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Ligamiento y Recombinacion
Ligamiento y Recombinacion
0
46
$a-b $abb aa-b aabb Total
?bs. 1@5 AB A; 1=5 AC5
Esp. D5 D5 D5 D5 AC5
(?:E
;
8E (=5
;
8D5 (:=;
;
8D5 (:=B
;
8D5 (C5
;
8D5 =
,
ca"*E 1A=!1D
$l comparar el valor de >
;
cuadrado calculado con el valor
de tabla (para tres grados de libertad y un nivel de significacin del
=6 observamos que las desviaciones son altamente significativas.
:Cu(" es "a causa responsa!"e e esta iscrepancia<***
(e calcula >
;
para el locus ($!a! y se observan los siguientes
resultados.
,t: ,ubo segregacin normal- por lo tanto de la cru.a de prueba a
un heterocigota se espera 1 de cada clase fenotpica.
$a aa Total
?bs. 1@5FAB E 1GB A; F1=5E1B; AC5
Esp. 1B5 1B5 AC5
(?:E
;
8E (1GB:1B5
;
81B5 (1B;:1B5
;
81B5 =
,
ca"*E 5.5@@
H para el locus (-!b
,t: ,ubo segregacin normal- por lo tanto de la cru.a de prueba a
un heterocigota se espera 1 de cada clase fenotpica.
$a aa Total
?bs. 1@5FA; E 1G; AB F1=5E1BB AC5
Esp. 1B5 1B5 AC5
(?:E
;
8E (1G;:1B5
;
81B5 (1BB:1B5
;
81B5 =
,
ca"*E 5.G5
En el primer test reali#ado para comprobar la segregacin
con+unta se observa que las discrepancias entre lo observado y lo
esperado son altamente significativas! entonces debe recha#arse la
hiptesis de traba+o0 es decir! los genes no se encontraban en
distintos cromosomas y por lo tanto los genes no se distribuyeron
independientemente.
$l reali#ar los otros dos test para comprobar la segregacin
de cada loci en forma independiente! los resultados indican
concordancia entre lo esperado y lo observado! es decir! se hallan
dentro de los l,mites de una desviacin normalmente esperada.
A" rec#a5ar "a #ip$tesis e "a existencia e istri!uci$n
inepeniente 0 poer asegurar ;ue no #u!o istorci$n en "a
segregaci$n e "os a"e"os e "os os "oci poemos atri!uir "os
resu"taos o!ser>aos a" "igamiento* 'or ene9 e" "ocus A 0 e" "ocus B
se encuentran en e" mismo cromosoma.
*' 2hi-cuadrado
conjunto
rados de libertad 3gl':
2lases -*
4-*45
6
0
t 35- +.+7'4 8-8*
0' 2hi-cuadrado para
comprobar
anormalidades en la
segregacin en ambos
locus
Locus A
rados de libertad 3gl':
2lases -*
3gl'4 0-* 4*
6
0
t 3*- +.+7'4 5-94
Locus B
rados de libertad 3gl':
2lases -*
3gl'4 0-* 4*
6
0
t 3*- +.+7'4 5-94
2onclusin
47
(i los locus $ y - se encuentran en el mismo cromosoma.
:Cu(" es "a re"aci$n e en"ace en e" i#?!rio<
2ara contestar esta pregunta se debe considerar lo siguiente.
1 al ser una cru#a de prueba! el individuo ab8ab (el
probador slo producir& gametas ab! por lo tanto las variaciones
de la descencia son debidas al las diferencias en las gametas del
dihibrido.
; qu" descendencia se encuentra en mayor proporcin. En
nuestro e+emplo los descendientes de tipo $-8ab (1@5 y ab8ab
(1=5. Esto indica que las gametas $b y ab! que fueron aportadas
por el progenitor probado! se encuentran en mayor proporcin! por
lo tanto son de tipo progenitor y presentan la combinacin original
del progenitor heterocigota ya que provienen de las crom&tides
que no sufrieron recombinacin.
Itili#ando la notacin para ligamiento.
