FUNDACION UNIVERSITARIA SAN MARTIN

TALLER REPLICACION DE ADN

DANIEL ARGOTA

FAJID BAYTER

LUIS FERNANDO ORTIZ

PROFESOR

FEDERICO VASQUEZ NAVARRO

MEDICINA

NOVIEMBRE DEL 2018

Secuencia de ARN:

AUG GGU AUU GUU UGU GAA CAA GCU UCU CUU GAU AGA UGU GUU CCU AAA UUU UAU ACU
CUU CAU AAA AAU UGA

Secuencia de ADN:

TAC CCA TAA CAA ACA CTT GTT CGAN AGA GAA CTA TCT ACA CAA GGA TTT AAA ATA TGA GAA
GTA TTT TTA ACT

2. Explique qué consecuencias trae la asociación intracatenaria parcial y las asociaciones

intercatenarias (estructuras de pasador o hairpin) en el ARN y su estructura secundaria y
terciaria.

Da origen a las diferentes formaciones del ARN, por ejemplo el ARN mensajero es de cadena lineal,
el ARN de transporte posee estructura secundaria y el ARN ribosomal es el más complejo, posee
subunidades mayores y menores, lo que les da funciones específicas a cada uno.
Así, la estructura secundaria, está dada por el apareamiento de secuencias complementarias en la
misma cadena de ARN (asociación intracatenaria parcial) o por asociaciones intercatenarias, en el
caso de los ARN de doble cadena de ciertos virus

Las estructuras de pasador (hairpin), que da origen la complementariedad de las bases en el RNA

Estructura terciaria del RNA, No siempre se forma, sólo surge cuando las condiciones celulares
propician la interacción entre bases nitrogenadas de diferentes regiones de una misma molécula
de ARN. Los ARN de transferencia (ARNt) forman una estructura terciaria característica: en
disolución están plegados en forma de "L" compacta estabilizada por apareamientos de bases
convencionales y por interacciones
entre las bases de más de dos nucleótidos, como los tripletes de bases

Se refiere al plegamiento sobre la estructura secundaria formando hélices mediante interacciones

en el espacio intramolecular; estas interacciones pueden ser apareamientos de bases diferentes a
los propuestos por watson y Crick .

3. Defina y diferencie los siguientes elementos para conocer los elementos conceptuales básicos
de la traducción.

Codón de inicio, codones de terminación, aminoacil-ARNt, Aminoacil-ARNt sintetasa, Sitios E, P, A del

ribosoma, Shine-Dalgarno, secuencia Kozak, fenómeno de bamboleo.

Codón de inicio

El codón de inicio de la traducción o codón de inicio es una secuencia de ARN de tres nucleótidos
(es decir, un codón) que indica a la maquinaria celular el lugar de la cadena en el que comienza la
traducción del ARN mensajero. En el ADN se encuentra codificado en el triplete «TAC» (timina-
adenina-citosina), mientras que, en el ARN mensajero, queda como «AUG» (adenina-uracilo-
guanina). No obstante, en genética por convenio se hace referencia a la hebra "codificante" al
hacer referencia a la secuencia análoga en el ADN, por lo que es frecuente encontrar en
bibliografías que el codón de inicio se codifica en el ADN como ATG (complementario del TAC de la
hebra molde que se transcribe). La causa de que se haga referencia a la hebra "codificante" es que
es idéntica a la que se transcribirá a partir de la no codificante (TAC), también llamada hebra
molde, transcrita o "no codificante", solo cambiando timinas por uracilos.

Codón de terminación

Se denomina codón de terminación', codón de parada, codón sin sentido o codón stop a aquel
codón que no determina ningún aminoácido según el código genético. Su función es acotar el
mensaje cifrado por el ADN que dará lugar al ARN mensajero; de este modo, limita en el extremo
3' el marco abierto de lectura de los genes.

Existen tres codones de terminación, que reciben distintos nombres. «UAG», el primero
descubierto, se conoce como «codón ámbar»; «UGA», como «codón ópalo»; y «UAA», como
«codón ocre»

Su mecanismo de funcionamiento es el siguiente: cuando el ribosoma llega a uno de los codones

de paro, entra al sitio A ribosomal un factor de terminación (RF1 o RF2 en bacterias, eRF en
eucariotas) que impide la entrada de un nuevo ARNt, por lo que al aminoácido anterior ya no se le
puede unir ninguno más y se libera, junto con todo el resto del péptido del que forma parte.

Aminoacil-ARNt

Un aminoacil-ARNt (también citado a veces como aa-ARNt o ARNt cargado) es un ARN de

transferencia al cual se encuentra químicamente unido un aminoácido. En los seres vivos este
aminoácido coincide con el anticodón expuesto por el ARNt.

El aa-ARNt, junto con algunos factores de elongación, llevan el aminoácido hasta el ribosoma para
su incorporación a la cadena polipeptídica que está siendo producida.

