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Límite de resolución de MO
Separación límite a la que dos objetos pueden verse como separados.
1. Longitud de onda
No se pueden distinguir dos puntos que estén a una distancia menor que la longitud de onda
usada para verlos.
𝐴𝑁 = 𝑛 . 𝑠𝑒𝑛θ
1. Fijación: para hacer células permeables a los colorantes, las estabiliza y mantiene en
posición.
- inmersión en aldehídos activos: formaldehído y glutaraldehído
2. Inclusión: para preservar se deben incluir en un medio de soporte ya que los tejidos
siguen siendo muy blandos y frágiles
- ceras o resinas
Secciones por congelación: congelación rápida y cortada con criostato, puede evitar artefactos.
Tinción
Las células son incoloras y traslúcidas (casi invisibles al microscopio óptico convencional). No
presentan demasiados elementos que impidan el paso de rayos de luz.
⇓
A finales del siglo 19 se empezaron a usar colorantes.
Hoy:
● variedad de colorantes orgánicos que presentan afinidad específica por ciertos
componentes celulares → no son muy específicos a nivel molecular
● Métodos que revelan proteínas y otras macromoléculas específicas → difícil conseguir
la sensibilidad adecuada (incrementar n° de moléculas de colorante a cada
macromolécula)
MICROSCOPÍA DE FLUORESCENCIA
Usado en fluoróforos (moléculas fluorescentes) → intensidad y color son características de la
molécula usada (aparece brillante sobre un fondo oscuro)
Fenómeno natural:
Luz pasa a través de célula viva → fase de onda varía por índice de refracción de célula
La luz que atraviesa zonas más gruesas o densas se retrasa y su fase queda desplazada en
relación a la luz que atravesó una región más fina.
Este microscopio aprovecha los efectos de interferencia que se producen al combinarse los dos
grupos de onda → crea imagen de la estructura celular
● zona gruesa (fase desplazada): núcleo
● zona fina: citoplasma
● Observar células durante largos períodos de tiempo con baja intensidad de luz → evita
los daños de la luz intensa (y caliente) prolongada.
● Imágenes digitalizadas que se pueden procesar para obtener más información
● Alcanzar máximo de resolución → compensa fallos ópticos de microscopios
● Incrementa el contraste → necesario para detectar pequeñas diferencias (detección
limitada por nuestra vista)
Fuente láser: se debe iluminar solo un pequeño punto a una profundidad determinada
Las lentes son bobinas magnéticas (no de vidrio como en mo). Enfocan el haz de electrones.
Formación de imágen
La muestra se coloca en el camino del haz de electrones y la atraviesan
● Algunos electrones son dispersadas por partes densas
● El resto de los electrones se enfocan formando una imagen sobre una placa o pantalla
⬇
Las regiones densas de la muestra aparecen negras → áreas de un flujo bajo de electrones
Preparación
NO se pueden observar muestras vivas (por el vacío).
Muestras libres de agua y de otros solventes volátiles.
Técnicas del ME
Sombreado metálico
Se estudia superficie de forma que vemos macromoléculas individuales.
Se evapora sobre la muestra una película de metal de forma oblicua para generar capas de
diferentes grosores. Sombrea generando un efecto tridimensional
El material orgánico (generalmente) se elimina luego del sombreado
Criofractura
Visualizar interior de membranas celulares (como las partículas intramembrana)
Células se congelan a la temperatura del nitrógeno líquido con un anticongelante para que no
haya hielo que las distorsione
Se fracciona el bloque con una cuchilla por el centro hidrofóbico de la bicapa lipídica.
Tinción negativa
Permite observar detalles de macromoléculas aisladas.
Se aplica capa de carbón, luego de metal pesado que se distribuye donde no está la molécula.
Los electrones pasan en mayor flujo por la molécula (imagen negativa de la molécula)
MEMBRANA PLASMÁTICA
Funciones básicas:
Establece gradientes iónicos que son usados para sintetizar ATP, dirigir el movimiento de
solutos a través de membrana, produce y transmite señales eléctricas.
Las proteínas de membrana pueden actuar como sensores de señales externas, permite a la
célula modificarse en respuesta a indicaciones ambientales.
ESTRUCTURA
Todas las membranas presentan una estructura básica común: moléculas lipídicas y proteicas
unidas por interacciones no covalentes.
- Membrana como estructura dinámica y fluida: sus componentes no están fijos, pueden
moverse pero con ciertas restricciones. La localización de los componentes no es al
azar, sino que su localización atiende a la función a desempeñar en esa zona.
Bicapa lipídica
● Estructura básica de la membrana.
● Barrera impermeable al paso de la mayoría de moléculas hidrosolubles
● Sintetizada en el Retículo Endoplasmático (RE)
Fosfolípidos
Principales formadores de la bicapa.
➢ Cabeza polar
➢ 2 colas hidrocarbonadas hidrofóbicas → una tiene dobles enlaces cis (genera curvatura)
La diferencia de longitud de colas y de grado de saturación afectan la capacidad de las
moléculas de empaquetarse, afectando la fluidez de la membrana.
Mucha variedad de fosfolípidos: algunas proteínas sólo pueden actuar en presencia de grupos
de cabeza de determinados fosfolípidos
Movimientos de fosfolípidos
Colesterol
Las membranas plasmáticas eucariotas contienen cantidades
elevadas de colesterol. Ausente en bacterias
Glucolípidos
Moléculas lipídicas que contienen azúcares.
Solo están en la monocapa no citoplasmática de la bicapa (grupos azucar al descubierto en
superficie de célula)→ son las moléculas con mayor asimetría en su distribución.
Funciones supuestas
Interacciones de la célula con el entorno → supuesto por localización de los azúcares en la
superficie de la célula.
➢ Protección de la membrana a condiciones adversas → en células epiteliales se
encuentran confinados a la cara apical.
➢ Glucolípidos con carga alterarían campo eléctrico a través de membrana y
concentración de iones
➢ Aislamiento eléctrico →están en gran cantidad en la monocapa no citoplasmática de la
membrana mielínica de axones
➢ Reconocimiento celular
FLUIDEZ EN LA BICAPA
Depende de:
Temperatura
Transición de fase: punto de congelación característico de membranas donde pasan de un
estado líquido a uno cristalino rígido → cambia fluidez
↓
● Diferente para diferentes lípidos.
● Menor para lípidos de colas cortas y dobles enlaces: con menor longitud interaccionan
menos y los dobles enlaces les hace más difícil el empaquetamiento → permite que la
membrana sea fluida a temperaturas más bajas
Composición (tipos de lípidos)
Colesterol:
● Disminuye la movilidad de los primeros grupos CH2 de las colas fosfolipídicas → hace a
la membrana más rígida en esa región
● Impide que las colas se junten y cristalicen → inhibe posibles transiciones de fase
Microscopio electrónico
En el ME vemos la bicapa como estructura trilaminar.
● 2 láminas: cabezas de los fosfolípidos → las vemos negras porque son zonas densas
● 1 lámina: colas → las vemos como una zona blanca entre las cabezas porque es una
zona no densa
Para distinguir qué zona es citosol y cuál matriz tenemos que fijarnos si vemos membranas de
organelos.
➔ No permite ver las proteinas
Funciones propuestas
Ayudan a organizar proteínas de membrana y concentrarse para:
- Su posterior transporte en vesículas
- Permitir que funcionen juntas, por ejemplo: transduciendo señales intra y extracelulares
Controversia
Se cuestiona si estos microdominios existen (y si tienen una verdadera relevancia funcional) o
si son agrupaciones de lípidos al azar generadas por el dinamismo de la membrana.
La controversia se debe a que todavía existen limitantes técnicas que no permiten probar los
dominios in vivo.
GLUCOCALIZ O CUBIERTA CELULAR: los oligosacáridos que cubren tanto proteínas como
lípidos en la superficie celular
PROTEÍNAS
Imponen a cada membrana sus propiedades funcionales características
La cantidad y el tipo de proteínas de una membrana es muy variable.
