Busqueda Bibliografica Motor de Busqueda Pubmed Sesión 3

PubMed
PubMed es un recurso gratuito que proporciona acceso a MEDLINE, base de datos de la Biblioteca Nacional de
Medicina de Estados Unidos de citas y resúmenes de la literatura biomédica de todo el mundo.
¿QUÉ HAY EN PUBMED?
 Más de 25 millones de registros entre artículos de la literatura biomédica y una pequeña selección de
elementos de la base de datos de libros del Centro Nacional para Información Biotecnológica (NCBI) de la
Biblioteca Nacional de Medicina de Estados Unidos.
 La mayoría de los registros en PubMed son citas de MEDLINE.
 Otros registros incluyen aquellas en diferentes etapas de procesamiento (incluyendo registros proporcionados
directamente desde el editor de la revista), pero destinados a ser citas de MEDLINE.
 Un número relativamente pequeño de registros son incluidos en PubMed, pero no seleccionados para
MEDLINE.
CITACIÓN BIBLIOGRÁFICA BÁSICA EN MEDLINE

Una citación en MEDLINE está compuesta de campos que brindan información específica. Se proporciona
generalmente la siguiente información:
 Fuente de información de la revista.
 Título del artículo de revista.
 Idioma en el que se publicó el artículo (si no es inglés).
 Nombre de los autores.
 Filiación e información de los autores.
 Resumen publicado con el artículo.
 Palabras clave.
 Tipo de publicación.
 Términos de búsqueda vocabulario controlado.
Ejemplo:
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JOEL CHRISTIAN ROQUE HENRIQUEZ
MÉDICO EPIDEMIÓLOGO
SEGUNDA ESPECIALIZACIÓN EN ESTADÍSTICA EN INVESTIGACIÓN
PubMed
NAVEGANDO EN PUBMED
ENTENDIENDO EL VOCABULARIO
MEDLINE utiliza un vocabulario controlado, significa que hay un grupo específico de términos usados para describir
cada artículo. Familiarizarte con este vocabulario te hará un mejor buscador en PubMed.
“The Medical Subjet Headings” (MeSH) [Encabezamiento de Términos Médicos]
Es la lista autorizada de los términos utilizados para el análisis de temas de la literatura biomédica en la Biblioteca
Nacional de Medicina de Estados Unidos. El vocabulario MeSH se utiliza para indexar artículos de revistas en MEDLINE
y también para catalogar libros y audiovisuales.
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PubMed
Los términos MeSH se organizan en forma de categorías jerárquicas llamadas “MeSH Tree Structures” [Estructuras de
Árbol MeSH] las cuales se actualizan anualmente.
“The MeSH Tree Structure” [La Estructura de Árbol MeSH]
El vocabulario MeSH está organizado en 16 ramas principales:
 Anatomía
 Organismos
 Enfermedades
 Químicos y drogas
 Analítica, diagnóstico, técnicas terapéuticas y equipamiento
 Psiquiatría y psicología
 Fenómenos y procesos
 Disciplinas y ocupaciones
 Antropología, educación, sociología y fenómeno social
 Tecnología, industria y agricultura
 Humanidades
 Ciencias de la información
 Grupos con nombre
 Cuidado de la salud
 Características de publicaciones
 Geográficas
Indexación con Vocabulario MeSH

