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UNIVERSIDAD DE CÓRDOBA

ASIGNATURA: BIOQUIMICA
TALLER DE INTRODUCCIÓN AL CURSO DE BIOQUIMICA.

Para iniciar este curso es importante que cada estudiante recuerde y estudie los siguientes
conceptos, los cuales fueron socializados durante sus cursos anteriores.

1. Describa el átomo de Carbono, con relación a su número atómico, electrones de


valencia; ¿cuántos enlaces puede formar? Dibuje el átomo de C, con niveles de E.

Su número atómico es 6 y su masa atómica es 12. Esto significa que tiene en su


núcleo 6 protones y 6 neutrones en su configuración estable, y que el núcleo está
rodeado por 6 electrones. Esos electrones se distribuyen según la siguiente
configuración electrónica: dos en su primer nivel de energía (que tiene un orbital s)
y cuatro en su segundo nivel de energía (que tiene los orbitales s y p), esto se
representa como 1s2 2s22p2.
Es tetravalente. Esto significa que tiene 4 electrones orbitando en su último nivel de
energía, que se pueden combinar con los electrones más externos de otros átomos, a
menudo también de carbono, formando enlaces covalentes. Esto significa que el
carbono puede formar cuatro enlaces químicos.

2. Describa por que se caracterizan los compuestos llamados alcanos, alquenos,


alquinos y aromáticos, escriba ejemplos de cada uno (estructura química).

Los alcanos son compuestos que están formados por carbono e hidrógeno unidos por
medio de enlaces simples. Son hidrocarburos, es decir, compuestos que solo contienen
átomos de hidrógeno y carbono. El metano es el hidrocarburo saturado de cadena más
corta que existe. Su fórmula química es CH4, en la que cada uno de los átomos de
hidrógeno está unido a un átomo de carbono a través de un enlace covalente.

Los alquenos son hidrocarburos insaturados que tienen doble enlace carbono-carbono
en su molécula. Se puede decir que un alqueno es un alcano que ha perdido dos átomos
de hidrógeno produciendo como resultado un enlace doble entre dos carbonos. El eteno,
es un compuesto que controla el crecimiento de las plantas, la germinación de las
semillas y la maduración de los frutos.
Los alquinos son hidrocarburos que contienen enlaces triples carbono-carbono. Son
poco solubles en agua, tienen una baja densidad y presentan bajos puntos de ebullición.
Sin embargo, los alquinos son más polares debido a la mayor atracción que ejerce un
carbono sp sobre los electrones, comparado con un carbono sp3 o sp2. o etino es el
alquino más sencillo. Es un gas, altamente inflamable, un poco más ligero que el aire e
incoloro. Produce una de las temperaturas de llama adiabática más altas.

3. Recordar que es un grupo funcional y cual son los principales grupos funcionales,
escriba sus estructuras y anote un ejemplo para cada grupo funcional.

El grupo funcional es un átomo o conjunto de átomos unidos a una cadena


carbonada, representada en la fórmula general por R para los compuestos alifáticos
y como Ar compuestos aromáticos. Los grupos funcionales son responsables de la
reactividad y propiedades químicas de los compuestos orgánicos.

Grupo funcional: - OH (hidroxilo). Presentan isomería de posición


Los alcoholes resultan de la sustitución de uno o más átomos de hidrógeno de un
hidrocarburo por
grupos hidroxilo (-OH). Si la sustitución tiene lugar en un hidrocarburo alifático se
obtienen los alcoholes
propiamente dichos y si es aromático se obtienen los fenoles.
Los alcoholes se pueden clasificar en primarios, secundarios o terciarios en función
de que el grupo -OH se encuentre unido a un carbono primario, secundario o
terciario:

Nomenclatura
 Se nombran añadiendo la terminación –ol al hidrocarburo correspondiente.
 El grupo alcohol tiene preferencia sobre las insaturaciones. La cadena, por tanto,
se numera de forma que los grupos -OH tengan los números más bajos posibles.
 La posición del grupo -OH se indica (si es necesario) mediante un localizador. Los
localizadores se colocan inmediatamente antes de la terminación característica del
compuesto (-ol).
 Cuando en la molécula hay grupos con prioridad (aldehidos, ácidos...) el grupo
OH se nombra como sustituyente con la palabra HIDROXI
Grupo funcional: R -O-R' (éter).
En los éteres un átomo de oxígeno enlaza dos radicales de alquilo: R-O-R' Los
éteres se pueden considerar derivados de los hidrocarburos por sustitución de un
hidrógeno por el radical -O-R (alcoxi), o bien derivados de los alcoholes si
consideramos que el hidrógeno del grupo hidroxilo se ha sustituido por un radical
de alquilo. Si los dos radicales de alquilo son iguales se dice que el éter es simétrico
y si son diferentes, asimétrico.
Nomenclatura
 La IUPAC considera los éteres como alcanos con un sustituyente alcoxi. Como
estructura fundamental se considera al alcano más complejo.
 Se nombran los radicales (por orden alfabético) unidos al átomo de oxígeno
seguidos de la palabra éter.

Grupo funcional: (carbonilo).

El grupo carbonilo consta de un oxígeno unido mediante un doble enlace al


carbono. Puede estar situado en un carbono primario o en uno secundario.

Aldehídos
En los aldehídos el grupo carbonilo se encuentra en un carbono primario:
Nomenclatura:
 Los aldehídos tienen preferencia sobre cetonas, alcoholes, éteres e insaturaciones,
por lo que la
cadena se empieza a numerar por el extremo en que se encuentra el grupo carbonilo.
 Se nombran cambiando la terminación del hidrocarburo por –AL
 Cundo el grupo –CHO se encuentra unido a un ciclo se nombra con el nombre el
ciclo y la palabra carbaldehido.
Cetonas

En las cetonas el grupo carbonilo se encuentra en un carbono secundario:


Nomenclatura:
 Las cetonas tienen preferencia sobre alcoholes, éteres e instauraciones, por lo que
la cadena se numera de tal forma que el grupo carbonilo tenga el número más bajo
posible
 Se nombran cambiando la terminación del hidrocarburo por - ONA o nombrando
los radicales unidos al grupo carbonilo (por orden alfabético) seguidos de la palabra
CETONA.
 Cuando el grupo carbonilo está en una cadena y no es el grupo principal se
nombra como OXO

Grupo funcional: (carboxilo).

La función ácido se caracteriza por la relativa facilidad con la que el hidrógeno del
grupo carboxilo (hidrógeno ácido) puede ser sustituido por metales para formar
sales o por radicales de alquilo para formar ésteres.
Nomenclatura:
 Los ácidos tienen preferencia sobre todas las funciones orgánicas por lo que la
cadena se empieza a numerar por el extremo en que se encuentra el grupo carboxilo.
 Se nombran con la palabra ácido y cambiando la terminación del hidrocarburo por
- OICO o por – ICO
 Si la función ácido se localiza en un ciclo, o existen varios grupos ácido en una
molécula, se pueden considerar a los grupos carboxílicos como sustituyentes del
hidrocarburo, nombrándolos con la palabra CARBOXÍLICO.

Las sales de los ácidos orgánicos resultan de la sustitución del hidrógeno ácido (el
del grupo carboxílico) por un metal. Se nombran cambiando la terminación ICO del
ácido por ATO, característica de las sales.

Grupo funcional: Esteres


Los ésteres resultan al sustituir el hidrógeno ácido de los ácidos por un radical de
alquilo.
Nomenclatura:
 Se nombran cambiando la terminación ICO del ácido por ATO, seguido del
nombre del radical que sustituye al átomo de hidrógeno

Grupo funcional: Aminas


Las aminas pueden considerarse como derivados de los hidrocarburos al sustituir un
átomo de hidrógeno por el grupo –NH2 (amino). También pueden considerarse
derivados del amoniaco (NH3) al sustituir sus hidrógenos por radicales de alquilo.
Según el número de hidrógenos sustituidos podemos tener aminas primarias,
secundarias o terciarias:
Nomenclatura:
 Considerándolas derivados de los hidrocarburos, las aminas primarias se nombran
reemplazando la terminación o del alcano por AMINA (recomendación IUPAC).

