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DE SAN AGUSTÍN
Facultad de Medicina
Proyecto de Investigación
Alumnos:
♠Huillca Pumachara Maritza
♠Kjuro Chavez, Gloria
Fernanda
N Nestor
♠Luna Cutisaca Marella
Fiorela
♠Mamani Mamani David
♠Mamani Quispe Milagros
Danitza
S Tutor:
Lourdes Roxana Juarez
Bueno
A
Curso:
Biología Molecular
2019-Noviembre
ÍNDICE
1. TÍTULO ……………………………………………………………………………………………1
2. AUTOR ………………………………………………………………………………………..…..1
4. EL PROBLEMA …………………………………………………………………………….…….1
4.1JUSTIFICACIÓN ……………………………………………………………………………..1
4.2 MARCO TEÓRICO ……………………………………………………………………….…3
4.2.1 DEFINICIÓN………………………………………………………………………….7
4.2.2 ANTECEDENTES
4.2.2 EL METABOLISMO DEL ALCOHOL ………………………………………….……4
4.2.3 EL ALCOHOL COMO FACTOR DE RIESGO ……………………………….…….5
4.2.3.1 OTRAS PATOLOGÍAS ASOCIADAS ……………………….….………….7
4.2.4 EPIDEMIOLOGÍA …………………………………………………………..………..8
4.2.5 METILACIÓN DEL DNA ………………………………………………….…………9
4.2.5.1 ESTABLECIMIENTO DE LOS PATRONES DE METILACIÓN .……….10
4.2.5.2 MAQUINARIA CELULAR DE LA METILACIÓNDEL ADN ….………….11
4.2.5.3 FUNCIONES DE LA METILACIÓN…………………………..…………….14
4.2.5.4 REPRESIÓN TRANSCRIPCIONAL ………………………….……………14
5. MÉTODOS ……………………………………………………………………………………….20
5.1 TIPO DE ESTUDIO …………………………………………………………………...20
5.2 ÁMBITO Y PERÍODO DE ESTUDIO …………………………………………….….20
5.3 POBLACIÓN A ESTUDIAR …………………………………………………….…….21
5.4 TÉCNICAS Y PROCEDIMIENTOS ………………………………………………….22
1
lesiones, trastornos mentales y del comportamiento, afecciones gastrointestinales,
cánceres, enfermedades cardiovasculares, pulmonares, trastornos reproductivos,
así como daño prenatal, mayor riesgo de parto prematuro y bajo peso al nacer (2).
El siguiente trabajo se hace con la intención de dar a conocer un método por el cual
se pueda identificar la problemática del alcoholismo relacionado con la metilación del
ADN, tomando en cuenta trabajos que anteriormente fueron publicados, pero que
son análisis de otros lugares que no tienen nada que ver con la región de Arequipa
aunque la incidencia del consumo de alcohol sea bastante grande (1).
Estudios anteriores sugieren que el abuso del consumo puede ser hereditario ya que
se han identificado individuos que tienen genes con alto riesgo (1).
2
4. MARCO TEÓRICO
4.1Definición:
Los criterios DSM-IV son los mejor definidos para el diagnóstico de dependencia
alcohólica, estableciendo que esta dependencia existe cuando repetidamente se
presentan dificultades relacionadas con el alcohol en al menos 3 de 7 áreas de
funcionamiento. Estas incluyen cualquier combinación de:
No todas las personas que beben tienen necesariamente que depender de la bebida.
La dependencia es el estado extremo de un continuo espectro de problemas
relacionados con el consumo de alcohol. Por ello se define el abuso de alcohol como
la repetición de problemas asociados al alcohol en una de las siguientes cuatro áreas
vitales:
3
Puede observarse que los dos conceptos hasta ahora expuestos descansan en la
existencia de un conjunto de dificultades asociadas al consumo de alcohol y no tanto
en la cantidad o frecuencia con la que se realiza el consumo. Con ello se deja
entrever que establecer un umbral de ingesta como criterio para el diagnóstico de
estos problemas es algo arbitrario, que carece de mucho valor, si se tiene en cuenta
que sus efectos varían enormemente dependiendo de las características personales
de cada individuo (sexo, edad, peso, etc.), así como del tipo de bebida ingerida (3).
