Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
CE TRAL
DEL ECUADOR
OBJETIVO GENERAL
■ Aplicar las técnicas de tamizaje y
diagnóstico genético a un nivel
productivo en casos clínicos con ética
y responsabilidad.
U lVER..<;\DJ\D
CENTRAL
oEL EctiADOR
INTRODUCCIÓN A LA
GENÉTICA
Dra. Lourdes Pazmiño
¿Qué es la Genética?
■ La Genética es la ciencia que estudia los fenómenos de la
herencia y la variación, es decir, los mecanismos de
transmisión de los caracteres biológicos de generación en
generación, y como los mismos son expresados en cada
generación.
Genética médica
■ Abarca cualquier aplicación de la genética al ejercicio de la medicina.
■ Incluye estudios:
El Padre de la Genética
■ Para 1915 los principios básicos de la genética mendeliana habían
sido aplicados a una amplia variedad de organismos, donde
destaca la mosca de la fruta (Drosophila melanogaster), Thomas
Hunt Morgan y sus compañeros «drosofilistas», los especialistas en
genética desarrollaron la teoría mendeliana-cromosómica de la
herencia, la cual fue ampliamente aceptada para 1925.
■ No fue hasta 1956 que se establecieron las bases de la Genética
Humana, en donde se confirmó el número de cromosomas de la
especie humana, 46 cromosomas
�
1
IJ �
•• t
·� •-' 11 •• io• . /i4
-
�
-�
,. •• •. a�·� ... i 1 i
...
1 2 3 4 5
•I •i
�
r- ._.
.
•• - .,-
- � �
..
6 7 8 9 10 11 12
. ¡ ti e1
'
�
fli
13 14 15 16 17 18
..
•
tl:a
19
tll
20
1 .
•
21
el � ..¡
22 X
■ Con los patrones básicos de la herencia genética establecidos,
muchos biólogos se volvieron hacia investigaciones sobre la
naturaleza física de los genes.
Hum1n gtnomt
. tt c1 epi.;:;,-.((1).d) � '
-
,·
q.;enoma Humano
'
Genoma nuclear
!G-0 (
( '\
-75 ,-. ¡ - -----
Genes y secuencias D A
Ac!I ciona s 1
,-.:.VC1tragin ico
f-10 '4 -90 ,. ;-60.,. '
_ ,,__..... I
1
-'lo.,.
DNA DNA copia umcc o
ccdif icante no ccdif icante poco repetido
moderadamente o
altamente repetitivo
pseudogenes intrones
fragmentos génicos
'
repeticiones agrupadas
o en tandem
l
repeticiones
dispersas
codificador No codificador Copla ünlca o Do moderado
. <10'h . > 90 °/o en bajo número a altamente
70-80o/., .•-;-_. repetitivo 20-30%
, < 2 •¡. Codifica; n
(64Mb)
- · Repeticiones Repeticiones
VNT�, en tondiim y intercaladas I
,STRi O agrupadas 40o/�- ·1
m•no ,,
_-, .,; ·.,_\ 11. 60% 'Í.INE,,
, Y- SINÉS :,
TIPOS DE ADN EUCARIOTAS
Oonomo
Nucl€!ar
3.200 Mb
�OJllt_nuckur bumano- Genoma mitocondriol humano
3.300.000 kb en 23 moléculas lineales, 16,5 kb en una molécula circular.
2 copias por célula diploide, miles de copias por célula,
aprox. 100.000 genes 37 genes
Oenco repetidcs
y farnili3S
mutugénicas
Díspcrso (mim-
> mkrosatéll! . { DNA no �odili<�nlc
SlNL y LI • 6,1'Y. y
Regulador
93,Jo/. Fxones
{no hay in1tnncs
niDNA
intergémco)
6(1%
DNA único no
codificantc 100% D'IA de copi4 única
(no hay DNA repetitivo)
-·····�1,
.ffi:"!.
• Repetidos en londem
lntef\f)<'rwd
r('lrotr ,lll\fXH!lrH
Unlco que
Usodos en ldenlificoclón
etiti0
2. ADN d ia única im le o no re
(100º��1lriotas;80%
• Constítuye la mayor parte del genoma en eucariotas
inferiores; 50-70% en animales superiores)
• Parte de este ADN ("' 5%) constituye las secuencias de genes. que codifican
protelnas y ARNs; otra parte ("' 5%) es responsables del control de la expresión de
esas secuencias. mientras que el resto. mayoritario, es ADN no codificante, cuya
función, si existe. apenas se conoce.
Genes p.,m RN,\.
C..'-Clu,ivanlC'ntc: s.c L e RNA
����· rc_.;.ilin
t:,lfuClulill
....º'' l ft "'
..... ,
,,.�.�
C\CIM,__.J/
�°'?-..,L
Es!ructuradelGe....pdf "'
ADN repetitivo codificante disperso
Fn. ,4i fllP' \Id d...,...nrJk, IM "'te,;OMS. c.,..iml 1.ld C'ü C\it" dirldct.llnltk\,.;;
t11•1A� tt I.SI 6ftt� di.fttnk' �J ..... (t..c,t) df •"""'-'
'°"' �
illl*tm:l'I.. f'lY 111$1. J\)r b ptetffltll
Lt..;,, d: Jn&m.illo Otncs que se t."Apn:�.u, Cl'I h, (lene., q1,1c � c.,prann en l.:1
I k.-moglob,flO(.)
--
) 61poo dm.k f'itmtb:a ¡in� de 11 �lobinl.
(11mili1s;énic:1 de I� a.·gk)bina
•
IT.[C'tir.w.-,I·,·
la•�-
"i'JIII_.IJAfl
(en '-'l c:romo--...011:tá 16} (C'ft�lcron� 11)
�llll!•••
• -t,,,Ya1 o •• ��tlll-
'·''"'
f..111brl6n
(J3CO "iccfino)
"'trf\Yltaru. ,k,t,1� \ ,n:ul
,.,�,:.ti, .�,1
'-b)nm.w'l" ¡t� ( \t�·\ll-1
�·
\<11�(i,'f,
(hí¡,>00 y-·
fckl �¡zili�j»
l
••
\t,yo.,w..;. ttil':
"-""'
1i._,'fg 'tci_, ·1 U, \..,N............
4'
,.h..,t.uu. ,:l<ibina
-cQ..•
l ==->�
H••• •• 1 Ir
AdulKI
(n.chlull ml�)
M.1,._,..,w,1 ¡p-+.,,..u
� !IÍrlta• g-i�
>,';,"•D\lt ,,,'>blnl, rr,1
'-1,nor-lbn• .W,... O t:.-,)
,\l�O.:L\
\1 J"P'llNi&: «la:
11�1 1
Centrómero
Repetietones en tándem
I Repeticiones en tandem
dispersas
Reiroelementos y microsatélítes
asoc,aclasan:tintrim:ler-0
1
Repeticiones telomencas Retroelementos (LINEs)
,... --
y subtelomericas
secuencias de copia única o en
bajo número, incluyendo genes
•• • Preview File Edit View Go Too Is Window Help � �>)) 94% i.J• Thu 3:QQPM
m-
Vicw
e.
--- Zoom
@.. �
Sharo I
,
gr 911
o'
Ro tato Morkup
O. ,earcli
.,e ore,., V •w Zoom
['.}
Sh r
" PM 05
@
M rk.u
o
Zoom Roto
93,3% Exones DNA
o
(no hny mtroncs ccdificnnte
niDNA (cenes)
intergénieo)
ct;enoma Humano 60%
DNA úruco no
! codificamc 100% DNA de copia única
(no hay ONA repetitivo)
Genoma nuclear D'\ A mtcrgcmco
?
/ (lodal. lm, cifras son aproximadas
� y dilic:rcn según lo, fuemcs)
l -25 % -75 % l
Genes y secuencias DNA
relacionadas extragénico
GEN20/21
-60 %
-10 "· -90 "·
'º o
'
- lII1 !;;! eR9 .., ......
ei
l
ooo V
mo aun�
!--'------ t..Ai.rrnDt..LA-v-.onf.ormoA�rl tvil ..:DGr. '1'1 !JO'ln�t....1Jl.!�A. _oni: _t\,v..J_ UftDII t
-= M
Polimorfismo O 9
***********�
**** * **** * *
* � *** ***
***�***** *
** *** *****
"l'GA�\.;.� � "QA �11�
f sutfeptlbilidad a e_!lfermeda Pr2tección a enfermedad�
f Resistencif fármac�)
. f Metabolizador lento
olimorfismo de Lon · 8
Fragmentos de estricció
e .
I ACGTATTCGG� CGGCCGGCAT
I
l---+-\\.J
ACGTATTCGG
.
Secuencia. de
Restr1cc1on
�
La enzima no corta el
200 fragmento amplificado
y mantiene el tamaño or
'-------·__,, � La enzima corta el f
100 ---------13 amplificado en <!ºS
'
lltfl� f;llllll
• IIDI I�
ll!f'dAln111;1N's4
,1018";1J lt:tc•l•
\_
1 2 3 4 5
_,_,_ -�
f'
•
• J ,,, •
6 7 8 9 10 11 12
I
_,._
-. _, •• ..... _,, - -JI,-
•A
. _.,•
13 14 15 16 17 18
.... -
19 20 21 22
SEX CHROMOSOMES
Figure 2-11 A human malc karyorypc wirh Gicmso banding (G banding). The chromosomes are
at the promeeaphase stage of mitosis arid are arrunged in a smndard classification, numbered 1 ro
22 in ordcr of lcngth, wim thc X arrd Y chromosomes shown scpararely, See Sources &
Acienoioledgments,
o Los miembros de un par de cromosomas,
denominados “Cromosomas Homólogos” o
“Homologoa”, contienen información genética congruente
entre sí, es decir, poseen los mismos genes y en la misma
secuencia.
--- ---
5' GGATTTCTAGGTAACTCAGTCGA 3·
Double Hellx
s· CCTAAAGATCCATTGAGTCAGCT 5·
Reference
Sequence
... GGATTTCTAGGTAACTCAGTCGA ...
Sin embargo, en un locus específico pueden existir formas
idénticas o ligeramente diferentes del mismo gen,
denominados “Alelos”.
Uno de los miembros de cada par de cromosomas se
hereda del padre y el otro de la madre.
A B
...
' .... ....
....
....
.....
' ....
;
l
I'
I
., ,.,
I
,
,
I'
;
I'
2DA
tf1e 3
6
·.5'
ORGANIZACIÓN DE LOS
CROMOSOMAS
Cada cromosoma está constituido por una única
doble hélice de ADN, cada cromosoma nuclear
es una única molécula larga y lineal de ADN
dispuesta en forma de cadena doble.
De manera que el genoma nuclearestá formado
por 46 moléculas de ADN que suman un total
más de 6,000 millones de nucleótidos
D En el interior de cada célula, el genoma se dispone
formando la cromatina, en la que el ADN genómico forma
complejos con varias clases de proteínas cromosómicas.
Cuando la célula se divide su genoma se condensa y
aparece formando los cromosomas, que son
microscópicamente visibles.