Ejemplos:
- vaina de mielina, menos de un 25% de su masa es proteína, ya que su función requiere
principalmente de lípidos
- membranas dedicadas a transducción de energía, el 75% de su masa es proteína
- membrana plasmática normal, un 50% de su masa es proteína
⇩
Debido a que las moléculas lipídicas son más pequeñas, en todos los casos siempre hay más
moléculas lipídicas que proteicas.
3. Unidas a la membrana a través de una unión covalente a un lípido (ácido graso o grupo
prenil) de la monocapa citoplasmática
↳ se generaron como proteínas solubles en el citosol y posteriormente se
trasladaron hacia la membrana
.
4. Unidas a través de un oligosacárido a un fosfolípido (fosfatidilinositol) en la monocapa
no citoplasmática
1. Detergentes
Pequeñas moléculas anfipáticas que forman micelas en el agua (sustituyen lípidos)
Detergentes iónicos: los extremos polares del detergente pueden estar cargados, ej: SDS
(también los hay no cargados).
- permiten solubilizar las proteínas de membrana más hidrofóbicas.
- Despliegan las proteínas (las desnaturalizan) para solubilizarlas, inactivandolas y no
permitiendo realizar estudios funcionales.
En algunos casos al eliminar el detergente pueden ser renaturalizadas
⇩
Luego de solubilizar las proteínas, se puede separarlas por peso molecular (electroforesis) -
hoy en día podemos hacer espectrometría de masas.
1. Se expone célula a medio con una concentración de solutos menores al interior celular
2. Agua fluye hacia adentro de célula
3. Lisis celular
4. Obtenemos fantasmas de membrana.
Espectrina:
Proteína periférica → proteína del citoesqueleto asociada no covalentemente a la cara
citoplasmática
Glucoforina:
Glucoproteína transmembrana paso único: atraviesa la bicapa formando una hélice alfa de
paso único.
- Cola amino terminal: superficie externa donde a donde se unen los carbohidratos (a
cola amino terminal → mayoría de la masa en superficie externa
- Extremo carboxilo terminal: expuesto hacia el citoplasma
- Segmento α-helicoidal: zona hidrofóbica que atraviesa la bicapa
Banda 3:
Proteína transmembrana multipaso: atraviesan membrana en conformación muy plegada
(atraviesa la membrana hasta 14 veces).
Cataliza el cotransporte aniónico
Permite el transporte pasivo de moléculas polares
Criofractura
Permite partir la bicapa lipídica y ver proteinas (pero no identificarlas)
Permiten:
● Captan varias formas de energía
● Transducir las señales extraceulares en intracelulares
Dominios específicos para lípidos y proteínas
Hay sistemas que permiten restringir proteínas y lípidos en dominios específicos.
Difusión restringida.
➢ Célula tiene un polaridad funcional: permite generar funciones específicas para cada
dominio, asimetría que es esencial en muchas estructuras
Ejemplo:
Células epiteliales
Hay proteínas que solo se encuentran en la superficie apical y otras solo en las
superficies basales y laterales (esencial para difundir en direcciones correctas)
La composición lipídica también será diferente en estos dominios
● Por barreras formadas por un tipo de uniones intercelulares (las proteínas que forman
estas uniones no pueden difundir lateralmente entre las membranas que interactúan)
Carbohidratos
Cadenas de oligosacáridos
La membrana como barrera, mantiene las diferentes concentraciones entre el citosol y la matriz
extracelular.
Se necesitan sistemas para poder transportar solutos a través de la barrera (de forma de
regular concentraciones, excretar productos y nutrirse de otros).
Difusión simple
Moléculas que pueden atravesar la membrana por difusión simple.
Con el tiempo la molécula, a pesar de ser hidrofílica, puede acabar difundiendo a favor de su
gradiente de concentración.
➢ Las familias de proteínas transportadoras son pocas, pero una familia puede contener
muchas proteínas diferentes.
● Proteínas CANALES
● Proteínas TRANSPORTADORAS
PROTEÍNAS CANALES
Forman un estrecho poro que permite el transporte pasivo de pequeños iones específicos
Estructura:
Tienen un centro hidrofóbico que permite el pasaje de solutos hidrofílicos.
Diámetro del canal les otorga la especificidad (hay solutos que no podrán pasar)
Tipos de canales:
Alternancia entre estados abiertos y cerrados → determinado por un estímulo que depende de
la naturaleza del canal
➢ apertura mecánica: se abren en respuesta a una acción mecánica (ej: estiramiento por
presión o tensión)
Acuaporinas
Son proteínas integrales de membrana que median el flujo de agua a través de ésta
● Comunes en las células que deben mover agua a velocidades elevadas.
● Tienen gran conservación evolutiva → se encuentran en todos tipos celulares
estudiados en todas las formas de vida.
Tipos de transportadores
● Uniporte (sencillos)
Transportan soluto a través de la membrana con una velocidad determinada por Vmax y
KM.
● Acoplados
Transferencia del soluto depende de la transferencia de un segundo soluto
o Simporte (unidireccional): segundo soluto en misma dirección
o Antiporte (intercambio): segundo soluto en dirección contraria
Transportadoras de transporte pasivo
Difusión simple (difusión facilitada, por una proteína) por gradiente de concentración y
electroquímico (son fuerzas disponibles)
Condiciones
Interior celular
Exceso de solutos orgánicos, que no difunden (tamaño) o se están generando constantemente
- La mayoría de macromoléculas están muy cargadas y atraen muchos iones inorgánicos
de carga opuesta
- Gran concentración de pequeñas moléculas orgánicas (por transporte activo y procesos
metabólicos, metabolitos) que también atraen contraiones
Líquido extracelular
Llena de pequeños iones inorgánicos que difunden lentamente a través de la membrana.
- Tienden a equilibrarse: intentar mantener la misma cantidad dentro y fuera de la célula.
↓
Si se genera este equilibrio, de todas formas la concentración total de iones inorgánicos es
mayor dentro de la célula, por la atracción ejercida por macromoléculas y metabolitos.
Problema
La célula tendrá una concentración de solutos mayor en el interior
Provoca que por ósmosis el agua se desplaza hacia adentro →lisis
Solución
Controlar la osmolaridad bombeando activamente iones inorgánicos hacia el exterior.
Objetivo → que el citosol tenga menor concentración de iones inorgánicos, ya que tiene un
exceso de solutos orgánicos
Fuente de energía
ATPasas median transportes activos primarios → son el primer mecanismo para mantener un
gradiente electroquímico (usan una fuente de energía que no depende de este)
Bombas ATPasas
● Transporte activo: bombea de forma activa Na+ hacia el exterior (en contra del gradiente
porque es donde hay más) y K+ hacia el interior.
● Antiporte: intercambia iones en direcciones contrarias.
Funciones
● Crea un potencial eléctrico: dirige una corriente neta a través de la membrana que
genera un exterior más positivo (electrogénica)
● Intercambiador Na+ - H+
Acopla la entrada de Na+ a la salida de H+.
Los H+ son transportados directamente al exterior celular
Además hay una ATPasa Na +-K+ para mantener el gradiente de Na+ (localizada en dominio
basolateral)
NÚCLEO
ADN
El ADN se halla en el núcleo.
Molécula de ADN
Doble hélice: bases hacia dentro y esqueleto azúcar fosfato hacia afuera
Formada por 2 hebras de ADN
- cadenas de polinucleótidos (4 tipos de subunidades): la información genética está
contenida en el orden lineal de los nucleótidos del ADN.
- unidas por enlaces de H
- antiparalelas y complementarias
Genoma:
Total de información genética almacenada en el ADN del organismo.
Genoma humano: 24 cromosomas (22 autosomas y 2 sexuales).
Gen:
Segmento de ADN que codifica para una proteína o para un conjunto de proteínas íntimamente
relacionadas entre sí (o para ARNt)
¿Por qué solo una parte pequeña del genoma regula y codifica proteínas esenciales?
Es necesario limitar el número de genes esenciales de los que el organismo depende para su
supervivencia.
