Termodinámica del crecimiento

DEPARTAMENTO DE INGENIERÍA BIOQUÍMICA

FACULTAD DE INGENIERÍA
UNIVERSIDAD ICESI
 Termodinámica del crecimiento

Objetivo:
Definir parámetros biotecnológicos.
Incrementar producción de biomasa.
Favorecer viabilidad económica.
Modelo de la caja negra
 Diseño en fermentación
Sustrato: producto

Estequiometría constante vs crecimiento

Tasa de crecimiento y rxn estequiométrica

Black box: Tasa crec – rxn estequiométrica

Cinética celular: transferencia de electrones

Usado en t muy grandes y µ no cambia

 Modelo de la caja negra
Fuente  de  C Biomasa
Fuente  de  N CO2
Donador  de   Agua
Receptor  de  e Productos

-­5.815 C2O42-­ 1C1H1.8O0.5N0.2

-­0.2NH4+ 10.63HCO3-­
-­1.857  O2 -­5.417H2O  
– 0.8H+

Macroecuación correspondiente
-5.815 C2O42- -0.2NH4+ -1.857 O2 – 0.8H+ -5.417H2O +
10.63HCO3- + 1C1H1.8O0.5N0.2 = 0
 Modelo de la caja negra

La macroecuación de reacción para el crecimiento

microbiano contiene los compuestos relevantes del
sistema biológico.  

Normalmente se expresa con base a 1 C-mol de

biomasa.

Muestra cómo un sustrato se convierte en 1 C-molX,

consumiendo la fuente de C/donador electrones, una
fuente de nitrógeno y receptor de electrones.  
 Modelo de la caja negra

Comúnmente se acepta que la formación de biomasa resulta de:

Anabolismo: donde un donor de electrones orgánico

(crecimiento heterotrófico) o CO2 y un donor de electrones
inorgánico (autotrófico) se convierte, empleando Fuente de
Nitrógeno

Para crecimiento heterotrófico el donor de electrones es

también la fuente de carbono.
 Parámetros de crecimiento
pH    1-­14
µ max
Temperatura   0  -­110  ºC

Concentración   especies Ks
Fuentes   de  nitrógeno
Ysx
Donador   de  electrones

Aceptor   de  electrones ms
 Crecimiento microbiano

1/YSX= cantidad electrón donado (mol) necesario para

sintetizar 1 Cmol de biomasa

B𝑖𝑜𝑚𝑎𝑠𝑎=𝐶𝐻1.8O0.5N0.2 40-70 % proteína

1-2 % DNA
2-10%RNA
3-10 % Lípidos
3-10 % Carbohidratos
Crecimiento microbiano
 Grado de reducción

El grado de reducción (γi) es una cantidad

estequiometrica.

Refleja la cantidad de electrones que disponibles en un

compuesto dado.

Se calcula para escribir las reacciones redox en la cuales

un compuesto i se convierte a una serie de compuestos de
referencia (CO2, H2O, H+, Fe3+ SO42-, PO43-, N2 y
electrones.
 Grado de reducción

Número de electrones disponibles que pueden ser

transferidos
Elemento Electrones transferibles
C 4
H 1
O -2
N -3, -5, 0

Calcule el grado de reducción para la biomasa con

fórmula: 𝐶𝐻1.8O0.5N0.2
 Balance de grados de reducción

γi = Cantidad
estequiométrica
para cada
compuesto.
Cantidad de e-
producidos
 Grado de reducción

Ejercicio 1.: Grados de reducción

1.1 Complete el grado de reducción de las siguientes
sustancias
CO2 = 1 (4) + ( )(-2) =
NH4+ = 1 ( ) + (4)( ) + (1 ) ( ) =
NO3- = 1 ( ) + (3)( -2) + ( 1) ( ) =
H+ = (1) ( ) + ( )( ) =
CH1.8O0.5N0.2 = ( 1)( ) + ( )(1.8) +( )( 0.5) +(0.2) ( ) =
 Grado de reducción

Ejercicio 1.: Grados de reducción

1.2 En la siguiente reacción:

fCO2 + aFe2+ + bNH4+ + cH+ + dH2O + e Fe3+ + CH1.8O0.5N0.2 = 0

Cuál es el grado de oxidación de la biomasa?

Cuáles son los grados de reducción de los demás componentes? Qué
clase de ruta metabólica tiene lugar en esa reacción?
 Ejercicio

Cuál  es  el  grado  de  reducción  del  CO2  y  de  biomasa    

Cuál  es  el  grado  de  reducción  de  la  biomasa  tomando  
NO3-­ como  fuente  de  nitrógeno
 Estequiometría del crecimiento

Sustrato  compuesto  orgánico:Fuente de  C  y  

donador  de  e-­:    Crecimiento  heterotrófico

CO2 como  fuente  de  carbono.  Se  reduce  a  

biomasa:  Crecimiento  autotrófico
 Estequiometría del crecimiento
Crecimiento heterotrófico
a donador de e-/C-source + b N-Source +cH+ + dH2O + eCO2 +
1C1H1.8O0.5N0.2 =0

Crecimiento Autotrófico
f CO2 + a donador de e-+ bN-Source +cH+ + dH2O + e donador de e-
oxidado + 1C1H1.8O0.5N0.2 =0

Formato para reacción anabólica para la formación de 1 Cmol de

biomasa
 Ejercicio

Cuánto de oxalato necesito para obtener 1CmolX?

