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PARCIAL 1
- Carbono e hibridación
- Hidrocarburos saturados
- Hidrocarburos insaturados
- Hidrocarburos aromáticos
- Alcoholes y fenoles
- Éteres y epóxidos
- Sustitución nucleofílica
- Reacciones de eliminación
- Grupo carbonilo
- Grupo carboxilo
- Aminas y compuestos nitrogenados
- TP2 - Reacciones orgánicas
- Polímeros sintéticos
El carbono puede formar enlaces covalentes (comparte electrones) o cadenas carbonadas (sólo
formada por carbonos).
Hibridación → forma en que los orbitales se recombinan y dan lugar a orbitales híbridos.
Energía subnivel s < energía subnivel p.
Cuando se forman orbitales híbridos, un orbital s se combina con 3 orbitales p para formar orbitales
sp3. Cuando estos 4 orbitales se combinan (tienen la misma energía), determinan la estructura del
carbono en forma de tetraedro regular (pirámide).
ALCANOS - CnH2n+2
Los alcanos son hidrocarburos, es decir, compuestos que solo contienen átomos de carbono e
hidrógeno. Pueden ser de cadena abierta (alifáticos) o cíclicos. Sus enlaces C-C son enlaces simples.
Hay enlaces covalentes; no hay polos positivos y negativos en la molécula.
Nomenclatura según IUPAC
1) Tanto los alcanos cíclicos como acíclicos tienen la terminación -ANO.
En este caso la cadena más larga es de 6, por lo cual su nombre va a ser hexano. Como queda un
carbono sólo, el cual es un metilo, se lo nombra como sustituyente de la cadena principal. Se cuenta la
posición en la cual se encuentra el radical alquilo desde el extremo que tenga más cerca una
ramificación, y si se repite la “distancia” de las ramificaciones a cada extremo, se elige el que tenga
más radicales asociados a dichas ramificaciones (en este caso, la posición es la 3).
4) Se numeran los átomos de carbono de la cadena principal comenzando por el extremo que
tenga más cerca alguna ramificación, buscando que la posible serie de números “localizadores”
sea la menor posible.
- Su densidad aumenta con el número de carbonos, siendo siempre menor a la del agua
(<1g/ml).
Ejemplo:
Halogenación
En oscuridad y a temperatura ambiente la reacción no se produce; se le debe suministrar energía
mediante alta temperatura o luz, la cual va a romper el halógeno y a producir que un átomo del mismo
(son biatómicos - 2 átomos iguales) reemplace un hidrógeno unido a un carbono del alcano.
Si se forman aniones y cationes se denomina RUPTURA HETEROLÍTICA – Si se forman radicales se
denomina RUPTURA HOMOLÍTICA
Ejemplo:
HIDROCARBUROS INSATURADOS
- Enlaces acumulados → los enlaces múltiples están uno al lado del otro.
- Doble o triple enlace conjugado → hay un enlace simple entre dos enlaces múltiples.
- Doble o triple enlace aislado → hay más de un enlace simple entre dos enlaces múltiples.
ALQUENOS - CnH2n
Los alquenos son hidrocarburos insaturados que tienen doble enlace carbono-carbono en su
molécula. Se puede decir que un alqueno es un alcano que ha perdido dos átomos de hidrógeno
produciendo como resultado un enlace doble entre dos carbonos.
Son más reactivos que los alcanos en el doble enlace debido a los electrones que saltan entre los
enlaces p, son menos atraídos por los núcleos.
carbocatión → enlace p vacío
Nomenclatura según IUPAC
1) La presencia de 1 – cambia el sufijo ANO por ENO.
CH2=CH2 Eteno
CH3-CH=CH2 Propeno
2) 2 = dienos; 3 = trienos, 4 = tetraenos y + de 4 polienos. La presencia de = y ≡ cambia la
terminación a ENINOS
CH2=CH-CH2-CH2-CH2-CH3 1-hexeno
CH2=CH-CH=CH-CH2-CH3 1,3-hexadieno
CH2=CH-CH=CH-CH-CH=CH2 1,3,5-hexatrieno
3) Indicar la posición de =. Debe estar lo más cerca posible del extremo de la cadena.
CH3-CH2-CH=CH2 1-buteno
CHE-CH=CH-CH3 2-buteno
CH3-CH=CH-CH2-CH3 2-penteno
CH3-CH2.CH=CH-CH2-CH3 3-hexeno
4) Seleccionar la cadena más larga que contenga el =.
8) Estereoisomería:
ALCANOS
ALQUENOS
Los 3 orbitales sp2 se encuentran en el mismo plano y el cuarto electrón se encuentra por encima y
por debajo de ese plano (de forma perpendicular al plano formado por los 3 orbitales).
El enlace sigma se da entre dos enlaces sp2 que se encuentran en el mismo plano, se produce un
solapamiento en el cual comparten los electrones.
El enlace pi se da por un solapamiento lateral de los dos electrones en el orbital 2p, perpendicular al
eje de los orbitales híbridos.
Enlaces sp en los alquinos
El enlace pi es diferente al enlace sigma; en el enlace pi los electrones están más expuestos a ser
“robados”, ya que están más alejados del núcleo. Se rompe el doble enlace y se forman dos nuevos
enlaces sigma.
1) Ataque del enlace pi al electrofílico: El electrófilo le roba el electrón pi y se forma un enlace
sigma. A su vez, el electrófilo se lleva los dos electrones del enlace C-C, por lo cual uno de los
carbonos queda parcialmente positivo con 3 enlaces y un electrón faltante. Es un proceso lento.
3) Ácido
o Halogenuros de H (HF, HCl, HBr, HI).
o H2SO4
o Ácidos orgánicos.
Adición electrofílica.
En los reactivos y alquenos no simétricos, se cumple la Regla de Markovnikov.
4) Hidrógenos (hidrogenación)
Se realiza para saturar un aceite. Se usa un catalizador (un metal como el platino o el paladio),
de forma que los hidrógenos se adsorben a una superficie metálica.
Los productos son siempre isómeros cis.
Mecanismo de polimerización:
𝑐𝑎𝑙𝑜𝑟
𝑅 − 𝑂 − 𝑂 − 𝑅 → 2𝑅 − 𝑂 ∙
peróxido orgánico dos radicales
El catalizador se adiciona al doble enlace:
𝑅𝑂 ∙ 𝐶𝐻2 = 𝐶𝐻2 → 𝑅𝑂 − 𝐶𝐻2 − 𝐶𝐻2
radical catalizador un carbono
con un radical libre
6) Oxidación de alquenos
ALQUINOS - CnH2n-2
Los alquinos son hidrocarburos alifáticos con al menos un triple enlace (dos enlaces π pi y uno Σ
sigma) C≡C entre dos átomos de carbono.
Nomenclatura según IUPAC
1. Se toma como cadena principal la cadena continua más larga que contenga el a los triples
enlaces.
2. La cadena se numera de forma que los átomos del carbono del triple enlace tengan los números
más bajos posibles.
3. Dicha cadena principal se nombra con la terminación -INO, especificando el número de átomos
de carbono de dicha cadena con un prefijo (et- dos, prop- tres, but- cuatro; pent-; hex-; etc).
CH3-C≡CH Propino
4. En caso necesario, la posición del triple enlace se indica mediante el menor número que le
corresponde a uno de los átomos de carbono del enlace triple. Dicho número se sitúa antes de
la terminación -INO.
CH3-CH2-CH2-CH2-C≡C-CH3 hept-2-ino.
5. Si hay varios triples enlaces, se indica con los prefijos di, tri, tetra...
CH≡C-C≡C-C≡C-C≡CH octa-1,3,5,7-tetraino
6. Si existen dobles y triples enlaces, se da el número más bajo al doble enlace
CH3-CH=CH-C≡CH pent-2-en-4-ino
7. Los sustituyentes tales como átomos de halógeno o grupos alquilo se indican mediante su
nombre y un número, de la misma forma que para el caso de los alcanos.
CH≡C-CH2Cl 3-cloropropino
CH3-C(CH3)-C≡C-C(CH3)-CH3 2,5-dimetilhex-3-ino
Reacciones de los alquinos
1) Halógenos (halogenación)
2) Hidrógenos (hidrogenación)
4) Agua
HIDROCARBUROS AROMÁTICOS
BENCENO - C6H6
Es una estructura altamente insaturada. Cada carbono se encuentra unido a otros 2 carbonos y a un
hidrógeno; de esta forma estaría faltando un enlace, el cual se representa con un doble enlace con uno
de los carbonos.
Estructura resonante del benceno
Los carbonos tienen una posición dentro de un
hexágono plano, unidos a dos carbonos y a un
hidrógeno. Cada átomo de carbono ocupa el vértice
de un hexágono regular, tres de las cuatro valencias
de los átomos de carbono se utilizan para unir
átomos de carbono contiguos entre sí, y la cuarta
valencia con un átomo de hidrógeno.
La longitud de un enlace C-C en un benceno es un intermedio entre un doble enlace y un enlace simple
Los 6 enlaces pi se encuentran en continuo movimiento, por lo cual son muy estables
termodinámicamente, por lo que no van a reaccionar de forma que la nube pi se rompa.
Diferentes representaciones del benceno
3) En presencia de dos sustituyentes, las estructuras isoméricas se designan con los prefijos orto,
meta y para, que se abrevian o-, m- y p-.
Energía de resonancia: le otorga al benceno una gran estabilidad. Es la diferencia de energía entre el
compuesto hipotético y el compuesto real.
Mecanismo de reacción: sustitución electrofílica aromática
Paso 1. El compuesto electrófilo reacciona con un par de electrones del sistema aromático
(benceno) formando un carbocatión. Esta etapa necesita generalmente ser catalizada (ácido de
1) Halogenación
Necesita de la presencia de un catalizador. Se produce una polarización del enlace hacia el
catalizador.
2) Nitración
El ácido nítrico necesita de un catalizador para poder convertirse en un electrófilo fuerte que
pueda atacar al anillo bencénico.
4) Oxidación
Siempre es en función de los compuestos que se encuentran como sustituyentes. El anillo
bencénico nunca se oxida.
ALCOHOLES Y FENOLES
GRUPO HIDROXILO
Alcoholes R = cadena alifática o grupo alquilo
Fenoles R = anillo aromático o grupo arilo (hidroxilo unido a un anillo bencénico)
GRUPO TIOL
Tioles R = Cadena alifática o grupo alquilo
Tiofenoles R = anillo aromático o grupo arilo
2) ALCOHOLES INSATURADOS
Dos terminaciones, para el doble o triple enlace, y otra para el OH. Se tiene que nombrar la
posición del doble enlace.
2-cloro-1-etanol
ciclobutanol
3-pentin-1-ol
Clasificación de alcoholes
Mientras más cadenas hay unidas al carbono que está unido al radical hidroxilo, más difícil es el
acceso de un reactivo al mismo carbono.
Propiedades físicas
- Puntos de ebullición
Son isómeros porque tienen el mismo número de átomos pero la posición de los mismos es
diferente, por lo cual el comportamiento químico también es diferente.
El PE del etanol es mucho más alto debido a que el alcohol puede formar puentes hidrógenos
con otros alcoholes. no es un enlace covalente pero su ruptura necesita menos energía. La
existencia de muchos puentes hidrógenos le brinda mucha estabilidad a la molécula. Para
cambiar de estado a los alcoholes se debe añadir suficiente energía para romper todos los
enlaces hidrógenos y posteriormente producir el cambio de estado del alcohol.
- Solubilidad
Los primeros alcoholes, con cadena corta, son completamente solubles en agua (la estructura
es muy parecida a la molécula de agua; mientras menor sea la cadena lateral del alcohol, más
fácil será unirse por puentes hidrógenos a otras moléculas de agua). A medida que se
incrementa la cadena la solubilidad va disminuyendo.
