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TALLER EVALUATIVO DE BIOQUÍMICA SEGUNDO CORTE

José Peinado, Jonathan Janna, Amedd Badel, Isaac Mahuad


Universidad de Córdoba.
_______________Departamento de Ingeniería Ambiental._______________

1. Observa cada uno de los vídeos presentados por tus compañeros, incluyendo el
tuyo. Elabora un resumen de esta información en una tabla como la siguiente.
(2ptos)

ENZIMA
TIPO DE
NOMBRE ESTRUCTURA QUÍMICA SOBRE LA MECANÍSMO DE ACCIÓN
INHIBIDOR
CUAL ACTÚA
El sildenafilo es un inhibidor selectivo de
la fosfodiesterasa tipo 5, enzima que actúa
específicamente sobre el guanosino-
monofosfato cíclico (cGMP). El
mecanismo fisiológico de la erección del
pene resulta de la liberación del óxido
nítrico (NO) en el cuerpo cavernoso. El
NO activa la guanilatociclasa, la cual
SILDENAFI Fosfodiesterasa aumenta los niveles intratinsulares del
COMPETITIVO
LO tipo 5 cGMP. A su vez, el cGMP relaja los
músculos lisos del cuerpo cavernoso
permitiendo la entrada de sangre. La
fosfodiesterasa tipo 5 es la responsable de
la degradación el cGMP, reduciendo los
niveles de éste en el cuerpo cavernoso. La
inhibición de esta enzima mantiene los
niveles del cGMP y por lo tanto la acción
relajante del NO.
Los salicilatos inhiben la actividad de la
enzima cicloxigenasa para disminuir la
formación de precursores de las
prostaglandinas y tromboxanos a partir del
ácido araquidónico. Aunque muchos de los
efectos terapéuticos y adversos de estos
CICLOOXIGE
ASPIRINA medicamentos pueden ser debidos a la
NASA
inhibición de la síntesis de protaglandinas
(y la consiguiente reducción en su
actividad) en diferentes tejidos, hay otras
acciones que también pueden contribuir
significativamente a sus efectos
terapéuticos.
La inhibición de la HMG-CoA reductasa
reduce las cantidades de mevalonato y por
consiguiente los niveles hepáticos de
hidroximetilglut
colesterol. Esto redunda en la regulación
LOVASTATI aril-coenzima A
COMPETITIVO de los receptores a las LDLs y a una
NA (HMG-CoA)
captación de estas lipoproteínas de la
reductasa
circulación, La consecuencia final es la
reducción del colesterol asociado a las
LDLs.

El cianuro es un potente veneno que inhibe


la cadena de transporte de electrones y la
fosforilación oxidativa bloqueando el paso
de electrones del citocromo a3 al oxígeno
CITOCROMO en el complejo IV. Esto bloquea la cadena
CIANURO
OXIDASA de transporte de electrones, lo que conlleva
que no se genere el gradiente de protones y
por tanto no se produzca la obtención de
ATP con la consiguiente acumulación de
NADH y FADH2.
CAPTOPRIL es un antihipertensivo
inhibidor de la enzima convertidora de
angiotensina (ECA) que conduce a una
inhibidor de la
disminución en los niveles de angiotensina
enzima
II y aldosterona, con la consiguiente
CAPTOPRIL COMPETITIVO convertidora de
reducción de la resistencia vascular
angiotensina
periférica y reducción de la retención de
(ECA)
sodio y agua; todas estas acciones
conducen a una disminución de la presión
arterial.

Actúan mediante la inhibición en


la síntesis de la pared celular de la bacteria
transpeptidasa,
y la activación de su sistema autolítico
PENICILIN carboxipeptidas
IRREVERSIBLE (autolisinas).
A ay
La acción de las penicilinas necesita la
endopeptidasa
presencia de una pared celular que
contenga peptidoglicanos.

Inhibidor de la
Inhibe la ECA reduciendo la conversión de
BENAZEPRI enzima
REVERSIBLE angiotensina I en angiotensina II.
L convertidora de
angiotensina.
Inhibe la síntesis de proteínas en la
Actúa mediante
bacteria al unirse a la subunidad 50S
su unión a la
del ribosoma bacteriano. Esta unión inhibe
ERITROMI subunidad 50S
REVERSIBLE la actividad de la peptidil transferasa,
CINA ribosomal de los
interfiriendo con la traslocación de
microorganismo
los aminoácidos durante la traducción y
s susceptibles.
ensamblaje de las proteínas.

