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El origen de la vida terrestre moderna

Normalmente dos enfoques se han empleado para explicar y así poder entender como
la vida terrestre se originó. El primer enfoque que es el de abajo hacia arriba,
ejemplifica el experimento de Miller tratando así de reconstruir las condiciones de la
tierra primitiva para poder tener una idea de cómo los principales componentes de los
seres vivos llegaron a existir. En este enfoque podríamos añadir ciencias como la
astrofísica, geofísica y química. El segundo enfoque es el de arriba hacia abajo y
principalmente se ve favorecida por los biólogos, ellos tratan de encontrar en los
organismos de hoy en día las reliquias de sus antepasados para así poder reconstruir
antiguas vías metabólicas y procesos moleculares. Ninguno de estos enfoques puede
ser exitoso solo, ya que para tener un escenario exitoso se debe reunir pruebas
fehacientes que van desde la química inorgánica hasta la evolución darwiniana, en
este sentido podríamos decir que la búsqueda de nuestro origen es intrínsecamente
interdisciplinaria. A pesar de las dificultades los avances fueron a pasos de gigantes
en la última década en el tema de comprensión del origen de la vida moderna. Aún
quedan muchos enigmas por resolver y uno de ellos es el origen del ARN, ya que es
donde los enfoques de abajo hacia arriba y de arriba hacia abajo se encuentran.
Sabemos que definitivamente, de la resolución de la estructura del ribosoma, que las
proteínas modernas fueron “inventadas” por el RNA. Esto significa que el ARN fue
dueño de la vida en tiempos pasados y que abarcaba las propiedades genéticas y
catalíticas actuales realizadas por el ADN y las proteínas, respectivamente. Sin
embargo hasta hoy en día no se pudo realizar de buena fe la formación de un
ribonucleótido en el laboratorio ya que es extremadamente difícil al igual que la
formación de oligonucleótidos a partir de monómeros.
LA CONSTRUCCION DE UN PLANETA HABITABLE
La formación de la tierra
La formación de la tierra tiene planteado diferentes mecanismos, sobre todo
explicando el mecanismo de acumulación que podría haber dado lugar a la formación
de un planeta semejante al terrestre. La formación de la tierra está fechada con
bastante precisión (4.56 Ga), esto se encuentra basado en la datación de un tipo
particular de meteoritos llamados “condritos ordinarios”. Probablemente el mecanismo
de acumulación era rápido (alrededor de 100 Ma) y esto habría conducido a un planeta
muy caliente con un océano de magma. Probablemente la formación de los océanos y
continentes se produjo más rápido de lo pensado (entre 4,5 y 4,4 Ga), esto se puede
inferir gracias a que se pudo encontrar la roca más antigua, un antiguo circón de 4.4
Ga de Australia, que da pruebas de una interacción entre las rocas y el agua a
temperaturas inferiores de 100 ° C.
La atmosfera también se habría formado muy tempranamente a partir de elementos
volátiles (tales como el nitrógeno) aportados por material extraterrestre en la superficie
de la tierra. En este aspecto la astrofísica nos ha enseñado que la vida no es ajena al
universo. Las moléculas complejas orgánicas, así como silicatos, hidrocarburos y
diversas formas de hielo se han podido encontrar en nubes extrasolares. Por lo tanto a
medida que la temperatura disminuía, los compuestos orgánicos, ya sea producidos
en la tierra o procedentes de meteoritos o micrometeoritos (polvo cósmico), pudieron
haberse comenzado a acumular en la superficie. Algunos autores nos han enseñado
que las condiciones para el surgimiento de la vida ya existían hace 4.4 a 4.3 Ga. Sin
embargo, la habitualidad de la tierra primitiva se vio seriamente comprometida por
múltiples impactos gigantes. Particularmente hacia 3.9 Ga ya que la tierra fue un
objeto de impresionante episodio de bombardeo que lleva por nombre el Bombardeo
Pesado Tardío (LHB)
Bombardeo Pesado Tardío (LHB)
Los cráteres observados en diversas superficies de planetas y/o satélites cuya
superficie no fue remodelada por la erosión, la sedimentación y la tectónica de placas
testifican que los meteoritos que golpearon la superficie de la tierra durante LHB tenían
un gran diámetro. Este acontecimiento dramático pudo haber sido provocado por la
migración de los planetas gigantes que tuvo lugar después de la disipación de la
nebulosa gaseosa circunsolar. El LHB tuvo una duración de 20 a 200 millones de años
aproximadamente, la frecuencia de impacto es muy debatida. Los modelos predicen
que de tales impactos habría casi completamente resurgido nuestro planeta, llevando
a la evaporación de los océanos, la fusión de la corteza hasta por lo menos 1.000 ms,
y la perdida de la atmosfera. Se puede inferir que la corteza continental terrestre más
antigua data exactamente con el final del LHB. Es poco probable que cualquier forma
de vida, si ya existía, habría sobrevivido al devastador impacto del LHB. Si esto fuese
correcto la vida moderna habría resurgido después de 3.9 a 3.8 Ga. Las rocas
sedimentadas testifican que los océanos ya se habían reformado por ese tiempo.
