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INVESTIGACIÓN ORIGINAL
Recibido: 31 de octubre de 2007 / Aceptado: 18 de diciembre de 2007 / Publicado en línea: 3 de enero de 2008
© SpringerVerlag 2007
Resumen El color de ojos humanos es un rasgo cuantitativo que presenta subconjuntos de extractos nucleares. Un solo haplotipo, representado por
herencia multifactorial. Varios estudios han seis SNP polimórficos que cubren la mitad de los 3 extremos.
demostrado que el locus OCA2 es el principal contribuyente a la del gen HERC2 , se encontró en 155 individuos de ojos azules de
variación del color de los ojos humanos. Mediante análisis de vinculación de una gran Dinamarca, y en 5 y 2 individuos de ojos azules
familia danesa, asignamos el lugar del color de ojos azules a un de Turquía y Jordania, respectivamente. Por lo tanto, nuestros datos
Región de 166 Kbp dentro del gen HERC2 . Por asociación sugieren una mutación fundadora común en un inhibidor de OCA2 .
análisis, identificamos dos SNP dentro de esta región que elemento regulador como causa del color de ojos azules en
estaban perfectamente asociados con los colores de ojos azules y humanos. Además, una puntuación LOD de Z = 4,21 entre
marrones: rs12913832 y rs1129038. De estos, rs12913832 es color de cabello y D14S72 se obtuvo en la familia numerosa,
ubicado 21.152 pb aguas arriba del promotor OCA2 en un indicando que RABGGTA es un gen candidato para el cabello
Secuencia altamente conservada en el intrón 86 de HERC2. El color.
H. Eiberg (&) ∙ J. Troelsen ∙ M. Nielsen ∙ A. Mikkelsen ∙ KW Kjaer ∙ de pigmento en el iris (Fig. 1) sugieren la genética del color de ojos
L. Hansen ser mucho más complejo como lo respaldan datos recientes (Eiberg
Departamento de Medicina Celular y Molecular, Sección y Mohr 1996; Sturm et al. 2001; Zhu et al. 2004; Posthuma et al. 2006;
IV Edificio. 24.4, Instituto Panum, Universidad
DuVy et al. 2007). Pérdida de pigmentación
de Copenhague, Blegdamsvej 3b, 2200 Copenhague,
Dinamarca en la piel, el cabello y los ojos, también conocido como oculocutáneo
correo electrónico: he@imbg.ku.dk albinismo, deriva de mutaciones en los genes OCA14
(Sturm et al. 2001). El locus responsable del color marrón o
J. MengelDe
Los fenotipos de color de ojos azules (MIM 227220) se identificaron por
Instituto de Genética Forense, Universidad de Copenhague, Fredrik
V's vej 11, 2100 Copenhague, Dinamarca primera vez mediante vinculación al cromosoma 15q (puntuación LOD multipunto
de Z = 32,2) en la población danesa por Eiberg y Mohr
KW Kjaer ∙ L. Hansen (1996). El locus candidato se asignó a 15q1213.
Centro Wilhelm Johannsen para la Investigación del Genoma Funcional,
Superado por los marcadores D15S156 y D15S144 con una puntuación
Departamento de Medicina Celular y Molecular, Instituto
Panum, Universidad de Copenhague, Blegdamsvej LOD máxima cercana a D15S165 y OCA2 (MIM
3, 2200 Copenhague, Dinamarca 611409) fue sugerido como gen candidato. Subse
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Posteriormente, varios otros estudios de vinculación y asociación Los dromes se han asociado con el albinismo oculocutáneo.
confirmaron que el locus y OCA2 son los principales contribuyentes a o pigmentación reducida (Spritz et al. 1997) en varios
variación del color de los ojos humanos (Sturm et al. 2001; Zhu et al. casos. Se desconoce la función de HERC2 pero el gen
2004; Póstuma et al. 2006; Frudakis et al. 2003) y 74% codifica dominios proteicos funcionales conservados deferentes
de la variación se estimó a un QTL, vinculado a OCA2 involucrado en la espermatogénesis, proteólisis mediada por ubicutina
(DuVy et al. 2007). y transporte intracelular (Yonggang et al. 2000). El
Intentos de identificar las mutaciones BEY/blue en OCA2 El genoma humano codifica entre 3 y 12 pseudogenes HERC2 .
han fracasado (Frudakis et al. 2007), y una variación dentro del la mayoría ubicada en el cromosoma 15q, que tienen complicaciones
Se sugirió que la región de control reguladora proximal de OCA2 era estudios de esta región.
responsable del 90% de la variación de la pigmentación del color de ojos Aquí presentamos evidencia de vinculación y asociación.
(DuVy et al. 2007). estudios que una región en HERC2 contiene un altamente conservado
La función de la proteína OCA2 es ambigua (Rebbeck et al. 2002), y elemento regulador, que es la causa del color de ojos azules
se ha sugerido que es una proteína Na+ /H+. Inhumanos. La influencia de otros loci como el color del cabello, como
antiportador (Ancans et al. 2001; Puri et al. 2000) o un transportador de controlar la variación en el color de ojos marrones, son
glutamato (Lamoreux et al. 1995). Tanto las funciones examinado.
