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Una historia de la genética y la genómica
Phil McClean
septiembre 2011
La genómica es una convergencia reciente de muchas ciencias, incluidas la genética, la biología
molecular, la bioquímica, la estadística y las ciencias de la computación. Antes de que los científicos
pronunciaran siquiera la palabra genómica, estos otros campos estaban muy desarrollados. De estos campos,
la historia de la genética y la biología molecular son particularmente relevantes para las técnicas, los
diseños experimentales y los enfoques intelectuales utilizados en la genómica. El desarrollo de las
computadoras e Internet ha brindado a los investigadores un fácil acceso a la gran cantidad de información
generada en todo el mundo. La Tabla 1 es una extensa historia de los principales desarrollos en estos campos.
La narrativa intentará unificar algunos de estos descubrimientos en hallazgos importantes.
Mediados y finales del siglo XIX : evolución, selección natural, herencia de partículas y nucleína
Comprender los orígenes es una búsqueda constante del hombre. En 1858, la investigación de Darwin
y Wallace revolucionó nuestra comprensión del origen de las especies y cómo surgió la variabilidad de las
especies. Describieron cómo surgieron nuevas especies a través de la evolución y cómo la selección natural
usa la variación natural para desarrollar nuevas formas. La importancia de este descubrimiento se reflejó en
la ahora famosa cita de Dobzhansky:
“Nada en biología tiene sentido excepto a la luz de la evolución”.
Theodore Dobzhansky, The American Biology Teacher, marzo de 1973
Unos años más tarde, Gregor Mendel, un monje austriaco, resumió sus años de investigación sobre
los guisantes en su famosa publicación. En ese artículo, describió la unidad de la herencia como una partícula
que no cambia. Esto contrastaba con la prevaleciente “teoría de la combinación de la herencia”.
Igualmente importante, Mendel formalizó la importancia de desarrollar líneas puras (genotípicamente
homocigóticas), tomando notas cuidadosas y analizando estadísticamente los datos. Su enfoque de cruzar
individuos con fenotipos variables y seguirlos en generaciones sucesivas sigue siendo el único enfoque
utilizado para comprender la herencia genética de un rasgo. Otros en este siglo llegaron a la conclusión de
que los enfoques estadísticos de la biología ayudarían a resolver problemas en biología y herencia.
La investigación en el siglo XIX a menudo se realizaba de forma aislada. Mientras Mendel
llegaba a la conclusión de que la herencia era de naturaleza particulada, otros intentaban averiguar la naturaleza
física de la partícula. Haeckel predijo correctamente que el material de herencia estaba ubicado en el núcleo.
Miescher demostró que el material del núcleo era un ácido nucleico. Otros observaron el comportamiento de
los cromosomas y sugirieron que tenían un papel en la herencia. Uno se pregunta cómo podrían haber
evolucionado los conceptos si la información fuera móvil en ese momento como lo es hoy.
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Principios del siglo XX : se amplían los principios mendelianos y se desarrolla la teoría cromosómica de
La herencia se solidifica
Excepto en sus primeros años de adulto, Mendel no tuvo un programa de investigación activo.
Por lo tanto, su investigación pionera pasó desapercibida. No fue hasta 1900 que otros, que habían realizado
experimentos similares a los suyos, llegaron a las mismas conclusiones. Sus publicaciones citaron
su trabajo, lo que llevó a un redescubrimiento de los principios mendelianos. Rápidamente después del
redescubrimiento, se describieron otros principios genéticos como el ligamiento, los genes letales y, un poco
más tarde, la herencia materna. En cada caso, los principios se consideraron simples extensiones de
las leyes mendelianas, lo que proporcionó una prueba más de su importancia.
A principios de siglo, el trabajo sobre los cromosomas se unió a la teoría cromosómica de
la herencia. Esta teoría centró la investigación en el cromosoma como la ubicación de los genes. El campo
de la citogenética se basó en este descubrimiento. Se informan las primeras observaciones de anomalías
cromosómicas (duplicaciones, deleciones, translocaciones, inversiones).
