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CÓDIGO GENÉTICO

INTRODUCCIÓN

¿Cómo está codificada la


información genética?

¿Cómo se produce la
transferencia del DNA al RNA
definiendo así el proceso de
Transcripción?
Fundamentos
La información genética se almacena en el DNA utilizando un código de tripletes.

El código genético se transfiere inicialmente del DNA al RNA a través del proceso
de Transcripción.

Una vez transferido al RNA, el código genético se presenta en «codones» o


«tripletes» (conformados por cualquier combinación de tres ribonucleótidos).

Usando cuatro letras, tomadas de tres en tres, las 64 secuencias de tripletes


pueden codificar cualquiera de los 20 aminoácidos presentes en la naturaleza o
señales especiales.

Existen codones especiales que representan señales de inicio o de paro del


proceso de Traducción.
Representación del código
genético
INTRODUCCIÓN
Una cuestión central es como se puede decodificar en una proteína una
información almacenada en forma de ácido nucleico.

¿Cómo se produce la transferencia de información?

Investigaciones analíticas
ingeniosas establecieron que el
código genético está escrito en
unidades de tres letras.
INTRODUCCIÓN
Los ribonucleótidos presentes en el RNA son el «reflejo» de la información
almacenada en los genes.

Cada palabra escrita en un código de tripletes dirige la incorporación de un


aminoácido específico durante la síntesis de la proteína.

Como puede predecirse del proceso de replicación, la transcripción o formación


del RNA también es un proceso complejo que depende de una enzima
polimerasa y otra colección de enzimas y elementos soporte.
El código genético presenta una serie
de características
1. El código genético esta escrito de manera lineal, utilizando como
«letras» las bases ribonucleotídicas que componen al RNA.

2. La secuencia ribonucleotídica proviene de las bases nucleotídicas


complementarias del DNA.

3. Cada palabra del RNA contiene tres letras ribonucleotídicas denominados


«codones».

4. Cada codón o grupo de tres ribonucleótidos específica un aminoácido.

5. El código no tienen ambigüedades, en el sentido de que cada triplete


específica a un único aminoácido.

6. Es degenerado
¿Cómo está codificada la información
genética
El código genético está escrito en unidades de tres letras (codones).

Cada palabra escrita en un código de tripletes dirige la incorporación de un


aminoácido específico durante la síntesis de una proteína (traducción).
Los patrones funcionales básicos del
código
A finales de 1950 aun no quedaba claro que el RNAm era el intermediario entre el DNA
y las proteínas.

Fue hasta 1961 que Francois Jacob y Jacques Monod postularon la existencia del
RNAm. Una vez descubierto, quedo claro que aunque la información genética se
almacena como DNA, el código que se transcribe a proteínas es el RNAm.

¿Cómo únicamente cuatro letras, los cuatro nucleótidos, podían especificar 20


palabras, los aminoácidos?
Degeneración del código
genético
Los aminoácidos están especificado por dos, tres, cuatro o incluso hasta seis
codones diferentes (en algunos casos, como la Serina, Arginina y Leucina)

Solo el Triptófano y la Metionina están codificados por un solo codón.

Patrón de degeneración: Quiere decir que muy a menudo dentro del


conjunto de codones que especifican un mismo aminoácido, las
primeras dos letras son las mismas y solo difieren en la tercera.

Ejemplo: Hay cuatro codones que especifican a la Valina (GUU, GUC,


GUA, GUG).
Hipótesis del tambaleo (Crick – 1966)
Esta hipótesis de Crick predice que los dos primeros ribonucleótidos del triplete
son más importantes que el tercer miembro para «atraer» al RNA de
transferencia (RNAt) correcto.

