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Metabolismo de Carbohidratos GLICOLISIS y Ciclo Pentosa Fosfato. Tema 12 y 13 Dra Maldonado
Metabolismo de Carbohidratos GLICOLISIS y Ciclo Pentosa Fosfato. Tema 12 y 13 Dra Maldonado
GLÚCIDOS
La glucólisis tiene lugar en el citoplasma de las células, encontrándose las enzimas que participan en la
ruta en estado disuelto en el citosol.
Etapas de la glucólisis
Dentro de esta ruta se pueden diferenciar dos fases:
1ª Fase o fase preparatoria en la que se produce un consumo de energía, formada por las cinco
primeras reacciones y una, 2ª Fase o fase de degradación, formada por las cinco últimas reacciones y
en la que se produce la obtención de energía.
A lo
largo de
la
primera
fase se
producen
las
siguiente
s
reaccion
es:
1.-La glucosa es fosforilada en el OH de su carbono 6 pasando a glucosa-6-fosfato (G6P).
2.-La glucosa-6-fosfato se isomeriza a fructosa-6-fosfato (F6P).
3.- La fructosa-6-fosfato se fosforila a nivel del carbono 1 pasando a fructosa, 1,6-bisfosfato
4.- La fructosa1, 6-bisfosfato se rompe (lisis) dando dos moléculas de tres átomos de carbono la
dihidroxiacetona-fosfato (DHAP) y el gliceraldehído-3-fosfato (G3P).
5.- La dihidroxiacetona-fosfato se isomeriza a gliceraldehído-3-fosfato. A lo largo de esta etapa se
produce un consumo de ATP, ya que es el dador de los fosfatos en ambas fosforilaciones, elevando la
energía libre de cada uno de los metabolitos intermediarios.
A través de esta segunda etapa:
6) El gliceraldehído-3-fosfato es oxidado y fosforilado por fosfato inorgánico del medio, y no
por ATP, pasando a 1,3-bisfosfoglicerato. La energía libre de la óxido-reducción se conserva
en forma de energía de enlace del fosfato.
7) El 1,3 bisfosfoglicerato realiza una transferencia del grupo fosfato al ADP para formar ATP,
ésta es la primera reacción de obtención de energía, mediante fosforilación a nivel de sustrato,
pasando el 1,3 bisfosfoglicerato a 3-fosfoglicerato. 8) El 3-fosfoglicerato transfiere
internamente en la molécula el fosfato al carbono 2, formándose 2-fosfoglicerato.
9) El 2-fosfoglicerato se deshidrata formando un doble enlace (enol) y convirtiéndose en
fosfoenolpiruvato.
10) El fosfoenolpiruvato transfiere el grupo fosfato al ADP, obteniéndose ATP como en la
reacción 7 por una fosforilación a nivel de sustrato y liberándose el producto final de la vía, el
piruvato.
De forma resumida la glucólisis es una ruta metabólica en la que se produce:
Una característica importante de la vía glucolítica es que todos los metabolitos intermediarios
son moléculas fosforiladas. La presencia de este grupo fosfato permite, en primer lugar, que
estas moléculas tengan una carga negativa, y siendo por lo tanto polares no pueden atravesar la
membrana celular, quedando atrapadas en el citoplasma.
Además, la transferencia de un enlace de alta energía aporta a la molécula un incremento de
energía libre, que le dará una mayor energía de activación, facilitando el curso de las
reacciones.
RUTAS DEL PIRUVATO. FERMENTACIONES
La ecuación global de la
glucólisis sería: Glucosa + 2
NAD+ + 2ADP + 2 Pi = 2
Piruvato + 2 NADH + 2 H+ + 2
ATP
TEMA 13:
Conocida como lanzadera o shunt de la pentosa fosfato, es una ruta metabólica estrechamente
relacionada con la glucólisis, durante la cual se utiliza la glucosa para generar ribosa, que es necesaria
para la biosíntesis de nucleótidos y ácidos nucleicos.
También se obtiene poder reductor en forma de NADPH que se utilizará como coenzima de enzimas
propias del metabolismo anabólico.
De esta manera, este proceso metabólico, el cual es regulado por insulina, tiene una doble función, ya
que la glucosa se usa para formar NADPH, mientras que también se puede transformar en otros
componentes del metabolismo, especialmente pentosas, utilizadas para la síntesis de nucleótidos y de
ácidos nucleicos.
Así, se forma un puente entre rutas anabólicas y catabólicas de la glucosa.
La ruta de la pentosa fosfato tiene lugar en el citosol, y puede dividirse en dos fases:
Fase oxidativa: se genera NADPH.
Fase no oxidativa: se sintetizan pentosas-fosfato y otros monosacáridos-fosfato.
Una ruta secundaria de la degradación de la glucosa, que no persigue como objetivo la formación de
ATP, es la ruta de las pentosas-fosfato o del fosfogluconato.
Su fin es obtener pentosas-fosfato, como la D-ribosa, necesaria para la biosíntesis de ácidos nucleicos,
y NADPH, que constituye un transportador de energía metabólica en forma de poder reductor
necesario para los procesos biosintética.
