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Generalidades virología
Importancia medica de los virus como causa de mortalidad por enfermedades respiratorias y
diarreas en niños.
¿Qué es un virus?
Parásitos genéticos intracelulares obligados, es decir, necesitan infectar una célula para
poder generar progenie viral, a partir del uso de la maquinaria de la célula que infectan.
Carecen de potencial bioquímico y genético para generar su propia energía, por lo que utilizan
los ribosomas, ATP e incluso algunos utilizan las polimerasas celulares.
Los virus y bacteriófagos pueden formar parte de la virobiota, es decir forman parte de la flora
de los individuos. Sin necesidad de producir enfermedad.
Virus ADN en su mayoría tienen cápsides de tipo icosaedrica, a excepción de Poxviridea que
tiene una simetría compleja.
Mientras que los virus ARN envueltos tienen cápside icosaédricas (Togaviridae, Flaviviridae,
Retroviridae) y helicoidal (Coronaviridae, Rhabdoviridae, Flavoviridae, Paramyxoviridae, etc.).
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Por fuera de la cápside pueden tener una envoltura glicoproteica y glicolipida. No está
presente en todos los virus, aquellos que presentan la envoltura son conocidos como virus
envueltos y los que no, como virus desnudo. La envoltura deriva de la membrana de la célula
huésped durante la gemación. Posee proteínas específicas de unión a receptores de la célula,
secuencias que determinan la unión a membranas y presentan determinantes antigénicos,
en cambio en los virus desnudos el tropismo está determinado en su cápside.
Todos los virus van a tener en su cápside o en su envoltura, dependiendo si son virus desnudos
o envueltos, proteínas específicas que les van a permitir adherirse a receptores celulares que
van a permitir la entrada del virus a la célula.
Virus desnudos:
Rotavirus: Es un virus con gran importancia por la producción de diarrea en menores de dos
años, pero que gracias a la incorporación de la vacuna ha disminuido su impacto en la salud
pública. Posee en su interior una partícula viral con material de tipo ARN segmentado, lo que
aumenta su capacidad de generar diversidad. Presenta triple cápside icosaédrica (interna,
media y externa) la cual expresa en su porción externa proteínas como la VP4 o VP7, lo que le
permite al virus interaccionar con receptores celulares.
Picornavirus: Virus desnudo con ARN monocatenario y de polaridad positiva. Dentro de este
grupo, encontramos virus de gran importancia en medicina, como los enterovirus: virus del
polio.
Virus envueltos:
La envoltura es una membrana
fosfolipidica que deriva de la célula que
infectó.
HIV: Su genoma está compuesto por dos hebras casi idénticas de genoma de tipo ARN doble
cadena, asociado al cual se encuentra la enzima transcriptasa inversa, esencial para la
replicación viral. Protegiendo el genoma se presenta una cápside icosaédrica constituida por la
proteína p24. Por fuera de la cápside, se presenta la envoltura nuclear que presenta
glicoproteínas, como la Gp120 y la Gp41. Entre la cápside y la envoltura se encuentra la matrix.
Virus influenza: Genoma tipo RNA, simple cadena, segmentado, que codifica para
neuroaminidasa, hemaglutinina, etc. La cápside en este tipo de virus es de tipo helicoidal,
donde las proteínas rodean a cada uno de los segmentos del genoma constituyendo las
ribonucleo-proteinas. En la envoltura viral se hayan insertas proteínas como la neuroaminidasa
y la hemaglutinina.
Genoma
Genoma puede ser ADN o ARN. Simple o doble cadena.
Lo común es que presenten ADN dc o ARN sc, pero hay excepciones por ejemplo,
Un genoma ADN con “polaridad” es el de HBV. Este virus presenta dos cadenas de ADN,
una cadena larga y una cadena corta, se dice que la cadena larga tiene polaridad negativa y
la corta positiva por convención.
