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Historia del artículo: Los productos agrícolas pueden perecer fácilmente si no se los cuida bien durante el
Recibido el 6 de julio de 2018 tratamiento poscosecha. Una de las principales causas de los productos dañados es la
Recibido en forma revisada 20 de agosto contaminación biológica de hongos patógenos, como Rhizopus spp. que da lugar a los
de 2019 Aceptado 30 de agosto de 2019
síntomas de la putrefacción de Rhizopus. El propósito de esta investigación fue aislar
Rhizopus spp. de diferentes productos agrícolas que muestran síntomas de putrefacción
PALABRAS CLAVE: de Rhizopus, así como para identificarlos. Se aislaron cultivos puros de rizopo en agar
Rhizopus rot, de dextrosa de patata. La identificación se realizó a través de técnicas moleculares
SU rDNA, utilizando el Kit de Extracción de ADN PhytopureTM y el Kit de ADN de Planta RSC para aislamiento de
moho, ADN, espaciador transcrito interno (ITS4 e ITS5) como cebadores para amplificación y análisis genético evolutivo molecular 7 (MEGA7) para la
reconstrucción del árbol filogenético a partir del resultado de la secuencia. El árbol filogenético usando las estadísticas de Máxima Probabilidad
enfermedad poscosecha,
R.
con 1000 replicaciones de la prueba de bootstrap mostró cinco cepas, a saber, AR9, AR10, AR11, AR13 y AR14, que pertenecen a
agricultura
delemar, y las otras siete cepas restantes, AR1-AR7 pertenecen a R. stolonifer. La identificación se aclaró con
datos morfológicos y fisiológicos utilizando el crecimiento de Rhizopus en el control de
temperatura de 33 y 42°C, así como la observación microscópica que involucra
rizoides, columelas, medición de esporangiosporas y esporangioóforos.
2.3. Rhizopus Isolation PCR fue operado 94°C, 2 min; 35 ciclos a 94°C, 15 seg; 55°C, 30 min; 72°C, 1
Se determinó la putrefacción del rizopo a partir de min; 72°C, 5 min. Los resultados de la PCR se visualizaron en gel de agarosa al
productos agrícolas mediante la clarificación microscópica 1% a 100 V durante 45 min, y luego se siguió teñido de bromuro de etidio
de la estructura rizoidea. El aislamiento se realizó durante 15 min. El gel se enjuagó con acuarelas y se observó con luz UV
mediante el método de enchapado directo en una placa de
(Hartanti et al. 2015).
agar de dextrosa (PDA) de patata que contenía 250 ppm de
cloranfenicol. Los cultivos se incubaron a 28°C. Los aislamientos extraídos y amplificados sin complicaciones con el kit de extracción de ADN
PhytopureTM se trataron con un protocolo rápido de Promega Maxwell= RSC Plant DNA
La suspensión de esporas de un cultivo de 4 días de
Kit con el sistema RSC Maxwell (AS4500). Se colocó una
edad se llevó a cabo para adquirir una sola hifa. La única
muestra de hasta 20 mg en el fondo de un microtubo
hifa fue transferida a un medio PDA fresco. El único
ClickFit con una capacidad de 1,5 ml. Se añadió nitrógeno
aislamiento de hifas se incuba a 28°C durante dos días. La
líquido a la muestra para congelarla. Usando una mano de
única hifa obtenida se transfirió a un nuevo medio PDA
plástico, la muestra congelada fue molida contra la pared
inclinado para la recolección de cultivos. del tubo. Se añadió hasta 300 μl de tampón de lisis de cola
(TLA) a cada tubo, seguido de 10 μl de ARNAsa. Todos los
2.4. Identificación molecular de Rhizopus tubos se agitaron brevemente durante 10 segundos. y se
La extracción genómica de rizopos se realizó con
centrifugaron a 13.000 rpm durante 2 min. Se instaló una
materiales adquiridos de illustra Nucleon PhytopureTM Kit.
