PRACTICA 3

HERENCIA DEL COLOR EN GRANOS DE MAÌZ

Guadalupe Fernanda Zaisar Munguía, Josué Zaid Vega Olmos, Daniela Ibarra Maldonado
E-mails: d.ibarramaldonado@ugto.mx jz.vegaolmos@ugto.mx gf.zaisarmunguia@ugto.mx

PROTOCOLO
1. Se consiguieron varias mazorcas con diferente coloración aquellas denominadas mazorcas con
granos “pintos (conseguidas en una zona rural) y se escogieron 3 mazorcas diferentes con variedad
de coloración en sus granos.

2. Posteriormente se repartió una mazorca entre cada miembro del equipo y se comenzó a desgranar
con cuidado cada mazorca evitando tirar o perder los granos.

3. Luego se separaron por diferencia en coloración (incluso por tonalidades y combinaciones de

colores) y textura cada grano, agrupándolos según por características similares.

4. Después, se realizó un conteo general de los granos de cada mazorca y un conteo por grupo con
características similares.

5. Una vez terminada la separación y conteos se observaron los granos detenidamente y se les realizo
una incisión o corte pequeño para apreciar el pericardio, la aleurona y endospermo, a su vez se
identificaba que parte era la que determinaba el color del grano según lo siguiente:
Si el pericarpio es coloreado no se expresa el color de la aleurona y el endospermo.
Si el pericarpio es incoloro se expresa el color del endospermo.
Si la aleurona es coloreada no se expresa el color del endospermo.

RESULTADOS

1 3

Imagen 1. Mazorcas de maíz, de las cuales sólo se

utilizaron las que están enumeradas del 1 al 3.

1
MAZORCA 1

Total de granos
388

Colores de los granos Número de granos

Rosa 116
Azul/morado 272

Identificación de las partes de los granos

Pericarpio

Aleurona

Endospermoo

Imagen 2. Dos granos color rosa de la mazorca número

1 partidos a la mitad para poder identificar sus partes.

Pericarpio Incoloro
Aleurona Rosa
Endospermo Blanco

2
 Pericarpio

Aleurona

Endospermoo

Imagen 3. Dos granos color morado/azul de la mazorca

Pericarpio
número 1 partidos aIncoloro
la mitad para poder identificar sus
Aleurona
partes. Morado
intenso
Endospermo Blanco

MAZORCA 2
Total de granos
328

Colores de los granos Número de granos

Rosa 63
Morado 93
Blanco 172

Identificación de las partes de los granos

3
 Pericarpio

Aleurona

Endospermoo

Imagen 4. Dos granos color rosa de la mazorca

número 2 partidos a la mitad para poder identificar
sus partes.

Pericarpio Incoloro
Aleurona Rosa
Endospermo Blanco

4
 Pericarpio

Aleurona

Endospermoo

Imagen 5. Dos granos color morado de la mazorca número 2

partidos a la mitad para poder identificar sus partes.

Pericarpio Incoloro
Aleurona Morado
Endospermo Blanco

Endospermoo

Pericarpio Incoloro
Aleurona Rosa
Endospermo Blanco Aleurona

Pericarpio

Imagen 6. Dos granos color blanco de la mazorca

número 2 partidos a la mitad para poder identificar
sus partes.

Pericarpio Incoloro
Aleurona Blanco
ligeramente
amarillo
Endospermo Blanco

5
MAZORCA 3
Total de granos
268

Colores de los granos Número de granos

1) Azul/morado 92
2) Blanco 24
3) Azul 84
4) Morado 68

Imagen 7.

Granos de la mazorca
número 3, donde se puede
apreciar los diferentes
colores de cada uno.

Identificación de las partes de los granos

1) Azul/morado

Pericarpio

Aleurona

Endospermoo

Imagen 8. Grano color morado/azul de la mazorca Imagen 9. Grano color morado/azul de la

número 3 partidos a la mitad para poder identificar mazorca número 3 partidos a la mitad para
sus partes. poder identificar sus partes.

6
 Pericarpio Incoloro
Aleurona Morado azul
Endospermo Blanco

2) Blanco

Pericarpio

Aleurona

Endospermo

Imagen 10. Grano color blanco de la Imagen 11. Grano color blanco de la mazorca
mazorca número 3 partidos a la mitad para número 3 partidos a la mitad para poder
poder identificar sus partes. identificar sus partes.

Pericarpio Incoloro
Aleurona Blanco
Endospermo Blanco

3) Azul

Pericarpio

Aleurona

Endospermo

Imagen 12. Grano color azul de la mazorca Imagen 13. Grano color azul de la mazorca
número 3 partidos a la mitad para poder número 3 partidos a la mitad para poder
identificar sus partes. identificar sus partes.

