Replicación del DNA

▪ Elija la respuesta correcta de esta lista. No es necesario usar todas las opciones.
a) helicasas
b) hebra rica en G
c) telómeros
d) topoisomerasas
e) DNA polimerasa
f) RNA polimerasa
g) molde
h) Holliday
i) Okazaki
1._______________ cataliza la adición de desoxirribonucleótidos al DNA.
2. La doble hebra de DNA se relaja para la replicación por acción de _______.
3. El DNA puede servir como un ____________ para dirigir la síntesis de la hebra complementaria de DNA o RNA.
4. Los pequeños fragmentos de DNA que se sintetizan en la cadena rezagada se denominan fragmentos de _____.
5. Las proteínas que usan la hidrólisis de ATP para separar el DNA durante la replicación se denominan _________.
6. Los extremos de los cromosomas se denominan _______________.
7. Una _______________ es crítica en la formación de un telómero.

▪ Rellene los espacios en blanco

8. La elongación de la hebra de DNA se produce en dirección ____________.
9. Las dos subunidades β de cada una de las dos abrazaderas de la DNA polimerasa actúan como una _______.
10. El cebador para la síntesis de DNA es sintetizado como una molécula de RNA por la enzima ____________.
11. La hebra de DNA que es replicada de forma continua se denomina hebra ________________.
12. La actividad correctora de la DNA polimerasa incrementa su precisión en un valor de ____________ veces.
13. Durante la replicación del DNA, los trozos de RNA (cebadores) son eliminados por la _____________.
14. La precisión de la DNA polimerasa depende de la formación adecuada de una __________________.
15. En E. coli, la proteína DnaA se une al __________________.

▪ Preguntas de elección múltiple

16. La tasa de error observada en la replicación es de:
A) 1 per 106 nucleótidos.
B) 1 per 104 nucleótidos.
C) 1 per 108 nucleótidos.
D) 1 per 1015 nucleótidos.
E) Ninguna de las anteriores.
17. ¿Qué requieren las DNA polimerasas para que comience la replicación?
A) DNA superenrollado.
B) DNA molde monocatenario.
C) Una hebra-cebador que elongar.
D) Todas las anteriores.
E) Ninguna de las anteriores.
18. La DNA polimerasa I:
A) Posee un sitio con actividad exonucleasa 3’→5’.
B) Posee un sitio con actividad exonucleasa 5’→3’.
C) Tiene una velocidad de síntesis de 1000 nt/s.
D) Tiene una alta procesividad.
E) A y B son ciertas.
19. ¿Qué es la girasa?
A) Una topoisomerasa II bacteriana
B) Una topoisomerase I bacteriana
C) Una helicasa bacteriana
D) Todas las anteriores
E) Ninguna de las anteriores
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20. La replicación se desplaza en sentido:
A) 5’ → 3’
B) 3’ → 5’
C) 5’ → 5’
D) 3’ → 3’
E) Ninguna de las anteriores
21. ¿Cómo se dicta la especificidad de la replicación?
A) Deben establecerse puentes de hidrógeno de Watson-Crick.
B) Las interacciones de la enzima con el DNA permiten determinar si las bases emparejadas se disponen en el espacio
correctamente.
C) El puente de hidrógeno se rompe y reconstituye para asegurar el posicionamiento preciso en cada par de bases.
D) A y B.
E) A, B, y C.
22. ¿Qué función realiza la helicasa durante la replicación?
A) Estabiliza la carga negativa del estado de transición.
B) Utiliza ATP para impulsar la separación de las hebras del DNA parental.
C) Añade superenrollamientos negativos al DNA.
D) A y C.
E) Ninguna de las anteriores.
23. ¿Cómo pueden las hebras guía y retrasada ser sintetizadas de manera coordinada?
A) Enzimas específicas controlan el tamaño del DNA abierto.
B) Las proteínas de unión a la hebra retasada (SSBP) inhiben la replicación de la hebra guía si las dos hebras monocatenarias
tienen tamaños desproporcionados.
C) La DNA polimerasa III es una holoenzima dimérica, y el lazo de la hebra rezagada permite a la enzima proceder en la misma
dirección con cada hebra.
D) Todas las anteriores.
E) Ninguna de las anteriores.
24. El extremo libre de los cromosomas eucarióticos forma una estructura de DNA única que permite su “completa” replicación.
Esta estructura implica unas secuencias ricas en G repetidas que forman:
A) Una horquilla de replicación.
B) Un gran bucle dúplex.
C) Un bucle superenrollado.
D) Un bucle de desplazamiento.
E) Ninguna de las anteriores.
25. El término procesividad:
A) indica la tasa de error de una DNA polimerasa.
B) es la deleción de una o más bases en el DNA.
C) es específicamente la velocidad de la replicación.
D) es la capacidad de catalizar muchas reacciones sin soltarse del sustrato.
E) A, B y C.
26. Los extremos de los cromosomas eucarióticos se denominan:
A) Sombreros pirimidínicos.
B) Telómeros.
C) Extremos ricos en G.
D) Extremos replicón.
E) Nínguna de las anteriores.
27. Las abrazaderas del DNA:
A) Están compuestas por dos subunidades β.
B) Forman un anillo alrededor de la parte delantera de la horquilla de replicación.
C) Permiten a la polimerasa desplazarse a lo largo de la molécula de DNA sin soltarse.
D) Todas las anteriores.
E) Ninguna de las anteriores.
28. La replicación de los telómeros requiere específicamente:
A) Una DNA polimerasa que sea RNA dependiente.
B) La adición de un sombrero de GC.
C) La presencia de un bucle en el extremo.
D) Una separación de las hebras de DNA por acción de una helicasa.
E) Ninguna de las anteriores.
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▪ Preguntas cortas
29. ¿Por qué son necesarias otras enzimas, además de la DNA polimerasa, para la replicación?
30. ¿Cómo se sellan las mellas en el ADN discontinuo durante la replicación?
31. ¿Cuáles son los requerimientos mínimos para la replicación del DNA?
32. ¿Cómo se logra la procesividad de la DNA polimerasa III?
33. ¿Cómo se mantienen las regiones monocatenarias del DNA?
34. Escriba la reacción química para la adición de un dNTP a una hebra de DNA en el exremo 3’:

Soluciones
1. (e)
2. (d)
3. (g)
4. (i)
5. (a)
6. (c)
7. (b)
8. 5’→3’
9. pinza deslizante
10. primasa
11. guía
12. 1000
13. DNA polimerasa I
14. pareja de bases Watson-Crick
15. origen de replicación (oriC)
16. (C)
17. (D)
18. (E)
19. (A)
20. (A)
21. (D)
22. (B)
23. (C)
24. (B)
25. (D)
26. (B)
27. (D)
28. (A)
29. El DNA es una molécula extremadamente estable con casi ninguna tendencia a separarse en cadenas individuales. Sin
embargo, las dos cadenas de DNA deben estar separadas para que se produzca la replicación. Se necesitan varias
enzimas adicionales para separar las dos cadenas del DNA antes de la replicación.
30. La DNA ligasa es la enzima que sella las mellas al crear un enlace fosfodiéster entre un grupo 3’-hidroxilo y un 5’-fosfato al
final de la otra pieza. Sólo puede sellar una ruptura en un fragmento de ADN bicatenario. Utiliza la energía proporcionada
por la hidrólisis de ATP (o NAD+) a AMP y PPi (o NMN).
31. La replicación del DNA requiere un molde de DNA; los cuatro desoxinucleósidos trifosfatos (dATP, dTTP, dGTP, dCTP
(dNTP)); un polinucleótido cebador con un 3’-OH libre; Mg++; y DNA polimerasa.
32. La estructura del complejo enzimático permite la procesividad de la reacción. La enzima es un gran complejo que forma un
anillo alrededor del polímero de ADN. Una subunidad específica (β) deja suficiente espacio para que el ADN recién
ensamblado se forme correctamente y actúa como una pinza deslizante de ADN.
33. Proteínas de unión a hebras monocatenarias (SSBP) se unen a regiones monocatenarias del DNA.
34. La respuesta debe indicar claramente cómo el oxígeno del grupo 3’-OH ataca al fosfato α en el dNTP entrante con el
desplazamiento del pirofosfato.