Mycelia se recogió de la colección de cultivo anterior y se transfirió a un tubo de Eppendorf con una
bandeja de cubierta y cartuchos del kit. Se añadió una
capacidad máxima de 1,5 ml que ya contenía 500 miliQ μl. Se hizo centrifugación a 10.000 rpm durante 10 cantidad de 300 μl de NFW al primer pozo de cada
minutos, seguida de la eliminación del sobrenadante. El pellet fue machacado con una cuchara de plástico
hasta que el pellet formó una sustancia similar a la avena. Se agregaron hasta 300 μl de reactivo 1, seguido cartucho reactivo del Kit de ADN de la Planta de RSC. El
de resuspensión. Se añadieron hasta 3 μl de ARNsa (20 μg/ml), se resuspendieron y luego se incubaron a
37°C durante 30 min. Se añadieron hasta 200 μl de reactivo 2 y se agitaron hasta que fueran homogéneneos, lisado de la muestra, excluyendo cualquier material sólido,
luego se incuba a temperatura ambiente durante 10 min y se pone en hielo durante 20 min. La suspensión de
micelias se añade a continuación con 500 μl de fenol frío: cloroformo: isopropanol, luego se agita la mezcla se transfirió del tubo de extracción al primer pocillo del
durante 10 min a temperatura ambiente y se centrifuga a 10,000 rpm a 4°C durante 10 min. El sobrenadante
formado se transfirió a un nuevo tubo de Eppendorf, y luego se añadió con isopropanol frío hasta la mitad
cartucho reactivo. Las muestras fueron programadas bajo el
del volumen del tubo mientras
Sistema RSC Maxwell con 45 min. de duración.
Los resultados de la PCR fueron secuenciados por 1st
Base, Malasia. La secuencia de ADN fue editada usando
ChromasPro2. La secuencia editada se alineó con la
referencia de la base de datos de ADN en Gene Bank,
incluyendo especies tipo Rhizopus
(www.ncbi.nih.gov/Genbank), utilizando MEGA7 con el
grupo externo Phycomyces blakesleeanus. El resultado de
alineación se utilizó para construir el árbol filogenético
utilizando el método MEGA7 con máxima probabilidad
(ML).
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Vol. 27 No. 1, enero de 2020
3. Resultados
4. Debate
0.10
Figura 1. Árbol filogenético de las cepas de Rhizopus AR1-7, 9-11, 13-14 comparado con la especie de referencia utilizando las
estadísticas de máxima probabilidad con 1.000 réplicas de la prueba bootstrap
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Tabla 2. Datos fisiológicos de Rhizopus delemar y Rhizopus measuring mostly within 1,000 μm, and reaching 1,700 μm
stolonifer realizados a temperatura 33 y 42°C or more in length; in this study 120.43-1,088.50 μm of
sporangiophore’s length was acquired. R. stolonifer had
Código de cepa 33°C 42°C sporangiophores measuring mostly within 2,500 μm,
R. STOLONIFER AR1 - reaching 3,000 μm or more in length; in this study 463.69-
R. STOLONIFER AR2 -
R. stolonifer AR3 -
2,683.87 μm of sporangiophore’s length was acquired.