Si un organismo depende de muchos genes, este será mucho más afectado por mutaciones (si
dependemos de menos genes mutaciones pueden caer en partes no codificantes)
↓
Recordar
Tasa de mutación: riesgo de mutación que es inherente y constante
Cromatina:
Complejo de ADN y proteínas
Replicación del ADN
Se da en la fase S, antes de la división celular (fase M).
Las copias replicadas se reparten entre las dos células hijas.
Transcripción
Transcribir moléculas de ADN en ARN
Esta compactación se da en diferentes niveles, que podemos encontrar en las diferentes fases
del ciclo celular. Algunos niveles pueden encontrarse al mismo tiempo en el núcleo (por
ejemplo los dos estados de la cromatina).
● Algunas regione se descondensan para que la célula pueda tener acceso a secuencias
específicas de ADN (para la expresión de genes, reparación y replicación del ADN) y se
recondensan al terminar el proceso
NUCLEOSOMA
Unidad fundamental del empaquetamiento.
Complejo ADN y proteínas (histonas), que compacta la hebra de ADN hasta un tercio de su
longitud original.
Estructura
Complejo formado por un segmento de ADN que se enrolla 2 veces alrededor de un núcleo
proteico (octámero de histonas).
Modificaciones postraduccionales
Las colas de histonas* que quedaron hacia fuera del núcleo pueden modificarse
(fosforilaciones, metilaciones, etc). A lo que estas modificaciones se generan en la proteína
(histona) ya traducida son llamadas modificaciones postraduccionales.
↓
Cambios epigenéticos: permiten agregar información por arriba del código genético
(modificaciones solo sufridas por histonas, no por ADN).
- Pueden generar que las zonas modificadas sean más difíciles de transcribir (ejemplo).
Modificaciones determinan cuando transcribir un gen
* Histonas no solo sirven para empaquetar sino que también para agregar información.
Empaquetamiento de nucleosomas
Los nucleosomas se empaquetan uno sobre otro adoptando disposiciones regulares en las que
el ADN se encuentra todavía más condensado.
↓
Histonas H1
Responsables del empaquetamiento repetido y regular.
Cada molécula H1 se une por una región globular a un lugar único del nucleosoma, mientras
que los brazos entran en contacto con otros lugares.
● en proporción 1:1 con los nucleosomas
● menor tamaño que las histonas que forman los núcleos proteicos
CROMATINA
La cromatina es un complejo de ADN y proteínas, puede estar en diferentes niveles de
compactación.
Eucromatina
Forma menos condensada - genes transcripcionalmente activos
La mayoría de los genes están en esta forma.
Heterocromatina
Forma altamente condensada - genes mayormente inactivos (por gran condensación)
Tiene una menor cantidad de genes
Disposición de heterocromatina:
● En interfase: periferia del núcleo → proteínas asociadas a las heterocromatinas se unen
a la lámina nuclear
● En división: en varios lados de los cromosomas pero concentrada en centrómeros y
telómeros.
Para las diferentes escalas estructurales vamos a tener diferentes métodos de análisis.
CROMOSOMAS
Formado por una molécula de ADN asociada a proteínas que la pliegan.
Cantidad en humanos
Cromosomas: 46. Dos copias de cada cromosoma de progenitores (cromosomas homólogos),
organismos diploides.
Cromosomas sexuales: 2 (XX o XY)
En los machos los cromosomas sexuales son los únicos no homólogos (XY, contienen diferente
información genética)
Cromosoma mitótico
Mayor nivel de empaquetamiento
Cromosomas en fase M son transcripcionalmente inactivos.
Al estar muy condensados (reduce unas 10 veces la longitud del cromosoma interfásico)
pueden ser distinguidos en MO y realizar un cariotipo (en división celular: metafase)
Funciones
Funciones del empaquetamiento en mitosis
Estructura
Cubiertos por diversas moléculas, como las ribonucleoproteínas (RNP)
Centrómero:
Se ubica en un tramo especial de la heterocromatina que permanece condensado durante toda
la interfase
Formación
En la fase M, la expresión génica se detiene y comienzan a formarse los cromosomas.
➔ Condensinas:
Grandes complejos proteicos que asisten el empaquetamiento del cromosoma
(hidrolizando ATP). Son los componentes estructurales principales que determinan el
eje de los cromosomas metafásicos
Cromosomas interfásicos
Cromosomas extendidos, descondensados, por ende son activos en síntesis de ARN.
No pueden ser observados (excepción: cromosomas plumulados y politécnicos), se extienden
en territorios cromosómicos.
TERRITORIOS CROMOSÓMICOS
Cada cromosoma ocupa su propio territorio en el núcleo durante la interfase.
Se disponen de manera organizada y dividen distintos dominios funcionales, esto tiene un
papel fundamental en la regulación génica.
➔ Los genes que se transcriben de forma activa están en la periferia de los territorios
cromosómicos
Topología nuclear
¿Cómo ubicamos los territorios cromosómicos?
El territorio cromosómico de los cromosomas con menos genes por unidad cromosómica estará
en los lugares del núcleo donde se muestren menos genes.
Dos posibilidades:
- Si no hubiera territorios (cromosomas mezclados): el daño se generaría en varios
cromosomas (porque aunque sea puntual van a haber ADN de diferentes cromosomas)
y por ende podríamos ver reparaciones en diferentes cromosomas
- Si hay territorios (ADN ordenado): el daño solo afecta un cromosoma (se genera dentro
de un territorio cromosómico) y va a generar un reparación en un solo cromosoma
2. Generación de sondas: se usan enzimas para copiar ADN. Se agrega una molecula
fluorescente, de forma que cada cromosoma se tiña de color diferente.
- Obtenemos muchas sondas chicas que equivalen a cromosomas enteros
Consideraciones técnicas
● Técnica in vitro: se debe desnaturalizar el ADN para lograr marcarlo. Para
complementar las bases hay que abrir la doble cadena para que se una con la sonda
que vamos a sintetizar.
● Cuerpos PML: función desconocida (no están enriquecidos en RNPs ni son sitios de
replicación o transcripción)
Microdominios de transcripción
Hay microdominios que se pueden cargar de muchos componentes y cuando está todo junto
comienza la transcripción.
Microdominios son principalmente eucromatina: ya que es a donde los genes se trasladan para
activarse
Una vez más vemos que los genes se reorganizan por su actividad.
- esto apunta a la optimización de recursos
NUCLEOLO
Transcripción y procesamiento de ARN ribosomal y síntesis de subunidades del ribosoma (el
ribosoma se ensambla en el citoplasma)
Dominio diferenciado dentro del núcleo: no está delimitado por una membrana, sino que por la
unión que forman entre sí los precursores ribosómicos no terminados (formando una malla)
➢ Splicing (maduración del ARN por corte y empalme): eliminación de los intrones
2. ARNr se asocia con proteínas ribosomales (que son transportadas del citoplasma al
núcleo). Esta asociación se realiza mayormente a preARN antes de modificar
Funciones
- Permite que se obtenga una gran concentración de solutos y así generar un ambiente
favorable para ciertas reacciones químicas
Estructura
Formada por 2 membranas concéntricas (bicapa externa e interna), atravesadas por poros
nucleares, y la lámina nuclear.
Membranas
Bicapas fosfolipídicas permeables a pequeñas moléculas apolares.
Actúan como barrera separando el núcleo y el citoplasma
● Membrana externa: se continúa con la membrana del RE, tiene funciones similares a las
del RE y posee ribosomas adheridos
● Membrana interna: tiene proteínas específicas del núcleo, y toma contacto con la lámina
nuclear.
Poros nucleares
Perforan las membranas permitiendo transporte activo de ciertas moléculas entre el núcleo y el
citosol
- Son los únicos canales que permiten el paso
- Un lugar de unión de ambas membranas
Lámina nuclear
Recubre la membrana interna dando soporte estructural al núcleo
Red fibrosa compuesta de laminas.
Laminas:
Tipo de filamento intermedio que se ensamblan entre sí.
● Sitios de unión para la cromatina: existe una matriz de laminas nucleares (de
organización más laxa) que se extiende hacia el interior nuclear, a la cual se une la
cromatina por regiones específicas
- La organización laminar es esencial para la replicación del ADN y rol en la
regulación de la transcripción.