Los indexadores de la Biblioteca Nacional de Medicina de Estados Unidos examinan los artículos y le asignan los
encabezamientos MeSH más específicos que apropiadamente describen los conceptos discutidos.
 Los indexadores pueden asignar tantos encabezamientos MeSH como sean necesarios para cubrir los tópicos
del artículo (generalmente de 5 a 15).
 Cuando no hay un encabezamiento específico para un concepto, el indexador puede usar el encabezamiento
más cercano, general disponible.
 Los indexadores pueden también asignar “subheadings” [subencabezamientos] para describir con más detalle
un aspecto particular de un concepto MeSH.
 Los términos MeSH que reflejan los principales puntos del artículo están marcados con un asterisco (*).
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PubMed
CONSTRUCCIÓN DE LA BÚSQUEDA
“Automatic Term Mapping” [Mapeo Automático de Términos]
Cuando usted no utiliza entrecomillados, etiquetas y asteriscos, PubMed usa un mapeo automático de términos para
buscar:
 Temas (usando MeSH)
 Revistas y
 Autores
En ese orden.
Tan pronto como PubMed encuentra una coincidencia, el mapeo se detiene. Si un término coincide con un tema,
PubMed no continua buscando dicho término en revistas.
Las frases y términos individuales son también buscados en todos los campos.
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PubMed
Cuando PubMed encuentra una coincidencia en el vocabulario MeSH, automáticamente busca los términos más
específicos debajo del encabezamiento (si los hay). Esto se conoce como la “explosión” del término. Es importante
saber esto porque la “explosión” no se muestra en los detalles de la búsqueda.
Ejemplo:
En casos en que el término utilizado no coincida con el vocabulario MeSH, es mejor tratar de encontrar otro término en
MeSH que describa el tópico.
“Citation Censor” [Sensor de Cita]
Se elabora combinaciones que son característicos de la búsqueda de citas, por ejemplo: volumen/número de edición,
nombre de los autores, título de la revista, fecha de publicación.
Ejemplo:
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PubMed
Artículos Similares
Es tan sencillo como suena. PubMed usa un poderoso algoritmo que compara palabras del título y resumen de cada
cita, así como los encabezamientos MeSH asignados. Las mejores coincidencias para cada cita son pre-calculados y
almacenados como un conjunto.
Ejemplo:
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PubMed
Filtros
Se añaden a los términos de búsqueda para obtener mejores resultados.
 Se ubican en el lado izquierdo de los resultados.
 Haga click a uno o más para aplicarlos a su búsqueda.
 Los filtros activos aparecen encima de los resultados de búsqueda.
 Si no se desactivan estos se aplicaran por defecto a futuras búsquedas (haga click en el filtro activado para
desactivarlo).
 Solo se muestran los filtros más populares. Click show additional filters [mostrar filtros adicionales] para
desplegar otras opciones.
 Si se utiliza más de un filtro de una misma categoría, la búsqueda se realizará por defecto con el operador
booleano “OR”.
Ejemplo:
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PubMed
Construcción de Bloques de Búsqueda
 Los operadores booleanos AND, OR, NOT se usan para combinar los términos de búsqueda en PubMed.
 Los operadores booleanos deben escribirse en mayúsculas.
 Se recomienda usar paréntesis para organizar el motor de búsqueda. Los términos al interior del paréntesis se
procesan como una unidad.
Ejemplo:
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PubMed
Historial
 Está disponible en el link “advanced” [búsqueda avanzada].
 En dicha página figuran las estrategias de búsqueda y el número de resultados para cada búsqueda.
 Los motores de búsqueda se pueden combinar entre sí o con nuevos términos usando la lógica booleana
(ejemplo: #1 AND #2).
 El historial puede albergar un máximo de 100 motores de búsqueda. Cuando este número es alcanzado
PubMed remueve los más antiguos para reemplazarlos por los más recientes.
 El historial se pierde automáticamente después de 8 horas de inactividad, pero los 6 últimos meses se
encuentran almacenados en “recent activity” [actividad reciente] en su cuenta de NCBI.
Ejemplo:
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PubMed
Búsqueda de Frases
El mapeo automático de términos incluye la búsqueda de frases. Sin embargo, si usted desea ceñir su búsqueda solo
como frase, puede hacer lo siguiente:
 Redactar la frase entre comillas.
 Redactar la frase con una “search tag” [etiqueta de búsqueda]. Ejemplo: robotic surgery[tw].
 Separación silábica. Ejemplo: first-line.
 Truncamiento. Ejemplo: citizen jur*.
Ejemplo (entre comillas):
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Truncamiento
Es la búsqueda de todos los términos que comienzan con una cadena dada de texto. Son pocas las ocasiones en que
su uso puede ser de utilidad. El símbolo de truncamiento es el asterisco (*).
Ejemplo:
Herramientas de Búsqueda
 Base de datos MeSH.
 Búsqueda en el catálogo de revistas de la Biblioteca Nacional de Medicina.
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PubMed
 Consultas clínicas.
Búsqueda por Cita

 Usando el buscador para encontrar citas específicas. Por ejemplo:
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PubMed
 “Citation sensor” [sensor de cita].

 “Single citation matcher” [coincidencia de una cita individual]. Por ejemplo.
Búsqueda por Campo

 Búsqueda avanzada.
 Búsqueda en el campo de etiquetas. Cada término de búsqueda debe ser seguido (cualificado) con la etiqueta
de búsqueda adecuada que indica el campo en que se buscará.
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ADMINISTRACIÓN DE LOS RESULTADOS

