CHILE

INSTITUTO DE SALUD PÚBLICA DE

DIAGNÓSTICO BACTERIOLÓGICO

T.M. FABIOLA ARIAS MUÑOZ

JEFE SECCIÓN MICOBACTERIAS
INSTITUTO DE SALUD PÚBLICA DE CHILE
LABORATORIO SUPRANACIONAL DE
TUBERCULOSIS OMS/OPS.

Instituto de Salud Pública de Chile

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Fuente: Acciones bacteriologicas Red de Laboratorios de TBC
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Fuente:
Instituto deAcciones bacteriologicas
Salud Pública de Chile Red de Laboratorios de TBC
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Pruebas rápidas aprobadas por la OMS para tuberculosis

2008

2010 2012
2011
2013 2014
2015
2016
2017
2018
2019 2021
2020

La recomendación actual promueve que estas técnicas reemplacen o c

omplementen las pruebas convencionales por ser más sensibles, se deben u
tilizar como prueba diagnóstica inicial
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Alta precisión diagnóstica y mejores resultados de tratamiento para los
pacientes diagnosticados por Xpert MTB / RIF como prueba inicial en
reemplazo de la baciloscopia y para detectar simultáneamente la resistencia
a la rifampicina

Intervención: Intervención:
Xpert MTB / RIF como reemplazo de la Xpert MTB / RIF para la detección
baciloscopia de esputo (cultivo
bacteriológico como estándar de referencia) simultánea de resistencia a la
rifampicina (patrón de referencia PSD
Datos evaluados: fenotípica)
70 estudios (incluidos 5 ensayos controlados
aleatorios) con más de 30.000 participantes Datos evaluados:
de 37 países (incluidos 14 países con alta
carga de tuberculosis). 48 estudios en los que participaron
más de 8.000 participantes de 33
Resultados: países (incluidos 9 países con alta
-Sensibilidad 85% muestras (BK+ y BK-) carga de tuberculosis).
-Especificidad 98% muestras (BK+ y BK-)
-Sensibilidad en esputo de HIV+ fue 81%
y Resultados:
Especificidad 98%.
Sensibilidad general 96%
Los resultados mostraron mejoras Especificidad 98%
importantes en los resultados para el
paciente (tasas de curación, reducción de
la mortalidad y reducción perdidos en
seguimiento) cuando Xpert MTB / RIF
reemplazó aPública
Instituto de Salud la microscopía
de Chile como prueba
de diagnóstico inicial.
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Alta precisión diagnóstica de Xpert Ultra como prueba inicial para
diagnosticar la tuberculosis pulmonar reemplazando la baciloscopia y para
detectar simultáneamente la resistencia a la rifampicina

Intervención: Intervención:
Xpert Ultra como sustituto baciloscopia Xpert Ultra para la detección
(cultivo bacteriológico como estándar de simultánea de resistencia a la
referencia)
rifampicina (PSD fenotípica)
Datos evaluados:
6 estudios, 2000 participantes de 14 países Datos evaluados:
(incluidos 8 países de alta carga).
Se necesitan más datos sobre la 5 estudios, 1000 participantes de 12
relevancia países (incluidos 7 de alta carga Países
de los ”resultados trazas" y sobre con TB).
los
resultados de los tratamientos de
los
pacientes.
Resultados:
- Sensibilidad general 94%
Resultados: - Especificidad 99%
- Sensibilidad (incluyendo ‘trazas’ como
positivo) 90% en todas muestras (BK+ y
bajó a 86%.
- Bk-)
Especificidad incluyendo trazas 96%
- Cuando se excluyó
en todas ‘trazas’
muestras (BK+la ySensibilidad
BK-)
- Excluyendo trazas 98% en todas
muestras.
las
- Sensibilidad en esputo para VIH fue 88%
y Especificidad
Instituto de Salud Pública 95%.
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Uso de Xpert MTB / RIF y Xpert Ultra para diagnosticar la tuberculosis y
detectar la resistencia a rifampicina en niños, a partir de muestras de
esputo, nasofaríngeas, gástricas y heces.
Intervención: Intervención:
Xpert MTB / RIF o Xpert Ultra como Xpert MTB / RIF para detectar la
prueba diagnóstica inicial de TB en niños
resistencia a la rifampicina en
(cultivo como patrón de referencia)
niños (PSD fenotípica)
Datos evaluados para Xpert MTB / RIF:
43 estudios, 6000 participantes, 21 países (14 Datos evaluados:
alta carga). Muestras de esputo, muestras 6 países, 200 4 países
gástricas, nasofaríngea y muestras de heces. participantes, con alta carga.