● Formación de lamina
Dos laminas se enrollan por su zona alfa hélice entre ellas para formar un dímero. Los
dímeros se asocian entre sí hasta formar un filamento (lamina)
Desensamblaje de la envoltura
Durante la mitosis (en eucariotas) la envoltura nuclear se disgrega.
Esta disgregación implica cambios en sus componentes
Reformación de la envoltura
En la telofase se forman los dos nuevos núcleos (reensambla la envoltura) alrededor de cada
juego separado de cromosomas hijos.
● Formación de la membrana
1. Unión de las vesículas a la superficie de cromosomas: vesículas de membrana
fragmentada rodean a los cromosomas
● Importación de proteínas
Los poros nucleares comienzan la importación activa de proteínas (estas se habían
diluido en el citosol en mitosis).
Se importan las proteínas que presentan una secuencia de importación nuclear →
dentro del núcleo esta secuencia no se corta ya que van a tener que ser reimportadas
en la próxima división celular.
CITOESQUELETO
Es una estructura (sistema de filamentos) que cumple funciones vitales para la célula.
Existen 3 familias de filamentos con características estructurales y funciones biológicas
diferentes, pero que comparten principios fundamentales y trabajan en conjunto.
FUNCIONES
Subunidades proteicas
Todos los filamentos se forman por pequeñas subunidades proteicas
Dinámicos y adaptables
Subunidades ensamblandose y desensamblandose continuamente.
Por ejemplo:
En algunas estructuras especializadas hay regiones del citoesqueleto que deben ser
menos dinámicas. En neuronas muchos de sus filamentos de actina y microtúbulos
están estabilizados, pero cuando necesita realizar nuevas conexiones puede disponer
del dinamismo.
Proteínas accesorias
Los filamentos tienen asociadas proteínas accesorias, con varias funciones:
Proteínas motoras
Se mueven sobre los filamentos del citoesqueleto.
Clasificación según
➢ Tipo de filamento al cual se unen (microtúbulos o filamentos de actina)
➢ Sentido en el que se desplazan
➢ Carga que transportan: pueden ser organelos membranosos u otro filamento (induce
filamentos a ejercer tensión o deslizarse uno contra otros)
Partes
➢ Dominios motores (regiones apicales o cabeza): región de la proteína que se asocia a
los filamentos e hidroliza ATP o GTP
➢ Colas: determinan el tipo de carga a la que la proteína se unirá (y por ende determinan
la función biológica de la proteína)
Movimiento
Usan energía para moverse de forma direccional
Un tipo de proteína solo pueden ir hacia una dirección
Convierten energía química (hidrólisis de ATP o GTP de las propias proteínas, no usan el del
filamento) en energía mecánica del movimiento.
Nucleación
Inicio del ensamblaje de un filamento, donde las subunidades se tienen que ensamblar en un
agregado inicial (núcleo) estabilizado.
● Tiempo de nucleación depende del número de subunidades que se deben unir para
formar el núcleo inicial (generalmente dura bastante tiempo)
- Es la etapa limitante en la velocidad de formación de los polímeros
𝑘 𝑜𝑓𝑓 1
𝐶𝑐 = 𝑘 𝑜𝑛
= 𝑘
Filamento polar
Subunidades que se ensamblan con direccionalidad (cabeza con cola), porque sus extremos
son diferentes, generan polaridad
➢ Extremo +
➢ Extremo -
Distribución
Córtex celular: capa bajo la membrana
Los filamentos del córtex celular son los responsables de la forma y el movimiento de la
superficie de la célula (formando filopodios y lamelipodios)
SUBUNIDAD ACTINA
Proteína globular: cadena polipeptídica globular simple y monomérica
Actina G
Monómero, proteína globular y asimétrica
➔ Actina-ATP
En solución la actina G generalmente unida a ATP
➢ Promueve la polimerización (formar filamentos)
➢ Al unirse al filamento se aumenta su capacidad de hidrolizar ATP (es una
ATPasa)
Actina F
Actina formando filamentos.
Las actinas forman dos protofilamentos paralelos que giran uno sobre el otro siguiendo una
hélice de rotación hacia la derecha
➔ Actina-ADP
Actina al unirse al filamento hidroliza su ATP y queda unida a ADP
Promueve la despolimerización (filamento se desensambla)
POLIMERIZACIÓN
Polimerización in vitro
Si tomamos Actina G y la ponemos sola en un tubo de ensayo va a polimerizar.
2. Polimerización aumenta velocidad: empieza a formarse más rápido porque ahora cada
subunidad que se encuentre con el complejo inicial se va a unir a este (ya no
necesitamos una cantidad mínima de subunidades que se encuentren)
3. Equilibrio: una parte de la actina se encuentra formando los filamentos, y otra en forma
monomérica.
Sigue habiendo intercambios entre estos monómeros, manteniendo el largo de los
filamentos constantes (intercambio rotatorio).
- Concentración crítica (Cc)
Polimerización in vivo
No va a tener la misma dinámica que la polimerización in vitro por la presencia de proteínas
accesorias (proteínas que interaccionan con la actina).
Estas proteínas van a regular las velocidades de polimerización o despolimerización y
aumentar la velocidad de la nucleación.
Experimento
Evidenciar el comportamiento de los extremos (in vitro)
1. Agregamos Actina G
2. Empieza a polimerizar
3. Se agrega miosina
- Miosina se une a las actina G presente (sigue polimerizando)
4. Luego se agrega más Actina G
5. Se polimerizan las nuevas actinas, pero sin miosina
Obtenemos un polímero con subunidades con miosina (las primeras actinas agregadas) y con
subunidades sin miosina.
➔ Hay más subunidades sin miosinas en el extremo más.
Polimerización espontánea
Concentración de las subunidades libres supera Cc: hay más concentración de subunidades
libres que de las que hay en equilibrio.
- Para llegar al equilibrio: polimerización
- Energía libre de polim negativa (espontáneo)
Despolimerización espontánea
Concentración de subunidades libres por debajo de Cc
- Para llegar al equilibrio: despolimerización (liberar subunidades para llegar a Cc)
- Energía libre de despolim negativa
Recambio rotatorio
Estado predominante en los filamentos de actina - hay polimerización y despolimerización pero
la LONGITUD del filamento permanece CONSTANTE (los filamentos de actina sufren menos
fluctuaciones de longitud que los microtúbulos)
NUCLEACIÓN DE LA ACTINA
La nucleación está regulada por señales externas.
Así la célula cambia su forma y rigidez respondiendo a los cambios de su entorno.
La nucleación es catalizada por dos factores reguladores: complejo ARP (Actin Related
Proteins) y forminas.
➢ Sin factores reguladores: deberían de encontrarse tres actinas para formar el núcleo
desde donde se puede comenzar a polimerizar
Forminas
Gran familia de proteínas diméricas.
Cada dímero de formina capta 2 monómeros de actina.
Uniéndose a subunidades
● Profilina: pro polimerización → acelera ensamblaje
● Timosina: anti polimerización → impide ensamblaje
Uniéndose a filamentos
● Cofilina: acelera desensamblaje (uniéndose a filamentos de actina-ADP)
● Tropomiosina: estabiliza filamento
● Gelsolina: rompe filamento y se une al extremo más → así no se puede seguir
ensamblando
● Proteína casquete: impide ensamblaje y desensamblaje en extremo más
GELES
No tenemos dos brazos rígidos manteniendo una distancia constante, sino que estas proteínas
unen dos filamentos con ángulos muy diversos y cambiantes, formando geles.
● Filamina: geles muy viscoso y laxos, enlaza dos filamentos en ángulo recto
- forma parte del córtex celular y proporciona soporte
- permite extensión de lamelipodios (proyecciones de membrana como láminas)
● ERM: proteína que media la unión de la actina y la membrana plasmática. Es una gran
familia de proteínas que se relaciona con funciones de la membrana (mantenimiento de
la polaridad, exocitosis y endocitosis).
También se une a la matriz (media: actina-membrana-matriz): la fuerza de los contactos
entre la matriz y la actina están mediados por señales extracelulares e intracelulares.
