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instrumentales I
TEORÍA DE BIOQUÍMICA
YAIZA HORNA GONZÁLEZ, 1º BIOTECNOLOGÍA
Tema 1: técnicas instrumentales
como ciencia.
1.1) Técnicas instrumentales.
Una ciencia es un conjunto de conocimientos metódica y sistemáticamente agrupados
en una serie de preceptos lógicos o leyes, que tienen como objeto conocer, cambiar o
predecir todo lo que nos rodea (medio externo), así como lo que sucede en nuestro
interior (medio interno).
Métodos clásicos.
Una vez que tenemos los analitos separados por métodos clásicos podemos hacer
diferentes tipos de análisis:
Análisis cualitativos: los componentes separados se trataban con reactivos que
originaban productos que se podían identificar por su color, por sus temperaturas
de ebullición o de fusión, sus solubilidades en una serie de disolventes, sus olores,
sus actividades ópticas o por sus índices de refracción. Saber si está.
Análisis cuantitativos: la cantidad de analito se determinaba mediante mediciones
gravimétricas (masa del analito) o volumétricas (volumen o la masa de un reactivo
estándar necesario para reaccionar por completo con el analito). Saber cuánto hay.
Métodos instrumentales.
A principios del siglo XX, los científicos empezaron a explotar fenómenos distintos de
los usados en los métodos clásicos (métodos químicos) para resolver problemas
analíticos.
La medición de propiedades físicas del analito empezó a usarse en el análisis
cuantitativo: conductividad, potencial de electrodo, absorción de la luz o emisión de la
luz, relación masa/carga y fluorescencia.
1.3) Instrumentos.
Un instrumento para análisis convierte la información acerca de las características
físicas o químicas de un analito en datos que puede manipular e interpretar el ser
humano.
EJEMPLO:
Un espectro de masas se obtiene por conversión de los componentes de una
muestra en iones gaseosos que se mueven rápidamente y se separan en función
de su relación masa-carga.
1.4) Proceso analítico.
Conjunto de operaciones que se inicia con el planteamiento de un problema analítico y
finalizan con la obtención de unos resultados que satisfacen las exigencias del
problema planteado.
Análisis: proceso físico o químico por el cual se obtiene información acerca de los
constituyentes de una muestra o de la muestra por sí misma.
Determinación: realización de las operaciones necesarias durante el proceso de
análisis para obtener información sobre la identidad, la cantidad o las propiedades
del analito o analitos de interés.
La realización de esta determinación requiere de la medida de una o varias de las
propiedades físicas o químicas de los analitos.
Medida: evaluación cuantitativa de una propiedad física o química de un
determinado analito.
Técnica analítica: principio físico o químico que puede ser utilizado para analizar
una muestra, u obtener información sobre el analito.
Método: aplicación concreta de una técnica analítica para el análisis de una
muestra definida y la obtención de una información determinada. Incluye todas las
operaciones implicadas hasta la obtención del resultado final.
Procedimiento: conjunto de directrices escritas que explican cómo aplicar un
método a una muestra en particular. Más concreto que el método. El usuario posee
conocimientos previos de la metodología y no proporciona un detalle exhaustivo.
Protocolo: contiene detalles específicos que no recoge el procedimiento, y que
deben seguirse sin excepción si se pretende que los resultados analíticos sean
aceptados para un propósito particular.
Verificación y validación.
Verificación:
Es la acción de comprobar que lo que decimos que estamos haciendo lo estamos
haciendo.
Validación:
Esto es lo que confirma que lo que estamos haciendo se está haciendo bien y se
consigue el objetivo pretendido.
Mantenimiento equipos.
La mayoría de las técnicas instrumentales quedan en una de las tres áreas principales:
espectroscopía, electroquímica y cromatografía.
Aunque también existen otras técnicas importantes, como la espectrometría de masas
o el análisis térmico, que no se ajustan convenientemente a estas clasificaciones.
Las técnicas analíticas están basadas en interacciones de materia y energía.
Aprovecha la interacción de la materia con alguna forma de energía y se utiliza un
instrumento más o menos complejo para cuantificar el valor de alguna propiedad física
o fisicoquímica del sistema objeto de análisis, la cual es dependiente de la
concentración de analito de interés.
Esta medida de la propiedad física o fisicoquímica se denomina señal analítica.
Tipos de técnicas instrumentales a estudiar: ópticas (espectroscópicas y no
espectroscópicas), electroquímicas, magnéticas, térmicas, radioquímicas y
técnicas de separación.
Para cada uno de los niveles energéticos, los átomos, iones o moléculas que
constituyen la materia sólo pueden adoptar determinados estados, caracterizados por
cantidades discretas de energía.
En ausencia de estímulo las especies químicas que constituyen la materia se
encuentran predominantemente en su estado energético más bajo, denominado
estado fundamental o basal.
La aplicación de determinados estímulos (energía térmica, radiación electromagnética,
reacción química) puede producir la absorción de energía por parte de las especies
químicas presentes en la muestra. Si ésta coincide exactamente con la energía
necesaria para llevar a la especie química en cuestión desde el estado fundamental
hasta alguno de los niveles energéticos superiores se promueve una transición a un
estado de mayor energía (estado excitado).
Rayos X.
Aplicaciones.
Instrumentación.
A) FUENTE DE RADIACIÓN:
Como fuente de radiación se utilizan lámparas de filamento de wolframio, diodos
fotoemisores e incluso, en nefelometría, donde es importante que la fuente sea de
gran potencia radiante, se emplean tubos láser, con mezcla de helio-neón o helio-
cadmio.
B) SELECTOR DE LA LONGITUD DE ONDA:
En nefelometría al ser la radiación incidente de igual longitud de onda que la
detectada, solo es necesario un sistema monocromador, aunque la mayoría de los
aparatos tienen dos.
En ambas técnicas, pero sobre todo en turbidimetría (donde la radiación incidente se
transmite a lo largo de la muestra), hay que evitar la absorción de la radiación. La
longitud de onda debe seleccionarse adecuadamente para que la absorción del medio
se reduzca al mínimo.
Como selectores de longitud se onda se utilizan filtros o monocromadores.
MONOCROMADORES:
Los monocromadores descomponen una radiación policromática, dispersando las
diferentes longitudes de onda que la forman; a partir de esta dispersión se puede
seleccionar una radiación monocromática de longitud de onda deseada.
Estos dispositivos permiten variar de forma continua la longitud de onda de la
radiación que incide sobre la muestra, realizando así un barrido del espectro.
Constan de:
Rendija de entrada.
Lente o espejo colimador: que produce un haz de radiación paralelo.
Elemento dispersor:
Prisma que actúa por refracción.