2rogenitores. $-8ab x ab8ab
3ametas. $- y ab $b y a- ab
T.2. T.J.
*escendencia. $-8ab Tipo 2rogenitor
$b8ab Tipo Jecombinante
$-8ab Tipo Jecombinante
$b8ab Tipo 2rogenitor
48
-
.recuencia e
Recom!inaci$n
$ la proporcin en que se forman las nuevas combinaciones
de dos pares de genes! en comparacin a la suma de todas las
combinaciones! se la conoce como frecuencia e
entrecru5amiento o e recom!inaci$n*
<olviendo a los datos del e+emplo 15.
$-8ab $b8ab a-8ab ab8ab Total
?bservados 1@5 AB A; 1=5 AC5
*el total! G5 (ABFA; son combinaciones nuevas! lo que
representa una frecuencia de recombinacin de 5!1D o 1D6.
)a frecuencia de recombinacin se define como.
7recuencia de recombinacin E
Total derecombinantes
Total de descendientes
y se expresa como.
6 de recombinacion E ( frecuencia de recombinacion 155
)a frecuencia de recombinacin entre los genes aumenta o
disminuye a medida que aumenta o disminuye la distancia de los
genes y puede ser utili#ado para construir mapas g"nicos. Es decir!
existe una relacin entre la frecuencia de recombinacin entre los
genes ligados y la distancia entre los mismos en el cromosoma.
*e acuerdo con lo anterior! por definicin! un uno por ciento e
recom!inaci$n es igua" a una unia e mapa @u*m*79 tam!in
enominaa centimorgan @cM7*
A B
1D cM
)os valores de recombinacin pueden variar desde 5 a =5
por ciento con distintos con+untos de pares de genes. El l,mite inferior
representa la ausencia de recombinacin entre dos pares de genes!
mientras que el l,mite superior representa un grado de
recombinacin igual a la transmisin independiente.
AB < 6recuencia e recom!inaci$n > /AB
frecuencia de
recombinacin
unidades de mapa o
centimorgan
49
(i entre dos genes existe m&s del =56 de recombinacin! es
necesario utili#ar otro m"todo para calcular las distancias y el orden
de los genes. Este m"todo se denomina cru5a e tres puntos y
consiste en adicionar un tercer gen obteniendo diferentes productos
meiticos o gametas.
)a figura siguiente muestra los distintos tipos de gametas
posibles a partir de un trih,brido en fase de acoplamiento.
Jesumiendo.
$ partir de un individuo trih,brido con genes ligados se obtienen los
siguientes tipos de gametas.
1) , Gametas tipo progenitor. con la combinacin original de los
genes del progenitor.
2) , Gametas tipo recom!inantes en Cona I. son las resultantes de
un entrecru#amiento a la i#quierda del marcador o gen central.
3) , Gametas tipo recom!inantes en Cona II. como producto de un
entrecru#amiento a la derecha del marcador o gen central.
4) , Gametas tipo o!"e recom!inantes. son las que resultan del
entrecu#amiento simult&neo en Kona L y Kona LL.
9por :u;
el porcentaje de
recombinacin nunca es
del *++<=
>ona ? ! >ona ?? surgen de
tra.ar una lnea
imaginaria a partir del
marcador o gen central.
Asi:
A la i.:uierda : >ona ?-
a la derecha >ona ??.
50
A B C
Cona I
Cona II
$ - /
a b c
$ - /
a b c
$ - /
a b c
$ - /
a b c
(in
Jecombinacin
3ametas Tipo
2rogenitor
$-/
abc
/on Jecombinacin
3ametas Jecombinantes en.
Kona L Kona LL Kona L y LL
$bc $bc $b/
a-/ a-/ a-c
Ejemplo **: Itili#ando los datos siguientes calcule.
