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08-Código Genético-Características y Desciframiento PDF
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DESCIFRAMIENTO
Una vez que Crick (1958) propuso la Hiptesis de la Secuencia ("existe una relacin entre la
ordenacin lineal de nucletidos en el ADN y la ordenacin lineal de aminocidos en los
polipptidos"), la comunidad cientfica la admiti y se plantearon dos preguntas:
Existe algn cdigo o clave que permite pasar de la secuencia de nucletidos en el ADN
a la secuencia de aminocidos en las protenas?
La primera pregunta conlleva el estudio del desciframiento del cdigo gentico y el estudio de
sus caractersticas. La segunda pregunta consiste en el estudio de los procesos genticos de la
sntesis de protenas: la transcripcin y la traduccin.
Las caractersticas del cdigo gentico fueron establecidas experimentalmente por Fancis
Crick, Sydney Brenner y colaboradores en 1961. Las principales caractersticas del cdigo
gentico son las siguientes:
Si cada grupo de tres nucletidos determina un aminocido. Teniendo en cuenta que existen
cuatro nucletidos diferentes (A, G, T y C), el nmero de grupos de tres nucletidos distintos
que se pueden obtener son variaciones con repeticin de cuatro elementos (los cuatro
nucletidos) tomados de tres en tres: VR4,3 = 43 = 64. Por consiguiente, existe un total de 64
tripletes diferentes, cifra ms que suficiente para codificar los 20 aminocidos distintos.
Las molculas encargadas de transportar los aminocidos hasta el ribosoma y de reconocer los
codones del ARN mensajero durante el proceso de traduccin son los ARN transferentes (ARN-
t). Los ARN-t tienen una estructura en forma de hoja de trbol con varios sitios funcionales:
Normalmente el ARN-t adopta una estructura de hoja de trbol plegada en forma de L o forma
de boomerang.
Los ARN-t suelen presentar bases nitrogenadas poco frecuentes como son la pseudouridina
(), metilguanosina (mG), dimetilguanosina (m2G), metilinosina (mI) y dihidrouridina (DHU,
UH2).
El que realiza el reconocimiento del codn correspondiente del ARN-m es el anticodn del
ARN-t y no el aminocido. Mediante un experimento se demostr que era posible transformar el
cisteinil-ARN-t mediante tratamiento con hidruro de nquel en alanil-ARN-t. Este tratamiento
convierte la cistena en alanina. De esta manera se consigui un ARN-t especfico de cisteina
que en lugar de llevar unida cisteina llevaba unida alanina. Cuando se empleo este ARN-t
hbrido para sintetizar protenas se pudo comprobar que en el lugar en el que deba aparecer
cisteina en la secuencia del polipptido apareca alanina. Por tanto, el que llevaba a cabo el
reconocimiento del codn del ARN-m era el anticodn del ARN-t y no el aminocido.
Algunos aminocidos pueden ser transportados por distintas especies moleculares (tipos)
de ARN transferentes (ARN-t) que contienen distintos anticodones.
Flexibilidad de la 3 base del anticodn, tambaleo: La tercera base del anticodn, la que ocupa
la posicin 5' no est especialmente confinada de forma que en algunos casos puede
emparejarse con distintas bases del codn. En la siguiente grfica se observa que cuando en la
posicin 5' del anticodn hay una G, esta guanina puede emparejarse con un uracilo (U) de la
posicin 3' del codn o con una citosina (C).
Flexibilidad de la tercera base del anticodn, tambaleo
En la siguiente tabla se indican tres ARN-t de serina que pueden leer cada uno de ellos dos
codones diferentes en el ARN-m. Estos tres ARN-t se denominan isoaceptores porque se unen
(aceptan) al mismo aminocido pero estn codificados por genes distintos.
Un nucletido solamente forma parte de un triplete y, por consiguiente, no forma parte de varios
tripletes, lo que indica que el cdigo gentico no presenta superposiciones. Por tanto, el cdigo
es no solapado. Wittmann (1962) induciendo mutaciones con cido nitroso en el ARN del virus
del mosaico del tabaco (TMV) pudo demostrar que las mutaciones habitualmente producan un
cambio en un solo aminocido. El cido nitroso produce desaminaciones que provocan
sustituciones de bases, si el cdigo fuera solapado y un nucletido formar parte de dos o tres
tripletes, la sustitucin de un nucletido dara lugar a dos o tres aminocidos alterados en la
protena de la cpside del TMV.
Diferencias entre un cdigo solapado y uno no Cdigo solapado: restricciones en la secuencia
solapado de aminocidos
Otra forma de comprobar que el cdigo es sin superposicin es que no hay ninguna restriccin
en la secuencia de aminocidos de las protenas, de manera, que un determinado aminocido
puede ir precedido o seguido de cualquiera de los 20 aminocidos que existen. Si dos codones
sucesivos compartieran dos nucletidos, cualquier triplete solamente podra ir precedido o
seguido por cuatro codones determinados. Por consiguiente, si el cdigo fuera superpuesto, un
aminocido determinado solamente podra ir precedido o seguido de otros cuatro aminocidos
como mucho.