La degradación de la glucosa a través de esta ruta es necesaria en algunos tejidos concretos
(tejido adiposo, corteza adrenal, hígado, etc.) donde las reacciones biosintética son elevadas.
Es una ruta citoplasmática y las enzimas que catalizan las correspondientes reacciones se
encuentran en solución en el citosol. Consta de dos fases:
1.- Fase oxidativa o irreversible en la que se produce la oxidación de la glucosa-6-fosfato hasta
6-fosfogluconato, la eliminación de un átomo de carbono (Decarboxilacion) en forma de CO2 y
como producto final, una molécula de pentosa.
El balance de esta primera fase será: 3 Glucosa-6-P + 6 NADP+ + 3 H2O = 3 Ribosa-5-P + 3
CO2 + 6 NADPH + 6 H+
2.-Fase no oxidativa o reversible, en la que se produce una serie de interconversión entre
monosacáridos de 3, 4,5 y 6 átomos de carbono para obtener dos metabolitos intermediarios de la
vía glucolítica, la fructosa-6-fosfato y el gliceraldehído-3-fosfato.
Bibliografia:
. «The oxidative pentose phosphate pathway: structure and organization». Curr. Opin. Plant Biol. 6 (3): 236-46.
PMID 12753973.
. Müller Stern, W. (2008) “Bioquímica: Fundamentos para Medicina: Ciencias de la Vida” Ed. Reverté, páginas
522-527
Gliceraldehído-3-Fosfato Intermediario
Enediol Dihidroxiacetona
o Enediolato fosfato
Fosfoglucohidroximato 2-fosfoglicolato
La TPI cataliza las reacciones uniendo más fuertemente al estado de transición que al
substrato; de hecho el 2-fosfoglicolato se une de 100 a 155 veces con más afinidad a la TPI
que el GLICERALDEHÍDO-3-FOSFATO o DIHIDROXIACETONAFOSFATO. De ahí que
estas moléculas sean fuertes inhibidores de la enzima
Por otra parte se, conocen los rearreglos estructurales que se llevan a cabo en
presencia de diversos análogos del substrato. Todas las enzimas analizadas, son dímeros
formados por dos cadenas idénticas de aproximadamente 27 kDa. Los parámetros cinéticos
de la enzima proveniente de diferentes especies son semejantes. No se han descrito
cofactores o reguladores alostéricos, ni se ha detectado cooperatividad entre las
subunidades y la actividad de los sitios es independiente. Por medio de técnicas de
ingeniería genética, se construyó una variante monómerica a partir de la TPI de
Trypanosoma brucei, a la cual se ha denominado como monoTIM. Esta molécula, es capaz
de unir al substrato y catalizar la reacción, sin embargo, manifiesta una disminución de 20
veces con respecto a la enzima nativa en la Km y de 1000 veces en la kcat.
La triosafosfato isomerasa, es una enzima muy eficiente, la velocidad con que cataliza
la isomerización del GLICERALDEHÍDO-3-FOSFATO es entre 108 y 109 veces mayor que
en ausencia de ésta. La relación kcat/Km para el GLICERALDEHÍDO-3-FOSFATO como
substrato (La relación kcat/Km representa la constante de velocidad aparente de segundo
orden (v) de la reacción entre enzima libre ( E ) y substrato libre (S); v = (kcat/Km)
ES) es de 108 M-1s-1; éste valor es comparable al calculado (108-1010 M-1s-1) para
reacciones bimoleculares en solución controladas por difusión. La reacción catalizada por la
TPI se lleva a cabo gracias a la formación de un intermediario cis-enediol(ato).
Mecanísticamente, la función biológica de esta enzima, consiste en disminuir las barreras
energéticas que limitan la velocidad de protonación y deprotonación de los substratos y/o
estabilizar el intermediario cis-enediol(ato). El perfil de energía libre de la reacción que
cataliza, muestra que el estado de transición más alto es precisamente la unión del
GLICERALDEHÍDO-3-FOSFATO a la enzima. Gracias al estudio de los parámetros
catalíticos de la TPI variando la viscosidad del solvente, se ha confirmado por una parte, que
la unión del GLICERALDEHÍDO-3-FOSFATO a la enzima está limitada por la frecuencia de
encuentros entre las dos especies, y por otra, que no se debe a los ajustes
conformacionales que la proteína desarrolla con el solvente para la catálisis o a los
rearreglos químicos entre substrato y enzima. Por tanto, la TPI es un catalizador
"perfecto"; cualquier aumento en la velocidad de los pasos catalíticos no tendría efecto en
la velocidad de la reacción. En varias enzimas (Gracias al estudios cinéticos variando la
viscosidad del solvente, se ha demostrado que la velocidad catalítica de las siguientes
enzimas: fosforilasa b, peroxidasa de rábano, quimotripsina, -lactamasa, anhidrasa
carbónica, invertasa, acetilcolinesterasa, y adenosina desaminasa; está limitada por la
difusión del substrato hacia la enzima.), se ha encontrado que la difusión del substrato, es el
paso limitante para la catálisis. De tal forma, que el recambio entre el agua de hidratación y
el solvente, permite que la velocidad con la que la capa de hidratación de la proteína se
reajuste durante la catálisis, y no sea un paso limitante durante los rearreglos químicos entre
la proteína y el substrato. Estos hechos han permitido la evolución de mecanismos
biológicos altamente eficientes.