Por lo tanto, los cromosomas son visibles en forma de
estructuras bien delimitadas cuando las células se dividen .
En la cromatina, las moléculas de ADN de un cromosoma
forman un complejo con una familia de proteínas
cromosómicas básicas
denominadas “histonas”
�v,.r�ll\i� �
s:K clil n «1tttr: m:fü:l;a¡
d] -;��
DNA, RNA y
Proteínas
Dra. Lourdes Pazmiño M.
PROYECTO DEL
GENOMA HUMANO
“Project Genome
Human (PHG)”
Dra. Lourdes Pazmiño M.
En 1986, el Departamento de Energía de los Estados Unidos
lideró la Iniciativa del Genoma Humano,
Tras varios años de contactos y reuniones, y puso en marcha el mayor
proyecto biomédico de la historia con el objetivo final de conseguir la
secuencia completa del genoma humano en el año 2005.
El Proyecto Genoma Humano comenzó oficialmente en Estados Unidos en
octubre de 1990 cuando los Institutos Nacionales de Salud y el
Departamento de Energía de los Estados Unidos se unieron a distintos
colaboradores internacionales en un esfuerzo concertado para
determinar la secuencia correcta de 3 mil millones de bases de ADN
LJ Siguiendo un plan a cinco años para desarrollar las herramientas
que permitiesen conseguir esa meta.
Estas herramientas eran principalmente la construcción de mapas
genéticos (de ligamiento) y de mapas físicos (de clones) de todo el
genoma humano, al tiempo que se desarrollaba la tecnología
necesaria para realizar secuenciación a gran escala.
La estrategia general consistió en construir mapas genéticos y
físicos e integrarlos, para aumentar cada vez más en resolución
desde el cromosoma hasta la secuencia de ADN.
AMPLIFICACIÓN
J JO
•••••
a••
•••
72ºC 94ºC
Elongación por Separación de
polimerasa cadenas
Taq
,
AMPLIFICACION
Homo sapiens
2900 27.000
(ser humano)
DNA, RNA y Proteínas: Herencia en
el nivel molecular
Dra. Lourdes Pazmiño M.
Estructura de los cromosomas
“Cada cromosoma humano está constituido por una
única doble hélice de DNA continuo.”
Quiere decir: cada cromosoma es una única molécula
lineal de DNA dispuesta en forma de cadena doble .
De manera que el genoma nuclear está formado por
46 moléculas lineales de DNA que suman 6.000
millones de pares nucleótidos.
En el interior de la célula, el genoma se dispone formando
la CROMATINA, en el que el ADN forma complejos con
varias clases de proteínas especializadas.
Cuando la célula se divide, su genoma se condensa y
aparece formando los cromosomas.
Las moléculas de DNA de un cromosoma forman un
complejo con una familia de proteínas cromosómicas
cargadas positivamente denominadas HISTONAS
Existen 5 clases principales dehistonas.
Dos copias de cada una de lsa histonas nucleares H2A,
H2B, H3 y H4 constituyen un OCTÁMERO, alrededor del
cual se enrolla un segmento de doble hélice de DNA
Con cada octámero se asocian aproximadamente 140 pb
dando al menos 2 vueltas
Cada complejo de DNA con su núcleo de histonas se
denomina NUCLEOSOMA, que es la unidad básica de la
cromatina
Una quinta histona H1, se enlaza con el DNA en el margen
de cada nucleosoma, en la región espaciadora
internucleosómica.
Cromosoma Doble cadena
deDNA
--
Cromátida Cromátida
Telómero ---+-
Núcleo
OCTÁMERO
Core of g His:0·1�s
Hay varias histonas especializadas que pueden sustituir a
las histonas H3 o H2A dando características específicas del
DNA en esas localizaciones.
Las histonas también pueden ser modificadas por cambios
químicos, y estas modificaciones pueden variar las
propiedades de los nucleosomas.
E
e
o
Ct)
10 nm
DNA Histone
<, / octamer
H1 histone
Nucleosome
30 nm
Cada vuelta de solenoide incluye seis nucleosomas.
Los solenoides se organizan en asas de cromatina, que
están fijados en un esqueleto proteico.
El resultado final de esta torsión y replegamiento es que
el DNA, en su máxima fase de condenzación, tiene una
longitud de 1/10,000 de la que tendría si se extendiera
por completo.
(
FIX!i ·2:-4 lp,o11._.-i;:;ineB de tor:..!� del DNA. EJ C-NA :se ,enrolla -en l:or(l';O a lh,í:.gt_cmai::::!; p.ara fQM'TlBr 1n.K:leo-
�s:. és.t:EtS SJeo arganiz.t.!n eA soJenok;l.e.a_, que, ..e su vez: cor-n�en le.-s .a:s.asi de o:::rornatina
Replicación de DNA
Empieza cuando se rompen los enlaces débiles de
puente de Hidrógeno entre las bases, produciendo
hebras únicas de DNA con bases no emparejadas.
El principio de emparejamiento de bases
complementarias determina que la base no
emparejada sólo atraerá a un nucleótido libre si ese
nucleótido tiene la base complementaria adecuada.
@ Ejemplo
D Una secuencia de ATTGCT se unirá a una
serie de nucleótidos TAACGA.
Actuando así la hebra como molde sobre la que
constituye la hebra complementaria.
Cuando la replicación está completa, se forma una
nueva molécula bicatenaria idéntica a la original.
;;: 1
1 -t ..
í�
.
..
Varias enzimas diferentes intervienen enla
replicación.
Una enzima desenrolla la doble cadena y otrala mantiene
separada
La DNA polimerasa: recorre la hebra simple añadiendo
nucleótidos libreshasta el extremo 3’ de la hebra, por lo que,
la replicación siempre va desde el extremo 5’ al 3’
Además cumple con el papel de revisión enel que
comprueba que los nucleótidos son complementarios,
caso contrario el nucleótido se extrae.
ADN primase
ADN Ega3a Cebadot
ADN pe meresa (Pola}
Cadena
retrasada
Topo&somerasa
3'
AON poánerasa (P�)
He casa
Proteinas de Urion
a Cadena 5-np {ssb)
EL GENOMA HUMANO: ESTRUCTURA Y
FUNCIÓN DE LOS GENES
Nucleosomas
Modificaciones
en las colas
de las histonas
Variantes de histonas para
marcar regiones específicas
Dra. LourdesPazmiño
Variación genética: origen y detección
En los seres humanos existe una cantidad sustancial de variación genética como:
Esta mutación puede afectar a las células de línea germinal (producen gametos) o a las células
somáticas.
h h H h
H Hh Hh H HH Hh
..... .....
o o
-� -�
e e
a, (1)
O)
o... g>
...
a.. a..
H Hh Hh h Hh hh
- -
Ttpos de mutaciones.
MUTACIONES
según el mV.el del .m.a:te.rlal según si tipo cm·
ge,néti co .afee tedo tejl do .afoct.a·do
11
1
.¡ l
MUTACIONES MUTACIO�ES MUTACIONES MUTACIONES
GÉNICAS CROMOSÓMICAS GERMINALES SOMÁTICAS
1 1 l. 1
.afe·ct.a·n a· .afecla·.n' a .a.fe·ctan a afet::lan .a·
l
UN SOLO
SEGMENTOS DE
CROMOSOMAS
!.
TEJIDO
!
TEJID·O
GEN: GERMINIAL SOMÁTICO
CR,OM.OSOMAS
ENrTEROS
PUEDEN
SI -+ TRANSMITIRSE A. lA +- N
JUEGOS O
CR·OM OSÓMI COS O.ESCENDENC.IA
Tipos de mutacióngenética
Sustitución de pares de bases.- mutación de un único gen, alteran la secuencia de
aminoácidos
• Mutaciones de cambio de sentido o sentido erróneo.- Este tipo de mutación ocurre
cuando se sustituye un nucleótido. El codon modificado codifica un aminoácido distinto.
Suele dar lugar a un cambio de actividad de la proteína resultante, lo que puede ser
beneficioso o perjudicial.
T A C T T C G T G A T C Gen original
A U G A A G C A C U A G ARNm
DNA
e r e e
G A G G U G
ANA
Fig. 11.2
Protein
molecules hemoglobin
"' molecules
a. b.
• Mutaciones finalizadoras o mutaciones sin sentido
la sustitución de un nucleótido da lugar a un codon que no codifica ningún aa, el
Codon resultante es la señal de STOP de la traducción. La proteína resultante es mas
corta de lo normal y probablemente pierda la función que debería realizar.
T A C T T C G T G A T C Gen original
A U G A A G C A C U A G
T A C TA T C G T G A T C Mut. Sinsentido
A U G I_
AU A G C A C U A G ARNm mutado
,
Met
Met Stop
Thr Triplete
His sin sentido
Stop
T A C T T C G T G A T C Gen original
A U G A A G C A C U A G ARNm
Met Lys His Stop Tripéptido
T A C T T C G T GA A T C Mutación Silenciosa
A U G A A G C A UC U A G ARNm Mutado
Met Lys His Stop Tripéptido
El codon CAU codon codifica también la His,
Así que el tripéptido no cambia.
Consecuencias moleculares de la mutación
• Las mutaciones pueden producir una ganancia de función o una pérdida de
función.
AGENTES MUTÁGENOS
Físicos
• Radiaciones ionizantes (Rayos X)
•Radiaciones no ionizantes (Rayos UV)
