TRABAJO DE

INVESTIGACIÓN
UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA

USO DEL SOFTWARE SNAPGENE PARA

SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS
EN GEL DE AGAROSA CON DATOS DEL
ARTÍCULO CIENTÍFICO
“AISLAMIENTO DE BACTERIAS CON
POTENCIAL BIORREMEDIADOR Y ANÁLISIS DE
COMUNIDADES BACTERIANAS DE ZONA
IMPACTADA POR DERRAME DE PETRÓLEO
EN CONDORCANQUI – AMAZONAS – PERÚ”

AUTOR:
Cáceres Quiroga, María Fernanda

DOCENTE:
Dr. Hebert Hernan Soto Gonzales
 UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA

ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL

“Año de la unidad, la paz y el desarrollo”

CURSO:
BIOTECNOLOGÍA

CICLO:
VII

INFORME DE
PRÁCTICA

TEMA:
Uso del software SnapGene para simulación de electroforesis
en gel de agarosa con datos del artículo científico
“Aislamiento de bacterias con potencial biorremediador y análisis de comunidades
bacterianas de zona impactada por derrame de petróleo en
Condorcanqui – Amazonas – Perú”

AUTOR:
Cáceres Quiroga, María Fernanda

DOCENTE:
Dr. Hebert Hernan Soto Gonzales

02 de junio del 2023

Ilo – Moquegua – Perú

 ÍNDICE

1. INTRODUCCIÓN ...................................................................................... 1

2. OBJETIVOS ............................................................................................... 1

2.1. Objetivo general .................................................................................. 1

2.2. Objetivos específicos........................................................................... 1

3. MARCO TEÓRICO ................................................................................... 2

3.1. Electroforesis ....................................................................................... 2

3.2. Gel de agarosa ..................................................................................... 2

3.3. NCBI (National Center for Biotechnology Information) .................... 2

3.4. Software SnapGene ............................................................................. 3

3.5. Análisis de secuencias de ADN ........................................................... 3

4. METODOLOGÍA ....................................................................................... 3

4.1. Materiales y equipos............................................................................ 3

4.2. Procedimiento...................................................................................... 4

5. RESULTADOS ........................................................................................... 8

6. CONCLUSIONES ...................................................................................... 9

7. BIBLIOGRAFÍA ........................................................................................ 9
 LISTA DE FIGURAS

Figura N° 1. Abrimos el artículo científico que contiene los códigos genéticos. 4

Figura N° 2. Introducimos el primer código en la página del NCBI................... 4

Figura N° 3. Lo guardamos en nuestro dispositivo en formato FASTA.............. 5

Figura N° 4. Le asignamos el nombre del microorganismo para guardarlo ........ 5

Figura N° 5. Abrimos el archivo en SnapGene y lo guardamos en formato

SnapGene DNA ................................................................................................................ 6

Figura N° 6. Al nombre del archivo le añadimos nuestras iniciales .................... 6

Figura N° 7. Nos dirigimos a la herramienta Tools y abrimos el archivo en gel

de agarosa al 1% ............................................................................................................... 7

Figura N° 8. Repetimos los mismos pasos hasta completar los 13 códigos

genéticos ........................................................................................................................... 7

Figura N° 9. Secuencia de ADN de los 13 códigos genéticos ............................. 8

Figura N° 10. Secuencia de 13 códigos genéticos en gel de agarosa al 1% ........ 8

 1

1. INTRODUCCIÓN

SnapGene es un software de clonación de secuencias de ADN que ayuda a

planear y simular la manipulación del ADN. Permite de forma sencilla y segura

planificar, observar y documentar los procesos diarios ocurridos en la biología

molecular.

Además de permitir la visualización, anotación, edición y clonación de

secuencias de ADN, igualmente con la visualización de proteínas, las documentación e

intercambio de datos y la simulación de métodos de clonación similares.

Es por ello que SnapGene es un programa de gran utilidad debido a su alta

capacidad de visualizar y documentar los procesos diarios ocurridos en la biología

molecular, debido a estas razones es que este software es utilizado por científicos,

instituciones educativas y empresas de todo el mundo.

2. OBJETIVOS

2.1. Objetivo general

• Realizar una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el

software SnapGene, con los códigos genéticos proporcionados por el

artículo científico “Aislamiento de bacterias con potencial

biorremediador y análisis de comunidades bacterianas de zona

impactada por derrame de petróleo en Condorcanqui – Amazonas –

Perú”

2.2. Objetivos específicos

• Aprender sobre el manejo del software SnapGene

• Conocer el proceso de electroforesis en gel de agarosa

 2

3. MARCO TEÓRICO

3.1. Electroforesis

La electroforesis es una técnica de laboratorio muy utilizada que consiste en la

separación de las moléculas de ADN y ARN en función de su tamaño con mediante el

uso de corriente eléctrica. Tiene gran variedad de usos pero mayormente se utiliza en la

identificación de personas.

Esta técnica se realiza con un equipo compuesto por un extremo con carga

negativa y otro extremo con carga positiva. Al insertar las moléculas cargadas en el

medio, las negativas se irán a un extremo y las positivas al otro extremo.

3.2. Gel de agarosa

El gel de agarosa al 1% es un tipo de material similar a la gelatina por su textura.

