Función de las proteínas

Dr. Julio Ortiz Ortiz

Diversidad proteínica
1. Catálisis: Enzimas dirigen y aceleran procesos como la digestión, la captura de
energía y la biosíntesis.

2. Estructura. Proteínas estructurales como colágeno (tejidos), fibroína (seda),

elastina (fibras elásticas en vasos sanguíneos y piel).

3. Movimiento: Participan en el movimiento celular como la actina, tubulina

(citoesqueleto).

4. Defensa: Queratina (daños mecánicos y químicos), fibrinógeno, fibrina (coagulación

hemática), inmunoglobulinas (sistema inmunológico).

5. Regulación: hormonas como insulina y glucagon (concentración de glucosa

sanguínea), hormona del crecimiento (desarrollo y división celular), PDGF y EGF
(división y diferenciación celular).

6. Transporte: a bomba de Na+-K+, ATPasa, transportador de glucosa hemoglobina,

LDL, HDL, transferrina y ceruloplasmina (hierro y cobre).

7. Almacenamiento: Actúan como reserva de nutrientes como nitrógeno orgánico,

por ejemplo ovoalbúmina (desarrollo de aves), caseína (leche de mamíferos) y la
zeína (germinación de semillas).

8. Respuesta al estrés: Sobrevivencia en estrés abiótico, por ejemplo citocromo P 450

transforma contaminantes tóxicos en menos tóxicos (animales y plantas),
metalotioneína que secuestra metales tóxicos (cadmio, mercurio y plata) y proteínas
de choque térmico (hsps) (plegamiento correcto de proteínas en temperaturas
elevadas)
2. Estructura. Proteínas estructurales como colágeno (tejidos), fibroína (seda), elastina (fibras elásticas en vasos sanguíneos y piel) y
queratina (piel, pelo y uñas)
Los vertebrados tienen 46 cadenas polipeptídicas genéticamente distintas
que comprenden 28 tipos de colágeno presentes en diferentes tejidos.

Biosíntesis y ensamblaje del colágeno.

Los filamentos intermedios son proteínas exclusivamente estructurales, forman láminas (queratinas).
Monómero

Espiral enrollada Dímero

Tetrámero

Espiral enrollada de tropomiosina

Filamento intermedio con 16 subunidades,

pueden tener hasta 32 subunidades. Micrografía electrónica de barrido de un cabello
humano.
Las queratinas “blandas” ayudan a definir estructuras corporales
internas.

Las queratinas “duras” se encuentran en piel, pelo y uñas.

La unidad estructural básica de un filamento intermedio es un dímero

de hélices α que se enrollan una alrededor de la otra; forman una
espiral enrollada.

El humano contiene cerca de 65 genes para filamentos intermedios.

3. Movimiento: Participan en el movimiento celular como la actina, tubulina (citoesqueleto)

Monómero de actina
Ensamblaje de
microfilamentos

Organización de
los filamentos de
actina en una
célula epitelial.

Microfilamentos filamento de actina Célula en movimiento Pratt, 2012

 Un microtúbulo es tres veces más grueso y mucho más rígido porque
tiene la forma de un tubo (es hueco).
Estructura de la β-tubulina
Dímero de α y β-tubulina

Los dímeros αβ de tubulina forman un protofilamento lineal. Los protofilamentos se

asocian lado a lado, hasta formar un tubo. Pueden agregarse dímeros de tubulina a
cualquier extremo del microtúbulo, pero el crecimiento es unas dos veces más rápido en
Microtúbulos el extremo (+) que en el (–).
4. Defensa: Queratina (daños mecánicos y químicos), fibrinógeno, fibrina (coagulación hemática), inmunoglobulinas (sistema
inmunológico)
Conformación sin antígeno unido Conformación con antígeno unido Conformación con antígeno unido
(no mostrado) (mostrado)
Técnicas con anticuerpos
 5. Regulación: hormonas como insulina y glucagon (concentración de
glucosa sanguínea), hormona del crecimiento (desarrollo y división
celular), PDGF y EGF (división y diferenciación celular).
Impulsos sensitivos del
entorno o estímulos

Sistema nervioso central

(Excepto hipotálamo)

Hipotálamo
Factores de liberación Axones de las células
del hipotálamo del hipotálamo
Objetivo
primario
Hipófisis anterior Hipófisis posterior

β-Corticotropina Somatotropina Hormona Hormona Prolactina Vasopresina Oxitocina

Tirotropina
(ACTH) luteinizante folículo-
estimulante

Objetivo Corteza Medula Células de

secundario
Tiroides los islotes Ovario Testículos
suprarrenal suprarrenal
pancreáticos

