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Aminoácido
• Los aminoácidos son los monómeros de las
proteínas.
• Los aminoácidos están formados por:
– Un carbono unido a un grupo carboxilo.
– Un grupo amino
– Un hidrógeno y
– Una cadena R de composición variable
• En los aminoácidos naturales, el grupo amino y el
grupo carboxil se unen al mismo carbono que recibe
el nombre de alfa asimétrico.
• Existen unos 20 aminoácidos distintos componiendo
las proteínas.
• Técnicamente hablando, se les denomina alfa-
aminoácidos, debido a que el grupo amino (–NH2) se
encuentra a un átomo de distancia del grupo
carboxilo (–COOH).
Fórmula general
Alanina
• Fenilalanina
Arginina
Acido
Aspártico
Aminoácidos estándar
SEGÚN LA CADENA
• Neutros polares, polares o hidrófilos : Serina (Ser,S), Treonina (Thr,T),
Cisteína (Cys,C), Asparagina (Asn,N), Glutamina (Gln,Q) y Tirosina
(Tyr,Y).
• Neutros no polares, apolares o hidrófobos: Glicina (Gly,G), Alanina
(Ala,A), Valina (Val,V), Leucina (Leu,L), Isoleucina (Ile,I), Metionina
(Met,M), Prolina (Pro,P), Fenilalanina (Phe,F) y Triptófano (Trp,W).
• Con carga negativa, o ácidos: Ácido aspártico (Asp,D) y Ácido
glutámico (Glu,E).
• Con carga positiva, o básicos: Lisina (Lys,K), Arginina (Arg,R) e
Histidina (His,H).
• Aromáticos: Fenilalanina (Phe,F), Tirosina (Tyr,Y) y Triptofano (Trp,W)
(ya incluidos en los grupos neutros polares y neutros no polares).
CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS. 1
ALIFÁTICOS
NO POLARES
AROMÁTICOS
9
No polares alifáticos
O O O
H CH3 CH CH3
O O O
H2N CH C OH H2N CH C OH C OH
CH2 CH CH3
HN
CH CH3 CH2
CH3 CH3
LEUCINA ISOLEUCINA PROLINA
Leu Ile Pro
10
No polares aromáticos
O
O
O
H2N CH C OH
H2N CH C OH
H2N CH C OH
CH2
CH2
CH2
HN
FENILALANINA
Phe OH
TRIPTOFANO
TIROSINA Trp
Tyr
11
Polares sin carga
O O O
CH2 CH OH CH2
OH CH3 SH
SERINA TREONINA CISTEÍNA
Ser Tre Cys
O O
O
H2N CH C OH H2N CH C OH
H2N CH C OH
CH2 CH2
CH2
CH2 CH2
C O
METIONINA ASPARRAGINA
S C O
Met NH2 Asn
GLUTAMINA
CH3 NH2 Gln
12
Con carga
CH2 CH2
C O CH2
N
CH2 CH2
OH C O
NH
CH2 NH
ACIDO GLUTÁMICO
OH
NH2 Glu
C NH HISTIDINA ÁCIDO ASPÁRTICO
Hys
NH2
Asp
LISINA
Lis ARGININA
Arg
13
Según su obtención
• No pueden ser obtenidos por biotransformacion propia.
Deben ser ingeridos.
• Para un
amicoacido
monoaminico y
monocarboxilo
Curva de valoración de la glicina
El pH controla la carga de la
glicina: catiónica por debajo
de pH = 2.3; aniónica por
encima de pH = 9.6 y
zwitteriónica entre pH = 2.3
y 9.6. El pH isoeléctrico es
6.0.
El punto isoeléctrico es el
pH al que el aminoácido se
encuentra en equilibrio
entre las dos formas, como
el zwitterión dipolar con
una carga neta de cero.
Ejemplo, la valina:
• a pH 1: carboxilo como -COOH y amino como
-NH3+. El aminoácido tiene carga positiva neta.