 Si las consideramos derivados del amoniaco se nombran con el nombre del radical
de alquilo y la palabra AMINA (admitido por la IUPAC):

 Las aminas secundarias y terciarias se nombran tomando como amina el radical


más complejo y los otros, considerados sustituyentes, se nombran anteponiendo una
N- a los nombres de los radicales correspondientes. Si uno de los radicales es el
fenilo, en general, se toma la anilina como amina base.

 Cualquier función oxigenada tiene preferencia sobre las aminas (por ejemplo, los
ácidos). Cuando la función amina está como radical se nombran como AMINO.

Grupo funcional: Nitrilos


Los nitrilos o cianuros podemos considerarlos derivados del ácido cianhídrico
(HCN) al sustituir el H por radicales de alquilo (cianuros de alquilo) o como
derivados de los hidrocarburos al sustituir un átomo de hidrógeno por el grupo -CN
(ciano).
Nomenclatura:
Se pueden nombrar de tres formas distintas:  Como derivados de los hidrocarburos:
añadiendo la palabra NITRILO al nombre del hidrocarburo con igual número de
átomos de carbono (incluyendo el carbono del grupo CN)
 Como derivados del ácido cianhídrico (HCN): palabra cianuro seguida del nombre
del radical de alquilo que sustituye al hidrógeno ácido.

 Considerando que los ácidos carboxílicos pueden obtenerse a partir de los nitrilos
por hidrólisis (RCN + H2O R-COOH) los nitrilos se pueden nombrar cambiando la
terminación ico del ácido de igual número de átomos de carbono (incluyendo el del
grupo CN) por NITRILO.

 Solo los ácidos y sus derivados tienen preferencia sobre los nitrilos. Cuando el
grupo nitrilo se nombra como sustituyente se nombra como CIANO

Grupo funcional: Amidas


Las amidas se consideran derivados de los ácidos carboxílicos en los que se ha
sustituido el grupo OH del grupo carboxílico por un grupo -NH2
Nomenclatura:
 Se nombran cambiando la terminación oico o ico de los ácidos por AMIDA

4. ¿Puede usted proponer diferencias entre formula molecular y fórmula estructural?


Puede utilizar diferentes ejemplos, escriba las formulas estructurales.

Una fórmula molecular es una representación de una molécula que utiliza símbolos
químicos para indicar los tipos de átomos seguidos de subíndices para mostrar el
número de átomos de cada tipo en la molécula.
C₆₃H₈₈CoN₁₄O₁₄P
La fórmula estructural de un compuesto químico es una representación gráfica de la
estructura molecular, que muestra cómo se ordenan o distribuyen espacialmente los
átomos. Se muestran los enlaces químicos dentro de la molécula, ya sea
explícitamente o implícitamente.
Formula estructural de la vitamina B12
5. Elabore una lista de los diferentes tipos de enlaces químicos que pueden existir en
química, represéntelos a través de un ejemplo para C/U con estructuras.
Covalente: ocurre cuando los átomos no metálicos comparten electrones. En este
tipo de enlace, los electrones se mueven entre los átomos dando origen a los enlaces
covalentes polares (cuando comparten electrones de forma no equitativa) y apolares
(cuando se distribuye equitativamente la cantidad de electrones).
Ejemplo: el agua (H2O), formada por dos átomos de hidrógeno y uno de oxígeno, y
cuyo enlace viene dado porque cada átomo de hidrógeno comparte un átomo de
oxígeno.

Iónico: ocurre cuando existe una unión de átomos metálicos y no metálicos,


transfiriéndose una carga de electrones entre ellos. Como resultado, se forman iones
cargados tanto negativa (aniones) como positivamente (cationes) y se genera una
atracción entre sus cargas opuestas.
Ejemplo: el cloruro de sodio (NaCl), que combina un átomo de cloro y uno de
sodio; mientras el primero tiene siete electrones, el segundo tiene uno. A la hora de
formar el enlace iónico, el sodio cede su electrón al cloro y así se cumple la ley del
octeto.
Metálico: son aquellos que se forman entre átomos de metales, cuyos núcleos
atómicos se reúnen y están rodeados por sus electrones como una nube. Es un
tipo de enlace fuerte que se distribuye a manera de red.

Todos los elementos metálicos puros están conformados por enlaces metálicos,
por ejemplo: oro (Au), hierro (Fe), aluminio (Al), etc.