Tiroxina, Cortisol, Adrenalina Insulina, Progesterona, Testosterona

triyodotironina corticosterona, glucagón, 17-β-estradiol
aldosterona somatostatina

Objetivo Musculos, Muchos Musculos, Musculos, Órganos Glándulas Arteriolas Músculos

final hígado tejidos hígado, hígado reproductores mamarias liso,
corazón glándula
mamaria
 La unión de la insulina a un receptor de insulina (IR) heterotetramérico en
la membrana plasmática específico para la célula blanco da lugar a una
Respuesta a hiperglucemia: cascada de eventos intracelulares. Primero, la actividad de tirosina cinasa
intrínseca del receptor de insulina es activada, y marca el evento inicial. La
Generación de activación de receptor incrementa la fosforilación de tirosina (conversión
de residuos Y específicos →Y-P) dentro del receptor. Después, moléculas de
señal: sustrato receptor de insulina (IRS) (IRS 1-4) se unen al receptor tirosina-
fosforilado, y ellas mismas son tirosina-fosforiladas de manera específica.
las proteínas IRS interactúan con el IR activado mediante dominios PH
(homología de plekstrina) y PTB (unión a fosfotirosina) N terminal. Las
proteínas IRS acopladas a IR son tirosina-fosforiladas, y los residuos P-Y
resultantes forman los sitios de acoplamiento. Las proteínas emisoras de
señales adicionales (PI-3 cinasa, GRB2 y mToR). GRB2 y PI3K se unen a
residuos P-Y de IRS por medio de sus dominios SH (homología Src). La unión
a residuos IRS-Y-P lleva a activación de la actividad moléculas emisoras de
señales intracelulares, como GTPasas, proteína cinasas y lípido cinasas, las
cuales desempeñan papeles clave en ciertas acciones metabólicas de la
insulina. En detalle, la fosforilación de una molécula de IRS (probablemente
Transducción IRS-2) da por resultado acoplamiento y activación de la lípido cinasa, PI-3
de señal: cinasa. La PI-3K genera lípidos inositol nuevos que actúan como moléculas
“segundo mensajero”. Éstas, a su vez, activan PDK1 y después varias
moléculas emisoras de señales torrente abajo, incluso proteína cinasa B
(PKB/AKT). SGK y aPKc. una vía alternativa comprende la activación de
p70S6K y quizá otras cinasas todavía no identificadas. Después, la
fosforilación de IRS (probablemente IRS-1) da por resultado acoplamiento
Efectos de GRB2/mSoS y activación de la GTPasa pequeña, p21Ras, e inicia una
biológicos: cascada de proteína cinasa que activa Raf-1, MEK, y las isoformas p42/p44
de MAP cinasa. Estas proteína cinasas son importantes en la regulación de
la proliferación de muchos tipos de células y la diferenciación de los
Blancos: mismos. La vía mToR proporciona una vía alternativa de activación de
Transportador de Receptor de insulina PEPCK Hexocinasa Síntesis de DNA p70S6K y parece estar involucrada en la emisión de señales de nutriente,
glucosa Proteínas fosfatasas Glucagón Glucocinasa Respuesta temprana a la así como en la acción de la insulina. Cada una de estas cascadas puede
Receptor de insulina Fosfodiesterasas* IGFBP1 >otros 100 inducción de trascripción influir sobre procesos fisiológicos diferentes. Todos los eventos de
Receptor de IGF-II Otros de gen fosforilación son reversibles por medio de la acción de fosfatasas
específicas. Por ejemplo, la lípido fosfatasa PTEN desfosforila el producto
de la reacción de la PI-3 cinasa, lo que antagoniza la vía y termina la señal.
6. Transporte: a bomba de Na+-K+, ATPasa, transportador de
glucosa, hemoglobina, LDL, HDL, transferrina y ceruloplasmina Quelante
(hierro y cobre).

Fe quelado

b) Protoporfirina IX
(Sistema de anillo tetrapirrolico)
a) Porfirina (C20H14N4)
(Clorofila, citocromos, pigmentos nat.)
a)
c) Ferroprotoporfirina (hemo)
Grupo prostético de la Hb y mioglobina
a) El hierro y los cuatro nitrógenos
de la protoporfirina IX se
encuentran próximos en un plano.
La histidina F8 o His 93 ocupa una
de las posiciones axiales y el O2 se
mantiene en el otro lado por la
histidina E7 o His 64.