Crick propuso que el puente de hidrógeno en la tercera posición de la interacción


codón – anticodón estaría menos restringido, por lo que no necesita adherirse
tan específicamente según las reglas del emparejamiento de bases en esta
tercera posición.
Hipótesis del tambaleo (Crick – 1966)
U – emparejaría con una A o una G
G – emparejaría con una U o una C

Aplicando estas reglas del tambaleo se necesita como mínimo de 30 tipos


diferentes de RNAt para proveer a los 61 tripletes que codifican aminoácidos.

El tambaleo se puede considerar como medida de economía, siempre y


cuando no se comprometa la fidelidad de la traducción. Estimaciones
actuales indican que hay:

30-40 tipos de RNAt en bacterias

50 tipos de RNAt en animales y vegetales


La naturaleza ordenada del
código
Establece que aminoácidos químicamente similares comparten una o
dos bases en los diferentes tripletes que los codifican. Por ejemplo:

U o C en la segunda posición de aminoácidos hidrofóbicos (ejemplo


de ello son la valina y la alanina).

Aminoácidos cargados positivamente: Lisina (AAA y AAG), cambiando


solo la letra central de ellos de A a G (AGA y AGG) se específica la
arginina, otro aminoácido también cargado positivamente.
EXPRESIÓN GÉNICA – Código genético

Polares (Hidrófilos): Ser, Thr, Asn, Gln, Tyr

Apolares (Hidrófobos): Ala, Cys, Val, Leu,


Ile, Pro, Met, Phe, Trp y Gly.

Ácidos (carga negativa): Glu, Asp

Básicos (carga positiva):


Lys, His, Arg

Arómáticos: Phe, Tyr, Trp y Pro.


La naturaleza ordenada del
código
El resultado final de la naturaleza ordenada del código es que
amortigua el efecto potencial de las mutaciones sobre la función de
las proteínas. Mientras que muchas mutaciones en la segunda base
del triplete producen el cambio de un aminoácido por otro, el
cambio es a menudo por una aminoácido con propiedades químicas
parecidas.

En estos casos la función de la proteína podría alterarse de manera


imperceptible.
Iniciación, terminación y
supresión
La iniciación de la síntesis proteica es un proceso altamente específico.

En bacterias el aminoácido inicial que se inserta en todas las cadenas


polipeptídicas es una forma modificada de la metionina (N-
formilmetionina o fmet).

Un único codón AUG, codifica la metionina (codón de inicio). Pero


cuando un AUG está en el interior de un RNAm, se inserta metionina
no formilada en la cadena polipeptídica.

En bacterias cuando se completa la síntesis de la proteína el grupo


formil se elimina de la metionina inicial. En eucariotas el aminoácido
inicial en la síntesis de proteínas es una metionina no formilada.
Iniciación, terminación y supresión
Iniciación (codón de inicio)
Bacterias- (AUG) N-formil metionina
Eucariotas (AUG) Metionina

Terminación (codones de paro)

UAG No codifican para ningún aminoácido


UAA No son reconocidos por ningun RNAt
UGA

Terminación anticipada/prematura o «mutación sin sentido»: Es el resultado de


presentarse cualquiera de estos tres codones en la secuencia que está siendo
utilizada como molde (RNAm).

Mutaciones supresoras: Suprime la terminación. Hacen que la señal de terminación


de la cadena sea leída como un codón «con sentido». Aunque puede insertar un aa
diferente al de la pt silvestre puede o no alterar drásticamente la función proteica.
El código genético se ha confirmado en
estudios del fago MS2 (1972)
Aspectos del código genético:
- Formato por tripletes
- Degenerativo
- Inequívoco
- Sin signos de puntuación internos
- Puntuación específica al inicio y al final

Principios confirmados mediante el análisis detallado del


bacteriofago de RNA MS2 (Trabajo realizado por Walter Fiers y
colaboradores).

Bacteriofago que infecta a E. coli. Su ácido nucleíco es RNA y


contiene 3500 ribonucleótidos que codifican para solo tres
genes.
El código genético se ha confirmado en
estudios del fago MS2 (1972)
La función de los tres genes que codifican el RNA de MS2 son:
- Cubierta proteica
- Replicasa dirigida por RNA
- Proteína de maduración

Estudios con este fago permitieron comparar la naturaleza química del gen
con la de la proteína observando una relación de colinealidad.