6. ¿Qué quiere decir el termino Polar y Apolar? Escriba la estructura del H2O.

En un enlace covalente polar, los electrones se comparten de forma no equitativa


entre los átomos y pasan más tiempo cerca de un átomo que del otro. Debido a la
distribución desigual de electrones entre los átomos de diferentes elementos,
aparecen cargas ligeramente positivas (δ+) y ligeramente negativas (δ–) en distintas
partes de la molécula.
Los enlaces covalentes no polares se forman entre dos átomos del mismo elemento
o entre átomos de diferentes elementos que comparten electrones de manera más o
menos equitativa. Por ejemplo, el oxígeno molecular (O2) no es polar porque los
electrones se comparten equitativamente entre los dos átomos de oxígeno.

En una molécula de agua el enlace que une al oxígeno con cada hidrógeno es un
enlace polar. El oxígeno es un átomo mucho más electronegativo que el hidrógeno,
por lo que el oxígeno del agua tiene una carga parcialmente negativa (tiene una
densidad de electrones alta), mientras que los hidrógenos llevan cargas parcialmente
positivas (tienen una densidad electrónica baja).
En general, la electronegatividad relativa de los dos átomos en un enlace, es decir su
tendencia a acaparar los electrones compartidos, determinará si el enlace es polar o
no polar. Siempre que un elemento sea significativamente más electronegativo que
otro, el enlace entre ellos será polar; esto significa que uno de sus extremos tendrá
una carga ligeramente positiva y el otro una carga ligeramente negativa.

7. Cómo definiría el concepto de pH, que quiere decir pH ácido y básico. Cuál es su
pH fisiológico. ¿Por qué a menor pH, la solución es más ácida?

El pH es una medida que sirve para establecer el nivel de acidez o alcalinidad de


una disolución. La “p” es por “potencial”, por eso el pH se llama: potencial de
hidrógeno. Se expresa como el logaritmo negativo de base 10 de la concentración de
iones hidrógeno.
Ácidos: son compuestos que contienen hidrógeno y pueden disolverse en el agua
liberando iones de hidrógeno a la solución. Por ejemplo, el ácido clorhídrico (HCl)
se disuelve en el agua de la siguiente manera: Bases: compuestos que se disuelven
en agua liberando iones hidroxilo (OH-) a la solución.
La escala de pH mide el grado de acidez de un objeto. Los objetos que no son muy
ácidos se llaman básicos. La escala tiene valores que van del cero (el valor más
ácido) al 14 (el más básico).
El pH fisiológico es un término que hace referencia al nivel de concentración de
acidez o alcalinidad en determinadas sustancias o elementos de un ser vivo, como la
piel o el plasma sanguíneo.
Para que exista un correcto funcionamiento de las células, tejidos, órganos y
organismos, son necesarios determinados niveles de pH (potencial de hidrógeno).
Se mide en una escala de 0 (ácido) a 14 (alcalino), siendo 7 el punto neutro. Por
ejemplo, se suele establecer que el pH del plasma sanguíneo se sitúa entre 7,37 y
7,43.

8. Que quiere decir punto de fusión y ebullición de una molécula.


El punto de ebullición y el punto de fusión son temperaturas a las que una sustancia
pasa de un estado a otro. En el caso del punto de fusión es el paso de una sustancia
del estado sólido al líquido, mientras que el punto de ebullición es la temperatura en
que una sustancia líquida pasa al estado gaseoso.

9. Que es para usted una propiedad física y una propiedad química, para una sustancia
o molécula.
10. ¿Cuál son las principales biomoléculas? Describa sus principales características
químicas.