Los metabolitos de la heroína actúan sobre


Actúa sobre los receptores µ en neuronas GABA para
HEROÍNA REVERSIBLE receptores desinhibir los disparos de neuronas
opioides dopaminérgicas en AVT, esto resulta en
aumento de liberación de dopamina.

2. Se ha determinado la velocidad inicial de una reacción catalizada por una enzima


para diversas concentraciones de sustrato. Los datos obtenidos son los siguientes:
[S] µmol/L V (µmol/L)min-1
5 22
10 39
20 65
50 102
100 120
200 135
Calcule Vmax y Km a partir de un gráfico directo de V frente a [S]

*primero que todo graficamos los valores,


A partir de los valores podemos sacar la inversa de estos valores, obteniendo asi esta
grafica

Con los valores de esta grafica tenemos

b = 1/Vmax = 0.0061
Vmax = 1/0.0061
Vmax = 163.9

m = Km/Vmax = 0.1961
Km = 0.1961*
Km = 32.14

3. Los siguientes datos describen la catálisis de la ruptura de los enlaces peptídicos


pequeños por la enzima elastasa. La flecha indica el péptido que se rompe en cada
caso.
SUSTRATO Km (mM) Kcat (S-1)
PAPA G 4.0 26

PAPA A 1.5 37

PAPA F 0.64 18

a) Si se presenta una mezcla de estos tres sustratos a la elastasa, con una


concentración de cada péptido igual 0.5mM, ¿cuál sería digerido con mayor
rapidez? ¿cuál lo sería de forma más lenta? Asuma que la enzima se
encuentra presente en exceso.
para responder esta pregunta primero se debe tener en cuenta que representa cada valor,
entre menor sea el valor en Km mayor será la afinidad que tiene el catalizador por el
sustrato. En cambio, el Kcat representa al número de moléculas de sustrato transformadas
en producto por unidad de tiempo por molécula de catalizador.
Entonces con esto en mente y observando los valores podemos decir que el péptido P A P
A F es el que mayor afinidad presenta, seguido del péptido PAPA A y que este último
presenta un mayor Kcat, los péptidos al encontrarse a la misma concentración se diría por
lo tanto que PAPA A es el que es digerido con mayor rapidez, en cambio el péptido PAPA
G presenta una baja afinidad y un Kcat intermedio, por esta razón este sería el péptido que
se digiere de forma más lenta.
b) Basándose en estos datos sugiera que características de la secuencia de
aminoácidos dictan la especificidad de la ruptura proteolítica de la elastasa.
De acuerdo a los datos en la tabla y sabiendo que la elastasa es una enzima que produce un
rompimiento en enlace peptídico tras residuos pequeños neutros tales como la alanina,
serina, glicina o valina. Solo si estos no están seguidos de una prolina.
4. La serina proteasa, subtilisina, se utiliza en detergentes de lavandería para
facilitar la eliminación de manchas de proteínas. ¡que tipo poco habitual de
estabilidad sugiere esto para la enzima?

Es una enzima que hidroliza los enlaces peptídicos presentes en proteínas, utilizado en
algunos detergentes de lavandería para eliminar manchas proteicas, la estabilidad que nos
da la enzima es que esta puede hidrolizar cualquier tipo enlace peptídico a diferencia de que
otras proteasas solo hidrolizan aquéllos enlaces peptídicos en los que se incluyen
determinados aminoácidos.
b. La subtilisina tiene un problema, por cuánto queda inactivada por la
oxidación de una metionina próxima al sitio activo. Sugiera una forma de
obtener una subtilisina mejor.
Lo podemos conseguir mediante bacterias del suelo, por ejemplo, de Bacillus
amyloliquefaciens, las cuales son secretadas en grandes cantidades por muchas especies del
género Bacillus. Sabemos que las cepas de Bacillus que crecen a pH por encima de 10,
sintetizan enzimas que presentan alta actividad proteolítica, son activas y estables a pH
hasta 12, temperaturas relativamente altas y poseen puntos isoeléctricos extremadamente
básicos. Estas proteasas son útiles como aditivos para jabones y detergentes, así como en
diversas industrias.
5. Sugiera los efectos de cada una de las siguientes nutaciones sobre la función
biológica del tripsinógeno.
a. Arg 15 Ser
b. Cys 1 Ser
c. Thr 147 Ser
6. Un inhibidor competitivo es análogo estructural del sustrato y compite por ocupar
el sitio activo de la enzima, además su unión con la enzima es irreversible por lo su
efecto sobre una reacción enzimática se refleja en un aumento de Km. Se estudia la
cinética de una enzima en ausencia y presencia de dos inhibidores (A y B), la
velocidad viene dada en función de la concentración de sustrato en la siguiente tabla
(2 ptos):
[S] mmol/L V[(mmol/L)mil-1]
Sin inhibidor Inhibidor A Inhibidor B
1.25 1.72 0.98 1.25
1.67 2.04 1.17 1.54
2.50 2.63 1.47 2.00
5.00 3.33 1.96 2.86
10.00 4.17 2.38 3.70

