Bioquímica. UNACHI.

Análisis del Documento “How Crowded is the Cytoplasm”

¿Qué tan lleno está el citoplasma? El citoplasma debe ser una estructura con una elevada
concentración de proteínas, esto se debe a que el citoplasma acuoso tiene especial
relevancia a la estructura del agua. Se han acumulado muchas observaciones que indican
que el agua celular presenta una estructura diferente a la del agua en una solución salina
diluída. Algunas de estas observaciones se refieren a Ias anormalidades del punto de
congelación y de los espectros de resonancia nuclear magnética del agua celular y los
experimentos realizados con la técnica de la fase de referencia.

El citoplasma en general, no es un jugador invisible en esas reacciones. Uno de los

ejemplos mejor estudiados es la aglomeración macromolecular (también llamado efecto
volumen excluido). Tener grandes vecinos de todas partes cambia concentración efectiva
de una proteína e influye en su movimiento y capacidad de reacción. Una reacción
biológica observada en solución diluida puede ser mucho más rápido o más lento que la
misma reacción dentro de una celda llena de gente.

Ahora bien, la actividad enzimática celular de una proteína no sólo es función de su propia
concentración sino, además, de la de otras proteínas, aun cuando estas no interactúen
específicamente con la enzima en cuestión. Según el artículo el gliceraldehído-3-P
deshidrogenasa existe en solución como una mezcla en equilibrio de monómeros y
tetrámeros y que los monómeros poseen una actividad específica al menos 10 veces mayor
que los tetrámetros. La adición de proteínas globulares no relacionadas con la enzima
promueve la formación de tetrámeros con la consiguiente disminución de la actividad
específica (Minton, 1981; Minton y Wilf, 1981).

Este "molecular crowding" inespecífico podría tener importancia en la regulación del flujo
metabólico o para la formación de compartimientos. Algunas Interacciones entre enzimas
glicolíticas crean un microambiente macromolecular que parece tener importancia en el
desempeño de la función catalítica in vivo, la asociación específica entre enzimas que
catalizan reacciones sucesivas debería tener aún mayor influencia, principalmente porque
reduce el tiempo de tránsito de moléculas de sustrato entre ellas.

Al igual se habla de la libre asociación y hetero-asociación en soluciones diluidas que

pueden afectar las actividades catalíticas de enzimas si bien la configuración o la asociación
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de proteínas son impulsadas por su alta concentración. McConkey sugirió que los
polipéptidos con puntos isoeléctricos muy conservados y con peso molecular forman
estructuras amplias complejas y extensas. Es por ello que se realizaron diferentes estudios
científicos como las dos fases de agua en las mitocondrias por Garlid en el cual consistió
en medir la distribución de solutos cargados penetrantes en diferentes volúmenes de esta
organela. Paine y Horwitz inyectaron oocitos de rana con gotita de gelatina con el fin de
crear una referencia para medir las propiedades de la gelatina como disolvente dentro de
los ovocitos, encontrando compartimientos de agua. Y cabe señalar a Clegg, que examinó
organismos como el camarón, salmuera, Artemia con el fin de conocer la dependencia de
diversos procesos metabólicos en la hidratación de la célula, demostrando que un 35% de
hidratación las células sintetizan lípidos, aminoácidos, reanudan el metabolismo de
moléculas pequeñas y fijan el CO2 en moléculas orgánicas.