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TEMA II:
NOMENCLATURA DE COMPUESTOS
ORGÁNICOS E ISOMERÍA
GUÍA DE EJERCICIOS
MARZO, 2021
PARTE I: NOMENCLATURA DE COMPUESTOS ORGÁNICOS.
A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z
A-E 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1
F-J 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2
K-O 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3
P-T 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4
U-Z 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5
Ejemplo: Ramón Mijares Fajardo → inicial primer apellido M; inicial segundo apellido F
Ejercicios asignados: Grupo 3
AMINOÁCIDOS RAMIFICADOS - 2 - 4 5
Los aminoácidos ramificados básicos y esenciales se refiere a un tipo de aminoácidos que posee
un compuesto alifático que son no lineales (su nombre proviene de esta característica ramificada). Entre
ellos se encuentran la leucina, la isoleucina y la valina. Se trata de los aminoácidos más hidrófobos y se
ingieren mediante una dieta adecuada. La combinación de estos tres aminoácidos esenciales compone
casi la tercera parte de los músculos esqueléticos en el cuerpo humano y desempeñan un papel muy
importante en la síntesis de proteínas. Los aminoácidos de cadena ramificada se emplean frecuentemente
en los tratamientos de los pacientes que han sufrido quemaduras, así como en los suplementos dietéticos
de los atletas que practican musculación.
La leucina es uno de los veinte aminoácidos que utilizan las células para sintetizar proteínas. Su
cadena lateral es no polar, un grupo isobutilo (2-metilpropilo). La leucina se usa en el hígado, tejido adiposo,
y tejido muscular. En tejido adiposo y muscular, se usa para la formación de esteroles, y solo el uso en
estos dos tejidos es cerca de siete veces mayor que el uso en el hígado. La estructura molecular de la
isoleucina es casi idéntica a la de la leucina, variando únicamente por la colocación de sus átomos que es
ligeramente diferente, dando lugar a propiedades diferentes; su cadena lateral es no polar, un grupo sec-
butilo (1-metilpropilo).
La valina forma parte integral del tejido muscular, puede ser usado para conseguir energía por los
músculos en ejercitación, posibilita un balance de nitrógeno positivo e interviene en el metabolismo
muscular y en la reparación de tejidos. La valina es la responsable de una enfermedad genética conocida
como anemia de células falciformes, la persona que la padece tiene un tipo de hemoglobina especial
llamada hemoglobina S, que hace que los glóbulos rojos tengan una forma de hoz en vez de tener la
tradicional forma de plato, y que tengan una vida media entre seis y diez veces menor, causando anemia
y otras complicaciones. La anemia de células falciformes se produce por una codificación anómala de la
hemoglobina por la que la valina ocupa el lugar de otro aminoácido, el ácido glutámico.
Actividad:
- Identifique los grupos funcionales presentes en cada una de las estructuras de los aminoácidos
ramificados.
- Haciendo uso de la lectura identifique cuales de las estructuras pertenecen a la Leucina e
Isoleucina.
- Nombre las estructuras de estos aminoácidos, empleando las normas de nomenclatura IUPAC.
SIMPLES Y PEQUEÑOS - - - - -
Dentro de los 20 aminoácidos que forman parte de las estructuras proteicas de los seres vivos, la
glicina y la alanina con los más simples y pequeños de todos. La glicina es el aminoácido más pequeño y
el único no quiral de todos los presentes en la célula, además es un aminoácido no esencial, que puede
ser sintetizado por los organismos vivos. Otro nombre (antiguo) de la glicina es glicocola. Se utiliza en el
organismo para sintetizar gran número de sustancias; por ejemplo, el grupo C 2N de todas las purinas se
consigue gracias a la glicina. También tiene funciones como neurotransmisor inhibidor en el sistema
nervioso central, especialmente en la médula espinal, tallo cerebral y retina.
Por otra parte, la alanina es el aminoácido más pequeño después de la glicina y se clasifica como
hidrofóbico. Es un aminoácido no esencial para el ser humano, pero es de gran importancia. Existe en dos
distintos enantiómeros L-alanina y D-alanina. La L-alanina es uno de los 20 aminoácidos más ampliamente
usados en biosíntesis de proteína, detrás de la leucina. La D-alanina está en las paredes celulares
bacteriales y en algunos péptidos antibióticos. Se encuentra tanto en el interior como en el exterior de las
proteínas globulares.
Actividad:
- Identifique los grupos funcionales presentes en las estructuras de la lectura.
- Nombre las estructuras empleando correctamente la nomenclatura IUPAC.
- Identifique la estructura de la alanina y glicina, basándose en la información presentada.
