Los reguladores de la transcripción activan y desactivan la transcripción de genes

individuales en las células

En los procariotas, estas proteínas generalmente

se unen a secuencias de ADN específicas
cercanas al sitio de inicio de la ARN polimerasa

En eucariotas es mucho más compleja, acorde con un tamaño de genoma más grande y la
gran variedad de tipos de células que se forman
 Regulación genética por operón

Un operón bacteriano típico consiste en:

 Gen regulador (I): codifica la proteína represora

 Promotor (P): donde la RNA polimerasa se une al DNA antes de comenzar la transcripción

 Operador (O): sitio de unión para una proteína reguladora del gen (represor)

 Represor: proteína que reconoce una secuencia especifica de pares de bases dentro del
DNA y que se une a esa secuencia con alta afinidad

 Genes estructurales: Generalmente se encuentran adyacentes entre si, y la RNA polimerasa

se mueve de un gen estructural al siguiente
 ¿Cómo aumenta o disminuye la expresión génica en respuesta al cambio ambiental?

En los procariotas, las proteínas reguladoras a menudo están controladas por la disponibilidad
de nutrientes

Algunas proteínas reguladoras son activadores. Cuando un activador se une a su sitio de fijación
del ADN, aumenta la transcripción del operón

Ej.: Una bacteria con un exceso de

aminoácidos que señalan el "encendido"
de algunos genes y el "apagado" de otros
 Algunos aminoácidos se unirían a proteínas reguladoras positivas llamadas activadores

Las proteínas activadoras se unen a los sitios reguladores del ADN cercanos a las regiones
promotoras que actúan como interruptores de encendido/apagado

Algunos promotores no funcionan

en ausencia de proteínas activadoras
de genes o factores de transcripción

Otros promotores pueden ser

inherentemente activos

Otros aminoácidos se unirán a proteínas reguladoras negativas llamadas represores, que se

unen a sitios reguladores en el ADN que bloquean eficazmente la unión de la RNA polimerasa
Control positivo, se requiere un activador para activar un gen,
en respuesta a una señal de algún tipo

Control negativo, un represor apaga un gen y solo se expresa

en presencia de una señal que elimina el represor del gen
 Represor de triptófano apaga los genes

El genoma de E. coli codifica aproximadamente 4300 proteínas

Las bacterias regulan la expresión de muchos de sus genes según las fuentes de alimento
disponibles en el medio ambiente

Cinco genes codifican enzimas que fabrican

el aminoácido triptófano. Están dispuestos
en un grupo en el cromosoma y se
transcriben a partir de un solo promotor
(una molécula de mRNA)

Su expresión está controlada por una secuencia reguladora (operador)

 [Triptófano] ↓ el operón se transcribe; el mRNA resultante se traduce para producir un
conjunto completo de enzimas biosintéticas, que trabajan en conjunto para sintetizar triptófano

[Triptófano] ↑ el operón no se transcribe; el aminoácido se importa a la célula y detiene la

producción de las enzimas, que ya no son necesarias
 El represor no puede unirse al operador DNA por si mismo, donde el triptófano funciona
como un correpresor

El represor activa y desactiva la producción de un conjunto de enzimas biosintéticas según la

disponibilidad del producto final de la vía que catalizan las enzimas

La proteína represora de triptófano está siempre presente en la célula. El gen que lo codifica
se transcribe continuamente a un nivel bajo, de modo que siempre se produce una pequeña
cantidad de la proteína represora
 Operón triptófano: regulación por atenuación

Se identificó mutantes que afectaban la proteína represora (gen trpR) y que continuaban
produciendo mRNA del operón trp aún en presencia de triptófano

Demostró que estos mutantes tenían una deleción (30 bases que se extendía desde la
posición 130 a la 160) entre el operador y el primer gen estructural, el gen E
 Atenuador, región del ADN inactivada por la deleción, ya que su presencia conduce
aparentemente a disminuir la tasa de transcripción

La región atenuadora actúa como una región terminadora de la transcripción en presencia de

triptófano, mientras que en ausencia de triptófano el atenuador se desactiva y todas las
moléculas de mRNA se completan
 Regulación mediada por catabolitos (cAMP, y proteínas CRP o CAP)

Proteínas activadoras de la transcripción actúan sobre promotores

Las proteínas activadoras unidas al DNA pueden

aumentar la tasa de iniciación de la transcripción

La proteína activadora debe estar unida a su

secuencia reguladora, y esta secuencia debe estar
posicionada, con respecto al promotor, de modo
que puedan ocurrir las interacciones favorables

En las bacterias, la unión del activador al DNA suele estar controlada por la interacción de un
metabolito u otra molécula pequeña (triángulo rojo) con la proteína activadora
CRP responde a la disponibilidad general de fuentes de carbono y media la elección entre
diferentes azúcares

CRP es una proteína activadora global que se

requiere para activar los genes para usar maltosa,
lactosa y otros nutrientes menos favorecidos que
la glucosa. La proteína CRP es alostérica

