Interacciones entre plantas y microbios

del suelo
1. Interacciones positivas
- Simbiosis
- PGPRs (bacterias promotoras del crecimiento en
plantas)
- Degradadores de materia organica
- Endofitos

2. Interacciones neutrales
- No hay un efecto claro en el crecimiento/salud de la
planta.

3. Interacciones negativas.
- Patogenos
- Competidores por nutrientes.
 Rhizospheric Chemical Warfare
Positive Interactions

PGPRs; Symbionts

Biocontrol, VAM, endophytes

ROO
Growth facilitators

T
ROOT

Vectors for symbioses, SARs

Negative Interactions
Antibacterial compounds, QS mimics

Type-III
Phytotoxins
Antifungal compounds

Phytotoxins

ROO
Allelopathy
Root
Nematicidal compounds

T
herbivory
Root
herbivory
PGPRs (Bacterias promotoras del
crecimiento)
 Interrelación entre la biodiversidad,
funcionamiento del ecosistema suelo y
cambios globales
Cambios Globales
Actividad Humana

Población
Dinámica

Funcionamiento
Diversidad de los
Biológica Ecosistemas

Dinámica
del Paisaje

Sistemas Sustentables
Interrelación de los componentes del suelo

Biológico

Sustentabilidad
del suelo

Químico Físico
 Raíz - Microbio
Específico

General

Raíz - Microbioma
Comunidades Microbianas & Producción de la
Planta

0.035
y = 0.0009x - 0.0091 Suelos con mayor biodiversidad
0.03
R2 = 0.955 microbiana produjeron mayor
0.025 biodiversidad vegetal
Biomass (%)
Arabidopsis

0.02

0.015
CSI = Dfungi / Dbacteria
0.01

0.005

0
0 10 20 30 40 50
Com m unity Stability Index (CSI)
¿Cómo mejorar la diversidad microbiana del
suelo?

-Estrategias de manejo
Huancayo, Peru
San Luis Valley, Colorado (orgánico e intensivo)
Cebadores Universales de 16SrRNA para Hongos

2234C, 5’-gcctccctcgcgccatcagnnnnnnnnnnnnGTTTCCGTAGGTGAACCTGC-3’
3126T, 5’-gccttgccagcccgctcagATATGCTTAAGTTCAGCGGGT-3’

Cebadores Universales de 16SrRNA para Bacterias

27F, 5’-gcctccctcgcgccatcagnnnnnnnnnnnnAGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3’
388R, 5’-gccttgccagcccgctcagTCTGCTGCCTCCCGTAGGAGT-3’
Comparación UPGMA de comunidades específicas agrícolas con
base en índices de similitud Jaccard (disimilitud del 3%)

Membresía de la Comunidad Estructura de la Comunidad

A B
Con-III Con-III
Con-II Con-II
Con-I Con-I
Org-III Org-III
Org-II Org-II
Org-I Org-I

0.1 0.05
 Phylotypes (#) Diversity (Simpson’s index)

Organic Conventional Peru Organic Conventional Peru

Evenness (Shannon’s index)

Comparison between
organic and
conventional farms

Organic Conventional Peru

 Abundance of specific microbes
(qPCR validation of pyrosequencing)

1000 A p = 0.055
Organism Result Correlation
800
600
400 Alternaria solani Con. > Org. 0.982
200
4
Copies / g FW soil x 10

Pythium ultimum Con. < Org. 0.923

160
B p = 0.021

120
Phoma foveata Con. = Org. 0.856
80

40

16 C p = 0.966 Specific microbes were identified that

12 differed between convention & organic.
8

4
qPCR confirmed pyrosequencing
Con-III
Org-III

Con-II
Org-II

Con-I
Org-I

estimates of microbial presence.

¿Cómo mejorar la diversidad microbiana del
suelo?

- Capacidades intrínsecas de las plantas por medio de

exudados de raíz
Dos modelos de plantas:

Arabidopsis
Medicago

Tres tipos de Suelo:

Arabidopsis (IL)
Medicago (TX)
Forest (OR)

Broeckling et al. (2008) AEM

 Suelo Arabidop Suelo OR Suelo Medic
Plantas
200

DNA(pg/uL)

Gen 1
100

200
DNA(pg/uL)

Gen 2
100

200
DNA(pg/uL)

Gen 3
100

trt at c mt
Total C and N and C:N ratio is unchanged

Generation:
I II III
25

20

15
IL
10

25

20

15
OR
C/N

10

25

20

15
TX
10

At Atx C Mt Mtx At Atx C Mt Mtx At Atx C Mt Mtx

Exudados Suelo Arabidop Suelo OR Suelo Medic
de la Raíz
200

DNA(pg/uL)

Gen 1
100

200
DNA(pg/uL)

Gen 2
100

200
DNA(pg/uL)

Gen 3
100

trt atx c mtx

Exudados radiculares de Arabidopsis y Medicago