• A pH 7, el carboxilo se disocia (-COO-) y el amino
sigue protonado (-NH3+); (zwitterion).
• A pH 13, el carboxilo sigue disociado (-COO-) y el
amino pierde el protón ( -NH2); el aminoácido queda
con una carga negativa.
pKa
•Es una forma simplificada de observar la constante de
equilibrio K
•La ecuación de Henderson-Hasselbach rige la disociación de
cualquier ácido o base débil a un pH determinado.
•La ecuación implica el uso de las concentraciones de
equilibrio del ácido y su base conjugada. Para el cálculo del
pH en soluciones buffer.
Donde, HA H +A
+ - Ka = [ H+][A-]
[HA]
pH = -log [ H+]
Punto isoelectrico
• pH en el cual un aminoácido tiende a adoptar una forma
dipolar neutra.
• La solubilidad en agua de un aminoácido es mínima
en su punto isoeléctrico.
PROPIEDADES QUIMICAS
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Los aminoácidos se pueden unir por enlaces
peptídicos
Dos aminoácidos
Eliminación de una
molécula de agua
Enlace peptidico
Extremo amino
Extremo carboxilo
Reacciones del grupo amino
• La ninhidrina reacciona con el grupo amino, lo oxida y
libera amonio el cual se condensa con la ninhidrina
reducida, y con otra molécula de ninhidrina libre, para
producir un producto púrpura.
reacción de la ninhidrina
• Es una de la reacciones más importantes, la cual se ha
utilizado durante muchos años para detectar y
cuantificar a.a. en cantidades del orden del microgramo.
• La ninhidrina descarboxila por oxidación los -a.a. a CO2
y un aldehído, formándose un complejo de color azul-
púrpura (l : 570 nm).
• Los a.a. Como la, prolina e hidroxiprolina, producen un
color amarillo con ninhidrina.
Otras reacciones
• Prolina e hidroxiprolina, producen color amarillo con
ninhidrina.
• REACCION CON DINITROFLUOROBENCENO.
• Principal aplicación. Determinación del residuo N-terminal
de cadenas peptidicas.
• El complejo formado es el dinitrofenil (DNP) de color
amarillo.
• REACCION CON FENILISOTIOCIANATO.
• Reacción de Edman. Con cloruro de dansilo.
• Aplicación principal: determinar la secuencia de cadenas
peptídicas desde el extremo N-terminal.
Reacciones del grupo COO-
•Con bromohidruro de litio.
• Las dos formas en cada par son denominadas estereoisómeros,
isómeros ópticos o enantiómeros.
• Todos los aminoácidos que se encuentran en las proteínas
son de configuración L.
• No obstante los aminoácidos de configuración D son
encontrados en algunos antibióticos y en paredes de células
bacterianas.
Aminoacidos D
• Un grupo de científicos de la Universidad de Harvard, con
la colaboración de investigadores del Centro Biología
Molecular Severo Ochoa del Consejo Superior de
Investigaciones Científicas (CSIC), ha descubierto que las
bacterias liberan D-aminoácidos, que son capaces de
modular la biosíntesis del peptidoglicano --principal
componente de la pared celular bacteriana-- para
adaptarse a los cambios ambientales y a "condiciones
adversas".
• Los priones tienen aminoacidos DEXTROGIROS, y estan
presentes en los hongos Streptomyces y Actinomyces,
tambien en las bacterias llamadas Bacillus esporulados.
PROPIEDADES OPTICAS
•Cromóforo. Molécula capaz de absorber luz a cierta longitud de onda
•Los aromáticos absorben a 280 nm
•Los demás a 220 nm
Determinacion espectrometrica
• La espectroscopia ultravioleta-visible o espectrofotometría
ultravioleta-visible (UV/VIS) es una espectroscopia de
emisión de fotones y una espectrofotometría.
• Utiliza radiación electromagnética (luz) de las regiones
visible, ultravioleta cercana (UV) e infrarroja cercana (NIR)
del espectro electromagnético, es decir, una longitud de
onda entre 380nm y 780nm.