Teniendo en cuenta que la lectura se hace de tres en tres bases, a partir de un punto de inicio
la lectura se lleva a cabo sin interrupciones o espacios vacos, es decir, la lectura es seguida
"sin comas". De manera, que si aadimos un nucletido (adicin) a la secuencia, a partir de ese
punto se altera el cuadro de lectura y se modifican todos los aminocidos. Lo mismo sucede si
se pierde (delecin) un nucletido de la secuencia. A partir del nucletido delecionado se altera
el cuadro de lectura y cambian todos los aminocidos. Si la adicin o la delecin es de tres
nucletidos o mltiplo de tres, se aade un aminocido o ms de uno a la secuencia que sigue
siendo la misma a partir del la ltima adicin o delecin. Una adicin y una delecin sucesivas
vuelven a restaurar el cuadro de lectura.
En la siguiente tabla se da un ejemplo con una frase que contiene solamente palabras de tres
letras. A partir de la adicin de una letra cambia la pauta de lectura y el significado de la frase,
lo mismo sucede cuando se pierde una letra. Una adicin y una delecin sucesivas recuperan
el significado de la frase. Una adicin de tres letras aade una palabra pero despus se
recupera la pauta de lectura y el sentido de la frase.
La mayora de los trabajos realizados por estos tres grupos de investigacin consistieron en
sintetizar ARN mensajeros (ARN-m) para utilizarlos posteriormente como mensajeros artificiales
en un sistema acelular de traduccin "in vitro". Estos sistemas acelulares de traduccin "in vitro"
procedan de la bacteria E. coli y contenan todo lo necesario para llevar a cabo la traduccin:
ribosomas, todos los ARN transferentes, aminocidos, enzimas, etc. Sin embargo, a estos
sistemas acelulares se les quitaban los ARN mensajeros de E. coli y se les aada un ARN
sintetizado artificialmente. En estos sistemas acelulares se sintetizaba un polipptido.
La puesta a punto de estas tcnicas requera poder sintetizar ARN-m de forma enzimtica
(grupo de Ochoa) o de forma qumica (grupo de Khorana) y conseguir un sistema acelular
estable para sintetizar protenas (grupo de Nirenberg).
Utilizacin de homopolmeros.
Uso de copolmeros.
Matthei y Nirenberg (1961) consiguieron sintetizar polipptidos "in vitro" aadiendo un ARN
sinttico de secuencia conocida a un sistema acelular estable de traduccin. Usando la
Polirribonucletido fosforilasa sintetizaron poli-uridlico (poli-U: UUUUUUUUUUUUUU...).
Cuando emplearon este ARN sinttico en su sistema acelular de traduccin daba lugar a la
formacin de un polipptido que solamente contena el aminocido fenilalanina (Poli-
fenilalanina: phe-phe-phe-phe-..). Por tanto, el triplete UUU codificaba para fenilalanina (phe).
Tambin comprobaron que el ARN snttico Poli C (Poli-citidlico: CCCCCCCCCC....) daba
lugar a un polipptido que contena solamente prolina (Poli-prolina: pro-pro-pro-pro-pro-...), por
tanto, el codn CCC significaba prolina (pro).
Poco tiempo despus, Ochoa sintetiz Poli-adenlico (Poli-A: AAAAAAAAA....) y observ que el
polipptido que apareca solamente tena el aminocido lisina (Poli-lisina: lys-lys-lys-lys-....). Por
consiguiente el triplete AAA codificaba para el aminocido lisina (lys). Tambin corrobor que el
Poli-C daba lugar a Poli-prolina. El ARN Poli-guanlico no produca protena alguna,
probablemente debido a que adquira una estructura terciara helicoidal que impeda su
traduccin a protena.
Triplete Aminocido
CCC prolina
UUU fenilalanina
AAA lisina
USO DE COPOLMEROS
El siguiente paso fue la utilizacin de copolmeros, es decir, de ARN sintticos que contenan
ms de un ms de un ribonucletido distinto. Para ello emplearon la Polirribonucletido
fosforilasa y pusieron en el medio dos ribonuclesidos distintos. Por ejemplo, U y G, de manera
que haba 5 veces ms U que G en el medio (5U:1G). Debido a que el enzima toma los
ribonuclesidos difosfato del medio al azar, la probabilidad de que tome un U del medio es 5/6,
mientras< que la probabilidad de que tome una G es 1/6. El ARN sinttico formado presentaba
una secuencia al azar de uracilos y guaninas y aparecan en l ocho tripletes diferentes con las
siguientes probabilidades:
Cuando se analiz el polipptido que se sintetizaba con este mensajero sinttico, se observ
que contena fenilalanina (phe), cisteina (cys), valina (val), glicina (gly) y triptfano (trp).