Qué tipo de inhibición de produce ¿Competitiva o no competitiva? Explique su


respuesta.
Bueno se tiene que dependiendo del tipo de inhibición se verá afectada una variable, si la
inhibición es de tipo competitivo habrá un aumento del Km, pero su Vmax se mantendrá
igual. En cambio, para una inhibición de tipo no competitivo su Km permanecerá igual pero
su Vmax disminuirá. Como la velocidad es directamente proporcional a su Vmax e
inversamente proporcional al Km, se podría decir de acuerdo a los valores presentados en la
tabla que se está dando una inhibición de tipo competitivo.

7. Cuando hay muerte de un tejido el contenido celular llega al pasma aumentando la


concentración de proteínas no plasmáticas como la Fosfocreatinín quinasa (CPK) que
es monitoreada a nivel sanguíneo cuando hay ataques cardíacos. Está isozima, en los
tejidos presenta una isoforma distinta en donde las dos subunidades son de tipo
muscular (MM), En el corazón una es M y la otra es tipo B (MB) y en el cerebro sus
dos cadenas polipeptídicas son tipo B (BB). Explique por qué la electroforesis y
porqué sería la mejor técnica para dar un diagnóstico más acertado.

tenemos que la electroforesis es un procedimiento en donde se lleva a cabo una separación de


moléculas según la movilidad de estas en un campo eléctrico. Entonces de acuerdo a la isoforma
que presenten las subunidades, cada una de estas presentara diferentes cargas, ya sean las MM, MB
o BB. De esta forma es posible determinar el tipo de daño que se está sufriendo, a partir de los
resultados obtenidos durante el proceso electroforético.

8. La siguiente tabla muestra los parámetros cinéticos para la L-aminoàcido


oxidasa de B. atrox sobre diferentes sustratos. Según esta información con cuál de
todos estos sustratos sería más eficiente la L-aminoácido oxidasa. Defina Kcat y
Km.

como se habló en la pregunta 2, podemos saber la afinidad que tiene una enzima por un
sustrato si el valor en Km es bajo y que el valor de Kcat nos muestra la velocidad con
que es transformada una molécula de sustrato por molécula de enzima en una unidad de
tiempo.

Al observar la tabla tenemos entonces que los aminoácidos que presentan la mayor
afinidad con la L-aminoácido oxidasa son la L-fenilalanina y siguiente la es la L-
leucina. Cada uno de estos aminoácidos presenta que en ambos pH sus afinidades son
relativamente cercanas. Pero al observar los demás valores en la tabla tenemos que la L-
leucina presenta valores en su velocidad y Kcat mucho mayores que los de la
L-fenilalanina. Por lo tanto, el sustrato con el que la L-aminoácido oxidasa será más
eficiente será la L-leucina. Teniendo también en cuenta la eficiencia catalítica que en el
caso de la L-leucina también es mucho mayor que el caso de la L-fenilalanina.

El Km se define como la relación entre las constantes cinéticas y ha recibido el nombre


de constante de Michaelis-Menten y Corresponde a la concentración de sustrato con la
cual la velocidad de reacción enzimática alcanza un valor igual a la mitad de la
velocidad máxima.

El Kcat recibe diferentes nombres, puede ser constante catalítica o también como
constante de velocidad y también suele ser llamada como número de recambio.