Por otra parte, estudios de resonancia magnética nuclear (NRM) indican que esta His
95 está en su forma neutral imidazol en vez de la forma imidazolio protonada. Pero, ¿cómo
un grupo imidazol N3-H, el cual tiene un pK altamente básico de 14.0, protona a un
oxígeno carboxílico que cuando se protona tiene un pK muy ácido de 0? Y del mismo
modo, ¿cómo puede el carboxilato del Glu 165 (pK 6.5) sustraer el protón del C2 (pK17) del
GLICERALDEHÍDO-3-FOSFATO?. Una posible explicación es que el intercambio del protón
esté facilitado por la formación de una intensa barrera de puentes de hidrógeno. Esta
inusual asociación tan fuerte (-40 a –80kJmol-1 vs –12 a -30kJmol-1 para puentes de
hidrógeno “normales”) se forma cuando los pK´s del donador y aceptor son muy parecidos.
La estructura secundaria de la TPI, está formada por ocho hebras que alternan con
una (a veces dos) hélice(s). La cadena se pliega de manera que las ocho hebras forman
una hoja paralela central semejante a un barril (el ángulo entre las hebras y el eje del
barril es de 35 0). Las hélices que unen a las hebras se empaquetan en forma paralela a la
dirección de las hebras. El sitio activo se encuentra en uno de los extremos del barril, en la
cavidad formada por las asas contiguas a las hebras . Este patrón topológico se ha
encontrado en más de 20 enzimas con actividades catalíticas diversas (aproximadamente el
10 % de las enzimas cristalizadas). No es claro si este patrón de plegamiento refleja las
características de un ancestro común, o si el barril presenta una topología estable a la cual
han convergido diferentes enzimas
Existe una presión evolutiva continua para modificar la cadena polipeptídica; las
regiones conservadas son aquellas que han resistido esta presión a lo largo de la evolución.
En proteínas homólogas, las regiones que se encuentran en el sitio activo están
conservadas, así como los residuos directamente involucrados en la química de la reacción.
Este es el caso de la TPI, los aminoácidos conservados son aquellos que participan
directamente en la química de la reacción, o se localizan en la vecindad del sitio activo. A
pesar de las diferencias en los aminoácidos de la interfase, la topología del barril y la
geometría de la asociación de los monómeros en el dímero, es semejante en diferentes
especies.
Metil glioxal
A la fecha, no es todavía claro el por qué la TPI sólo es activa como dímero, ya que
los aminoácidos involucrados en la catálisis se encuentran contenidos en el monómero. Es
probable que las interacciones en la interfase sean necesarias para mantener a los
aminoácidos catalíticos en una posición adecuada, o para mantener la estabilidad de la
estructura de barril; de hecho, un número de aminoácidos de la interfase se encuentran
conservados. Sin embargo, algunos miembros de la familia de proteínas / son barriles
activos como monómeros.
La glicelaldehído-3-fosfato deshidrogenasa (GAPDH) cataliza la oxidación de un
aldehído, el GLICERALDEHÍDO-3-FOSFATO (reacción exergónica) y sintetiza un acil-
fosfato, el 1,3-difosfoglicerato (1,3-bisfosfoglicerato) (reacción endergónica). El mecanismo
catalítico de esta enzima, consiste de 5 pasos:
2.- Un grupo sulfidrilo en la enzima, esencial para la catálisis actúa como nucleófilo y ataca
al aldehído para formar un tiohemiacetal.
1.-Hay una formación muy rápida de un carbanion en C2 facilitado por la presencia de una
base en el sitio catalítico de la enzima. El protón retirado puede recambiarse con el solvente,
de ahí que se conocen las constantes de velocidad de este proceso.
2.- Eliminación del grupo C3-OH, que es el paso limitante del proceso. Esta eliminación es
muy lenta a juzgarse por las pequeñas cantidades de OH que se recambian con el solvente.
En el mecanismo, se forma un complejo con M2+.
1.- Un oxígeno del grupo fosforilo del ADP ataca nucleofílicamente al fósforo del
FOSFOENOLPIRUVATO, formando un enol piruvato y ATP. En esta reacción, se conserva
la energía de la hidrólisis del FOSFOENOLPIRUVATO.
El ácido pirúvico puede seguir varios caminos metabólicos dependiendo de las condiciones
de la célula:
Cuando las condiciones anaeróbicas están presentes, se reduce para formar ácido
láctico. En las levaduras, existe otra vía metabólica que es la fermentación alcohólica, en la
que se produce etanol en vez de ácido láctico.