El Fe porfirínico en Hb = color rojo

(sangre). El Mg porfirínico en
clorofila = color verde (plantas).
b) Bolsillo del hemo. Muestra las
cadenas laterales de las histidinas
proximal (F8 o His 93) y distal (E7 o
b) His 64).
Cambios conformacionales de la Hemoglobina

pH más bajo en tejidos, indica

demanda de O2, facilita la descarga del
O2. Esta respuesta es el efecto Bohr.
Mecanismo de la transición T R en la
hemoglobina
7. Almacenamiento: Actúan como reserva de nutrientes como nitrógeno orgánico, hierro, por ejemplo ovoalbúmina
(desarrollo de aves), caseína (leche de mamíferos), la zeína (germinación de semillas) y ferritina (Enterocitos).
8. Respuesta al estrés: Sobrevivencia en estrés abiótico, por ejemplo citocromo P 450 transforma contaminantes tóxicos en
menos tóxicos (animales y plantas), metalotioneína que secuestra metales tóxicos (cadmio, mercurio y plata) y proteínas
de choque térmico (hsps) (plegamiento correcto de proteínas en temperaturas elevadas)
Estructura Estado T Estado R

Un catalizador es una sustancia que aumenta la rapidez

o velocidad de una reacción química, sin verse alterada
ella misma en el proceso global.

Las enzimas son catalizadores biológicos, proteínas

capaces de catalizar reacciones químicas (de 103 a 1020),
sin modificar las condiciones del equilibrio.

Aspartato carbamoiltransferasa
(ATCasa)

Lugar de unión
de ATP/CTP

Quimotripsina

Glucógeno fosforilasa
Sitio activo Cys, Arg, His, Ser, Asp, Asn, Glu, Tyr y Lys

fructosa-2,6-bisfosfatasa.

Quimotripsina
Residuos polares de aminoácidos en sitios activos
Residuos polares de aminoácidos en
sitios activos

Las enzimas suelen tener de dos a seis residuos catalíticos

esenciales.

Los residuos con carga, His, Asp, Arg, Glu y Lys forman casi las
dos terceras partes de todos los residuos catalíticos.

Es más probable que las cadenas laterales con carga funcionen

como ácidos, bases y nucleófilos.

Es más probable que tengan un papel en el enlazamiento con

el sustrato, o con estados de transición.

La histidina es el residuo catalítico número uno.

Clasificación de las 1
enzimas Reductasa de ribonucleótido, oxidasas,
oxigenasas, peroxidasas
2
Transcarboxilasa, transmetilasas,
transaminasas.
Carboxilo, metilo, amino, carbonilo,
fosforilo y acilo.

Rompen enlaces C – O, C – N y O – P
Esterasas, fosfatasas, proteasas
3

4
Descarboxilasas, hidratasas,
deshidratasas, desaminasas, sintasas.
H2O, CO2, NH3.

5
Isomerasas: Interconvierte aldosas y cetosas
Epimerasas: inversión en carbonos asimétricos
Mutasas: Transferencia intramolecular de grupos
funcionales.

Distribución de todas las

enzimas conocidas por número
6
de clasificación EC. Sintetasas, carboxilasas.
Formación de enlaces entre 2 moléculas
Cofactores enzimáticos

Pirofosfato de tiamina, FAD y FMN, Fosfato de piridoxal,

NAD+ y NADP+, Retinal, 1,25-Dihidroxicolecalciferol,
Coenzima Q.
Complejo II (succinato:ubiquinona oxidorreductasa
Anhidrasa carbónica
o complejo de succinato deshidrogenasa)
Coenzimas
 Mecanismos de acción
Sustituciones nucleofílicas

Ricas en electrones o
nucleofílicas o nucleófilos.

El compuesto intermediario puede ser detectado.

Mecanismo usado por las serina proteasas.
Deficiencia de electrones o
electrofílicas o electrófilos.

La adición del nucleófilo atacante y el desplazamiento

del grupo saliente ocurren en forma simultánea.
Catálisis ácido-base
La aceleración se debe a la transferencia
catalítica de un protón. Es la forma más común.
Un aceptor de protón, puede romper los enlaces O—H, N—H,
incluso algunos C—H, quitando a un protón. Puede participar en
la ruptura de enlaces como C—N, al generar un equivalente de
OHΘ en solución neutra mediante la eliminación de un protón de
una molécula de agua.

Carboxilato

Carboxilato

Imidazol
Quimotripsina

Amina

Sulfhidrilo

Hidroxilo
Las enzimas estabilizan el estado de transición

Estabilización del estado de

transición en el agujero
oxianiónico

Enlace de hidrógeno
de barrera baja
Catálisis por ion metálico

El átomo de zinc actúa como catalizador iónico

metálico que fomenta la hidrólisis. Actúa así
estabilizando la carga negativa sobre el
oxígeno en el estado de transición tetraédrico.

Sitio activo de la proteasa

carboxipeptidasa A.