Red que da lugar a la difracción de la radiación incidente produciendo en ambos
casos la dispersión de la radiación en las longitudes de onda que la componen.
Las redes de difracción ofrecen mejores prestaciones que los prismas y cada vez
son más empleados en la actualidad.
Lente o espejo de enfoque: dirige y enfoca la radiación sobre el siguiente
elemento.
Rendija de salida: aísla la longitud de onda deseada.
La dispersión o difracción sólo es controlable si la luz está colimada, es decir, si todos
los rayos de luz son paralelos, o prácticamente.
Una fuente, como el sol, que está muy lejos, proporciona luz colimada.
La fuente de luz en un equipo está cerca y un sistema óptico en el monocromador
convierte la luz divergente de la fuente en luz colimada.
C) CELDAS PARA LA MUESTRA:
Las celdas para la muestra pueden tener diferentes formas y tamaños. Generalmente
son prismáticas o cilíndricas y suelen ser de vidrio, con tapón roscado. Habitualmente
llevan una línea indicando hasta dónde deben llenarse.
D) DETECTOR:
Muchos aparatos pueden usarse indistintamente para medidas turbidimétricas y
nefelométricas, por lo que viene equipados con dos detectores, una en línea con la
fuente de radiación para medir la luz transmitida y otro situado en un ángulo
determinado, para captar la radiación dispersada. Los detectores suelen ser tubos
fotomultiplicadores.
FOTOMULTIPLICADOR:
Es un dispositivo que permite detectar luz con alta sensibilidad. Consta básicamente
de un elemento (fotocátodo) en donde, por efecto fotoeléctrico, se produce un electrón
(fotoelectrón) que es acelerado hacia una serie de electrodos (dinodos) debido al
campo eléctrico creado por una tensión suministrada externamente.
Este fotoelectrón inicial va siendo multiplicado en las distintas etapas a su paso por los
dinodos obteniéndose en el último de ellos (ánodo) una corriente apreciable que sobre
una resistencia de carga adecuada puede formar un impulso de tensión detectable.
El efecto fotoeléctrico es la expulsión o emisión de electrones de los átomos de un
metal cuando sobre él incide una luz (radiación electromagnética), liberándolos de
la atracción de su átomo.
Aplicación.
FUENTES CONTINUAS:
Emiten radiación en un amplio rango de longitud de onda de la misma potencia o
intensidad.
Este tipo de fuentes se usa ampliamente en la espectroscopía de absorción y de
fluorescencia.
En el caso de la región UV, la fuente más común es la lámpara de deuterio.
Las lámparas de arco de alta presión llenas de gas, que puede ser argón, xenón o
mercurio, se usan cuando se requiere una fuente muy intensa.
En el caso de la región visible del espectro normalmente se utiliza la lámpara con
filamento de tungsteno.
Las fuentes comunes infrarrojas son sólidos inertes calientes a de 1500 a 2000K,
una temperatura a la cual la salida máxima radiante ocurre de 1.5 a 1.9µm.
FUENTES DISCONTINUAS O DE LÍNEAS:
Emiten un número determinado de bandas de radiación, un intervalo determinado de
longitudes de onda. Las fuentes que emiten unas cuantas líneas discretas también
tienen gran aceptación en la espectroscopía de absorción atómica, la espectroscopía
de fluorescencia atómica y molecular y la espectroscopía Raman (en la refractometría
y la polarimetría también se usan fuentes de líneas).
Las conocidas lámparas de mercurio y de sodio proporcionan unas cuantas líneas
nítidas en las regiones UV y visible, y se usan en varios instrumentos
espectroscópicos.
Las lámparas de cátodo hueco y las de descarga sin electrodo son las fuentes de
líneas más importantes para los métodos de absorción atómica y de fluorescencia.
FUENTES LÁSER (LIGHT AMPLIFICATION BY STIMULATED EMISSION OF
RADIATION):
Los rayos láser producen haces de radiación especialmente estrechos, de sólo unas
cuantas centésimas de micrómetro, pero muy intensos. Genera un haz de radiación
altamente monocromática con ancho de banda de 0.01nm o menos y con coherencia
notable.
Los láseres son utilizados como fuentes debido a que tienen una gran intensidad, una
pequeña anchura de banda y una naturaleza coherente en sus señales de salida.
Los rayos láser se han convertido en fuentes importantes que se usan en las regiones
UV, visible e IP del espectro.
DENSIDAD ÓPTICA:
Es la absorbancia por unidad de longitud que recorre a luz al atravesar la sustancia
para una longitud de onda dada.
Donde L corresponde al espesor de la muestra.
Instrumentación.
Aunque el paso óptico más habitual es de 10mm, se pueden encontrar cubetas con
pasos ópticos desde 1 hasta 100 mm, para muestras que presentan muy altas o
muy bajas absorbancias específicas respectivamente.
Con objeto de disminuir costes, es habitual encontrar cubetas con dos caras
paralelas perfectamente pulidas y transparentes, para alinear con la fuente de
radiación y el detector, y las otras dos traslúcidas o rayadas, que son por las que se
debe sujetar la cubeta.
Si algún componente de la muestra de análisis es muy volátil, la evaporación puede
provocar cambios en la absorbancia, o bien afectar a algún componente del
instrumento, por lo que se recomienda en estos casos la utilización de cubetas con
tapones.
Las microcubetas permiten el análisis de pequeñas cantidades de muestra. En este
caso hay que asegurarse de que coincida el haz de radiación incidente con el
compartimento donde se contiene la muestra.
Las celdas de flujo permiten bien el análisis continuo de un efluente, o bien se
utilizadas en un proceso automatizado que incluye el llenado, el vaciado y la
limpieza de la celda por medio de un módulo robotizado.
Existen celdas para muestras gaseosas, con forma cilíndrica y entrada y salida para
la muestra, y la posibilidad de varios pasos ópticos.
DENOMINACIONES:
Espectroscopio: instrumento óptico para la evaluación visual de espectros en la
región visible.
Espectrógrafo: incorpora algún tipo de sensor para obtener la imagen del
espectro, por ejemplo mediante una emulsión fotográfica o más modernamente con
sensores que proporcionan una imagen digital.
Fotómetro: aunque es un término desaconsejado por la IUPAC, se suele designar
con él a los instrumentos sencillos, dotados de filtros para la selección de la longitud
de onda y un fototubo como detector. Suelen ser robustos, económicos y de fácil
manejo.
Colorímetro: aunque tradicionalmente se ha designado así a instrumentos muy
simples en los que el detector era el ojo humano, hace referencia en la práctica a
un fotómetro de absorción que trabaja en la región visible del espectro.