Pantalla de los Resultados de Búsqueda
 Las citas recuperadas se muestran en formato “summary”. Esto incluye título, autor(es) e información fuente.
Nota: La recuperación de una sola cita se muestra en formato “abstract”.
 Los resultados se muestran en grupos de 20.
 Los filtros permiten crear subconjuntos de los resultados. Nota: Usted puede modificar o crear sus propios
filtros en “My NCBI” haciendo click en “manage filters” [administrar filtros].
 Los “search details” [detalles de búsqueda] muestra como PubMed traduce la búsqueda.
 Si bien los campos de la columna derecha pueden variar según la búsqueda realizada, suele incluir búsquedas
sugeridas, enlaces a información relacionada en PubMed y otras bases de datos, etc.
Ejemplo:
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PubMed
Configuración de Pantalla
 Para ver la pantalla completa de una cita en PubMed, haga click en el vínculo del título.
 Utilice el menú configuración de pantalla para cambiar el formato de visualización (número de citas por página,
orden de clasificación de los resultados, etc.). Nota: Usted puede seleccionar las citas, haciendo click en el
cuadrado, a configurar.
Ejemplo:
MENU CONFIGURACIÓN
DE PANTALLA
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PubMed
 Formatos de texto. El formato “summary (text)” está diseñado para lista de referencias, también tenemos el
formato “abstract (text)” el cual puede ser útil para copiar, imprimir, guardar o enviar por mail.
Enviar a…
Se usa para enviar o copiar registros PubMed a las siguientes ubicaciones,
 “File” [a un archivo]: Para guardar registros en una carpeta.
 “E-mail” [correo electrónico]: Para enviar los resultados a una dirección de correo electrónico.
 “Citation manager” [administrador de citas]: Para exportar los resultados a un programa de gestión de citas,
como EndNote, Reference Manager o ProCite.
 “Clipboard” [portapapeles]: Para almacenar registros y hacer algo con ellos antes de salir o cerrar PubMed. Los
registros serán eliminados después de ocho horas de inactividad.
 “Collections” [colecciones]: Se utiliza “My NCBI Collections” para guardar citaciones PubMed para uso futuro.
 Otros
GUARDAR LA BÚSQUEDA
Salvando la Búsqueda
A través de mi “My NCBI” se puede salvar la estrategia de búsqueda y establecer una actualización automática por
correo electrónico.
Paso 1: Corra su búsqueda en PubMed.
Paso 2: En la pantalla de resultados haga click en el enlace “Create alert” debajo de la caja de búsqueda, aparecerá
una pantalla “Saved Searches” en donde podrá elegir sus opciones.
Paso 3: Cuando haya hecho todas sus elecciones, haga click en “Save” [guardar]. La se búsqueda se incluirá en su lista
de búsquedas guardadas en “My NCBI”.
Enviar a RSS (Really Simple Syndication)

La función RSS en PubMed le permite generar una retroalimentación de una búsqueda en PubMed para ver nuevos
resultados, con enlaces a las citas en PubMed.
CONSIGUIENDO LOS ARTÍCULOS

PubMed no incluye copias de artículos de revistas. Sin embargo, ofrece enlaces al texto completo cuando están
disponibles. El acceso en algunos será gratuita y en otras requerirá el pago.
Usted puede acceder al texto completo de los artículos a través de:
 PubMed Central es el archivo digital libre de la literatura biomédica y ciencias de la vida de la Biblioteca
Nacional de Medicina de USA.
 Los editores que ofrecen ya sea gratis o pagado el acceso a artículos en sus sitios web.
 Bibliotecas institucionales a los que está afiliado.
 Otras bibliotecas médicas y públicas.
 Servicios de entrega de documentos a domicilio.
 Enlaces a los artículos en texto completo desde PubMed están disponibles a través del servicio llamado
“LinkOut”.
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PubMed
LinkOut
MY NCBI
Es una característica de la base de datos NCBI que le permite guardar los registros y búsquedas, y personalizar la
pantalla de resultados con filtros y otras opciones.
Registro o Inicio de Sesión a Través de Una Organización Asociada
 Cada cuenta en My NCBI puede tener solo una dirección de correo electrónico.
 La primera vez que usted cree su cuenta o la dirección de su correo electrónico es cambiado, usted recibirá un
mensaje confirmatorio.
 No se enviarán actualizaciones automáticas a la dirección de correo electrónico hasta que no haya recibido la
confirmación.
 Si usted desea, puede personalizar la página inicial de My NCBI.
Bibliografía
1. U.S. National Library of Medicine [Internet]. Bethesda, U.S.: PubMed tutorial; 2015 [Citado el 01 de enero de
2016]. Disponible en: https://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/cover.html.
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Indexación con Vocabulario MeSH

Construcción de Bloques de Búsqueda

 Búsqueda en el catálogo de revistas de la Biblioteca Nacional de Medicina.

Búsqueda por Cita

 “Citation sensor” [sensor de cita].

Búsqueda por Campo

ADMINISTRACIÓN DE LOS RESULTADOS

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