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CFB#6041505) (Eiberg et al. 1989). Sólo familias con SNP polimórficos (Tabla complementaria 1) que fueron
hermanos, que tenían ojos azules y marrones, respectivamente, eran utilizado para análisis de asociación y construcción de haplotipos.
incluidos en el estudio. Los padres y hermanos estaban clasificados como (Tablas 1, 2). Se utilizó la prueba exacta de Fisher para probar
de ojos azules (Fig. 1a) o de ojos marrones (Fig. 1c o d). distribuciones significativas de genotipofenotipo.
individuos. Los haplotipos se construyeron a partir de 100 daneses.
Se seleccionaron tríos de familias informativos, y la mayoría de estos Análisis de ligamiento y construcción de haplotipos.
padres también se incluyeron en los estudios de asociación. Estos
100 triosis representaron 45 familias donde al menos un individuo tenía La región candidata OCA2HERC2APBA2 para BEY1
ojos marrones y 55 familias donde todos los individuos tenían ojos azules. Se mapeó el locus (Eiberg y Mohr 1996) y se construyeron haplotipos
Familias donde el ojo verde y el marrón utilizando los siguientes marcadores STS
No se utilizaron manchas de color segregadas. Los haplotipos fueron y SNP: D15S1002, D15S156, D15S1533, rs4074658,
deducida manualmente del estudio familiar. Se recolectó material de rs1129038, rs10680280, rs3054537, rs10627597 y
control adicional para la secuenciación de ADN de dos D15S1048 (Figura 2). Los SNP se analizaron mediante ADN directo.
familias numerosas danesas del Copenhagen Family Bank. secuenciación o digestiones de enzimas de restricción (cebador de PCR
Cinco individuos de Turquía con ojos azules, cabello negro y Las secuencias están disponibles en la Tabla 1 complementaria). Se
piel clara y dos individuos de Jordania con ojos azules, probaron marcadores adicionales y se encontró que no eran informativos en
pelo negro y piel oscura fueron incluidos en la asociación las familias analizadas (datos no mostrados). Los cálculos de la puntuación
análisis. Además, se examinaron dos personas con heterocromía natal. LOD se realizaron utilizando FASTLINK (SchäVer et al. 1994)
y el color de ojos marrones se consideraba un rasgo dominante
El fenotipo del color de ojos azules se describió como un completo el color de ojos azules. Los familiares del CFG#694 fueron
falta de pigmentación marrón (Fig. 1a), se describió un fenotipo intermedio previamente genotipado con más de 400 marcadores (Eiberg
como “ojo azul con puntos soplados” (Fig. 1b), y Mohr 1996).
un fenotipo de color de ojos marrón intermedio se describió como
avellana con un amplio anillo peripupilar y fue nombrado el secuencia ADN
El fenotipo BEY1 (Fig. 1c) y un color de ojos completamente pigmentado
de color marrón se definieron como el fenotipo BEY2. Cuatro individuos no relacionados que representan el color de ojos azules.
(Figura 1d). fenotipo (Fig. 1a), el fenotipo variante BEY1 con
Todos los individuos en el estudio fueron entrevistados mediante varias manchas marrones (Fig. 1b), el BEY1 (Fig. 1c) y el
cuestionarios y se les pidió que determinaran su propio color de ojos a partir de Se seleccionaron el fenotipo BEY2, respectivamente, (Fig. 1c, d).
las categorías: marrón, azul, gris y verde, y si para la identificación de posiciones de nucleótidos polimórficos en el
Había manchas marrones o anillos peripupilares marrones. Región candidata a BEY mediante análisis de secuencia de ADN. El
Los colores del cabello se clasificaron en rojo, negro, marrón y Tres personas con diferentes fenotipos de color de ojos marrones.
cabello rubio en el momento en que las personas tenían entre 20 y fueron seleccionados de familias, donde puntuaciones LOD superiores a
y 30 años de edad. En la familia CFB#694, el color de ojos de Z = 2,5 para los marcadores D15S1533 y rs10680280 en el
todos los individuos fueron documentados con fotografías y todas las Se logró la región candidata a BEY. El promotor OCA2
personas clave fueron reexaminadas. Todos los individuos con ojos verdes. (Lee et al. 1995) y exón 1, 2, 7 y 10 y exón HERC2
color o color de ojos azul o gris con manchas marrones no localizadas 21, 26, 30, 33, 39, 44–47, 51, 52, 54, 55, 59, 72, 76–78, 85,
cercanos al alumno fueron excluidos de los estudios de vinculación y 87–93, incluida la secuencia 3UTR, se secuenciaron bidireccionalmente.