Cuanto más bajo es el valor de pKa (constante de equilibrio ácida), más ácido va a ser el
carácter del alcohol.
- EN PRESENCIA DE UN ÁCIDO FUERTE
Manuela Bernay – mbernay@hotmail.com
El metanol es mucho más fácil de solvatar (rodearse se solvente mediante atracción
electroestática) que el 1-butanol, por lo cual tiene mayor capacidad acídica.
- TIPO DE HIDROCARBURO
- PRESENCIA DE SUSTITUYENTES
El enlace F-C es un enlace donde la nube electrónica se desplaza hacia el F, por lo cual la misma
deja parcialmente negativo al F y parcialmente positivo al C. El carbono se neutraliza con la
carga negativa del O, lo cual le da una estabilidad termodinámica mayor frente al ion etóxido.
Al efecto de la resonancia del ion fenóxido se le suma el efecto inductivo, por lo cual el
paranitrofenóxido es un compuesto muy estable. La fuerza ácida de este ion es muy grande
(pKa muy bajo).
Los fenoles no reaccionan con los halogenuros de hidrógeno. No pueden dar productos
de reacción SN2, ya que no pueden formar un carbocatión; si pierden el grupo hidroxilo, el
carbono queda con una hibridación sp y rompe la estabilidad aromática del anillo bencénico.
Tampoco se da la SN1 porque se da la inversión (el halógeno se acerca al R mientras el
hidroxilo se “aleja” por el otro lado del carbono”). Por otro lado, sí pueden reaccionar con
halógenos en una reacción de sustitución electrofílica aromática.
3) Oxidación de alcoholes
Los alcoholes primarios se pueden oxidar en presencia de un agente oxidante. Se oxida, en
primer lugar, a un aldehído, y si hay agente oxidante en exceso puede oxidarse a un ácido.
Los fenoles se oxidan en presencia de un agente oxidante a una quinona, que no puede volver a
oxidarse.
Oxidación de tioles
A partir de un grupo tiol (equivalente al grupo hidroxilo) en presencia de un agente oxidante,
se obtiene un puente disulfuro, y con un agente reductor se obtiene otra vez el grupo tiol. Se
ultrapliega la estructura química.
5) Síntesis de alcóxidos
Los alcoholes no pueden reaccionar con una base de hidróxido (no es lo suficientemente
fuerte), y la reacción está desplazada hacia la izquierda. Como base se usa una mucho más
fuerte (metal o hidruro metálico) de forma que se lleve a cabo la reacción.
6) Síntesis de fenóxidos
Los fenoles son más ácidos que los alcoholes, por lo cual sí pueden reaccionar con un
hidróxido, para dar lugar a un fenóxido.
ÉTERES Y EPÓXIDOS
Es muy parecido a un alcohol, pero el hidrógeno del grupo OH se reemplaza por un
grupo arilo o grupo alquilo.
ÉTERES
Nomenclatura según IUPAC
1) Se nombran R y R’ como si fueran sustituyentes, seguidos con la palabra ÉTER.
Manuela Bernay – mbernay@hotmail.com
2) En estructuras más complejas, se nombra el grupo OR como un grupo alcóxido sustituyente. La
palabra ÉTER desaparece y aparece el sufijo OXI.
Tienen un punto de ebullición muchísimo menor que los alcoholes porque éstos forman puentes
hidrógenos con el agua y entre ellos (requieren más temperatura para romper los puentes).
Los éteres no forman puentes hidrógenos entre sí pero sí pueden hacerlo con un alcohol. La poca
solubilidad que tiene en el agua se debe también a la posibilidad de formar puentes hidrógeno con el
agua.
No reaccionan con ácidos o bases fuertes ni con compuestos reductores u oxidantes, por lo que tienen
un gran uso como solvente en los laboratorios por ser tan poco reactivo. Al tener poca solubilidad en
agua puede disolver compuestos no polares.
Preparación de éteres
- Éteres simétricos
Las condiciones de reacción se van a cumplir como una sustitución nucleofílica bajo
condiciones muy específicas.
- Eteres no simétricos
Reacción de Williamson:
Paso 1. El alcohol reacciona en presencia de un metal o hidruro metálico.
Paso 2. El ion alcóxido del paso 1 reacciona con un halogenuro de alquilo y el alcóxido se
une al otro grupo.
Reacciones de epóxidos
Una reacción típica es con agua en un medio ácido. Se rompe el ciclo y se forma un polialcohol.
SUSTITUCIÓN NUCLEOFÍLICA
Muchas reacciones en laboratorio e industria usan como precursor un halogenuro de alquino.
REACCIONES SN2 (SUSTITUCIÓN)
- El cloroetano (halogenuro de alquino) va a reaccionar con un nucleófilo en un medio acuoso. El
cloro se sustituye por el hidroxilo, y el cloro “sale” del alquilo y queda como un grupo libre
llevándose los electrones del enlace. El hidroxilo aporta sus electrones para el enlace.
- Es una reacción bimolecular que se lleva a cabo en un solo paso y requiere de la presencia de
un sustrato y un nucleófilo.
- La velocidad de la reacción depende de la concentración del sustrato y del nucleófico. Los
desplazamientos proceden a la formación de un producto por inversión y se ve favorecida o
acelerada con grupos alquilos, metilo (el volumen es pequeño y se tiene acceso más rápido al
carbono) y primarios.
RESUMEN
REACCIONES DE ELIMINACIÓN
(Mencionadas en las reacciones de alcanos).
A partir de un halogenuro de alquilo, en presencia de un nucleófilo puede provocar:
- Una sustitución del halógeno por el nucleófilo.
- Se elimina el halógeno,
el nucleófilo se una al
halógeno y da como
producto un alqueno
(cadena con doble
enlace C-C).
REACCIÓN E1
Se ve favorecida por grupos alquilos terciarios.
Se da en 2 pasos:
Paso 1. De forma lenta, se produce la salida del grupo saliente y la formación de un carbocatión
terciario.
Paso 2. El hidrógeno del carbocatión se va como protón y se produce la formación de un enlace
pi, dando lugar a la formación de un alqueno.
ALDEHÍDOS
Es el grupo en el cual el grupo
carbonilo está unido a un R y a un
hidrógeno.
2) El carbono 1 es el que lleva el grupo principal. Considerar si aparecen otros grupos (el aldehído
lleva la prioridad) o dobles enlaces (es parte de la cadena principal).
3) Aldehídos cíclicos:
Se le da la terminación aldehído.
CETONAS
El grupo carbonilo se encuentra unido a dos cadenas carbonadas (dos cadenas alifáticas, una alifática
y una aromática, dos aromáticas, cetonas cíclicas).
El carbono se encuentra unido por un doble enlace al oxígeno. La geometría sigue siendo trigonal
plana y el orbital p del carbono se encuentra solapado al orbital p del oxígeno. Están compartiendo un
enlace pi en un plano perpendicular al enlace sigma C-O.
El oxígeno es más electronegativo que el carbono, por lo tanto, la nube electrónica va a estar
desplazada hacia el oxígeno, dejando parcialmente negativo al mismo y parcialmente positivo al
carbono. La presencia de esta polaridad determina que el mecanismo de reacción de estos
compuestos va a ser por adición nucleofílica, a diferencia de los alquenos (adición electrofílica).
Adición nucleofílica
El nucleófilo va a atacar por
detrás al carbono carbonilo.
La geometría trigonal se
rompe y se forma una
geometría tetraédrica. Se
obtiene un producto de
adición tetraédrico.
El mecanismo de reacción es
el mismo sin importar la
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ubicación del carbono carbonilo. Un carbono terminal va a ser mucho más reactivo que un carbono
secundario, cuya reactividad depende a su vez de la longitud de las cadenas carbonadas que estén
unidas al mismo (los aldehídos son más reactivos).
Reacciones
1) Adición de alcoholes
- Un hemiacetal contiene ambos grupos funcionales, alcohol y éter, en el mismo
átomo de carbono. Resulta de una reacción entre un aldehído y un alcohol (R-
OH).
Se requiere de un medio ácido para producir la reacción. El grupo hidroxilo del
alcohol actúa como un nucleófilo, se rompe el doble enlace y se forma un
producto de reacción de geometría tetraédrica, donde el carbono principal queda
unido a la cadena a la cual ya estaba unido, al grupo hidrohilo y a una segunda
cadena con un grupo éter.
- Un acetal tiene dos grupos funcionales éter en el mismo átomo de carbono. En los
acetales al menos una de las valencias la ocupa un átomo de hidrógeno.
Si en la reacción de hemiacetal hay alcohol en exceso, el hemiacetal sigue
reaccionando con el mismo y se produce un acetal. El oxígeno con la cadena
lateral del alcohol se une al hemiacetal en sustitución de un protón hidrógeno, el
cual se libera para formar agua en el producto final.
TAUTOMERÍA CETO-ENÓLICA
El carbono unido al carbono principal se denomina carbono alfa, y al hidrógeno unido al mismo,
hidrógeno alfa (se lo considera hidrógeno ácido porque una base se puede llevar el protón fácilmente
para protonarse y dejando el carbono con dos electrones que le dan una carga negativa, la cual puede
estabilizarse por resonancia formando un segundo enlace C-C con el carbono principal). El producto
resultante se estabiliza por resonancia.
La forma cetónica es muchísimo más estable termodinámicamente que la forma enólica. La mayor
parte de los compuestos que presentan un grupo carbonilo se encuentran en forma cetónica y muy
pocos en forma enólica. Muchas reacciones de la química biológica tienen como producto
intermediario de reacción una forma enólica; esa cadena está aumentando la reactividad para seguir
una direccionalidad y dar un producto final.
Los tautómeros son isómeros estructurales que se diferencian en la localización de un protón y un
doble enlace.
CONDENSACIÓN ALDÓLICA
Los aldehídos que tienen hidrógeno alfa pueden reaccionar
por condensación aldólica.
Paso 2. El carbono del anión enolato actúa como un nucleófilo sobre el carbono carbonílico del
segundo acetaldehído y se va a formar una unión C-C (enlace sigma). Si estoy en presencia de
un acetaldehído y el carbono alfa actúa como nucleófilo, el carbono 3 siempre va a llevar la
función hidroxilo.
Paso 3. El ión alcóxido acepta un protón del solvente y va a regenerar un hidroxilo del carbono
3, dando lugar a la formación de un aldol.
REACCIÓN DE CANNIZARO
Los aldehídos en presencia de una base fuerte se dismutan (oxidan y reducen al mismo tiempo). Los
productos de reacción son un alcohol y un ácido (generalmente una sal de ácido). Es una reacción de
auto óxido reducción para aldehídos que no tienen carbonos alfa. Uno de los aldehídos se reduce a
alcohol y el otro se oxida a ácido carboxílico.
Paso 1. Consiste en una adición nucleófila de la base (el anión hidróxido) al carbono carbonílico
del aldehído. El alcóxido resultante desprotona para dar un di-anion Para que este intermedio
se forme se requiere un medio fuertemente básico.
Paso 2. El producto intermediario va a actuar como nucleófilo para producir la unión del
hidruro al carbono, la ruptura del doble enlace y formación del alcohol, y el otro aldehído se va
a transformar en un ácido.
GRUPO CARBOXILO
Caracteriza a los ácidos carboxílicos o ácidos orgánicos. Surge de combinar al grupo
carbonilo con el grupo hidroxilo.
ÁCIDOS CARBOXÍLICOS
Nomenclatura según IUPAC
1) Se agrega el prefijo ÁCIDO y al alcano o alqueno el sufijo OICO.
La función principal es la función del ácido.
Carbono alfa: adyacente al carbono que tiene el grupo principal.
2) El grupo carboxilo tiene prioridad ante todos los otros grupos principales.
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3) Ácidos carboxílicos cíclicos.
Ácido (número de carbono) ciclo + número de ciclo + carboxílico.