Espectrómetro: instrumento con uno o varios detectores que permiten la medida
de la intensidad de la radiación electromagnética incidente, proporcionando así una
medida cuantitativa. Según la IUPAC un espectrómetro secuencial mide la
intensidad de varias bandas espectrales secuencialmente, mientras que un
espectrómetro simultáneo proporciona al mismo tiempo la medida correspondiente
a una región espectral (mediante el empleo, por ejemplo, de detectores de
fotodiodos en serie).
Espectrofotómetro: aunque tampoco se aconseja su uso por la IUPAC, se utiliza
ampliamente para designar al instrumento más sofisticado que el fotómetro, dotado
de monocromador para la selección de la longitud de onda, así como sistemas de
detección de mayor sensibilidad. En la práctica esta denominación es la que se
suele aplicar a los espectrómetros que trabajan en las regiones UV, visible e IR.
Aplicación.
Fundamento.
Instrumentos.
Aplicaciones.
Fundamento.
Aplicación fluorescencia.
Aplicación quimioluminiscencia.
En otros casos se utiliza una corriente eléctrica para producir la transformación del
analito mediante un proceso de oxidación o reducción, pudiéndose medir bien la
cantidad de analito en la muestra directamente por pesada (electrogravimetría) o bien
la cantidad de electricidad necesaria para llevar a cabo la reacción (coulombimetría).
4.2) Potenciometría.
Fundamento.
Instrumento.
Aplicaciones.
Fundamento.
Instrumento.
Como ventaja se presenta como una técnica sencilla, con gran facilidad de aplicación,
de respuesta rápida, económica y que apenas requiere mantenimiento.
La mayor limitación de esta técnica es su falta de selectividad: la conductividad de una
disolución se debe a la contribución de todas las especies iónicas presentes.
Las aplicaciones prácticas de estas medidas pueden ser agrupadas en dos grupos:
Conductimetría directa: medida de la conductividad de una muestra, evaluando
de esta forma la cantidad global de especies iónicas en disolución. Se aplica a:
sólidos totales disueltos en soluciones acuosas, salinidad y dureza del agua.
Valoraciones conductimétricas: se utilizan para poner de manifiesto el punto final
de una valoración, en sustitución de los indicadores visuales.
4.4) Electrogravimetría.
Fundamento.
Instrumentación.
Los electrodos son usualmente de platino, aunque pueden usarse también electrodos
de cobre, latón, acero inoxidable, grafito y otros metales.
Los electrodos de platino tienen la ventaja de ser relativamente no reactivos y pueden
ser calcinados para eliminar materia orgánica, residuos o gases que tendrían efectos
perjudiciales sobre las propiedades físicas del depósito.
Hay ciertos metales, como el bismuto, zinc y galio, que no pueden ser depositados
directamente sobre platino ya que causan un deterioro permanente en el electrodo.
El platino debe ser protegido siempre con una capa de obre electrodepositada antes
de realizar la electrolisis de esos metales.
Aplicaciones.
4.5) Coulombimetría.
Fundamento.
Aplicaciones.
Fundamento.
A mediados de los años 20 del siglo XX, el modelo atómico propuesto por Bohr y
Sommerfield, estaba aún lejos de explicar las observaciones experimentales hechas
por los espectroscopistas. No estaba claro a qué fenómeno físico se debía la
generación de dobletes y tripletes en los espectros de emisión atómica y más
desconcertante aún era el hecho de que en presencia de un campo magnético intenso,
inclusive el átomo de hidrógeno, el elemento químico más sencillo, produce un
espectro con un patrón de líneas múltiples diferente al observado a campos
magnéticos más débiles.
La espectroscopía es el estudio de la interacción entre la radiación electromagnética
y la materia, con absorción o emisión de energía radiante.
Cuando los espectrómetros fueron más sensibles, los espectroscopistas se dieron
cuenta de que muchas de las líneas espectrales no eran sino dos, tres o más líneas
muy juntas, grupos a los que se les denominó “multipletes”.
Las bases teóricas de la espectroscopía de resonancia magnética nuclear fueron
formuladas por W. Pauli en 1924, quien sugirió que ciertos núcleos atómicos tienen las
propiedades de espín y momento magnético y que al exponerlos a un campo
magnético se produciría una división de sus niveles de energía.
El espín nuclear puede tomar dos valores numéricos característicos: +1/2 y -1/2.
En ausencia de campo magnético externo los espines nucleares, y por tanto los
momentos magnéticos de una población de núcleos, se orientan al azar.
Cuando una población de núcleos de un determinado elemento químico con actividad
magnética se coloca en un campo magnético externo:
Los núcleos con espín positivo se orientan en la misma dirección que el campo
magnético externo, en un estado de mínima energía.
Los núcleos con espín negativo lo hacen en dirección opuesta, en un estado de
mayor energía.
Instrumento.
Siempre puedes separar una serie temporal como la suma de muchas ondas de
dimensiones diferentes y con ritmo también diferentes.
Esto es la transformada de Fourier. Es un “separador” de series temporales en ondas
simples.
EJEMPLO:
El espectro de alta resolución del etanol revela que dos de las tres resonancias del
protón se desdoblan en más picos.
Aplicaciones.
Por su versatilidad y por la gran información que aporta, es la técnica más usada en la
identificación de nuevos compuestos orgánicos. El rango de posibles aplicaciones es
muy amplio, algunas de ellas son:
Verificación del grado de pureza de materias primas.
Análisis de drogas y fármacos.
Desarrollo de productos químicos.
Investigación de reacciones químicas.
Identificación de sustancias desconocidas.
Análisis de polímeros.
Esta técnica también es aplicable al análisis cuantitativo, teniendo en cuenta que el
área bajo cada pico es proporcional al número de núcleos que lo originan.
Sin embargo su coste y complejidad la hacen inapropiada para este tipo de
aplicaciones, ya que tampoco aporta mayores prestaciones que otras técnicas
instrumentales en este ámbito.
BIOLOGÍA ESTRUCTURAL:
Desde el nivel macromolecular, los principales componentes básicos de nuestro
cuerpo están compuestos por proteínas, ácidos nucleicos, lípidos y carbohidratos.
Estas macromoléculas también tienen la misma importancia en bacterias o virus, que
son los patógenos comunes para nosotros. La estructura y dinámica de estas
macromoléculas y sus complejos determinan sus funciones. Esta información es
fundamental para la mayoría de nuestros problemas médicos.
La RMN proporciona ventajas específicas para determinar la estructura y dinámica de
las macromoléculas.