Químicos
• Agentes alquilantes: gas mostaza, acridina
• Antibióticos
•Drogas
Biológicos
• Virus
Tasa demutación
• Grupos Sanguíneos
• Electroforesis de proteínas
• Técnica de Southern y análisis de fragmentos de restricción
Extracción ONI\ de En2imade redriccióncorta el
Froamento, de :>HA se
Kporo"I ,or c:lc:t,ok>rc,ís
/_q�
___ L/_, - --.
Lavido de membrana para
Se un, una peltCula de rayo.s X pa•a
dettctarel patr6r rM:i oKttvo Sf:ccmparan Sos tatronn de ONJ. c::>n
p;:Jt:ronc:5dc: $Jjc:tc�$ c:oncc:ido. o $0$pc:C:t-o�
MÉTODOS DE DETECCIÓN DE MUTACIONES
. ·····--------------------
PROCEDIMIENTO DESCRIPCIÓN BREVE APLICACIÓN
Técnica de Southern Digestión del DNA de prueba con enzima de restricción; Detección de inserciones,
resolución de fragmentos con electroforesis con gel deleciones, reordenamiento;
de agarosa; transferencia de DNA a membrana de nailon ordenación de fragmentos
e hibridación de sonda marcada a fragmentos de DNA de DNA en un mapa físico
Análisis del tamaño Los productos de la PCR se clasifican según su tamaño Detección de pequeñas inserciones
de producto de la PCR mediante electroforesis en un gel de agarosa o y deleciones, y expansiones
poliacrilamida por repetición de tripletes
Secuenciación directa del DNA Determinación del orden lineal de los nucleótidos Detección de inserciones,
del DNA de prueba; detección de nucleótidos deleciones, mutaciones
específicos mediante división químlca, terminación puntuales, reordenamientos
de didesoxi-cadenas o colorante de fluorocromo
División de emparejamientos Hibridación de una sonda marcada para el DNA de Detección de pequeñas inserciones
erróneos de DNA prueba; división del DNA en el sitio del emparejamiento o deleciones, mutaciones
erróneo de pares de bases. puntuales
Hibridación de oligonucleótidos Hibridación preferencial de la sonda marcada para el DNA Detección de alelos de
específicos de alelos (ASO) de prueba con composición de bases complementarias composición conocida
únicamente
Amplificación múltiple Ligación de fragmentos de DNA tras la hibridación Detección de deleciones
de sondas dependientes de sondas espectñoas para una región y duplicaciones de exones
de ligación (M LPA) o genes completos
Espectrometría de masas Detección de masas físicas de hebras codificantes Detección de pequeñas inserciones
y no codificantes del DNA de prueba o deleciones, mutaciones
puntuales
Hibridación de micromatrices Hibridación del DNA de prueba en matrices Detección de SNP. CNV, diferencias
de DNA de oligonucleótidos ordenadas en chips de silicona de expresión
o portaobjetos de cristal
Truncamiento de proteínas El DNA de prueba se utiliza para hacer DNA Detección de mutaciones
complementario (qONA) mediante- RT--PCR con del marco de lectura, el sitio
cebador 5' con activadorT7; el cDNA se traduce de splicing o finalizadoras
y el producto se resuelve mediante SDS-PAGE que truncan el producto proteico
Polimorfismo
Dra. LourdesPazmiño
Polimorfismo genético
• Susceptibilidad a enfermedad
• Resistencia a fármaco *
.6 Protección a enfermedad
Metabolizador lento
Polimorfismo de un único nucleótido o SNP (Single
Nucleotide Polymorphism, pronunciado snip) es una
variación en la secuencia de ADN que afecta a una
sola base (adenina (A), timina (T), citosina (C) o
guanina (G) de una secuencia del genoma.
Polimorfismo de inserción-deleción
D Varón normal
O Sexo no especificado
0
SB29
Pérdida fetal a las 29 semanas
de gestación
sem
Herencia autosómica dominante
Características
Transmisión Vertical del fenotipo de la enfermedad.
Ausencia del Salto de generaciones
Una cifra aproximadamente equivalente de hombres ymujeres
afectados.
Puede observarse transmisión paterno filial del gen de la
enfermedad.
Un heterocigoto afectado transmite el alelo causante de
enfermedad a la mitad de sus hijos aproximadamente.
Riesgo de Recurrencia
&'I C>
��
...c:.o
�
..SS
Si
·;
�
JD6JÓL::I
,..<\<>«DIJ
,.4,-"QQ
����������������C:)�-C>�•--¡_c:,�-t-�r:>�e:>�""���������������
• .....
1.J<o.l<=> A.lte>
C:\..1-:L.eitL._-J1,..ft.t...1..1. 1u .1-:l,.Co1-.,, c"-ln.d.) .. e:::, 1....1 ic:,.a..-,_ ·,s. MU c...,_1_.L .... ..._, --...,._.,_t".l."'E\ .-. • "'°' c.\ t;; ea.e- o. lel
C-.X.1Jl .. c....,,""I' e-;. n.ltie:, clc In tlJt:i,;l..l"'"'lL=--l..• 1--.!•,._ ,.,rcR�t:""l_t:n.:1.-i múes o.._l �1<.>et y C-.:.'- �1__ •••c,:q
L'----..l.'1-:>b.ic...!J.-Lt.,.. 1t.1 ·s ... ._., ...._�,,::a,,-.�t:cn ele: lL1. c'.t"lfCr.a:a..""1 "-l�t.<1t...l y t.lc,,c-r-. mó.a. prc::,ba._b1.l.ic..JL'l.-
d�N cLie. c.:le:e.ci..:ra....<..>L];i...1,...t'1c.._'"\... E.a.: '-ª'._1,tc,, n.. lCt..N c.r1..•b:a..-r-L1.0e;..li'-U ,..� .J""'"'"''''., 1-rnc::t·c,rlo.1-e:s
:J.'--''� c.�At ,\ ,, ..., ..-C'!!(:¡�.,.t..e:s e> <11.....t..t=,.C•:a.L...,e=,.. 8 ..1.. -- -,�A-� .-le> r,l'-,_IJ:>C!TOr -\..."l.r-1. -..::aa-r..b.- ..-. •••
,..-&:,.•c:co:9ce>t..l.bJl.i,laoc-..,l .l: n,·n q·�-._.,, Re e,:x:.prc.,.� .lu.. -.,,.LiC'-'>.L·�·,;:,.. c lc--.1. l.>c->-r <:;;lcbu.jec> cl e I,
'-' ,,-,-n l"'t:"\.I .. ·1 a pc::.1-e:1.,c,,:11 "'- p�, 1• ,_... '"" --... .a A le - t_·cl..clo.¡ pc:>r e.1:1c:i_:1.""11.�'-> ·B t::1:-". •'.:l. f"� - t-A..d <">
e, a...\._l.� ... .._.__�, ..._-.._ t.:> e:,�,
� , .. 1 n Fe .-;r.i.-..�clu.cl.
e:-...,
t.....J r,_CL le-r.a...11ci....:L�t.�l- C.:J..t...•c s� ,-�� c:c, .-·r�e,;-pc.,·n e;;;l'-'.3 i;._J , �.l.."->...,.1 ,...., c...--l c,l � ml".'>ra.l
·a l-..1., St"rJ:a"""'c-.�1� plló·rlc=o.� '-L.11.. Lt''--'-st:e>.1...1�,<:>, q·1-1c ,-.e= L-r:LC1.a--.lf1.c.Nl...¡,_,_t.. P"--' .... ...:.> lcs-
pLLé� c.l •J. r.a.ll..1, .. in.:&..l ... .._..__....., y C.A"t"'Ó. C:0.\..1NCL.clc:> _pc.....>.r 4t!l1 �Sl.t',......,1,1r,,,,i�r1te> C> l�
PRINCIPIOS DE LA HERENCIA MULTIFACTORIAL
Baja Alta
Susceptibilidad
Baja Alta.
Susceptibilidad
FIG "12-2 Distribución de la suscep·tibilidad para una enfer-
medad multifactoriel en una población. Para estar afectada
por la enfermedad, una persona debe superar el umbral de
la distribución de la susceptibilidad. Esta figura muestra dos
umbrales: uno más bajo para los varones y otro más alto para
las mujeres (como en la estenosis pilórica}.
PRINCIPIOS DE LA HERENCIA MULTIFACTORIAL
Estudios de gemelos:
A. Fragmentación normal
t
a-secretasa
(
,._------------
_ -
42 (
- --=-:-----"-')
[(A�
;===--
Placas de l}-amiloide.
I V
�-secretasa y-secretasa
FIG 12-9 A, La fragmentación de la proteína precursora de fH¡miloide (APP) mediante a-secretasa
interrumpe la proteína �amiloide e impide la formación de placas amiloides. B, Una vía de fragmen-
tación alternativa implica la fragmentación de la APP mediante la ¡i-secretasa en el extremo N y la
y-secretasa en el extremo C. produciendo un producto proteínico de entre 40 y 42 aminoácidos.
Las mutaciones de ganancia de función de los genes de la presenilina provocan un aumento de la
actividad de corte a través de esta vía. Esto da lugar a una cantidad excesiva de la forma de APP
de 42 aminoácidos. lo que lleva a la formación de placas amiloides. Las mutaciones del gen de
la APP también pueden alterar los sitios de corte de la a-secretasa de manera que se producen
cantidades excesivas de la forma más larga de APP.
GENÉTICA DE LAS
ENFERMEDADES COMUNES
•
VARIANTES DEL METABOLISMO
PREVALENCIA DE LA ENFEREMEDAD METABÓLICA
• Se han descrito muchos errores innatos del metabolismo
diferentes que son infrecuentes en su mayoría.
• Los trastornos metabólicos representan un porcentaje
sustancial de la morbimortalidad directamente atribuible a una
enfermedad genética.
• Incidencia de trastornos metabólicos 1 de cada 2.500
nacimientos.
• Los diferentes alelos de los genes que codifican enzimas pueden
alterar el riesgo de sufrir numerosas enfermedades comunes
como la diabetes.
• El diagnostico de estas enfermedades es complicado.
HERENCIA DE LOS TRASTORNOS METABÓLICOS
• La mayoría se heredan en un patrón autosómico recesivo: solo están
afectados los individuos con dos alelos mutantes.
• El análisis de muestras de sangre seca para detectar valores elevados de
metabolitos en el periodo neonatal sigue siendo las prueba de cribado de
,,
uso mas comun.
•
•
•
•
•
•
•
•
•
Aldolasa
I UDP-glucosa I! +
____.____
Galactocinasa
Galactosa
GAL-1-P
uridiltransferasa .------..
�------.> Glucosa
...
... 1-fosfato 1-fosfato
J
----rr----···-··
> \. • • .•..•
UDP-galactosa
4-epimerasa
UDP Glucolípidos
>
<
•
TIROSINA
β
•
•
•
•
Aminoácidos de cadena ramificada
•
HORMONAS ESTEROIDEAS
El colesterol es el precursor de varias clases importantes de
hormonas esteroideas.
,
HIPERPLASIA SUPRARRENAL CONGENITA CAH es un
grupo de trastornos autosómicos recesivos genéticamente
heterogéneos de la biosíntesis del cortisol.
Defecto relativamente frecuente de la síntesis de cortisol que
provoca masculinización de los genitales en las niñas y
masculinización prematura en los niños. Normalmente esta
causado por una actividad reducida de la 21-hidroxilasa.