● Espectrina: forma una red de actina que se une con la membrana plasmática para
generar un cortex rígido.
Por ejemplo, por debajo de la membrana de los eritrocitos hay una red de
espectrina-actina; esto es importante para la flexibilidad de estas células al atravesar los
capilares
Proteínas motoras
MIOSINAS
Estructura
● 2 cadenas pesadas
➢ dominio apical, motor (en N-terminal): tiene la maquinaria generadora de fuerza
● 2 cadenas ligeras (2 copias de 2 cadenas ligeras): las cadenas ligeras se unen cerca
del dominio apical
Tipos de miosina
Tienen un dominio motor común (hidroliza ATP y se une a la actina), pero difieren en los
dominios que interaccionan con las cargas.
Cada tipo va a interaccionar con cargas diferentes.
Miosina V:
Interviene en el transporte de organelos y vesículas
- Importantes en división celular (para dividir organelos hacia células hijas)
Miosina II:
Asociada a actividad contráctil (no transporta cargas):
Se unen cada cabeza a un filamento de actina diferente, generando que los filamentos se
desplacen entre sí de forma antiparalela. La miosina está fija y la actina se mueve, desliza
entre ella.
- Rol en citocinesis
Miosina VI → excepción
Se desplaza hacia el extremo menos.
Regulación celular
Fosforilación en Miosina II (en la cadena pesada o en las cadenas ligeras).
Afecta la actividad motora y el ensamblaje de filamentos.
↓
Genera 2 estados conformacionales:
➢ Estado extendido:
Fosforilación de la cadena ligera por MLCK (kinasa de la cadena ligera de miosina, es
una kinasa dependiente de calcio)
- Ensamblaje en filamento bipolar
- Contracción celular
- MLCK se activa también durante mitosis → miosina II se ensambla formando el
anillo contráctil (citocinesis)
➢ Estado plegado:
Dominio de la cola interactúa con la cabeza motora
MICROTÚBULOS
➢ Más anchos
➢ Distribución: centro celular a la periferia.
➢ Filamentos polares
➢ Subunidad asociada a GTP (no a ATP como actina)
SUBUNIDAD TUBULINA
Heterodímero
Dímero formada por 2 tipos de proteínas globulares diferentes
Genera polarización:
La cara alfa y beta son diferentes, por ende los extremos del microtubulo serán diferentes,
estarán polarizados
- Extremo más: por donde se intercambian subunidades
- Extremo menos: bloqueado
Conservación
Tubulina se encuentra en todas las células eucariotas, está muy conservada.
Hay distintas formas de tubulina que son muy parecidas entre sí y pueden copolimerizar
formando microtúbulos mixtos
● A lo largo del eje longitudinal del microtúbulo: cabeza de beta tubulina - cola alfa
tubulina
POLIMERIZACIÓN
La polimerización y despolimerización se dan desde el extremo más
El lado menos está bloqueado
Inestabilidad dinámica
Interconversión rápida entre un estado en crecimiento y un estado en disociación.
Grandes fluctuaciones en su longitud - muy dinámicos
Estabilización
Capuchón de GTP en extremo más estabiliza el microtúbulo → con velocidad de unión similar a
velocidad de hidrólisis.
Si se corta este capuchón (experimentalmente), el microtúbulo se despolimeriza muy rápido.
NUCLEACIÓN
La nucleación de microtúbulos requiere del encuentro de 13 tubulinas.
Esto es muy improbable y por ende la célula proporciona un molde para promover la
nucleación.
➢ Esto sucede en los centros organizadores de microtúbulos (MTOC).
➢ Neurona:
Se disponen a lo largo del axón.
Un microtúbulo no alcanza todo el largo del axón por eso hay varios MTOC a lo largo
del axón para poder cubrirlo por completo.
➢ Células epiteliales:
Se disponen en la zona apical. Microtúbulos van desde la zona apical hasta la basal.
Centrosoma
Es un MTOC localizado cerca del núcleo.
Microtúbulos emergen del centrosoma en forma de estrella, nucleados desde su extremo
menos y con su extremo más hacia la periferia celular.
Formado por:
Centriolos (2)
Estructuras cilíndricas en el centro del centrosoma.
● Regula la formación del centrosoma (tiene función estructural) y organiza la matriz del
centrosoma.
● Desde donde ocurre la nucleación: se nuclean desde extremos menos y dejan extremo
más hacia la periferia, libre para su polimerización
- Contiene más de 50 copias de γ-TuRC
Pared pericentriolar
Lo más externo
PROTEÍNAS ASOCIADAS
Proteínas que se asocian a los microtúbulos e intervienen en las velocidades de polimerización
y despolimerización, en la unión de microtúbulos con otras estructuras y en el transporte de
cargas a través de microtúbulos.
➢ MAP: estabiliza microtúbulos (se une lateralmente). Es un nombre genérico para las
proteínas que se asocian lateralmente a microtúbulos (microtubule associated protein)
➢ XMAP 15: estabiliza extremos mas (no se van a poder despolimerizar) y acelera su
ensamblaje
➢ Catanina: rompe microtúbulos
➢ Estatmina: impide ensamblaje (se une a subunidades)
Proteínas motoras
Estructura
Dímeros: dos cabezas motoras que caminan sobre el microtúbulo hidrolizando ATP
➢ 2 cadenas pesadas: 2 cabezas globulares que actúan como dominio motor → dímeros
➢ 2 cadenas livianas
Tipos
Superfamilia: el único elemento en común es el dominio motor.
La cola helicoidal varía en las diferentes familias, ya que transportan cargas diferentes.
Kinesina 1:
Uno de los principales motores que traslada cargas a través del axón.
Kinesina 5:
Desliza microtúbulos entre sí (una cabeza en cada microtúbulo)
Excepción
- Kinesina 13: no va a ningun lado, esta es la despolimerizadora de microtúbulos
- Kinesina 14: va hacia el lado menos
Hay familias que van a tener roles específicos en la formación de los husos mitóticos (y
meióticos) y en la separación de los cromosomas.
Estructura
Señales competidoras
El desplazamiento de algunos organelos está controlado por un balance de señales
competidoras que regulan la actividad y la unión de las proteínas motoras
Ejemplo: melanocitos.
Los melanocitos (gránulos de pigmentos) se agregan o dispersan a lo largo de los microtúbulos
Familia de proteínas fibrilares muy grandes relacionadas entre sí: keratinas, neurofilamentos
(en las neuronas), laminas nucleares
● No se asocian con ATP ni GTP (no tienen sitios de unión para nucleósidos trifosfato) →
desensamblaje puede estar regulado por fosforilación de proteínas
● No hay polaridad
● No están presentes en todas las células eucariotas ni en todos los tipos celulares
- Particularmente abundantes en células sometidas a estrés mecánico
FORMACIÓN
2. Dímero enrollados entre sí paralelamente (cabeza con cabeza y cola con cola)
FUNCIONES
FAMILIAS
Los diferentes tipos celulares expresan familias distintas de filamentos intermedios.
Filamentos de Queratina
En células epiteliales.
● Organización:
Redes de queratina unidas por enlaces disulfuro
Formada por cadenas de queratina tipo I (ácidas) y tipo II (neutras/básicas).
Neurofilamentos
En concentración elevadas a lo largo de los axones
Su nivel de expresión está relacionado con el diámetro del axón → esto afecta la velocidad de
la señal eléctrica
Vimentina
Desmina (miembro de esta familia): se expresa en el músculo liso, cardíaco y esquelético.
- Un ratón sin desmina tiene fibras musculares desordenadas.
Toxinas
La supervivencia de las células depende de un equilibrio entre el ensamblaje y el
desensamblaje de filamentos de actina y microtúbulos
⇓
Filamentos de actina y microtúbulos son diana para toxinas (matar células).
Proteínas SUN-KASH
A través de estas proteínas el citoesquelto puede unirse a elementos del núcleo (a la lámina
nuclear o a los cromosomas).
Citoesqueleto en bacterias
Hay homólogos de los componentes del citoesqueleto de eucariotas en bacterias.