DETERMINACIÓN ESTRUCTURAL DE PROTEÍNAS:
Las proteínas representan más del 75% de los objetivos farmacológicos actualmente
conocidos. Algunas proteínas también se desarrollan como medicamentos para
completar el cuerpo. El conocimiento de la estructura de una proteína en particular
puede ayudarnos a comprender cómo logar su función específica y cómo solucionar
los problemas cuando algo sale mal.
A 16 de mayo de 2020, había más de 163.949 estructuras de proteínas depositadas
en el banco de datos de proteínas (PDB).
La mayoría de las estructuras se resuelven mediante cristalografía de rayos X, menos
del 10% de las estructuras se resuelven por RMN (estructuras 12.983), especialmente
por RMN en solución. Sin embargo, la RMN en solución todavía ofrece algunas
ventajas particulares sobre la cristalografía. Al estudiar las proteínas en solución, las
proteínas reciben un entorno que imita estrictamente su estado fisiológico y también se
les permite tener su dinámica natural.
DRUG SCREENING:
Los químicos han sintetizado un gran número de compuestos de bajo peso molecular
y los biólogos han caracterizado un gran número de dianas biológicas. Estos
compuestos y sus derivados son los fármacos potenciales. Se necesita un cribado de
alto rendimiento para seleccionar las parejas correctas, el compuesto (como ligando
para su objetivo) y su objetivo de interacción, a menudo proteínas o ácidos nucleicos.
La NMR, especialmente la NMR en solución, se ha aplicado ampliamente en síntesis
química como herramienta analítica para identificar compuestos. Además, en la
investigación farmacéutica, la RMN también se ha desarrollado para seleccionar
rápidamente los compuestos farmacológicos potenciales, así como para detectar la
unión del ligando a sus objetivos macromoleculares biológicos, localizar los sitios
activos, medir la afinidad o la cinética de la unión y optimizar la estructura de los
ligandos en función de los resultados.
METABOLÓMICA: ESTUDIO DE METABOLITOS.
Los metabolitos son los productos intermedios o finales de diferentes reacciones
bioquímicas que se ocurren en un sistema biológico. La metabolómica es una
disciplina dentro de la Biología de Sistemas en la que se evalúan, identifican y
cuantifican los metabolitos de un sistema biológico específico para obtener información
sobre el estado funcional de ese sistema biológico en un momento y condiciones
concretas.
Los metabolitos de un sistema biológico particular suelen ser complicados y muy
variados.
El uso de la RMN como herramienta de diagnóstico a través de la metabolómica
todavía se encuentra principalmente en la etapa de investigación.
NMR EN TEJIDOS CORPORALES:
Esta técnica permite obtener imágenes de múltiples secciones transversales a lo largo
de un determinado eje, de forma que es posible reconstruir a partir de ella imágenes
tridimensionales de órganos y tejidos en el interior del cuerpo del paciente. Es lo que
se conoce como imagen por resonancia magnética o IRM.
Esta técnica implica un riesgo prácticamente nulo en relación con otras técnicas de
obtención de imágenes como los rayos X o la gammagrafía. Sí se debe tener en
cuenta que el intenso campo magnético al que se somete al paciente impide que se
pueda aplicar esta técnica a personas con algún tipo de implante en el que están
presentes materiales conductores de le electricidad o ferromagnéticos.
Fundamento.
Se basa en la ionización de las moléculas o átomos que forman una muestra, de forma
que en una siguiente etapa estos iones pueden ser analizados en función de las
diferentes trayectorias o velocidades con las que se mueven en el seno de campos
electromagnéticos de características variables, y que en general dependen de la
relación masa/carga (m/z) de los iones.
Según el sistema de ionización empleado las moléculas pueden sufrir una
fragmentación más o menos intensa, con lo que los iones analizados pueden estar
constituidos por fragmentos de la molécula original.
Un detector específico cuantifica separadamente cada uno de los iones producidos a
partir de una muestra, dando lugar así a un espectro de masas en el que se
representa la abundancia relativa de cada ion (generalmente en porcentaje sobre el
ion más abundante, al que se le asigna el valor 100), en función de su relación
masa/carga.
Es “habitual” que la carga de los iones sea la unidad, con lo que cada ion o fragmento
iónico se caracteriza básicamente por su masa.
Tradicionalmente la espectrometría de masas se ha clasificado como una técnica
magnética, ya que los primeros sistemas de análisis de iones que se desarrollaron
utilizaban un campo magnético para separarlos. En la actualidad existen sin embargo
sistemas analizadores de iones que hacen uso de otros fundamentos distintos.
Aplicaciones.
Partes.
1. Haz láser produce: matriz neutra (X), iones de matriz (XH)+, (X-H)- muestra neutra
(M).
2. La matriz transfiere protones a la muestra: XH+ + M ─ ─ X + MH+
Aplicaciones.
MALDI BIOTYPER:
El sistema MALDI identifica los microorganismos utilizando la espectrometría de
masas MALDI-TOF para determinar una huella única de un organismo. En concreto, el
sistema MALDI Biotyper mide las proteínas altamente abundantes que se encuentran
en todos los microorganismos.
Los patrones característicos de estas proteínas altamente abundantes se utilizan para
identificar de forma fiable y precisa un microorganismo concreto comparando el patrón
respectivo con una extensa biblioteca de referencia (comparación basada en la
coincidencia de patrones →posiciones de picos, intensidades y frecuencias).
Una vez finalizada la adquisición de los datos espectrales se genera un informe.
DESCUBRIMIENTO DE BIOMARCADORES:
Un número relativamente pequeño de casos y controles se analizan mediante
descubrimiento sin hipótesis proteómica en gran profundidad, lo que idealmente
conduce a la cuantificación de miles de proteínas. Esto puede dar lugar a decenas de
candidatos con expresión diferencial que se analizan mediante métodos de proteómica
dirigida en cohortes de tamaño moderado.
Por último, para uno o unos pocos de los candidatos a biomarcadores restantes, se
desarrollan inmunoensayos que se validan en grandes cohortes y se aplican en la
clínica.
En la fase de descubrimiento se investiga una gran cohorte con la mayor cobertura
posible del proteoma. En la fase de validación, se analiza otra cohorte para confirmar
los biomarcadores candidatos, pero se utiliza la misma tecnología y un tamaño de
cohorte similar. Ambas cohortes pueden analizarse en paralelo, pero sólo las proteínas
que son estadísticamente diferentes en ambos estudios (círculo naranja frente al verde
en la parte derecha del panel). en la parte derecha del panel A) son biomarcadores
validados.
En la actualidad, los médicos toman decisiones sobre el tratamiento basándose en
unas pocas pruebas de biomarcadores plasmáticos combinados con el historial del
paciente y los datos clínicos.
La adición de nuevos biomarcadores sobrecargaría rápidamente el paradigma
actual, lo que daría lugar a decisiones clínicas subóptimas.
