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Taxonomía basada en la homología del ADN

. La clasificación debe basarse en la homología; es decir, características


compartidas que han sido heredadas de un ancestro común. Cuanto más
recientemente dos especies han compartido un ancestro común, más homologías
comparten y más similares son estas homologías. Hasta las últimas décadas, el
estudio de las homologías se limitaba a las estructuras anatómicas y al patrón de
desarrollo embrionario. Sin embargo, desde el nacimiento de la biología molecular,
ahora también se pueden estudiar homologías a nivel de proteínas y ADN.

Producción de energía
Las fuentes de energía (compuestos químicos o luz) utilizadas por las diferentes
clases de microorganismos y la forma como ellos las utilizan son muy variadas,
pero cualquiera que sea el sustrato y el mecanismo bioquímico empleado por los
microorganismos para su utilización, el objetivo final común es la obtención de
energía, la cual es convertida en ATP, que es el mediador de muchas de las
transferencias metabólicas de energía del catabolismo y el anabolismo.
Las fuentes de elementos químicos y energía necesarias por los microorganismos
para sintetizar sus compuestos bioquímicos deben estar disponibles en su
ambiente y listos para ser usados. Las fuentes orgánicas incluyen un gran número
de compuestos que van desde moléculas de 2 átomos de carbono hasta
moléculas más complejas tales como el almidón, el cual contiene miles de átomos
de carbono. Las fuentes inorgánicas incluyen el dióxido de carbono, sulfuro de
hidrógeno y otras moléculas

Fermentación
Es un proceso catabólico de oxidación incompleta, totalmente anaeróbico, siendo
el producto final un compuesto orgánico. Estos productos finales son los que
caracterizan los diversos tipos de fermentaciones.
 Fermentación láctica: Es un tipo de fermentación en la cual el ácido láctico es
el producto principal de la fermentación de la glucosa
 Fermentación alcohólica: Es un tipo de fermentación que es realizada por un
amplio rango de hongos filamentosos (mohos) como Aspergillus, Mucor y
Fusarium y hongos unicelulares (levaduras) como Saccharomyces .
 Fermentación ácido mixta: En esta vía se forman ácidos acético, láctico,
succínico y fórmico en diferentes proporciones que varían con el microorganismo y
con las condiciones de cultivo. Los microorganismos que llevan a cabo esta
fermentación dan positiva la prueba del rojo de metilo.
 Fermentación butanodiólica: Este es un tipo de fermentación que es llevada a
cabo por ciertos miembros de la familia Enterobacteriaceae
 Fermentación butírica: Este tipo de fermentación es realizada por ciertas
especies de Clostridium en la que la glucosa es fermentada con la formación de
ácido acético, ácido butírico, CO2 y H2.
 Fermentación propiónica: Esta es una fermentación realizada por especies del
género Propionibacterium en la cual los productos principales de la fermentación
de la glucosa son los ácidos propiónico y acético.
Coenzimas: Los procesos metabólicos de los microorganismos, al igual que los
de los organismos superiores, son catalizados por una serie de enzimas, algunas
de las cuales para su actividad requieren de la acción de cofactores (coenzimas).
Tipos de coenzimas:
* Coenzima A
*TPP (Pirofosfato de Tiamina, Vitamina B1)
*Biotina (Vitamina H) Transferencia de CO2
*Ácido lipoíco
*NAD
*NADP
*Derivados de la riboflavina (Vi tamina B2)
*Ubiquinona (Coenzima Q)
*Naftoquinona
*Citocromos
*ATP
*Fosfato de piridoxal (Vitamina B6).
*Racemización
*Tetrahidrofolato
*Cobamida (Vitamina B12)
*Ferredoxinas
*Flavodoxinas.

Vías de Piruvato: Como sabemos el piruvato es el resultado final de la glicolisis o


glucolisis, que en síntesis es un proceso metabólico donde el sustrato que se
degrada es la glucosa (principalmente) con la intervención de 10 enzimas
diferentes, que como resultado aparte del piruvato ya mencionado se produce2
ATP y 2 NADH.
Y para que esta glucosa que ahora ya es piruvato, ATP y NADH se siga
descomponiendo en moléculas más simples, le toca seguir dos rutas una de ellas
es la ruta aerobia y anaerobia.