La atmósfera primitiva y los océanos
En la composición de la atmosfera primitiva se pudo comprobar y aceptar que la
atmosfera primitiva de principios del Arcaico era anóxico y probablemente débilmente
reductora, y dominado por especies oxidantes tales como el CO
2
, N
2
, CO y H
2
O, con
pequeñas cantidades de H
2
, que se habría escapado rápidamente al espacio exterior.
La radiación UV habría destruido a los gases suministrados por desgasificación
volcánica, como CH
4
y NH
3
y estos puede ser que hayan subsistido solo a nivel local
alrededor de los respiraderos hidrotermales. Actualmente se formuló una teoría en la
que nos dice que el escape de hidrogeno fueron más bajos que los estimados
anteriormente, lo que sugiere que el hidrogeno puede haber sido abundante. Esta
habría sido una buena noticia para todos los modelos de vida que se originaron en
nuestra superficie terrestre, ya que una atmosfera reductora habría favorecido a la
química prebiótica “tradicional”. Sin embargo estas estimaciones han sido objeto de
críticas y el debate está en curso. También se pudo notar que la tierra primitiva estaba
en peligro de congelación debido a la baja luminosidad del sol. Varios autores han
sugerido que se requirieron concentraciones elevadas de CO
2
en la atmosfera
primitiva para así poder evitar la congelación de la tierra. La glaciación a escala global
queda excluida ya que se pudieron encontrar viejas rocas sedimentadas. Un estudio
realizado con isotopos sobre el carbono orgánico demuestra que las concentraciones
de oxigeno se convirtieron en significativas y que comenzó a aumentar de manera
constante. Curiosamente, este periodo coincide con dos posibles episodios de
congelación de la tierra y esto se supone que han sido provocados por la acumulación
de oxigeno producido biológicamente. Los océanos se oxigenaron después de una
etapa llamada euxinica. Sin embargo los datos isotópicos siguen siendo
controversiales por diversos motivos.
El registro fósil
La descripción de rastros de vida se pudo dar en las observaciones de estructuras en
capas Arcaicas que son muy similares a los estromatolitos y gracias a la ciencia se ha
demostrado que muchas de estas estructuras se producen abogenicamente en el
laboratorio bajo condiciones particulares. También se detectó materia orgánica gracias
a la espectroscopia Raman laser in situ. Teniendo en cuenta la composición isotópica
de los diferentes elementos se ve afectada por los procesos biológicos y por lo tanto
puede indicar la presencia de los metabolismos particulares. Teniendo en cuenta esto
podemos decir que las señales isotópicas se han estudiado ampliamente para buscar
señales de vida en rocas antiguas y para identificar metabolismos antiguos
específicos. Por último, fósiles moleculares derivados de la transformación de lípidos
también se han utilizado para determinar provisionalmente la edad de la aparición de
diversas formas de vida. Actualmente se están realizando nuevas pruebas con nueva
tecnología para poder extraer lípidos y se espera poder limitar biomarcadores de
iniciales rocas arcaicas.
EL ORIGEN Y EVOLUCIÓN TEMPRANA DE LA VIDA
Las teorías heterótrofas frente a teorías autótrofas.
