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ASIGNATURA: BIOQUIMICA
TALLER DE INTRODUCCIÓN AL CURSO DE BIOQUIMICA.
Para iniciar este curso es importante que cada estudiante recuerde y estudie los siguientes
conceptos, los cuales fueron socializados durante sus cursos anteriores.
Los alcanos son compuestos que están formados por carbono e hidrógeno unidos por
medio de enlaces simples. Son hidrocarburos, es decir, compuestos que solo contienen
átomos de hidrógeno y carbono. El metano es el hidrocarburo saturado de cadena más
corta que existe. Su fórmula química es CH4, en la que cada uno de los átomos de
hidrógeno está unido a un átomo de carbono a través de un enlace covalente.
Los alquenos son hidrocarburos insaturados que tienen doble enlace carbono-carbono
en su molécula. Se puede decir que un alqueno es un alcano que ha perdido dos átomos
de hidrógeno produciendo como resultado un enlace doble entre dos carbonos. El eteno,
es un compuesto que controla el crecimiento de las plantas, la germinación de las
semillas y la maduración de los frutos.
Los alquinos son hidrocarburos que contienen enlaces triples carbono-carbono. Son
poco solubles en agua, tienen una baja densidad y presentan bajos puntos de ebullición.
Sin embargo, los alquinos son más polares debido a la mayor atracción que ejerce un
carbono sp sobre los electrones, comparado con un carbono sp3 o sp2. o etino es el
alquino más sencillo. Es un gas, altamente inflamable, un poco más ligero que el aire e
incoloro. Produce una de las temperaturas de llama adiabática más altas.
3. Recordar que es un grupo funcional y cual son los principales grupos funcionales,
escriba sus estructuras y anote un ejemplo para cada grupo funcional.
Nomenclatura
Se nombran añadiendo la terminación –ol al hidrocarburo correspondiente.
El grupo alcohol tiene preferencia sobre las insaturaciones. La cadena, por tanto,
se numera de forma que los grupos -OH tengan los números más bajos posibles.
La posición del grupo -OH se indica (si es necesario) mediante un localizador. Los
localizadores se colocan inmediatamente antes de la terminación característica del
compuesto (-ol).
Cuando en la molécula hay grupos con prioridad (aldehidos, ácidos...) el grupo
OH se nombra como sustituyente con la palabra HIDROXI
Grupo funcional: R -O-R' (éter).
En los éteres un átomo de oxígeno enlaza dos radicales de alquilo: R-O-R' Los
éteres se pueden considerar derivados de los hidrocarburos por sustitución de un
hidrógeno por el radical -O-R (alcoxi), o bien derivados de los alcoholes si
consideramos que el hidrógeno del grupo hidroxilo se ha sustituido por un radical
de alquilo. Si los dos radicales de alquilo son iguales se dice que el éter es simétrico
y si son diferentes, asimétrico.
Nomenclatura
La IUPAC considera los éteres como alcanos con un sustituyente alcoxi. Como
estructura fundamental se considera al alcano más complejo.
Se nombran los radicales (por orden alfabético) unidos al átomo de oxígeno
seguidos de la palabra éter.
Aldehídos
En los aldehídos el grupo carbonilo se encuentra en un carbono primario:
Nomenclatura:
Los aldehídos tienen preferencia sobre cetonas, alcoholes, éteres e insaturaciones,
por lo que la
cadena se empieza a numerar por el extremo en que se encuentra el grupo carbonilo.
Se nombran cambiando la terminación del hidrocarburo por –AL
Cundo el grupo –CHO se encuentra unido a un ciclo se nombra con el nombre el
ciclo y la palabra carbaldehido.
Cetonas
La función ácido se caracteriza por la relativa facilidad con la que el hidrógeno del
grupo carboxilo (hidrógeno ácido) puede ser sustituido por metales para formar
sales o por radicales de alquilo para formar ésteres.
Nomenclatura:
Los ácidos tienen preferencia sobre todas las funciones orgánicas por lo que la
cadena se empieza a numerar por el extremo en que se encuentra el grupo carboxilo.
Se nombran con la palabra ácido y cambiando la terminación del hidrocarburo por
- OICO o por – ICO
Si la función ácido se localiza en un ciclo, o existen varios grupos ácido en una
molécula, se pueden considerar a los grupos carboxílicos como sustituyentes del
hidrocarburo, nombrándolos con la palabra CARBOXÍLICO.
Las sales de los ácidos orgánicos resultan de la sustitución del hidrógeno ácido (el
del grupo carboxílico) por un metal. Se nombran cambiando la terminación ICO del
ácido por ATO, característica de las sales.