asociación. El ADN genómico se extrajo de
sangre completa usando procedimientos estándar de fenol/cloroformo Las regiones secuenciadas representaron exones codificantes,
y el estudio se adhirió a los principios de la declaración de incluidos SNP no sinónimos, islas CpG y regiones que codifican dominios
Helsinki. de zinc Wnger o áreas filogenéticamente conservadas.
ubicado en intrones de OCA2 y HERC2 según el
Estudios de asociación Navegador del genoma UCSC (posiciones de cebador y físico)
Las posiciones se dan en la Tabla complementaria 2). Los oligonucleótidos
La búsqueda en la base de datos reveló que la mayoría de los SNP en se diseñaron utilizando el software Primer3 en combinación con
HERC2 muestra bajas frecuencias [q < 0,1, UCSC Human alineamientos de ClustalW para la identificación de
Genome Browser (julio de 2003) y GenBank dbSNP] y secuencias de cebadores únicas. Incluye amplificación por PCR de exones
no fueron incluidos en el estudio de asociación debido a la falta de mínimo 100 pb del sitio de empalme intrónexón. las cartillas
información potente. Muchos de los »2.000 SNP reportados en utilizado para análisis de secuencia de posiciones polimórficas en
HERC2 puede explicarse por variaciones de un solo par de bases HERC2 se presentan en la Tabla 2 complementaria.
entre HERC2 y los pseudogenes HERC2 . Después La PCR se llevó a cabo utilizando condiciones estándar de acuerdo
exclusión de SNP redundantes, pudimos identificar 15 con los protocolos del fabricante, Taq ADN polimerasas.
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Automóvil club británico EN TT GG Georgia Automóvil club británico CC California Automóvil club británico
Sin marrón/azul 10 6 3 91 6 0 59 3 0
Con marrón 15 13 2 35 4 0 15 30 0
P = 0,48 P = 0,47 P = 3,13e–12
Las muestras de ADN representan 150 padres daneses de ojos azules y 46 de ojos marrones recuperadas del Copenhagen Family Bank (CFB). Los valores de p fueron
calculado utilizando la prueba exacta de Fisher
Tabla 2 Haplotipos para 13 SNP diferentes en OCA2 y HERC2 encontrados mediante el examen de 100 tríadas familiares
haplotipo h1 h2 h3 h4 h5 h6 h7 h8 h9 h10
rs7170852 A A T AA AA T A t
rs2238289 t t t t t t t C.C.C.
rs3940272 C C C C C C C un aa
rs8028689 t t t t t t t t C C
rs2240203 A A A GRAMO AAAG _ GRAMO
En las 100 familias sólo se analizaron el padre y la madre. Las familias fueron recuperadas del Copenhagen Family Bank1
a
Los haplotipos #1 a #4 representan individuos con color de ojos azules; Los haplotipos #5 a #10 representan individuos con color de ojos marrones (BEY1 o BEY2)
b
Los valores en cursiva (alelos y números entre paréntesis) representan posibles nuevas mutaciones o recombinantes.
C
Las variaciones en rs1129038 y rs12913832 son comunes en caucásicos y muy raras entre otros grupos étnicos (dbSNP, GenBank, NCBI)
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fueron adquiridos en Qiagen (Hilden, Alemania), nuevos El sitio de inicio de la transcripción de OCA2 se amplificó por PCR utilizando
England Biolabs (Ipswich, MA, EE. UU.) y Applied Biosystem Industries el BamHI que contiene un par de cebadores y ADN genómico de
(Foster City, CA, EE. UU.). Las reacciones fueron una persona de ojos azules (el alelo G de rs12913832) y de
realizado en volúmenes de 15 l que contienen el buVer, 2,5 M una persona de ojos marrones (BEY2) (el alelo A de rs12913832)
dNTP, 10 M de cada cebador, rojo cresol al 0,008% (Sigma (Tabla complementaria 2). Los fragmentos de PCR de 675 pb fueron
Aldrich Co., St Louis, EE. UU.), 12 % de sacarosa (p/v) y 50– clonado en pCR2.1TOPO y secuenciado antes de la subclonación
100 ng de plantillas de ADN. Condiciones de reacción estándar para todos. en pGL4 OCA2 usando el sitio de restricción BamHI aguas arriba
los pares de cebadores fueron: 95°C, 5 min; 40 ciclos 95°C durante 30 s, del promotor OCA2 . Los dos plásmidos se denominaron pGL4.
56,4°C durante 30 s y 72°C durante 1 min; seguido de 5 min en OCA2HERC2azul y pGL4 OCA2HERC2marrón. El
72°C. Las reacciones de PCR se analizaron mediante electroforesis en gel actividad transcripcional del plásmido pGL4 OCA2, pGL4
de agarosa al 2% teñida con bromuro de etidio, 1£ de TBE, OCA2HERC2azul y pGL4 OCA2HERC2marrón fueron
antes de la secuenciación. La secuenciación se realizó según analizado mediante transfección en células Caco2 y COS7 (Remenyi et al.
al protocolo del fabricante utilizando los cebadores de PCR y 2004; Troelsen et al. 2003b), y la luciferasa
BigDye versión 1.1 (Applied Biosystems, Foster City, CA, las actividades se corrigieron para la eficiencia de transfección y se
EE.UU.) sin mayores modificaciones y analizado mediante un normalizaron al nivel de pGL4 OCA2.