Que el tipo de genoma sea ADN o ARN es de gran importancia debido a la probabilidad de
errores de las polimerasas involucradas en su replicación. Sin embargo, no todos los virus ARN
son igualmente variables, va a depender de su capacidad para fijar esos cambios.
PROTEÍNAS NO ESTRUCTURALES (NS o NSP) son aquellas codificadas por el genoma viral,
requeridas para la replicación, pero no están en el virión. Aquellas que solo se expresan al
infectarse una célula, como puede ser el caso de una enzima.
Pr no estructuras NS1 del virus Dengue puede ser usada como blanco para su pesquisa
diagnostica, además de ser responsable del tropismo del virus y de su patogenicidad.
Por ejemplo, el virus HIV tiene en su envoltura las glicoproteinas virales gp120 y gp41, que se
unen a dos receptores celulares específicos, el CD4 y el CCR5.
Cuando una célula tiene un receptor específico para un virus decimos que es susceptible, sin
embargo, esto no significa que al realizar la infección se produzca progenie viral. Es decir, es
susceptible pero no permisivo.
Susceptibilidad: propiedad celular de expresar receptores para permitir el ingreso del virus a
la célula.
Una célula es permisiva si tiene todos los factores celulares requeridos para completar una
infección productiva. Una infección productiva es aquella que culmina con la producción de
partículas virales, las que cuando son infectantes reciben el nombre de viriones.
Tipos de polimerasas:
- ADNpol ADN dependiente Usada por virus ADN, excepto Herpes, Adenocirus,
Poxvirus.
- ARN polimerasas ARN dependientes Utilizadas por los virus ARN.
- Retrovirus y pararetrovirus usan una polimerasa que es ADNpolimerasa, ARN
dependiente.
La transcriptasa inversa que usa HIV tiene varias funciones: ADN polimerasa dependiente de
ARN, ADN polimerasa dependiente de ADN y ribonucleasa. Esto le permite generar una hebra
de ADN a partir de ARN y luego otra hebra de ADN a partir del ADN anterior, para formar ADN
dc.
¿Todos los virus que ingresan al núcleo deben integrar su genoma al celular para replicarse?
HIV hace parte de su ciclo de replicación en el núcleo y se integra al genoma celular, pero no
todos los virus que ingresan al núcleo requieren integrar su genoma al de la célula. Por
ejemplo, el virus HBV no necesita integrarse al genoma celular para replicar. Además no todos
los virus que se integran al genoma necesitan una integrasa viral.
Hay virus que usan las polimerasas celulares como es el caso de algunos virus ADN, pero
también de algunos virus ARN como es el caso del HDV (que tampoco es un virus en sí mismo,
sino que es un viroide porque requiere coinfectar con HBV).
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En los virus de tipo ARN em general la síntesis del ARNm es catalizada por una ARN polimerasa
II celular, mientras que la replicación del ADN viral está a cargo de una ADN polimerasa propia
de ambos virus. Como la ARN polimerasa II está ubicada en el núcleo, el virus debe viajar al
mismo para replicar (a excepción de Pox donde todo el proceso ocurre en el citoplasma).
Virus HPV y Parvovirus (eritrovirus) B19 pueden replicar su genoma a pesar de carecer de
polimerasas propias debido a que usan polimerasas celulares. Sin embargo, la familia
Parviviridae (de la que pertenecen Parvovirus B19 y Bocavirus) presenta un genoma muy
pequeño, por lo que no puede regular el inicio de su replicación y necesita si o si replicar en
células que estén en división activa (como es el linaje eritroide).
Variabilidad genética
Recombinación: Es necesaria la coinfección de una misma célula de dos virus que
tengan variaciones en su genoma. Durante el evento de transcripción se puede copiar
una parte del genoma de una variante viral roja y otra parte del genoma de la variante
viral de color azul. Esto produce un genoma recombinante con una porción roja y azul.
Esto tiene importancia en la infección por HIV, que presenta variantes BF (una parte de
su genoma corresponde a una variante B y otra parte de su genoma corresponde a una
variante F).