Trastornos de ácidos grasos y cuerpos cetónicos
3.1 Upólisis
3.2 Transporte y ciclo de ta carnitina
3.3 Oxidación de ácidos grasos rnltocondriales
3.4 Metabolismo de los cuerpos cetónicos
3.5 Otros procesos metabólicos de ácidos grasos
y cuerpos cetónicos
Trastornos del metabolismo energético
4.1 Metabolismo del piruvato
4.2 Ciclo del ácido cítrico
4.3 Cadena respiratoria mítocondrial
4.4 Transporte de membrana mitocondrial
4.5 Trastornos mitocondriales no especificados
4.6 Metabolismo de la creatina
4. 7 Otros procesos del metabolismo energético
Trastornos del metabolismo de purinas, pirimidinas
y nuc/eótidos
5.1 Metabolismo de las purinas
5.2 Metabolismo de las pirimidinas
5.3 Metabolismo de los nucleótidos
Trastornos del metabolismo de los esteroles
6. 1 Biosín tesis de esteroles
6.2 Biosíntesis de ácidos biliares
6.3 Metabolismo y transporte de ácidos biliares
6.4 Otros procesos metabólicos de los esteroles
Trastornos del metabolismo de las porfirinas y el hemo
RECEPTORES DE LAS HORMONAS ESTEROIDEAS
ENZIMAS PEROXISÓMICAS
•
•
Trastornos lisosomales
10.1 Mucopolisacaridosis
10.2 Oligosacaridosis
1 o. 3 Esfingolipidosis
10.4 Lipofuscinosis ceroides neuronales (LCN)
10.5 Trastornos de la exportación de usosomas
10.6 Otros trastornos lisosomales
•
•
ENZIMA MUTANTE . . . CUADRO ClÍNl�Q
Hurler-Scheie (MPS-1) o-t-iduronidase :· Rostro tosco, hepatoesplenorneqelie, opacidad de la córnea,
· disostosis'rnúltíple'. discapacidad intelectual
Hunter (MPS-11) lduronato sulfatase , Rostro tosco, hepatoesplenomegalia, disostosis múltiple,
.: discapacidad intelectwal, problemas conductuales
Sanfilippo A MPS-IIIA Heparán-rv-sulfarnidase :: Problemas conduetuales, disostosis múltiple, discapacidad intelectual
Sanfilippo B MPS-IIIB cx.-N-acetílglucpsamihídasa ::· · -• Problemas coeouctuates. disostosis múltiple, discapacidad intelectual
Sanfilippo C MPS-IIIC Acetil-CoA: cx.-g1ucos�minida i Problemas conductuales, disostosis múltiple, discapacidad intelectual
N-acetiltransíerasa ·
Sanfilippo D MPS-1110 N-acetilglucosámina�,.sulfatasa · Problemas conductuales, disostosis múltiple, discapacidad intelectual
Morquio A MPS-IVA N--acetilg1ucosamina-6-sulfatasa , :: Estatura baJa, displasia ósea, pérdida auditiva
Morquio B MPS-IVB Galactosidasa � · ··: Estatura bata, displasia ósea, pérdida auditiva
Ma roteaux-La my Aril sulfatase B "- Estatura baja, opacidad de la córnea, cardiopatía valvular, disostosis
MPS-VI múltiple
Sly MPS-VII GlucuronidassB Rostt,o tosco; hepatoesplenorneqalia, opacidad de la córnea, disostosis
rnéltiple ·'
*El síndrome de Hunter es un trastorno recesivo ligado al cromosoma X; las MPS restantes son autosómicas recesivas.
'La disostosis múltiple consiste en una configuración característica de alteraciones óseas. incluyendo cráneo grueso, engrosamiento anterior de
las costillas. anomalías vertebrales y huesos largos cortos y gruesos.
Tras tornos del metabolismo de vitaminas y cofactores
(no proteicos)
1 3 .1 Metabolismo y transporte de, folato
13.2 Absorción, transporte y metabolismo
de 1a cobalamina
13.3 Metabolismo de la pterina
13.4 Metabolismo y transporte de la vitamina D
13.5 Metabolismo de la biotina
1 3.6 Metabo,ismo de la piridoxina
13.7 Metabolismo de la tiamina
13.8 Metabolismo del cofactor molibdeno
13.9 Otras vitaminas y cofactores
Trastornos del metabolismo de oligoelementos
y oligometales
14.1 Metabolismo del cobre
14.2 Metabolismo del hierro
14.3 Metabolismo de1 dnc
14.4 Metabolismo del fosfato, el calcio y la vitamina D
14.5 Metabolismo del magnesio
14.6 Otros olígoelementos y oligometales
Trastornos y variantes del metabolismo de los xenobloticos
15.1 Oxidación mediada por el citocromo P450
15.2 Otras enzimas que oxidan xenobióticos
1 5. 3 Con j ugadón de xenobi óticos
1 5. 4 Transporte de xenob lóticos
TRASTORNOS DEL CICLO DE LA UREA
Objetivo del ciclo en prevenir la acumulación de desechos nitrogenados del
riñon y síntesis de novo de la arginina.
La deficiencia de carbamil fosfato sintetasa (CPS), ornitina transcarbamilasa
(OTC), acido argininosuccionico sintetasa (ASA), provocan la acumulación de
precursores de la urea como el amoniaco y la glutamina.
• Deficiencia de NAGS
• Deficiencia OTC
• Deficiencia de carbamoilfosfato sintetasa I
• Citrulinemia tipo I
• Aciduria arginosuccínica
• Argininemia
• Hiperamonemia
CITOGENÉTICA
CLÍNICA
u u
• LA CITOGENÉTICA CLÍNICA ES EL ESTUDIO DE LOS CROMOSOMAS, SU
ESTRUCTURA Y SU HERENCIA, APLICADO A LA PRACTICA DE LA MEDICINA.
• LOS CAMBIOS MICROSCÓPICAMENTE VISIBLES EN EL NUMERO O LA
ESTRUCTURA DE LOS CROMOSOMAS PUEDEN PRODUCIR TRASTORNOS
CROMOSÓMICOS.
• EL ANÁLISIS ACTUAL DEL GENOMA UTILIZA METODOS COMO LAS
MICROMATRICES CROMOSÓMICAS Y LA SECUENCIACIÓN DEL GENOMA
COMPLETO.
o
u j
)
• LOS TRASTORNOS CROMOSÓMICOS CONSTITUYEN UNA ENTIDAD
PROPIA DENTRO DE LAS ENFERMEDADES GENÉTICAS.
• LOS TRASTORNOS CITOGENÉTICOS ESPECÍFICOS SON
RESPONSABLES DE CIENTOS DE SÍNDROMES ESPECÍFICOS, QUE EN
CONJUNTO SON MAS FRECUENTES QUE TODAS LAS ENFERMEDADES
MONOGÉNICAS JUNTAS.
o
u j
)
CITOGENÉTICA CLÍNICA
• ESTUDIO DE LOS
CROMOSOMAS Y SUS
ANOMALÍAS
• 1/150 NACIDOS VIVOS
• PRINCIPAL CAUSA DE RETRASO
MENTAL Y ABORTO
• 50% ABORTOS ESPONTÁNEOS
1ER TRIMESTRE
• 20% ABORTOS ESPONTÁNEOS
2DO TRIMESTRE -
• MORBI-MORTALIDAD
a
Centromeric posilion and arm lang¡th
CROMOSOMAS
e ")(�
¡
r
$. 1
' ,
Ex\ernii) d
cap� e 1 ,
J
Med111 clne1ocor
'"terne
Lon erm+
Te ccentnc A croe antm: Su m2tl!.. nt re
u
J
CARIOTIPO
22 pares de autosomas
Organización según…
6 7 8 9 10 11 12
13 14 15 16 17 18
___ ,�
o
"' . ,_ -
.... .
19 20 21 22 X y
u
J -...,
) <:»
r
l 3
''.,
4
. \I
5
'
,, '
11 .1
• á
f !4 '
6 8 9 10 11 12 Femenino:
' ..
13 14 15
lt
16 17
•
18
XX
•
••
19 20 21 22
f lo r- 1 2 3
,, 11
.. :,
ii r \i (
�, ,, '
Masculino: l' .:
Xy 6 7 8 10 11
o
19
•
u 1'4
20
15
11
16
.
• 21•
17
22
'1''
q
18
V
J
IDENTIFICACIÓN DE CROMOSOMAS
BANDAS CROMOSÓMICAS
• Identificación de
– cromosomas
(A) (8) (C)
individuales
– anomalías
estructurales q21.1
q21 q21.2
• Bandas Q q21.3
• Bandas G
• Bandas R
• Bandas C
• Bandas NOR
u
J
LOS 24 TIPOS DE CROMOSOMAS EXISTENTES EN EL GENOMA HUMANO
SE PUEDEN IDENTIFICAR FÁCILMENTE A NIVEL CITOLÓGICO MEDIANTE
DE TINCIÓN ESPECIFICAS.
• MÉTODO GIEMSA (BANDAS G)
UTILIZADO PARA DESCRIBIR LOS CROMOSOMAS INDIVIDUALES Y SUS
VARIANTES O ANOMALIAS EMPLEANDO UN SISTEMA ACEPTADO
INTERNACIONALMENTE DE CLASIFICACIÓN DE LOS CROMOSOMAS.
o
u j
)
INDICACIONES CLÍNICAS PARA EL ANÁLISIS
CROMOSÓMICO Y GENÓMICO
) )
ANÁLISIS GENÓMICO MEDIANTE
SECUENCIACIÓN DEL GENOMA COMPLETO
Numéricas Estructurales
Poliploidia letalesNuméricas
• Triploidia (69) Balanceadas
• Tetraploidia (92)
Aneuploidia
• Monosomias
• Trisomias
No balanceadas o
) )
ANOMALÍAS NUMÉRICAS: TRIPLOIDÍA
• 15% anomalías durante fecundación
• Abortos espontáneos
• Causas:
– Dispermia
– Fusión ovocito + cuerpo polar fecundados
– Error meiótico
o
u j
)
ANOMALÍAS NUMÉRICAS:
ANEUPLOIDÍA AUTOSÓMICA
Monosomías
Trisomías
•una sola copia de un
cromosoma (nl 2n)
•Incompatible al termino • Tres copias de un
(mayoría) cromosoma (nl 2n)
•Mas fácil tolerar el • Causa mas frecuente:
exceso que el déficit de • no disyunción
material genético
--
An 110
J
REORDENAMIENTO DESEQUILIBRADOS
o
u j
)
<:>
REORDENAMIENTOS
AM E TOS EQUILIBRADOS
EQ ILIBRADOS
TRANSLOCACIONES: INTERCAMBIO DE SEGMENTOS ENTRE DOS CROMOSOMAS.
• TRANSLOCACIONES RECÍPROCAS.- SE DEBE A LA ROTURA O RECOMBINACIÓN
DE CROMOSOMAS NO HOMÓLOGOS CON INTERCAMBIO RECIPROCO DE LOS
SEGMENTOS DESPRENDIDOS.
Antn de la Onput� de ta
trlMlocacllOn tr.utstocact6n
CtomcKOm • 4
,toelldo
Cromosoma•
u
)
ISOCROMOSOMAS: CROMOSOMA EN EL QUE HA PERDIDO UN BRAZO Y EL
OTRO SE HA DUPLICADO EN FORMA ESPECULAR.
} brazo que
se perderá
brazo que
•
quedará
duplicado
ro
Eo
e
=
--p11.2
=
- -p11.2
1,4 21
1
21
21
u
J
TRISOMÍA 21: SX. DE DOWN
• CARIOTIPO
• 47, XX, +21 O 47, XY, +21
J
• SUPERVIVENCIA A 7 8 9 10 11 12
.. - i 't. .., • ;l
- ..
;t
TERMINO 13 14 15 16 17 18
--- .. •"' · . ..
• SOBREVIDA 10 AÑOS 19
OIIMtli�··
20 21
J r....c,.