Pericarpio Incoloro
Aleurona Azul
Endospermo Blanco

7
4) Morado

Pericarpio

Aleurona

Endospermo

Imagen 14. Grano color morado de la mazorca Imagen 15. Grano color morado de la
número 3 partidos a la mitad para poder mazorca número 3 partidos a la mitad
identificar sus partes. para poder identificar sus partes.

Pericarpio Incoloro
Aleurona Morado
Endospermo Blanco

DISCUSIÓN DE RESULTADOS

De acuerdo con los resultados podemos observar que en cada mazorca analizada existen diferencias en el color
de sus granos, excluimos la mazorca amarilla debido a la falta de granos de diversos colores.

En cada una de las mazorcas hay al menos dos diferentes tonalidades, esto es debido a la presencia de un
transposón, el cual es una secuencia de ADN que puede moverse de manera autosuficiente a diferentes partes del
genoma de una célula. Estas secuencias son las causantes de las mutaciones en el genoma de la planta y provocar
una alteración fenotípica visible, en este caso el color.

Además de partir a la mitad al menos dos granos de cada color diferente para analizar sus partes; en este caso fue
el pericarpio, la aleurona y el endospermo y así poder identificar la zona causante de la pigmentación en las
mazorcas. En el caso del pericarpio, el gen P localizado en el cromosoma 1 es el responsable de su color. La
aleurona, su color es determinado por 12 genes A, A-2, A-3, C, C-2 y R, si falta uno de estos genes dominantes su
color será blanco o incolora. Y el endospermo, el cual puede ser amarillo o blanco, esto es determinado por el gen
dominante Y en el cromosoma 6.

C O N C L U S I Ó N.

En esta práctica observamos 3 mazorcas distintas las cuales cuantificamos basándonos en la variabilidad del
color del grano de cada una, de tal modo que identificamos diferentes colores de granos como: rosa,
azul/morado, morado, blanco y azul. La expresión de dichos colores en los granos de las mazorcas es debida
a la acción de los transposones, los cuales son secuencias genéticas que se insertan en el genoma causando

8
interrupciones o mutaciones en el mismo afectando posteriormente el fenotipo, en este caso la expresión
alternada de los colores de los granos de maíz.

Además de que identificamos en los distintos tejidos del grano de maíz (pericarpio, aleurona y endospermo),
en donde se propagaba la expresión del color, la cual depende de los genes que se presenten, y de los
transposones involucrados por lo que cada grano posee un contenido genético distinto en relación con los
demás.

Aplicación en el área de QFB:

Potencial Del Uso Biomarcador De Los Retrotransposones En El Adenocarcinoma De Pulmón.

Los transposones o también conocidos como elementos móviles capaces de moverse de un lado a otro a
través del genoma de forma autosuficiente. Se sabe que algunos tipos de cáncer entre otras enfermedades
pueden ser consecuencia del movimiento de los transposones.

Un 3% del genoma humano son transposones de ADN y el resto son transposones de ARN o
Retrotransposones que en el aumento de tamaño de los genomas al utilizar un mecanismo conocido como
«copiar y pegar» con ayuda de la retrotranscriptasa y un ARN intermedio.

Los Retrotransposones pueden ser de origen vírico por repeticiones terminales largas (LTR) o no son de
origen vírico sin secuencias LTR conocidos como LINE, ambos tipos codifican la retrotranscriptasa necesaria
para su transposición además, otros transposones dependen de estos anteriores.

Lo anterior es importante ya que se ha comprobado que muchos tumores presentan alteraciones e

inestabilidades genómicas típicas de una “retrotransposición descontrolada” al permitir un ambiente
favorable que permite la retrotransposición, esto sería esencial para el estudio a fondo de la transposición
tumoral para dar una explicación de la progresión de la enfermedad o bien seguir sus mejoras debido a
cierto tratamiento o intervención quirúrgica al determinar si la retrotransposición ha regresado a su
regulación adecuada o bien continua con su “programación” normal.

Procedimiento: Materiales y Métodos:

Selección de las muestras y su secuenciación:

1. Se seleccionó el adenocarcinoma, el cáncer de pulmón más frecuente, utilizando muestras

congeladas de biopsias ARN total del tejido tumoral y de tejido sano de 8 pacientes intervenidos en
el Hospital Regional de Málaga.
2. Se extrajo el ARN total sano y tumoral de cada muestra de cada paciente y se secuenciaron en el
NextSeq 550 de Illumina® siguiendo un protocolo estándar marcado por el fabricante para un
experimento de ultra-secuenciación de ARN (RNA-seq) para obtener lecturas pareadas de 2 × 100 nt.
3. Por último se llevó a cabo el análisis de datos, con diversos aparatos, programas y algoritmos para su
limpieza, mapeo y cuantificación de la expresión de los transposones y cálculo de expresión global
(SeqTrimNext, mapeador Bowtie1, algoritmo de RepEnrich con ayuda de herramientas de SAMtool y
cálculo de la expresión global con R edgeR respectivamente).
4. Por último se filtraron los datos para retirar del análisis los transposones que se expresaban poco.