Secuenciador ABI370. Los datos de secuencia se analizaron utilizando La preparación de extractos nucleares y EMSA se realizó como se
software estándar (Chromas ver. 2.1, Technelysium Pty describió anteriormente (Troelsen et al. 2003a). El
Ltd, Australia) y se llevaron a cabo alineamientos de secuencias En el ensayo se utilizan los siguientes oligonucleótidos:
utilizando ClustalW. Las digestiones con enzimas de restricción de los Variante A: tcatttgagcattaaatgtcaagttctgcacgc y agcgtg
productos de PCR se separaron mediante electroforesis en gel de agarosa al 2%, 1 £cagaacttgacatttaatgctcaaatg;
TBE. Variante G: tcatttgagcattaagtgtcaagttctgcacgc y agcgtg
cagaacttgacacttaatgctcaaatg
Ensayo de actividad promotora en cultivo celular. Sin especificar: aacgtagctgatcgaatcggttac y agtaaccgattcg
atcagctacgt
La región promotora OCA2 humana posición +80 a ¡435
Se amplificó por PCR utilizando ADN genómico de un animal de ojos marrones.
individuo homocigoto usando el cebador HindIII y KpnI Resultados
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Z = 8,10 ( = 0) cuando los fenotipos BEY2 y BEY1 El alelo rs4778241*A para el haplotipo 1 encontrado en tres
fueron considerados como un fenotipo. Se construyeron haplotipos para personas podría ser una mutación posterior o un evento de recombinación,
cinco microsatélites y cuatro SNP y se revelaron ya que este marcador está cerca de rs4074658. No tenemos
dos eventos de recombinación clave en los individuos II3 y III4, examinó más a fondo esta recombinación. El haplotipo h1 fue
respectivamente. Esto redujo la región candidata a encontrado como el haplotipo común entre las personas de ojos azules
estar entre rs4074658 y rs10602331 (Figs. 2, 3a). de Dinamarca y el haplotipo se encontró además en
siete individuos no relacionados con el fenotipo de ojos azules
Estudios de asociación de Turquía o Jordania y en dos personas con heterocromía natal.
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Las células Caco2 expresan ARNm de OCA2 en su estado diferenciado (http:// Unión diferencial de factores nucleares a las dos variantes.
gastro.imbg.ku.dk/chipchip/, término de búsqueda = OCA2), por lo tanto, Especialmente el complejo Sc3 es más pronunciado usando la sonda del alelo
transfectamos la línea celular de carcinoma de colon humano Caco2 y G en comparación con la sonda del alelo A.
también la línea celular COS7 de Wbroblast de riñón transformada con African
Green Monkey SV40 con las construcciones del promotor OCA2 (Fig. 4a). Asociaciones del color de ojos con el color de cabello.
Ambas líneas celulares pudieron iniciar la expresión del gen indicador a partir
del promotor OCA2 . El promotor OCA2 era aproximadamente 10 veces más La investigación del color de cabello rubio versus oscuro en la familia CFG#694
activo en las células Caco2 en comparación con las células COS7. El demostró una asociación del cabello rubio con el fenotipo BEY1 y una
fragmento HERC2 de 676 pb que incluye rs12913832 redujo la expresión del asociación del color de cabello oscuro con el fenotipo BEY2 (P = 0,0056, Tabla
gen indicador de luciferasa en un 6070% tanto en células Caco2 como en 3). Al analizar el material total, los SNP rs12593529*G y rs7495174*A se
células COS7. En las células Caco2, se observó una diferencia significativa en asociaron con el fenotipo BEY2 (Tabla 3). Un estudio de vinculación en esta
la actividad represora entre el alelo A (marrón) y el G (azul) (P <0,05 Fig. 4a). familia que utilizó más de 400 marcadores versus color de cabello oscuro o
Estos resultados sugieren un elemento regulador conservado en la secuencia rubio dio como resultado una puntuación LOD de Z = 4,21 con = 0,0 para el
del intrón 86 que actúa como silenciador transcripcional con poder regulador marcador D14S72, que está cerca de
Fig. 4 Estudios funcionales de la regulación del promotor OCA2 en cultivos de b El ensayo de cambio de movilidad electroforética del elemento conservado
células COS7 y Caco2. a Las secuencias del promotor OCA2 y del intrón HERC2 demostró la unión de los factores nucleares de las células Caco2 tanto al alelo A
de individuos de ojos azules y marrones se insertaron en un plásmido del gen (ojo marrón) como al alelo G (ojo azul). Se añadieron oligonucleótidos no
indicador de borrado de lucif (pGL4.10) y se transfectaron en células COS7 o marcados para demostrar la unión específica a ambas variantes. Los complejos
Caco2. Las actividades de luciferasa medidas se corrigieron para determinar la específicos se indican mediante Sc13. Nosotros indicamos un complejo
eficiencia de transfección y se normalizaron con respecto a la expresión de pGL4 inespecífico.