R. STOLONIFER AR4 - Swellings were supposedly seen mostly at the apex or the
R. STOLONIFER AR5 - middle portion of the R. delemar sporangiophores;
R. stolonifer AR6 - meanwhile, R. stolonifer had no swellings present. Both R.
R. STOLONIFER AR7 - delemar and R. stolonifer are typically ovoid, ellipsoidal, or
R. delemar AR9 + - roundish conical shaped columellae. The diameter of
R. delemar AR10 + - sporangiospores on R. delemar is mostly 5-9 (-14.5) μm,
R. delemar AR11 + -
R. delemar AR13 + - and when irregular it reached 53 μm in length; in this study
R. delemar AR14 + - 2.31-
Annotation: (+) growth, (-) no growth
un
b e
Figure 2. Rhizopus delemar strain collected from cherry tomato and peach: (a) sporangiophores in one cluster arising from rhizoid, (b)
finger-like shaped rhizoid, (c) columella with distinct apophyses, (d) irregular shaped sporangiospores, (e) swelling on
sporangiophore
42 Hartanti ATet al.
un b
c d
Figure 3. Rhizopus stolonifer strain colleted from apple, banana, and pear: (a) profusely branched rhizoid, (b) irregular shaped
sporangiospores, (c) columellae with distinct apophyses, (d) sporangiophores in single clusters arising from rhizoid
10.23 μm of sporangiospore’s diameter was acquired. delemar and R. oryzae were distinct from each other by
Rhizopus stolonifer had sporangiospores with a diameter the acids they produced. Rhizopus delemar was reported
measuring mostly 5-12.5 (-19) μm; in this study 5.41- to be lacking ldhA gene, which was responsible in the
24.55 μm of sporangiospore’s diameter was acquired. production of lactic acid; furthermore, R. delemar was
Rhizopus spp. can be divided into fumaric-malic classified to be a fumaric-malic acid producer. On the
acid producers, lactic acid producers, and producers of other hand, R. oryzae was capable of producing lactic
both. Although there wasn’t a clear correlation between acid, thus making R. oryzae different from R. delemar
organic producers and morphological classification, R. (Abe et al. 2007).
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Vol. 27 No. 1, January 2020
Abe et al. (2010) reported that R. americanus, R. hence, making it useful in oil companies or biodiesel
sexualis, and R. stolonifer shared morphological and production (Shimada et al. 1997). Protease produced by R.
physiological features. However, R. stolonifer is stolonifer is of greater importance due to its higher protease
heterothallic, and both R. americanus and R. sexualis are producing activity. Protease is essential in about 60% of
homothallic, so these strains are classified as independent total enzyme market and capable of digesting insoluble
species in morphological taxonomy. A molecular materials such as cellulose and protein (Kranthi et al.
phylogeny cluster occuring in phylogenetic trees based on 2012). Naming and validating a specific Rhizopus species is
rDNA-ITS, act1, and EF-1α consisted of R. reflexus, R. an essential step to ensure the role and benefit of the actual
stolonifer, R. sexualis, and R. americanus. Abe et al. (2010) sample acquired.
reclassified these species to be in the R. stolonifer group.
However, high divergence and multiple types sequences in 5. Conclusion
this cluster should be modified further for conclusive
taxonomy. Twelve strains were successfully isolated and identified
Rhizopus stolonifer AR7, AR6, and AR2 is similar to R. from nine different types of agricultural products. Five
stolonifer occuring on pear (Kwon and Lee 2006), guava strains were identified as R. delemar and the other seven
(Ooka 1980) and grapes (Latorre et al. 2002). Although R. remaining strains were identified as R. stolonifer. These
delemar AR10 and AR14 were found on cherry tomato and strains have the potential to yield useful organic acids and
tomato, R. stolonifer has been reported to be the fruit enzymes for many types of industries.
pathogen as well (Kwon et al. 2001). Rhizopus stolonifer
AR1, AR3, AR4, AR5 and R. delemar AR11, AR9
contradict reports of R. oryzae invading banana, apple, Acknowledgements
sweet potato, and strawberry (Kwon et al. 2011, 2012a,
2012b, 2014). Although R. delemar AR13 occured on The authors would like to thank Faculty of
peach, this product had the potential in experiencing R. Biotechnology, Atma Jaya Catholic University of Indonesia
stolonifer rot (Kwon and Lee 2006). Host nutrients and for providing a fund to support this research.
acidic pH are required for all Rhizopus species to germinate
optimally, thus different agricultural products from
different origins do not trigger species specific growth. References
There’s no clear correlation between the host nutrients, in
this case agricultural products, and Rhizopus species. Abe A et al. 2007. Rhizopus delemar is the proper name for
However, environmental factor affects prominently in the Rhizopus oryzae fumaric-malic acid producers. Mycologia
infection of species specific pathogens, which might result 99:714-722.