La secuencia lineal de nucleótidos (codones) se corresponde con absoluta


precisión con la secuencia lineal de los aminoácidos de la proteína.

El análisis muestra claramente que el código genético en los virus es


idéntico al establecido en sistemas bacterianos. Otras pruebas
sugieren que el código es también idéntico en Eucariotas.
Introducción al control génico

• Los distintos grupos celulares de un organismo


pluricelular contienen el mismo ADN.
• El ADN de un organismo codifica todas las moléculas
de ARN y proteína necesarias para la construcción de
las células.
Control génico
Distintos tipos celulares sintetizan distintos conjuntos de
proteínas.

1. Muchos procesos son comunes a todas las células.


2. En las proteínas comunes se detectan pocas
diferencias de expresión.
3. Algunas proteínas son abundantes en células
especializadas, pero no se detectan en ningún otro
tipo celular.
Control génico
Una célula puede cambiar la expresión de sus genes como
respuesta a señales externas. Ejemplo: Células de hígado
expuestas a la hormona glucocorticoide.

Tipo celular Respuesta


Células de higado Producción de glucosa a partir de
aminoácidos.
Se induce la producción de la enzima
tirosina aminotransferasa
Adipocitos Reducen producción de tirosina
aminotransferasa
Otros tipos celulares No responden de ninguna manera
Control génico

La expresión génica se puede regular en muchas etapas desde el


ADN hasta las proteínas.

1. Control transcripcional: regulación del momento y frecuencia de


la transcripción de genes concretos.
2. Procesamiento del ARN: modo de maduración o procesamiento
de los transcritos primarios.
3. Transporte de ARN: selección de los RNAm maduros que serán
transportados al citoplasma.
4. Control traduccional: selección de los RNAm citoplásmicos que
serán traducidos por los ribosomas.
5. Control de la degradación del RNAm
6. Control de la actividad proteica: activación, desactivación o
ubicación de las proteínas ya sintetizadas.
Control génico

La expresión génica se puede regular en muchas etapas


desde el ADN hasta las proteínas.
Características del ARN

• Macromolécula polinucleotídica de una sola cadena.


• Sigue la dirección en sentido 5’ a 3’.
• Se encuentra constituido por ribonucleotidos
conformados unidos por enlaces fosfodiéster:
Las bases nitrogenadas: adenina, uracilo, guanina
y citosina.
Un azúcar llamado ribosa y
Un grupo fosfato.
Características del ARN

• Tipos de ARN

RNA mensajero (RNAm): 3-5% del RNA total


RNA de transferencia (RNAt): 5-7% del RNA total
RNA ribosomal: 85-90% del RNA total
RNA pequeños (núcleo, nucléolo o citoplasma): 1% del RNA total
La transcripción en procariotas presenta diferencias
con respecto a eucariotas

En ambos casos hay diferencias importantes.

1. En eucariotas la transcripción se produce dentro del núcleo y es dirigida por


tres tipos diferentes de RNA polimerasas. En procariotas, el transcrito no se
puede asociar a los ribosomas antes de concluir la transcripción, ya que el
RNAm debe salir del núcleo al citoplasma.