Este proceso ocurre en el hígado donde el etanol pasa por dos procesos oxidativos,
primero se transforma en acetaldehído (AcH) y después en acetato. En los
hepatocitos existen 3 vías o sistemas por los cuales el etanol se transforma en
acetaldehído. La vía principal implica la alcohol deshidrogenasa citosólica (ADH),
que cataliza el metabolismo oxidativo del alcohol a acetaldehído . El hidrógeno se
transfiere del alcohol al cofactor nicotinamida adenina dinucleótido (NAD),
convirtiéndolo en la forma reducida, y se produce acetaldehído (5).
4
4.3 El alcohol como factor de riesgo
5
(trastornos amnésicos inducidos por tensión arterial a pequeñas dosis de
el alcohol). alcohol.
- Degeneración cerebelosa (1% de los - Hipertensión arterial a dosis mayores
alcohólicos con desnutrición). (3,5).
- Alteraciones cognitivas graves: - Miocardiopatía (4).
demencia alcohólica... - Ictus hemorrágicos (sobre todo en las
- Apnea obstructiva del sueño 24 horas tras consumo excesivo) (3,
- Tristeza, ansiedad, alucinaciones... 14,15).
B) Aparato Digestivo: - Incremento del riesgo de infarto de
miocardio si el patrón es de mucho
- Esofagitis y gastritis, síndrome de
consumo en un solo día o un fin de
Mallory-Weiss debido a vómitos
semana (4).
repetidos.
- Arritmias de fin de semana.
- Varices esofágicas por hipertensión
F) Alteraciones genitourinarias:
portal.
- Hemorragias duodenales y diarreas. - Atrofia testicular, amenorrea,
- Pancreatitis aguda o crónica. infertilidad.
- Esteatosis hepática, hepatitis - Problemas durante el embarazo.
alcohólica y cirrosis (5,6). Diversos estudios muestran como un
C) Cáncer: El alcohol es 14% de las mujeres continúan
fundamentalmente un co- bebiendo alcohol durante el
carcinógeno. Los alcohólicos embarazo, elevando con ello el riesgo
presentan un RR=10 para cualquier de abortos espontáneos o la aparición
cáncer (3). Las zonas más del llamado “síndrome alcohólico
frecuentemente afectadas son la fetal” (retraso del crecimiento,
cabeza y cuello, esófago, cardias, deformidades faciales y disfunción del
hígado, páncreas, mama y colorrectal SNC), si bien este último también se
(3,5). ha relacionado con factores
genéticos, nutricionales y
metabólicos (5,6).
En nuestro país se calcula que un 4% de todas las muertes son debidas directa o
indirectamente al alcohol, lo que en términos absolutos supone alrededor de 13.000
defunciones anuales. El consumo de alcohol es un claro factor de riesgo de suicidio,
especialmente entre la gente joven. La intoxicación alcohólica puede conducir a
6
comportamientos sexuales irresponsables que incrementan el riesgo de
enfermedades de transmisión sexual y de adquirir el SIDA (7).
Hepáticas
Desidratación
7
4.5 Epidemiologia
La prevalencia de vida del consumo del alcohol, en la población urbana del Perú,
casi no ha sufrido cambios entre el 2010 y el 2015, de 87.8% a 86.2%, si bien se
observa una ligera disminución en población de 12 a 18 años desde 62.7% a 59.7%,
así como en los jóvenes de 19 a 24 años, desde 92.7% a 87.3%
(9).
(9).
8
(10).
En las células somáticas humanas, la 5mC constituye 1% del total de las bases del
ADN y afecta un alto porcentaje de todos los dinucleótidos CpG en el genoma. La
presencia de la 5mC produce un cambio conformacional en la doble cadena del ADN,
lo cual+ podría actuar como una señal específica para otras moléculas que
intervienen en la regulación de la expresión génica. El estado de metilación de los
residuos de citosina le puede conferir una variación espacial y temporal a la
estructura de la cromatina, habiéndose demostrado que generalmente existe una
correlación inversa entre los niveles de metilación del ADN y la expresión génica
(12).