El ácido etanoico cede un protón y se transforma en el ion acetato. Como posee un enlace
C=O, la carga parcial negativa del oxígeno se estabiliza por resonancia con ambos oxígenos
del ion.
Explicación del comportamiento ácido
La carga negativa del oxígeno que ha cedido el protón se estabiliza por resonancia y la forma de
interpretarlo queda evidenciado experimentalmente: los dos enlaces dobles del producto de
resonancia son equivalentes y tienen una distancia intermedia entre el enlace simple y el doble.
La estructura resonante producto de la desprotonación del ácido carboxílico se estabiliza por
resonancia de forma equivalente entre ambos oxígenos.
En resumen
Una transferencia de acilo es la transferencia de un grupo acilo desde un grupo saliente a un
nucleófilo.
Rosa – nucleófilo.
Celeste – grupo saliente.
Negro – grupo acilo. Si tiene 2 carbonos es un grupo acetilo; si tiene 3 carbonos es un grupo propanilo.
El grupo acilo siempre se transfiere entre el grupo saliente y el nucleófilo.
Reacciones
1) Formación de sales.
Los ácidos con fuerte carácter ácido fueren formar sales. Se reemplaza la terminación ICO por
ATO y se nombra al metal como un sustituyente. La reacción está fuertemente desplazada a la
formación del carboxilato.
Un compuesto aromático puede oxidarse pero no se modifica la estructura del anillo bencénico.
Ésteres
La reacción también puede ser intramolecular (que en la misma molécula se
encuentre el ácido y el alcohol – ácido hidroxilado) y formar esteres cíclicos
(lactonas).
Con R’’ = H
Estructura
Estructura piramidal con hibridación sp3.
La presencia de un par de electrones no compartidos, hace que
los 3 enlaces restantes se modifiquen y el ángulo entre ellos sea
menor.
Las aminas aromáticas se forman por el mismo método (en presencia de un halogenuro de
alquilo se produce la formación de una amina por la sustitución de uno d ellos hidrógenos por
el grupo metilo). En los aromáticos todas las reacciones ocurren por fuera de la nube 6 pi.
La distancia
siempre es entre
3/4/5 carbonos.
Se reducen los grupos sustituyentes del anillo bencénico en presencia de un agente reductor.
Basicidad de las aminas
El agua va a actuar como un ácido protonando a la amina y formando el ion amonio y como segundo
producto en anión hidroxilo.
A toda base le corresponde en su ion un ácido conjugado débil (si el ácido tiene una Ka alta o pKa muy
chica, el mismo es un ácido fuerte y la base de la amina es débil; si la Ka es pequeña o la pKa muy alta,
el ácido es débil y la base de la amina es fuerte).
- Las bases aromáticas son bases más débiles que las bases de los cicloalcanos:
La anilina se estabiliza por resonancia en las posiciones orto y para, por lo que los dos
electrones están menos disponibles para protonarse. Sabiendo que una base fuerte se
caracteriza por protonarse rápidamente, la poca disponibilidad del par electrónico para
protonarse en las bases aromáticas le da un carácter débil.
Uno de los carbonos del benceno es reemplazado por un heteroátomo. El compuesto recibe el
nombre de piridina.
El nitrógeno pone un electrón en un orbital p, por lo que el anillo aromático sigue con la nube
electrónica 6pi (comportamiento igual al benceno).
La estructura es casi hexagonal, plana y con hibridación sp2.
El par de electrones no compartidos le da la propiedad de poder protonarse. El nitrógeno es más
electronegativo que los carbonos, por lo que el carbono en posición para al mismo queda
parcialmente positivo. Por la presencia de este carbono parcialmente positivo y el par de electrones
libres, los compuestos aromáticos de 6 miembros no reaccionan mediante sustitución nucleofílica
“normal”. El mecanismo de reacción es sustitución electrofílica aromática.
5 MIEMBROS
Uno de los carbonos del benceno es reemplazado por un heteroátomo. El compuesto recibe el
nombre de furano.
La estructura es pentagonal, plana, con hibridación sp2, con un sistema similar a la nube 6 pi. Para
que en un anillo de 5 miembros se siga manteniendo la nube 6 pi, el oxígeno provee al compuesto de
dos electrones libres.
El mecanismo de reacción es la sustitución electrofílica aromática (igual al benceno).
Reducción
El anillo se puede reducir a un ciclo no aromático mediante una hidrogenación y un catalizador
(platino).
Productos naturales:
Ejemplos de heterociclos
de 5 miembros
Productos naturales:
Reacciones polares
Las reacciones polares tienen lugar debido a las atracciones eléctricas entre los centros positivos y
negativos en los grupos funcionales presentes en las moléculas. La mayor parte de los compuestos
orgánicos son eléctricamente neutros, no tienen carga neta, ni positiva ni negativa; sin embargo,
ciertos enlaces dentro de una molécula son polares, particularmente los enlaces en los grupos
funcionales.
La polaridad del enlace es una consecuencia de una distribución electrónica asimétrica en un enlace y
se debe a la diferencia en la electronegatividad de los átomos unidos. Los elementos como el oxígeno,
nitrógeno, flúor y cloro son más electronegativos que el carbono, por lo que un átomo de carbono
unido a uno de estos átomos tiene una carga parcial positiva (δ +). Por el contrario, los metales son
menos electronegativos que el carbono, por lo que un carbono unido a un metal tiene una carga
parcial negativa (δ -).
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Por otro lado, los enlaces polares también pueden resultar de la interacción de grupos funcionales con
ácidos o bases. Por ejemplo, En el metanol el átomo de Cα es un poco pobre de electrones debido a que
la electronegatividad del oxígeno atrae con mucha más fuerza a los electrones del enlace C-O, que el
carbono ( δ+ C-O δ- ). , Al protonar el oxígeno del metanol por un ácido, la carga totalmente positiva
en el O atrae con mucha más fuerza a los electrones del enlace C-O y hace mucho más pobre al C en
electrones.
Otra consideración adicional es la polarizabilidad (no es lo mismo que la polaridad) de los átomos de
una molécula . A medida que el campo eléctrico alrededor de un átomo dado cambia debido a las
interacciones con el disolvente u otras moléculas polares cercanas, también cambia la distribución
electrónica alrededor de ese átomo. La medida de esta respuesta a una influencia eléctrica externa se
llama polarizabilidad de un átomo. Los átomos más grandes, con más electrones débilmente
retenidos, son más polarizables y los átomos más pequeños, con más electrones fuertemente
retenidos, son menos polarizables; por lo tanto, el azufre es más polarizable que el oxígeno, y el yodo
es más polarizable que el cloro. El efecto de esta polarizabilidad más alta para el azufre y el yodo es
que aunque los enlaces C-S y C-I son no polares ( por los valores de electronegatividad) usualmente
reaccionan como si fueran polares.
La característica de las reacciones orgánicas polares es que los sitios ricos en electrones reaccionan
con los sitios pobres en electrones debido a que las cargas opuestas se atraen. Los enlaces se forman
cuando un átomo rico en electrones comparte un par de electrones con un átomo pobre en electrones,
y los enlaces se rompen cuando un átomo sale con los dos electrones que formaban el enlace . Para
referirse a las especies ricas y pobres en electrones antes descritas, en química, se utilizan los
términos nucleófilo y electrófilo. Un nucleófilo es una sustancia que es amante del núcleo, por lo tanto
es rico en electrones, esta polarizado negativamente y puede formar un enlace al donar un par de
electrones a un átomo que es pobre en electrones polarizado positivamente. Los nucleofilos pueden
ser neutros o estar cargados negativamente, ej, amoniaco, agua, el ion hidróxido y el ion cloruro. En
contraste, un electrófilo tiene un átomo pobre en electrones y polarizado positivamente y puede
formar un enlace al aceptar un par de electrones de un nucleofilo. Los electrófilos pueden ser neutros
o bien estar cargados positivamente, son ej los ácidos (donadores de H+), los haluros de alquilo y los
compuestos carbonilicos.
5) ¿En qué condiciones se produce una reacción de sustitución nucleofílica tipo 1 y tipo 2?
POLÍMEROS SINTÉTICOS
Los polímeros son macromoléculas compuestas por una o varias unidades químicas (conocidas como
monómeros) que se repiten a lo largo de toda la cadena. Pueden ser lineales o ramificados.
Polímeros
Naturales Sintéticos
Proteínas
Por medio de radicales libres
(aminoácidos)
La molécula va a tener una orientación. Se va a tener un crecimiento de “cabeza” y “cola”, teniendo una
direccionalidad en las reacciones de síntesis. La reacción se lleva a cabo generalmente mediante los
electrones del enlace pi. Este mecanismo de reacción se mencionó en las reacciones de alquenos.
La reacción en cadena comienza con un iniciador o catalizador (peróxido orgánico).
- Paso inicial
Se dan las condiciones para que la reacción se vea favorecida para la formación de las
estructuras monoméricas. El catalizador se adiciona al doble enlace C=C formando un
intermediario reactivo. Esto se produce “atacando” al carbono menos sustituido, es decir, el
que no está unido a un sustituyente L.
- Paso propagador
El intermediario formado por acción del catalizador se adiciona al doble enlace de una
segunda unidad de monómero para formar un segundo intermediario.
- Paso finalizador
Acoplamiento de radicales: hay 2 monómeros (radicales) en una larga cadena, los cuales se
enfrentan “cabeza” con “cabeza” y se forma un enlace uniendo las dos cadenas en una sola
cadena polimerizada.
Contrariamente a los polímeros con crecimiento en cadena, estos polímeros se forman por etapas (o
saltos), con frecuencia mediante la reacción de una molécula del polímero con otra.
Para que tenga una mayor velocidad de reacción es fundamental que los reactivos sean lo más puros
posibles. Si hay muchas impurezas en los reactivos la velocidad de reacción se disminuye porque el
encuentro de los grupos funcionales va a estar disminuido. Mientras más puros sean los reactivos,
más favorecida se va a ver la reacción.
Formación del uretano (adición nucleofílica)
o En el paso siguiente, el alcohol-éster-ácido (aea) puede reaccionar con otro diol, con otro
diácido o con otra molécula igual, con tres grupos funcionales. Se puede obtener una
mezcla de productos (reacción regioselectiva).
Anticuerpos
Son espacios/núcleos proteicos que pueden estar
asociados a una membrana o en el interior celular que
Receptores
tienen un sitio de reconocimiento a una hormona o
neurotransmisor
Actina y miocina
AMINOÁCIDOS
La estructura química de las proteínas es la misma sin importar su función.
Esta estructura corresponde a una estructura de biopolímero (es decir, un
conjunto de monómeros o unidades que se unen mediante reacciones químicas
para formar macromoléculas). La estructura monomérica de la proteína se
denomina aminoácido o alfa aminoácido.
Un aminoácido es una porción de molécula en la cual el carbono terminal está
unido a 4 grupos diferentes: un grupo amino H2N, un grupo carboxilo COOH,
un hidrógeno y una cadena lateral R. El carbono alfa, en los aminoácidos,
recibe el nombre de carbono quiral o centro quiral.
El aminoácido puede tener un comportamiento ácido o básico. Los enlaces de los
aminoácidos se denominan unión peptídica (unión entre un ácido carboxílico y
una amina formando una amida).
Grupos R aromáticos
Las cadenas laterales pueden ser grupos aromáticos
(anillo bencénico o grupos fusionados). Estos
aminoácidos son fundamentales en cadenas
biológicas.
PROTEÍNAS CONJUGADAS
Son proteínas o cadenas polipeptídicas (se diferencian entre sí al pasar de determinado peso
molecular) que pueden estar asociadas a un grupo prostético (todo grupo de naturaleza diferente a la
proteica).