Un aminoácido específico se carga a cada tipo de ARNt por medio de una aminoacil ARNt
sintetasa. Esta especificidad es crucial, ya que es la que asegura que sólo un aminoácido en
particular haga juego con su respectivo anticodón, ya que luego la coincidencia entre este
anticodón con el ARNm es la que se utiliza para la síntesis de proteínas.

Debido a la degeneración del código genético, puede haber múltiples ARNt que posean el mismo
aminoácido, pero diferentes codones. Estos ARNt diferentes son llamados isoaceptores. Bajo
ciertas circunstancias, se puede producir la carga de un aminoácido incorrecto en un determinado
ARNt, resultando en un ARNt mal cargado o incorrectamente aminoacilado. Este ARNt
incorrectamente cargado debe ser hidrolizado para prevenir una síntesis de proteína incorrecta.

Aminoacil ARNt sintetasa

Una aminoacil-ARNt sintetasa (aaRS) es una enzima que cataliza la esterificación de un aminoácido
específico o su precursor con uno cualquiera de sus ARNt afines que resulten compatibles para
formar un aminoacil-ARNt. A veces se denomina "carga" a este proceso de conjugación del ARNt
con el aminoácido. Una vez que el ARNt se ha cargado, un ribosoma puede transferir el
aminoácido desde el ARNt a un péptido en crecimiento de acuerdo al código genético.

Secuencia Kozak

La secuencia de Kozak es una secuencia de ARNm que facilita el reconocimiento de la secuencia de

iniciación (AUG) durante el proceso de traducción en los eucariontes.

Fue descripta por Marilyn Kozak como «(5')ACCAUGG(3')». La A que precede a la secuencia AUG y
la G ubicada en la última posición determinan la eficiencia de la iniciación de la traducción.

Fenómeno de bamboleo

Se pueden formar pares de bases atípicos entre los nucleótidos que no son A-U y G-C, en la tercera
posición de un codón. Este fenómeno se conoce como bamboleo.

La formación de pares por bamboleo no sigue las reglas normales, pero sí tiene sus propias reglas.
Por ejemplo, una G en un anticodón se puede aparear con una C o U (pero no una A o G) en la
tercera posición del codón, como se muestra a continuación

Reglas como esta aseguran que los codones se lean correctamente a pesar del bamboleo
4. Explique brevemente los eventos clave de la iniciación, elongación y terminación de la
traducción.

 La iniciación

En la iniciación, el ribosoma se ensambla alrededor del ARNm que se leerá y el primer ARNt (que
lleva el aminoácido metionina y que corresponde al codón de iniciación AUG). Este conjunto,
conocido como complejo de iniciación, se necesita para que comience la traducción.

 La extensión de la cadena: elongación

La elongación es la etapa donde la cadena de aminoácidos se extiende. En la elongación, el ARNm

se lee un codón a la vez, y el aminoácido que corresponde a cada codón se agrega a la cadena
creciente de proteína.

Cada vez que un codón nuevo está expuesto:

Un ARNt correspondiente se une al codón

La cadena de aminoácidos existente (polipéptido) se une al aminoácido del ARNt mediante una
reacción química.

El ARNm se desplaza un codón sobre el ribosoma, lo que expande un nuevo codón para que se lea.

Durante la elongación, los ARNt pasan por los sitios A, P, y E como se muestra arriba. Este proceso
se repite muchas veces conforme se leen los nuevos codones y se agregan los nuevos aminoácidos
a la cadena.

 Terminación

La terminación es la etapa donde la cadena polipeptídica completa es liberada. Comienza cuando

un codón de terminación (UAG, UAA o UGA) entra al ribosoma, lo que dispara una serie de
eventos que separa la cadena de su ARNt y le permite flotar hacia afuera.

Después de la terminación, es posible que el polipéptido todavía necesite tomar la forma

tridimensional correcta, se someta a procesamiento (tal como el retiro de aminoácidos), sea
enviado a la parte correcta en la célula, o se combine con otros polipéptidos antes de que pueda
hacer su trabajo como una proteína funcional.

5. Aclare porque se dice que el código genético es redundante y degenerado

CODIGO GENETICO

Corresponde al conjunto de reglas que relacionan la secuencia de nucleótidos , el correspondiente

codón de mRNA y la secuencia de aminoácidos obtenida. Tres aminoácidos: Arg, Leu y Ser, están
especificados por seis codones, muchos de los demás están especificados por cuatro, tres o dos
codones. Sólo Met y Trp se representan por un solo codón.