En general en los virus de ADN, como Adenovirus, Herpesvirus y Pox, la recombinación
se da entre regiones con alta homología y los eventos de recombinación ocurren en
simultáneo con la replicación. En el caso de los virus ARN la recombinación se produce
porque la ARN polimerasa salta de un molde a otro, generando una molécula que
tiene parte de ambos genomas Eventos de copy-choice (elección de copia) y stand
displacement (desplazamiento de cadenas) de la transcriptasa inversa.
Estos eventos suceden en virus que poseen una transcriptasa inversa como HIV y HBV
y en muchos genomas con ARN polimerasas ARN dependientes y genomas ARN de
polaridad +, tales como algunos enterovirus, rinovirus o HCV (infrecuente), o de
polaridad – segmentados; Raramente en virus no segmentados.
Estas variantes que se generan en
un individuo coinfectado son
capaces de ser transmitidas, y de
esta forma, estas variantes son
capaces de ser diseminadas en la
población.
Si bien el del ejemplo es un virus
con genoma de tipo ARN, esto
también puede observarse en virus
con genoma de tipo ADN.
Reasociación, para que se produzca se requiere que una misma célula sea coinfectada
con dos variantes virales con genomas segmentados. Solo se han descripto
reasociaciones en genomas de tipo ARN, debido a que no se han identificado virus con
genoma ADN segmentado. Ambos genomas se van a replicar en la célula infectada y
en el momento del empaquetamiento (cuando se empaquetan los virus pueden
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Infección productiva: Ciclo de replicación completo con producción de progenie viral. Para
ello, el virus debe ingresar en células susceptibles y además permisivas.
Infección abortiva: El virus infecta una célula susceptible pero no completa su ciclo de
replicación por carecer de algún gen viral esencial o celular no expresado.
No necesariamente es benigna para la célula, por ejemplo, en el HIV las células que no son
permisivas y generan una infección abortiva mueren por la acumulación de ADN
retrotranscripto en el citoplasma que lleva a la activación del inflamasoma y la caspasa viral.
No puede completar su ciclo de replicación y no se produce progenie viral con capacidad
infectiva.
La infección abortiva no es lo mismo que la fase de latencia viral, debido a que en estos casos
el impedimento para completar su ciclo de replicación es reversible.
Definiciones:
Cuasiespecies: Variantes genéticas que están cercanamente relacionadas y que son viables.
Sometidas a un proceso continuo de variación genética, competencia y selección. Poseen un
alto porcentaje de similitud, mayor al 90%. Esto está asociado a que los eventos de replicación
presentan baja fidelidad.
Genotipos: Variantes que tienen diferencias sustanciales en la secuencia del genoma viral.
Heterogeneidad genética que les brinda un porcentaje de similitud menor al de las
cuasiespecies.
Por ejemplo, para el virus de la hepatitis C se han descripto hasta el momento 7 genotipos, que
deben identificarse comprando la secuencia nucleotidica.
Los virus con muchas variables genéticas son virus con alta variabilidad, mientras que los virus
con muchas variables serotipicas con virus con alta diversidad, como por ejemplo Adenovirus.
Modo de transmisión
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Transmisión por vía aérea: Virus influenza, VSR, Sarampión, rinovirus, adenovirus,
coronavirus. Individuos pueden inhalar las gotas respiratorias o por medio de fómites
(vectores pasivos). El tamaño de las gotas tiene relevancia por ejemplo, las gotas mayores a 5
micrones son diseminadas a menos de un metro (influenza); al toser o estornudar, pueden
transmitirse gotas más pequeñas, llamadas aerosoles (microgotas de Flugge), que pueden
diseminarse a mayores distancias y mantenerse en el ambiente por mayor cantidad de tiempo.
Transmisión sexual: Si bien la transmisión se produce a través de las células del epitelio
genital, las células que intervienen varían. En el caso del HIV intervienen las células de
Langerhans, al igual que en el HPV. En el caso del virus herpes humano 2 tenemos a las células
neuronales.