Los paneles multiproteicos y los datos del pasado se combinan de forma
algorítmica. Esto ayudará al médico a hacer recomendaciones más precisas
recomendaciones de tratamiento más precisas, sin dejar de tener en cuenta el
historial del paciente y los datos clínicos.
PROTEÓMICA UNICELULAR:
Los organismos multicelulares muestran una amplia heterogeneidad en la expresión
de proteínas en diferentes condiciones y durante un período de tiempo. Por lo tanto, el
análisis en un momento concreto de las proteínas de una célula a menudo pasa por
alto esa heterogeneidad celular perdiendo conocimiento del efector de la respuesta
analizada y sobre las regulaciones de procesos biológicos clave puede permanecer sin
definir.
Por ello, surge la necesidad de tecnologías de “single-cell proteomics” (proteómica
unicelular), porque actualmente los equipos tiene el potencial de identificar una gran
cantidad de proteínas expresadas dentro de una única célula diana individual o una
población de células diana individualmente en un momento dado (instantánea), o
pueden ser dirigidos para generar información sobre un varios de parámetros en las
mismas células a lo largo del tiempo.
La generación mapa de expresión de proteínas (perfil proteómico) de ciertas células
individuales diana, puede proporcionar información sobre los procesos de desarrollo,
progresión de una enfermedad y biomarcadores de diagnóstico, efectos del
tratamiento y pronóstico para que los científicos comprendan, controlen, modifiquen y
mejoren la vida de los organismos. La tecnología single-cell proteomics se encuentra
en su fase inicial de desarrollo y aún tiene que progresar de manera integral para
aplicaciones biológicas.
Tema 6: técnicas térmicas.
6.1) Técnicas térmicas.
Se basan en la evolución de las propiedades de una muestra cuando se somete a un
proceso de calentamiento.
Los efectos del calor sobre los materiales pueden ser variados y producir cambios en
muchas de sus propiedades, dando lugar así a un variado grupo de técnicas.
Las principales aplicaciones de estas técnicas se encuentran en el ámbito de:
La investigación.
El control de calidad de procesos de fabricación de materiales cerámicos, poliméricos,
etc.
Los métodos térmicos difieren en las propiedades que se miden y en los programas de
temperatura aplicados. Hay más de una docena de métodos térmicos.
Termogravimetría o análisis termogravimétrico: la muestra se coloca en una
atmósfera controlada y se registran cambios en su masa en función de la
temperatura, o en función del tiempo mientras se mantiene constante la
temperatura. El resultado es un termograma o curva de descomposición térmica.
Análisis térmico diferencial (ATD): se registra la diferencia de temperatura entre
la muestra y un material de referencia mientras se someten al mismo programa de
calentamiento.
Calorimetría diferencial de barrido (DSC): se registra la diferencia en el cambio
de entalpía entre la muestra y un material de referencia, cuando ambos se someten
a un programa controlado de calentamiento para mantenerlos a la misma
temperatura. En resumen, mide la energía que es necesaria suministrar a la
muestra para mantenerla a la misma temperatura que el material de referencia.
Termodilametría: se miden los cambios en las dimensiones de un material en
función de la temperatura.
Termooptometría: se mide la evolución de alguna propiedad óptica en función de
la temperatura.
Análisis electrotérmico: cambios en la conductividad eléctrica en función de la
temperatura.
Análisis microtérmico: combina el análisis térmico con la microscopía de fuerza
atómica.
6.2) Termogravimetría.
Fundamento.
Instrumento.
Los hornos para termogravimetría van desde la temperatura ambiente hasta 1000ºC,
aunque algunos se usan con temperatura de hasta 1600ºC. para evitar la transferencia
de calor a la balanza es necesario aislar y refrigerar el exterior del horno.
Las tasas de calentamiento se pueden seleccionar desde 0.1ºC/min hasta 100ºC/min.
Se utiliza nitrógeno o argón para purgar el horno y evitar la oxidación de la muestra.
Aplicaciones.
Definición de las condiciones térmicas necesarias para obtener una especie pura.
Las regiones horizontales perfectamente definidas corresponden a los intervalos de
temperatura en los que los compuestos de calcio indicados son estables.
Como el análisis termogravimétrico es capaz de proporcionar información
cuantitativa, la determinación de niveles de humedad es otra importante aplicación.
Se pueden determinar niveles de 0.5% y algunas veces menores.
Fundamento.
Se considera una técnica cualitativa. Aunque es capaz de medir las temperaturas a las
cuales ocurren varios cambios, es incapaz de medir la energía asociada con cada
fenómeno.
Es una herramienta que se utiliza ampliamente para estudiar y caracterizar polímeros
de forma muy considerable en la industria de la cerámica y de los metales.
Es apta para estudiar procesos a altas temperaturas (hasta 2400ºC) y tamaños de
muestra relativamente grandes de cientos de miligramos.
Se utiliza para estudiar las temperaturas de descomposición, transiciones de fase,
puntos de fusión y de cristalización y estabilidad térmica.
El método térmico diferencial proporciona también una manera sencilla y exacta para
determinar los puntos de fusión, ebullición y descomposición de compuestos
orgánicos.
Fundamento.
Es una técnica que se usa para caracterizar la estabilidad de una proteína u otra
biomolécula directamente en su forma nativa. Lo hace mediante la medición del
cambio de calor asociado con la desnaturalización térmica de la molécula cuando se
calienta a un ritmo contante.
Una biomolécula en solución está en equilibrio entre sus conformaciones nativa
(plegada) y desnaturalizada (desplegada). Cuanto mayor es el punto medio de
transición térmica (Tm), más estable es la molécula. Ka DSC mide la entalpía (∆H) de
despliegue que resulta de la desnaturalización inducida por calor.
Como ventaja estos métodos presentan una alta sensibilidad, siendo a la vez
específicos, por lo que se reduce o elimina incluso la necesidad de separaciones
previas.
Como desventaja presentan los riesgos asociados al empleo de sustancias
radiactivas, así como la necesidad de instalaciones y equipos adecuados.
Las técnicas que se van a tratar son:
Análisis por activación de neutrones.
Dilución isotópica.
Radioinmunoensayo.
Los núclidos estables son aquellos que nunca se han desintegrado en forma
espontánea.
Los radionúclidos experimentan desintegración espontánea que finalmente da lugar a
núclidos estables.
La desintegración radiactiva se produce por:
Emisión de radiación electromagnética en forma de rayos X o rayos gamma, con la
formación de electrones, positrones y núcleos de helio.
Fisión en la que un núcleo se rompe en núcleos más pequeños.
7.3) Análisis de la actividad neutrónica.
Fundamento.