9
en el genoma están metiladas, mientras que las correspondientes a las islas CpG
localizadas en la mayoría de los genes de mantenimiento celular no lo están. En
general, las islas CpG se localizan entre la región central del promotor y el sitio de
inicio de la transcripción, observándose represión en la expresión del gen cuando se
encuentran hipermetiladas (13).
10
La metilación de novo también puede ocurrir en las células somáticas adultas, un
número significativo de islas CpG son susceptibles de metilación progresiva en
ciertos tejidos durante el proceso de envejecimiento o en los procesos neoplásicos.
Sin embargo, la velocidad con que ocurren estos cambios parece ser muy lenta.
Recientemente se ha observado que existen patrones de metilación anormales en
muchos tipos de cáncer, los cuales conducen principalmente a la inactivación de
genes supresores de tumores y a la inestabilidad del genoma (11).
Una gran interrogante ha sido cómo se generan los patrones de ADN metilado y
desmetilado durante el desarrollo y cómo se mantienen en las células diferenciadas.
Estos procesos parecen ser el resultado de la acción combinada de enzimas que se
encargan de metilar y de mantener los patrones de metilación, llamadas
metiltransferasas de novo y de mantenimiento, respectivamente (13).
Diferentes líneas de investigación sugieren que los patrones de metilación del ADN
son vitales para el desarrollo normal de los vertebrados. Esto ha sido demostrado en
ratones transgénicos homocigotos para mutaciones en alguno de los genes que
codifican para las ADN metiltransferasas, los cuales mueren durante el desarrollo
embrionario. El nivel de metilación de células pluripotenciales embrionarias en estos
animales comparado con el de células normales y de animales heterocigotos se
redujo alrededor de un tercio con respecto a lo observado en los heterocigotos o en
las células de embriones normales. Aunque no se observaron diferencias en el
fenotipo de las células pluripotenciales embrionarias homocigotas en cultivo, los
embriones homocigotos mostraron atrofia severa, retardo en el desarrollo y muerte
a mitad de la gestación (12).
11
diferentes que llevan a cabo esta reacción y se han clasificado en dos grupos: las
ADN metiltransferasas de mantenimiento (DNMT1) y las metilasas de novo
(DNMT3A y DNMT3B) (12).
12
la pérdida de diferentes motivos conservados del dominio catalético de la enzima.
Sin embargo, DNMT3L contiene el motivo conservado PHD a través del cual se
asocia con la desacetilasa de histonas 1 (HDAC1) para reprimir la transcripción. Se
ha postulado que la DNMT3L podría tener un papel en la regulación del
establecimiento de la metilación en la impronta genómica, y que la asociación con
las HDAC podría ser relevante para su funcionamiento (13).
13
ADN, sino también por el estado local de acetilación y metilación de las histonas (12).
Además del dominio MBD, MeCP2 es una proteína que contiene un dominio de
represión transcripcional (TRD, Transcriptional Represión Domain), y está codificada
por un gen localizado en el cromosoma X que se encuentra mutado en pacientes con
síndrome de Rett. La proteína MBD2 es parte de un complejo
14
llamado MeCP1 que muestra baja afinidad por el ADN metilado, lo que sugiere que
tiene una función de represión transitoria. Existen dos isoformas, MBD2a y MBD2b,
dependiendo del sitio de inicio de la traducción del gen. De manera interesante, la
isoforma MBD2b no ha sido observada in vivo, aun cuando se ha postulado que tiene
actividad de desmetilasa. La proteína MBD3 tiene una alta homología con MBD2,
aun fuera del dominio de unión a ADN metilado y forma un complejo proteico
diferente al de MBD2 (13,14).
Las proteínas MBD median la interacción entre el ADN metilado y los componentes
de la cromatina debido a que son capaces de reclutar complejos represores que
incluyen a las desacetilasas de histonas. Las HDAC remueven grupos acetilo de los
residuos de lisina de las histonas H3 y H4 y parecería que la carga positiva resultante
facilita la condensación de la cromatina y limita el acceso de los factores de
transcripción a los promotores localizados cercanamente (12).
15
que codifica el neuropéptido hipotalámico orexina A), o señalización presináptica y
tráfico de membrana ( SNCA , que codifica la sinucleína, alfa).