OMEGA 3 Y OMEGA 6 - - - - -
El ácido eicosatetraenoico (ETA) es un ácido graso de cadena lineal de 20 átomos de carbono con
dobles enlaces. Generalmente, en las ciencias biológicas se denomina así al ácido (cis,cis,cis,cis)-
8,11,14,17-eicosatetraenoico, un ácido graso omega 3 (ω-3), ya que el otro isómero que se encuentra en
la naturaleza se denomina ácido araquidónico (AA), un ácido graso omega 6 (ω-6). Estos ácidos grasos
son isómeros, químicamente idénticos excepto por la posición de los dobles enlaces. Ambos se podrían
llamar ácido eicosatetraenoico, pero solamente se denomina coloquialmente así al primero.
Los ácidos grasos del tipo ω-6 tienen la peculiaridad de tener el primer enlace doble en el carbono
de la posición 6, contando los carbonos desde el final de la cadena del ácido graso. En comparación, los
ω-3 tienen su primer doble enlace en el carbono 3, y los ω-9, en el noveno carbono. El ácido araquidónico
forma parte de fosfolípidos de las membranas de las células, y es el precursor de la biosíntesis de
eicosanoides. Además, puede sintetizarse a partir del ácido linoleico, uno de los ácidos grasos esenciales
requeridos por la mayoría de los mamíferos
Actividad:
- Realice la estructura molecular del ácido graso: ácido 8,11,14,17-eicosatetraenoico.
- A partir de la información de la lectura, realice la estructura molecular del isómero ácido
araquinódico.
- Identifique en cada estructura el grupo funcional e indique las posiciones ω específicas de cada
ácido graso.
Actividad:
- Identifique los grupos funcionales presentes en las estructuras no ionizadas del aspartato y
glutamato.
- Emplee la nomenclatura IUPAC para nombrar correctamente ambas estructuras.
- Identifique cuál es la diferencia entre ambas estructuras e indique cual aminoácido pertenece cada
una.
Son tres los aminoácidos que se presentan cargados positivamente a pH fisiológico: lisina, arginina
e histidina. De estos tres, la lisina e histidina son aminoácidos esenciales, los cuales deben ser suministrado
bajo una dieta correspondiente de alimentos. Mientras que la arginina es sintetizada por el organismo
humano en el tejido hepático, por medio del ciclo de la ornitina (o ciclo de la urea).
Dada la desigual distribución de la lisina entre los distintos alimentos, algunas dietas,
especialmente las basadas en cereales, pueden ser deficientes en ella. Esta deficiencia no suele tener
consecuencias, dado que la mayor parte de las dietas contienen un exceso de proteínas. En este caso,
simplemente se sintetizarán aquellas para las que haya suficiente lisina, y el resto de los aminoácidos en
exceso se metabolizarán para producir energía y urea.
Actividad:
- Identifique los grupos funcionales presentes en las estructuras de los aminoácidos de la lectura.
- ¿Cuál cree que sería la razón de que estos aminoácidos se encuentren en cargados positivamente
a pH fisiológico?
- La estructura de la lisina es la menos compleja de las tres, nombre dicha estructura empleando
correctamente las reglas de la IUPAC.
- Investigue e identifique, con sus nombres IUPAC, correspondientes las estructuras
correspondientes de la arginina e histidina.
La cisteína contiene un grupo tiol en su cadena lateral, que hace que este aminoácido, en su
totalidad, sea considerado como polar e hidrófilo. La parte tiol de la cadena suele participar en reacciones
enzimáticas. La cisteína también es llamada cistina, pero esta última se trata de un dímero de dos cisteínas
unidas mediante un puente disulfuro. La metionina es un intermediario en la biosíntesis de la cisteína, la
carnitina, la taurina, la lecitina, la fosfatidilcolina y otros fosfolípidos. Fallos en la conversión de metionina
pueden desembocar en ateroesclerosis.
Actividad:
- Identifique los grupos funcionales presentes en las estructuras de los aminoácidos azufrados.
- Nombre correctamente cada estructura empleando las reglas de nomenclatura IUPAC.
- Basándose en la información de la lectura responda: ¿Cuál de las estructuras corresponde a la
cisteína?
FARMACODINÁMICA DEL PARACETAMOL Y LA ASPIRINA 1 - 3 - 5
El ácido acetilsalicílico o AAS, conocido popularmente como aspirina, nombre de una marca que
pasó al uso común, es un fármaco de la familia de los salicilatos. Se utiliza como medicamento para tratar
el dolor (analgésico), la fiebre (antipirético) y la inflamación (antiinflamatorio), debido a su efecto inhibitorio,
no selectivo, de la ciclooxigenasa (COX), enzima precursora en la producción prostaglandinas.