9
Distribución del cambio de expresión de la transposición por paciente. Se ha calculado la expresión
diferencial normalizada (eje de ordenadas) para los 1267 transposones entre el tejido tumoral y normal,
agrupados por paciente (eje de abscisas). log2FC: logaritmo en base 2 del cambio de expresión normalizado
entre tejido tumoral y normal; los valores positivos indican expresión en tejido tumoral y represión en el tejido
normal, mientras que los valores negativos indican represión en el tejido tumoral y expresión en el tejido
normal.
Resultados:

Según el análisis de los datos, quedaron 1267 transposones que aparecieron en 4 713 583 posiciones del
genoma. En la expresión diferencial se tuvo en cuenta que los valores de expresión estaban emparejados
(entre tejido sano y tumoral de cada paciente). Debido a lo anterior se consideró que el cambio de expresión
de un transposón era significativo cuando cumplía dos condiciones: que el cambio de expresión al pasar de
normal a tumoral fuera de al menos el doble, y que superara el filtrado de falsos negativos para las pruebas
múltiples basado en el FDR (Ratio de Descubrimiento Falso). Con estos datos se han identificado siete
transposones con expresión diferencial significativa: cinco se sobreexpresan en las células del
adenocarcinoma y los otros dos se sobreexpresan en las células sanas del pulmón. Todos los que son de la
clase de retrovirus endógenos humanos (HERV) tienen un gran potencial como biomarcadores diagnósticos o
predictivos al reprogramarse de la misma forma en todos los pacientes.

CUESTIONARIO
1. ¿A qué se debe la segregación observada?

R: La segregación de genes observada en cada mazorca que interviene en la coloración de los granos se debe
a los TRANSPOSONES que son secuencias genéticas capaces de replicarse e insertarse en más de un sitio en
un genoma determinado (secuencias de ADN capaces de moverse de un lado a otro del genoma de manera
autosuficiente) y al insertarse pueden provocar interrupciones de genes, la sobreexpresión de otros debido a
las translocaciones que realizan y esto puede traer como consecuencia alteraciones en genes necesarios
para producción del pigmento que da la coloración a los granos de maíz.

10
 2. ¿Qué tejido le proporciona le color a los granos de cada mazorca?

R: Los genes del color solo se expresan en 3 partes del grano: El pericarpio, la aleurona y el endospermo.

Si el pericarpio es coloreado (expresión del gen P) no se expresa el color de la aleurona y el endospermo. Sin
embargo:

Si el pericarpio es incoloro y aleurona también se expresa el color del endospermo (gen 6 y: blanco, Y:
amarillo). Está bajo control genético de un locus;  sólo se manifiesta cuando la aleurona es incolora.

Si la aleurona es coloreada no se expresa el color del endospermo, el color está determinado por 4 loci:
Coloreada: C, sin color: c, inhibidor del color: I y coloreada: i.

3. ¿Por qué crees que no todas las mazorcas tienes granos jaspeados?

R: Posiblemente se deba a ciertas limitaciones y/o dificultades que pudiera tener un transposón al momento
de insertarse en cierta secuencia y alterar algún gen, como el evitar las DNA-asas para poder llegar a cierto
locus, además también puede que tarde cierto tiempo para poder insertarse e inactivar cierto gen por lo que
no hacerlo en el momento preciso podría afectar a la inactivación del gen en cuestión, otro elemento para
tomar en cuenta es que los transposones pueden ser heredados por los padres a la descendencia implicando
diversidad en su acción y efecto e incluso podemos mencionar que la transposición se lleva a cabo de forma
individual en cada grano por lo que la herencia y expresión/inexpresión de los colores puede variar.

ANEXOS

Genes que afectan o codifican para la coloración:

1. Nombre del Gen: C o C1 (aleurona coloreada 1) Codificador de proteínas.

Ubicación: Cromosoma 9 en el brazo corto, BIN: 9.01, localización: NC_024467.2 (8983450...8984644 bp).
Cromosoma 9 - NC_024467.2

Ruta metabólica que afecta: Síntesis de 3-hidroxi antocianina / glucósido.