9. Las fosfatasas ácidas son producidas por los eritrocitos, hígado, pulmón, el
bazo y la glándula de la próstata. La enzima de ésta glándula es clínicamente
importante porque el aumento de su actividad en sangre es frecuentemente una
indicación del cáncer de próstata. La fosfatasa de la glándula prostática es
fuertemente inhibida por el ión tartrato, pero la fosfatasa de otros tejidos nó.
Cómo puede esta información ser usada para desarrollar un procedimiento
para medir la actividad de la fosfatasa ácida.
la forma que podría llevarse a cabo para medir la actividad de la fosfatasa acida podría ser
mediante el desarrollo del cálculo en la diferencia de concentración en una muestra antes y
después de ser tratada con el tartrato. Es decir, si lo que queremos saber son los niveles de
fosfatasa acida prostática en la sangre, lo que se podría hacer seria, primero tomar una
muestra de sangre y medir la concentración de fosfatasa acida total, la que es producida por
los eritrocitos, hígado, pulmón, el bazo y la glándula de la próstata, tomar el valor de la
concentración de esta por medio de un análisis.
El siguiente paso sería tratar esta muestra con tartrato para que así de esta forma la fosfatasa
acida prostática sea inhibida y de esta forma volver a desarrollar el procedimiento de
calcular los niveles de fosfatasa acida en la muestra, que deberían ser diferentes a la
primera lectura, de esta forma podemos obtener los niveles de fosfatasa prostática por
medio de la resta del valor de la concentración en la muestra antes del tartrato y el valor de
la concentración en la muestra después del tartrato.
10. Consulta un ejemplo de cada tipo de enzima y explica su función teniendo en
cuenta la reacción que cataliza.

1. Oxidorreductasas
Ejemplos son la succinato deshidrogenasa o la citocromo c oxidasa, ya que estas
lo que hacen es catalizar reacciones de óxido-reducción, es decir, transferencias de
hidrógeno (H) o electrones (e-) de un sustrato a otro.

2. Transferasas:
Un ejemplo es la glucoquinasa, ya que esta es responsable de catalizar la
transferencia de un grupo químico (distinto del hidrógeno) de un sustrato a otro.

3. Hidrolasas:

Un ejemplo es la lactasa, ya
que estas enzimas catalizan reacciones de hidrólisis.

4. Liasas:

Un ejemplo es la acetacetato descarboxilasa, las enzimas de este tipo agregan (o


sustraen) grupos químicos a dobles ligaduras.

5. Isomerasas:

Son ejemplos la fosfotriosa isomerasa y la fosfoglucosa


isomerasa, que catalizan la interconversión de isómeros representadas en la
siguiente tabla:
6. Ligasas:

Un ejemplo es la piruvato carboxilasa, ya que estas enzimas lo que hacen es formar


uniones covalentes entre dos compuestos, la reacción es endergónica y requieren de
la ruptura de moléculas de ATP que proporcionen energía.

11. Clasifique las siguientes hormonas según su estructura química en esteroideas,


peptídicas,

aminoacídicas. Diga qué tipo de mecanismo de acción seguiría cada una.


a. Testosterona b. Somatostatina c. Noradrenalina

A. Testosterona: es una hormona esteroidea.


Mecanismo de acción: actúa por medio de un receptor andrógenico nuclear, que
pertenece a la familia de receptores de hormonas esteroides y tiroideas, el complejo
esteroide anabólico-receptor se une al ADN nuclear así como a elementos reguladores
de hormonas específicos sobre los cromosomas y aumenta la síntesis de ARN
mensajero y de proteínas específicas. Es un andrógeno natural secretado por las células
intersticiales de Leydig del testículo. Propicia el crecimiento y desarrollo normal de los
órganos sexuales masculinos y el mantenimiento de los caracteres sexuales secundarios.
B. Somatostatina: es una hormona peptídica.
Mecanismo de acción: Interviene indirectamente en la regulación de la glicemia, e
inhibe la secreción de insulina y glucagón. Esta hormona inhibe la síntesis y/o secreción
de la hormona del crecimiento (GH, STH o Somatotropina) por parte de
la adenohipófisis o hipófisis anterior. También inhibe el eje hipotálamo-hipófisis-
tiroides, bloqueando la respuesta de la hormona estimulante del tiroides (TSH o
tirotropina) a la hormona liberadora de tirotropina o TRH.
C. Noradrenalina: es una hormona aminoacídica.
Mecanismo de acción: Su acción directa sobre todo en los receptores adrenérgicos
alfa, y en menor proporción en los adrenérgicos beta 2, produce respuestas fisiológicas
semejantes a las que se provocan con la estimulación de las fibras simpáticas
posganglionares. A nivel cardiovascular, estimula directamente la fuerza contráctil y el
marcapasos del corazón, así como la velocidad de conducción y el automatismo;
también aumenta la presión arterial sistólica y la diastólica, y produce incremento
significativo de la resistencia periférica total. La elevación de la presión arterial origina
una respuesta vagal refleja compensatoria que induce disminución de la frecuencia
cardiaca, lo cual enmascara el efecto estimulante de la amina sobre el corazón y causa
aumento del volumen del latido con poco cambio en el gasto cardiaco. El aumento de la
resistencia vascular periférica se observa en casi todos los lechos vasculares, y en
consecuencia disminuye el flujo sanguíneo renal, el hepático, el cutáneo y, en general,
el musculo esquelético.
12. La celulosa es la biomolécula orgánica más abundante ya que forma la mayor
parte de la biomasa terrestre. Es una característica de la celulosa:
a. Es un disacárido
b. Es una gran fuente de energía para plantas y animales
c. Sus monómeros poseen extremo no reductor
d. Sus monómeros están en conformación beta

