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Metagenómica: Un pequeño paso para la ciencia, un gran salto

para la tecnología ambiental.


El término “metagenómica” apareció en la década de los 90´s, refiriéndose al
análisis basado en las funciones del ADN de las especies en ambientes mixtos. La
definición esencial de la metagenómica es el análisis de ADN genómico a partir de
toda una comunidad, lo que difiere de la genómica, que es el análisis de ADN
genómico de un organismo o célula individual. [CITATION Nag16 \l 2058 ] En este
contexto la metagenómica se dedica a estudiar el genotipo y fenotipo de un
consorcio bacteriano, y como los genes que comparten codifican para funciones
específicas.
La metagenómica representa una aproximación totalmente nueva al estudio de
las comunidades microbianas, definida como el análisis funcional y de secuencias
de los genomas microbianos colectivos contenidos en una muestra ambiental,
basándose ya sea en expresión o secuenciación.[ CITATION Ger08 \l 2058 ]

Para estudiar la diversidad bacteriana, las técnicas del ADN recombinante


permiten superar la limitación de no poder cultivar la mayoría de las bacterias de
un ambiente particular. La necesidad de cultivar las bacterias presentes en una
muestra ha sido substituida por la capacidad de aislar y caracterizar el material
genético presente.[ CITATION Ade01 \l 2058 ] A partir de este paso se pueden
crear Librerías de ADN metagenómico, estas son una herramienta poderosa para
explorar la diversidad microbiana en sistemas de microorganismos que no se
pueden cultivar y forman la base de los estudios genómicos para vincular la
diversidad filogenética y la relación funcional de los microorganismos en su medio
ambiente.[ CITATION Nag16 \l 2058 ]
Es entonces cómo es posible el aislar genes de un consorcio de organismos en
concreto para insertarlos en otro que podrá ser cultivables y desarrollar las
características de interés, ejemplo de esto último es el estudio expuesto en
[ CITATION Ger08 \l 2058 ] donde se encuentra la ruta metabólica involucrad en la
bio-oxidación de la pirita en una mina de Hierro. Si es de interés bien puede ser
clonado e insertado. Un proceso que si es de interés es el proceso de eliminación
de fosforo en aguas residuales que [ CITATION Ger08 \l 2058 ] menciona que el
desconocimiento de la metagenómica del grupo de células que se encargan de
esto reduce la funcionalidad bilógica del proceso.
La metagenómica puede ser usada en proceso de biorremediación, pues cuando
se diseña una estrategia para la biorremediación de algún sitio contaminado, el
entendimiento de las comunidades microbianas autóctonas del lugar puede ser de
gran ayuda
Diversos trabajos en biorremediación se han llevado a cabo, destacan las
publicaciones de:
Zhan et al. (2012); -secuenciación del genoma de Acinetobacter calcoaceticus
PHEA-2, una bacteria no patógena con actividad catalítica al fenol
Fondi et al. (2013) muestra la secuencia del genoma de Acinetobacter venetianus
VE-C3, una cepa conocida por su capacidad para degradar n-alcanos.
Yergeau et al. (2012) secuencion el metagenoma del suelo de un proyecto de
biorremediación en Canadá, con el objetivo de evaluar que microorganismos y
genes funcionales son abundantes en la degradación de hidrocarburos a baja
temperatura.
El metagenoma como se ha señalado es una herramienta poderosa para la
tecnología ambiental, proveyéndonos de facultades ingeniosas que nos permiten
acciones como remediar, mejorar o prevenir problemas ambientales

Referencias
Balagurusamy, N. (2016). Metagenómica: concepto y aplicaciones en el mundo
microbiano. Fronteras en Microbiología Aplicada.
Bonilla, G. (2008). Metagenómica, Genomica y Ecologia Molecular: La Nueva
Ecologia en el Bicentenario de Darwin. TIP Revista Especializada en
Ciencias Qumico-Biolgicas.
Ecalante, A. (2001). Diversidad Bacteriana del Suelo: Metodos de estudio no
dependientes del cultivo microbiano e implicaciones biotecnologicas.
Agrociencia.

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