N° de bases por codón 43 = 64 bases diferentes combinaciones Con un código de tripletes, existen
dos posibilidades: Existen 44 codones que no codifican para aminoácidos. Algunos aminoácidos
son codificados por más de un codón. Desde el punto de vista matemático, un código como el
descrito en la opción b, se denomina como redundante o Degenerado

6. Llene los espacios en blanco para darle sentido al esquema de la traducción de proteínas.

7. Explique por qué de los 64 codones posibles solo 61 codifican para proteínas y los tres
restantes no.

El número de codones posibles es 64, de los cuales 61 codifican aminoácidos (siendo además uno
de ellos el codón de inicio, AUG) y los tres restantes son sitios de parada (UAA, llamado ocre; UAG,
llamado ámbar; UGA, llamado ópalo). La secuencia de codones determina la secuencia de
aminoácidos en una proteína en concreto, que tendrá una estructura y una función específicas.

8. Mencione y defina las diferentes modificaciones postraduccionales.

La modificación postraduccional de una proteína es un cambio químico ocurrido en esta después

de su síntesis por los ribosomas. Es uno de los pasos finales de la síntesis de proteínas y, por lo
tanto, de la expresión génica. Muchas proteínas no podrían ejercer sus funciones si no sufrieran
estos cambios.

Las modificaciones postraduccionales ocurren mediante cambios químicos de los aminoácidos que
constituyen las proteínas y pueden ser de muchos tipos.:
Acilación. Adición de un grupo acilo.

Fosforilación. Adición de un grupo fosfato.

Metilación. Adición de un grupo metilo.

Hidroxilación. Adición de un grupo hidroxilo.

Glicosilación. Adición de un glucido.

Glicación. Modificación no enzimática de los grupos amino de las proteínas por la acción de
azúcares reductores.

Sulfonilación

Prenilación. Adición de moléculas hidrofóbicas.

Nitrosilación. Adición de un grupo nitroxilo.

Nitración. Adición de un grupo nitro.

Modificaciones que enlazan proteínas

Sumoilación. Adición de la proteína miniatura (small ubiquitin-related modifier) a proteínas diana.

Ubiquitinación. Adición de la proteína ubiquitina a proteínas diana.

9. Mencione:

a) ¿cómo esperaría encontrar el complejo cinasa quinasa en la fase G1, activo o inactivo?

b) ¿En replicación encontrar eucromatina o heterocromatina?

c) ¿En G1 alto grado de compactación? ¿Cuáles de estos mecanismos activos (replicación,

transcripción o traducción)?

a) Se encuentra inactiva, el complejo cinasa quinasa se activa en la fase s cuando se necesita que la
cinasa y la quinasa se unan para activar las enzimas que van a desenroscar y volver a estructurar el
ADN de la célula para su replicación, si la quinasa y la cinasa no se unen, estas enzimas no se
activarán y el proceso de replicación no se llevaría a cabo.

b) La eucromatina es una forma de la cromatina ligeramente compactada, con una gran

concentración de genes, y a menudo (no siempre) se encuentra en transcripción activa. A
diferencia de la heterocromatina, se encuentra tanto en eucariotas como en procariotas.

c) En el G1 hay un alto grado de compactación ya que en esta fase las células aumentan su tamaño
celular y también incrementan su actividad metabólica.

Mecanismo activo es la transcripción

 10. . Llene el siguiente cuadro con la información que se requiere dentro y luego coloque en el
proceso que corresponda los conceptos y palabras que aparecen en la caja debajo.

Replicación Transcripción Traducción

Producto final: ADN Producto final: ARN mensajero Producto final del proceso:
Proteinas

Dirección de replicación: 5’-3’ Direccion de transcripción: 5’-3’

Dirección de traducción: 5’-3’

- TATA
- ORF
- Cadena lider - Maduración del ARN
- Fragmentos de ookasaki - Promotores distales - Secuencia shine-delgarno
- ADN polimerasa - Enhanser - Sitio E, P, A
- Primer - Intrones - Anticodón
- Topoisomerasa - ARN polimerasa - Aminoacil ARNt
- Ligasa - Splicing alternativo - Metionina
- Semisconservativa - Promotores - Bamboleo
- Helicasa - Cap7 - Degenerado
- Cadena retrasada - Edición del ARN - Redundante
- Proteina SSB - Uracilo
- Bidireccional - Spliceosoma
- Multifocal
- Replisoma
- Exonucleasas

Secuencias shine- delgarno, TATA, ORF, ORI y inr,promotores distales, cadena líder, enhancer,
Primer, caja TATA, fragmentos de Okasasy, intrones, fragmentos de Okasaki, ARN polimerasa,
ADN polimerasa, secuencia Shine Dalgarno, aminoacil-ARNt, topoisomerasas, sitio E,P,A, splicing
alternativo, ligasa, semiconservativa, maduracion del ARN, helicasa, promotores, replisoma,
spliceosoma, exonucleasas,Poli A, metionina, cadena retrasada, ARN hn, bamboleo, cap7,
Anticodon, Proteinas SSB, Edición del ARN, Uracilo, degenerado, bidireccional, redundante,
multifocal,