Estructura primaria
Es la secuencia de alfa aminoácidos en uniones peptídicas cuyas cadenas laterales (de distinta
naturaleza) quedan hacia afuera de ese “esqueleto” principal. Un extremo es amino terminal y el otro
extremo es carboxilo terminal.
La estructura resonante determina los planos con impedimento de rotación. Cuando se observa una
estructura primaria se observa una secuencia de planos con distinto grado de rotación.
Dependiendo del grado de rotación es la forma tridimensional que va a tomar la estructura
secundaria.
LÁMINA O PLEGAMIENTO β
No hay un giro como en la hélice, sino que se va
plegando como si fuera una hoja de papel, siempre
dejando hacia el exterior las cadenas laterales R. Las
cadenas se organizan de forma lineal una al lado de
la otra. Se va a mantener la estructura mediante los
puentes hidrógenos entre un grupo carboxilo y un grupo amino distantes en la cadena.
Estructura terciaria
Corresponde a enlaces no covalentes que permiten un mayor plegamiento de los mencionados en la
estructura secundaria. Los tipos de atracciones pueden ser:
Estructura cuaternaria
Son estructuras terciarias de distintas subunidades que se
asocian para formar una estructura mucho más compleja,
dependiendo de la función biológica que vaya a cumplir esa
proteína.
Desnaturalización: es la pérdida de la estructura tridimensional
(secundaria, terciaria o cuaternaria) de la proteína, y por lo
tanto, la pérdida de su función. Los agentes que la llevan a cabo
son: calor (laboratorio – no la destruye completamente, sólo la
“desarma”), ácidos y bases fuertes, solventes orgánicos
(alcoholes, cloroformo), sales concentradas, radiación.
PROPIEDADES ÁCIDO-BASE
Los grupos amino y carboxilo de los aminoácidos, junto con los grupos R ionizables de algunos
aminoácidos, actúan como ácidos y bases débiles. Cuando un aminoácido sin grupo R ionizable se
disuelve en agua a pH neutro, se encuentra en solución en forma de ion dipolar o zwitterion, que
puede actuar como ácido o base.
NUCLEÓTIDOS
Los nucleótidos tienen diferentes funciones:
- Unidades monoméricas (precursores) de los ácidos nucleicos: ADN - ARN
- 2° mensajeros: AMPc (la hormona es el 1° mensajero) (transmiten la señal traída por el primer
mensajero a la célula)
- Coenzimas: NAD – FAD – Coenzima A (grupos prostéticos que muchas veces trabajan con una
enzima y son las que realmente trabajan – la enzima “presta el espacio” para llevar a cabo las
reacciones)
- Transferencia de energía: ATP
El nucleótido está formado por una base nitrogenada, un azúcar simple y un ácido. La unión de la base
a la pentosa se denomina nucleósido. Cuando el nucleósido de une a un grupo fosfato se forma un
nucleótido.
La diferencia entre la base del ARN y ADN es que el ADN tiene unido un grupo metilo.
Las purinas son moléculas más grandes porque son dos anillos fusionados.
FORMACIÓN DE LA RIBOSA
El carbono de la función principal es un aldehído. Es una molécula polihidroxilada. En el carbono 4
hay un grupo hidroxilo que puede actuar como un nucleófilo atacando por detrás el grupo carbonilo
(flecha verde) para formar una azúcar cíclica (hemiacetal cíclico) denominada ribosa.
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PREGUNTA DE PARCIAL: ¿La estructura de la ribosa es la misma que la del furano? NO. El furano es un
compuesto heterocíclico (aromático),
mientras que la ribosa es un
aldehído; tienen una forma similar
pero la estructura y los mecanismos
de reacción de cada molécula son
completamente diferentes.
FORMACIÓN DE LA RIBOSA
El ADN está formado por:
- Adenina unida a la ribosa y fosfato.
- Guanina unida a la ribosa y fosfato.
- Timina unida a la ribosa y fosfato.
- Citocina unida a la ribosa y fosfato.
La diferencia entre estas estructuras es que los nucleótidos comparten la misma azúcar (ribosa) pero
las bases nitrogenadas son diferentes. El crecimiento de las moléculas va a estar relacionada a la
combinación de bases nitrogenadas que se produzca.
ESTRUCTURA PRIMARIA
La estructura primaria tiene una dirección 5’ (grupo fosfato unido al carbono 5 de una ribosa) → 3’
(carbono prima de otra ribosa) y los extremos están dados por el número del carbono interviniente de
la ribosa. Esto es así debido a que las enzimas que van a llevar a cabo la síntesis del ADN reconocen
primero la posición 5’.
PREGUNTA DE PARCIAL: ¿Cómo se une la base nitrogenada con la ribosa para formar un nucleósido?
(Cuadro verde). La base nitrogenada de une a la ribosa (en el ADN es la 2-desoxi-ribosa, porque el
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grupo hidroxilo del carbono 2 de la ribosa se pierde). El azúcar de las cadenas de ADN no tiene un
grupo hidroxilo en el carbono 2.
El carbono 1 que es el que lleva el grupo principal recibe el nombre de carbono anomérico.
El grupo hidroxilo del hemiacetal (círculo verde) va a reaccionar con el nitrógeno de la citocina y va a
formar una unión N-glicosídica (formación de un acetal) entre el nitrógeno de la base pirimídica y el
hidroxilo del carbono 1 de la ribosa o el nitrógeno 9 de la base indólica (púrica) con el carbono 1 de la
ribosa.
El enlace fosfodiéster se forma reaccionando un ácido inorgánico (fosfórico) con el hidroxilo del
carbono 5 de una ribosa y con el hidroxilo del carbono 3 de otra ribosa, y forma la cadena primaria de
unión de nucleótidos. Las bases nitrogenadas quedan alineadas hacia el interior, y los enlaces
fosfodiéster quedan hacia afuera.
¿Cómo se forma un nucleosoma? Cada nucleosoma está formado por histonas, que tienen la
característica de ser proteínas básicas (aquellas que además del grupo amino en el carbono alfa tienen
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otros grupos aminos). El ADN se enrolla alrededor de esta estructura (la H1 ayuda a que se forme la
“unión”) de tal forma que se almacena la misma cantidad de información en un espacio mucho menor.
ARN de transferencia
Está formado por una simple cadena compleja (de hoja de trébol)
donde el extremo 5’ da 3 “asas” del cual importa el anticodón, y el
extremo 3’ que va a estar unido a un aminoácido. La forma se da
por complementariedad de bases. El brazo extra es propio de
algunos ARN de transferencia, no de todos., por lo cual permite
identificar los tipos de ARN.
ARN mensajero
COENZIMAS
Un sustrato (ácido pirúvico en forma ionizada, piruvato) se transforma en acetil-CoA. Esta reacción
está asociado a un compuesto enzimático conformado por 3 enzimas combinadas con otras
coenzimas. Las coenzimas trabajan dentro del espacio que le dan las enzimas.
Ácido lipoico
Coenzima Q o ubiquinona
Tiene una cabeza de quinol que puede ceder los hidrógenos y reducirse para dar una cabeza de
quinona (la coenzima está asociada a reacciones de tipo redox). En la coenzima Q o ubiquinona
(enzima que se encuentra dentro de una membrana; las membranas biológicas son hidrofóbicas, por
lo que para que la cabeza que es completamente polar, para moverse dentro de un medio apolar, debe
tener algún sustento que le permita ese movimiento, y este sustento es la “cola” de carbonos
altamente apolar, la cual se encuentra inserta en la membrana, y la cabeza polar por fuera de la
membrana, generalmente en la membrana interna de la mitocondria).
Azúcares fosfato
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La glucosa es un azúcar de 6 carbonos que se encuentra
formando un hemiacetal cíclico. La reacción es entre el
hidroxilo del carbono 5 con el carbono 1 (aldohexosa, por
lo que se forma un aldehído cíclico.
En la glucosa-6-fosfato por acción de un cofactor
(magnesio) el grupo fosfato puede ser transferido a otra
hexosa (tiene estructura furanosa pero tiene 2 carbonos
hacia afuera) denominada fructosa-6-fosfato. Tanto la
glucosa como la fructosa son hexosas pero la forma en la que se encuentran cicladas dentro de la
célula es diferente (la glucosa es una piranosa y la fructosa una furanosa).
Acil-coenzima A
La coenzima A tiene una base nitrogenada y una ribosa con el carbono 3 fosforilado y en el carbono 5
unido un pirofosfato, al cual le sigue una vitamina. La acción de coenzima se produce en el grupo tiol
final (HS); el tiol va a reaccionar con un ácido carboxílico (por ejemplo, un ácido graso), dando como
producto un tioéster. Esta coenzima está asociada a la transferencia de grupos acilos y tiene mucha
importancia en la biosíntesis de lípidos.
Azúcares nucleótidos
Para que dos azúcares simples (glucosa) se unan para
formar un azúcar complejo o se polimericen para formar
una estructura macromolecular (glucógeno), necesitan
primero estar unidos a un nucleótido (UDP, uridin
difosfato). Un azúcar no se une de forma directa a otra si
una no está activada o unida a un nucleótido. Una vez que
esto pasa va a ser reconocida por una enzima y su
coenzima, que van a hacer que se rompa el uridin, se
libere y las azúcares puedan unirse entre sí. Después se
produce la desfosforilación y queda conformado un
disacárido (en este caso, sacarosa - azúcar común).
Clasificación
Hay parte que se va a absorber y parte que se
va a emitir o a "dejar pasar".
Espectrometría de
emisión
La emisión es directamente proporcional a la
concentración del analito en la muestra.
- Fuente de luz policromática: para visible lámpara de tungsteno y para UV lámpara de deuterio.
- Sistema óptico: para seleccionar una determinada longitud de onda (colimador,
monocromador, seleccionador de longitud de onda).
- Cubeta: recipiente donde se coloca la muestra a medir. Para visible debe ser de vidrio o de
plástico, para UV de cuarzo.
Las cubetas tienen 1cm de espesor. Pueden ser de diferentes materiales, lo cual se debe
tener en consideración porque también va a absorber una parte de la luz. Tienen dos
caras transparentes translúcidas y dos caras opacas; se las debe sostener desde las caras
opacas para no ensuciar las caras translúcidas.
- Detector (fototubo).
- Procesador y lector de la señal.
Se debe utilizar una sustancia o muestra “blanco” para indicarle al espectrofotómetro cuál va a ser el
valor base o 0 que se va a utilizar para las mediciones. Esta muestra blanco va a depender de en qué
medio está disuelta la sustancia que se quiere medir.
Aplicaciones de la espectrofotometría de absorción molecular UV-visible
- Medición del oxígeno transportado por la hemoglobina en el interior de los vasos sanguíneos
(pulsioximetria). El dedo o lóbulo de la oreja cumple la función de la cubeta.
- Determinación de enzimas, ácidos nucleicos y proteínas.
- Medición de pigmentos fotosintéticos (estimación de biomasa).
- Determinación del contenido de fósforo en un fertilizante o en el suelo.
GUÍA DE ESTUDIO 1
1. ¿Qué es una radiación electromagnética?
La radiación electromagnética es un tipo de campo electromagnético variable, es decir, una
combinación de campos eléctricos y magnéticos oscilantes, que se propagan a través del espacio
transportando energía de un lugar a otro.1 Desde el punto de vista clásico, la radiación
electromagnética son las ondas electromagnéticas generadas por las fuentes del campo
electromagnético y que se propagan a la velocidad de la luz.
2. ¿Qué sucede cuando una molécula absorbe energía?
Cuando una molécula interacciona con una onda electromagnética que porta una cantidad de
energía exactamente igual a la diferencia de energía entre el estado fundamental y el estado
excitado la molécula absorbe la energía y se produce la excitación. La excitación de la molécula
se puede utilizar para analizar los espectros de absorción y emisión.