Si las consideramos derivados del amoniaco se nombran con el nombre del radical
de alquilo y la palabra AMINA (admitido por la IUPAC):
Cualquier función oxigenada tiene preferencia sobre las aminas (por ejemplo, los
ácidos). Cuando la función amina está como radical se nombran como AMINO.
Considerando que los ácidos carboxílicos pueden obtenerse a partir de los nitrilos
por hidrólisis (RCN + H2O R-COOH) los nitrilos se pueden nombrar cambiando la
terminación ico del ácido de igual número de átomos de carbono (incluyendo el del
grupo CN) por NITRILO.
Solo los ácidos y sus derivados tienen preferencia sobre los nitrilos. Cuando el
grupo nitrilo se nombra como sustituyente se nombra como CIANO
Una fórmula molecular es una representación de una molécula que utiliza símbolos
químicos para indicar los tipos de átomos seguidos de subíndices para mostrar el
número de átomos de cada tipo en la molécula.
C₆₃H₈₈CoN₁₄O₁₄P
La fórmula estructural de un compuesto químico es una representación gráfica de la
estructura molecular, que muestra cómo se ordenan o distribuyen espacialmente los
átomos. Se muestran los enlaces químicos dentro de la molécula, ya sea
explícitamente o implícitamente.
Formula estructural de la vitamina B12
5. Elabore una lista de los diferentes tipos de enlaces químicos que pueden existir en
química, represéntelos a través de un ejemplo para C/U con estructuras.
Covalente: ocurre cuando los átomos no metálicos comparten electrones. En este
tipo de enlace, los electrones se mueven entre los átomos dando origen a los enlaces
covalentes polares (cuando comparten electrones de forma no equitativa) y apolares
(cuando se distribuye equitativamente la cantidad de electrones).
Ejemplo: el agua (H2O), formada por dos átomos de hidrógeno y uno de oxígeno, y
cuyo enlace viene dado porque cada átomo de hidrógeno comparte un átomo de
oxígeno.
Todos los elementos metálicos puros están conformados por enlaces metálicos,
por ejemplo: oro (Au), hierro (Fe), aluminio (Al), etc.
6. ¿Qué quiere decir el termino Polar y Apolar? Escriba la estructura del H2O.
En una molécula de agua el enlace que une al oxígeno con cada hidrógeno es un
enlace polar. El oxígeno es un átomo mucho más electronegativo que el hidrógeno,
por lo que el oxígeno del agua tiene una carga parcialmente negativa (tiene una
densidad de electrones alta), mientras que los hidrógenos llevan cargas parcialmente
positivas (tienen una densidad electrónica baja).
En general, la electronegatividad relativa de los dos átomos en un enlace, es decir su
tendencia a acaparar los electrones compartidos, determinará si el enlace es polar o
no polar. Siempre que un elemento sea significativamente más electronegativo que
otro, el enlace entre ellos será polar; esto significa que uno de sus extremos tendrá
una carga ligeramente positiva y el otro una carga ligeramente negativa.
7. Cómo definiría el concepto de pH, que quiere decir pH ácido y básico. Cuál es su
pH fisiológico. ¿Por qué a menor pH, la solución es más ácida?
9. Que es para usted una propiedad física y una propiedad química, para una sustancia
o molécula.
10. ¿Cuál son las principales biomoléculas? Describa sus principales características
químicas.
https://prezi.com/p/c23mdduaf-vu/los-alquenos-en-la-vida-cotidiana/
https://www.caracteristicas.pro/alcanos/
https://concepto.de/ph/#ixzz7w89ZEMKK
https://prtr-es.es/CH4-metano,15588,11,2007.html#:~:text=El%20metano%20es%20el
%20hidrocarburo,trav%C3%A9s%20de%20un%20enlace%20covalente.
https://humanidades.com/atomo-de-carbono/
https://ciencia.lasalle.edu.co/ova_ciencias_basicas/12/
https://fisquiweb.es/Apuntes/Apuntes2Qui/Organica2.pdf
TALLER No.2.
Este taller ha sido diseñado, para que al desarrollarlo, el estudiante adquiera destrezas y
forme los siguientes conceptos:
1)
Aminoácidos
Criterios para la clasificación de los aminoácidos
Características de los aminoácidos
Comportamiento de los aminoácidos según el medio donde se encuentren
Importancia biológica de los aminoácidos.
Para poder desarrollar adecuadamente este taller usted debe leer cuidadosamente el tema
sobre aminoácidos en libros de Bioquímica (Bioquímica de Horton; o de Bohinski; o de
Salisbury & Ross, entre otros.
Concepto: Todos los aminoácidos que forman parte de las proteínas poseen ciertas
características comunes.