Respiración: Proceso de producción de energía en el cual compuestos


inorgánicos actúan como aceptores externos de electrones.
Job

Metabolismo: es un conjunto de reacciones químicas que sufren los nutrientes en


el interior del organismo para convertirse en energía útil.
-Aerobio: Son esfuerzos de intensidad media prolongados y menos intensos y
suministra energía de hidratos de carbono, ácidos grasos y aminoácidos. Donde la
célula utiliza esta energía para sus reacciones anabólicas de la célula: duplicación
del ADN y síntesis de proteínas.
-Anaerobio: Después del glucolisis ocurre un proceso llamado fermentación en el
mismo citosol, haciendo que el piruvato se reduzca a moléculas orgánicas como el
ácido láctico o el etanol donde solo hay producción de 2 ATP en el glucolisis.
*Anaerobio láctico: Son esfuerzos de intensidad submáxima de 30 segundos a 1
minuto de duración, tal como ocurre en los deportes de equipo (hidratos de
carbono).
*Anaerobio aláctico: Son esfuerzos de intensidad máxima caso de los saltos,
lanzamientos o movimientos de velocidad gestual acíclica (ATP y fosfocreatinina)
Síntesis de proteínas: es el proceso de construcción de las proteínas en las
células a partir de los aminoácidos. Las proteínas son importantes para el
funcionamiento de la célula, por lo que son esenciales para todos los seres vivos.
La síntesis de las proteínas consiste en la traducción del ARN mensajero (ARNm)
que se produjo a partir del ADN. De esta forma, la información genética en el ADN
se transforma en proteínas, que son las encargadas de llevar a cabo las
actividades celulares.
Sustrato: es la superficie en la que una planta o un animal vive. El sustrato puede
incluir materiales bióticos o abióticos; orgánicos o minerales. Por ejemplo, las
algas que viven incrustadas en una roca pueden ser el sustrato para otro animal
que vive en la parte superior de las algas.
Variación genotípica y fenotípica: En las bacterias, al igual que en los
organismos superiores, se distingue el denominado genotipo o conjunto de
caracteres que posee y los trasmite por herencia, ya que están impresos en su
ácido desoxirribonucleico (ADN), y el llamado fenotipo o aquellos caracteres
expresados por interacción entre el genoma y el medio que lo circunda, de forma
que éste permite o no la expresión de los primeros. Desde el punto de vista de la
patología humana bucal, las variaciones explican, por ejemplo, cambios en la
virulencia de los microorganismos o la aparición de resistencias a determinados
antimicrobianos. Las variaciones fenotípicas o adaptaciones se producen por la
presión ambiental sobre las bacterias, pero no resulta afectado el genoma, en el
que no hay repercusión alguna.

-Reproducción bacteriana
 Reproducción asexual: Las bacterias se reproducen por bipartición. El ADN
(cromosoma bacteriano) se une a un mesosoma y se duplica. Posteriormente, la
membrana plasmática se invagina y se produce un tabique de separación, lo que
da lugar a dos células hijas, cada una de ellas con una réplica exacta del
cromosoma de la célula madre.
 Reproducción parasexual: Conjunto de mecanismos mediante los cuales
intercambian información genética con otras bacterias, sean o no de la misma
especie. Una vez introducido el fragmento de ADN, es generalmente estabilizado
al ser incorporado al cromosoma bacteriano. Existen tres procesos de intercambio
genético: conjugación, transducción y transformación.

- Principios de la nutrición bacteriana: Proceso por el que las bacterias toman


del medio las sustancias químicas necesarias para desarrollarse y realizar sus
funciones. Se requieren para dos objetivos:
*Fines energéticos
*Fines bio Desde el punto de vista de los fines de aprovisionamiento de energía,
las bacterias se pueden dividir en:
litógrafas (del griego lithos = piedra): son aquellas que sólo requieren sustancias
inorgánicas sencillas (SH2 , S0, NH3, NO2-, Fe, etc.).
Organotrofas: requieren compuestos orgánicos (hidratos de carbono,
hidrocarburos, lípidos, proteínas, ......).
Desde el punto de vista biosintético (o sea, para sus necesidades plásticas o de
crecimiento), las bacterias se pueden dividir en:
Autótrofas: crecen sintetizando sus materiales a partir de sustancias inorgánicas
sencillas. Ahora bien, habitualmente el concepto de autotrofía se limita a la
capacidad de utilizar una fuente inorgánica de carbono, a saber, el CO2.
Heterótrofas: su fuente de carbono es orgánica (si bien otros elementos distintos
del C pueden ser captados en forma inorgánica).sintéticos.