3enotipos ?bservados
$-/8abc AD5
abc8abc AG@
$bc8abc ;G
a-/8abc A5
$-c8abc B1
ab/8abc B=
$b/8abc =
a-c8abc B
Total 1555
a la frecuencia de recombinacin de los genes.
b el orden en el mapa entre los tres genes.
c M/u&les son las distintas clases de las descendenciaN
2rimero se debe determinar cu&l es el genotipo de los
progenitores. 2ara esto se tiene como dato que es una cru#a de prueba!
por lo tanto el genotipo de el progenitor probador es abc8abc. 2ara
determinar el genotipo del otro progenitor debemos considerar las clases
m&s numerosas de la descendencia llamadas e tipo progenitor y que se
corresponden con las gametas de tipo progenitor que siempre se
encuentran en ma0or proporcin.
*escendencia
?bservados
3ametas del dih,brido
de las que provienen
$-/8abc AD5 $-/
abc8abc AG@ abc
En consecuencia las gametas $-/ y abc son copia de los
cromosomas del dih,brido cuyo genotipo ser,a. $-/8abc.
Ina ve# determinado el genotipo de los progenitores! es
necesario saber el orden real de los genes en el cromosoma! o sea! cu&l
es el gen central. 2ara ello se debe recurrir a las clases o!"e
recom!inantes que provienen de las gametas que son producto de una
doble recombinacin (tanto en #ona L como en #ona LL. Estas gametas
pueden identificarse pues son las que aparecen en menor proporcin en
el con+unto de gametas.
*escendencia ?bservados
3ametas del dih,brido
de las que provienen
$b/8abc = $b/
a-c8abc B a-c
(i se considera que al reali#arse un doble entrecru#amiento! se
intercambian el alelo central las crom&tides no hermanas! al reconstruirlo
debemos obtener la combinacin original! lo que confirma el alelo
central y por lo tanto el orden real de los alelos en el cromosoma.
An@lisis de un ligamiento
de tres puntos
(aso *
Aeterminar el genotipo de
los padres
(aso 0
Aeterminar el oden de los
genes
51
T.2. T.2.
T.J T.J
$ b / $ - /
a - c a b c
Ina ve# determinado el orden se puede calcular la frecuencia
de recombinacin entre los tres alelos! o sea! la proporcin de los
recombinantes observados para cada par de genes respecto al nmero
total de individuos de la descendencia.
3enotipos
recombinantes
?bservados
$bc8abc ;G (;GFA581555E
a-/8abc A5 /9DB
$-c8abc B1 (B1FB=81555E
ab/8abc B= )E9DB
$b/8abc = (=FB81555E
a-c8abc B )9-B
Total 1555
C("cu"o e "a 6recuencia e recom!inaci$n entre a 0 !*
Este valor se obtiene de considerar el porcenta+e de recombinantes en
#ona L m&s los dobles recombinantes! ya que estos incluyen
entrecru#amientos en esta #ona.
6 recombinacin entre a y bE 6 de recombinacin en #ona L F 6 *.J.
6 recombinacin entre a y bE =!G F 1!A
B recom!inaci$n entre a 0 !F DB
C("cu"o e "a 6recuencia e recom!inaci$n entre ! 0 c*
Este valor se obtiene de considerar el porcenta+e de recombinantes en
#ona LL m&s los dobles recombinantes! ya que estos incluyen
entrecru#amientos en esta #ona.
6 recombinacin entre b y cE 6 de recombinacin en #ona LL F 6 *.J.
6 recombinacin entre b y cE 1C!G F 1!A
B recom!inaci$n entre ! 0 cF )GB
C("cu"o e "a 6recuencia e recom!inaci$n entre a 0 c*
=!G F 1C!G F ;(1!AE ;=6
B recom!inaci$n entre a 0 cF ,/ B
Otese que para calcular la recombinacin entre los genes extremos a la
suma de los porcenta+es de recombinacin en #ona L y en #ona LL se
agrega el doble de la frecuencia de los doble recombinantes (;!C6. $l
aPadirlo al ;;!@ por ciento resulta un total de ;=6 para a:c! que es la
suma exacta de las distancias a:b (G y b:c (1B.
(aso5
2@lculo de la frecuencia
de recombinacin
52
*.J.