Proteína que codifica y función: myb proteína C1 que controla la expresión de genes implicados en la
biosíntesis de antocianinas. Regula la expresión de 3 genes estructurales: chalcona sintasa, dihidroflavonol
reductasa y flavonol O3 glucosiltransferasa, y es necesaria para el desarrollo del pigmento en granos.

Fenotipos: Dominante Aleurona de color, recesiva aleurona incolora, aleurona incolora con sectores
pigmentados, color de aleurona diluida, aleurona de color inducible por la luz, grano moteado.

11
 2. Nombre del Gen: C2, Codificador de proteínas.

Ubicación: Cromosoma 4 brazo largo, BIN: 4.08, localización: NC_024462.2

b(196893216...196896503 bp).

Cromosoma 4 - NC_024462.2

Rutas metabólicas que afecta: Síntesis de 3-hidroxianocianidina / glucósido, Síntesis de flavonol / glucósido,
Síntesis de flavanona, Síntesis de 3-desoxisocianidina / glucósido, Síntesis de flavona-C-glicosilo, Síntesis de
flobafeno, Síntesis de proantocianidina

Proteína que codifica y función: Chalcona (o calcona) sintasa 2 que produce la 4,2 ', 4', 6'-
tetrahidroxicalcona (también llamada naringenina-chalcona o chalcona), que puede, bajo condiciones
específicas, isomerizarse espontáneamente en la naringenina, participa en la vía de biosíntesis de
flavonoides, que forma parte de la biosíntesis de metabolitos secundarios.

Fenotipos: Dominante: Aleurona colorida, recesivo aleurona: incolora con sectores pigmentados, color
pericarpio difuso, color aleurona diluida, grano moteado, aleurona pálida, aleurona manchada.

3. Nombre del Gen: A1 (carencia de anticianinas 1), codificador de proteínas.

Ubicación: Cromosoma 3 brazo largo, BIN: 3.09, localización NC_024461.2 (219867858...219869634 bp,
complemento).

Chromosome 3 - NC_024461.2

Ruta metabólica que afecta: Síntesis de 3-hidroxianocianidina / glucósido, Síntesis de 3

desoxiantocianidina / glucósido, Síntesis de proantocianidina, Síntesis de antocianina, Síntesis de flobafeno.

Proteína que codifica y función: Dihidroflavonol 4-reductasa que es una enzima bifuncional implicada en
el metabolismo de los flavonoides.

Fenotipos: Dominante: pericarpio marrón o pericarpio colorido, Aleurona coloreada, recesivo: aleurona
incolora, incolora con sectores pigmentados, incolora / pálida, con secto pigmentado, pericarpio rojo pardo,
aleurona manchada.

4. Nombre del Gen: A2 (carencia de anticioninas 2) codificador de proteínas.

Ubicación: Cromosoma 5 brazo corto, BIN: 5.03, localización NC_024463.2: (68025862...68027404 bp).

Chromosome 5 - NC_024463.2

12
Ruta metabólica que afecta: Biosíntesis de antocianinas

Proteína que codifica y función: leucoantocianidina dioxigenasa que sirve para la oxidación de
leucoantocianidinas en antocianinas.

Fenotipos: Dominante: aleurona colorida. Recesivo: aleurona incolora sin embargo con el gen p-rr
pericarpio rojo.

5. Nombre del Gen: r1 (colorido 1), codificador de proteínas.

Ubicación: Cromosoma 10 brazo largo, BIN: 10.06, localización: NC_024468.2 (139780958...139790280 bp).

Cromosoma 10 - NC_024468.2

Ruta metabólica que afecta: Biosíntesis de antocianinas y flavonoides.

Proteína que codifica y función: factor de transcripción bhlh, proteína myc de s (de r1) regula la ruta
metabólica de antocianinas; El R1 dominante (elemento S) confiere función a la aleurona; los dominantes
representados por R1-r o r1-r (elemento P) confieren función en anteras, punta de la hoja, raíces de
refuerzo, etc., y es un activador transcripcional putativo que controla la síntesis específica de tejido de los
pigmentos de antocianina en varias partes de la planta de maíz.

Fenotipos: Dominante: diferentes coloraciones de la aleurona, recesivo: aleurona incolora.

BIBLIOGRAFIA

 https://rua.ua.es/dspace/bitstream/10045/14789/1/maiz04-RUA.pdf
 http://www.plantgdb.org/ZxGDB/
 http://www.genetics.org/content/199/3/655
 https://www.maizegdb.org/gene_center/
 https://books.google.com.mx/books?
id=ZANLDwAAQBAJ&pg=PT96&dq=transposones+2018&hl=es-
419&sa=X&ved=0ahUKEwi0he3S8dDhAhUrgK0KHUd1CDMQ6AEIQjAE#v=onepag
e&q=transposones%202018&f=false

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