CRP (CAP, catabolite activator protein) se une al AMP cíclico, forma dímeros y estos pueden
unirse a un sitio de reconocimiento en el ADN cadena arriba del promotor

La presencia de CRP ayuda a la RNA polimerasa a unirse al promotor

El AMP cíclico es una señal global de que la célula bacteriana se ha quedado sin glucosa

Sólo cuando esto ha ocurrido pueden activarse los genes para utilizar los nutrientes menos
favorecidos

Para activar los genes para usar la lactosa, se

requiere tanto una señal individual (la
disponibilidad de lactosa) como una señal
global que indique la necesidad de nutrición
(AMP cíclico)

Solo cuando el represor Lac está ausente y la proteína CRP está presente para ayudar, la RNA
polimerasa puede unirse al promotor y producir mRNA
 Un activador y un represor controlan el operón Lac

El operón Lac en E. coli, está

controlado tanto por el represor Lac
como por el activador CAP

En ausencia de glucosa, la bacteria produce cAMP, que activa CAP para activar genes que
permiten a la célula utilizar fuentes alternativas de carbono, incluida la lactosa

El represor Lac apaga el operón en ausencia de lactosa

 La región de control del operón Lac integra
dos señales diferentes, solo cuando se
cumplan dos condiciones: la glucosa debe
estar ausente y la lactosa debe estar
presente

Lactosa ausente: el represor Lac se une a una

secuencia reguladora (operador Lac), e
interrumpe la expresión del operón

Lactosa presente: ↑[alolactosa] intracelular

y se une al represor Lac sufriendo cambio
conformacional que librera su control
https://biomodel.uah.es/metab/expresion/operon_Lac.htm

El operon lac contiene tres genes estructurales en tándem

Si la lactosa esta presente en el medio:

 El disacárido entra a la célula a través de cantidades limitadas de galactosido permeasa

 Lactosa se une al represor lac, cambiando la conformación del represor y haciéndolo incapaz
de unirse al DNA del operador

Operón inducible, la proteína represora se une al DNA solo en ausencia de lactosa

 A medida que disminuye la concentración de
lactosa en el medio, el disacárido se disocia de
su sitio de unión en la molécula represora, lo
cual permite que el represor se una nuevamente
al operador y reprima la transcripción
https://es.khanacademy.org/science/biology/gene-regulation/gene-regulation-in-
bacteria/a/the-lac-operon
https://biomodel.uah.es/metab/expresion/operon_Lac.htm
 Sistema SOS
 Mientras que la mayoría de estos sistemas de reparación del DNA están prácticamente
libres de errores, algunos son propensos a errores y el propio sistema de reparación
introduce la mutación

 El daño a gran escala causado por productos químicos muy

múgatenos o por grandes dosis de radiación, pueden interferir
con la replicación

 Si las lesiones causadas no pueden ser reparadas antes de que

comience la replicación, esta se estancara

El estancamiento de la replicación, así como algunos tipos de daño importante en el DNA

activan el sistema de reparación SOS
 Sistema SOS

La reparación del DNA se puede realizar sin necesidad de cadena molde (incorporación
aleatoria de dNTPs). Esto ocasiona muchos errores (muchas mutaciones)

“Las mutaciones normalmente pueden ser corregidas mientras que las rupturas no”

El sistema SOS de reparación de E. coli regula la transcripción de aprox 40 genes localizados

por todo el cromosoma que participan en la reparación del DNA y la tolerancia a daños
causados en el DNA

Las dos polimerasas reparadoras propensas a cometer errores son: la DNA polimerasa V,
una enzima codificada por los genes umuCD, y la DNA polimerasa IV, codificada por dinB
 Sistema SOS

Esta regulado por dos proteínas, LexA y RecA:

 LexA es una proteína represora, impide la expresión del sistema SOS

 La proteína RecA, se activa por la presencia de daño en el DNA, en particular por el DNA
monocatenario que se forma debido al estancamiento de la replicación

 La forma activada de RecA estimula la autoinactivación de LexA

 Sistema SOS
La proteína LexA reprime la actividad del gen recA y de los genes de reparación del DNA
uvrA y umuCD (las proteinas UmuCD forman parte de la DNA-polimerasa V)

La represión no es completa. Se produce un poco de proteína RecA incluso en presencia de la

proteína LexA
 SISTEMAS DE REGULACIÓN DE DOS COMPONENTES

Las bacterias poseen también numerosos sistemas en los que la señal ambiental no entra a
la célula, sino que es detectada por un “sensor” a nivel de membrana, el cual “reemite”
(transducción) el estímulo hacia una proteína citoplasmática

 Familia de histidín-proteín-quinasas (HPK): Este tipo de proteínas son las sensoras de algún
tipo de estímulo ambiental
 Familia de reguladores de respuesta (RR): cada regulador de respuesta, tras ser fosforilado
en cierto aspártico por su correspondiente HPK, ejerce algún efecto regulatorio.
Normalmente, los RR fosforilados actúan como activadores de la transcripción de ciertos
operones