➢ FtsZ: homólogo de la tubulina. → estructuralmente relacionado con la tubulina
Función análoga a la actina: forma un anillo Z con el septo durante la división celular
➢ MreB y Mlb: homólogos de actina → regulan la forma celular (forman parches que
sirven como andamios para dirigir la síntesis de la pared)
Transporte de proteínas
Se generan muchas proteínas en el citosol que deben de ir a un lugar específico de la célula.
Su destino se determina por una señal de localización.
Si no presenta señal permanecen en el citosol como residentes permanentes.
Se puede cambiar la secuencia (ej: generando ADN mutante para que la codifiquen) para
alterar la ubicación de la proteína
Experimento ejemplo:
Por bioingeniería se altera secuencia aminoacídica → señaliza otro destino → cambia de lugar
(B) Ahora lo que vemos es el citoplasma porque la proteína mutada migró al citoplasma (así se
lo indicaba su secuencia)
TRÁFICO NUCLEAR
Exportación e importación nuclear funcionan por el mismo mecanismo, pero con diferentes
receptores y señales (hay receptores específicos para exportación e importación, igual que con
las señales)
Energía para el transporte activo
Transporte activo obtiene energía a través de la hidrólisis del GTP por la GTPasa monomerica
Ran.
Importe nuclear
Se transporta una carga del citosol y se libera en el núcleo.
1. Receptores (aunque no estén unidos a nada) saltan de una repetición FG a otra hasta
llegar a la cara nuclear, donde se unen a Ran-GTP
2. Receptores – Ran-GTP en cara nuclear →se libera la carga (si es que la tenían) al
núcleo.
⇩
4. GAP hidroliza GTP → obtenemos Ran-GDP que se separa del receptor y queda libre
para volver a usar
Exporte nuclear
Se transporta una carga del núcleo al citosol (Ran GTP y GDP no tienen las mismas funciones
que en el importe).
NF-AT (factor nuclear de las células T activadas): proteína lanzadera, reguladora de genes
- Célula en reposo: NF-AT está en el citosol en estado fosforilado
Experimentalmente:
Esto se puede ver experimentalmente, adhiriendo GFP a la proteína lanzadera y observando su
localización en la célula luego de liberar calcio (por ionóforos de calcio).
TRÁFICO AL INTERIOR DE MITOCONDRIAS Y CLOROPLASTOS
Cada uno de los compartimientos de mitocondrias y cloroplastos tiene una dotación específica
de proteínas.
➢ Mitocondrias compartimentos: espacio intermembrana, matriz mitocondrial
➢ Cloroplastos: espacio intermembrana , matriz, espacio tilacoidal
Mitocondrias
Translocadores
Son complejos que tienen 2 componentes: receptor de la proteína y canal de translocación.
Generalmente los complejos TOM y TIM trabajan juntos pero también pueden trabajar
independientemente.
● Hidrólisis de ATP
- en exterior de la mitocondria: el complejo TOM requiere hidrólisis de ATP
- en la matriz: chaperona mitocondrial requiere ATP ya que actúa como un motor
estirando la proteína precursora hasta el espacio de la matriz.
Cloroplastos
Transporte es muy similar al transporte de mitocondrias (tiene complejos translocadores,
requiere energía, secuencia señal es eliminada)
RH2 + O2 →R + H2O2
Importación de proteínas
La mayoría de las proteínas es importada selectivamente desde el citosol, pero hay otras que
ingresan al peroxisoma a través del RE
Red de tubos ramificados y sacos aplanados interconectados, que se extiende por todo el
citoplasma. Membrana continua con la membrana nuclear externa.
Estructura del RE
Para asumir diversas funciones, sus regiones se han especializado. Es estructural y
funcionalmente diverso.
● RE rugoso:
Cubierto de ribosomas (permite identificar donde está el lumen y el citosol).
Es por donde ingresan las proteínas. Contiene los ribosomas en donde se están
sintetizando las proteínas translocadas (importación cotraduccional).
● RE liso:
Regiones sin ribosomas (son más escasas).
Principal sitio de producción de partículas lipoproteicas. El RE liso puede ser abundante
en células especializadas que requieran muchas de estas partículas (ej: hepatocitos).
Como estudiar el RE
Para estudiar sus funciones y características debemos aislarlo.
1. Un extremo del SRP se une a la subunidad mayor del ribosoma → así la señal puede
formar parte de la proteína sintetizada
Translocación de proteínas
(cotraduccional)
Translocación cotraduccional: la proteína
se transloca mediante traducción (todavía con el ribosoma adherido)
● Inactivo: cerrado por una hélice corta → es importante que esté cerrado cuando está
inactivo para que la membrana permanezca impermeable a los iones (Ca2+ podría salir
del RE).
● Apertura por junta lateral: permite que la cadena polipeptídica que se esta translocando
se inserte en la parte hidrofóbica de la membrana.
Esto sucede con:
- péptido señal de RE (la proteína ya lo necesita, ya llegó al RE, péptido se corta y
se queda en la membrana) → luego péptido se degrada por peptidasa señal
- proteínas de membrana (su destino es la membrana del RE)
Integración de proteínas transmembranas PASO ÚNICO
Hay tres vías por las cuales una proteína transmembrana de paso único puede ser insertada en
el RE.
1. La translocación inicia por una secuencia señal N-terminal (extremo N-terminal queda
en lumen del RE)
Translocación termina por una secuencia de paro en la proteína que ingresa en el
translocador, generando que este cambie de conformación y descargue la proteína
lateralmente a la membrana
Proceso de plegamiento:
3. Calnexina & Calreticulina reconocen proteína (al tener solo 1 glucosa) y se unen para su
plegamiento
Cubierta
Jaula citoplasmática de proteínas.
Se pierden antes de fusionarse con la membrana aceptora (del organelo blanco) → permite que
las dos caras citosólicas de las membranas entren en contacto para fusionarse
Funciones
➔ Moldear la vesícula → vesículas con el mismo tipo de cubierta tienen un tamaño y forma
similares
➔ Concentrar ciertas proteínas de la membrana en una región para seleccionar las
moléculas para el transporte.
Trisquelion:
Subunidad de clatrina, determinan su geometría.
3 polipéptidos grandes y 3 pequeños → formando estructura de tres
brazos.
➢ AP2 determinan la carga que va a ser transportada por la vesícula (porque son
específicos de los receptores de transporte, que se unen a la carga)
ENSAMBLAJE DE CUBIERTA
Es necesario que las cubiertas se ensamblen solo cuando son necesarias.
↓
GTPasas de control de reclutamiento
Regulan el ensamblaje de los tres tipos de vesículas.
Indican cuándo empieza la vesiculación
Al activarse hay cambios conformacionales, que les permiten unirse a la membrana del
orgánulo donde se va a formar la vesícula
Tipos de GTPasas
● Proteínas Arf → ensamblan cubiertas de clatrina y COPI (membranas del Golgi)
● Proteínas Sar1 → ensamblan cubiertas de COPII (membranas del RE)
GTPasas en desensamblaje.
1. Hidrólisis del GTP (por GAP)
2. Cambio conformacional de la GTPasa → extrae su cadena hidrofóbica de la membrana
3. Desensamblaje de cubierta → queda la vesícula sola
Rabs
RECONOCEN
Proteínas que dirigen la vesículas a puntos específicos sobre la membrana diana (organelo
destino).
➔ Están sobre la vesícula y la membrana diana.
➔ GTPasas monoméricas.
➔ Las Rabs son una gran familia, hay diversidad → por ende especificidad, las diferentes
membranas tienen distribución específica.
Activas: unidas a GTP y unidas a la membrana del organelo o vesícula (activadas por
Rab-GEF en membrana)
Cuando están activas se unen a Rab efectoras
SNARE
Proteínas que participan en la fusión membrana-vesícula
Para que puedan fusionarse es necesario aproximar las bicapas lipídicas hasta una distancia
de 1,5 nm → lípidos pueden fluir de una membrana a otra.
Permite que el agua se desplaze de la superficie hidrofílica de la membrana (proceso que sino
sería muy desfavorable energéticamente) →esto es necesario para que las membranas junten
y fusionen sus interiores hidrofóbicos (se aísla la fusión).