3. Definición de espectro de absorción ¿Cuál es la utilidad?
El espectro de absorción es la representación gráfica de la probabilidad de absorción en función
de la longitud de onda. Nos permite conocer a qué longitud de onda de la radiación incidente se
obtendrá la absorción máxima de la especie a ser determinada para obtener la mejor
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sensibilidad en su cuantificación. El espectro de absorción se determina midiendo la absorbancia
a distintas longitudes de onda para establecer la frecuencia de máxima absorción.
4. Definición de absorbancia y transmitancia. Concepto de ley de Lambert y Beer.
La transmitancia es la relación directa que hay entre la intensidad de luz transmitida y la
I
intensidad de luz absorbida (T = I t ).
0
La absorbancia es el logaritmo con signo negativo de la transmitancia (A = − log T) o también,
es igual la diferencia entre 2 y el logaritmo de un cierto porcentaje de transmitancia (A = 2 −
log(%T)).
La Ley de Lambert-Beer establece que la absorbancia está directamente relacionada con las
propiedades intrínsecas del analito, con su concentración y con la longitud de la trayectoria del
haz de radiación al atravesar la muestra (A = ε ∙ b ∙ c).
5. Conocer los componentes básicos de un espectrofotómetro.
Los componentes básicos de un espectrofotómetro son: fuente de luz policromática, sistema
óptico, cubeta, detector (fototubo), procesador y lector de la señal.
6. ¿Cómo elige la longitud de onda de trabajo?
Para ello se utiliza el espectrograma o espectro de absorción que es un gráfico, característico
para cada analito, en el que se grafican las absorbancias del analito en función de la longitud de
onda incidente.
MÉTODO DE BIURET
Cuando la urea (principal producto terminal del metabolismo de las proteínas en los mamíferos) se
calienta a una temperatura de unos 180°C, se descompone transformándose en un producto llamado
“Biuret”, el cual en presencia de Cu2+ y en medio alcalino forma un complejo de color violeta.
GUÍA DE ESTUDIO 2
1. ¿Cómo puede determinar experimentalmente la concentración de una solución por
espectrofotometría Uv Visible?
En resumen, si tenemos una solución coloreada de concentración desconocida (TUBO
PROBLEMA) podemos determinar su concentración midiendo la absorbancia en el
espectrofotómetro a una longitud de onda apropiada. Esta longitud de onda se obtiene
previamente a partir del espectro de absorción.
Ya que nos interesa conocer solamente la absorbancia de la sustancia problema, primero es
necesario descontar la absorbancia de las sustancias de la solución que no nos interesan, por eso
se mide la absorbancia del TUBO BLANCO. Sin embargo, para poder determinar la concentración
de la sustancia de interés en la solución problema, es necesario construir previamente una curva
de calibración con valores de absorbancia obtenidos a partir de los TUBOS TESTIGOS.
Finalmente, la concentración de la sustancia de interés en el tubo problema se obtiene mediante
la interpolación del valor de absorbancia en la curva de calibración.
2. ¿Qué criterio emplea para seleccionar la longitud de onda óptima para efectuar una
determinación espectrofotométrica?
Para ello se utiliza el espectrograma o espectro de absorción que es un gráfico, característico
para cada analito, en el que se grafican las absorbancias del analito en función de la longitud de
onda incidente.
3. ¿Cómo construye y qué utilidad tiene una curva de calibración?
Para conocer la concentración de una solución problema se debe construir una curva de
calibración (gráfico que expresa la relación entre absorbancia y la concentración) de la especie
de interés. Esta curva permite determinar gráficamente la concentración de la solución a
cuantificar verificar si se cumple la ley de Lambert y Beer. En general se grafica absorbancia en
función de la concentración.
4. ¿Cómo se preparan y qué utilidad tienen los tubos blanco, testigo y problema?
Tubo blanco: contiene otras especies químicas a la misma concentración en que se encuentran
en el tubo problema, pero sin estar presente la sustancia que se desea cuantificar.
Tubo testigo: soluciones de concentración conocida de la sustancia en estudio.
Tubo problema: solución de concentración desconocida.
5. ¿Cuál es el fundamento químico del método de Biuret para cuantificar proteínas?
Cuando la urea (principal producto terminal del metabolismo de las proteínas en los mamíferos)
se calienta a una temperatura de unos 180°C, se descompone transformándose en un producto
llamado “Biuret”, el cual en presencia de Cu2+ y en medio alcalino forma un complejo de color
violeta.
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TAREA
Leer el artículo del pulsioxímetro de la guía de TP y responder (brevemente):
1. La saturación de oxígeno (SpO2) es una medida de la cantidad de oxígeno disponible en el
torrente sanguíneo; en la sangre saludable y normal es de entre un 95% y un 100%. Si en un
paciente X, un pulsioxímetro detecta una saturación parcial de oxígeno menor al 90%, entonces
comparándolo con un paciente normal:
a. ¿Qué podría decir con respecto a la cantidad de oxihemoglobina en el paciente en relación al
rango normal?
Si la saturación de oxígeno está por debajo del 90%, quiere decir que la cantidad de hemoglobina
oxigenada en el torrente sanguíneo está por debajo del porcentaje normal.
b. ¿Que podría inferir con respecto a la cantidad de luz absorbida a los 920 nm con respecto a la
absorbida a los 660 nm en relación a un paciente normal? ¿Por qué?
Se puede inferir que, en relación con un paciente normal, la luz absorbida a los 920nm
(oxihemoglobina) va a ser inferior a la absorbida a los 660nm (desoxihemoglobina).
2. Si Ud. como Ingeniero Biomédico debe asistir al desarrollo de un oxímetro de pulso, ¿cuáles
serían los valores de longitud de onda de los LED y el rango de saturación de oxígeno que
debería utilizar para dicho desarrollo? ¿Por qué?
¿?
3. Según la Ley de Lambert Beer, la absorbancia es directamente proporcional a la concentración
de la sustancia que absorbe, según la relación 𝐀 = 𝛆 ∙ 𝐛 ∙ 𝐜. Indique como están representadas las
variables de esta relación en un pulsioxímetro.
Relacionando el funcionamiento de un pulsioxímetro a la ley de Lambert-Beer, podemos decir
que b equivale al ancho del dedo o lóbulo de la oreja donde se esté midiendo la saturación, c
equivale a la concentración de oxihemoglobina, y ε equivale a la absortividad que tenga la
hemoglobina.
ENZIMAS
Las enzimas son catalizadores biológicos (incrementan la velocidad en que se forma producto en una
reacción).
Extraordinario poder catalítico, mucho mayor que la catálisis inorgánica.
CLASIFICACIÓN
Cuando comenzó el estudio de las enzimas para nombrarlas se usaba la función que cumplían con el
sufijo ASA.
El sustrato es la glucosa. El ATP cede uno de sus grupos fosfato y este va a ser captado por la glucosa
en posición 6. Como la función de esta enzima es transferir un fosfato desde el ATP a la glucosa, se la
denomina glucosa fosfotransferasa:
ATP + D-glucosa → ADP + D-glucosa 6-fosfato
Para sintetizar los nombres de los compuestos, la Unión Internacional de Bioquímica y Biología
Molecular estableció una serie de 4 números que definen a la enzima.
- Clase a la que pertenece la enzima.
- Subclase dentro de la clase.
- Sub-subclase (grupo funcional al cual se va a transformar o va a ser parte de la formación del
complejo enzima-sustrato)
- Grupo aceptor del grupo funcional del tercer número.
1 - Oxidoreductasas 3 - Hidrolasas
• Catalizan las reacciones redox - 2 - Transferasas
• Intervienen en reacciones
transferencias de electrones • Catalizan la transferencia de hidrólisis.
(iones hidruro o átomos de H) de grupos funcionales.
desde un grupo hacia el sustrato • Ej. Esterasas, peptidasas,
• Ej. Transaldolasas y fosfatasas, tiolasas,
o viceversa. transcetolasas. fosfolipasas, amidasas,
• Ej. Deshidrogenasas, oxidasas, Fosforiltransferasas, desaminasas,
peroxidasas, catalasas, quinasas, fosfomutasas. ribonucleasas.
oxigenasas, hidroxilasas.
2. Deshidrogenasas aerobias
Suelen trabajar con una coenzima (flavin mononucleótido). El
aceptor está reducido, el cual entra en un proceso redox, de oxida, y
los electrones van a ser transferidos desde el aceptor hacia el
oxígeno, dando como producto el peróxido de hidrógeno.
Ej: Un aminoácido se desamina mediante la reducción de la flavin
mononucleótido, se produce la liberación del grupo amino y la transformación del aminoácido
a cetoácido.
3. Deshidrogenasas anaerobias
Tienen la propiedad de transferir hidrógenos desde el aceptor
reducido a una coenzima reducida, la cual en una segunda
oportunidad se los transfiere a otro aceptor oxidado, el cual se
reduce. La diferencia con las deshidrogenasas aerobias es que en
las anaeróbicas no participa el oxígeno.
Ej: El succinato se va a oxidar, dando como producto de reacción el fumarato, y el NAD
(coenzima que participa) se reduce. La enzima que lleva a cabo es la succinato deshidrogenasa,
la cual es la única enzima del ciclo de Krebs que está incluida en la membrana interna de la
mitocondria, también conocida como complejo 2.
b. Catalasas (animales)
La reacción es la misma que en las peroxidasas.
5. Oxigenasas
a. Dioxigenasas (oxigenasa verdadera)
El aceptor en presencia de oxígeno da un aceptor oxidado.
Un aceptor reducido en presencia de oxígeno, da lugar a un aceptor dihidroxilado.
Se diferencian de las hidroxilasas porque el aceptor es oxidado y se usan los dos
oxígenos de la molécula, mientras que en las hidroxilasas de usa un solo oxígeno en el
grupo funcional hidroxilo.
A + O2 → AO2
AH2 + O2 → A(OH)2
b. Monooxigenasas (hidroxilasas)
A − H + O2 + CoH2 → AOH + H2 O + Co+ (NAD+ o IAD+ )
La reacción por sí sola no es una reacción rápida. Cuanto más alto sea el pico de energía, más lenta es
la reacción. Si se le da un lugar, como es el centro activo de la enzima, la reacción se va a producir
mucho más rápido, ya que requiere menos energía de activación.
▪ Azar
ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS
(Desarrollado previamente en clase teórica de proteínas).
Precipitación salina
Se agregan determinadas concentraciones de
una cierta sal al homogenato, logrando que la
proteína precipite, ya que las concentraciones de
sal en las que precipita una proteína varían
según el tipo de proteína.
Las proteínas precipitan porque en principio
están en solución (disueltas en agua). Son
polielectrolitos, es decir que tienen cargas
positivas y negativas, por lo que pueden
solvatarse con el agua.
Cuando se le agrega una sal, al tener una mayor
afinidad (solubilidad) la sal con el agua, lo que hace es “secuestrar” el agua y sacarle la solvatación a la
proteína, por lo que comienzan a “juntarse” entre sí y precipitan. Después, se usa una cierta filtración
para extraer las proteínas del agua con sal, para luego hacerles un lavado que permita terminar de
eliminar el agua con sal que pudiera quedar con las proteínas.
Cromatografía de afinidad
Nuevamente se tiene una columna con una fase estacionaria (el procedimiento es igual al de
filtración por exclusión molecular y de cromatografía de intercambio iónico, solamente varía la
matriz donde se filtran las proteínas). En este caso, la fase estacionaria está formada por moléculas
que se unen a una cierta proteína o porción de una proteína. Es mucho más específica que las
matrices anteriores. Se agregan las proteínas en solución (fase móvil) y las proteínas que no tengan
afinidad van a “pasar de largo”. Para poder separar las proteínas de las moléculas de la fase
estacionaria, se agrega una cierta solución que se corresponda a la afinidad de las moléculas, y
arrastra a las moléculas.