Muchos procesos de emisión alfa y beta dejan un núcleo en estado excitado, que
vuelve al estado fundamental en una o más etapas cuantizadas con la liberación de
fotones de rayos gamma monoenergéticos.
Los rayos gamma no se distinguen de los rayos X de igual energía, excepto por su
fuente: los rayos gamma se producen por relajaciones nucleares y los rayos X
provienen de relajaciones de los electrones.
El espectro de emisión de los rayos gamma es característico para cada núclido y, por
tanto, útil para identificar radionúclidos.
Aplicación.
APLICACIONES EN MEDICINA:
Los elementos traza (Ca, Cu, Co, I, Mg, Se, Fe, Zn, Hg, Ba, Cr) tienen una influencia
importante en los procesos fisiológicos y bioquímicos. La abundancia relativa y el
equilibrio de diferentes elementos en cantidades de trazas influyen fuertemente en la
aparición y el avance de muchas enfermedades (cáncer de piel, pecho, colorectal;
disfunción de la glándula tiroides).
APLICACIONES EN MATERIALES:
Evolución de los daños en el material de la vasija de los reactores nucleares que
está sujeto a la irradiación del bombardeo de neutrones provenientes del núcleo del
reactor.
Contenido de elementos materiales.
Fundamento.
Fundamento.
Los inmunoensayos son métodos bioanalíticos en los que la cuantificación del analito
depende de un antígeno (analito) y un anticuerpo.
Aplicaciones: COVID.
Aplicaciones: clínica.
8.2) Centrifugación.
Fundamento.
Tipos de centrifugación.
Svedberg:
El coeficiente de sedimentación, s, tiene unidades de tiempo y habitualmente se
mide en Svedberg, S, y se define como la razón entre la velocidad V a la que
sedimenta la partícula y la aceleración centrífuga aplicada, C; este coeficiente se
relaciona con el radio y la densidad de la molécula, además de, con la densidad y
viscosidad del medio.
c) Centrifugación isopícnica o de equilibrio de sedimentación: separación de las
partículas en un gradiente de densidades en función de la densidad de las mismas,
se especializa en separar macromoléculas, aunque sean de un mismo tipo (el ADN
encaja muy bien en este tipo de macromoléculas, ya que presenta variaciones en
las secuencias y cantidad de sus bases nitrogenadas; y por lo tanto, sedimentan a
diferentes velocidades)
El tiempo de centrifugación es lo suficientemente largo (hasta 1 o 2 días) como para
que se alcance el equilibrio de sedimentación. Lo más frecuente es mezclar la
muestra con el material que formará el gradiente y generar un gradiente
autoformado a la vez que se hace la separación; requiere ultracentrifugación para
que se forme el gradiente.
La densidad máxima del gradiente final DEBE siempre exceder a la densidad de las
partículas. Así la sedimentación final (preciptado en el fondo del tubo) no se
produce si se controlan las condiciones de centrifugación, ya que las partículas
flotan sobre un "colchón" de material que posee una densidad superior a la de
éstas. Se emplea para separar partículas similares en tamaño pero distintas en
densidad.
Tipos de centrífugas.
Instrumento.
En las ultracentrífugas, la velocidad extrema (más de 100.000 rpm), hace que sea
necesario hacer un intenso vacío en la cámara de la centrífuga para evitar el
calentamiento de rotor y muestra.
Tipos de rotor.
De ángulo fijo: se utiliza para separaciones más simples y el adaptador del tubo
tiene una cierta inclinación fija respecto al eje de giro.
Oscilantes, flotantes o basculantes: el adaptador del tubo está unido al brazo del
rotor por su parte superior, pero no está fijo a él; los tubos pierden la verticalidad
cuando se inicia el proceso a causa de la fuerza centrífuga y se sitúan
perpendiculares al eje de rotación (isopícnicos).
Verticales: son típicos de ultracentrífugas en separaciones isopícnicas y posee
rotores macizos con compartimentos esculpidos paralelos al eje.
Recomendaciones de seguridad.
La carga debe ser equilibrada tratando de colocar los tubos de muestra repartidos
de la forma más simétrica posible. Las diferencias de peso pueden desequilibrar el
rotor cuando gira a gran velocidad ocasionando daños en la centrífuga y posible
rotura de los tubos de muestra o del eje. Nunca se ha de dejar la centrífuga sin
atención hasta llegar a la velocidad máxima de giro.
Los tubos deben ser de una calidad adecuada y suficiente para soportar la fuerza
centrífuga a la que serán sometidos. No usar tubos de la calidad adecuada puede
provocar su rotura y la pérdida de la muestra. Los ajustes de velocidad incorrectos
también pueden causar roturas de los tubos. Para muestras biológicas o sustancias
peligrosas es conveniente usar tubos con tapa.
La fatiga del metal puede afectar al rotor debido al estrés que suponen las
elevadas fuerzas G a las que está sometido. No debe sobrepasarse su tiempo de
vida útil para evitar accidentes.
La corrosión puede afectar tanto al rotor como al resto de componentes de las
centrífugas de laboratorio, debilitando los materiales y reduciendo su capacidad
para soportar las tensiones de la fuerza centrífuga. Deben comprobarse
periódicamente para asegurar su perfecto estado de conservación.
La tapa debe permanecer cerrada durante el funcionamiento de la centrífuga.
Nunca abra la tapa ni la mueva de lugar con el rotor en marcha. Las centrífugas
más modernas disponen de bloqueo automático cuando el rotor está en marcha.
8.3) Cromatografía.
Historia.
Fundamento.
Clasificación.
Parámetros de la cromatografía.
VOLÚMENES:
Cuando se introduce una sustancia en la corriente de la fase móvil de un sistema
cromatográfico, si no existe ningún tipo de interacción entre ésta y la fase móvil, la
sustancia se desplazará a la misma velocidad que la fase móvil, y emergerá de la fase
estacionaria cuando el volumen total de la fase móvil utilizado sea igual al volumen
vacío de la fase estacionaria. Ese es el volumen muerto.
Lo normal es que los componentes de la muestra interaccionen con la fase
estacionaria, necesitarán para su elución un volumen mayor de fase móvil denominado
volumen de retención de la muestra.
TIEMPOS:
Tiempo muerto (tM): es el tiempo que tarda en salir un componente que no se
retiene.
Tiempo de retención, (tR): es el tiempo que tarda en salir un determinado
componente que sí se retiene.
Tiempo de retención corregido, (t’R): es el tiempo real que la fase estacionaria ha
retrasado el avance de la sustancia.
FACTOR DE CAPACIDAD:
Es un factor adimensional, y es una medida de la fortaleza con que la fase
estacionaria retiene a un componente dado.