➔ Proteínas transmembrana
➔ Parejas complementarias: hay proteínas SNARE en la membrana del orgánulo y en la
vesícula que interactúan
COMPLEJO trans-SNARE
Haz estable de hélices formando por los dominios helicoidales de ambas SNARE enrollados
durante su interacción.
NSF: ATPasa que deshace las uniones entre los dominios helicoidales de las SNARE (el
complejo SNARE se disocia para reutilizarse)
Hélices se enrollan
- se libera energía → esa energía es usada para catalizar la fusión de la membranas
- se aproximan las membranas expulsando las moléculas de agua.
Salida del RE
Las proteínas tienen una señal que indica su destino al Golgi.
Solo pueden abandonar el RE las proteínas que están correctamente plegadas y ensambladas
(si no lo están sus señales de salida están bloqueadas).
Las mal plegadas van al citosol a ser degradadas por proteosomas
2. Agregado de túbulo-vesiculares
Vesículas fusionadas forman un nuevo compartimiento separado del RE que se
desplaza por microtúbulos hacia el Golgi.
Señales de recuperación
Hay señales de recuperación diferente en los diferentes componentes a recuperar
➢ En proteínas solubles residentes del RE: señal KDEL, deben unirse → señal debe
unirse a receptores KDEL para poder interaccionar con cubierta
2. Cisternas cis
3. Cisternas medias
4. Cisternas trans
5. Red trans (TGN): red de salida, donde las proteínas son clasificadas hacia su siguiente
destino (lisosomas, vesículas de secreción, superficie celular) en vesículas de
transporte.
Dictiosoma
Apilamiento del Golgi formado por entre 4 a 6 cisternas
- Cisternas: compartimentos de forma aplanada, que constituyen una unidad de
procesamiento múltiple.
Las proteínas se modifican a medida que van de cisterna en cisterna a través del dictiosoma.
Por ende, las enzimas que catalizan las primeras etapas se localizan en las cisternas más cis
del dicitiosoma.
Unión de dictiosomas
Muchos dictiosomas se pueden unir entre sí formando un solo complejo.
● Unión por conexiones tubulares entre cisternas
● En las proximidades del núcleo cerca del centrosoma
● Depende de los microtúbulos: si los microtúbulos se despolimerizan
(experimentalmente), el complejo de Golgi se reorganiza en dictiosomas individuales
GLUCOSILACIÓN
Procesamiento de oligosacáridos
Se pueden sintetizar 2 tipos de N-oligosacáridos
El procesamiento en estos dos tipos va a depender de su posición en la proteínas → si es
accesible a las enzimas será convertido en una forma compleja.
Funciones de la glucosilación
● Fabricación de productos intermedios plegables más solubles
● “Glyco-code” marca la progresión del plegamiento
● Limitar la aproximación de otras macromoléculas a la superficie de la proteína → por
ejemplo: para hacerlas más resistentes a enzimas proteolíticas
● Reconocimiento de las cadenas (por lectinas) en el espacio extracelular. Esto es
importante en muchos proceso de desarrollo y en el reconocimiento de célula a célula
2 Modelos
Ambos modelos no son mutuamente excluyentes.
Evidencias sugieren que el transporte puede ocurrir por una combinación de ambos
mecanismos. Algunas moléculas se desplazan rápidamente en vesículas de transporte y otras
que son más lenta se desplazan mientras que el Golgi se va renovando y madurando.
Lumen:
● Contienen hidrolasas ácidas (enzimas): provienen del Golgi
● pH ácido
Membrana:
● Proteínas de membrana glicosiladas → esto las protege de las proteasas del lumen del
lisosoma
● Transportadores de membrana (transportan productos finales de digestión)
● ATPasa de H+ vacuolar: bombea protones al interior del lisosoma (mantiene acidez) -
opuesto a ATP sintasas que bombean protones hacia afuera
1. Endosomas tardíos: tienen material recibido por endocitosis (que llegó atravesando la
membrana plasmática) y material recién sintetizado por hidrolasas del lisosoma
3. Lisosomas clásicos: es cuando la mayoría del material endocitado fue digerido (y solo
quedan residuos resistentes o de digestión lenta). Son densos, redondos y pequeños, y
pueden volver a entrar al ciclo fusionándose con endosomas tardíos o endolisosomas.
Vacuolas
Las vacuolas, presentes en plantas y hongos, están relacionadas con los lisosomas animales
(son como lisosomas muy versátiles).
3. Vesículas (una vez que pierden cubiertas) se fusionan con endosomas tempranos.
- Hidrolasas se activan debido al bajo pH
Endocitosis
Macromoléculas tomadas desde el exterior celular
Autofagia
Se destruyen partes obsoletas de la propia célula (puede también ayudar en la defensa contra
virus y bacterias).
Cuando los nutrientes escasean, la autofagia puede ser un mecanismo de supervivencia.
Fagocitosis
Forma de endocitosis.
FAGOCITOSIS
Se encierran grandes partículas (como microorganismos o células muertas) en fagosomas.
Desencadenación de fagocitosis
1. Partículas a ser fagocitadas se unen a la superficie celular
2. Se activan receptores (en la superficie)
3. Transmiten señal al interior celular que desencadene la fagocitosis.
Ejemplo: ANTICUERPOS
Anticuerpos - sustancias desencadenante de la fagocitosis
1. Se unen a la superficie de microorganismos
2. Forman cubierta que regiones en la cola de los anticuerpos (Fc)
3. Receptores Fc de la superficie de macrófagos y neutrófilos reconocen los anticuerpos.
4. Engulle partícula extraña (recubierta de anticuerpos)
➢ Células animales exponen señales “don’t eat me”: proteínas de superficie que inhiben
macrófagos (se unen a receptores inhibidores de la superficie de macrófagos)
➢ Células apoptóticas exponen señales “eat me”, pierden señales “don’t eat me”
PINOCITOSIS
Ingestión de fluidos y solutos en pequeñas vesículas pinocíticas.
Endocitosis de fase fluida
Selección de macromoléculas
Endocitosis mediada por receptores
Para captar componentes del fluido extracelular de forma específica sin internalizar un gran
volumen de fluido:
Los receptores son modificados con ubiquitina (proteína) para dirigirlos hacia las depresiones
recubiertas de clatrina.
(Proteínas de unión a la ubiquitina reconocen la ubiquitina en los receptores y los guían).
Ejemplo: COLESTEROL
El colesterol debe captarse hacia la célula para que no se acumule en la sangre.
EN EL GOLGI
Clasificación de proteínas
Se separan al menos 3 clases de proteína, haciendo uso de señales
➢ destinadas a lisosomas
➢ destinadas a vesículas de secreción
➢ destinadas a superficie celular
2. Formación de vesículas secretoras inmaduras (se parecen a cisternas del trans Golgi
que se separaron del dictiosoma) - COP II
EXOCITOSIS
Las vesículas maduras están tan densamente rellenas de componentes, puede descargarlos
rápidamente por exocitosis cuando es estimulada.
➔ Liberación Constitutiva: se fusionan con la membrana en cuanto la alcanzan
➔ Vía Regulada: las vesículas esperan cerca de la membran hasta que la célula reciba
una señal de secreción y entonces se fusionan.
MITOCONDRIAS Y CLOROPLASTOS
Estas bacterias fagocitadas darían lugar (dependiendo que tipo de bacteria fueran) a los
cloroplastos y mitocondrias
- Cloroplastos: bacteria fotosintética (ejemplo: cianobacterias).
- Mitocondria: alfa proteobacterias
Evidencias:
● Presencia de más de más de una membrana: la membrana interna, habría sido la
membrana de la bacteria fagocitada, y la externa, la membrana propia del organelo. La
membrana fagocitica desaparecio
● Tiene su propio ADN genómico, sus propios ARN y ribosomas (propias maquinarias
biosintéticas para producir ARN y proteínas).
Si hoy en día la mayoría de genes que codifican para las proteínas de mitocondrias y
cloroplastos se hallan en el núcleo (por transferencia de genes), ¿por qué siguen existiendo los
genomas de mitocondrias y cloroplastos?
