INVESTIGACIÓN BIOINFORMATICA

Integrantes: Ximena Cajamarca, Nathaly Romero

Bioinformática para la agricultura en la era de la secuenciación de próxima generación
Introducción
La bioinformática surgió del requerimiento inicial de una informática adecuada para la
organización, gestión y distribución de datos biológicos, pero pronto se reveló también fundamental en
la provisión de herramientas para el análisis, interpretación y modelado de datos. Además, gracias a la
bioinformática, fue posible analizar y comprender la estructura y función no solo de biomoléculas
individuales, sino también de colecciones moleculares más grandes, derivadas de los llamados enfoques
experimentales ómicos. La rápida difusión de las técnicas ómicas, con su creciente poder y costos más
accesibles, aumentó drásticamente la cantidad de colecciones de datos moleculares de diferentes niveles
de organización de un organismo o una muestra ambiental. Esto favoreció una visión holística de la
organización y funcionalidad de los sistemas. La reciente introducción de las tecnologías de
secuenciación de próxima generación (NGS) revolucionó aún más la secuenciación de ácidos nucleicos
y contribuyó a una nueva era en los enfoques ómicos.
Desarrollo

• Genómica de especies únicas y múltiples para la agricultura

La genómica, la transcriptómica, la proteómica y la metabolómica pueden contribuir a la

comprensión de la organización y la funcionalidad de los sistemas biológicos, con la posibilidad de
rastrear también la variabilidad molecular durante el desarrollo, en diferentes condiciones, como
fisiológicas, patológicas o influenciadas por cambios ambientales.
En enfoques individuales, se investiga la organización y la funcionalidad de células, tejidos u
órganos específicos, principalmente para identificar factores que influyen en las propiedades
emergentes, como la calidad y la forma. Esto también allana el camino para la caracterización de
características aún más complejas o procesos (Semagn K, Bjornstad Å,,2010).

• Impacto de NGS en la agricultura

Los temas científicos multifacéticos en las ciencias agrícolas pueden ser consistentemente
respaldados por NGS ómicas para individuos, poblaciones o comunidades individuales.
La secuenciación de genomas completos de varias especies permite definir su organización y
proporciona el punto de partida para comprender su funcionalidad, favoreciendo así la práctica de la
agricultura humana. Los esfuerzos dirigidos a lograr un conocimiento adecuado de la información
molecular asociada, como la que surge de la secuenciación del transcriptoma y el proteoma, también
son fundamentales para representar mejor el contenido génico de un genoma y sus principales
funcionalidades. Estos esfuerzos conducen a importantes avances en todas las ciencias biológicas y
también en la agricultura. Además, la elucidación de la complejidad de los genes y su red es fundamental
para que eventualmente se traduzca en prácticas de mejoramiento para cultivos o ganado, contribuyendo
a su salud, resistencia y productividad (Benkeblia N,2011).

• La revolución de las tecnologías ómicas y el impacto en la bioinformática

La introducción de enfoques ómicos tuvo un gran impacto en la bioinformática en la

recopilación de datos, la organización, la integración y la implementación de herramientas de minería
de datos adecuadas. El apoyo de la bioinformática eficiente favoreció la introducción de las
denominadas tecnologías de alto rendimiento, allanando el camino para el florecimiento de los
esfuerzos de secuenciación del genoma de especies modelo clave, como Homo sapiens y Arabidopsis
thaliana.
La NGS contribuyó notablemente a expandir el número de genomas actualmente
completamente secuenciados, así como al establecimiento de nuevos esfuerzos ambiciosos, por
ejemplo, aquellos centrados en la secuenciación de múltiples genomas o aquellos que apuntan a definir
metagenomas globales de diferentes muestras ambientales para definir colecciones de referencia.
Las tecnologías NGS atrajeron un interés inesperado del mundo científico por su accesibilidad
y su poder de resolución, desafiando aún más la estabilización de los recursos y la integración de datos.
Por ejemplo, la secuenciación rápida de genomas completos de diferentes especies, como las de
diferentes genotipos o cultivares, enfrenta el cuello de botella causado por la necesidad de análisis y
curación de datos adecuados.
Conclusión
La bioinformática es el enfoque exclusivo capaz de explotar y compartir la gran cantidad de
datos ómicos que pueden proporcionar las diferentes tecnologías. Los métodos informáticos adecuados
y los recursos apropiados son fundamentales para detectar información biológica de valor añadido que
proporciona nuevos conocimientos sobre la organización de los sistemas biológicos. La era de la
bioinformática NGS está revolucionando el diseño experimental en biología molecular, contribuyendo
notablemente a aumentar el conocimiento científico al tiempo que impacta en aplicaciones relevantes
en muchos aspectos diferentes de la agricultura (Van Emon,2015).
Referencias bibliográficas

→ Van Emon J. Revolución Omics en la investigación agrícola. J Química agroalimentaria. 2015.

→ Semagn K, Bjornstad Å, Xu Y. La disección genética de los rasgos cuantitativos en los cultivos.
Electron J Biotechnol. 2010;13(5):16–7.
→ Benkeblia N. Agricultura sostenible y nuevas biotecnologías. Boca Ratón: CRC Press; 2011.