Observaciones como el efecto de posición demuestran que existe un vínculo directo entre la estructura
cromosómica y el fenotipo. Todos estos descubrimientos justificaron la investigación para descubrir la base
física de la herencia.
Mediados del siglo XX : el ADN es la sustancia de la vida; se confirma la preeminencia de la teoría
darwiniana de la evolución vía selección natural
Ya en la década de 1870, se determinó que el material del núcleo era un ácido nucleico.
Desde la década de 1920 hasta mediados de la década de 1950, una serie de experimentos demostraron
que el ADN era de hecho el material genético. Los experimentos de transformación de Griffith demostraron
que un factor encontrado en una cepa letal de bacterias podría convertir una cepa no letal de bacterias en
una cepa letal. Fueron los cuidadosos experimentos de Avery, MacLeod y McCarty los que determinaron que
el ADN, no la proteína o el ARN, era el factor responsable de la conversión. Esto fue confirmado además
por Hershey y Chase, aunque sus experimentos tenían fallas que les impedían ser definitivos. Watson y Crick
determinaron la estructura del ADN y otros sugirieron que el ADN contenía un código genético. A mediados de
la década de 1960 se descifró ese código. Los experimentos relacionados con el proceso de transcripción y
traducción llevaron al desarrollo del concepto de "dogma central de la biología molecular" de Crick.
Los experimentos de principios del siglo XIX que confirmaron que los principios mendelianos podían
extenderse a muchos sistemas de genes se convirtió en un componente importante de lo que se llamaría
la síntesis moderna (sobre el neodarwinismo). La demostración experimental de que se podían inducir
mutaciones también fue un componente importante de la solidificación del concepto de que la selección
natural era un factor importante en la evolución. Finalmente, las teorías encarnadas en la genética de
poblaciones también fueron críticas. La síntesis establece que las mutaciones crean variación; la recombinación
desarrolla nuevas formas, la variación se extiende a través de la población y, en función de las limitaciones
ambientales, las fuerzas de la selección natural actúan finalmente sobre la variación para producir
individuos más aptos.
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Mediados del siglo XX y principios del siglo XXI : la era de la genética molecular;
Estudios Intensivos de Filogenética; la era de la información; El surgimiento de la ciencia genómica
Los descubrimientos de mediados a finales del siglo XX definieron procesos que proporcionarían la
herramientas para biología molecular, tecnología de ADN recombinante y, finalmente, la industria biotecnológica. La
aclaración del proceso de replicación del ADN describió los componentes necesarios para el procedimiento de secuenciación
del ADN de terminación de cadena ampliamente utilizado. Comprender la replicación ayudó a determinar las
herramientas necesarias para el marcaje radiactivo del ADN. El desarrollo fue necesario para respaldar las
hibridaciones de Southern y los primeros experimentos de mapeo molecular. Comprender la replicación también definió el
papel de la enzima ligasa que es tan crítica para la clonación de ADN. Las enzimas de restricción se descubrieron y
utilizaron para construir moléculas de ADN recombinante que contenían ADN extraño que podía crecer en
abundancia en células bacterianas. El descubrimiento de la transcriptasa inversa también permitió la clonación de ADNc,
que es esencial para los proyectos modernos de EST. La clonación es esencial para el descubrimiento de la estructura
y función de los genes. También es un paso esencial para todos los proyectos de secuenciación del genoma. La importancia
del procedimiento PCR no se puede enfatizar lo suficiente.
El advenimiento de la secuenciación de proteínas y ADN lanzó una nueva era de la filogenética.