2. La iniciación de la transcripción de los genes eucarióticos precisa que la


compacta fibra de cromatina caracterizada por el enrollamiento de los
nucleosomas, se desenrolle y el DNA sea accesible a la RNA polimerasa y
otras proteínas reguladoras. Esta transición se denomina remodelación de la
cromatina.
La transcripción en eucariotas presenta diferencias con
respecto a eucariotas
3. El inicio y regulación de la transcripción comprenden una mayor interacción entre
secuencias de DNA corriente arriba que actúan en cis y factores proteicos que
participan en la estimulación e inicio de la transcripción actuando en trans. Además
de los promotores también hay otras unidades denominadas intensificadores que
pueden estar rio arriba o rio abajo.
La transcripción en eucariotas presenta
diferencias con respecto a eucariotas
4. Se requiere la maduración del RNAm eucariotico:

a. Adición de una caperuza en el extremo 5’


b. Adición de una cola de poli-A en el extremo 3’
La transcripción en eucariotas presenta diferencias con
respecto a eucariotas
4. Se requiere la maduración del RNAm eucariotico:

c. Se produce corte y empalme en las secuencias internas de los RNAm


inmaduros (eliminación de los intrones).
Introducción
La traducción es el proceso mediante el cual se sintetizan las diferentes
proteínas que tiene un organismo o que requiere en un momento específico,
estas vienen determinadas por el RNAm presente en un momento dado en
las células.
La secuencia de ribonucleótidos del RNA mensajero (RNAm) refleja la
información almacenada en el DNA y se corresponde con la secuencia de
aminoácidos de la proteína.

Elementos que intervienen en la traducción:

- RNA mensajero (RNAm)


- RNA de transferencia (RNAt) - Aminoácidos
- Ribosoma
- Factores de Traducción
La traducción del RNAm depende de
los ribosomas y los RNAt

Comparaciones de tamaño entre los principales elementos


que conforman la maquinaria de traducción.
Elementos constituyentes de los ribosomas
(partículas ribonucleoproteicas)

Los ribosomas son partículas ribonucleoproteícas. Conformadas por


RNAr y proteínas r. Están conformados por dos subunidades: pequeña
y grande.
RNA de Transferencia

Modelo bidimensional Modelo tridimensional


o de hoja de trébol
RNA de Transferencia
Antes de poder ejercer su función en el proceso de Traducción, el RNAt
debe «cargarse» o unirse químicamente a su respectivo aminoácido.

Carga o aminoacilación

(Aminoacil-RNA de transferencia sintetasas)


TRADUCCIÓN
Elementos que intervienen en el proceso
TRADUCCIÓN – Elementos que intervienen en
el proceso «Aminoácidos»

Polares (Hidrófilos): Ser, Thr, Asn, Gln, Tyr

Apolares (Hidrófobos): Ala, Cys, Val, Leu, Ile, Pro,


Met, Phe, Trp y Gly.

Ácidos (carga negativa): Glu, Asp

Básicos (carga positiva):


Lys, His, Arg

Arómáticos: Phe, Tyr, Trp y Pro.


TRADUCCIÓN
Iniciación (procariotas)
La mayoría de los ribosomas celulares que no están participando en el
proceso de traducción se encuentran disociados en su subunidad grande
y pequeña.

PASO 1. Para dar inicio a proceso la subunidad ribosómica pequeña se


une a varios factores de iniciación y este complejo posteriormente se une
al RNAm.

En bacterias, en esta unión (subunidad pequeña + RNAm) participa una


unión de hasta 6 ribonucleótidos que se encuentra antes del codón de
inicio (AUG-Metionina) del RNAm. Esta secuencia se denomina Shine
Dalgarno (AGGAGG) y se empareja con una región del RNAr 16S de la
subunidad ribosómica pequeña, facilitando la Iniciación.
La iniciación requiere apareamiento de bases
entre el RNAm y el RNAr
El sitio de unión al ribosoma presente en
el RNAm está formado por:

1. El codón de inicio
2. Secuencia Shine Dalgarno, hexámero
ubicado rio arriba del codón de inicio
5’ AGGAGG 3’
3. Esta secuencia es complementaria a
una región muy conservada del RNAr
16s.