OCA2 en células COS7, N = 4. Los valores de P se calcularon con la prueba T de Student.
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Tabla 3 Asociación entre 5 SNP y los dos fenotipos de ojo marrón BEY1 y BEY2
bey1 bey2
Marrón 1 6
El número de individuos para los dos fenotipos BEY1 y BEY2 representa personas normales no relacionadas y el número entre paréntesis representa el
Número de niños hasta los primeros 4 años con ojos marrones. Las asociaciones más significativas para BEY1 y BEY2 se encuentran en rs12593529 y el color del cabello en
familia CFB#694
Los valores de p se calcularon utilizando la prueba exacta de Fisher.
loci potenciales para el fenotipo de color de ojos azul/marrón. El rs12913832 se encuentra dentro de un elemento regulador
El locus candidato se asignó a 15q1213 Xanked por el que inhibe la expresión de OCA2
marcadores D15S156 y D15S144 con un Zmax cercano a
marcador D15S165. Este locus incluía el gen OCA2 , Nuestro estudio de asociación sugiere tanto rs1129038*A como
que fue propuesto como el gen candidato para el BEY2 rs12913832*G como mutaciones candidatas preferibles responsables del
fenotipo. fenotipo de color de ojos azules. La fuerte conservación entre especies
En este estudio, hemos minimizado la región candidata para propone la región del ADN donde
pigmentación del iris marrón/azul mediante análisis de ligamiento a 1,1 Mb rs12913832*G está ubicado para tener importantes funciones regulatorias.
intervalo Xanked por los marcadores rs4074658 y rs10602331 Esto está respaldado por el potencial regulatorio de ESPERR.
y luego a un fragmento de 166 Kbp Xanked por los SNP presentado por el navegador del genoma UCSC (Fig. 5a). Nosotros
rs4074658 y rs2240203 por construcción de haplotipos dentro mostró que una secuencia de 676 pb, que representa el HERC2
los tríos investigados. Este fragmento incluye el OCA2. intrón 86 que alberga rs12923832, redujo la expresión de
intrón 1 y el promotor OCA2 y la región intergénica el gen indicador de luciferasa 6070% ambos en células Caco2
más el tercer extremo de HERC2 hasta el intrón 20 (Tabla 1; Fig. 3b). y células COS7, cuando estaba bajo el control del promotor OCA2 (Fig.
4a). Estos resultados apoyan una función reguladora.
Un haplotipo compartido entre individuos de ojos azules es casi perfecto de OCA2 para este elemento y esta función reguladora se conserva entre
y sugiere que el fenotipo del color de ojos azules es causado por una especies (Tabla 4). El rs1129038*A y
mutación fundadora. Los alelos rs12913832*G demostraron diferentes regulaciones.
Efectos sobre la actividad del promotor OCA2 en células Caco2, y
Más del 97% de las personas de ojos azules analizadas portaban el esto está respaldado por el estudio de EMSA donde diferentes enlaces
haplotipo h1 y el 3% restante portaba el haplotipo h1. AYnidades de los factores nucleares Caco2 con el azul y el marrón.
haplotipos h2, h3 y h4 (Tabla 2). El origen de estos Se mostraron los alelos. Esto infiere que los dos alelos tienen
tres haplotipos podrían explicarse por recombinación diferentes actividades reguladoras de genes in vivo para los dos alelos;
eventos o mutaciones de menor edad que la mutación original. Siete sin embargo, dadas las grandes diferencias en el OCA2 observado
individuos no emparentados de origen mediterráneo actividad en dos tipos de células utilizadas en el estudio, esto habría
con ojos azules portaba el haplotipo h1 en ambos cromosomas, lo que destinado a experimentos con melanocitos humanos.
sugiere que este haplotipo es idéntico para el azul La búsqueda del posible elemento regulador en la secuencia
individuos oculares en otras poblaciones humanas. conservada reveló la unión transcripcional
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Fig. 5 Presentación gráfica de la región altamente conservada del intrón 86 de el navegador del genoma UCSC y HapMap CEU). b Un modelo hipotético para el
HERC2 . a La curva superior muestra los potenciales reguladores de ESPERR y complejo silenciadorpromotor (T) para la regulación de la actividad del gen OCA2 .
la parte inferior muestra el área de conservación entre especies (adaptado de El alelo rs12593929*G en el intrón 90 está asociado con el fenotipo BEY2 (Tabla
UCSC Human Genome Browser). Tres SNP diferentes están representados en la 4) y puede interferir con la actividad del complejo de unión.