Considere crecimiento heterotrófico y use NH4+ como fuente
de nitrógeno

a C2O42- + bNH4+ + cH+ + dH2O + eCO2 + 1C1H1.8O0.5N0.2 = 0

Empiece  por  establecer  el  balance  de  grados  de  

reducción  de  la  reacción  de  oxalato.
 Ejercicio
a C2O42- + bNH4+ + cH+ + dH2O + eCO2 + 1C1H1.8O0.5N0.2 = 0
𝛾𝑜𝑥𝑎𝑙𝑎𝑡𝑜 = 2 y 𝛾𝑋 = 4,2

El balance de grados de reducción: a(2)+ 1(4.2) = 0

a = -2.1 cantidad en mol de donador de electrones necesarios

para obtener 1 Cmol de X.
−
𝑚𝑜𝑙  𝑑𝑒  𝑒 𝑛𝑒𝑐𝑒𝑠𝑎𝑟𝑖𝑜𝑠  𝑝𝑎𝑟𝑎  𝑎𝑛𝑎𝑏𝑜𝑙𝑖𝑠𝑚𝑜 𝛾7
=
𝐶 − 𝑚𝑜𝑙  𝑋 𝛾8

En realidad se requiere más de 𝜸𝑿 mol de donador de electrones para

producir 1 C-molX.
 Ejercicio

Considere un organismo que usa Fe2+ como donador de e- y

se oxida a Fe3+. Cuántas moles de Fe2+ necesito para obtener
1CmolX. Use NH4+ y CO2 como fuente de C.
 Reacciones catabólicas y anabólicas

Dada la diversidad (donores y receptores: orgánicos e inorgánicos) existen

cientos de miles de posible reacciones catabólicas, lo que contribuye
significativamente a la diversidad microbiana.
Reacciones catabólicas
 Reacciones catabólicas

Para un determinado donador de electrones la energía libre

producida por mol de donador de electrón depende del par
aceptor de electrones disponibles.

La energía libre de una reacción catabólica se estima

teniendo en cuenta la estequiometría del consumo completo
de 1 mol del donador de electrones posteriormente se aplica:

−Δ𝐺=>? =  Δ𝐺@AB
>?
 Ejercicio

Para la siguiente reacción catabólica donde el metanol actúa

como donador de electrones y NO3- que se reduce a N2.
Estime el ΔG0cat
CH4O + NO3- + N2 + H+ + HCO3- + H2O = 0
Reacciones catabólicas
 Estequiometría del crecimiento

Ys/xmax Vital  para  el  diseño  de  proceso

1/Ys/xmax =  cantidad  de  donador  de  e-­ necesaria  

para  sintetizar  1Cmol  de  biomasa  (1CmolX)

Ys/xmax = YD/xmax
Reacciones catabólicas y anabólicas
 Termodinámica y estequiometría
Cantidad de energía de Gibbs requerida para reacción
anabólica: YXG

Crecimiento heterotrófico
YXG = 200 +18(6-C)1.8 + exp[((3.8-γd/C)2)0.16 x (3.6+0.4C)]

C = número de carbonos de la fuente donadora de e-/Csource

γd = grado de reducción de 1 mol de donador de e-/Csource

Crecimiento Autotrófico
YXG = 3500 kJ/CmolX
 Termodinámica y estequiometría

Crecimiento heterotrófico
YXG = 200 +18(6-C)1.8 + exp[((3.8-γd/C)2)0.16 x (3.6+0.4C)]

Da directamente la cantidad de e- que debe ser catabolizado,

es decir:
YXG/ΔGcat = mol de e- catab./CmolX producido
 Termodinámica y estequiometría
YDX max = rendimiento de biomasa en base al donador

1/ YDX max = Donador de e- usado para obtener 1 CmolX

1/YDXmax = γx/γD + YXG/ΔGcat

Anabolismo + Catabolismo

DAE
(𝛾8 /𝛾7 )Δ𝐺𝑐𝑎𝑡
𝑌87 =
Δ𝐺𝑐𝑎𝑡 + (𝛾8 /𝛾7 )𝑌7J
 Termodinámica y estequiometría
Asuma que un microorganismo crece aeróbicamente empleando la
glucosa como fuente de carbono y donora de electrones. El amonio es la
fuente de nitrógeno. Calcule el 𝑌𝑀𝐴𝑋𝐷𝑋

γD = 6*4 +12*1+6 - 2 = 24 Biomasa: γX= 4.2.

Dado que O2 es el aceptor final de electrones, entonces el

∆𝐺01cat = 2843.1 1 kJ/Cmol X

𝑌XG =200+18 (6−6)1.8 +𝑒𝑥𝑝 [((3.8−24/6)2)0,16 (3.6+0,4∗6)] =236kJ/CmolX

32 % de la glucosa es usado en el catabolismo y 68 % en el anabolismo

1 /𝑌𝑀𝐴𝑋DX = 4.2 /24 + 236 /2843.1 = 0,25 𝑚𝑜𝑙 𝑔𝑙𝑢𝑐𝑜𝑠𝑎/𝐶𝑚𝑜𝑙𝑋

 Termodinámica y estequiometría
Ahora asuma que el microorganismo crece anaeróbicamente
empleando la glucosa como fuente de carbono y donadora de
electrones y produce etanol. Cómo cambian sus resultados?
 Mantenimiento
Tenga  en  cuenta  que  a  la  cantidad  de  e-­ que  debe  ser  
catabolizada    para  la  reacción,  debe  sumarse  la  energía  
necesaria  para  el  mantenimiento

YXG total = YXG + me/µ

−69000 1 1
𝑚P = 4.5  𝑒𝑥𝑝 −
𝑅 𝑇 298
me= energía  necesaria  por  hora  para  el  mantenimiento  de  
1CmolX  <  kJcmol-­1h-­1  >
 Relación Herbert-Pirt
µ qs= Consumo de e- donado
(−qS ) = max
+ (−mS )
YSX a una vel específica

-­qS 1
max
YSX

(-­mS)
0                                                 µ