22 X
MllditOne ,. ......&..aMIID:llftfUIUQffl
y
• EDAD MATERNA
TRISOMÍA 21: SX. DE DOWN
• FENOTIPO
• IMPLANTACIÓN BAJA DE LA NARIZ
• HENDIDURA PALPEBRALES INCLINACIÓN SUPERIOR
• PABELLONES AURICULARES PEQUEÑOS Y CON PLIEGUES
• APLANAMIENTO REGIONES MAXILARES Y MALARES
• COMISURAS BUCALES HACIA ABAJO
• APLANAMIENTO OCCIPITAL
• CUELLO CORTO o
• RETRASO MENTAL MODERADO A SEVERO
u j
)
TRISOMÍA 21: SX. DE DOWN
)
u
)
TRISOMÍA 21: SX. DE DOWN
• MALFORMACIONES • MORBILIDAD
CONGÉNITAS • NEUMONÍA A REPETICIÓN
• OBSTRUCCIÓN DUODENAL • RIEGO ALTO DE LEUCEMIA
• ATRESIA ESOFÁGICA, • SORDERA
DUODENAL O ANAL • HIPOTIROIDISMO
• HTTP • ALTERACIONES OCULARES
• CIV • ESTERILIDAD MASCULINA
• AMENORREA
o
u j
)
TRISOMÍA 18: SX. DE EDWARDS
• CARIOTIPO
• 47, XX, +18 O 47, XY, +18
rt
1
1
'
)1 ,1 • SEGUNDA CAUSA MÁS
FRECUENTE ANEUPLOIDÍA
,J• 1 AUTOSÓMICA
<I
• ..
• ANOMALÍA MAS
u
,. ..1 @)
·� HABITUAL EN RN
n •• ...
4
11
•• fl a
MUERTOS CON
MALFORMACIONES
• EDAD MATERNA
TRISOMÍA 18: SX. DE EDWARDS
• FENOTIPO
• OREJAS PEQUEÑAS
• BOCA PEQUEÑA DE APERTURA
DIFÍCIL
• PUNO CERRADO
• ESTERNÓN CORTO
• PIE MECEDORA
• RETRASO MENTAL SEVERO
)
u
)
TRISOMÍA 18: SX. DE EDWARDS
• MALFORMACIONES • MORBILIDAD
CONGÉNITAS
• NEUMONÍAS
• DEFECTOS CARDIACOS • INFECCIONES
• ONFALOCELE • APNEA
• HERNIA DIAFRAGMÁTICA • INCAPACIDAD LOCOMOCIÓN
• ESPINA BÍFIDA
o
u j
)
TRISOMÍA 13: SX. DE PATAU
• CARIOTIPO
• 47, XX, +13 O 47, XY,
)\.
+13
.. ..
• EDAD MATERNA •" .. a
•• n ••
• FENOTIPO " .. n
1a
• HENDIDURAS
OROFACIALES
• MACROFTALMIA
• POLIDACTILIA
• APLASIA CUTIS
• DEFECTOS SNC
TRISOMÍA- NO DISYUNCIÓN- EDAD
MATERNA
.12----------�
.11 ntOOln IS
• Al blrth
.10
.09
I
;
.08
t
., .07
! 06
.00
.02
¡}
l./
01
o
.;. 9
�--·- ..uur..:•='---· ----'---'-----' o
O 20 25 30 35 40 45 SO
Matemal age (years)
J
u
)
ANEUPLOIDÍAS CROMOSOMAS
SEXUALES:
SX. DE TURNER
• CARIOTIPO
• 45, X Turner's SyndN::Jm• "� XO
• MUJERES
9 ¿
• FENOTIPO ·f,
• J
t l1
u
J
ANEUPLOIDÍAS CROMOSOMAS
SEXUALES:
SX. DE TURNER
• MORBILIDAD
• DEFECTOS CARDIACOS
CONGÉNITOS
• DEFECTOS RENALES
ESTRUCTURALES
• INFERTILIDAD
)
u
)
ANEUPLOIDÍAS CROMOSOMAS
SEXUALES:
SX. DE KLINEFELTER
• CARIOTIPO
• 47, XXY
o
u j
)
ANEUPLOIDÍAS CROMOSOMAS
SEXUALES:
SX. DE KLINEFELTER
1(/'l H
LPoorbeard
TesUcular
atrophy
Femare publc
hair pattem
l)
•
)( )í
7
•
JI .J!,
• 10
\ \
•!
u
)'(
"
(1
x;,J�x�
>I 1 \
� r 1a !• ''I..
•I) 1} I'
" " 15
••
.
..
}P t·'....
20
t ••
r e
" u lt·(�)
o
(a) Klinefelter Syndrome (47,XXY)
)
u
)
ANEUPLOIDÍAS CROMOSOMAS
SEXUALES:
SX. DE KLINEFELTER
• FENOTIPO
• ALTURA SOBRE LA MEDIA
• TESTÍCULOS PEQUEÑOS
• ATROFIA TUB. SEMINÍFEROS
• GINECOMASTIA
• INTELIGENCIA INFERIOR A LA MEDIA
• MORBILIDAD
• INFERTILIDAD
• CÁNCER DE MAMA
o
)
u
)
FARMACOGENÓMICA
INTRODUCCIÓN
•
Fgenómica Fgenética
A nivel A nivel proteico y
(GENOMA) Fisiológico,
asociados a SNP
Farmacología:
-Genes CINÉTICA
-Asociación de DINAMICA
genes
ACTORES PRINCIPALES DE LA FARMACOGENÉTICA
• Las responsables en gran medida de la variación interindividual en la respuesta a los
fármacos, objetivos principales de estudio de la Farmacogenética, son las diferentes
secuencias en los genes que codifican:
Inicialmente fueron
Proteínas con
Enzimas que
metabolizan los
Efectos casos clínicos de
estudio, en
respuesta fármacos.
efecto indirecto
sobre la
respuesta al
fármacos
adversos Ahora conforman la
base en la cual se
intenta establecer
tratamiento
Polimosrfismos la relación
genética-
Receptores de
fármacos
nucleotídicos enfermedad con la
fármaco-respuesta.
Proteínas
transportadoras únicos (SNP)
de fármacos
Análisis de genes
APLICACIÓN CLÍNICA genes implicados en el metabolismo de fármacos,
Y LIMITACIONES
transporte o rutas diana.
identifica la variabilidad en la respuesta del
fármaco entre los individuos
Una vez que se encuentra un polimorfismo, es
Falta de laboratorios clfnicos donde realizar los análisis PGx de forma rápida y coste-efectiva necesario determinar su utilidad mediante el
estudio de las frecuencias génicas estratificadas
por población.
Los estudios farmacogenómicos conllevan mucho tiempo
Bioinformática
Dificultad de integrar la gran cantidad de datos genómicos en un sistema de decisión clfnica
Necesidad de ident�cación de nuevos biomarcadores de toxicidad de medicamentos y su respuesta
Necesidad de elaborar algoritmos en los que incluya la variabilidad biológica yfactores no genéticos Asociación genómica (Genome Wide
Association Studies [GWAS]).
Falta de directrices, garantfas legales y éticas
consideran todos los genes y secuencias no
codificantes del genoma humano
Limitada descripción de los estándares de calidad
Secuenciación génica completa pero dificultad de
Carencia de profesionales de la salud capacitados para interpretar los resultados farmacológicos procesamiento de información.
Se compara el perfil genómico completo de 2
Falta de evidencia clfnica suficiente de muchas de las pruebas farmacogenéticas disponibles que d�culta la elaboración de grupos de pacientes clasificados según unos
criterios fenotípicos determinados a priori: casos
gulas clfnicas (los que reciben el fármaco) y controles (los que
reciben placebo).
CONSO TACLi, ICA ANALIS,S TEOAICO
lorrnaew>n clíMCO. kllffltooón del • rmaco y lu
np¡ rmológ"� y mpó � VÍll$ mo• bóhct.tG
+
AHALIS!S
GE OTIPAOO TEGAAO()ft
Solc«ión do!., l�orrn.1'1c ónclt�a y
va,�mes po1enciatm gOOétee �radar pauta
n,J>I l e actas m póLf..lC(i
1
f
REEVALUAQÓN O
LA RESPUESTA
CLÍNICA
DESDE EL PUNTO DE VISTA CLÍNICO
Gen influye en efectos de medicamentos
Los amerindios eliminan ciertos fórmacos mós lentamente, mientras que los
• Un objetivo es encontrar
mestizos lo hacen de manera mós rópido. según un estudio realizado en di-
ferentes grupos de población costarricenses.
respuesta al tratamiento.
10,2 % 3,6 %
2% 8,2 %
DESDE EL PUNTO DE VISTA CLÍNICO
• Por otro lado, el principio de variabilidad también radica en que los blancos terapéuticos pueden ser
biomarcadores farmacodinámicos por presentar variantes genéticas en población, llevando a diferencias
en la eficacia farmacológica. Entre estos biomarcadores podemos destacar un par de ejemplos notables:
• 1. Vitamina K epóxido reductasa (VKOCR): Enzima blanco de acción de los fármacos anticoagulantes
cumarínicos (acenocumarol y warfarina), responsable de la renovación de la vitamina K oxidada y que es
un cofactor esencial para la activación de la cascada de la coagulación. El polimorfismo VKORC1
(−1639G>A -rs9923231-), reduce la unión de factores de transcripción y el efecto final es una menor
cantidad de enzima, requiriéndose dosis menores de warfarina o acenocumarol para obtener el efecto
farmacológico deseado.
• 2. Timidilato sintasa (TYMS): Enzima blanco de acción de fluorouracilo que genera la conversión
monofosfato de desoxiuridina, cuya conversión es fundamental para generar timidina para la síntesis de
DNA. Polimorfismos en este gen afectan el tratamiento de quimioterapias con 5-fluorouracilo (5FU)
PRINCIPALES BIOMARCADORES FARMACODINÁMICOS Y SUS VARIANTES
ALÉLICAS CLÍNICAMENTE RELEVANTES
AMA SAS
•s,.01.01 Pl'M81U del alélO Al>aau. G!tlla1111�1111.
Al«>YMcl Ffflill>M, 0.p:cno,
ht«.a:ol.amid.a. Ne\--rap"J"I�.
Go�m•:xil, Motm,;c,L
i:-� tnowraci10
•33:03 Prr..enc:a dll •.leb h'.D N.O N.O tl..D. HD N.D. Areo..,fflol
•31:01:0! PN":.-enc a cW a leo h.D. ••.o 11.0 IID. HD N.D. Goiw.,..:tpn•
'C3 <Jl:01 P,r.- .. del alelo l,.D ll.D !.: D. 11-0. N.D N.D 4cldo ac•cea cllco
•cc:01 p,..-� del alt-b N.D. N.D. N..O. 1/J:>. N.O N.O �4tiñb"
•01:01 :01 PrrAnC!a dll alft> r..D "o "-º· 110. NO r-,.0 �liria.p¡iu
'03.02 Ptt-.- clol ll!lo !..D. lt.O H.D. N.O. N.D. N.O. �,u,1
'OL0?:01
NO. ,..,-
P...-An<ia del úlo 1-LD.
rsi-t•i
N.O.
s
't.D.
10
IW.
6
N.O.