Transmisión vertical: CMV (primera causa de microcefalia congénita), virus rubeola, parvovirus
B19, virus Zika, virus hepatitis B y HIV.
Algunos virus pueden transmitirse por mordedura de un animal, como es el caso del virus
Rabia.
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Arbovirus: virus transmitidos por artrópodos, como mosquitos (Virus del nilo occidental,
fiebre amarilla, dengue, zika y chicungunya).
Infección localizada: Por ejemplo, en el caso del Rinovirus, el agente ingresa por vía aérea,
hace una infección localizada en el aparato respiratorio, para ser luego, eliminado por vía
aérea.
La progenie viral que se libera infecta células adyacentes, desde el sitio primario de
replicación. Esto es debido a que la progenie viral va a salir desde la cara apical de las células
polarizadas.
Infección diseminada: En el caso del Sarampión, este virus también ingresa por vía aérea y
produce una infección diseminada, ya que es capaz de infectar células distantes del sitio de
infección.
Vías de diseminación: hemática. Por ejemplo el virus Chikungunya puede diseminarse por vía
hemática alcanzando diversos órganos. Otro ejemplo de infección diseminada es parotiditis.
Hemática/neural: Les permite atravesar la BHE. Por ejemplo infección de células de la BHE (p.
ej. el virus polio), por la infección local generando un aumento de la permeabilidad por
medio de las uniones estrechas (p. ej. en el caso del virus del nilo occidental) o atravesando
por medio de monocitos infectados –metodo caballo de troya- como es el caso del HIV.
Diseminación axonal, puede ser retrograda (rabia o poliovirus) o transporte de tipo
retrogrado y anterógrado (para herpes simple y varicela zoster).
Sin embargo, los virus también pueden causar daño indirecto, productos de la respuesta
inmune que se genera en el hospedero infectado. Como son el caso de la miocarditis por
Coxsackie B (componente inflamatorio en miocardio con infiltrado linfoplsmocitario, sumado
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al daño directo asociado a la proteasa 2 A), la hepatitis por HBV y las Crioglobulinemias en HCV
y HBV.
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Las viroporinas son proteínas que se anclan a la bicapa lipídica de la membrana celular
formando un poro en ella.
Ejemplos:
Formación de Sincicios:
VSR y Parainfluenza 3 estan asociados a la interacción de las proteínas F con una proteína
celular PhoA con actividad GTPasa que facilita la formación de sincicios.
- Agudas Autolimitadas
- Crónicas:
1. Latentes virus deja de replicar, pero puede reactivarse y volver a replicar (como
por ejemplo la Familia Herpesviridae).
2. Persistentes El virus replica constantemente (HCV, HBV, HIV y HTLV).
3. Transformante Inmortalización celular. Puede ser por integración del ADN, pero
no es exclusivo, como también puede ser por HCV, donde la transformación se da
por inflamación o por las proteínas virales que interactúan con factores de
transcripción.
La activación de los RRP produce la activación de los factores de transcripción NFkB, IRS3 y
ATF2. Al interactuar con receptores específicos, los interferones activan complejos de
traductores de señales y activadores de transcripción, los Stat son factores de transcripción
que regulan la activación de ciertos genes dentro del sistema inmune. Esto inicia la vía clásica
de señalización, conocida como JAK-STAT, se produce un complejo STAT-IRF9, y se unen a
elementos de respuesta estimulados por INF (IRSE), presentes en los promotores de ciertos
genes.
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Proteínas efectoras del interferón (aquellas reguladas por IRSE) Induce la apoptosis en la
célula infectada, a partir de inhibir la síntesis de proteínas (esto también determina la
interrupción de la síntesis de progenie viral), activación de ARNasas que degradan el ARN,
aumentan la expresión de CMH clase I (estimulando la presentación de proteínas virales por
medio del CMH y desencadenando la respuesta inmune adaptativa).