Las especies ahora podrían compararse a nivel molecular. Se desarrollan nuevos procedimientos para el desarrollo de
filogenias. Se propone la teoría neutral de la evolución molecular. Este es un ataque directo a la preeminencia de la
selección como fuerza motriz de la evolución. La teoría sugiere que la mayoría de las mutaciones son neutrales y están
fijadas por la deriva genética y no por la selección. Se debate si la evolución de las especies está impulsada más por
efectos neutrales o por selección. Algunos sienten que las dos teorías son compatibles y ejercen sus efectos sobre
diferentes genes.
La era de la información es esencial para la genómica. El análisis electrónico, la distribución y el almacenamiento
de datos genómicos es un sello distintivo de la ciencia. Para esto fue fundamental el desarrollo de computadoras, tanto
grandes como pequeñas, que pusieron el poder de cómputo en manos de todos los científicos. La distribución gratuita de
software analítico proporcionó a los científicos las herramientas para estudiar los detalles de sus experimentos. Internet
generó la distribución de información de bases de datos centrales.
El correo electrónico conectó a los científicos y fomentó el rápido intercambio de ideas. El advenimiento de la WWW
proporcionó un nuevo medio para la presentación de información.
Se secuencia el genoma completo por primera vez. Para otras especies, el contenido de genes es
descrito usando tecnologías ecológicamente racionales. Los análisis de micromatrices proporcionaron la primera visión
de los patrones de expresión global. La proteómica comienza a describir el componente proteico del genoma. Se establece la
metabolómica.
Se introduce la tecnología de secuenciación paralela masiva. Esta nueva tecnología en gran medida
aumenta la cantidad de secuencia de ADN que se puede recolectar en un período corto. También disminuirá
drásticamente el costo de la secuenciación. Es importante destacar que lanza la era de la secuenciación del genoma
individual que respaldará una era de medicina individualizada.
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Tabla 1. Historia comentada de la genética y la genómica.
Año Quién Descubrimiento
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1935 GW Beadle y B. Se describe la genética bioquímica que controla la síntesis
efrussi; y A. Kuhn y A. del pigmento ocular en Drosophila (Beadle y Ephrussi) y
Butenandt Ephestia (Kuhn y Butenandt).
1936 puentes calvin Se publica el primer mapa citogenético del cromosoma de la glándula
salival de Drosophila .
1936 Alfredo Sturtevant Se describe el uso de inversiones para describir la filogenia de
Teodoro Dobzhansky un cromosoma.
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1946 Max Delbruck y Se demuestra la recombinación genética de bacteriófagos .
WT Bailey AD
Hershey
1948 hj muller Se describe el fenómeno de la compensación de dosis .
1948 J. Lederberg y N. Se describe la técnica de utilizar la selección con penicilina para
Zinder descubrir mutantes bioquímicos de bacterias. Los dos grupos
BD Davis hacen este descubrimiento de forma independiente.
1948 Bárbara McClintock Luego de un intenso estudio de los genes que controlan el color de
la cubierta de la semilla en el maíz, se propone el concepto de
elementos transponibles para explicar la inducción
espontánea de mutaciones.
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1967 WM Fitch E. Se desarrolló el primer árbol filogenético . Consistía en una comparación
Margoliash de la secuencia de aminoácidos del citocromo C de veinte especies
que iban desde hongos hasta mamíferos.
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1990 Gobierno de EE. UU. Se lanza el Programa Genoma Humano de 15 años . El objetivo es
"encontrar todos los genes en cada cromosoma del cuerpo y determinar
su naturaleza bioquímica".
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19934 Genthon Se publica el primer mapa de ligamiento de alta densidad del genoma
humano.
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Plantas (+algas) 47 107
dieciséis
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Una historia de la genética y la genómica
Mediados a finales del siglo XIX : Evolución, Natural
Selección, herencia de partículas y nucleína
1858
• Darwin y Wallace • Papel
de la variación natural y la selección natural en la evolución
“Nada en biología tiene sentido excepto a la luz de la evolución”.