Aminoácidos: conforman la base de las proteínas y participan en diversos procesos


biológicos. Por ejemplo: glutamina, cisteína, entre otras.
Glúcidos: también llamados carbohidratos, son una fuente de energía importante
para los seres vivos. Por ejemplo, glucosa, almidón, celulosa, entre otros.
Lípidos: se encargan de diversas funciones, entre la que destaca la reserva de
energías para el cuerpo. Se dividen en dos grupos, saponificables (ácidos grasos,
fosfolípidos, entre otros) e insaponificables (isoprenoides, esteroides).
Proteínas: participan en gran cantidad de procesos biológicos. Algunos ejemplos
son: enzimas, hormonas, anticuerpos, entre otros.
Ácidos nucleicos: proporcionan información biológica de vital importancia para el
funcionamiento de los organismos. Por ejemplo: ADN y ARN.
Vitaminas: se encargan del funcionamiento fisiológico. Algunos ejemplos son:
vitamina A, vitamina C, complejo vitamínico B, entre otros.

https://prezi.com/p/c23mdduaf-vu/los-alquenos-en-la-vida-cotidiana/
https://www.caracteristicas.pro/alcanos/
https://concepto.de/ph/#ixzz7w89ZEMKK
https://prtr-es.es/CH4-metano,15588,11,2007.html#:~:text=El%20metano%20es%20el
%20hidrocarburo,trav%C3%A9s%20de%20un%20enlace%20covalente.
https://humanidades.com/atomo-de-carbono/
https://ciencia.lasalle.edu.co/ova_ciencias_basicas/12/
https://fisquiweb.es/Apuntes/Apuntes2Qui/Organica2.pdf

TALLER No.2.
Este taller ha sido diseñado, para que al desarrollarlo, el estudiante adquiera destrezas y
forme los siguientes conceptos:
1)
 Aminoácidos
 Criterios para la clasificación de los aminoácidos
 Características de los aminoácidos
 Comportamiento de los aminoácidos según el medio donde se encuentren
 Importancia biológica de los aminoácidos.
Para poder desarrollar adecuadamente este taller usted debe leer cuidadosamente el tema
sobre aminoácidos en libros de Bioquímica (Bioquímica de Horton; o de Bohinski; o de
Salisbury & Ross, entre otros.

Concepto: Todos los aminoácidos que forman parte de las proteínas poseen ciertas
características comunes.
2) Mencione las características generales de los aminoácidos PROTÉICOS y sus
propiedades biológicas y químicas.
A los aminoácidos proteicos se les caracteriza como tales debido a que de toda la serie de
aminoácidos existentes ellos son los únicos que conforman a las proteínas. Uno de las
características destacables de los aminoácidos es que para cada uno de ellos existe unos o
más codones específicos que los codifican en la traducción genética, en términos más claros
esto significa que la información genética para la fabricación de aminoácidos se almacena
en secuencias de tres moléculas pequeñas llamadas nucleótidos quienes conforman la
estructura de los ácidos nucleicos ADN y ARN dicha secuencia es la que se denomina
codón en el ARNm. Cada codón representa a cada uno de los 20 aminoácidos empleados en
el ensamble de proteínas de modo que la información contenida allí le sirve a las células
comí instrucciones de construcción proteica. Es como si un nucleótido contuviera
ingredientes que se complementan con los de otro nucleótido formando un codón que
finalmente permite formar un aminoácido.
Los aminoácidos proteicos comparten la característica de poseer una estructura muy similar
ya que todos tienen el carbono alfa ala que están unidas cuatro sustituyentes como los son
NH2 y COOH el H y el grupo radical R grupo que diferencia a un aminoácido de otro.
Propiedades biológicas
Los aminoácidos proteicos cumples diversas funciones dentro de los organismos vivos
algunas de las cuales son intervenir en el sistema nervioso como neurotransmisor apoyar el
crecimiento o sufrir modificaciones químicas para producir otras moléculas que cumplen
funciones de neurotransmisores, hormonas que regulan el metabolismo de los mamíferos.

Propiedades químicas
Todos los aminoácidos presentan isómeros que difieren en su orientación espacial, tienen
un carbono quiral y por tanto pueden ocupar diversas posiciones en el espacio excepto la
glicina, son solubles en solventes polares cómo agua y etanol e insoluble en solventes
apolares como benceno hexano y éter, todos los aminoácidos presentan en solución acuosa
propiedades tanto ácido como base llamándose anfóteros o anfolitos, forman un enlace
peptídico enlace que se establece entre el extremo alfa-carboxilo de un aminoácido y el
extremo alfa-amida del siguiente, poseen capacidad de comportarse como amortiguadores
de pH
3) Observe en su texto la estructura química de los aminoácidos describa las semejanzas
que hay entre ellos.