En cromatografía de líquidos depende de la composición de la fase móvil y la fase
estacionaria, y en cromatografía de gases depende de la temperatura y del
empaquetado de la columna.
Por el contrario, es independiente de la velocidad de flujo de la fase móvil y de las
dimensiones de la columna, y puede usarse para comparar retenciones en
instrumentos diferentes.
Los valores de los factores de capacidad para una separación óptima deben
encontrarse entre 2 y 5. Valores mucho más altos alargarían demasiado los tiempos
de separación.
DISPERSIÓN:
Al introducir una mezcla de componentes en una columna cromatográfica, la mezcla
va pasando desde un extremo a otro; los compuestos se van separando y se forman
bandas para cada uno de ellos, que según avanzan se van ensanchando y separando
unas de otras. A mayor tiempo, mayor dispersión de banda habrá.
Dado que los procesos de difusión de las moléculas tienen su fundamento en
movimientos al azar, la concentración final de las moléculas dentro de la banda
cromatográfica adoptará idealmente una distribución normal o gaussiana.
EFICACIA:
Cuanto más agudos (menos anchos) sean los picos que emergen de una columna,
más eficaz es dicha columna, porque se están separando adecuadamente los
componentes. Si las bandas se ensanchan, se podrán resolver o separar menor
número de componentes en un intervalo de tiempo dado.
La eficiencia de la columna, y por tanto la anchura de la banda cromatográfica,
depende de las características de dicha columna, tales como tamaño de las partículas
de la fase estacionaria u homogeneidad de ésta, pero también de otros factores, como
la velocidad y viscosidad de la fase móvil, y la temperatura de trabajo.
Algunos picos cromatográficos no son ideales y presentan deformación hacia la cola o hacia el frente.
La teoría del plato explica de manera satisfactoria la forma gaussiana de los picos
cromatográficos y su velocidad de desplazamiento por la columna.
La teoría del plato se abandonó en favor de la teoría de la velocidad, debido a que la
primera fallaba al intentar justificar el ensanchamiento de los picos de una manera
mecanicista.
No obstante, los términos originales para la eficiencia se han incorporado a la teoría de
velocidad.
RESOLUCIÓN:
Grado de separación que se puede obtener en un sistema cromatográfico para dos
componentes dados.
La resolución puede observarse directamente sobre el cromatograma; se tendrá una
buena resolución si los picos no se solapan y están perfectamente delimitados, sin que
coincida el final de uno con el principio del siguiente.
Aplicaciones generales.
Calibración.
Principio de la técnica:
Los intercambiadores de iones contienen básicamente grupos cargados unidos
covalentemente a la superficie de una matriz insoluble.
Los grupos cargados de la matriz pueden tener carga positiva o negativa.
Cuando se hace pasar una solución acuosa, los grupos cargados de la matriz
estarán rodeados por iones de carga opuesta.
En esta “nube de iones”, los iones se pueden intercambiar de forma reversible sin
cambiar la naturaleza y las propiedades de la matriz.
EJEMPLO:
Las proteínas tienen numerosos grupos funcionales que tienen cargas positivas y
negativas.
La cromatografía de intercambio iónico separa las proteínas de acuerdo a su
carga neta, la cual depende la composición de la fase móvil.
INSTRUMENTO:
Un cromatógrafo de líquidos conta de una serie de elementos indispensables, que
normalmente constituyen en módulos con funciones bien definidas.
La circulación de la fase móvil entre los módulos se hace a través de conductos
tubulares. Deben emplearse siempre diámetros muy pequeños para estos conductos,
con el fin de minimizar el ensanchamiento de banda.
Las partes de un cromatógrafo de líquidos son: el suministro de la fase móvil, la
bomba, la columna y el detector.
SUMINISTRO FASE MÓVIL:
Puede ser un disolvente puro, o una mezcla de disolventes. Además, la fase móvil
puede mantener durante todo el proceso la misma composición, realizándose
entonces una elución isocrática, o, lo que es más frecuente, pueden usarse dos o más
disolventes cuya relación va variando a lo largo del proceso, de forma programada.
Esta elución se denomina en gradiente, y aumenta considerablemente la eficacia de la
separación.
INYECCIÓN DE LA MUESTRA:
Se trata de montajes más o menos sofisticados diseñados para introducir un volumen
pequeño de muestra líquida en el sistema, lógicamente entre el sistema de bombeo y
la columna. Puede ser manual o automático.
COLUMNA:
Es la parte esencial del cromatógrafo de líquidos, ya que en ella, a través de diferentes
mecanismos, tiene lugar la separación de los analitos. Las columnas son tubos de
acero que miden entre 10 y 30 cm de longitud y cuyo diámetro oscila entre 2 y 10 mm
normalmente.
DETECTOR:
Se sitúa a la salida de la columna, y proporcionan de forma continua información
acerca de la composición del eluyente que circula a su través. Comparan o detectan la
diferencia en alguna propiedad física entre la fase móvil y la fase móvil más muestra.
Un detector ideal en HPLC debe ser sensible a pequeñas concentraciones de analito,
dar una respuesta lineal amplia, tener poco ruido de fondo y ser estable en el tiempo
que dura el cromatograma.
Constante dieléctrica.
Densidad.
Detectores basados en alguna propiedad de los componentes de la muestra:
Absorbancia en UV:
El detector ultravioleta/visible es muy común en HPLC; porque muchas
sustancias absorben luz ultravioleta.
Los sistemas más simples utilizan la intensa línea de emisión de 254 nm de una
lámpara de mercurio.
Los instrumentos más versátiles tienen también lámparas de deuterio, xenón o
wolframio, y un monocromador, con el que se puede elegir la longitud de onda
óptima, de ultravioleta o visible, para estudiar los analitos separados.
El detector de matriz de diodos (PDA) es un tipo de detector ultravioleta cuya
importancia es cada vez mayor en HPLC.
Se basa en que el haz de radiación que atraviesa la cubeta a través de la cual
circula la fase móvil procedente de la columna es dispersado por medio de una
red de difracción fija, siendo recogidas simultáneamente todas las longitudes de
onda dispersas mediante una matriz de fotodiodos.
El resultado es la obtención del espectro de absorción de cada uno de los
componentes de la muestra.
Corriente límite.
Cromatografía de gases (CG).
FUNDAMENTO:
Se inyecta y volatiliza una pequeña cantidad de muestra en una columna
cromatográfica. La elución se produce por el flujo de un gas inerte, que constituye la
fase móvil.
Esta corriente de gas atraviesa la columna cromatográfica arrastrando así a los
componentes separados emergerán de la columna a intervalos discretos y pasarán a
través de un sistema de detección adecuado o serán dirigidos hacia un dispositivo de
recogida de muestras.