región, pero solo el alelo rs12913832*G está 100% asociado con el alelo azul (P =
0,792 en el material CEPH de
Tabla 4 Conservación de la secuencia del silenciador del color de ojos en el intrón 86 de HERC2 en 9 especies diferentes
Las secuencias de ADN de las 9 especies provienen del navegador del genoma de la UCSC (mayo de 2006). Las secuencias sombreadas en gris representan la región
del sitio de unión y el nucleótido G o A en negrita en el área gris representa la variación encontrada entre el color de ojos azul y marrón. Nkx2.5 coincide con la secuencia
azul (puntuación 0,99) y CdxX1 coincide con las secuencias marrón (puntuación 0,92) y azul (puntuación 0,87) analizadas por TFSEARCH
secuencia TAAATGTCAA (coincidencia 0.92, el alelo A (TAAGTGTCAA, coincidencia 0,98, el alelo G está en negrita).
rs12923832 está en negrita) para el factor de transcripción del Dado que Cdx1 y Nkx2.5 se expresan en el intestino y el
homeodominio Cdx1, y el alelo G correspondiente da como corazón, respectivamente, no es probable que participen en el
resultado una unión rápida al factor de transcripción del homeodominio
desarrollo
Nkx2.5 y la regulación de los melanocitos del iris. Este
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indica que los melanocitos del iris expresan otros factores de transcripción Se ha descrito la asociación o vinculación entre BEY2 y /HCL3 (color
de homeodominio implicados en la actividad reguladora de la región de cabello castaño) (Eiberg y Mohr 1996; DuVy et al. 2007), pero los
conservada rs12923832. Estas diferencias en la afinidad de unión al factor resultados apuntan hacia otros loci no vinculados a OCA2HERC2 (DuVy
nuclear mediante un cambio de G a A en la secuencia de reconocimiento et al. 2007). Los candidatos para estos loci son MATP y MC1R , donde
pueden explicar por qué el complejo silenciadorpromotor implicado en la se asocian
regulación del gen OCA2 puede cambiar la conformación y, por tanto, la Se ha encontrado una relación con el color del cabello humano (Remenyi et al.
actividad (Heinemeyer et al. 1998 ; Carter et al. 1998 ). otros 2002). 2004). Curiosamente, también los fenotipos BEY2 muestran asociación
con rs7495174*A (P = 0,0018) y rs12593529*G (P = 0,0010) en los loci
El alelo SNP rs12593529*G asociado con BEY2 OCA2HERC2 (Tabla 3), lo que sugiere fuertemente que la variación del
El fenotipo (Tabla 3) se encuentra en el intrón 90 de HERC2 entre el ADN en esta región está asociada con el fenotipo BEY2 (Eiberg y Mohr
promotor OCA2 y rs12923832 (Fig. 5b). Este SNP puede tener un efecto 1996).
estabilizador o desestabilizador sobre el complejo silenciadorpromotor
OCA2 propuesto . Curiosamente, el rs7495174*A en el intrón 1 de OCA2 El origen de la mutación fundadora.
se asoció con rs12593529*G (Tabla 3) y sugiere un haplotipo común para
aproximadamente el 30 % de los individuos con fenotipo BEY2. Las mutaciones responsables del color de ojos azules probablemente se
originan en la zona más cercana o en la parte noroeste de la región del
Mar Negro, donde tuvo lugar la gran migración agrícola hacia la parte norte
de Europa en el Neolítico, hace unos 6 a 10.000 años (Cavalli Sforza y
DiVerentes fenotipos de color de ojos marrones otros 1994).
Se encuentra que el SNP rs12913832 está asociado con el La alta frecuencia de individuos de ojos azules en las zonas
color de ojos marrones y azules, pero esta única variación de ADN no escandinavas y bálticas indica una selección positiva para este fenotipo
puede explicar toda la variación del color de ojos marrones, desde marrón (CavalliSforza et al. 1994; Myant et al.
oscuro sobre avellana hasta ojos azules con manchas marrones. 1997). Se han sugerido varias teorías para explicar la selección evolutiva
Todos los individuos portadores de los fenotipos BEY1 y BEY2 en la de los rasgos de pigmentación que incluyen la exposición a los rayos UV
familia CFG#694 (Fig. 2) compartieron los mismos dos haplotipos h5 y que causa cáncer de piel, la deficiencia de vitamina D y también se ha
h1. Además, todos los individuos de ojos marrones compartieron una mencionado la selección sexual. La selección natural, como se sugiere
región de 7,6 Mbp que incluye toda la región codificante de OCA2 desde aquí, hace difícil calcular la edad de la mutación.