16
• La elevada cantidad de homocisteína está relacionada con hipermetilación del gen
promotor de la alfa-sin sinucleina y elevados niveles de mRNAs. La reducida
expresión del mRNA de la homocisteína induce la proteína el retículo endoplasmático
y la hipermetilación de su promotor en células sanguíneas ha sido asociada con
elevados niveles de homocisteína en sangre.
• Los promotores Htr3a se metilan en regiones relacionadas con la recompensa,
elevadas en el hipocampo, pero reducidas en el cuerpo estriado dorso medial y la
corteza prefrontal dorso medial.
• La desregulación de BDNF causa degeneración de la plasticidad sináptica y la
morfología de las dendritas. Los medicamentos Zebularina y 5 aza 2 desoxicitidina
bloquean las DNA metiltransferasas; su inhibición altera la metilación del promotor
de BDNF y Reelina implicados en la plasticidad en el hipocampo (19).
Polimorfismos
El gen que codifica DRD2 se localiza en el brazo largo del cromosoma 11, en la
región q22-q23.
17
respuesta completamente aversiva, que contribuye a una incidencia baja de
alcoholismo; ofrece protección contra el desarrollo de este; aparentemente no tiene
efecto sobre otras adicciones (20).
18
• POMC (codifica proopiomelanocortina)
• SNCA (codifica la sinucleina) (22, 23).
5. ANTECEDENTES
Dos estudios demostraron niveles elevados de metilación del ADN global (elemento
repetitivo) en sujetos con dependencia al consumo de alcohol (DAA). Quince estudios
de genes candidatos mostraron hipermetilación de regiones promotoras de seis
genes (AVP, DNMT3B, HERP, HTR3A, OPRM1 y SNCA) o hipometilación de
GDAP1región promotora en temas relacionados con DAA. Cinco estudios de
metilación del ADN en todo el genoma demostraron cambios generalizados en la
metilación del ADN en todo el genoma en sujetos con DAA. Seis estudios mostraron
correlaciones significativas de la metilación del ADN con la expresión génica en
sujetos con DAA. Tres estudios revelaron efectos interactivos de la variación genética
y la metilación del ADN en la susceptibilidad a los dependientes al consumo de
alcohol. La mayoría de los estudios analizaron los cambios de metilación del ADN
asociados con DAA en la sangre periférica; Algunos estudios examinaron los cambios
de metilación del ADN en cerebros post mortem de sujetos con DAA.
7. HIPÓTESIS
El consumo de alcohol provoca cambios en la metilación del ADN, generalmente en
genes asociados
talescomo ( ANP , AVP , GDAP1 , GRIN2B , HERP , MAOA , OPRM1 , OrexinA , P
OMC , SLC6A3 , SLC6A4 y SNCA ) los cuales ejercen efectos sobre una variedad de
funciones celulares, como la sed y el equilibrio de sodio, asimismo las alteraciones
en la metilacion del DNA estan asociadas al grado de dependencia de alcohol y a
factores externos tales como la edad, sexo y tener un familiar con alcoholismo.
19
8. OBJETIVO GENERAL:
Determinar las alteraciones en la metilación del ADN de genes relacionados,
asociados al consumo de alcohol en pacientes del Centro de tratamiento y adicciones
Moisés Heresi.
Objetivos Específicos:
9. MÉTODOS
a. TIPO DE ESTUDIO:
Desde el punto de vista epidemiológico es de casos y controles.
Según Altman, es observacional, transversal y prospectivo. Según Baylor es
pseudolongitudinal.
20
El periodo de estudio comprende desde el mes de diciembre del presente año hasta
el mes de marzo del 2020.
c. POBLACIÓN A ESTUDIAR:
Estará constituida por aproximadamente 50 pacientes con diagnóstico de
alcoholismo del Centro de Tratamiento de Adicciones y Salud Mental Moisés Heresi
(casos); y por 50 personas sin diagnóstico de alcoholismo quienes serán
seleccionados de manera aleatoria de diferentes lugares; y que cumplan con los
siguientes criterios
Para casos:
Criterios de inclusión:
-Pacientes que acepten participar en el estudio y firmaron el asentimiento y el
consentimiento informado.
-Pacientes de ambos sexos.