De acuerdo a la “sopa prebiótica”, las moléculas orgánicas se habrían acumulado por
primera vez en el océano o en las pequeñas masas de agua en la tierra primitiva, ya
sea suministrado por fuentes extraterrestres o producidas por experimentos tipo de
Miller. Se dice que los primeros sistemas de vida aparecieron luego de la
complejización gradual del caldo prebiótico. Los autores que apoyan la teoría
heterotrófica a menudo argumentan que la química prebiótico es la prolongación de
nuestro planeta de la química cósmica cuyos productos de hecho coinciden con los
pilares de la vida. Para esta teoría la posibilidad de producir moléculas orgánicas en
condiciones prebióticas es demasiado sorprendente para ser fortuita. Estos autores
han deducido que el tiempo para la estabilidad fue a largo plazo con un origen lento y
frio. Como una alternativa a esta teoría nació la teoría autotrófica, propuesta
principalmente por Wachtershauser. En esta teoría se utilizó un flujo de energía
proporcionado por las reacciones químicas en las interfaces de solido a líquido para la
fijación del carbono. Otro autor que propuso un modelo parecido fue Russell y Hall. En
esta teoría en vez de vinculas química cósmica con bioquímica, se vinculó la
bioquímica con la geoquímica. Los autores de esta teoría han sido influenciados
altamente por el descubrimiento de las fuentes hidrotermales y de hyperthermophiles a
finales de 1970 y principios de 1980. A diferencia de los partidarios del origen
heterotrófico ya que ellos se apoyan en una fuente de energía geotérmica. En estos
modelos, la estabilidad de las moléculas orgánicas ya no es un problema ya que estos
habrían sido de corta duración. Teniendo en cuenta que la alta temperatura aumenta
la velocidad de las reacciones en la superficie de los minerales o dentro de las
estructuras de minerales. En los experimentos realizados por parte de las dos teorías
no se ha podido demostrar que son autocataliticas, un requisito fundamental para
iniciar la evolución química real. Particularmente los seguidores de la teoría
heterotrófica coinciden en que las reacciones que se producen se dan en entornos
hidrotermales y/o volcánicos y estos pueden ser que hayan enriquecido el arsenal
prebiótica de moléculas orgánicas. En tanto la actividad volcánica podría haber sido
especialmente importante para la producción de compuestos fosfóricos que son
esenciales para la vida. Ferry y House pudo juntar las dos teorías y así poder formar
un flujo de energía geotérmica y esta se acopla a la formación de compuestos
fosforilados. Los defensores de la hipótesis de las teorías heterotróficas afirman que
las primeras moléculas orgánicas se producen por reacciones totalmente
independientes del metabolismo moderno por lo contrario los defensores de la teoría
autotrófica nos dicen que se suele vincular directamente el protometabolismo a las
proteínas modernas a través de la coevolucion de ARN y péptidos.
Sobre el camino a proto-celulas
Existen algunos autores que sugieren que la evolución darwiniana pudo haber ocurrido
ya antes de la existencia de entidades celulares. Sin embargo esta posición no tiene
tanta validez ya que argumentos teóricos y experimentales convincentes sugieren que
la formación de células ocurrió tempranamente en la evolución de la vida. La evolución
de estas proto-celulas fue probablemente esencial para la evolución de replicadores
ARN y el establecimiento de cualquier protometabolismo impulsado por energía.
Siguiendo esta línea podemos decir que un protometabolismo es capaz de sintetizar
nucleótidos para la producción de ARN y que también ha sido capaz de producir
células simples. Si hablamos de las vesículas lipídicas podemos decir que estas se
pueden producir con bastante facilidad in vitro a partir de ácidos grasos o mejor aún
esteres de glicerol de ácidos grasos. Además estas vesículas tienen la capacidad de
someterse a varios ciclos de crecimiento y división también se demostró que las
vesículas que encapsulan ARN crecen preferentemente por captura de lípidos a
expensas de vesículas vacías. Esto se puede llegar a explicar por el aumento de la
presión osmótica en el interior de vesículas que contienen ARN.
Origen de ribonucleótidos
Podríamos decir que el ATP y otros NTPs, incluyendo muchas bases modificadas; se
originaron por primera vez como transportadores de energía en el protometabolismo y
como coenzimas catalizadoras de péptidos antes del origen del RNA por si mismo.
Pero como principal problema tenemos la formación de ribosa y nucleosidos. Los
intentos de combinar con bases de ribosa y/o fosfato en condiciones prebióticas
también producen mezclas complejas con los bloques de construcción “normales” de
nucleótido en la reacción de ensamblaje. Esto nos lleva a decir que la ribosa no es un
compuesto prebiótico, pero fue inventado por los organismos que vivieron en un
mundo pre-ARN, donde lo importante no era la ribosa sino los azucares simples o
amino ácidos, pero estos compuestos son también difíciles de producir química
prebiótica y carecen de algunas de las propiedades interesantes de ARN. Otro
hallazgo reciente que podría ser de gran importancia es que la ribosa impregna tanto
el ácido graso y las membranas de fosfolípidos más rápidamente que otras
aldopentosas.


Origen de las ribozimas
En esta parte podemos decir que el ARN se puede estabilizar por una alta
concentración de sales monovalentes, pero la mayoría de las ribozimas absolutamente
requieren concentraciones milimolares de sales divalentes que por el contrario
aumentan fuertemente la degradación del ARN a altas temperaturas. En este
problema Vlassov y colaboradores han sugerido que el ARN se produjo por primera
vez en ambientes fríos. Curiosamente, un enlace 3-5 entre los nucleótidos es el
principal o incluso el único producto formado bajo condiciones de congelación. Los
primeros ribosomas podrían haber sobrevivido el transporte a los ambientes más
cálidos y húmedos, en virtud de su poder de síntesis que supera a la degradación.