10
N.D
�
\l<tt:,ol•rnida
AiOlllilu.ll lli
HD. C�A r..32'193-6 ,s ¡• 15 70 70 c�mp,,r.10: de plr.u>o
N.D G>C r,1\H2S2l t; o t. D. II D. ND N.D �'leCj)(�C�
N.O. AJ G r-..44J.490l ,e =4 ,1 31 4 °"""""b
ND. G>l< r,:SOOE.Z, 1 H 3
' s llclall!hlt11ab
e,-,.,.,..
n.fl.mmab
r.n.1bdot9;G•
Farmacocinética
• Absorción: rápida y completa de forma oral, depende de factores como contenido en tabletas, ph luminal.
• Vida media: 15 min, si aumentan las dosis dadas, 500 mg(3 horas), 1g(5 hora), 2g(9 horas).
• Biotransformación: Acido acetilsalicílico se hidroliza en el hígado en acido salicílico; se conjuga con glicina y
se forma acido glucurónico y se excreta en la orina.
• Toxicidad: dolor abdominal, nauseas, vómitos, hipokalemia, hipoglucemia, arritmias, hipotensión, insuficiencia
renal, etc.
• Farmacodinamia:
La ••1>lnna •• uno • do• anzrm-
1mponon1os y evna que ollas
,r,.b•J_....
Pro�lna
�
Allvla• llalar
• LaCox·2 axpo1-
prosna_gtandlru, on
r-p"'"'ª a , .. ion" o
eapasmoa muacular-.
como al dolor do
cabeza.
• La pro•••cJandJn.a
Dattva norvlo• eon••bJoa
RI dolor
• La ••olnna •• adhient II
la Co,c-2, evitando que
exput.omll\a
pros,,..•ndlno.
•
Aspirina� ) IE-...10�---
�Cox-2 ./
- __, La Cox-1
•yudaa
manteno,- la
Bloquea la
dahcada
mombrana
cox1 y puede
ATL Qua cubro ol
••16ma.ac, provocar
La asptnno lmp,do qLlola Cox·2 úlceras
••&M&U• pr<oa1ae1.&ndlna.En1UJ
lupr o-1 c;uvo-po aru• .a quimic.o
anlitnfi.mo1or10 ATL-
ticas
Reacciones adversas al ácido acehlsahcílico
Grupo
Tipo de reacción
implicado CIOSM.
Poco
Hepatitis
frecuentes
Piel y tejido
I Frecuentes Urticaria, erupciones cutáneas, angioedema.
subcutáneo Poco
Sudoracíon
frecuentes
Sangre y sistema
Frecuentes Hlpoprotromblnemla
linfático
Poco
Sistema nervioso Mareos, confusión, tmnltus, sordera
frecuentes
Poco
Síndrome de Reye, cefalea.
frecuentes
La farmacogénomica se
encarga de comprender las • Su objetivo final es conseguir nuevos y
efectivos fármacos para las enfermedades
bases genéticas de la comunes que carecen de tratamiento
enfermedad y así poder definir adecuado en la actualidad. Aunque para
nuevas dianas terapéuticas o muchos autores los términos farmacogenética
marcadores moleculares que y farmacogenómica son intercambiables, se
evalúen la eficacia de nuevos trata de conceptos diferentes.
fármacos.
HISTORIA
• Pitágoras observó que la ingesta de habas producía en algunos individuos una
reacción potencialmente fatal. Con el tiempo se reconoció que se trataba de una
anemia hemolítica que aparecía en individuos con deficiencia en la enzima glucosa 6-
510 a.C fosfato deshidrogenasa (G6PDH)
• Vesell et al demostraron que las vidas medias plasmáticas de muchos fármacos eran
menos divergentes entre parejas de gemelos monocigotos que entre parejas de
gemelos dicigotos. Concluyeron que la herencia multifactorial podía determinar el
1980 metabolismo farmacológico individual (herencia multigénica).
HISTORIA
• REGLAS DE CHARGAFF
INICIO
1950
• Watson, Crick y Rosalind Franklin
• Genómica funcional
Era
PostGenómic
a
• Bioinformática
PROYECTO GENOMA HUMANO
• 2004 - 99% del proyecto esta completo. Resultados:
• 1. El genoma es muy semejante entre los diferentes animales.
• 2. La secuencia de ADN entre dos seres humanos es idéntica en el 99,9 %. La mayor parte de las
diferencias se encuentran en regiones que no codifican a proteínas. Es ese 0,1 % de diversidad genética
el responsable de la mayoría de las diferencias que existen entre los individuos. Sin embargo, muy
pequeñas diferencias en la secuencia del ADN pueden dar lugar a grandes diferencias en la expresión
génica.
• 3. Cada célula de nuestro organismo contiene la misma secuencia de ADN. A pesar de ello, cada gen no
se expresa en cada una de las células. Algunos genes básicos se expresan en casi todas o todas las
células (por ejemplo, aquellos que codifican la obtención de energía), pero otros sólo se expresan en
células muy especializadas (por ejemplo, genes que codifican la síntesis de melanina sólo se expresan
en los melanocitos).
• 4. Sólo el 30 % del genoma contiene genes y la suma de todas las secuencias codificantes de proteína
ocupa únicamente el 1,5 % del genoma (existen genes codificantes de proteína y no codificantes).
• 5. Que se haya completado la secuenciación de nuestro genoma no significa que se conozca su
¿CUÁLES SON LAS CAUSAS, LOS FACTORES
DETERMINANTES, DE LA VARIABILIDAD ENTRE
LA POBLACIÓN EN LA RESPUESTA A LOS
FÁRMACOS?
Factores F. No
genéticos genéticos
TABlA 1. FACTORES NO GENETICOS QUE
CONDICIONAN LA RESPUESTA TERAP€UTICA
DE LOS INDIVIDUOS
la genética interviene en el 20-
95 % de la variabilidad en la Fisiológicos
disponibilidad de un fármaco y Ed1d
sus efectos Sexo
Pwso
Gras.i corporal
Parofrsiofóglc-0s
Función renal
Función hepátlca
Función cardlovascular
La expresión de los genes, más Enfermedades eoncomllantu
que la propia dotación génica,
Medioambientales
y los polimorfismos existentes en Tratamientos concomitamos
ellos es lo que explica y Tabaco
condiciona las diferencias de los Alcohol
individuos en la respuesta a los Nutrición
tratamientos. Contaminantes
OBJETIVOS DE LA FARMACOGENÉTICA
• «optimizar el tratamiento de las enfermedades a nivel individual», ir hacia una
«terapia personalizada más segura y eficiente»
• Generar perfiles farmacogenéticos
• Seleccionar la medicación más adecuada para un determinado paciente.
• Seleccionar la dosis más adecuada de un fármaco para un determinado
paciente.
• Es decir, seleccionar «el fármaco correcto, a la dosis correcta, para el paciente
indicado», determinar a priori la eficacia y tolerancia de los medicamentos para
cada paciente.
ACTORES PRINCIPALES DE LA FARMACOGENÉTICA
• Las responsables en gran medida de la variación interindividual en la
respuesta a los fármacos, objetivos principales de estudio de la
Farmacogenética, son las diferentes secuencias en los genes que
codifican:
Inicialmente fueron
Proteínas con
Enzimas que
metabolizan los
Efectos casos clínicos de
estudio, en
respuesta fármacos.
efecto indirecto
sobre la
respuesta al
fármacos
adversos Ahora conforman la
base en la cual se
intenta establecer
tratamiento
Polimosrfismos la relación
genética-
Receptores de
fármacos
nucleotídicos enfermedad con la
fármaco-respuesta.
Proteínas
transportadoras únicos (SNP)
de fármacos
ENZIMAS QUE METABOLIZAN LOS FÁRMACOS
REACCIONES DE FASE I (SINTÉTICAS):
OXIDACIÓN, REDUCCIÓN E HIDRÓLISIS
TABLA 2. VARIACIONES FARMACOGENÉTICAS EN LAS QUE INTERVIENEN ENZIMAS METABOLIZADORAS
DE REACCIONES TIPO I
SMvl
• La actividad de la TPMT está afectada por
Sulhtacion R-OH R,.Q.SO)
R-NH, Sulfotransferasa R-NH-SO, polimorfismo genético, teniendo el 89 % de los
caucásicos una actividad elevada (HH), el 9,7 %
R-COOH + H,N- CHrCOOH -+ R-CO-NH-CH2-COOH son heterocigotos y presentan una actividad
intermedia (HL), y el 0,9 % tienen una actividad
GS � R-CH2-CH-OH
Cluta tioni-ución R-CH.CH, muy baja de TPMT (LL).
'd SG-dH,
SftM
R-0.CH,
• Un paciente que tenga niveles de actividad bajos o que no
M l"tilació n R,.OH
tenga actividad de la TPMT (LL) que reciba dosis estándar
Acetil-CoA
de AZ presentará concentraciones muy elevadas de su
Acetilacuin RHH, RNH-COCH,
metabolito activo, bien correlacionadas con eficacia
N aceti!Trensferasa
terapéutica pero también con el riesgo de padecer
mielosupresión, en ocasiones letal.
LLARNING TOXICOI .. OGY TI IROUGJ I OPJ� N EDUCATIONAL RE OURCES
Phase 11 reactions
.,..,, . . . _. -
Conjugatio
l
.Acetvlatlon
,. 1•'.C-
,M ctl1,)�tat!o·n. ,
•_• ,r - ·�� ., "';.·
I Enzvme:
. UDP- .
Enzvme: Enz . me: Enzymc: Mcthyl- .
Enzvme: Enzyme: Amino
glucuronosyl Sulphcrransfcrascs Acctyl translcrascs Glutathionc- - acids-transfcra es
tram ferases ( GTs) ( ULTs) transfcrascs tran fcrasc:
--
IUPHAR/BPS
,....
�PHARMACOLOGY
An expen.driven guide to phormiltologi�I mrgelS and the substances t.hol ncton them.
http://www.guidetopharmacology.org/
PROTEÍNAS CON EFECTO INDIRECTO
SOBRE LA RESPUESTA AL TRATAMIENTO
• Existen polimorfismos en los genes que codifican proteínas que ni son
dianas directas de fármacos ni están involucradas en su
farmacocinética/farmacodinámica, pero que son capaces de producir una
alteración en la respuesta al tratamiento en determinadas situaciones. Por
ejemplo, diferencias hereditarias en los factores de la coagulación pueden
predisponer a las mujeres que toman anticonceptivos orales a padecer
trombosis venosa profunda o trombosis cerebral
TENER EN CUENTA:
• La mayoría de las diferencias entre los individuos en su respuesta a los
fármacos son multigénicas (por la acción combinada de numerosos
genes que codifican productos muy diversos) y multifactoriales. Esto es
debido a que los efectos de los medicamentos están determinados por la
interacción de varios productos genéticos que influyen en la
farmacocinética y la farmacodinámica de los fármacos (la mayor parte de
los fármacos son metabolizados por varias enzimas diferentes, son
transportados por varios tipos de proteínas e interaccionan con una o
más dianas terapéuticas).
• Las diferencias poblacionales y el origen étnico tienen que ser
considerados en los estudios farmacogenéticos.
FUENTES:
• https://es.wikipedia.org/wiki/Dogma_central_de_la_biolog%C3%ADa_molecular.