Resultados:
Sensibilidad: 46% nasofaríngeas; 61% heces;
Resultados:
65% esputo; y 73% gástricas. Sensibilidad 90%
Especificidad: 98% al 100 %. Especificidad 98%

Datos evaluados para Xpert Ultra:

3 estudios países alta carga, 700 participantes.
Todos estos estudios evaluaron muestras de
esputo, uno nasofaríngeo.

Resultados:
Sensibilidad: 46% nasofaríngeas; 73% esputo.
Especificidad 97% al 98%.
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Uso de Xpert MTB / RIF y Xpert Ultra para diagnosticar la tuberculosis y
detectar la rifampicina resistencia en adultos con TB extrapulmonar
Intervención: Intervención:
Xpert MTB / RIF como prueba Xpert Ultra como prueba
diagnóstica inicial en adultos con TB diagnóstica inicial en adultos con
extrapulmonar (cultivo como patrón de TB extrapulmonar (cultivo como
referencia) patrón de referencia)

Datos evaluados: Datos evaluados:

59 estudios, 26 países (7 alta carga).
MTB / RIF en adultos con TB extrapulmonar.
Muestras LCR, aspirado de ganglios
linfáticos, biopsia de ganglios, líquido
pleural, orina, líquido sinovial, líquido
peritoneal, líquido pericárdico y sangre.
6 estudios de 3 países (2 alta carga).
LCR, LP, orina, líquido sinovial
Resultados:
Sensibilidad Xpert Ultra 71% LP, 100%
para biopsia de ganglio linfático.

Resultados: Especificidad 71% LP, 100% orina.

Sensibilidad de Xpert MTB / RIF varió según
el tipo de muestra. 50% para el líquido Intervención:
pleural hasta el 97% para líquido sinovial. Xpert MTB / RIF o Xpert Ultra para
la detección simultánea de
Especificidad de Xpert MTB / RIF también resistencia a la rifampicina
varió según el tipo de muestra, 79% biopsia Sensibilidad 96-97%
ganglios linfáticos hasta el 99% para líquido Especificidad 99%
pleural.
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NAAT automatizadas de complejidad moderada para la detección de TB,
rifampicina e isoniazida, la resistencia en muestras respiratorias resultó ser
altamente precisa.

Intervención:
NAAT automatizadas de complejidad moderada realizadas en muestras
respiratorias de personas con signos y síntomas de tuberculosis pulmonar
para la detección de tuberculosis y resistencia a isoniazida y rifampicina, en
comparación con el cultivo y PSD fenotípicas.

Datos evaluados:
32 estudios con 16.726 muestras.

Resultados:
Sensibilidad global combinada, detección de TB 93,0% y Especificidad 97,7%.
Sensibilidad global combinada, resistencia a rifampicina 96,7% y Especificidad
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98,9%. Sensibilidad global combinada, resistencia a isoniazida 86,4% y Especificidad
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NAAT automatizados de baja complejidad para la detección de resistencia a
isoniazida, Se encontró que las fluoroquinolonas, etionamida y amikacina
en el esputo eran altamente precisas.

Intervención:
NAAT automatizadas de baja complejidad realizadas en esputo de personas con
con TB pulmonar microbiológicamente diagnosticada, para la detección de
resistencia a isoniazida, fluoroquinolonas, etionamida y amikacina.

Datos evaluados:
3 estudios, 1605 participantes.

Resultados:
Sensibilidad global combinada, resistencia a isoniazida 94,2% y Especificidad 98,0%.
Sensibilidad global combinada, resistencia a fluoroquinolonas 93,1% y Especificidad 98,3%.
Sensibilidad global combinada, resistencia a amikacina 89,1% y Especificidad 99,5%.
Sensibilidad general, resistencia a etionamida 96,4% y Especificidad 100,0%.
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DIAGNOSTICO BACTERIOLÓGICO DE LA TUBERCULOSIS

Del diagnóstico de la tuberculosis pulmonar

• El diagnóstico de tuberculosis requiere la demostración de la presencia

de M. tuberculosis por medio de una prueba molecular, baciloscopía o
cultivo, aprobadas y recomendadas por el LRN.

• En los casos presuntivos de tuberculosis (CPT), el examen

bacteriológico para el diagnóstico de inicio es la prueba molecular.

• A los pacientes VIH se les realizará para el diagnóstico una prueba

molecular, cultivo líquido y baciloscopía.