Por otra parte, el paracetamol (DCI), también conocido como acetaminofén o acetaminofeno, es un
fármaco con propiedades analgésicas y antipiréticas utilizado principalmente para tratar la fiebre, y el dolor
leve y moderado. Durante mucho tiempo se ha creído que el mecanismo de acción del paracetamol es
similar al del ácido acetilsalicílico. Es decir, que actúa reduciendo la síntesis de prostaglandinas,
compuestos relacionados con los procesos febriles y el dolor, inhibiendo la ciclooxigenasa.
Sin embargo, hay diferencias importantes entre los efectos del ácido acetilsalicílico y el
paracetamol. Las prostaglandinas participan en los procesos inflamatorios, pero el paracetamol no presenta
actividad antiinflamatoria apreciable. Además, la COX también participa en la síntesis de tromboxanos que
favorecen la coagulación de la sangre; el AAS tiene efectos antiagregantes, pero el paracetamol no.
Finalmente, el AAS es perjudicial para la mucosa gástrica, donde las prostaglandinas desempeñan un papel
protector, pero en este caso el paracetamol es seguro.
De esta forma, mientras el AAS actúa como un inhibidor irreversible de la COX y bloquea el centro
activo de la enzima directamente, el paracetamol la bloquea indirectamente y este bloqueo es inútil en
presencia de peróxidos. Esto podría explicar por qué el paracetamol es eficaz en el sistema nervioso central
y en células endoteliales, pero no en plaquetas y células del sistema inmunitario, las cuales tienen niveles
altos de peróxidos.
Actividad:
- Identifique los grupos funcionales presentes en las estructuras moleculares de la aspirina y
paracetamol.
- ¿Cuál es el grupo principal que predomina en cada molécula?
- Empleando las normas IUPAC, nombre correctamente las estructuras de ambos fármacos.
- ¿Cuál de las estructuras pertenece al paracetamol?
Por su lado, el naproxeno se emplea en el tratamiento del dolor leve a moderado, la fiebre, la
inflamación y la rigidez provocados por afecciones como artrosis, artritis psoriásica, espondilitis
anquilosante, tendinitis y bursitis. También en el tratamiento de la dismenorrea primaria y la migraña. Al
igual que el ketoprofeno, actúa inhibiendo la síntesis de prostaglandinas. Se administra por vía oral, la dosis
habitual en adultos es entre 250 y 500 mg cada 12 horas, se une muy bien a la albúmina y por lo tanto
tiene una vida en la sangre más larga que otros medicamentos del grupo, llegando hasta 12 horas por
dosis. Mientras que la eficacia del ketoprofeno administrado oralmente para aliviar el dolor moderado a
severo y el mejoramiento del estado funcional y la condición general fue significativamente mejor que la
del ibuprofeno y/o diclofenaco.
Actividad:
- Identifique los grupos funcionales presentes en las estructuras del ketoprofeno y naproxeno.
- Realice la estructura molecular del precursor del ketoprofeno, el ácido fenilpropanoico.
- ¿Cuál de las dos estructuras pertenece al naproxeno?
- Nombre las estructuras presentes de estos fármacos, empleando la correcta nomenclatura IUPAC.
Los ácidos grasos están formados por una larga cadena hidrocarbonada con un grupo carboxilo
en un extremo. La cadena hidrocarbonada puede tener, según el ácido graso, entre 12 y 24 átomos de
carbono. Los ácidos grasos pueden ser insaturados, con dobles enlaces entre algunos de sus carbonos,
los cuales son líquidos a temperatura ambiente; mientras que los ácidos grasos saturados no tienen dobles
enlaces en su cadena hidrocarbonada y son sólidos a temperatura ambiente. Los ácidos grasos son
moléculas bipolares o anfipáticas. La cabeza de la molécula es polar o iónica y, por tanto, hidrófila. Mientras
que la cadena carbonada es apolar o hidrófoba. Algunos ácidos grasos de importancia son los siguientes:
Actividad:
- Realice las estructuras de cada uno de los ácidos grasos descritos en la lectura, empleando la
isomería geométrica.
- Aplique la nomenclatura IUPAC a la estructura mostrada del ácido linoleico.
- Clasifique las estructuras realizadas de los ácidos grasos como saturados o insaturados.
EJERCICIO Y LACTATO 1 - - - -
Cuando se realiza ejercicio, las fibras musculares requieren de mayor energía que la obtienen
principalmente de los carbohidratos y las grasas; cuando se agotan estos nutrimentos, las células pueden
metabolizar carbohidratos almacenados como el glucógeno y lo transforman en ácido láctico. Esto genera
energía suficiente para mantener la intensidad del ejercicio desde pocos segundos hasta un par de minutos;
si bien, se obtiene un poco más de energía también se genera la aparición de fatiga, dolor y/o ardor
muscular que detiene el ejercicio derivada de la acumulación de lactato en los músculos.
