Nació alrededor de 1535 en el pueblo de San Cristóbal de Sondondo, perteneciente a la provincia

ayacuchana de Lucanas. Sus padres fueron Martín Guamán Mallqui y Curi Ocllo, hija menor
de Tupac Yupanqui. Tuvo un hermano mestizo, por parte de madre, llamado Martín de Ayala,
clérigo del hospital de naturales de Huamanga, quien le
habría enseñado a leer, inculcándole los principios religiosos.
El respeto y deferencia por este hermano y por su padrastro
le llevaron a adoptar el apellido Ayala. En su juventud fue
intérprete de visitadores eclesiásticos, doctrineros y
encomenderos, así como secretario de los protectores de
naturales y escribanos de la ciudad de Huamanga. Prestó sus
servicios al vicario Cristóbal de Albornoz, autor de unas
famosas Instrucciones para descubrir todas las huacas del
Perú y sus camayos y haciendas, recorriendo con él los
pueblos de Lucanas y Soras, derribando huacas y persiguiendo a los idólatras que predicaban el
Taqui Oncoy, un movimiento nativista qUe anunciaba el retorno de los antiguos dioses.
Acompañando a Albornoz viajó también al Cuzco, siendo testigo de la entrada a Vilcabamba que
hicieron los españoles para acabar definitivamente con la resistencia indígena, y de la ejecución
de Tupac Amaru.

ARGUMENTO DE LA OBRA NUEVA CRONICA Y BUEN GOBIERNO

Esta obra tiene un objetivo concreto retratar la realidad andina y solicitar a la Corona española
una reforma del gobierno virreinal para salvar al pueblo andino de la explotación, las
enfermedades y las mezclas raciales.
ARGUMENTO DE COMENTARIOS REALES DE LOS INCAS
Trata sobre la idolatría de los Incas de la segunda edad, y su origen. Afirma que
los incas rastrearon al Dios verdadero, que tuvieron una cruz en un lugar sagrado del Cuzco,
que creyeron en la inmortalidad del alma y la resurrección universal.