• Las provenientes de contactos, muestras

muestras
extrapulmonares y menores de 15 años se les realizará como
diagnóstico de inicio una prueba molecular y un cultivo líquido,
esto debido a que en su mayoría son muestras paucibacilares y se
necesita emplear una combinación de métodos para aumentar la
sensibilidad y lograr el diagnóstico oportuno de casos.
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Del diagnóstico de la tuberculosis pulmonar

• En pacientes CPT con persistencia de sintomatología y resultados

de exámenes bacteriológicos negativos se deberá repetir la prueba
molecular solicitando además cultivo líquido, asegurando una buena
calidad de la muestra para estos exámenes. La condición de
persistencia de síntomas con bacteriología negativa previa se debe
consignar en la solicitud de examen, en el espacio dispuesto para ello.

• Si el resultado de la bacteriología sigue siendo negativo con

persistencia de sintomatología, se debe derivar a evaluación médica por
el referente clínico, para determinar el origen de su sintomatología.

Durante el proceso de implementación de esta norma, los servicios

que no cuenten con la capacidad instalada para realizar el
diagnóstico molecular como prueba de inicio y el cultivo líquido
podrán, de manera transitoria, hacer el diagnóstico a través de la
baciloscopía y cultivo de acuerdo a la norma técnica del año 2014.

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De la toma de muestra para tuberculosis pulmonar

• Para el diagnóstico de la tuberculosis pulmonar, se debe tomar

dos muestras seriadas de expectoración por cada paciente, las
que se enviarán al laboratorio con una sola solicitud de
investigación bacteriológica.

• Las muestras deben ser de preferencia inmediatas, de buena

cantidad y calidad. Las muestras deben ser mantenidas y
trasladadas en condiciones óptimas hasta su procesamiento.

BUENA  Proviene del sitio de la lesión que

MUESTRA se investiga.
 Cantidad suficiente.
 Envase adecuado.
 Bien identificada.
 Bien conservada.
 Bien transportada.

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De la toma de muestra para tuberculosis pulmonar

Cada establecimiento de salud debe decidir y quién,

organizar cuándo y dónde realizará el procedimiento.

La toma de la muestra se debe hacer en un lugar privado, bien

ventilado e iluminado, evitando riesgos para el resto de los
consultantes y para el equipo de salud.

Casetas toma de Sala de toma de muestras Exterior, en lugar libre

baciloscopías con ventilación adecuada. de público y cómodo y
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privado.
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De la toma de muestra para tuberculosis pulmonar

La petición para el diagnóstico de

tuberculosis se hará en el
Formulario de Solicitud de
investigación bacteriológica de
tuberculosis vigente, el cual
deberá ser llenado con toda la
información requerida, pues esto
permitirá tomar decisiones de
acuerdo al algoritmo diagnóstico
vigente.

En el Libro de Registro y Seguimiento

de Casos Presuntivos de Tuberculosis
se registrará la fecha en que se
recibe la muestra de esputo en el
establecimiento, para luego
enviarla al laboratorio.

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Del procesamiento de las muestras de esputo

• Son motivo de rechazo de muestras en el laboratorio:

• Muestra en descomposición
• Muestra derramada
• Muestra sin rotular

Se realizarán las técnicas bacteriológicas estandarizadas y

aprobadas por el programa y detalladas en el Manual de
procedimientos técnicos para el diagnóstico bacteriológico la
de tuberculosis del Instituto de Salud Pública.

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Del procesamiento de las muestras de esputo

• Se realizará cultivo líquido a todas las muestras que resulten

positivas para M. tuberculosis en la prueba molecular de
inicio, incluidos los resultados con trazas, indistintamente del
resultado de susceptibilidad.

Los laboratorios tipo II y III enviarán los informes de resultados al

lugar de petición del examen en los plazos que se describen a
continuación:
 Prueba molecular: Máximo 48 horas hábiles
 Baciloscopía: Máximo 48 horas hábiles
 Cultivo líquido: Máximo 45 días

Sin embargo, si alguno de los exámenes bacteriológicos resulta positivo, el

laboratorio informará de inmediato al equipo de salud del lugar de
procedencia y al equipo del Nivel Intermedio para proceder a la ubicación del
paciente para consulta médica e inicio del tratamiento.
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Del diagnóstico de resistencia a
fármacos antituberculosos
• Todas las muestras serán sometidas al menos a una prueba de
susceptibilidad para rifampicina a través de las técnicas de
biología molecular.