• http://www3.uah.es/farmamol/ISCIII_Master2017/07-FGago_IntroFarma.pdf.
• http://depa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/farmacos_y_proteinas_4329.pdf
• http://depa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/farmacos_y_proteinas_4329.pdf
• Roses AD. Pharmacogenetics. Hum Mol Genet. 2001 Oct 1;10(20):2261-7. doi:
10.1093/hmg/10.20.2261. PMID: 11673409.
• Wolf, C. R., Smith, G., & Smith, R. L. (2000). Science, medicine, and the future:
Pharmacogenetics. BMJ (Clinical research ed.), 320(7240), 987–990.
https://doi.org/10.1136/bmj.320.7240.987
Farmacogenética y Farmacogenómica
Pruebas de Diagnóstico
Pruebas genéticas
Tipos de pruebas genéticas
Las pruebas predictivas son para aquellas Las pruebas diagnósticas se utilizan para Las pruebas farmacogenómicas te indican
personas que tienen un pariente con un confirmar o descartar un trastorno genético cómo reaccionarás a ciertos medicamentos.
trastorno genético. Los resultados ayudan a sospechoso. Los resultados de una prueba de Pueden ayudar a informar a tu proveedor de
determinar el riesgo que tiene una persona para diagnóstico pueden ayudarte a tomar decisiones atención médica sobre cómo tratar mejor tu
el trastorno específico que se está analizando. para tratar o controlar tu salud. afección y evitar efectos secundarios.
Estas pruebas se realizan antes de que se
presenten síntomas.
Las pruebas reproductivas están relacionadas Las pruebas directas al consumidor se pueden Las pruebas forenses se llevan a cabo con fines
con la decisión de iniciar una familia o de tener completar en casa sin un proveedor de atención legales y se pueden utilizar para identificar a
más hijos. Incluyen pruebas para que el padre y médica mediante la recolección de una muestra familiares biológicos, sospechosos y víctimas de
la madre biológicos vean qué variantes genéticas de ADN (por ejemplo, escupir saliva en un tubo) y crímenes y desastres.
llevan. Las pruebas pueden ayudar a los padres y enviarla a una compañía. La compañía puede
proveedores de atención médica a tomar analizar tu ADN y darte información sobre tus
decisiones antes, durante y después del antepasados, parentesco, factores de estilo de
embarazo. vida y riesgo potencial de enfermedad.
POLIMORFISMO Es un lugar en la secuencia de ADN donde existe una
variación, y la variante menos común está presente en al
GENÉTICO menos el uno por ciento de la población analizada. Así se
distingue un polimorfismo de una variante poco común
que puede ocurrir en sólo una de cada 1.000 personas.
Un polimorfismo tiene que ocurrir en al menos una de
cada 100 personas. Los polimorfismos pueden ser
cambios de una sola letra, como una C en vez de T. Pero
1. también podrían ser algo más complejo, como un tramo
-------c:··j�N": -
2 entero del ADN, el cual está presente o ausente. Éstas
también pueden llamarse alteraciones en el número de
copia; pero todos son polimorfismos. Básicamente, es un
término general para hablar de la diversidad en los
genomas de una especie.
Francis S. Collins, M.D.,Ph.D.
Polimorfismo
Polimorfismo de un solo nucleótldo (SNP)
Individuo,
cr z •• CGATATTCCT TCGAATGTC ..
copia! •• GCTATAAGGAUAGCTTACAG ..
cr2 •• CGATATTCCCAGCAGCAGCAGCAGATCGAATGTC ••
coµ1a1 •• GCTATAAGGCAGCAGCAGCAGCAGTAGCTTACAG ••
Individuo 4
cr2 •• CGATATTCCCAGCAGCAGCAGCAGATCGAATGTC ••
copia! •• GCTATAAGGCAGCAGCAGCAGCAGTAGCTTACAG ••
cr2 •• CGATATTCCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGATCGAATGTC ••
copio I •• GCTATAAGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGTAGCTTACAG ••
Polimorfismos
HapMap (mapa de haplotipos)
• El estudio consistió en estudiar 270 muestras de ADN, caracterizarlas con gran detalle y entender cómo
permiten estos vecindarios, algunos tan pequeños como un millar de bases y otros tan grandes como
100,000 bases, y que se extienden por varios cromosomas, que los polimorfismos de nucleótido sencillo o
SNPs de dicha región se muevan de forma conjunta. Esto es lo que llamamos desequilibrio de ligamiento, y
fue definido por primera vez para el genoma completo en HapMap, lo cual es extremadamente valioso para
intentar entender las relaciones existentes entre las variaciones y la enfermedad.
• El conjunto completo de ADN, o genoma, de cada persona, es entonces purificado a partir de la sangre o las células tomadas, se coloca en
chips diminutos y se escanea en máquinas de laboratorio automatizadas. Las máquinas buscan rápidamente en el genoma de cada
participante marcadores de variación genética seleccionados estratégicamente, conocidos como polimorfismos mononucleotídicos o
SNP (por sus siglas en inglés).
• Si se determina que ciertas variaciones genéticas son significativamente más frecuentes en la gente con la enfermedad en comparación
con la gente sin la enfermedad, se dice que las variaciones están "asociadas" con la enfermedad. Las variaciones genéticas asociadas
pueden servir como poderosas señalizaciones de la región del genoma humano donde se halla el problema que causa la enfermedad.
• Sin embargo, las variantes asociadas en sí, pueden no causar la enfermedad directamente. Éstas podrían tan sólo "estar acompañando"
a las variantes que de hecho causan la enfermedad. Por este motivo, los investigadores a menudo necesitan tomar pasos adicionales, tal
como la secuenciación de los pares de bases de ADN en esa región específica del genoma, para identificar el cambio genético exacto
implicado en la enfermedad.
GWAS
___--
asociar variaciones genéticas específicas con ASOCIACIÓN: se pasó de los genes candidatos a los
ciertas enfermedades. El método implica el análisis GENOMEWIDE (GWAs)
análisis de los genomas de muchas personas o a "o::. u a ce Jo a a un oou rnilll o o a:1: en
..
diferentes y la búsqueda de marcadores
genéticos que se pueden utilizar para predecir la ulDa llllllaDOll .íl .ufmi]JDOGO�OO rDíJO'
�......,...
.,....
presencia de una enfermedad. Una vez que 1l ID O IIEOO I O O 0001 O Clll DDDDDUID I WIDD]
dichos marcadores genéticos son identificados,
se pueden utilizar para entender cómo los genes
contribuyen a la enfermedad y desarrollar
mejores estrategias de prevención y tratamiento. --
--- •
___--
genoma completo es encontrar una gran cantidad de personas que padecen una ASOCIACIÓN: se pasó de los genes candidatos a los
enfermedad y un montón de gente que no la padece, pero que por lo demás son análisis GENOMEWIDE (GWAs)
comparables. Y entonces se busca en todo el genoma, utilizando polimorfismos
de nucleótido simple (SNPs), intentando encontrar un lugar donde hay una
o a "o::. u a ce Jo a a un oou rnilll o o a:1: en
..
diferencia constante entre ellos. Y si tienes éxito - y siendo realmente cuidadoso
con el uso de la estadística para no seleccionar un montón de falsos positivos -
llllllaDOll .íl .ufmi]JDOGO�OO rDíJO'
�......,...
.,....
esto te permite centrarte en un lugar en el genoma que debe de participar en el ulDa
riesgo de padecer la enfermedad, sin tener que adivinar de antemano qué tipo
de gen vas a encontrar. La belleza de los estudios de asociación de genoma 1l ID O IIEOO I O O 0001 O Clll DDDDDUID I WIDD]
completo es que nos llevan más allá de la búsqueda de un gen candidato, lo cual
era bastante frustrante porque la mayoría de los genes candidatos resultaban no
--
ser los responsables, sino que podriamos decir que todo el conjunto de esos
---
genes eran candidatos. Esta nueva estrategia es lo suficientemente exhaustiva
como para poder considerar todos ellos. •
1
LAOO
Crecimiento
exponencial de los LAS SON EL PASO
LIOO estudios publicados CONCLUSIONES INICIAL PARA
de farmacogenética J DE LOS ESTUDIOS CONSTITUIR
1.000 en los últimos años Y LA BIOMARCADORES
DETERMINACION GENETICOS QUE
1) ,. DE LA PUEDAN USARSE
'il
�
3 ""' • DrlUhcl s.NKhW*tf.CY l.t,N M�thod�); #11 ptlmr,
ASOCIACION DE COMO PERFIL DE
o � .-1ido e:utud-. rei,iew-,
.8 • r.t.-.,0.�a;IJ!.t'fY ..rtldll'C fulfill� thlt GENES ANALISIS EN UN
� 600 I· I· I· !�Cl'l:NÍ:I
z
• �"-:Siltc thf VESH b:lffi �pl\im1.c�• RELACIONADOS A PACIENTE Y
· '''"'·*•� UNA EFERMEDAD DETERMINAR SU
400
REACCION ANTE
UN FARMACO
,.
lil 11
I• I• I• I•
200
DPENDIENDO DE
SU GENOMA.
o -· •. ·-• u •U
,..,
Holmes et al., PloS One, 4(12):e7960, 2009
INVEGEM ES UNA
EMPRESA
GUATEMALTECA
INVEGEM scav,c.os s;..
-........... NIJfSTROS NVt.GlM ONG INVEGEM OOl[NlS SOMOS OONACIONE.S CONl",ClO
E INVESTIGACION SOBRE
FARMACOGENOMICA Y
FARMACOGENÉTICA
PRUEBAS FARMACOGENOMICAS
Ejemplo:
Mind Precision
Procedimiento
Esta prueba analiza genes que afectan la manera en la que el individuo responde a medicamentos para afecciones psiquiátricas.
Por lo que ayuda al médico a determinar si un medicamento puede funcionar para cada incluso antes de que lo pruebe. Con
esta información y la historia clínica, el médico puede encontrar los tratamientos adecuados para que el paciente pueda sentirse
mejor más rápido.
INVEGEM
ROUI' BOTPAN
Microarreglos: MICHOCHIP CYTOSCAN HD
AFFYMETRIX
Olas AnáUsls molecular de uanslocac.ión 9;22 1 mi. de sangre periférica o médula ósea en EDTA, 3 a 5 días
hábi�
Nombre del estudio Desaipclón
de (bcr/alll) en leucemia aguda Unfoblástica o guardar la muestra a temperatura ambiente o de
entrega leucemia granulocitica crónica preferencia a 4°(, ENVIAR LO MAS PRONTO POSIBLE
Atrofia músculo espinal o Determinación de deleción del exón 7 y 8 en el gen SMN-1 De2 a 3 Ver Mas
Síndrome de Werdnig-Hoffmann semanas.
y variantes alélicas: Ver Más Análisis molecular de transtocactén 12;21 1 mt. de sange penferica o médula ósea en EDTA. 3 a 5 oías
(teVaml-1) en leucemia aguda Unfoblá.stica. guardar La muestra a temperatura ambiente o de
Charcot Marie Tooth AnáUsis de duplicación gen PMPll mediante la tecnica de MLPA. De 2 a 3 preferencia a 4°(. ENVIAR LO MAS PROWO POSIBLE
semanas.