Elva.
Requerimientos por carbono:
Es requerido por todo tipo de bacterias:
 Autótrofas: es un organismo que produce compuestos orgánicos complejos
usando carbono de sustancias simples como dióxido de carbono, Lo requieren
como fuente de carbono y lo reducen usando como fuente de energía la luz
 Arqueobacterias Metanogénicas: Usan el CO2 como aceptor de electrones
procedentes de la oxidación del H2O.
 Heterótrofas: Necesitan pequeñas cantidades para las carboxilaciones en
determinadas rutas anabólicas y catabólicas.

Factores de crecimiento:
A los compuestos orgánicos que actúan como precursores o como constituyentes
de material celular y que no pueden ser sintetizados a partir de compuestos de
carbono más sencillos se les llama colectivamente factores de crecimiento; éstos,
por su estructura química y acción metabólica, se dividen en tres clases:
*Aminoácidos, requeridos como constituyentes de proteínas.
*Purinas y pirimidinas, requeridos como constituyentes de los ácidos nucleicos.
*Vitaminas, representadas por diversos compuestos orgánicos que forman parte
de grupos prostéticos o centros activos de numerosas enzimas.

Crecimiento microbiano:
El crecimiento consiste en el aumento de los constituyentes celulares, y tiene
como resultado un incremento del tamaño o del número celular o de ambos.

Temperatura:
La temperatura es uno de los factores ambientales más importantes por su amplia
aplicación. Temperaturas extremadamente bajas y extremadamente elevadas, se
utilizan de manera corriente para la conservación de microorganismos o para
provocar su muerte respectivamente.
Los tres valores de temperatura, mínima, óptima y máxima, se conocen como
temperaturas cardinales.
En base a ellas podemos clasificar los microorganismos en grupos compuestos
por organismos muy diferentes entre sí pero que presentan gran similitud en su
comportamiento frente a la temperatura

Agua:
Vehículo por el que entran en la célula las sustancias nutritivas y salen las
sustancias de desecho.
Desde el punto de vista funcional, el agua es:
*El principal constituyente de protoplasma bacteriano
* El medio universal donde ocurren las reacciones biológicas
*Un reactante en exceso
Las fuentes de agua son:
• Endógena
• Exógena

PH: En general, los ambientes naturales tienen un pH comprendido entre 5 y 9, y


la mayoría de los microorganismos crecen dentro de esos valores. Sin embargo,
algunos pueden desarrollar a valores de pH inferiores o superiores a los indicados.
de acuerdo al rango de pH en el que es posible su desarrollo, se los clasifica en
tres grupos:
*Acidofilos
*Neutrofilos
*Basofilos
Los valores de pH superiores e inferiores al rango que corresponde a un dado
microorganismo son nocivos, ya que afectan la estabilidad de la membrana
plasmática, inhiben enzimas, y alteran el transporte de solutos y la nutrición sin
embargo todos los microorganismos poseen mecanismos de regulación del pH
citoplasmático que les permite mantener su valor constante lo cual es muy
importante para su supervivencia.
Medios de cultivo:
 Medios complejos: se desconoce su composición química exacta.
Estos contienen componentes como peptonas extracto de levadura y agar si se
requiere de un medio de cultivo sólido.
 Medios sintéticos: son los medios que contienen una composición química
definida cualitativa y cuantitativamente.
 Medios selectivos: favorecen el crecimiento de microorganismos particulares.
 Medios líquidos: contienen los nutrientes en solución acuosa.
 Medios sólidos: se preparan añadiendo un agar a un medio liquido en placas
de Petri o tubos de ensayo.
Bermary.
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