El ácido láctico, o su forma ionizada, el lactato, es un producto terminal del metabolismo anaeróbico
de la glucosa, desempeña importantes roles en varios procesos bioquímicos, como la fermentación láctica
y se obtiene por reducción del ácido pirúvico en una reacción catalizada por la enzima deshidrogenasa
láctica donde interviene como coenzima la nicotinamida adenina dinucleótido (NAD) que pasa de su forma
reducida a la forma oxidada, todo esto en procesos de fermentación.
ISOMEROS AZÚCARADOS 1 2 3 4 5
Los azucares simples químicamente representa las moléculas de carbohidratos más sencillas, los
monosacáridos: glucosa, fructosa y galactosa. Estas moléculas tienen la misma fórmula molecular C6H12O6,
por lo tanto, son isómeros. La fructosa, o levulosa, es encontrado en los vegetales, las frutas y la miel. Su
nombre sistemático es 1,3,4,5,6-pentahidroxi-2-hexenona. Todas las frutas tienen cierta cantidad de
fructosa (a menudo junto con glucosa), que puede ser extraída y concentrada para hacer un azúcar
alternativo.
Por su parte, la galactosa es un azúcar simple que se convierte en glucosa en el hígado como
aporte energético. Desde el punto de vista químico es una aldosa, es decir su grupo funcional es un
carbonilo ubicado en el carbono 1. Es un epímero de la glucosa en el Carbono número 4, es decir, que el
grupo de alcohol de este carbono está dirigido hacia la izquierda La galactosa es sintetizada por las
glándulas mamarias para producir lactosa, que es un disacárido formado por la unión de glucosa y
galactosa, por tanto, el mayor aporte de galactosa en la nutrición proviene de la ingesta de lactosa de la
leche.
Actividad:
- Empleando los conocimientos de nomenclatura, realice la estructura molecular de la fructosa.
- Basado en la información de la lectura realice la estructura del isómero galactosa.
- Identifique los grupos funcionales presentes en las moléculas de estos azucares simples.
- ¿La glucosa y galactosa tienen el mismo nombre sistemático por la IUPAC?
- Indique los tipos de isomerías presente entre las tres estructuras de los azucares simples.
HIPERFENILALANINEMIAS - 2 - - -
Actividad:
- Identifique los grupos funcionales presentes en las estructuras de la fenilalanina y tirosina.
- Emplee la nomenclatura IUPAC para nombrar las estructuras representadas en la lectura.
- Basándose en la información dada, indique cuál de las dos estructuras corresponde a la tirosina.
IDENTIFICANDO ESTRUCTURAS - - - - 5
Por otra parte, como un aminoácido esencial, treonina no es sintetizado en suficiente cantidad en
humanos, por lo que debe ingerirse en proteínas que consume. Treonina actúa conjuntamente con otros
dos aminoácidos: la metionina y el ácido aspártico ejerciendo labor de metabolizar las grasas que se
depositan en órganos como el hígado. Entre los alimentos ricos en treonina, se incluyen el requesón, las
aves, el pescado, la carne, las lentejas y las semillas de sésamo
Anteriormente, en una de las lecturas, se ha dado información sobre la lisina, un aminoácido
esencial en la dieta en base a proteínas. En cuanto a estructura molecular, la serina y treonina se
caracterizan por tener en su estructura al grupo hidroxilo, pero no un segundo grupo amino como la lisina.
En este sentido cuando la lisina presenta un grupo hidroxilo se obtiene un aminoácido especial con
propiedades y funciones totalmente distintas.
Actividad:
- Identifique cual es la estructura del aminoácido especial y nómbrelo utilizando la nomenclatura
IUPAC.
- ¿Cuál son las diferencias entre las estructuras de la serina y treonina?
- Nombre correctamente las estructuras de la serina y treonina, empleando nomenclatura IUPAC.
La glutamina es un aminoácido formado mediante el reemplazo del hidroxilo del ácido glutámico
con un grupo funcional amino. Se trata de un aminoácido no esencial y el más abundante en los músculos
humanos y está muy relacionado con el metabolismo que se realiza en el cerebro. La L-glutamina es
biosintetizada por el hígado y los pulmones. Durante el ejercicio de musculación intenso se liberan ciertas
cantidades de glutamina superiores a las cantidades que sintetiza el cuerpo humano. Los estudios
científicos han demostrado que este consumo desgasta las reservas naturales de glutamina en los
músculos,10 es por esta razón por la que ciertos atletas lo emplean como suplemento dietético.
Actividad:
- Identifique los grupos funcionales presentes en las estructuras de la asparagina y glutamina.
- ¿Cuál de las dos estructuras corresponde a la asparraguina?
- Aplique la nomenclatura IUPAC para nombres las estructuras de estos aminoácidos.