Las enfermedades infecciosas son una de las amenazas
mas intimidantes, responsables de una inmensa carga de discapacidades y muertes.
La base fundamental de un tratamiento adecuado es la
identificación del agente causal de la infección, utilizando herramientas diagnosticas rápidas, sensibles, específicas y de bajo costo.
El laboratorio de bacteriología proporciona resultados
confiables y reproducibles todo esto para: • El diagnostico y tratamiento de las enfermedades de los pacientes; • Fortalecimiento de la vigilancia de las infecciones asociadas a la atención a la salud, para su prevención y control.
Por esta razón debemos seguir lineamientos para poder
ser realmente un apoyo al médico, entre los cuales se encuentran:
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Recolección, transporte, almacenamiento y procesos de muestras en bacteriología
Toda la información diagnóstica que el laboratorio de
bacteriología pueda proporcionar, depende de la “calidad” de la muestra recibida.
Por ello una toma mal realizada, pobremente recogida,
o mal transportada determinará un posible fallo en la recuperación de los agentes patógenos, que pueden inducir a errores diagnósticos, e incluso a un tratamiento inadecuado del enfermo.
Una vez que la muestra llega al laboratorio debe
registrarse, la hora y la fecha de recibida en la requisición.
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Al mismo tiempo tanto la muestra como la solicitud deben ser revisadas para comprobar que cumplen con los criterios de aceptación.
Estos criterios deben ser establecidos por el laboratorio
basados en bibliografía, como ejemplo se colocan los siguientes: • Temperatura de transporte inadecuada • Medio de transporte inadecuado. • Tiempo de transporte muy largo. • Muestra mal etiquetado o sin etiquetar. • Recipiente sin muestra. • Contenedor roto o fracturado. • Muestra contaminada. • Muestras en hisopos secos. • Muestras inadecuadas para el estudio solicitado. • Muestras repetidas (excepto sangre) en un periodo de 24 horas.
Reglas generales para la toma de muestra:
1. Debe ser representativa del proceso infeccioso. 2. Debe ser recolectada en recipientes adecuados y estériles. 3. Evitar la contaminación con microorganismos colonizantes (piel y mucosas). 4. Debe ser obtenida antes de la primera dosis del antimicrobiano.
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Etapa analítica
Para la siembra de la muestra es importante saber
seleccionar los medios de cultivo, el tiempo, temperatura y condiciones de incubación, saber que tinciones son adecuadas para el microorganismo.
Figura 1. Consideraciones a tomar en cuenta en el cultivo de bacterias.
Una vez que ya creció se debe identificar al
microorganismo, para esto, debemos conocer las características microscópicas (tinciones), las características macroscópicas, pruebas rápidas de identificación (catalasa, oxidasa), pruebas bioquímicas y si se cuenta con ellos la utilización de microsistemas.
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Figura 2. Métodos de identificación de las bacterias.
Una vez ya identificado se debe someter a pruebas
de susceptibilidad antimicrobiana, la cual debe estar estandarizada para otorgar resultados confiables, debemos saber el tamaño del inoculo, que medio de cultivo utilizar, tiempo, temperatura y condiciones de incubación y que agentes antimicrobianos se deben utilizar según el microorganismo.
Identificación bacteriana
La seguridad y rapidez en la identificación bacteriana,
así como los estudios de sensibilidad antimicrobiana, la rapidez en el diagnóstico y tratamiento en el manejo de los pacientes con enfermedades infecciosas, reducen no solo la mobi-mortalidad sino también la propagación de la infección. Mes de la Microbiología Clínica Figura 3. Esquema en el que se muestra los pasos a seguir en la identificación de S. aureus.
En la siguiente figura se muestra un diagrama sencillo para
la identificación de los estreptococos.
En el siguiente esquema se muestra un esquema de
identificación sencillo de los bacilos Gram negativos.
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Para la identificación de las bacterias se pueden emplear métodos automatizados o semi manuales. En la siguiente figura se ejemplifica el sistema API para la identificación de microorganismos.
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En la siguiente figura se muestra el flujo de trabajo de un sistema automatizado de identificación de microorganismos como es el sistema VITEK.
En la siguiente figura se muestran ejemplos de equipos
automatizados empleados en la identificación de bacterias.
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Sistemas automatizados
Tienen un impacto clínico importante ya que los resultados
se entregan más rápidos lo que ocasiona un inicio o cambio precoz del antimicrobiano. Disminuye la carga de trabajo, procesa gran cantidad de muestras, mejora la estandarización en los procesos y control de calidad.
En el ámbito económico, disminuye el uso de antibióticos
de amplio espectro y disminuye los días de cama de los pacientes hospitalizados. Tienen un impacto epidemiológico ya que el soporte informático permite obtener con facilidad la epidemiología microbiana. Actualmente existen nuevas metodologías como el Xpert MTB/RIF que están basados en la detección de ácido nucleicos (PCR).
Figura 4. Esquema en el que se muestra el funcionamiento del equipo
Xpert MTB/RIF
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También existen los métodos basados en espectrofotometría de masas como el MALDI-TOFF, que al ionizar las biomoléculas de los microorganismos dan un espectro específico que ayuda en la identificación.
Figura 5. Diagrama en el que se muestra el funcionamiento del equipo
MALDI TOFF.
Para tener un buen antibiograma se debe tener un buen
control de calidad en todas las fases, existen dos métodos, los cuantitativos como los de dilución y los cualitativos como el método de difusión en agar. En el siguiente esquema se muestra el método de difusión en agar por la técnica de Kirby Bauer.
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También las pruebas de susceptibilidad se pueden realizar en métodos automatizados y a continuación se muestra un ejemplo del flujo de trabajo de un VITEK.
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Por último los resultados se deben interpretar y confirmar por un microbiólogo experto y sustentarse en una adecuada interrelación clínico-microbiológico, para que el informe no sea un conjunto de datos, sino un resultado con información con utilidad clínica.
Etapa post-analítica
Los resultados se deben validar antes de entregarse
de acuerdo a los valores de referencia, al paciente y el diagnóstico, se deben cotejar con los resultados precedentes. Cuando los resultados sean críticos o con alertas se deben verificar para hacer un buen informe.
Es importante que se difunda la información de cómo
se comportan los microorganismos, en cambios de prevalencia, cambios de perfiles de susceptibilidad y la presencia de brotes o cepas que presentan mecanismos de resistencia inusuales, estos informes pueden ser semestrales o anuales dependiendo las necesidades del hospital.
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Inscripciones abiertas para el Diplomado de Microbiología Clínica