Están constituidos por un carbono alfa al cual se unen un grupo funcional amino, uno
carboxilo, un hidrógeno y un grupo R o lateral

4) Concepto: Los aminoácidos se clasifican de acuerdo con la polaridad del radical. Qué
quiere decir que la molécula sea polar?

Que su cadena lateral tiene grupos hidrófilos con los que puede formar puentes de
hidrógeno con moléculas polares, por lo que son solubles en agua.

5) La estructura general de los aminoácidos que forman parte de las proteínas


es:-----------------------------------------, Escriba el nombre de los grupos funcionales que
forman su estructura.
Los aminoácidos están constituidos por un carbono alfa al cual se unen un grupo funcional
amino, uno carboxilo, un hidrógeno y un grupo R

6) Localice en su texto las estructuras de los siguientes aminoácidos:

1. Ala, Val, Leu, Phe, e Ile


2. Ser, Cis, Tre, Asp, Lis, Arg, Tir, His
Qué grupos funcionales y átomos forman parte de sus radicales?

7) Clasifique los 20 aminoácidos que normalmente se encuentran formando parte de


las proteínas, de acuerdo con sus propiedades químicas, biológicas, dependiendo de su
carácter polar, apolar, básico o ácido, utilice su texto para ver las estructuras.

Los nombres de los aminoácidos usualmente no hacen referencia a ninguna de sus


características estructurales, por ello es conveniente conocer su nomenclatura basada en la
representación de sus tres letras o de una sola letra.

8) Escriba la nomenclatura para los aminoácidos que forman parte de las proteínas.
Los aminoácidos tienen dos sistemas de nomenclatura:
1. El clásico sistema de tres letras, que permite la representación de la estructura primaria de
una proteína mediante el enlace de cada triplete de letras mediante guiones, disponiendo a la izquierda
el aminoácido N-terminal y a la derecha el aminoácido C-terminal. Por ejemplo:
Ala-Glu-Gly-Phe- ... -Tyr-Asp-Gly
Representa la estructura primaria de una proteína cuyo aminoácido N-terminal es alanina (Ala) y
cuyo aminoácido C-terminal es glicina (Gly).
2. El actual sistema de una sola letra, impuesto en genética molecular e imprescindible para el uso
de bases de datos, que permite la representación de la estructura primaria de una proteína mediante
la disposición consecutiva de letras sin espacios ni signos intermedios, disponiendo a la izquierda
el aminoácido N-terminal y a la derecha el aminoácido C-terminal. Por ejemplo:
LSIMAG ... AYSSITH
Representa la estructura primaria de una proteína cuyo aminoácido N-terminal es leucina (L) y
cuyo aminoácido C-terminal es histidina (H).

9) Algunos aminoácidos contienen grupos funcionales o heterocíclicos que se conocen con


nombres tradicionales, tales como los que se mencionan a continuación. Dibuje la
estructura química de los grupos pirrolidín, imidazol, indol y guanidino.
Prolina_pirrol; His_imidazol; Trp_indol y Arg_guanidino

Pidorrilín Imidazol Indol Guanidino Prolina-pirrol

His-imidazol Trp-indol
10) Los aminoácidos tienen diferentes funciones en las células: Describa la importancia
de estas moléculas y algunas de sus propiedades.

11) Los aminoácidos tienen un carácter ácido y básico por lo cual se denominan
ANFOTEROS. Teniendo en cuenta este concepto Explique con sus propias palabras el
concepto de Punto isoeléctrico o pH isoeléctrico.

Se denomina punto isoeléctrico de un aminoácido al pH al cual no tiene carga neta. En


otras palabras, es el pH al cual la cantidad de carga positiva de un aminoácido es
exactamente igual a la cantidad de carga negativa.

12) Determine el punto Isoeléctrico para la Histidina, Arginina y acido aspártico. Realice
las respectivas ionizaciones para c/aminoácido y las respectivas curvas de titulación.

Aminoácido Punto isoeléctrico


Histidina 7,58
Arginina 10,76
Acido aspártico 2,76

13) La reacción principal de los aminoácidos es la formación de un enlace peptídico, cómo


se forma el enlace peptídico, ejemplos. A partir de alanina, valina y serina, forme un
tripéptido.

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