugar, por temas de errores
𝐸𝑟 = ∗ 100 = ( ) ∗ 100 personales, es posible que no se haya
𝜇 0.13944
= 94.59% esperado el tiempo suficiente para que se
formara el complejo entre el Azul de
𝐸𝑎 (𝐸𝑛𝑧𝑖𝑚𝑎 𝑝𝑟𝑜𝑡𝑒𝑎𝑠𝑎) = |0.3500 − 0.72865| Coomasie y las proteínas, lo cual también
= 0.3787 afecta la lectura de absorbancia.
Que en términos relativos corresponde a:
𝐸𝑎 0.3787 3.2 Preguntas de la guía de laboratorio
𝐸𝑟 = ∗ 100 = ( ) ∗ 100 a) La mayoría de los detergentes
𝜇 0.72865
= 51.97% comerciales presentan en su
composición enzimas para la
degradación de proteínas,
En consecuencia, se especula que el método
carbohidratos y grasas de la ropa
de Bradford usado en la experimentación
durante la etapa de lavado. ¿Si es
alcanzó una exactitud favorable para el
solicitada la medición de proteínas
extracto de levadura, pues se obtuvo un
en una muestra de detergente
94.59% de exactitud en términos relativos.
ARIEL, que método de
No obstante, este no fue el caso para la
cuantificación utilizaría?
proteasa, probablemente por poca experticia
del experimentador y poco tacto cuidadoso No existe un método ideal para la
con las muestras e instrumentos de cuantificación de proteínas en
medición. solución. Cada método tiene
Por otro lado, es necesario conocer la ventajas y desventajas, de modo que
precisión del método para verificar su uso, la elección se basa en la
por lo que se parte de la ecuación de compatibilidad del ensayo con la
desviación estándar: muestra que se desea examinar. Para
∑(𝑥 − 𝑥̅ ) muestras, como la de este caso, que
𝑠𝑑 = √ contienen detergentes es común
(𝑛 − 1)
utilizar métodos basados en la
formación de complejos cobre-
𝑠𝑑(𝐸𝑥𝑡𝑟𝑎𝑐𝑡𝑜 𝑑𝑒 𝑙𝑒𝑣𝑎𝑑𝑢𝑟𝑎) = 0.093 proteína como el método BCA que
no muestra inhibición en presencia
𝑠𝑑(𝑃𝑟𝑜𝑡𝑒𝑎𝑠𝑎) = 0.2677 de bajas cantidades de detergentes
(García & Vázquez, s.f.). Este es un
Con base en esto, se rectifica que para el método altamente sensible que
extracto de levadura se llevó a cabo una combina la reacción de las proteínas
mejor práctica que para la proteasa. No se con Cu+2 en un medio alcalino con
incluye únicamente la experticia o los un reactivo para la determinación de
Cu+ altamente selectivo calibración de azúcares reductores
denominado ácido bicinconínico. por el método DNS, y a partir de ello
calcular la concentración
b) Usted tiene una solución de maltosa experimental de proteína en las
con sacarosa, y desea cuantificar la muestras estudiadas.
concentración total de azúcares
presentes en la muestra. Un amigo le
sugiere utilizar el método del DNS,
¿seguiría la recomendación dada por
su amigo? 5. Referencias

Se debe tener en cuenta que la • Benucci, I., Liburdi, K., Garzillo, A.


solución posee dos disacáridos: por M. V. & Esti, M. (2011, febrero).
un lado, la maltosa que es un azúcar Bromelain from pineapple stem in
reductor, es decir, tiene un grupo alcoholic–acidic buffers for wine
aldehído libre con la capacidad
application. Food Chemistry,
reductora sobre otra molécula; por
otro lado, la sacarosa es un 124(4), 1349-1353.
disacárido conformado por glucosa y https://doi.org/10.1016/j.foodchem.
fructosa, y no logra actuar como 2010.07.087
agente reductor. Así que, se • García, H., Vázquez, R. (s.f.).
considera poco práctico emplear el Cuantificación de proteínas: una
método del DNS para esta situación,
revisión. Instituto de Biotecnología
dado que es muy probable obtener
resultados con información de UNAM. (pág. 82-85).
incompleta o totalmente errónea. cuantificacion-de-proteinas-una-
Este tratamiento se ha descrito, revision-6052d29f656fc (xdoc.mx)
específicamente, para la • Inagami, T. & Murachi, T. (1963,
cuantificación de azucares noviembre). Kinetic Studies of
reductores donde se determina la
Bromelain Catalysis*. Biochemistry,
presencia de grupos carbónicos
libres (C=O) de los azucares 2(6), 1439-1444.
reductores. Como conclusión, no se https://doi.org/10.1021/bi00906a04
llevaría a cabo tal técnica 1
recomendad por el amigo. • Lago, I. L., Varela, J. D. & de
Caceres, F. M. (1996, julio). LA
4. Conclusiones
BROMELINA: UNA PROTEASA
• Para el método de Bradford, se DE INTERÉS COMERCIAL.
reconoce que es un método útil para Ciencia y Tecnologia Alimentaria,
la determinación de proteínas; no 1(2), 17-22.
obstante, es importante acotar que es https://doi.org/10.1080/1135812960
un método que requiere de cuidado 9487552
intenso, ya que se fundamenta en un
• Novales, A. (2010, septiembre).
colorante sensible a la luz, el azul de
Coomasie G-250, lo que interferiría Análisis de Regresión. Universidad
en los resultados esperados, como Complutense de Madrid. (pág. 37-
resultado de la formación errónea del 39). 518-2013-11-13-Analisis de
complejo-proteína. Regresion.pdf (ucm.es)
• A través de métodos como la
regresión lineal fue posible
encontrar la ecuación de la curva de

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