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LABORATORIO CLÍNICO
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TEMARIO
• ¿Qué queremos decir cuando hablamos de Big Data y Data
Science?
• ¿Cuál es la relación con Laboratorio Clínico?
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BIG DATA: ¿QUÉ ES?
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BIG DATA: ¿QUÉ ES?
Por lo tanto…
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Lo que sabemos
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CIENCIA DE DATOS: ¿QUÉ ES?
Búsqueda de información
con significado dentro de un
gran set de datos.
Multidisciplinario
Con un propósito:
1) Predicción
2) Toma de decisiones
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CIENCIA DE DATOS: ¿QUÉ ES?
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APLICACIÓN EN BIOMEDICINA
• Predictores clínicos
• Biomarcadores. Nuevos test diagnósticos
• Medicina Personalizada
• Desarrollo de fármacos
• Predicción y control de brotes epidémicos
• Biología de sistemas
• Evaluaciones económicas en salud
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APLICACIÓN EN LABORATORIO CLÍNICO
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BIG DATA Y CONTROL DE CALIDAD
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BIG DATA Y CONTROL DE CALIDAD
La Alternativa:
Control de Calidad centrado en Pacientes
• Basado en el uso de muestras de pacientes
• Costo nominal
• Resultados robustos y reproducibles en
laboratorios/analitos con suficiente demanda de
exámenes
• Permite monitorización en tiempo real
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BIG DATA Y CONTROL DE CALIDAD
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BIG DATA Y CONTROL DE CALIDAD
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BIG DATA Y CONTROL DE CALIDAD
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BIG DATA Y CONTROL DE CALIDAD
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BIG DATA CONTROL DE CALIDAD
Corrida Real para Creatinina. A) Mediana móvil para creatinina (3 canales), mostrando
uno de ellos fuera de control. B) Gráfica de Bland-Altman mostrando comparación entre
los valores del bloque analizados en instrumento en control y fuera de control
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BIG DATA Y CONTROL DE CALIDAD
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MULTIDISCIPLINA:
¡TODOS PARA UNO… UNO PARA TODOS!
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TRASTORNO POR DÉFICIT DE ATENCIÓN E
HIPERACTIVIDAD (TDAH)
Impulsivida
Inatención Hiperactividad
d
dimensiones
TDAH
DSM-5 ICD-10
Feldman, H. M. and M. I. Reiff (2014). "Clinical practice. Attention deficit-hyperactivity disorder in children and adolescents."
N Engl J Med 370(9): 838-846.
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RELEVANCIA
Seguimiento
183049
años/persona
grupo TDAH
Dalsgaard, S. et al (2015). "Mortality in children, adolescents, and adults with attention deficit
hyperactivity disorder: a nationwide cohort study." Lancet 385(9983): 2190-2196.
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EL DIAGNÓSTICO DE TDAH PUEDE SER
UNA PESADILLA PARA EL MÉDICO
CLÍNICO
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MODELO CLÁSICO: DOPAMINA
Genes Ambiente
Disfunción circuitos Dopaminérgicos
Mesocorticale Nigro-
Mesolimbicos
s estriatales
Déficit de la atención y
Impulsividad. Pobre
desorganización del Aversión a la espera por la
adquisición de hábitos
comportamiento recompensa
Sagvolden, T., et al. (2005). "A dynamic developmental theory of attention-deficit/hyperactivity disorder (ADHD) predominantly
hyperactive/impulsive and combined subtypes." Behav Brain Sci 28(3): 397-419; discussion 419-368.
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NUEVAS HIPÓTESIS: MIELINA
128
64
Serum levels (uM)
32
4
ol
ol
ol
ol
D
D
ol
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ol
ol
H
H
tr
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D
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A
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-C
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R
R
R
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U
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ESFINGOLÍPIDOS Y TDAH:
SIN DATA SCIENCE
ROC
Area bajo la curva (AUC):
0.81 (95% CI: 0.71- 0.89)
p-value<0.0001
Sensibilidad: 79%
Especificidad: 78%
VPN: 98%
Henriquez-Henriquez, M.P., et al (2015). "Low serum sphingolipids in children with attention deficit-hyperactivity disorder."
Front Neurosci 9: 300.
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ESFINGOLÍPIDOS Y TDAH:
Cases = 25 CON DATA SCIENCE
Controls = 29
Red Neuronal con 6 analitos
seleccionados entre 60 especies
100 moleculares y ratios
biológicamente significativos
80
AUC = 0.95
Sensitivity%
60
Sensitivity = 93.1%
40
Specificity = 84.0%
20
0
0 20 40 60 80 100
100% - Specificity%
CerS6KO
Wild
Ebel, P., …Willecke,K. (2013). "Inactivation of ceramide Niimi, K., C. Nishioka, T. Miyamoto, E. Takahashi, I. Miyoshi, C
synthase 6 in mice results in an altered sphingolipid Itakura and T. Yamashita (2011). "Impairment of
metabolism and behavioral abnormalities." J Biol Chem neuropsychological behaviors in ganglioside GM3-knockout
288(29): 21433-21447. mice." Biochem Biophys Res Commun 406(4): 524-528.
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GRANDES DESAFÍOS EN LA INTERFASE
MATEMÁTICA- BIOQUÍMICA CLÍNICA
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MENSAJES DE DESPEDIDA
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Escuela de Medicina
INFORMACIÓN DE CONTACTO
¡¡¡¡¡Gracias!!!
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