Isoeletroenfoque
Todas las proteínas tienen un punto isoeléctrico (aminoácidos básicos o ácidos) . Hay un determinado
pH para el cual la densidad de cargas negativas y positivas es igual. En la fase estacionaria hay un
gradiente de pH. Se hace correr un campo eléctrico, y las proteínas van a comenzar a migrar hasta
alcanzar su punto isoeléctrico dentro de la fase estacionaria.
Electroforesis bidimensional
Se realiza un isoelectroenfoque, se saca la columna de fase estacionaria y se lo “acuesta” sobre un gel
de polietilamida. Se hace pasar una corriente eléctrica, y las proteínas van a correr en base a su peso
molecular. Se obtiene una doble información: en forma de columnas se determina el peso molecular
de la proteína (aumenta desde arriba hacia abajo), y en forma de filas el punto isoeléctrico (de
izquierda a derecha disminuye).
Parámetros importantes
Proteína de interés
Actividad específica =
Proteínas totales
Actividad específica 2
Grado de purificación =
Actividad específica 1
Proteína de interés 2
Rendimiento:
Proteína de interés 1
Evaluación cualitativa
Alto grado de purificación Poca proteína para
y bajo rendimiento experimentar
Glucosa, fructosa.
Lineales
Polisacáridos
Tipos
Ramificados
Aldosas
Una aldosa es un monosacárido (un glúcido simple)
cuya molécula contiene un grupo aldehído, es decir,
un carbonilo en el extremo de la misma.
Cetosas
Tienen un grupo carbonilo en el centro de la
cadena carbonada.
El enlace o unión glicosídica es un tipo de unión química entre los glúcidos que se forma mediante la
eliminación de una molécula de agua. La unión tiene lugar entre el carbono 1 de un azúcar y el
carbono 4 de otro. Se forma un enlace α-glucosídico cuando el grupo -OH del carbono 1 está debalo
del plano del anillo de glucosa, y β-glucosídico cuando se encuentra por encima del mismo.
(Wikipedia).
(+20, +100, +1000
Almidón C/24 a 30 residuos
monosacáridos)
Polisacáridos
ramificados
Glucógeno C/8 a 12 residuos
METABOLISMO DE GLÚCIDOS
La glucosa viene por sangre y tiene que ingresar a la célula a través de la membrana plasmática
mediante un transportador. Una vez que ingresa a la célula se fosforila en el carbono 6 (se esterifica
un fosfato al carbono 6) La función de esto es generarle una carga a la glucosa para que no pueda salir
la membrana apolar de la membrana. Además, le produce un sitio de reconocimiento para las
enzimas. Una vez que ingresa comienzan los metabolismos:
- Glucólisis → se originan dos moléculas de piruvato (3 carbonos cada uno). El piruvato ingresa a
la matriz mitocondrial y allí por la vía aeróbica va hacia la formación del acetl-CoA (el piruvato
pierde uno de los carbonos y se genera CO2). Ese acetil-CoA ingresa a un nuevo ciclo
denominado ciclo de Krebs.
- Ciclo de Krebs → ingresa un acetil-CoA, se une a un producto, forma un ácido tricarboxílico y
como producto del ciclo de producen dos descarboxilaciones más (2CO2). El ciclo es
termodinámicamente favorable, por lo que en un momento se produce una gran liberación de
energía y se forma un ATP. Además, se forma NADH2 y FADH2, los cuales van por la matriz
mitocondrial a la membrana interna de la mitocondria, donde está la cadena respiratoria
(complejo proteico que tiene la capacidad de hacer pasar los protones al espacio
intermembranal). Los electrones van a fluir a favor de un gradiente, por lo que parte de esa
energía es captada para formar ATP (fosforilacion oxidativa) y se forman 6 moléculas de agua.
Manuela Bernay – mbernay@hotmail.com
La glucosa en presencia de oxígeno libera dióxido de carbono y agua (oxidación completa). Es la
inversa de la fotosíntesis. La reacción de fotosíntesis no es termodinámicamente favorable, requiere
de energía lumínica para producirse.
C6 H12 O6 + 6 O2 → 6 CO2 + 6 H2 O Oxidación completa
luz
6 CO2 + 6 H2 O → C6 H12 O6 + 6 O2 Fotosíntesis
Azul: espacios físicos.
Verde: metabolismos a estudiar.
Rojo: glucosa (precursor) y productos del metabolismo de la glucosa (CO2, H2O y energía como ATP).
GLUCÓLISIS
Es una vía metabólica que va desde glucosa a piruvato. La reacción inversa se denomina
gluconeogénesis (formación de glucosa a partir de piruvato, no se da en todos los organismos). Se
caracteriza por 5 reacciones acopladas:
FASE PREPARATORIA (etapa de gasto de energía – 2 ATP)
1. La hexoquinasa (transferasa) transfiere un grupo fosfato desde el ATP a un sustrato, en este
caso la glucosa. Se produce un éster entre el hidroxilo del carbono 6 de la glucosa y el fosfato
(da como producto la glucosa-6-fosfato). Es una reacción irreversible; la reversa es llevada a
cabo por fosfatasas.
2. Se isomerisa la estructura piranosa de la glucosa para dar otra hexosa con estructura furanosa,
mediante la acción de la fosfohexosa isomerasa.
3. Se produce la segunda fosforilación por parte de la fosfo-fructo-quinasa el extremo 1 de la
fructosa. Se forma una molécula prácticamente simétrica. Es una reacción irreversible; la
reversa es llevada a cabo por fosfatasas. La fosfo-fructo-quinasa (entre otras) es denominada
La vía oxidativa de la glucosa siempre sigue la misma dirección: glucosa → piruvato → acetil-coA. Si
falta oxígeno se va a producir ácido láctico, que rápidamente vuelve a constituir piruvato o glucosa
para reaprovecharse.
CICLO DE KREBS / CICLO DEL ÁCIDO CÍTRICO / CICLO DE LOS ÁCIDOS TRICARBOXÍLICOS
ENZIMA
REACCIÓN REACTIVO PRODUCTO CARACT.
CATALIZADORA
Ácido cítrico o
citrato (ácido
2 carbonos del tricarboxílico
acetil-CoA + 4 formado por 6
carbonos del carbonos: 3 Reacción
1 Condensación Citrato sintetasa
oxalacetato carbonos en irreversible
(ácido forma lineal con 1
dicarboxílico) grupo carboxilo
unido a cada uno
de ellos)
2° etapa – No oxidativa
La ribulosa-5-fosfato entra en una vía de reacciones reversibles con otras azúcares. Estas reacciones
convierten pentosas fosfato de nuevo en hexosas fosfato, permitiendo que continúen las reacciones de
oxidación.
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- La ribulosa-5-fosfato forma dos isómeros: ribosa-5-fosfato y xilulosa-5-fosfato.
- Las dos pentosas se
combinan y producen
una triosa-fosfato y una
heptosa-fosfato.
- Las dos moléculas
obtenidas se vuelven a
combinar y generan una
hexosa-fosfato y una
tetrosa fosfato.
- Una nueva
redistribución forma
giceraldehído-3-fosfato
y fructosa-6-fosfato,
ambos intermediarios
de la glucólisis.
GLUCOGENOGÉNESIS (almidón)
Es la formación de glucógeno a partir de moléculas simples (glucosa).
animales vegetales
⏞
glucógeno o ⏞
almidón → almacenamiento
Cuando hay un exceso glucosa {
⏟
disacáridos → transporte
plantas, insectos
𝛼
4) Uniones 1 → 6 → transglucosidasa (transferasa)
𝛼
Su fubnción principal es producir la ramificación de la cardena lineal 1 → 4. El hidroxilo del
carbono 1 va a reaccionar con el del carbono 6 para formr la primera ramificación.
𝛼
Luego continúa la g.s con uniones 1 → 4 hasta la próxima ramificación.
GLUCÓGENOLISIS
1) Fosforolisis
𝛼
Ataque de Pi sobre 1 → 4 y libera glu-1-P (glucosa fosforilada).
2) Transferasa
𝛼
Cuando hay una ramificación (unión 1 → 6) comienza a actuar una transferanza
𝛼
desrramificante. Translada unos 6/7 residuos de glucosa, rompe la unión 1 → 6, traslada la
𝛼 𝛼
cadena 1 → 4 al otro extremo de la cadena lineal, y deja por sí sola la cadena 1 → 6, la cual se
rompe liberando una glucosa no fosforilada.
3) Mutasa (P glucanmutasa)
Pasa el grupo fosfato del carbono 1 al carbono 6.
AMPc
La proteína G activa la
x moléculas de La información
vía de formación del
adrenalina/glucagón se primaria es llevada
AMPc a partir del ATP
unen a un receptor de hacia el interior celular
por acción de la
membrana. por la proteína G.
adenilato ciclasa.
La proteinquinasa va a
Aumenta el AMPc y se activan El AMPc va a hacer que
promover la
muchas enzimas, las cuales van una PKA
fosforilación de la
a hacer que el glucógeno libere (proteinquinasa) pase
fosforilasa quinasa
glucosa para que entre al de un estado inactivo a
(activación, hay un
medio (glucogenólisis). activo.
gasto de ATP).
ÁCIDOS GRASOS
Poseen un grupo carboxilo en el extremo de una larga cadena carbonada. Si tiene la presencia de
dobles enlaces se denomina ácido graso insaturado (puede ser mono o poliinsaturado). Mientras más
larga es la cadena, son menos solubles en agua.
Los ácidos grasos saturados, también llamados grasas, se disponen dentro de la célula de forma lineal,
y entre las cadenas hidrocarbonadas existen
enlaces hidrofóbicos no covalentes, dando un
empaquetamiento y grado de agregación
mayor que los insaturados, en los cuales la
presencia de los dobles enlaces,
principalmente en posición cis, no le
permiten mantener la disposición lineal, por
lo que el grado de agregación es menor.
En una de las
moléculas hay Glicerofosfolípidos
esterificado un
Fosfolípidos
grupo fosfato
(uno de los
Son lípidos ácidos grasos es
polares (al reemplazado por
Lípidos de membrana
Cofactores (vitamina K)
Hormonas (vitamina D,
hormonas sexuales)
Mensajes intra y
extracelulares
GLICEROFOSFOLÍPIDOS
2. Glicerofosfolípidos
Las fosfolipasas sí tienen un reconocimiento por el ácido graso dependiendo de la posición que
tenga.
- La fosfolipasa A1 rompe el enlace del ácido graso en posición 1. Una vez que se va el
ácido graso se obtiene un lisoderivado del fosfolípido.
- La fosfolipasa A2 hidroliza el ácido graso en posición 2. Una vez que se va el ácido graso
se obtiene un lisoderivado del fosfolípido.
- La fosfolipasa C hidroliza el éster del ácido fosfórico, obteniéndose un diacilglicerol y un
fosforil-X.
- La fosfolipasa D deja un producto fosforilado (fosfatidato) pero elimina la unión del
hidroxilo a la molécula X.
Enzimas
Son catalizadores biológicos de naturaleza proteica. Su función es disminuir la energía de activación
(Ea) de una reacción. Son mucho más efectivas que la mayoría de los catalizadores inorgánicos porque
tienen mayor especificidad, es decir que catalizan una reacción química determinada. Las sustancias
sobre las cuales actúan las enzimas se denominan sustratos.
Catálisis enzimática
Tiempo de incubación
BIOSÍNTESIS
La biosíntesis del colesterol se lleva a cabo en el hígado, en la corteza adrenal (parte de los órganos
suprarrenales), en la piel (es precursor de la vitamina D) y en el intestino. Está compuesta por 4
etapas:
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Etapa 1 – Condensación
1. A partir de 2 acetil-CoA, por la acción de una tiolasa, se produce la salida de una coenzima A y la
condensación de las moléculas para dar una molécula de 4 carbonos denominada acetoacetil-
CoA.