Algunos virus inhiben a las proteínas efectoras del infterferon, como es el caso de Adenovirus
que inhibe a PKR, permitiendo que continúe su síntesis proteica.
Medio axenico
Un cultivo axénico está formado por una única especie, cepa o variedad de organismo, y por lo
tanto está desprovisto de otros organismos contaminantes. Los cultivos axénicos son muy
extraños en la naturaleza. En los medios naturales como el suelo, agua, o en el cuerpo
humano, existen cultivos mixtos que consisten en muchas y diferentes especies de forma
conjunta. Un cultivo axénico se obtiene artificialmente en un laboratorio.
Tener un cultivo axénico permite facilitar el estudio de ciertos microorganismos. Sin embargo,
presenta dificultades al no considerar los cambios fisiológicos y morfológicos que pueden
tener estos organismos al no encontrarse en su cultivo natural.
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Teórico 1
Oubiña.
Los virus no solo infectan al hombre, también a otras especies, incluso a bacterias
(bacteriófagos).
Dentro de nuestro genoma tenemos genomas virales endógenos en nuestro propio ADN
cromosómico, secuencias virales que se insertaron en nuestro propio genoma (constituyen el
8% del total del ADN).
CONCEPTOS:
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En el caso de HEV, se observan las dos estructuras del virus, el virión y la partícula virus-símil
(se generan cuando los decémeros de la proteína de la cápside carecen del extremo N-
terminal), la cual a pesar de tener una alta similitud antigénica, la misma no infecta. Estas
partículas son de gran ayuda para la elaboración de vacunas.
- Viroide: Partícula subviral, necesitan coinfectar células para poder completar el ciclo
de replicación, como es el caso de HDV que requiere de la coinfección con HBV.
- Prión: Proteína infecciosa (carente de ácidos nucleicos, solo presentan proteínas) con
disposición aberrante, estas producen patología debido al depósito anómalo
Producen encefalopatía (Enfermedad de Creutzfeld Jakob).
Corresponden a la expresión celular anómala del gen PRNP, la proteína del prión
está ubicada en la superficie celular, corresponden a la transformación de una alfa-
helice en una lamina plegada con conformación beta a partir de mutaciones en el
gen codificante NO SE REPLICAN, PERO PUEDEN PROPAGARSE AL INDUCIR LA
MODIFICACIÓN DE LAS PROTEINAS VECINAS.
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Viroma humano: Son aquellos virus que habían el organismo, está conformada por virus
humanos y bacteriófagos (aquellos virus que infectan a las bacterias del organismo). Hay virus
que están integrados en el genoma humano.
-Viroma humano.
- Genotipo G de HBV.
-Virus oncoliticos que inducen una respuesta inmune antiviral y antitumoral que promueven la
remisión del tumor y una memoria inmune de larga data.
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Síntesis:
- Los virus son partículas inertes en el extracelular, pero conforman una nueva unidad
estructural al invadir células: la célula infectada.
- La estructura y composición molecular de los virus influye en su viabilidad, tropismo,
sitio de replicación celular, variabilidad (cambios fonotipicos), diversidad (cambios
genotípicos), patogenicidad y virulencia.
- Los virus son “prisioneros de guerra” del hospedador en su evolución coadaptativa al
analizarse durante períodos prolongados (miles de años).
- El viroma humano es dinámico y característico de cada individuo en un momento
determinado, pudiendo modular la genética así como la magnitud y naturaleza de la
respuesta inmune del hospedador.
- Existen vacunas profilácticas en uso que están modificando el viroma universal, y
otras en urgente desarrollo para el tratamiento (vacunas “terapéuticas”) o la
prevención de enfermedades humanas virales y no virales.
- Se evalúa la potencial utilización de bacteriófagos para el control de la multi-
resistencia bacteriana a los antibióticos y la homeostasis de la flora intestinal, así como
el uso de algunos virus en la modulación de otras infecciones virales específicas.