Emergencia del mundo proteína-ARN
Una polimerasa eficiente no solo fue capaz de replicarse a si mismo, sino también
para replicar plantillas catalizadores que produzcan ya sea ribozimas útiles para el
metabolismo de la célula ARN. Muchos autores han sugerido que la síntesis de
proteínas apareció por primera vez como un subproducto de la replicación del ARN y
más tarde fue seleccionado en base a la expansión de chaperona y las actividades
catalíticas de los péptidos más largos. Por otra parte Maizel y Weiner sugirieron que el
módulo de amino-ácido de ARNt con su extremo CCA origino primero como una
etiqueta para la replicación del ARN genómico. Todos los ARNt modernos son
monofiléticos, es decir, originados a partir de una sola molécula ancestral que habría
aparecido en una estirpe ARN de células en particular. Además se supone que el
código genético primitivo era más simple y se expandió en el curso de la evolución. A
raíz de esto se han propuesto dos teorías principales, lo que sugiere que el codón
elegido fue iniciado por la interacción específica entre los aminoácidos y anticodones o
que la elección del codón se creó en paralelo con la evolución de las rutas
biosinteticas de aminoácidos. El código genético moderno no es probablemente, un
accidente congelado pero parece ser optimizado para reducir al mínimo las
consecuencias perjudiciales de las mutaciones. Por otra parte Goldenfeld y
colaboradores han demostrado recientemente a partir de la estimulación in silico que
in código optimo podría haber llegado a ser universal en el marco de una evolución
comunitaria, si esto es correcto indicaría que los mecanismos de transferencia de
genes estaban en funcionamiento muy tempranamente, lo que permite el intercambio
genético entre células de ARN-proteína. En un reciente trabajo se pudo demostrar la
existencia de don sintasas no homologas, lo que sugiere que el ADN moderno con
timidina puede haber sido inventado dos veces, y , posiblemente de forma
independiente. En conclusión se supone que el ADN reemplazo al ARN ya que es mas
estable y se puede replicar mas fielmente.
El ORIGEN DE LAS CELULAS MODERNAS
El ultimo ancestro común universal
Uno de los tantos objetivos de los enfoques de arriba hacia abajo en el campo del
origen de la vida es reconstruir el antepasado común de todos los organismos
existentes para alcanzar una etapa intermedia entre el origen de la vida y la presente
biosfera. Existe una entidad histórica llamada cenancestor, la progenota o la LUCA. La
LUCA no debe confundir con la primera célula, pero era el producto de un largo
periodo de evolución y se podría decir que la LUCA fue precedida por sus
antepasados y muchos de estos todavía estaban presentes en el tiempo de la LUCA.
Para ciertos autores la LUCA era un organismo muy simple, incluso, posiblemente,
acelular mientras que otros consideran que LUCA fue una bacteria de tipo moderna o
incluso eucariota primitivo con un núcleo. Gracias a los avances de la genómica
comparativa, algunos aspectos de estas hipótesis pueden ser corroboradas. Otra idea
polémica es que hipertermofilos modernos podrían ser los descendientes directos de
un LUCA amante del calor. Sin embargo, esta posición podría ser debido al alto
contenido de guanina-citosina de sus ARNr, que pudieran haber reducido su tasa de
evolución. Se puede decir si LUCA tenía un genoma de ADN, el sistema ancestral
podría haber sido reemplazado en un linaje por un nuevo sistema de origen viral. Por
ultimo si LUCA todavía tenía un genoma de ARN autentico, Forterre sugirió que las
pocas proteínas universales implicadas en el metabolismo del ADN se introdujeron de
forma independiente por los virus de ADN en los tres dominios celulares, La teoría de
que LUCA tenía un genoma de ARN fue impulsada recientemente por el
descubrimiento de los mecanismos de la reparación de los daños y para la mejora de
la fidelidad de la transcripción y la replicación. Estos resultados sugieren que las
células ARN-proteína pueden haber alcanzado un nivel de sofisticación mucho más
importante de lo que se pensaba, se presume que LUCA fue el último ancestro común
de Archae y Bacteria. La raíz del árbol bacteriano y el origen de los eucariotas siguen
siendo muy controversiales. Si la raíz resulto de la rama eucariota varias
características ahora exclusivamente presentes en eucariotas ya podrían haber estado
presentes en LUCA. Finalmente quedan muchas cuestiones por resolver entre ellas: (i)
por qué existen tres versiones canónicas de los ribosomas (ii) la forma en que ahora
son tan diferentes entre sí, pero tan similares entre cada dominio. Se han propuesto
muchos escenarios contradictorios y todavía se discuten, muchos trabajos tienes que
estar hecho en bioquímica comparada y biología molecular, para asi poder probar
varios escenarios de la evolución.



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