2) Mencione las características generales de los aminoácidos PROTÉICOS y sus
propiedades biológicas y químicas.
A los aminoácidos proteicos se les caracteriza como tales debido a que de toda la serie de
aminoácidos existentes ellos son los únicos que conforman a las proteínas. Uno de las
características destacables de los aminoácidos es que para cada uno de ellos existe unos o
más codones específicos que los codifican en la traducción genética, en términos más claros
esto significa que la información genética para la fabricación de aminoácidos se almacena
en secuencias de tres moléculas pequeñas llamadas nucleótidos quienes conforman la
estructura de los ácidos nucleicos ADN y ARN dicha secuencia es la que se denomina
codón en el ARNm. Cada codón representa a cada uno de los 20 aminoácidos empleados en
el ensamble de proteínas de modo que la información contenida allí le sirve a las células
comí instrucciones de construcción proteica. Es como si un nucleótido contuviera
ingredientes que se complementan con los de otro nucleótido formando un codón que
finalmente permite formar un aminoácido.
Los aminoácidos proteicos comparten la característica de poseer una estructura muy similar
ya que todos tienen el carbono alfa ala que están unidas cuatro sustituyentes como los son
NH2 y COOH el H y el grupo radical R grupo que diferencia a un aminoácido de otro.
Propiedades biológicas
Los aminoácidos proteicos cumples diversas funciones dentro de los organismos vivos
algunas de las cuales son intervenir en el sistema nervioso como neurotransmisor apoyar el
crecimiento o sufrir modificaciones químicas para producir otras moléculas que cumplen
funciones de neurotransmisores, hormonas que regulan el metabolismo de los mamíferos.
Propiedades químicas
Todos los aminoácidos presentan isómeros que difieren en su orientación espacial, tienen
un carbono quiral y por tanto pueden ocupar diversas posiciones en el espacio excepto la
glicina, son solubles en solventes polares cómo agua y etanol e insoluble en solventes
apolares como benceno hexano y éter, todos los aminoácidos presentan en solución acuosa
propiedades tanto ácido como base llamándose anfóteros o anfolitos, forman un enlace
peptídico enlace que se establece entre el extremo alfa-carboxilo de un aminoácido y el
extremo alfa-amida del siguiente, poseen capacidad de comportarse como amortiguadores
de pH
3) Observe en su texto la estructura química de los aminoácidos describa las semejanzas
que hay entre ellos.
Están constituidos por un carbono alfa al cual se unen un grupo funcional amino, uno
carboxilo, un hidrógeno y un grupo R o lateral
4) Concepto: Los aminoácidos se clasifican de acuerdo con la polaridad del radical. Qué
quiere decir que la molécula sea polar?
Que su cadena lateral tiene grupos hidrófilos con los que puede formar puentes de
hidrógeno con moléculas polares, por lo que son solubles en agua.
8) Escriba la nomenclatura para los aminoácidos que forman parte de las proteínas.
Los aminoácidos tienen dos sistemas de nomenclatura:
1. El clásico sistema de tres letras, que permite la representación de la estructura primaria de
una proteína mediante el enlace de cada triplete de letras mediante guiones, disponiendo a la izquierda
el aminoácido N-terminal y a la derecha el aminoácido C-terminal. Por ejemplo:
Ala-Glu-Gly-Phe- ... -Tyr-Asp-Gly
Representa la estructura primaria de una proteína cuyo aminoácido N-terminal es alanina (Ala) y
cuyo aminoácido C-terminal es glicina (Gly).
2. El actual sistema de una sola letra, impuesto en genética molecular e imprescindible para el uso
de bases de datos, que permite la representación de la estructura primaria de una proteína mediante
la disposición consecutiva de letras sin espacios ni signos intermedios, disponiendo a la izquierda
el aminoácido N-terminal y a la derecha el aminoácido C-terminal. Por ejemplo:
LSIMAG ... AYSSITH
Representa la estructura primaria de una proteína cuyo aminoácido N-terminal es leucina (L) y
cuyo aminoácido C-terminal es histidina (H).
His-imidazol Trp-indol
10) Los aminoácidos tienen diferentes funciones en las células: Describa la importancia
de estas moléculas y algunas de sus propiedades.
11) Los aminoácidos tienen un carácter ácido y básico por lo cual se denominan
ANFOTEROS. Teniendo en cuenta este concepto Explique con sus propias palabras el
concepto de Punto isoeléctrico o pH isoeléctrico.
12) Determine el punto Isoeléctrico para la Histidina, Arginina y acido aspártico. Realice
las respectivas ionizaciones para c/aminoácido y las respectivas curvas de titulación.