La cromatografía gaseosa puede utilizarse para cualquier tipo de muestra: sólida,
líquida o gaseosa siempre que sus componentes sean:
Volátiles.
Generalmente con un peso molecular por debajo de 1250 Da.
Térmicamente estables a la temperatura de trabajo para que no se degraden en el
sistema GC.
De forma general la CG es aplicable a la separación y el análisis de muestras cuyos
componentes tengan puntos de ebullición de hasta 300ºC.
Todos los componentes que se introduzcan en la columna han de ser volátiles. Los
compuestos de escasa volatilidad pueden ser retenidos por la columna, y eluir más
tarde, cuando se esté realizando un análisis posterior, dando lugar a los denominados
picos fantasma.
Por otro lado, los componentes no volátiles se condensan en la columna,
deteriorándola.
TIPOS:
Existen dos tipos de cromatografía de gases:
Cromatografía gas-sólido: la fase estacionaria es sólida, y la separación de los
componentes de la muestra se produce según su volatilidad y su capacidad para
ser absorbidos por la fase estacionaria. La aplicación de esta modalidad es muy
limitada debido a que muchas moléculas son retenidas en exceso por el sólido.
Cromatografía gas-líquido: la fase móvil es gaseosa y la fase estacionaria es
líquida inmovilizada sobre la superficie de un sólido inerte. Las sustancias se
separan en función de su volatilidad y según las diferencias de solubilidad en la
fase estacionaria. Tiene muchísimas aplicaciones en todos los campos de la
ciencia, y comúnmente la denominación de “cromatografía de gases” se refiere a
esta técnica.
El gas portador debe ser una especie químicamente inerte, no debe reaccionar con
la muestra ni con la fase estacionaria ni con las superficies del instrumento.
Además debe ser puro y relativamente barato.
Entre los gases portadores de mayor uso se encuentra en helio, nitrógeno y el
argón.
EQUIPAMIENTO:
La muestra se inyecta en el GC a través de un septo que permite la inyección de la
mezcla de muestra sin perder la fase móvil. Conectada a la entrada está la columna
analítica (longitud 10-150m. diámetro interno 01-0,53mm) de sílice fundida o de metal
que contiene la fase estacionaria revestida en las paredes internas. La columna
analítica se mantiene en el horno de columna que se calienta durante el análisis para
eluir los componentes menor volátiles. La salida de la columna se inserta en un
detector que responde a los componentes químicos que eluyen de la columna para
producir señal. La señal es registrada por el software de adquisición en un ordenador
que genera un cromatograma.
DETECTORES:
La combinación de cromatografía de gases con espectrometría de masas se conoce
con las siglas CGMS. La tasa de flujo procedente de las columnas capilares es casi
tan baja que la salida de la columna se puede alimentar de manera directa a la cámara
de ionización del espectrómetro de masas.
Los analizadores más comunes son los cuadrupolares y los de trampa de iones,
aunque también pueden utilizarse tiempos de vuelo.
APLICACIONES:
La cromatografía de gases se puede aplicar a:
Análisis medioambiental: análisis de contaminantes orgánicos en agua corriente o
residual, análisis de pesticidas y herbicidas, análisis de hidrocarburos aromáticos
polinucleares, etc.
Química industrial: análisis de aminas, hidrocarburos, disolventes, etc.
Industria alimentaria: análisis de saborizantes y otros aditivos, vinos,
contaminantes en comida envasada, etc.
Análisis clínico: análisis de drogas y fármacos, análisis de contaminantes o
alcohol en sangre, etc.
Análisis de fragancias, de derivados del petróleo, etc.
Un fluido supercrítico se forma siempre que una sustancia se calienta por encima de
su temperatura crítica.
La temperatura crítica de una sustancia es aquella por encima de la cual no puede
existir en fase líquida independientemente de la presión.
Una sustancia a temperaturas y presiones por encima de su temperatura y de su
presión críticas (punto crítico) se denomina fluido supercrítico.
La densidad, viscosidad y otras propiedades de los fluidos supercríticos son
intermedias entre las propiedades de esa sustancia en estado gaseoso y en estado
líquido.
Ventajas:
Una propiedad importante de los fluidos supercríticos, que está relacionada con sus
densidades elevadas (de 0,2 a 0,5 g/cm3), es su capacidad para disolver moléculas
grandes no volátiles.
Los analitos disueltos en ellos se recuperan con facilidad dejando que las
soluciones se equilibren con la atmósfera a temperaturas relativamente bajas.
Son baratos e inocuos.
8.4) Electroforesis.
Fundamento.
Tampón.
Tipos.
EQUIPAMIENTO:
Un sistema CE es bastante simple y comprende:
Un capilar de sílice (como en la CG) generalmente con un diámetro interno de 25
a 75µm y una longitud de 50 a 100cm, aunque condiciones especiales pueden
requerir diferentes tipos de capilares, cubiertos con poliimida para evitar que la
sílice se rompa.
Una fuente de energía capaz de reproducir potenciales hasta 30kV en los
extremos del capilar.
Un sistema de refrigeración capaz de eliminar el calor producido en el interior del
capilar debido al efecto Joule mientras debido a la aplicación de potencial.
Un sistema de inyección y un detector.
La replicación del ADN utiliza una mezcla de reacción que incluye los cuatro dNTP
estándar y los cuatro ddNTP, cada uno marcado con un fluoróforo diferente.
La incorporación aleatoria de los ddNTP marcados prodice una serie de fragmentos de
ADN en los que la elongación de la cadena va terminando en una posición sucesiva
siendo cada secuencia más larga que la anterior.
La separación de los fragmentos por tamaño produce una escalera de secuencias
como una serie de bandas coloreadas que son separadas por electroforesis capilar.
APLICACIONES: ESPECTROMETRÍA DE MASAS:
La CE con espectrometría de masas (MS) presenta una gran capacidad para separar
los compuestos presentes en muestras de volumen extremadamente pequeño,
rápidamente, con alta eficacia de separación y con capacidad de identificación de
compuestos basada en el peso molecular. Es una técnica analítica extremadamente
valiosa para el análisis de mezclas biológicas complejas utilizada en metabolómica,
proteómica, etc.
Un MS utilizado como detector se sitúa fuera del capilar por lo que el vial de salida
debe ser reemplazado por el de entrada al MS con las dificultades esperadas para
hacer coincidir dos voltajes con diferencias de varios órdenes de magnitud (CE y MS),
y desafíos para mantener un spray estable con un volumen de líquido muy bajo. Lo
más frecuente es conectar el capilar a la electrospray (ESI), que es la fuente de iones
más común en CE-MS.