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microbiana
Jesús Campos-García, Carlos Cervantes, Martha I. Ramírez-Díaz y Carlos R. Sosa Aguirre
Cuerpo Académico de Biotecnología
Resumen
La biotecnología moderna se ha enfocado al empleo de los organismos vivos, o de
sus componentes, con distintos objetivos de beneficio para la sociedad. Entre ellos se
encuentran los procesos de biorremediación y de biodegradación utilizando microor-
ganismos. Estas herramientas biotecnológicas aprovechan la amplia capacidad me-
tabólica que poseen las células microbianas. La biorremediación pretende disminuir o
eliminar los niveles de la contaminación ambiental, mientras que los sistemas micro-
bianos de biodegradación pueden aprovecharse para la optimización de procesos in-
dustriales. En este trabajo se resumen las líneas de investigación desarrolladas
actualmente por los integrantes del Cuerpo Académico de Biotecnología. Estos te-
mas incluyen aspectos relacionados con la degradación microbiana de hidrocarbu-
ros, los sistemas de tolerancia bacteriana al ión tóxico cromato y su regulación, y la
degradación de carbohidratos de la caña de azúcar mediante enzimas provenientes
de bacterias termofílicas.
Abstract
Modern biotechnology has focused to the use of living organisms, or their compo-
nents, with different objectives for the benefit of society. Among them are the proces-
ses of bioremediation and biodegradation employing microorganisms. The
application of these biotechnological tools takes advantage of the wide metabolic abi-
lities that display microbial cells. Bioremediation intends to diminish or to eliminate the
levels of environmental pollution, whereas the microbial biodegradation systems may
be used for the improvement of industrial processes. This article summarizes the cu-
rrent research lines carried out by the members of the Biotechnology academic group.
These subjects include aspects related to the microbial degradation of hydrocarbon
Ciencia Nicolaita No. 48 51 Octubre de 2007
Aspectos de la biotecnología microbiana
compounds, the bacterial systems for the tolerance to the toxic ion chromate and its
regulation, and the degradation of sugarcane carbohydrates by enzymes isolated
from thermophilic bacteria.
Introducción
Los microorganismos se encuentran en el ambiente expuestos a numerosos com-
puestos tóxicos, tanto de origen orgánico como de naturaleza inorgánica. Entre ellos se en-
cuentran, por ejemplo, cierto tipo de hidrocarburos y los derivados de los metales pesados.
Por otra parte, la contaminación ambiental provocada por las actividades humanas es uno
de los grandes problemas a los que se enfrenta la sociedad hoy en día. Algunas de las princi-
pales causas de esta grave situación son el aumento de la población, el uso desmedido de
fertilizantes y plaguicidas agrícolas, y la expansión de las industrias alimenticia y de manu-
facturas. Esto ha originado que en las últimas décadas se hayan liberado al ambiente una
gran cantidad de compuestos químicos, muchos de los cuales constituyen contaminantes
de alto riesgo debido a sus propiedades tóxicas, mutagénicas o carcinogénicas. Ante estas
agresiones, las bacterias han desarrollado diversos mecanismos para asimilar, degradar o
tolerar los compuestos nocivos presentes en el entorno.
Los investigadores han empleado estos variados mecanismos microbianos con fines
de beneficio para la sociedad por medio de la biotecnología. El uso de las herramientas bio-
tecnológicas intenta aprovechar, con distintos propósitos, la amplia capacidad metabólica
que han desarrollado los microorganismos. Ejemplos de estas aplicaciones son el uso de
microorganismos para disminuir la contaminación (biorremediación) y el empleo de siste-
mas catabólicos microbianos (biodegradación) para la optimización de procesos industria-
les. Un más profundo entendimiento de las capacidades metabólicas microbianas
redundará sin duda en un mejor aprovechamiento de las propiedades biotecnológicas que
ofrecen los microorganismos.
Figura 1. Rutas propuestas para la degradación de terpenos acíclicos y leucina en Pseudomonas aeruginosa. Se marcan los
puntos donde participan los productos codificados en los operones liu y atu en las rutas superior (A) o inferior (B) del catabolis-
mo del citronelol. También se indican las rutas superior (C) e inferior (D) del catabolismo de la Leucina. Tomada de Aguilar et
al. (2006).