• Las muestras que resulten positivas para M. tuberculosis,

independiente del resultado de susceptibilidad a rifampicina, se
enviarán además a estudio de susceptibilidad para
isoniacida a los laboratorios intermedios o al LRN según la
capacidad instalada.

• De este modo todos los casos de tuberculosis confirmados por

bacteriología deberán tener el resultado de la susceptibilidad a
rifampicina e isoniacida.

• Todos los cultivos positivos de las muestras que resultaron

resistentes o indeterminados para isoniacida, rifampicina o ambas
en las pruebas moleculares se enviarán al LRN del Instituto de
Salud Pública para realizar vigilancia de la resistencia a fármacos
antituberculosos de primera y segunda línea, según corresponda.
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Del diagnóstico de resistencia a
fármacos antituberculosos

• El LRN emitirá los resultados de diagnóstico y vigilancia de

fármacos antituberculosos al laboratorio intermedio, quien tiene la
responsabilidad de hacer llegar estos resultados al lugar de petición
del examen. Los tiempos de respuesta normados para estos
exámenes son los siguientes:
• Susceptibilidad genotípica (LPA o similar): 7 días hábiles
• Susceptibilidad fenotípica (MGIT o similar): 21 días hábiles

Los resultados de resistencia a rifampicina no requieren

confirmación por el LRN.

Fármacos estudiados PSD genotípica Isoniacida, Rifampicina, Quinolonas

Fármacos estudiados por PSD fenotípica Isoniacida, Moxifloxacino,
Bedaquilina, Clofazimina y Linezolid.

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Del control bacteriológico de tratamiento de tuberculosis
pulmonar

Para el control de tratamiento de tuberculosis pulmonar se debe tomar una

muestra mensual a partir de la fecha del inicio de tratamiento, preferentemente
matinal. Si es necesario se puede solicitar apoyo kinésico para obtener una
muestra. La saliva es permitida en estos pacientes considerando que una vez
en tratamiento el esputo puede no estar presente.
La muestra se debe enviar al laboratorio en conjunto con el Formulario de solicitud
de investigación bacteriológica de tuberculosis indicando el mes de tratamiento.

• Los exámenes bacteriológicos a realizar durante el control de tratamiento son

los siguientes:
• Baciloscopía
• Cultivo líquido

Estas muestras no se registrarán en el Libro de Registro y Seguimiento de Casos

Presuntivos de Tuberculosis.

Los resultados deben registrarse en la Tarjeta de Tratamiento de TB, en el Libro de

Registro y Seguimiento de Pacientes con Tuberculosis y en el Registro Nacional
Electrónico del programa.

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Del diagnóstico bacteriológico de la tuberculosis
extrapulmonar

El diagnóstico de la tuberculosis extrapulmonar es de resorte del especialista

según su localización, el cual solicitará las muestras adecuadas para la
investigación bacteriológica.

Ante sospecha de tuberculosis pleural, las muestras de líquido pleural pueden

ser tomadas por el médico general que atiende al paciente en hospitales de
menor complejidad (punción pleural).

Para el diagnóstico de la tuberculosis extrapulmonar se deben tomar las

muestras de acuerdo a las indicaciones contenidas en el Manual de
Organización y Procedimientos del PROCET, las que deben ser conservadas y
trasladadas en condiciones óptimas hasta su procesamiento.

Todas las muestras extrapulmonares deben ser recibidas y procesadas en el

laboratorio antes de 4 horas desde su recolección para evitar la pérdida de
viabilidad del bacilo por el uso de anestésicos, contaminación de microbiota
asociada y exposición a pH ácidos.

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Del diagnóstico bacteriológico de la tuberculosis
extrapulmonar

• Se debe realizar una prueba molecular inicial de diagnóstico y

cultivo líquido a todas las muestras extrapulmonares a excepción
de muestras de sangre.

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Del diagnóstico bacteriológico de la tuberculosis renal

• Para el diagnóstico de tuberculosis renal se deben tomar 3

muestras de orina a primera hora de la mañana en días
consecutivos y enviar al laboratorio en conjunto con el Formulario
de solicitud de investigación bacteriológica de tuberculosis.

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Del control bacteriológico de la tuberculosis renal

• Los casos en tratamiento por tuberculosis renal tendrán solo un

control bacteriológico al cuarto mes para evaluación del
tratamiento, con un cultivo líquido de una muestra de orina.

• En tuberculosis extrapulmonar de otros sitios no se realiza control

bacteriológico.

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ALGORITMO DIAGNÓSTICO PROCET

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