Theodore Dobzhansky, The American Biology Teacher, marzo de
1973
1865
• Gregor Mendel •
Herencia de partículas
1866
• Ernst Haeckel •
Los materiales hereditarios estaban en el núcleo
1871
• Friedrich Miescher • El
material del núcleo era un ácido nucleico
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Principios del siglo XX : se amplían los principios
mendelianos y se desarrolla la teoría cromosómica de
La herencia se solidifica
1900
• Correns, de Vries, von Tschermak •
Se redescubre el trabajo de Mendel
• Comienza la era de la genética
1902
• Walter Sutton y Theodor Boveri •
Teoría cromosómica de la herencia • El
material de la herencia reside en los cromosomas
19051923
• Ligamiento
• Ligamiento
sexual • Mapeo
genético • Número de grupos de ligamiento = número de
cromosomas •
Genes letales • Herencia materna
1908
• Hardy y Weinberg •
Principio de equilibrio genético de HardyWeinberg
1909
• NilssonEhle •
Teoría de los rasgos cuantitativos y genética cuantitativa
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Mediados del siglo XX : el ADN es la sustancia de
la vida; se confirma la preeminencia de la
teoría darwiniana de la evolución vía selección natural
1928
• Griffith •
Experimentos de transformación
1944
• Avery, MacLeod, McCarty •
Prueba definitiva de que el ADN es el material genético
1953
• Watson y Crick • Se
define la estructura del ADN
19541961
• Se determina el código de
ADN • Se describe la
transcripción • Se describe
la replicación • Se describe
la traducción • Se descubren los operones
19321953
• Fisher y Dobzhansky • Se
formula la síntesis moderna • Vincula la
teoría evolutiva darwiniana y la genética mendeliana
1968
• Kimura •
Se introduce la Teoría Neutral de la Evolución Molecular
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Mediados del siglo XX y principios del siglo XXI : la
era de la genética molecular;
Estudios Intensivos de Filogenética; El
Edad de información; El surgimiento de la genómica
Ciencia
1969
• ARPANET •
Internet entra en línea
1970
• Arber y Smith • Se
aísla la primera enzima de restricción, HindII.
1970
• Baltimore y Temin •
Descubrimiento de la transcriptasa inversa
1972
• Berg •
Se construye la primera molécula de ADN recombinante
1973
• Boyer y Cohen • Se
produce la primera célula de E. coli recombinante funcional
1977
• Sanger y Gilbert • Se
describen técnicas de secuenciación de ADN
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1977
• Sharp y Roberts • Se
descubren los intrones
1978
• Botstein •
Los RFLP lanzan la era del mapeo molecular de enlaces
grupos
1980
• Grupo Sanger • Se
secuencia el primer genoma, el bacteriófago ΦX174 de E.
coli
1983
• Mullis •
Se descubre la técnica PCR
1986
• Hood, Smith, Hunkapiller y Hunkapiller • Primer
secuenciador de ADN automatizado
1990
• Gobierno de EE. UU.
• Lanzamiento del Proyecto Genoma Humano
1990
• BernersLee • Se
crea el lenguaje HTML
1995
• Celera •
Se secuencia el primer genoma bacteriano (H. influenza)
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1995
• Brown, Stanford •
Tecnología de microarrays desarrollada
1996
• Consorcio del Genoma de la
Levadura • Primer genoma eucariótico (levadura) secuenciado
2000
• Iniciativa del genoma de Arabidopsis •
Se secuencia el primer genoma de una planta con flores (Arabidopsis
thaliana)
2001
• Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma Humano •
Celera •
Se publica la secuencia del genoma humano
2004
• Solexa (ahora Illumina) •
Tecnología de secuenciación por síntesis •
Tecnología de resecuenciación del genoma
2005
• 454 empresas •
Tecnología de pirosecuenciación automatizada •
Secuenciación del genoma completo de alto rendimiento
2005
• Applied Biosystems •
Secuenciación por ligadura y detección de oligonucleótidos •
Tecnología de resecuenciación del genoma