-Pacientes del Centro de Tratamiento de Adicciones y Salud Mental Moisés Heresi
con diagnóstico de alcoholismo
-Pacientes que hayamos informado debidamente respecto al cuestionario con el fin
de obtener respuestas apropiadas (confidencialidad) (24, 25).
Criterios de exclusión:
-Pacientes que se nieguen a participar
-Pacientes con enfermedades genéticas.
-Pacientes que consuman periódicamente otro tipo de sustancias nocivas como
drogas, etc., o necesite tratamiento de urgencias en ese momento.
-Pacientes que no completen en su totalidad las pruebas realizadas.
Para controles:
Criterios de inclusión:
-Personas que acepten participar en el estudio y firmaron el asentimiento y el
consentimiento informado.
-Personas de ambos sexos.
-Personas que hayamos informado debidamente respecto al cuestionario con el fin
de obtener respuestas apropiadas (confidencialidad)
21
-Personas que gocen de un estado de salud que les permita tomar la decisión de
beber alcohol o no
Criterios de exclusión
-Personas que se nieguen a participar
-Personas con enfermedades genéticas
-Personas que recientemente hayan consumido alguna sustancia que interfiera con
el adecuado desarrollo del cuestionario (26, 27).
d. TECNICAS Y PROCEDIMIENTOS
Variable independiente:
• Grado de dependencia al alcohol
• Edad
• Sexo
• Familiar con alcoholismo
22
VARIABLE INDICADORE VALOR FINAL ESCALA TIPO
S
GRADO DE Puntaje • Dependencia al Nominal Cualitativo
DEPENDENCI alcanzado en alcohol
A AL el Test de • No dependencia al
ALCOHOL AUDIT alcohol
23
se les entregará un consentimiento informado (anexo 2), el mismo que deberá ser
firmado.
El cuadro escribe los dominios conceptuales y el contenido de los items del AUDIT.
Fuente: “AUDIT, Pautas para su utilización en Atención Primaria” por Maristela
Monteiro con la asistencia técnica de Vladimir Poznyak del Departamento de Salud
24
Mental y Dependencia de Sustancias de la OMS, y Deborah Talamini, Universidad
de Connecticut.
25
genética y, en consecuencia, analizable mediante diferentes técnicas. Este método
se considera el patrón oro, dada su potencial alta resolución cuando se combina con
métodos de secuenciación.
Para analizar los niveles de metilación se utilizara la plataforma Ilumina
HumanMethylation450k BeadChip es uno de los métodos de secuenciación, más
asequible y más fácil de analizar e interpretar, contiene 485.512 sondas que
interrogan 19.755 islas CpG con cobertura adicional en las regiones de la costa y
los promotores de miRNA, así como 3091 en sitios no CpG., está adaptado para
reconocer ADN convertido en bisulfito para la interrogación de la metilación del
ADN. Ademas utilizan oligonucleótidos conjugados para medir secuencias diana
específicas, midiendo múltiples beads por tipo de beads, también permite la
selección de contenidos independientemente de las limitaciones asociadas con el
sesgo, frecuentemente asociadas con los métodos de captura de ADN metilado.
26
Se utilizara la prueba de T students para comparar la alteraciones de la metilación
entre los individuos dependientes de alcohol y los controles sanos.
12. RECURSOS
a. Humanos:
- Investigador, todo el grupo de trabajo.
- Asesor: Dra. Roxana Juárez
b. Material e Instrumentos:
- Ya descritos.
27
13. CRONOGRAMA
ACTIVIDADES
e e e e e e
s s s s s s
28
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
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comunes en la práctica clínica. 2ª ed. España: Jarpyo; 2012.p. 799-814
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30
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el receptor PAC1. Naturaleza. 2011; 470: 492–497.
22. Zannas AS, y col. El estrés de por vida acelera el envejecimiento epigenético en
una cohorte urbana afroamericana: relevancia de la señalización de glucocorticoides.
Genome Biol. 2015; 16: 266.
27. Rey-Buitrago M. Genética molecular del alcoholismo. Rev Fac Med. 2015; 63(3):
483-94
ANEXO 1
31
32
ANEXO 2
CONSENTIMIENTO INFORMADO
33
ANEXO 3
Firma:
DNI:
EDAD:
FAMILIAR CON ALCOHOLISMO: (SI) (NO)
34
ANEXO 4
35