J. Kona LL
J. Kona L
)as distancias g"nicas se obtienen a partir del porcenta+e de
recombinacin! siendo un uno por ciento de recombinacin igual a un
centiMorgan (cM o una unidad de mapa (u.m.
C("cu"o e "a istancia entre a 0 !F
6 de recombinacin entre a y bE G6 G u.m.
C("cu"o e "a istancia entre ! 0 cF
6 de recombinacin entre b y c E 1B6 1B u.m.
C("cu"o e "a istancia entre a 0 cF
6 de recombinacin entre a y cE ;=6 ;= u.m.
a ! c
COINCI8ENCIA E INTER.ERENCIA
)a ba+a frecuencia de los dobles entrecru#amientos indica la
dificultad que se presenta para separar en un entrecru#amiento el gen
central de los genes que se hallan a ambos lados del mismo. Esta
dificultad aumenta ya que los dobles entrecru#amientos se producen por
lo general con una frecuencia incluso menor a la esperada.
(i el entrecru#amiento de una pare+a de loci no afectase al
entrecru#amiento de una pare+a vecina! se espera que los dobles
entrecru#amientos se presenten con una frecuencia igual al producto de
ambas frecuencias (probabilidad combinada de dos sucesos
independientes. (in embargo la frecuencia observada siempre es
menor que la esperada. $parentemente el entrecru#amiento en una
regin interfiere con el entrecru#amiento en una regin vecina.
Este fenmeno se designa como inter6erencia @I7. )a medida de
la interferencia se calcula a partir del coe6iciente e coinciencia (c.c.
que es la relacin entre los dobles entrecru#amientos observados y los
dobles entrecru#amientos esperados.
esperados tes recombinan *obles
observados tes recombinan *obles
1 E . c . c 1 E L
(aso 4
Aeterminar las distancia
g;nicas
(aso 7
Aibujar el mapa
coincidencia interferencia
53
D u*m* )G u*m*
'ROBLEMA% RE%&ELTO%1
%Oo hay problemas resueltos! hay problemas m&s o menos resueltos'
1) En la meiosis femenina de Drosophila melanogaster la fraccin de recombinacin entre los loci
ligados $ y - es 5!@. (e cru#a un heterocigoto $b8a- con un homocigoto recesivo ab8ab. Lndique la
descendencia posible de este apareamiento.
%o"uci$n1
El problema indica la existencia de ligamiento entre los dos loci. $dem&s! al indicar que la
recombinacin es de 5!@ tambi"n nos dice un porcenta+e de recombinacin del @5 6 y! por lo tanto!
antre $ y - hay @5 u.m.
$l reali#ar el apareamiento.
2 $b8a- x ab8ab
$ b a b
a - a b
3 Todas
ab
2) En una especie animal hay tres caracteres recesivos respecto al normal. albino (a! sin cola (s y
enano (e. )os tres loci que los determinan est&n situados en el mismo cromosoma. (e reali#aron
cruces de prueba a individuos heterocigotos para estos tres genes y la progenie (1555 individuos fue
clasificada como . = enanos0 C albinos! sin cola0 CD normales0 CG albinos! enanos!sin cola0 AB; enanos!
sin cola0 AGD albinos0 @B sin cola0 y @@ albinos enanos. Explique estos resultados.
%o"uci$n1
2ara explicar los resultados se debe! al saber que est&n ligados0 determinar la frecuencia de
recombinacin de los genes! el orden que presentan los genes en el cromosoma y cu&les son
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Tipo 2rogenitor
A56 $b
A56 a-
Tipo recombinantes
;56 $-
;56 ab
:En ;ue proporci$n se encuentran "as
gametas e" progenitor i#?!io<
El porcenta+e de recombinacin es la
relacin que hay entre los recombinantes
y el total de la descendencia. $l tener
ese dato se sabe que el @56 de las
gametas producidas son de tipo recom:
binantes! ;56 de cada tipo.
El progenitor dih,brido se
encuentra en fase de repulsin
)as gametas de tipo progenitor! por lo tanto! constituyen el C56! A56 de cada una.