El codón AUG es precedido por una secuencia


shine-dalgarno.
TRADUCCIÓN
Iniciación (procariotas)

PASO 1. El RNAm se une a la subunidad pequeña junto con los


factores de iniciación (FI1, FI2 y FI3)
TRADUCCIÓN
Iniciación (procariotas)
PASO 2. Una vez la subunidad pequeña del ribosoma junto con los
factores de iniciación 1, 2 y 3 están unidos al RNAm se une el RNAt-
formilmetionina cargado a la subunidad pequeña, en respuesta al triplete
AUG en el RNAm. Una vez ocurre la unión de este primer RNAt el FI3 se
libera.
Un RNAt especial da inicio a la síntesis proteica
en bacterias

N-Formil-metionil-RNAt (fMet-RNAt) producido por


la formilación del metionil-RNAt
Un RNAt especial da inicio a la síntesis proteica
en bacterias
La síntesis inicia con el codón o triplete AUG (GUG o UUG también pueden ser
codones de inicio en bacterias)
Este triplete puede aparecer al inicio de la traducción (formilado) o durante la
elongación de la cadena polipeptídica (aminoacilado)
El grupo NH2 del RNAt iniciador bacteriano está formilado.

N-Formil-metionil-RNAt (fMet-RNAt) producido por


la formilación del metionil-RNAt
Características especiales del
fMet-RNAt
TRADUCCIÓN
Iniciación (procariotas)
PASO 3. Una vez conformado el «complejo de iniciación» del paso 2
se une la subunidad ribosómica grande. Liberándose posteriormente
los factores de iniciación que aún permanecían unidos.
Función de los factores de inicio de la Traducción
(FI) en procariotas
FI 1 – Se une al complejo evitando
ingresar RNAt al sitio A y la unión de
la subunidad grande.

FI 2 – Permite la unión del RNAt


formilado especial.

FI 3 – Permite que las subunidades


pequeñas se unan al sitio de unión
al ribosoma del RNAm.

Todos estos procesos ocurren con


gasto de energía

Esquema de formación del complejo de iniciación y


los elementos involucrados
Iniciación de la traducción en eucariotas
El «rastreo» que realiza la subunidad
pequeña a lo largo del RNAm eucariotico
comprende:

1. Reconocimiento del casquete 5’


2. Migrar a lo largo del RNAm
3. Desestabilizar orquillas (estructura
secundaria) para rastrear.
4. Hallazgo del codon AUG en el
«contexto» adecuado -4 y +1. (A o G y
G, respectivamente)
TRADUCCIÓN - Elongación
Una vez ensambladas las dos subunidades del ribosoma, se forman tres
sitios. Los sitios formados son los siguientes:
P – Peptidil A – Aminoacil E – (Exit), salida

El RNAt de iniciación cargado se une al sitio P. El sitio A se encuentra así


libre para recibir al siguiente RNAt que siga en la cadena, luego del codón
de inicio AUG.

El alargamiento de la cadena peptídica o proteína en crecimiento se


denomina elongación.

La peptidil transferasa cataliza la formación del enlace peptídico.

La aminoacil RNAt sintetasa cataliza la carga o incorporación del


aminoácido correspondiente a su respectivo RNAt.
Enlace peptídico – Extremos amino y carboxilo
en una proteína
El enlace peptídico es un
enlace entre el grupo amino
(NH2) de un aminoácido y el
grupo carboxilo (COOH) de
otro.

Este enlace peptídico implica


la liberación de una molécula
de agua y la formación de un
enlace covalente CO-NH.
Enlace fosfodiéster – Extremos 5’ y 3’ de un
ácido nucleico
Un enlace fosfodiéster es un enlace
covalente que se produce entre el
grupo hidroxilo (OH-) en el carbono 3’
y un grupo fosfato (PO43−) en el
carbono 5’ del nucleótido entrante,
formándose así un doble enlace éster.