Tomando como valor 100 el de el aminocido ms frecuente, cys y val presentaban un valor de
20 mientras que trp y gly mostraban un valor de 4 a 5. Se confirmaba que UUU significaba
fenilalanina y se deduca que 2U y 1G (UUG, UGU y GUU) codificaban para cistena y valina.
Tambin se deduca que 1U y 2G (UGG, GUG y GGU) codificaban para triptfano y glicina. Sin
emabrgo, no era posible asignar un triplete concreto para cistena y valina, o para triptfano y
glicina. Parece raro, que en estos experimentos no detectaran el aminocido leucina (leu) que
esta codificado por el triplete UUG, tampoco dedujeron que el aminocido valina estaba
codificado por 1U y 2 G (GUG). Uno e los problemas, de estos experimentos radica en asignar
el valor 100 al aminocido ms frecuente y comparar las proporciones de aminocidos
obtenidas de esta manera con las de los distintos tripletes del mensajero, ya que el aminocido
ms frecuente puede estar codificado por ms de un triplete. Oto inconveniente es que los
mensajeros sintticos producidos no presenten la frecuencia de codones esperada por azar.
Este tipo de experimentos fueron realizados por los grupos de Nirenberg y de Ochoa y no
rindieron grandes resultados.
Utilizando el Poli-UCde 116 residuos de longitud, ARN mensajero sinttico en el que se repite
muchas veces seguidas el dinucletido UC (UCUCUCUCUCUCUC...) obtuvieron un polipptido
que contena los residuos de serina y leucina en secuencia alternada (ser-leu-ser-leu-ser-leu-
ser-leu-....). El Poli-UC contiene dos tripletes diferentes, UCU y CUC, por consiguiente uno de
ellos codifica serina y el otro leucina, pero no se puede determinar cul a cul.
Tambin se emplearon los mensarejos sintticos Poli-AC, Poli-AG y Poli-UG que codificacban
para los siguientes aminocidos:
En esta tcnica se utilizan ARN mensajeros sintticos de secuencia conocida con la siguiente
estructura: los grupos de Khorana y Nirenberg emplearon trinucletidos, mientras que el equipo
de Matthei utilizaba oligonucletidos del tipo ABCCCCCCCCCCC.... (el tercer nucletido estaba
repetido 100 veces). En este ltimo caso solamente se analiza en primer triplete, ABC.
En todos los casos, en lugar de analizar los polipptidos sintetizados, se analiza la especificidad
con que el ARN transferente (ARN-t) con o sin su aminocido correspondiente se incorpora al
ribosoma. Dicha especificidad viene determinada por la secuencia de ribonucletidos del ARN-
m sinttico empleado.
Con este sistema fue posible descifrar todos los tripletes que an no haban sido descifrados.
Las tcnicas de ingeniera gentica que permiten introducir ADN de un organismo en otro
de manera que el organismo receptor sintetiza las protenas del organismo donante del
ADN. Por ejemplo, la sntesis de protenas humanas en la bacteria E. coli.
SEGUNDA BASE
U C A G
P UUU Phe UCU Ser UAU Tyr UGU Cys U T
UUC Phe UCC Ser UAC Tyr UGC Cys C
R U E
UUA Leu UCA Ser UAA FIN UGA FIN A
I UUG Leu UCG Ser UAG FIN UGG Trp G R
CUU Leu CCU Pro CUA His CGU Arg U
M C
CUC Leu CCC Pro CAC His CGC Arg C
C
E CUA Leu CCA Pro CAA Gln CGA Arg A E
CUG Leu CCG Pro CAG Gln CGG Arg G
R R
AUU Ile ACU Thr AAU Asn AGU Ser U
A AUC Ile ACC Thr AAC Asn AGC Ser C A
A
AUA Ile ACA Thr AAA Lys AGA Arg A
AUG Met ACG Thr AAG Lys AGG Arg G
B GUU Val GCU Ala GAU Asp GGU Gly U B
El cdigo gentico nos indica que aminocido corresponde a cada triplete o codn del ARN
mensajero.
El triplete de iniciacin suele ser AUG que codifica para Formil-metionina. Tambin
pueden actuar como tripletes de iniciacin GUG (Val) y UGG (Leu) aunque con menor
eficacia.
Existen tres tripletes sin sentido o codones de terminacin (FIN) que no codifican para
ningn aminocido: UAA (ocre), UAG (ambar) y UGA (palo).
Significado en Significado en
Organismo Codn
Cdigo Nuclear Cdigo Mitocondrial
Todos UGA FIN Trp
Levadura CUX Leu Thr
Drosophila AGA Arg Ser
Humao, bovino AGA, AGC Arg FIN
Humano, bovino AUA Ile Met (iniciacin)
Ratn AUU, AUC, AUA Ile Met (iniciacin)