:'or ;u mita e caa tipo< 2orque la separacin de los homlogos en la meiosis se reali#a y
por lo tanto las crom&tides migran con su carga g"nica ecuacionalmente0 m&s cuando
consideramos genes ligados la frecuencia depender& de la distancia de los mismos.
*e la unin de las gametas de ambos progenitores obtenemos la descendencia.
Respuesta1 descendencia de tipo progenitor. A56 $b8ab y A56 a-8ab y descendencia de tipo
recombinante. ;56 $-8ab y ;56 ab8ab.
)os t"rminos %tipo progenitor' y %tipo recombinante' se utili#an en fase haploide (gametas y en
fases diploides (genotipo y fenotipos.
las distintas clases de las descendencia. 2ara ello se siguen los pasos indicados en la parte terica
basados en la descendencia.
'aso )1 8eterminar "os genotipos e "os progenitores
)os fenotipos m&s abundantes corresponden a los tipo progenitor. los AB; enanos! sin cola y los AGD
albinos.
$l saber que es una cru#a de prueba (el progenitor probador! triple recesivo! slo aportar& gametas
de tipo %ase4 y teniendo en cuenta los s,mbolos indicados se puede escribir los genotipos de estos
individuos.
7enotipos ?bservados 3enotipos
AB; enanos! sin cola $se8ase
AGD albinos a(E8ase
*e esto se desprende que las gametas! aportadas por el progenitor trih,brido! de tipo progenitor
fueron $se y a(E. El genotipo del progenitor! por lo tanto! es Ase2a%E9 ya que esas gametas est&n
indicando qu" alelos se encuentran en cada uno de los homlogos del progenitor sometido a la
cru#a de prueba.
Jecordar que este paso no nos indica cu&l es el locus central. 2ara ello debemos pasar al segundo
paso.
'aso ,1 8eterminar e" oren e "os genes
2ara determinar el orden de los genes es necesario conocer los genotipos de los progenitores y los
genotipos de los doble recombinantes! que como ya fue mencionado son los que se encuentran en
menor proporcin en el con+unto de la descendencia.
7enotipos ?bservados 3enotipos
= enanos $(e8ase
C albinos sin cola asE8ase
En el doble entrecru#amiento se intercambia el alelo central entre las crom&tides no hermanas! al
reconstruirlo se debe obtener la combinacin original! lo que confirma el alelo central y por lo tanto
el orden real de los cromosomas.
$ ( e $ s e
a s E a ( E
(i hubiese considerado como central al "ocus e! por e+emplo! la situacin hubiera sido.
$ e ( $ E (
a E s a e s
?bservamos que al intentar reconstruir el genotipo del progenitor! se obtiene otro que no se
corresponde con el que considerablemente deb,a ser! de acuerdo a la descendencia que est& en
mayor proporcin.
2or lo tanto el orden correcto es el que establece al "ocus s como central.
55
'aso -1 8eterminar "as 6recuencias gnicas1
7enotipos
3enotipos
recombinantes
?bservados
Oormal $(E8ase CD (CDFCG81555E
$lbino!
enano!sin cola
ase8ase CG )-9EB
(in cola $sE8ase @B (@BF@@81555E
$lbino! enano a(e8ase @@ H9,B
Enano $se8ase = (=FC81555E
$lbino! sin cola asE8ase C )9)B
6 de recombinacin entre a y s. 1A!C F 1!1E 1@!G6
6 de recombinacin entre s y e. D!; F 1!1 E 15!A6
6 de recombinacin entre a y . 1A!C F D!; F ;(1!1E ;=6
'aso +1 8eterminar "as istancias gnicas
C("cu"o e "a istancia entre a 0 sF
6 de recombinacin entre a y sE1@!G6 1@!G u.m.
C("cu"o e "a istancia entre s 0 eF
6 de recombinacin entre s y e E 15!A6 15!A u.m.
C("cu"o e "a istancia entre a 0 eF
6 de recombinacin entre a y eE ;=6 ;= u.m.
'aso /1 8i!ujar e" mapa
a s e
56
D u*m* )G u*m*
*.J.
J. Kona LL
J. Kona L
57