Figura 2. Arbol filogenético de la familia LCHR de transportadores de cromato. Se muestran las 77 secuencias de proteínas ho-
mólogas de ChrA de Pseudomonas aeruginosa. A la izquierda se muestra la clasificación taxonómica de los organismos y a la
derecha las siete subfamilias. Las flechas rojas señalan las dos proteínas caracterizadas a nivel funcional. Tomada de Cervantes
y Campos-García (2007).
brana. Estos datos sugieren que ChrA surgió como resultado de un evento de duplicación
génica, seguida de la inserción del STM VII. Estos resultados también sugieren que las dos
mitades de la proteína llevan a cabo funciones distintas para el transporte de cromato (Jimé-
nez-Mejía et al., 2006).
Figura 3. Representación esquemática de la estructura de la proteína BrfA de Thermotoga maritima. El dominio â-sandwich
está coloreado en amarillo arriba a la derecha y las cinco aspas del dominio â-propela están representadas con colores individua-
les. La molécula de rafinosa está representada en “bonds” y los residuos catalíticos (D17 y D190) en “ball and stick”. Las coor-
denadas se obtuvieron del archivo 1W2T (Alberto et al., 2004) y la figura se preparó con los programas Molscript (Kraulis,
1991) y Raster3D (Merrit y Bacon, 1997).
Glu101, Arg137 y Glu188) y cinco residuos aromáticos (Trp41, Phe74, Tyr92, Tyr240 y
Trp260) (Alberto et al., 2006).
La enzima BrfA ha mostrado tener afinidad por diversos sustratos, como sacarosa, ra-
finosa, levana e inulina. Estudios con mutantes de esta enzima han señalado que, a pesar
de tener una mayor afinidad por sustratos como rafinosa o inulina (Km 15 y 19 mM, respecti-
vamente) que por sacarosa (Km 59 mM), al estudiar la eficiencia catalítica de la enzima se
observó que esta situación se invierte, encontrándose valores de kcat/Km de 9.3 x 103, 3.1 x
104 y 4.1 x 104 M-1s-1 para rafinosa, inulina y sacarosa, respectivamente (Alberto et al., 2006;
Merlos, 2007).
La alta eficiencia catalítica de la invertasa BrfA de T. maritima, y su alta termoestabili-
dad (temperatura óptima de 85ºC), la hacen compatible con los procesos industriales de ex-
tracción de sacarosa a partir de jugos de caña, que se realizan a 85ºC. Sin embargo, la
actividad de la enzima se ve drásticamente disminuida cuando se obtiene de jugo de caña
crudo en lugar de jugo de caña que fue sometido a un proceso de clarificación y desminerali-
zación (Tabla 1; Merlos, 2007). El tren de desmineralización, en consecuencia, toma un pa-
pel relevante; éste proceso consta de un tratamiento en serie con resinas catiónica fuerte,
aniónica débil, aniónica fuerte y catiónica fuerte. Este último paso se utiliza para controlar la
fuga de iones y regular el pH del jugo a 4.5.
TABLA 1
Actividad de BrfA en jugo de caña de azúcar
Bajo las condiciones de acidez (pH 4.5) y temperatura (85ºC) empleadas, al dejar la
reacción en incubación con la enzima por 1.5 h se encuentra una inversión (degradación) de
la sacarosa mayor del 90%. Estos resultados indican que la proteína BrfA de T. maritima
puede ser una importante alternativa para su uso a nivel industrial. En la actualidad, nos en-
contramos haciendo estudios de ingeniería de proteínas, para tratar de aumentar la activi-
dad de la enzima por medio de mutaciones sitio-dirigidas, y del diseño de reactores con
enzimas inmovilizadas, para buscar reducir los costos generados por el empleo de la enzi-
ma.
Agradecimientos
La investigación de nuestros laboratorios es apoyada por la CIC (UMSNH) y el
COECYT.
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