Probablemente porque estos tienen mejor capacidad de regular la cadena de transporte de
electrones.
MITOCONDRIAS
Organelos móviles que se fusionan unos con otros y se separan dependiendo de los
requerimientos celulares.
Asociadas a microtúbulos: determinan su orientación y distribución en los diferentes tipos
celulares.
Contienen su propio ADN
Estructura
Rodeada por dos membranas altamente especializadas y con funciones diferentes.
Membrana externa
Bicapa lipídica permeable
Membrana interna
Bicapa lipídica impermeable
Está altamente especializada
➢ Muy impermeable: gran cantidad de cardiolipina (fosfolípido “doble”, con cuatro ácidos
grasos) → es impermeable a iones (y a moléculas pequeñas cargadas), porque es a
través de esta que se debe generar un gradiente electroquímico de H+
↓
Permeable de forma selectiva a pequeñas partículas necesarias para las enzimas
mitocondriales → transportadores
➢ Crestas: la membrana forma una serie de dobleces que aumentan el área. la cantidad
de crestas es proporcional a la demanda de ATP (por ejemplo: hay mayor número de
crestas en las células del músculo)
ADN mitocondrial
Cromosomas circulares (como las bacterias)
- Casi no tiene ADN no codificante.
- Los componentes de la cadena respiratoria mitocondrial son codificados por ADN
nuclear y ADN mitocondrial
- En animales la herencia de la mitocondria es materna
- Mayor tasa de evolución que el genoma nuclear
- El código genético de la mitocondria no es igual al del núcleo (los codones no codifican
para los mismos aa que en el núcleo)
Translocadores de membrana
DINÁMICA MITOCONDRIAL
FISIÓN
Aumenta el número de mitocondrias
Cuando ocurre:
- en división celular
- cuando mitocondria está dañada
FUSIÓN
Disminuye el número de mitocondrias, pero mejoran en rendimiento.
Cuando ocurre: cuando la mitocondria tiene mucha actividad aeróbica. Por ende debe
fusionarse con otra para satisfacer las demandas
Síntesis de proteína mitocondrial fluorescente: se agrega a un gen una secuencia para GFP y
una secuencia señal para la mitocondria. Se produce una proteína fluorescente que va a la
mitocondria
Ejemplo
- Proteína mitocondrial fluorescente roja (todas las mitocondrias son rojas)
- Proteína mitocondrial fluorescente verde fotoactivable: cuando iluminamos una zona de
la célula con un láser se activan
1. Se ilumina con láser una zona → en esa zona vemos verde, proteína activada
2. Si el verde se expande hay fusión o fisión: mitocondrias que quedaron activadas con
verde aparecen en otros lados de la célula o en mayor cantidad
Glicolisis
En citosol
Catabolismo de la glucosa → glucosa se degrada hasta llegar a piruvato.
- En este proceso se produce sólo 2 moléculas de ATP
Ciclo de Krebs
En matriz.
Piruvato y ácidos grasos obtenidos en la glicolisis ingresan a la mitocondria, dando lugar al
acetil CoA. El acetil CoA ingresa al ciclo de Krebs, en la matriz mitocondrial, y se oxida.
Todas las enzimas que catalizan este ciclo están en la matriz, excepto la succinato
deshidrogenasa que está en la membrana interna (reduce el FAD)
Complejos aceptores:
Transferencia de electrones está acoplada a la captación y liberación de H +.
Los electrones pasan por complejos aceptores que bombean protones de la matriz hacia el
espacio intermembrana.
Gradiente electroquímico
El bombeo de H+ en contra de su gradiente genera un gradiente electroquímico: de
concentración (pH) y eléctrico (voltaje).
● Gradiente de pH:
Menor cantidad de H+ en la matriz genera un pH mayor (más básico).
En el espacio intermembrana hay un valor de pH equivalente al citosol (por la
permeabilidad libre de la membrana externa) el cual es menor que el de la matriz (más
ácido, más H+)
ATP sintasa
Complejo proteico transmembrana que usa energía del flujo de H+ a favor del gradiente
electroquímico para sintetizar ATP a partir de ADP y P (presentes en la matriz)
- Genera una vía hidrofílica a través de la membrana para así permitir el flujo de los
protones.
Estructura
Trabaja por catálisis rotatoria.
Funcionamiento
- ciclo de la urea
- formación de centros Fe-S
- síntesis de líquidos (hay relaciones entre el RE y la mit)
- Regulación de concentración de calcio (también con RE)
- Regulación de muerte celular programada (apoptosis)
CLOROPLASTOS
Orgánulo intracelular especializado para la realización de la fotosíntesis a partir de la clorofila.
Es un miembro de la familia de los plastidos. Los plastidios son organelos presentes en todas
las plantas que presentan características comunes como poseer su propio genoma y estar
rodeado por dos membranas concéntricas. Además todos los tipos de plastidos se originan a
partir de proplastidos (orgánulos pequeños presentes en células inmaduras), que se van a
desarrollar diferencialmente dependiendo de los requerimientos de las células diferenciadas (el
tipo de proplastido viene determinado en el genoma nuclear).
En los plastidos tiene lugar la fotosíntesis y el depósito de materiales de reserva, entre otras
funciones (ejemplo: síntesis de purinas, pirimidinas, la mayoría de los aminoácidos y todos los
ácidos grasos).
Estructura
A diferencia de mitocondrias tienen 3 membranas y 3 espacios.
Estroma:
Entre membrana interna y tilacoidal (análogo a matriz mitocondrial),
- Genoma del cloroplasto (moléculas de ADN y ARN)
- Ribosomas
- Enzimas metabólicas
Membrana tilacoidal:
Contiene el sistema fotosintético (para captación de la luz) y ATP sintasa.
La cabeza de la ATP sintasa sobresale de la membrana tilacoidal hacia el estroma (dirección
opuesta que en la mitocondria donde la cabeza sobresale de la membrana interna hacia
“adentro”, hacia la matriz). Dónde está la cadena de transporte.
Espacio tilacoidal:
Formado por la unión de los lumen de todos los tilacoides.
Espacio contenido por membrana tilacoidal.
- Tilacoides: conjunto de sacos discoidales aplanados.
- Granas: tilacoides apilados
- Laminilla: las granas se conectan generando una laminilla
FOTOSÍNTESIS
Proceso en el cual se genera energía química (ATP) a partir de energía de la luz.
A partir de esta energía lumínica también se convierte el CO 2 del aire (junto con el agua) en
carbohidratos.
Como desecho liberan oxígeno.
3. Complejo b6-f, recibe electrones de la plastoquinona, y bombea protones (H+ del agua)
dentro del espacio tilacoidal (este bombeo en contra del gradiente puede realizarse por
la energía otorgada por la luz)
4. Plastocianina (pC) acepta el electrón transferido por el complejo b6-f (se reduce porque
contiene un átomo de cobre que varía de estado de oxidación)
Los protones acumulados en el espacio tilacoidal (por el bombeo del complejo b6-f) generan un
gradiente electroquímico a través de la membrana tilacoidal.
Este gradiente es usado para la síntesis ATP, cuando los protones salen del espacio tilacoidal
hacia el estroma, a favor de su gradiente, se genera la síntesis por la ATP sintasa (recordar que
su cabeza está hacia el estroma).
Fuerza protón-motriz
Mayor parte de esta fuerza es debido al gradiente de pH, no por el potencial de membrana (al
contrario de lo que sucede en la mitocondria).
Esto se debe a que la membrana tilacoidal es un poco más permeable a los protones (que la
membrana mitocondrial interna) y por ende la diferencia de potencial entre el espacio tilacoidal
y el estroma no va a ser tan grande como para constituir el elemento más importante de la
fuerza protón-motriz.
H20 + X → XH2 + ½ O2
Reacciones bioquímicas o de fijación del carbono (fase oscura)
Comienzan en el estroma y continúan en el citosol.
El CO2 es convertido en carbohidratos.
Esta parte es la que sí depende de la presencia de CO2 para su producto, que es la glucosa.