D15S113 a D15S144 (chr15: 23,8–31,4 Mbp) pero excluye cualquier
secuencia reguladora ubicada en el exón 1 de OCA2 y la región promotora
aguas arriba para el Variaciones de color de ojos marrones y cabello
castaño en esta familia. Un estudio reciente de DuVy et al. (2007) Conclusión
mostraron una asociación del 90 % con los tres alelos SNP (TGT) en el
intrón 1 de OCA2 para el color de ojos azules humanos. Esta región puede En conclusión, hemos identificado un elemento regulador conservado
tener una función reguladora en la variación del color de ojos marrones, dentro del intrón 86 del gen HERC2 que está perfectamente asociado con
pero es más probable que el haplotipo TGT para estos SNP esté asociado el color de ojos marrón/azul en individuos estudiados de Dinamarca,
con el haplotipo h1 identificado para el gen HERC2 encontrado en este Turquía y Jordania. Este elemento tuvo un efecto inhibidor sobre la
estudio. actividad del promotor OCA2 en cultivos celulares, y se demostró que los
alelos azul y marrón se unen a subconjuntos no idénticos de extractos
Sin embargo, nuestros datos para la familia CFB#694 no estaban de nucleares. En total, todos estos datos respaldan firmemente un modelo en
acuerdo con las variaciones marrones controladas por los alelos en el el que el color de ojos azules en los seres humanos es causado por la
intrón 1 de OCA2 , ya que las personas que tienen diferentes fenotipos de homocigosidad del alelo rs12913832*G.
ojos marrones portan haplotipos OCA2HERC2 idénticos.
Los estudios de los fenotipos BEY1 y BEY2 mostraron asociación entre
el cabello rubio y BEY1 y asociación
entre el color de cabello oscuro y BEY2 (P = 0,0056, Tabla 3). Recursos web
123
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ClustalW, http://www.ebi.ac.uk/clustalw/ (para alineación de Heinemeyer T, Wingender E, Reuter I, Hermjakob H, Kel AE, Kel OV, Ignatieva
EV, Ananko EA, Podkolodnaya OA, Kolpakov FA et al (1998) Bases de
secuencias)
datos sobre regulación transcripcional: TRANSFAC, TRRD y COMPEL.
Prueba exacta de Fisher, http://home.clara.net/sisa/Wsher.htm Ácidos nucleicos Res 26:364–370
(prueba de distribuciones significativas de genotipofenotipo) Lamoreux ML, Zhou BK, Rosemblat S, Orlow SJ (1995) La proteína de dilución
GenBank dbSNP, http://genome.ucsc.edu/cgibin/hgGateway con llave y el interruptor eumelanina/feomelanina: en apoyo de una
hipótesis unificadora. Pigment Cell Res 8:263–270 Lee ST, Nicholls
(para el contig genómico del cromosoma 15 de Homo sapiens
RD, Jong MT, Fukai K, Spritz RA (1995). Organización y secuenciación del
[número de evaluación NT_010280]) OCA2 (NM_000275), HERC2 gen P humano e identificación de una nueva familia de proteínas
(NM_004667) transportadoras. Genomics 20:354–63 Lehman AL,
SNP de HapMap, http://genome.cse.ucsc.edu/cgibin/ Nakatsu Y, Ching A, Bronson RT, Oakey RJ, KeiperHrynko N, Finger JN,
DurhamPierre D, Horton DB (1998) Una proteína muy grande con
hgPistas (para SNP en los genes OCA2 y HERC2 )
diversos motivos funcionales es deficiente en Ratones rjs (enanos,
Herencia mendeliana en el hombre en línea (OMIM), http://
espasmódicos, estériles). Proc Natl Acad Sci EE.UU. 95:9436– 9441
www.ncbi.nlm.nih.gov/Omin/ (para OCA2 y HERC2).
Primer3 , http://frodo.wi.mit.edu/cgibin/primer3/primer3_www.cgi Myant NB, Fobes SA, Day INM, Gallagher J (1997) Estimación de la edad de
Ancestral Argenine3500 . Mutación de glutamina en ApoB100 humana.
(para construcción de imprimación)
Genomic 45:78–87 Novak EK,
TFSEARCH, http://www.cbrc.jp/research/db/TFS EARCH.html Reddington M, Zhen L, Stenberg PE, Jackson CW, McGarry MP, Swank RT
(para determinar los sitios de unión de un factor de transcripción a (1995) Trombocitopenia hereditaria causada por una producción reducida
una secuencia de ADN específica) de plaquetas en ratones con la mutación del gen del pigmento bronce.
Sangre 85:1781–1789
La base de datos de objetivos del factor de transcripción intestinal
Posthuma D, Visscher PM, Willemsen G, Zhu G, Martin NG, Slagboom PE,
http://gastro.imbg.ku.dk/chipchip/, término de búsqueda = OCA2 de Geus EJ, Boomsma DI (2006). Vinculación replicada para el color de
UCSC Human Genome Browser (julio de 2003 y mayo de 2006) ojos en 15q utilizando calificaciones comparativas de pares de hermanos.
