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  • Gavilanes - Kimberly - Deber Humana

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    KIMBERLY NAOMI GAVILANES ARMIJOS
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    El documento describe una tarea de laboratorio para un curso de Biotecnología Humana que involucra la extracción de ARN de la línea celular McCoy ATCC CRL-1696 Mus musculus, la búsqueda de la secuencia del gen ACTB en bases de datos, el alineamiento de la secuencia del gen y los primers utilizados mediante BLAST, y la determinación del tamaño del fragmento flanqueado por los primers utilizando PRIMER BLAST.

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    Gavilanes_Kimberly_Deber humana

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    Gavilanes - Kimberly - Deber Humana

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    El documento describe una tarea de laboratorio para un curso de Biotecnología Humana que involucra la extracción de ARN de la línea celular McCoy ATCC CRL-1696 Mus musculus, la búsqueda de la secuencia del gen ACTB en bases de datos, el alineamiento de la secuencia del gen y los primers utilizados mediante BLAST, y la determinación del tamaño del fragmento flanqueado por los primers utilizando PRIMER BLAST.

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    UNIVERSIDAD DE LAS FUERZAS ARMADAS – “ESPE”

    DEPARTAMENTO DE LA CIENCIAS DE LA VIDA

    Nombre: Kimberly Gavilanes Fecha: 10/02/2023

    Asignatura: Biotecnología Humana NRC: 9227

    Tarea de laboratorio

    Tema: Sensibilidad analítica y eficiencia de amplificación del gen ACTB en la Reacción en Cadena
    de la Polimerasa cuantitativa (qPCR) a partir de ARN extraído de la línea celular McCoy ATCC
    CRL-1696 Mus musculus, fibroblasto murino.

    1. Utilizar la base de datos del NCBI y buscar la secuencia de ARN mensajero del gen ACTB en
    Mus musculus.

    Tomado de : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_007393.5?report=fasta

    2. Luego para el gen:


    • Utilizar el software online BLAST (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi), ingresar la
    secuencia del gen ACTB y realizar el alineamiento de la secuencia del gen y los primers.
    Primer Forward ACTB: 5'- TGCTCTAGACTTCGAGCAGGAGATG -3'

    Primer Reverse ACTB: 5'- AGCCTCAGGGCATCGGAA -3'

    • Utilizar el software online PRIMER BLAST


    (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/), ingresar la secuencia del gen ACTB y
    determinar el tamaño del fragmento flanqueado por los primer forward y reverse.

    Tomado de :
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/primertool.cgi?ctg_time=1675955842&job_key=x80
    Z803cQHRnTtBL3Sv0eacw5UuKI_5Wiw

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