Abe A et al. 2010. A molecular phylogeny-based taxonomy of the
in inconsistencies of Rhizopus spp. discoveries from genus Rhizopus. Biosci Biotechnol Biochem 74: 1325-
different regions. The ecology and distribution of Rhizopus 1331.
spp. on fruits or vegetables are inadequate in mild or Hartanti AT et al. 2015. Rhizopus species from fresh tempeh
tropical regions; therefore, it is hard to conclude whether collected from several regions in Indonesia. HAYATI J
some of the known fungi are limited to specific hosts and Biosci 22:136-142.
Kranthi VS et al. 2012. Protease production by Rhizopus stolonifer
geography. through solid state fermentation. Cent Eur J Biol 1:113-
Rhizopus spp. are capable of producing significant 117.
amount of organic acids and enzymes that could be used in Kwon JH et al. 2001. Rhizopus soft rot on cherry tomato caused
industries and medicinal uses. Rhizopus delemar and R. by Rhizopus stolonifer in Korea. Mycobiology 29:176-178.
stolonifer produce fumaric acid used in plastic industry, and Kwon JH, Lee CJ. 2006. Rhizopus soft rot on pear (Pyrus
serotina) caused by Rhizopus stolonifer in Korea.
to a lesser extent, in the food industry (Roa Engel et al. Mycobiology 34:151-153.
2008). Rhizopus stolonifer also produces lactic acid and is Kwon JH et al. 2011. First report of Rhizopus oryzae as a
often used in dairy industry as preservatives or flavour postharvest pathogen of apple in Korea. Mycobiology
enhancer (Soccol et al. 1994). Rhizopus stolonifer was 39:140–142.
reported to bring about hydroxylation in the synthesis of Kwon JH et al. 2012a. First report of Rhizopus oryzae as a
postharvest pathogen of sweet potato in Korea. Plant
steroid used in treating hormonally imbalanced individuals, Pathol J 28:114.
patients with auto-immune diseases, and as birth control Kwon JH et al. 2012b. Soft rot of Rhizopus oryzae as a
pills (Nassiri-Koopaei and Faramarzi 2015). Rhizopus postharvest pathogen of banana fruit in korea.
delemar was reported to produce extracellular lipase Mycobiology 40:214-216.
capable of acidolysis. The lipase acted strong on myristic, Kwon JH et al. 2014. Rhizopus fruit rot caused by Rhizopus
oryzae on strawberry. J Agric Life Sci 48:27-34.
palmitic, palmitoleic, stearic, oleic, linoleic, and α-linolenic
acids,
44 Hartanti ATet al.
Latorre BA et al. 2002. Severe outbreaks of bunch rots caused by Schipper MAA. 1984. A revision of the genus Rhizopus. I. The
Rhizopus stolonifer and Aspergillus niger on table grapes Rhizopus stolonifer group and Rhizopus oryzae. Stud
in Chile. APS 86:815. Mycol 25:1-19.
Liu XY et al. 2007. Molecular phylogenetic relationships within Schipper MAA, Stalpers JA. 1984. A revision of the genus
Rhizopus based on combined analyses of ITS rDNA and Rhizopus. II. The Rhizopus microsporus group. Stud Mycol
pyrG gene sequences. Sydowia 59:235-253. 25:30-34.
Nassiri-Koopaei N, Faramarzi MA. 2015. Recent developments in Shimada Y et al. 1997. Fatty acid specificity of Rhizopus delemar
the fungal transformation of steroids. Biocatal lipase in acidolysis. J Biosci Bioeng 83:321-327.
Biotransformation 33:1-28. Soccol CR et al. 1994. Production of ʟ-lactic acid by Rhizopus
Ooka JJ. 1980. Guava fruit rot caused by Rhizopus stolonifer in species. World J Microbiol Biotechnol 10:433-435.
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