El almidón, o fécula, es una macromolécula que está compuesta por dos polímeros
distintos de glucosa, la amilosa (en proporción del 25 %) y la amilopectina (75 %). Es
el glúcido de reserva de la mayoría de los vegetales.

13. La amilosa (Múltiple Elección):


a. Es un polisacárido lineal
b. Es un polisacárido ramificado
c. Presenta únicamente enlaces α(1-4)G
d. Presenta únicamente enlaces α(1-6)G

14. La amilopectina (Múltiple Elección):


a. Es un polisacárido lineal
b. Es un polisacárido ramificado
c. Presenta únicamente enlaces α(1-4)G
d. Presenta únicamente enlaces α(1-6)G

15. Realiza un cuadro comparativo sobre las características estructurales y


propiedades biológicas del glucógeno, el almidón y la celulosa.

Presente en Función Estructura Enlaces


Ramificad
Plantas Animales R. Energía Estructural Lineal a α(1-4) α(1-6) β(1-4)
Almidón x x x x
Glucógeno x x x x x
Celulosa x x x x

16. Traces proyecciones de Hawort para: D-galactosa y D-ribosa.

17. Explique qué diferencias estructurales existen entre los grupos sanguíneos y
cuál es el fundamento del procedimiento para determinarlos.

El sistema ABO permite la división de la sangre en 4 grupos, A, B, AB y O (también


existe el sistema Rh que divide en Rh positivas y Rh negativas). Esto es gracias a que los
glóbulos rojos en su superficie presentan antígenos (glucolípidos) los cuales el
organismo reconoce como propios y evitan que ataquen a nuestras células. Los
antígenos están formados inicialmente por un glucano central común (o antígeno O) el
cual gracias a la enzima fucosiltransferasa pasa a ser un glucano fucosilado o antígeno
H). Luego la enzima glucosiltransferasa permite la formación de tres variables alélicas
de genes que se pueden unir a la parte terminal del antígeno H. estos son;
Gen O: no agrega nada a la parte terminal del antígeno H manteniéndolo igual.
Gen A: agrega N-acetilglucosamina al antígeno H, formando el antígeno A.
Gen B: agrega Galactosa al antígeno H, formando el antígeno B.
Al encontrarse presente tanto el Gen A como el Gen b, se da la formación ambos
antígenos, un eritrocito AB.

La presencia de antígenos en los glóbulos rojos genera la formación de anticuerpos


(antiglobulinas M) que reaccionaran con los otros antígenos. es decir, si se cuenta con
antígenos A se formarán anticuerpos para los antígenos B, de esta misma forma al tener
antígenos B se formarán anticuerpos A, al tener antígenos AB no se formarán
anticuerpos, y al ser del grupo O y no contar con antígenos se formarán anticuerpos A y
B. También existe una extraña alteración de la encima glucosiltransferasa que genera el
grupo sanguíneo Bombay el cuan no expresa antígenos H, A o B. por tanto, solo puede
recibir sangre del mismo grupo.
teniendo en cuenta lo anterior se determina la compatibilidad a la hora de una
transfusión sanguínea y los fundamentos para determinar el grupo sanguíneo de una
muestra, pues este se basa en reactivos para los distintos antígenos que se pueden
presentar, así, dependiendo del como reaccione la muestra de sangre con cada reactivo
de antígeno se podrá determinar el grupo y Rh de la misma.

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