2. Una sintetasa promueve la condensación de la tercera molécula de acetil-CoA con la salida de
una coenzima A y la formación de un compuesto de 6 carbonos denominado β-hidroxi-β-
metilglutaril-CoA.
3. Se produce un proceso de oxidorreducción mediante la catálisis de una hidrogenasa,
produciéndose la oxidación del NAD a expensas de la reducción del glutaril para dar el
mevalonato, con la consecuente salida de la coenzima A.
Etapa 3 – Polimerización
1. Dos moléculas de isopentenil-pirofosfato se van a unir perdiendo un pirofosfato y formando un
geranil-pirofosfato.
2. Al geranil-pirofosfato se le une otra molécula de isopentenil-pirofosfato, formando el farnesil-
pirofosfato.
3. Dos moléculas de farnesil-pirofosfato se unen para dar escualeno.
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Etapa 4 – Ciclación
1. El escualeno va a tomar una disposición tal que la enzima ciclasa va a promover el cierre del
ciclopentano perhidrofenantreno y va a tener también una función hidroxilasa, hidroxilando el
anillo fusionado, formando el lanosterol.
2. En el lanosterol van a producirse 3 desmetilaciones, formando el zimesterol.
3. El doble enlace del zimesterol se va a translocar a otra posición formando el demosterol.
4. El demosterol se reduce y forma el colesterol.
TP6 – BIOCOMPATIBILIDAD
¿QUÉ ES UN BIOMATERIAL?
Diferentes definiciones:
- Material utilizado en un dispositivo médico, pensado para interactuar mutuamente con sistemas
biológicos.
- Cualquier sustancia o combinación de sustancias de origen natural o artificial que puede ser
usada durante cierto tiempo como un todo o como parte de un sistema que permite tratar,
aumentar o reemplazar algún tejido, órgano o función del cuerpo humano.
- Material sintético empleado para reemplazar parte de un sistema vivo o que está en íntimo
contacto con fluidos biológicos.
TIPOS DE BIOMATERIALES
Metálicos
Cerámicos
Poliméricos
¿QUÉ ES LA BIOCOMPATIBILIDAD?
La biocompatibilidad es la habilidad de un material para comportarse con una respuesta satisfactoria
en una situación específica.
Se deben tener en cuenta 3 factores:
- La respuesta de un material individual específico puede variar de un sitio de aplicación a otro,
por lo que la biocompatibilidad no depende solamente de las características del material sino
también de la situación en la que el material está siendo usado.
- Un número creciente de aplicaciones requieren que el material reaccione específicamente con el
tejido en vez de que sea ignorado por él, tal como se requiere con un material inerte.
- Algunas aplicaciones requieren que el material se degrade en el cuerpo, en vez de permanecer
indefinidamente.
Variables que influencian la biocompatibilidad
- Las características propias del biomaterial.
- La naturaleza y calidad de la intervención clínica que ubica el biomaterial en contacto con los
tejidos.
- Las características del individuo (edad, sexo, estado inmunológico, movilidad física, estulo de
vida, antecedentes farmacológicos).
- El diseño del dispositivo y la relación física entre el dispositivo y el cuerpo.
- La presencia o ausencia de microorganismos y endotoxinas.
Variables que pueden influenciar la respuesta del biomaterial
Material Respuesta del cuerpo
- Composición bulk, micro(o nano)-estructura, - Adsorción y desorción de proteínas.
morfología. - Efectos citológicos generales.
- Cristalinidad o cristalografía.
- Constantes elásticas.
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- Contenido de agua, balance hidrofóbico- - Producción de células gigantes
hidrofílico. extrañas, formación de tejido
- Macro, micro y nano porosidad. granular.
- Composición química superficial, gradientes - Comportamiento de fibroblastos y
químicos, movilidad molecular superficial. fibrosis.
- Topografía superficial. - Respuesta celular específica de los
- Energía superficial. tejidos u órganos.
- Propiedades eléctricas-electrónicas superficiales. - Adhesión plaquetaria.
- Parámetros de corrosión, toxicidad de iones - Producción de anticuerpos, respuesta
metálicos (para materiales metálicos). celular inmune.
- Perfiles de degradación, forma y toxicidad de - Hipersensibilidad aguda o baja.
productos de degradación (para polímeros). - Respuesta mutagénica, genotoxicidad.
- Aditivos, catálisis, contaminantes y su toxicidad - Toxicidad reproductiva.
(para polímeros). - Formación de tumores.
- Perfiles de disolución/degradación, degradación
de productos tóxicos (para cerámicos).
- Desgaste.
Establecer la biocompatibilidad de un dispositivo médico y de sus materiales es de gran
importancia para certificar la seguridad del producto. Los fabricantes deben establecer la seguridad y
vida útil de sus productos antes de comercializarlos. Se deben realizar estudios preclínicos del
potencial nocivo de los materiales o componentes para minimizar el riesgo clínico.
La norma internacional que regula esta importante propiedad es la norma ISO 10993, que funciona
como una guía y en sus 20 partes recomienda los ensayos a realizar en función del tiempo y tipo de
contacto del biomaterial con los tejidos del organismo vivo.
PREPARACIÓN DE FROTIS
- Después de que cada tubo ha sido incubado a 37°C durante 60 minutos, retirar el control
negativo o la muestra de prueba desde el tubo con pinzas permitiendo que la mayor cantidad
de sangre drene desde la muestra al tubo.
- Realizar una inspección visual de la muestra del material removido para evaluar la adhesión
de sangre o coágulos de sangre y registrar los resultados.
- Inmediatamente después de que el control negativo o la muestra son retirados y examinados,
agitar el tubo suavemente varias veces para mezclar la sangre y preparar dos frotis de cada
tubo. Las células pueden llegar a ser frágiles después de la exposición a materiales biológicos
y por lo tanto deben ser manejadas suavemente.
En 1955 Arthur Kornberg trabajó con E. Coli y descubrió los mecanismos de síntesis de ADN. Se
requieren 4 componentes:
1. dNTPs: dATP, dTTP, dGTP, dCTP (deoxiribonucleósidos 5’-trifosfatos → azúcar-base + 3
fosfatos).
2. Cebador de ADN.
3. ADN polimerasa (enzima de Kornberg).
4. Mg2+ (optimiza la actividad de la ADN polimerasa).
3 aspectos principales en la reacción
La replicación es un proceso muy exacto, porque la enzima no sólo tiene la capacidad de verificar sino
que también tiene actividad exonucleasa. La enzima si se equivoca puede cortar el extremo que acaba
de colocar, hace una “limpieza” y pone el nuevo nucleótido. Hay muchísimo gasto energético para que
no haya errores, ya que estos podrían dar lugar a diferentes tipos de enfermedades o patologías.
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La fidelidad de la replicación del ADN se mantiene mediante:
- La selección de bases por parte de la polimerasa (geometría correcta).
- La actividad de exonucleasa 3' → 5’ de corrección de pruebas (proofreading) que forma parte de
la mayoría de las ADN polimerasas.
- Los sistemas de reparación específicos para los desajustes que quedan después de la replicación.
Tipos diferentes de ADN polimerasa (en células procariotas)
Polimerasa Polimerización 5' → 3’ Exonucleasa 3' → 5’ Exonucleasa 5' → 3’ Número de copias
𝙸 Sí Sí Sí 400
𝙸𝙸 Sí Sí No ¿?
𝙸𝙸𝙸 Sí Sí No 10-20
Actividad exonucleasa 3' → 5’: capacidad de remover nucleótidos desde el extremo 3’ de la cadena.
- Importante capacidad de corrección de errores.
- Tasa de mutaciones sin la capacidad de corrección → 1x10-6.
- Tasa de mutaciones con capacidad de corrección → 1x10-9 (1000 veces menor).
La actividad exonucleasa funciona en la replicación y reparación del ADN.
La replicación bacteriana requiere al menos de 20 proteínas más aparte de la polimerasa III; y a todo
este complejo se lo conoce como replisoma o sistema de replicación de ADN.
TRANSCRIPCIÓN DE ADN
No se transcribe todo el ADN, sólo se
transcribe un gen o grupo de genes.
No es tan grave que haya un error, ya
que lo único que va a suceder es que
una proteína se convierta en no
funcional. La enzima encargada es
una ARN polimerasa. Sólo va a usar la
secuencia que tiene el sentido que
puede leer, es decir, 3’ → 5’.
La hebra de arriba se denomina
codificante porque el ARN sintetizado
va a tener la misma secuencia de
bases que esta hebra, sólo cambiando
la timina por el uracilo.
Como la ARN no va a duplicar al ADN,
hay factores de transcripción
(pedacitos de
proteínas o
polipéptidos) que
reconocen secuencias
específicas del ADN
para que la polimerasa
se pueda ubicar y
transcribir un gen. Si
está mal ubicada la
polimerasa, la
secuencia va a estar
mal.
En el ARN todos los transcriptos son inmaduros y requieren de un proceso de maduración. Siempre se
sintetizan precursores. Hay 3 ARN polimerasas distintas que están encargadas de madurar distintos
tipos de ARN.
El ARNm puede madurar mediante splicing de diferentes maneras, generando distintas proteínas
similares a partir de un mismo gen (empalme alternativo).
DEGRADACIÓN DE AMINOÁCIDOS
En los animales (vertebrados superiores) la degradación oxidativa de proteínas (libera energía) se da
bajo 3 circunstancias metabólicas:
1. Durante la síntesis y degradación normales de proteínas celulares (renovación de proteínas,
cuando la proteína cumple su función deben renovarse – alrededor del 75% de estas proteínas
se recicla).
2. Cuando una dieta es rica en proteínas y la ingestión de
aminoácidos supera las necesidades de proteínas del cuerpo, el
excedente se cataboliza (degrada), no se puede almacenar.
3. Durante la inanición o la diabetes no controlada, cuando no hay
carbohidratos disponibles o no están siendo utilizados
correctamente, las proteínas se usan como combustible (se
produce bajo condiciones patológicas).
En el estómago, en un medio ácido y bajo efecto de una enzima comienza
la degradación, la cual continúa en el intestino, en un pH neutro,
mediante la acción de otra enzima.
3) Desaminación no oxidativa
Se produce en aminoácidos muy especiales.
4) Descarboxilación
FORMAS DE EXCRECIÓN
El 75% de los grupos aminos liberados en las desaminaciones se recicla, y el 25% restante se excreta.
Dependiendo del tipo de organismo se va a excretar de diferentes formas.
- Peces o formas más inmaduras de anfibios → NH3 (grupo amino)
- Reptiles y aves → ácido úrico
- Animales superiores → urea (no tóxica, suele utilizarse como fertilizante)
Desaminaciones fuera del hígado
El grupo amino producido en tejidos diferentes al hígado se une al glutamato por acción de la glutamina
sintetasa, con gasto de ATP, para dar glutamina (es como un glutamato pero con otro grupo amino).
Esta glutamina puede salir de la célula e ir a la sangre, y es transportada hacia el hígado.
Ácido úrico
CICLO DE LA UREA
El ciclo de la urea empieza desde el interior de las mitocondrias del hígado. La urea (producto final)
posee 2 grupos aminos: la primera reacción química del grupo amino se produce en la matriz
mitocondrial (el grupo proviene de una desaminación), y la incorporación del segundo grupo amino
de la urea es citosólica (el grupo proviene de un aminoácido).
Es una vía de 5 enzimas:
Enzimas mitocondriales Enzimas citosólicas
1 Carbamil P sintetasa 3 Arginin-succinato sintetasa
2 Ornitín transcarbonilasa 4 Arginin-succinasa
5 Arginasa
1. El NH4 generado en las mitocondrias hepáticas se utiliza únicamente e inmediatamente junto
con el CO2 producido por la respiración mitocondrial, generando carbamil P en la matriz. Esta
reacción dependiente del gasto de 2 ATP es catalizada por la carbamil P sintetasa.