Comportamiento Genet 36:12–17
http://genome.cse.ucsc.edu/cgibin/hgGateway?org= human (para
Puri N, Gardner JM, Brillante MH (2000). pH aberrante de melanosomas en
detecciones de SNP, regiones conservadas, exonesintrones en
melanocitos mutantes de dilución de ojos rosados (P) . J Invest Dermatol
OCA2, gen HERC2 y cromosoma 15). 115:607–613
Rebbeck TR, Kanetsky PA, Walker AH, Holmes R, Halpern AC, Schuchter LM,
Agradecimientos Nos gustaría agradecer a Karin U. Hansen por su asistencia Elder DE, Guerry D (2002). Gen P como biomarcador heredado del color
técnica. El proyecto contó con el apoyo financiero de la Fundación Danesa de de ojos humanos. Biomarcadores de epidemiol del cáncer Anterior 11:782–
Investigación (JN 22020208). El Centro Wilhelm Johannsen es establecido 784 Remenyi A,
por el Centro Nacional de Investigación Danés. Scholer HR, Wilmanns M (2004). Control combinatorio de la expresión génica.
Nat Struct Mol Biol 11:812–815 Russell LB, Montgomery
CS, Casheiro NLA, Johnaso DK (1995)
Referencias Análisis de complementación de 45 mutaciones que abarcan el locus de
dilución de ojos rosados del ratón. Genética 141:1547–1562 SchäVer
Ancans J, Tobin DJ, Hoogduijn MJ, Smit NP, Wakamatsu K, Thody AJ (2001). AA, Gupta SK, Shriram K, Cottingham RW Jr (1994).
El pH melanosomal controla la tasa de melanogénesis, la relación Recálculo en análisis de vínculos. Hum Hered 44:225–237 Spritz
eumelanina/feomelanina y la maduración del melanosoma en melanocitos RA, Bailin T, Nicholls RD, Lee ST, Park SK, Mascari MJ, Butler MG (1997).
y células de melanoma. Exp Cell Res 268:26–35 Carter D, La hipopigmentación en el síndrome de PraderWilli se correlaciona con
Chakalova L, Osborne CS, Dai YF, Fraser P (2002). Interacciones reguladoras la deleción del gen P pero no con el haplotipo del alelo P hemicigótico.
de la cromatina de largo alcance in vivo. Nat Genet 32:623–626 Cavalli Am J Med Genet 71:57–62 Sturm RA, Teasdale RD,
Sforza LL, Box NF (2001) Genes de pigmentación humana; Identificación, estructura y
Menozzi P, Piazza A (1994). La historia y geografía de los genes humanos. consecuencias de la variación polimórfica. Gen 277:49–62
Princeton University Press, Princeton DuVy DL, Box NF, Chen W,
Palmer JS, Montgomery GW, James MR, Hayward NK, Nicholas G, Martin NG, Toyofuku K, Valencia JC, Kushimoto T, Costin GE, Virador VM, Vieira WD,
Sturm RA (2007). Un haplotipo de polimorfismo de tres nucleótidos en el Ferrans VJ, Hearing VJ (2002). La etiología del albinismo oculocutáneo
intrón 1 de OCA2 explica la mayor parte de la variación del color de los (OCA) tipo II: la proteína rosa modula el procesamiento y transporte de la
ojos humanos. Am J Hum Genet 80:241–252 Eiberg H, Mohr J (1996). tirosinasa. Res. de células pigmentarias 5:217– 224
Asignación
de genes que codifican el color de ojos marrones (BEY2) y el color de cabello Troelsen JT, Mitchelmore C, Olsen J (2003a) Un potenciador activa el promotor
castaño (HCL3) en el cromosoma 15q. Eur J Hum Genet 4:237–241 de la lactasa florizina hidrolasa de cerdo en las células intestinales.
Gen 305:101–111
Eiberg H, Nielsen LS, Klausen J, Dahlén M, Kristensen M, Bisgaard ML, Møller Troelsen JT, Olsen J, Møller J, Sjöström H (2003b). Un polimorfismo
N, Mohr J (1989). Vinculación entre la colina sérica terasa 2 (CHE2) y el ascendente asociado con la persistencia de la lactasa ha aumentado la
grupo de genes cristalinos (CRYG): asignación al cromosoma 2. Clin actividad potenciadora. Gastroenterología 125:1686–
Genet 35:313321 Frudakis T, Thomas M, Gaskin Z, 1694 Yonggang J, Rebert NA, Joslin JM, Higgins J, Schultz RA, Nicholls RD
Venkateswarlu K, Chandra KS, Gin jupalli S, Gunturi S, Natrajan S, (2000). Estructura del gen HERC2 altamente conservado y de múltiples
Ponnuswamy VK, Ponnuswamy KN (2003). Secuencias asociadas a la parálogos parcialmente duplicados en humanos. Genome Res 10:319–
pigmentación del iris humano. 329 Zhu G,
Genetics 165:2071–2083 Evans DM, DuVy DL, Montgomery GW, Medland SE, Gillespie NA, Ewen KR,
Frudakis T, Terravainen T, Thomas M (2007) Los genotipos multilocus OCA2 Jewell M, Liew YW, Hayward NK, et al (2004). Una exploración del
especifican los colores del iris humano. Hum Genet 122:311–326. genoma para determinar el color de ojos en 502 familias de gemelos: la
doi:10.1007/s0043900704018 mayor variación se debe a un QTL en el cromosoma 15q. Res. gemelo 7:197–210
123