• La radiación absorbida por las moléculas desde esta región
del espectro provoca transiciones electrónicas que pueden
ser cuantificadas.
• Deben formarse complejos con ninhidrina, etc.
SEPARACION DE AMINOACIDOS
• Destrucción de proteínas.
• Los a.a. son liberados de las proteínas mediante una
hidrólisis, obtenido por cocción con HCl 6N.
Cromatografía:
• En todas las separaciones cromatográficas, las
moléculas son separadas dentro de una fase
estacionaria y una móvil.
• Dependiéndo del tipo de fase estacionaria podemos
distinguir: cromatografía en papel, cromatografía en
capa fina, o cromatografía en columna.
• La separación depende de la tendencia relativa de las
moléculas en la mezcla de asociarse con más fuerza
a una o a otra fase.
Cromatografía en papel
• Las muestras se aplican en un punto marcado aprox. A
5 cm del extremo de una tira de papel filtro, y ésta se
suspende en un recipiente sellado que contiene el
solvente cromatográfico (para a.a. son mezclas de agua,
alcoholes y ácidos o bases, constituyendo la fase móvil).
• La fase movil asciende por capilaridad. Cuando ha
avanzado hasta el otro extremo, la tira se seca y se trata
para permitir la visualización de las moléculas de interés
(ej.: para a.a. se trata con ninhidrina al 0.5% en acetona,
seguida de calentamiento de 90-100° C durante unos
minutos).
• La relación entre la
distancia recorrida por un
a.a. con la distancia que
viaja el solvente, medidas
ambas desde el sitio
marcado para la aplicación
de la mezcla de a.a., se
asigna como valor Rf
(movilidad relativa con el
sustrato) de ese a.a.
• La movilidad puede
expresarse en relación a
la de un estandar
Rf: La relación entre las distancias recorridas por incompuesto dado y el
frente de la fase móvil, desde el origen del cromatograma se conoce
como Rf (rate factor), y tiene un valor constante para cada sustancia
en unas condiciones cromatográficas dadas (temperatura,
composición de fase móvil, tamaño de la cubeta...etc). El cálculo del
Rf se realiza según:
Fundamento
• Los a.a. con grandes cadenas laterales no polares (Leu, Ileu, Fen,
Trip, Val, Met, Tir) migran más que que aquellos con cadenas
laterales mas cortas no polares (Pro, Ala, Gli) o con cadenas laterales
polares (Thr, Glu, Ser, Arg, Asp, His, Lis, Cis).
• Esto refleja la mayor solubilidad relativa de las moléculas polares en la
fase estacionaria hidrofílica, y de las moléculas no polares en
solventes orgánicos.
Cromatografía en capa fina
Es muy similar a la
cromatografía en papel,
pero se utiliza como fase
estacionaria unos
soportes adsorbentes
como celulosa
pulverizada o gel de
sílica, incorporados en
capa fina sobre una
placa de vidrio.
La cromatografía en capa
fina de adsorción se
aplica a sustancias
apolares, como lípidos,
no así a a.a. ni la
mayoría de los péptidos.
Cromatografía de intercambio iónico
• La columna cromatográfica consiste en un tubo largo relleno
de partículas de una resina sintética, que contiene grupos
cargados fijos; las que contienen grupos aniónicos se
denominan resinas de intercambio catiónico (ej.: resina con
grupos –SO3-) y las que contienen grupos catiónicos, resinas
de intercambio aniónico.
• La afinidad de cada a.a. por la resina está afectada por el pH
(que determinará el estado de ionización de la molécula) y la
concentración de iones salinos, que pueda competir con la
resina por asociación con el a.a.
• Se puede, por lo tanto, conseguir la separación óptima de los
a.a. mediante un cambio gradual del pH o de la concentración
salina de la solución que se pase a través de la columna, de
manera que se cree un gradiente de pH o de sal.