2. El carbamil fosfato por acción de la ornitín transcarbonilasa, se condensa con la ornitina para
formar citrulina y libera el grupo fosfato. Se produce un ataque nucleofílico del grupo amino de
la ornitina sobre el grupo carbonilo de la carbamil P. Por acción de la enzima se libera el grupo
fosfato y queda constituida la citrulina.
3. La citrulina abandona la matriz mitocondrial hacia el citosol. El segundo grupo amino se
introduce a partir del aspartato mediante una reacción de condensación entre el grupo amino
del aspartato y el grupo carbonilo de la citrulina, que forma arginin-succinato. Este tipo de
reacción citosólica, catalizada por la arginin-succinasa, requiere del gasto de 1 ATP.
4. Se corta reversiblemente el arginin-succinato por la arginin-succinasa, para formar arginina
libre y fumarato, que entra en la mitocondria y se une a la reserva de intermedios del ciclo del
ácido cítrico.
5. La enzima citosólica arginasa corta la arginina dando urea y ornitina. La ornitina es transportada
a la mitocondria para iniciar otra vuelta del ciclo de la urea.
Se forma el uroporfirinógeno
Pierde 6 hidrógenos y queda
(estructura de tetrapirrol), con
constituída una proto-porfirina
cadenas laterales de acetilos o
coloreada
poprionilos
FORMAS DE LA HEMOGLOBINA
1) OXI-hemoglobina
Hemoglobina unida al oxígeno (lo transporta unido al hierro). Es la ferroproteína que tiene
como función el transporte del oxígeno hacia los tejidos.
2) CARBO-hemoglobina
Hemoglobina unida al dióxido de carbono (lo transporta unido al grupo amino, formando el
ácido carbamínico). Es la ferroproteína que tiene como función el transporte del dióxido de
carbono desde los tejidos.
3) CARBOXI-hemoglobina
Hemoglobina unida al monóxido de carbono (lo transporta unido al hierro). El monóxido es
tóxico, ya que inhibe la cadena respiratoria: compite con el oxígeno y tiene una afinidad mayor
que éste; la hemoglobina se va a unir más rápido al monóxido de carbono que al oxígeno. Por
Se recuperan y entran
Globina Formada por
en otros procesos
(proteína) aminoácidos
biosintéticos
Hemoglobina
Entra a
Grupo hemo
degradación
Recambio de 6
g/día
transcripción traducción
ADN → ARNm → Proteínas
↓
lenguaje de 4 letras → lenguaje de 20 letras
↓
CÓDIGO GENÉTICO → 64 tripletes → 20 aminoácidos
PREGUNTA DE PARCIAL: Características del código genético
Todos los organismos usan el mismo
Universal
código de tripletes
SÍNTESIS DE PROTEÍNAS
La síntesis de proteínas requiere de un ARNm que lleva la transcripción de la lectura del ADN (nunca
abandona el núcleo) por una complementariedad de bases, un aminoácido activado y una organela
particular denominada ribosomas, formados por una subunidad menor y una subunidad mayor, en las
cuales primero el ARNm se posiciona en la subunidad menor y luego se une la mayor. A medida que se
va elongando la cadena se van formando las uniones peptídicas hasta la lectura del código stop,
cuando se libera la proteína.
2. Iniciación
3. Elongación
En la etapa de elongación, los factores de elongación van a
promover la búsqueda del aminoácido que corresponda
a la lectura del triplete que continúa en la cadena.
El factor de elongación 1 va a promover el
acercamiento del ARNt unido a la cerina y su
localización por complementariedad de bases del
codón y anticodón, con gasto de energía. La cerina queda
posicionada en la posición A de la subunidad mayor,
mientras que en la posición P se encuentra la cadena
previamente formada.
La peptidil-transferasa cataliza el ataque
nucleofílico del grupo amino de la cerina
sobre el grupo carbonilo del
carboxilo de la alanina (unión
peptídica entre los
aminoácidos). Es una enzima
que utiliza la energía
liberada del enlace entre el
ARNt y el aminoácido.
El ribosoma se mueve hacia el siguiente triplete,
dejando a la cadena recién formada en la posición P del
mismo, para volver a iniciar el proceso de elongación. Esta
traslocación del ribosoma también implica un gasto de energía.
EFICIENCIA TERMODINÁMICA
• 4 ATP por cada enlace peptídico
• 4 x 30,5 kJ/mol = -122 kJ/mol
• 1 enlace peptídico = 21 kJ/mol
ΔG = - 101 kJ/mol
5. Plegamiento de la proteína
PREGUNTA DE PARCIAL: ¿Por qué es tan cara (en términos energéticos) la síntesis/traducción de
proteínas? Tiene una eficiencia negativa debido a que se necesita guardar fidelidad en la copia. Puede
haber mutaciones en el ADN que pueden mejorar o perjudicar a la genética (mejorar una especie o
llevarla a la extinción).
MUTACIONES
Son un cambio en la secuencia del ADN que llevan a un cambio en la lectura, y por lo tanto, un cambio
en la estructura del ARNm. Estos cambios pueden ser:
a) Puntuales
Pueden ser el reemplazo de una base por otra (transición o transversión), o la adición o
pérdida de una base.
Consecuencias:
o 3° base sin significado → silenciosa (no influye en la estructura de la cadena, el
aminoácido sigue siendo el mismo).
o Cambiar 1 aminoácido por otro → sin consecuencias (neutro).
→ cambiar la conformación espacial (espacio) y alterar
función (centro activo).
b) Cambios estructurales en cromosomas
Alteran una porción del cromosoma.
1. Deleción
2. Duplicación
3. Inversión
4. Translocación (si tengo un código que es UAA-GUA, la translocación sería GUA-UAA).
Algunos factores de transcripción activan la transcripción. Por ejemplo, pueden ayudar a que los
factores generales de transcripción y/o la ARN polimerasa se unan al promotor.
Regulación negativa
Caso a) El represor se va a unir
al operador y no va a permitir que la
ARN polimerasa se una al promotor
y continúe la lectura, pero a la vez,
puede haber una señal molecular
que cuando se une al represor lo
libera del sitio operador, por lo que
permite que la ARN polimerasa se
una y empiece a transcribir el gen.
Caso b) El operador está libre,
por lo que la ARN polimerasa puede
unirse al promotor y leer la
secuencia. El represor, en presencia
de una señal molecular, sí se va a
unir al sitio del operador e impedir la
transcripción.
Regulación positiva
Caso c) Los activadores se unen
cerca del promotor. El activador va a
promover que la ARN polimerasa lea
los genes. Cuando hay una señal
molecular que se une al activador
puede anular su función,
separándolo del su sitio en el gen.
Caso d) El activador está libre,
por lo que la ARN polimerasa no va a
empezar la lectura de los genes. El
activador, en presencia de una señal
molecular, se une al sitio que le
corresponde en el gen y permitiendo
que la enzima comience a transcribir.
Lo que hace interesante a este operón es que utiliza un sistema muy particular de regulación: la
atenuación, basado en el estrecho acoplamiento que existe entre transcripción y traducción en los
procariotas. Con la atenuación se consigue coordinar la velocidad de síntesis de los aminoácidos con la
velocidad de crecimiento. Por lo tanto, es un operón con doble regulación: sensibilidad al triptófano y
atenuación. El sistema de represión actúa bajo el efecto de la concentración intracelular del Trp
mientras que la atenuación responde a la concentración de tRNAtrp cargado. Esto permite que el
proceso de traducción afecte directamente la transcripción del operón.
Cuando la concentración de triptófano es alta, pueden darse 2 situaciones:
- El mismo triptófano se une a un sitio del represor y ese represor se une al operador, inhibiendo
completamente la continuación de la lectura de los genes (represión).
- Se reprime la traducción, pero en una parte de la secuencia líder se forma una pequeña porción
de ARNm denominado ARNm atenuado (atenuación).
En este sistema, el represor Trp actúa como un sensor y como un interruptor. Detecta si triptófano ya
está presente en niveles altos, y si es así, "apaga" al operón, para prevenir que se produzcan enzimas
biosintéticas innecesarias.
TRANSDUCCIÓN DE SEÑALES
TIPOS DE SEÑALES CELULARES
Señales extracelulares
Las señales extracelulares son traducidas en señales
intracelulares. La unión de moléculas de señalización
extracelulares o ligandos con los receptores celulares
situados en la superficie externa de la membrana
plasmática desencadena los eventos hacia el interior de la
célula.
Algunas señales a las que responden las células son:
- Antígenos.
- Glicoproteínas/oligosacáridos de la
superficie de las células.
- Señales de desarrollo. - Tacto.
- Componentes de la matriz extracelular. - Neurotransmisores.
- Factores de crecimiento. - Olores.
- Hormonas. - Feromonas.
- Luz (receptores de los ojos). - Sabores.
Señales endocrinas Señales paracrinas
Las hormonas son producidas por células del Sólo actúan sobre células diana que se
sistema endocrino y circulan por el torrente encuentran en la vecindad de las células
sanguíneo hasta alcanzar todos los lugares del emisoras, como por ejemplo los
cuerpo. Es de respuesta lenta, inespecífica, larga neurotransmisores.
duración y actúa a distancia. Respuesta local.
Señales yuxtacrinas
Señales autocrinas
Son transmitidas a lo largo de la membrana
Afectan sólo a las células que son del mismo tipo
celular a través de proteínas o lípidos que
celular como las células emisoras. Un ejemplo de
integran la membrana celular y son capaces de
señales autocrinas se encuentra en las células
afectar tanto a la célula emisora como a las
del sistema inmune.
células inmediatamente adyacentes.
RECEPTORES
Son proteínas grandes altamente especializadas que comunican el medio extracelular con el
intracelular; su mediación producirá moléculas que modulan funcionamiento intra y extracelular.
Características de los receptores
← Especificidad: se une a un solo tipo de ligando.
Afinidad: fuerza con la que el ligando se une al receptor.
Actividad específica: promover cambios tróficos y
funcionales de la célula blanco.
Amplificación →: reciben una señal y en el
interior celular pueden activar a una
enzima que a su vez activa a 3 enzimas, cada una de las
cuáles activa a 3 enzimas más, y así sucesivamente,
amplificando la señal.
← Desensibilización/Adaptación: el receptor permanece activo un tiempo y da una
respuesta. Luego entra en un estado en el cual por más que esté unido al ligando, no
va a emitir ninguna respuesta.
Integración →: si hay dos receptores con efectos opuestos,
existe una integración en la cual se va a decidir en
función de cuál de los dos receptores esté más activado.
Los receptores pueden ser para hormonas, anticuerpos, bacterias, virus, para
reacción con otras células, toxinas o lactinas.
Ligandos
El ligando no es metabolizado a productos útiles, no es intermediario en
cualquier actividad celular y no tiene propiedades enzimáticas. La única función
del ligando es cambiar las propiedades del receptor.
Tipos de receptores
- Los canales iónicos activados por ligando son canales de iones que abren en respuesta a la
unión de un ligando. Para formar un canal, este tipo de receptores de superficie celular tiene
una región que atraviesa la membrana con un canal hidrofílico (que ama el agua) en medio. El
canal permite que los iones crucen la membrana sin tener que tocar el centro hidrofóbico de
la bicapa de fosfolípidos.
- Los receptores ligados a enzimas son receptores de superficie celular con dominios
intracelulares asociados a una enzima. En algunos casos, el dominio intracelular del receptor es
realmente una enzima que puede catalizar una reacción. Otros receptores asociados a enzimas
tienen un dominio intracelular que interactúa con una enzima.
- Los receptores acoplados a proteína G (GPCR) son una gran familia de receptores de superficie
celular que comparten una estructura y métodos de señalización similares. Todos los
miembros de la familia GPCR tienen siete segmentos de proteína diferentes que cruzan la
membrana y transmiten señales dentro de la célula mediante un tipo de proteína llamada
proteína G.