Estos geles suelen estar hechos del polisacárido llamado agarosa (encontrados en

hojuelas secas) para separar el ADN.

Cuando la agarosa es calentada en una solución de agua mezclada con sales para

luego llevarla a enfriar, se forma un gel sólido blando. Al bloque de gel se le hacen

pequeñas ranuras, también llamadas pozos, para permitir el ingreso de las muestras de

ADN.

3.3. NCBI (National Center for Biotechnology Information)

Es una parte de la Biblioteca Nacional de Medicina de Estados Unidos en la que

se encuentra información genética de gran importancia biológica molecular. Esta se

encarga del almacenamiento y constante actualización de información referente a

secuencias genómicas del banco de genes.

 3

En esta página biológica molecular también se pueden encontrar artículos

científicos referentes a medicina, genética, genómica y también se encuentran

enfermedades genéticas. Además de algunos otros datos biotecnológicos importantes.

3.4. Software SnapGene

Es un software de clonación de secuencias de ADN que ayuda a planear y

simular la manipulación del ADN, permitiendo de forma sencilla y segura planificar,

observar y documentar los procesos diarios ocurridos en la biología molecular.

3.5. Análisis de secuencias de ADN

Secuenciar todo el ADN de un organismo sigue siendo una tarea complicada ya

que este proceso requiere romper las cadenas de ADN del genoma en pedazos más

pequeños, secuenciarlos y ensamblarlos en una única larga cadena.

Sin embargo, gracias a los nuevos avances tecnológicos de la ciencia, es que en

las últimas 2 décadas se desarrollaron técnicas que faciliten la secuenciación de un gen

de forma más acelerada y sin un costo tan elevado.

4. METODOLOGÍA

4.1. Materiales y equipos

• Página NCBI

• Artículo con códigos genéticos

• Software SnapGene

• Laptop
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4.2. Procedimiento

Figura N° 1. Abrimos el artículo científico que contiene los códigos genéticos

Figura N° 2. Introducimos el primer código en la página del NCBI

 5

Figura N° 3. Lo guardamos en nuestro dispositivo en formato FASTA

Figura N° 4. Le asignamos el nombre del microorganismo para guardarlo

 6

Figura N° 5. Abrimos el archivo en SnapGene y lo guardamos en formato

SnapGene DNA

Figura N° 6. Al nombre del archivo le añadimos nuestras iniciales

 7

Figura N° 7. Nos dirigimos a la herramienta Tools y abrimos el archivo en gel

de agarosa al 1%

Figura N° 8. Repetimos los mismos pasos hasta completar los 13 códigos genéticos
 8

5. RESULTADOS

• Luego de copiar, guardar y abrir los 13 códigos genéticos de las especies en

el software SnapGene, tenemos la secuencia de ADN completa y también

podemos observar las 13 secuencias en gel de agarosa al 1%.

Figura N° 9. Secuencia de ADN de los 13 códigos genéticos

Figura N° 10. Secuencia de 13 códigos genéticos en gel de agarosa al 1%

 9

6. CONCLUSIONES

• El software SnapGene es un perfecto simulador de laboratorio ya que ayuda

a realizar procesos como la electroforesis en gel de agarosa con una

manipulación sencilla y entendible, proporcionando conocimiento sobre el

tema de una manera más fácil.

• Con ayuda de la presente práctica se pudo conocer más a fondo en qué

consiste la técnica de electroforesis, que básicamente es la separación de

moléculas para el análisis y caracterización de ácidos nucleicos de distintas

procedencias.

7. BIBLIOGRAFÍA

• Castillo Rogel, R. T., Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional de

Piura, Piura Perú., More Calero, F. J., Cornejo La Torre, M., Fernández

Ponce, J. N., Mialhe Matonnier, E. L., Empresa de investigación y

capacitación en Biotecnología Molecular, IncaBiotec - Tumbes Perú,

Cooperativa de trabajadores Biotecoop - Lima, Perú, Facultad de Ciencias de

la Universidad Nacional de Piura, Piura Perú., & Empresa de investigación y

capacitación en Biotecnología Molecular, IncaBiotec - Tumbes Perú. (2020).

Aislamiento de bacterias con potencial biorremediador y análisis de

comunidades bacterianas de zona impactada por derrame de petróleo en

Condorcanqui – Amazonas – Perú. Revista de Investigaciones Altoandinas -

Journal of High Andean Research, 22(3), 2015–2225.

https://doi.org/10.18271/ria.2020.656
 10

• Geater, J. (s/f). ¿Qué Es SnapGene? (de GSL Biotech LLC). Solvusoft.com.

Recuperado el 2 de junio de 2023, de https://www.solvusoft.com/es/file-

extensions/software/gsl-biotech-llc/snapgene/

• Huq, N. L., DeAngelis, A., Rahim, Z. H. A., J. Lucas, M. U., Cross, K. J., &

Reynolds, E. C. (2004). Whole And Parotid Saliva - Protein Profiles As

Separated On 5-20% SDS-Polyacrylamide Gradient gel Electrophoresis And

Using Maldi-tof Mass Spectrometry. Annals of Dentistry, 11(1), 24–29.

https://doi.org/10.22452/adum.vol11no1.4

• National center for biotechnology information. (s/f). Nih.gov. Recuperado el

2 de junio de 2023, de https://www.ncbi.nlm.nih.gov/