En esta reacción se libera una


molécula de agua y se forma un
dinucleótido.
Enlace peptídico
TRADUCCIÓN
Elongación (procariotas)

PASO 1. El segundo RNAt cargado entra en el sitio A con la ayuda de


EF-Tu, empezando el primer paso de elongación.
TRADUCCIÓN – Elongación (procariotas)

PASO 2. Se forma el enlace peptídico, el RNAt sin carga se mueve al sitio


E y después sale del ribosoma; el RNAm se ha translocado tres bases hacia
la izquierda y el RNAt que lleva el dipéptido se desplaza al sitio P.
TRADUCCIÓN – Elongación (procariotas)

• PASO 3. Se completa el primer paso de elongación. El sitio A queda


libre para recibir al siguiente RNAt.
TRADUCCIÓN – Elongación (procariotas)

• PASO 4. El tercer RNAt ahora entra al sitio A por EF-Tu y empieza el segundo paso
de elongación.

• PASO 5. Se forma un tripéptido y el siguiente RNAt ya sin aminoácido sale por el


sitio E del ribosoma.

• PASO 6. Luego de repetirse los anteriores pasos una y otra vez se sintetiza la
cadena polipeptídica que sale del ribosoma.
Función de FI2 y FE-Tu

El FI 2 coloca el RNAt formilado en el sitio P e


impide ocupar el sitio A por otro RNAt,
asegurando el complejo de inicio.

Al contrario FE-Tu coloca los aminoacil-RNAt en


el sitio A

• Finalización de la iniciación e inicio de la elongación.


Translocación del Ribosoma

• TRANSLOCACIÓN: Proceso mediante el cual el ribosoma se desplaza un


triplete a lo largo del mensajero.
La elongación y translocación ocurren
alternativamente

• La unión de los factores FE-Tu y EF-G se


alterna conforme los ribosomas aceptan
nuevos aminoacil-RNAt, forman los
enlaces peptídicos y se transfieren a
otra posición.

Traducción - Terminación

• La terminación de la síntesis proteica está señalada por tres tripletes o


codones de terminación (también se les denomina codones sin sentido)
que llegarán al sitio posicionarse en el sitio A del ribosoma.

• Estos codones no especifican ningún aminoácido por lo que no atraen al


sito A a ningún RNAt cargado.

• El codón de terminación señala la acción de factores de liberación


(también se pueden llamar factores de terminación) que cortan la cadena
polipeptídica que lleva el RNAt terminal liberándola del complejo.
Posterior a lo cual, se libera el RNAt que aún queda y se disocian las
subunidades ribosómicas.
Traducción - Terminación
La síntesis proteínica termina con tres
codones
• Los codones UAA, UAG y UGA y son reconocidos por factores de liberación de proteínas y
no por aminoacil-RNAt.
• Se utilizan con las frecuencias relativas UAA>UGA>UAG.
• Los factores de liberación pueden ser
• Clase 1: Responden a codones de terminación específicos e hidrolizan la ligadura
polipéptido-RNAt
• Clase 2: Asisten a los FL clase 1 y requieren de GTP para ser activos.

Factores de inicio, elongación,


translocación, liberación e incluso de
reciclaje del ribosoma tienen formas
moleculares que les permiten unirse al
mismo sitio ribosómico.
Factores de liberación en procariotas
• Clase 1
• Específicos para secuencias diferentes
• RF1 Reconoce codones UAA y UAG
• RF2 Reconoce codones UGA y UAA
• Clase 2
• RF3-GDP (no activo) – RF3-GTP (activo) Libera a RF1 o RF2

Factores de inicio, elongación,


translocación, liberación e incluso de
reciclaje del ribosoma tienen formas
moleculares que les permiten unirse al
mismo sitio ribosómico.
Los componentes del ribosoma tienen importantes
funciones
• Las interacciones en que está implicado el RNAr son claves para la función del
ribosoma. Todas las proteínas ribosómicas se encuentran en contacto con el
RNAr.
Ejemplo en procariotas
• RNAr 16S. Permite que la subunidad 30S pequeña interactúe con la grande 50S y
con los anticodones de los aminoacil-RNAt.
• RNAr 23S. Tiene actividad peptidil-transferasa.

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