Ver Más Ver Más
Distrofia muscular de Duchenne: AnáUs1s de mutaciones tipo deleciones en el gen OMD mediante la técnica De 2 a 3 Genot1p1flcación alelos amorfos de Tiopurina 3 ml. de sangre penférica con EOTA 10 a 15 días
Análisis de deleclones en 22 de PCR múltiple (22 exones) en varones semanas.
exones
metil transferasa (TPMT): TPMT'2, ·3A, "38 y
Ver t1ás -sc
Distrona muscular de Duchenne: Análisis de dosis genlca en et gen DMD en mujeres con varón arectaoo por De 2 a 3 Detección de quimerismo: análisis de 6 STR 1-3 mlde sangre con anti-coagulante EDTA previo al 1 semana después
idenuncaclón de mujeres deleclón en el gen DMD para determinación de estaOO de portadora semanas. para valoración de éxito en transplante de trasplante de receptor y de donador. de reobrr la
portadoras Ver Más mecuta ósea o coreen no relacionaClo muesua post·
1-3 mL de sangre con anticoagutante EOTAde receptor uasptame
D1strona muscular de Duchenne: Análisis de mutaciones upo detec,ones y duplicaciones en et gen DMD De 2 a 3 post-trasptante
Anáus1s de deleclones y mediante ta técnica de t 1LPA (79 exones) en varones areaaoos o para semanas.
duplicaciones ldentlftcaclón de mujeres portadoras. Ver Más
ver Más
El truco esta en determinar mediante los estudios de asociación, cuales son los genes
relacionados, ante la presunta variación de respuesta a los fármacos.
Enzimas de Fase
1 y Fase 2 con
sus principales
variantes
alélicas
clínicamente
relevantes
CYP3� CYl"JA.1. • 1
C'Vf!.:.,& •IG
CVP!A>'• I!:
"'
ce-t
C>T
r..1:-":'°
r.::...os;� -. ..
Oc.�
•••• ••
"
.,e
,. ..
z¡
100
-
..".. ..........,...
,-'º
.. " ... "" " "-· .. """""'
CYP"?S& <VP?S6•, ts2...'?93-!'S NO
..........
1'>< 21
tSJ� ,1;s;�.a
.
CYP?M·t G...,.4. G"'>T NO
cv,:u·,, �...::� NO
•• o o o
...
T>( 1
••... .....,.,
.. •• 26·''.. ...", .. .........
(>T r�1t NO
.....,..., ...,_
-........,...,.,_
UGTl�l
.••.. �"!'
,,...,.,. ........... . . ..
.. ... .." ••,, .......
�Al? r.:1!1SJ.&1 <4!·56 41·56 9.,. 9.,. P.it�
e
•C>••
T
,,....,,J:J ............ o
....,,.
1 1
••
--·
1JGne1t NO.
.••..
tSIIO!Ol)
-
UGTIIJI ·:: r"..JU.:0,,.J NO 10 �••JI
Enzimas de Fase
,...,
Vfi,T1A�
,..t
D..."01 ·�..:, NO 10
• •
...... 1 y Fase 2 con
<·•
•• o
o o o
�-¡O,,rt-..
r:1� 1 1
.,, .......,. ..''
T,< Clle).IS
ftl-.0
....._
l
o '
o Tle9-'....
sus principales
-se e,, nt&00&50
,.,,_ ,.,,"•
1
"' "
.,. .......... ' '
•,e
••
T>( G1Ht¡3,'S
variantes
,. ,.
.... ..
N,O, NO N.O H.O.
..
C>T fll�
u
COMT
--
G>A t'At!:O
��31 NO ; "'•• +¡
"""""
�..,�
w,m,,.
alélicas
••••
VKO.i!CI
.
"
..
t>T r.w�Je UD. ;
., .,.
A>G r..:.JSil61�
"'-
N.O
N.O. "
eo
a:
;5
" " <S -=
"'t,¡p
clínicamente
..
11 76
•o
",o
...
e,�1:. o
o'
G>A NO. H
l"'..511�'0 o o
relevantes
C>A N.D.
!.>(
.,....,...
�131 NO
"-º
1 o
'
.," ,.........,..
C>G .µ 26 40
............ ,,
..... ..
,,. see-e
C>G
" "
-... ...
..... ., ....,,.
"'1"n.�
--..
º"'' •• A,G
" " " �p.¡t!t:ll: �
., .....
"" ""
. .. .. " "o
""' .......
G!il'MI !0,.'4 ti.O.
,, ....,
Mf"'� ", "• " :z ..,_.,.
-
,SIIOI NJ)
••• ,:IIOHJJ
"° 10 ,:
o-M1.us;no
"""'
NAT2
...."
.,'".
A:,,G ijl:ot NO .. .. ...
,. ., ...
17 •
-=----
....
.......
.. . ... "'
C>T t:10-TNJ N.O
.
r,',�&: o o o o
.......
• I�
·s
••.,
.. ,., ·�·,....
T><
G>A
c;l.tQ).?80
r.:1799930
151199ttl '<.O.
"""""
,..,
11
"' ,.
"
' ' ..
,.' "
�
'
..............
Op�...io."--1
.1'.>J. A.>C es:� I0'9'N o o o o o
_
-ze Al'láogOSO!�
·:A_
,,.
( >T t"'.39�ial.."90 Uing.:nt o o
•
1 o
o o
1
�n..r
... ..•
r-..&:;3�pg¡¡ .."9'"' o 1
..
• ' "
T,C
..
,..1:!9;S9S N.O
'''"",,,
- " •••• 'º••
T>C r:tOSl�40 HO
...
0�-.,W,
,. .��...
n
L•G r..!!�
"º·
•A, !OJ:A._)76(; e,, i,10,c)!?I
""9-"' " o o o
......... __(
Principales
biomarcadores
farmacodinámicos
Protcin;11
......
Variant�
•s1.01.01
úmbio ginico
Aba:k,1. Girt>irn!:¿o.r.a.
Al�ol �N. D.¡p:.ona,
Mtu�lca. N..,tDp"11.
y sus variantes
Caroimi:ol, t,1ft.ll'\ll.:OL
...,,
....
i"!'Ol>lt!O'llri<ólO
""""' �).3:0l
alélicas
... '"'
�ll:Ot:O.? Pw.«iell dll 1i.lo ff.0. '-1> NO N.O. (ln:»fN.:fpiN
HlA-0181
HlA-OQAI
•03.01:01
•01:0l
Pr.-A!"é..a og •�
fl'�.:.tf!CII del tlftt
N.O
N.D.
N.O
N.O.
"-º N.O.
H.O.
ND
N.O.
N.D.
N.O.
AtdO 61:-fnl:alidi(O
�tillcb"'
clínicamente
-·"
¡.(1A,.l)A91 •01:01;()1 Pl'YMICia Oll ti.b NO. N.O. Nto-lirap,na
H1A< •os:02
·01:0.?:0l
Prf"M,0.6 del t!H>
,.,.....ff'C>t
del ,ieio
H.I> N.O
"-" .....
'i.D N.O. N.O
N.O.
11.C>.
A1ett!IDltmlCU
relevantes
H.0. N.o. N.I>
AfOE E2 NO C>l ,s��·i ;
•
•• 10 4 t.:or..Y.�t.N
..
nl-'1�, ss
.., ,.,, ",,
,o
ticc1 NO. C>A
'º C:O,.,pur.-10:d,�no
"''
ND G,C
........,,
n'C.:.?Sll HD ltD NO NO NO Arlh'l�n.cot
IGf N.O.
"
A,<) )1 C.W,,,,,b
TNf NO G,A ,SIOOC)62'
' • ; Adlll'INl'nib
E!.MWt�
..,,,. ..,,
"i�mtl:I
....
Ml>dO-�clt
"'"'
..,,., ..:= •
,... ..
"" ,."
N.O GoffiPl*'IO: dt Pllt!IIO
T ,C
...
X�CC1 NO CO!"!Mi.to� ót ottu110
XPC ND. G ., r-..U.:IOOt
,. ,. )l ll ��l!IO
"
-
S>,«Jt N.O. ,:11:""3AI !Mobóo•fl clt 11MG COA �tdu(tt�
lGflt N.D, �on«-o.11: C'ltl'Ol"I I c.& r:I 1§61)1\ NO NO NO H.0 ND �!inlb
NO
NO. e,,
n111•µsa;
n1:1.aµu,
NO
N.0
NO
�o
NO
HD. "º "·º ,..,....,
H.0
N.O lrlo1,ll<b
.,., .......
"°"""'
lfNU/JfN\.4 NO.
N.O.
C,T
T,G
no
n1:r,uo
,..sen,,·
,-.iw�·s "'.., "•
:a "•• "" !'t9-'Mtfft,On t!ft 2t
h-g,·�ffl�II •lft lb
'""" NO.
" JI
" �bao,rin
��•_....-i
't�IIPl'!Vlf
•s. f!'ll.lt:tr.n I•� Vtritnt.; �it,: :.t9'-"
:u t�M•�• dftoU C�or� dirJrc;.,:¡. M'litde �. lA. 11, Z:A 1 :a ff".d, i. t>a;e dtdat>: Phttmi;.\b'•.
� fteC'Utn(lt� .tú•� Ml'Ql'I *fflldt:fl i. � 6' doJ1:o: I.COOg�. � �... 4 <-W!ib.o ._� � r. �. oomv..omit.. po�tv,. C� no C')l;:l.itf\ d.to: ,n
t. � d.d.,:o: mtr,ootWd,, :.. ir:dic.t l.oO.$ ('-t.DJ .... A.wt Am.-x-.t. /,B;:. léu, U..S.k .. CMI .-.u. i\llt: iw;ipa. SAS.: A:.• 6111 Su-t.
Transportadores
de fármacos y sus
variantes alélicas
clínicamente
relevantes
Fármaco Área terapeuñc.a eiomarcador SUbgrupo referencia
&os\.ltir,iD C.noolOgía SCF.�-1 ceeeeeee Ñ.ac�a ¡:;osith'O
Slmff.án oncología 30!:--ABll cromc--.oma H1it.ade�ohia �aWO
Fármacos y
c.apecitabin.a CocoJogia D»l> Daiáencia de O?O
c.artiama:.�na NE"li!'Ologia HlA-8 OJelo poruoor HLA.-8"' 1 soz
HlA-A A.lelo portaóor HLA,,A•3101
farmacogenómico
ca.'lsoprodol �-eumatOIC>ga C'Yl'lC19 CYPZCI M..o::i.lX>li¡,a,oo, poore
car,"fdil<ll cart1io!og1.a 0,,:1)6 CYPZ06 'A!taboliudor pobre
CYPK9 M500fi¡aaor Pobre
s sugeridos por la
CeiecOllib Fi:eulJ'latOiogi.l C'm<9
c�1nio Crcologf.l AU< ALX 11.eo!tJfnamiento goen
c�ao OncologÍ.i
''"'""
''" ?(.ff. !xpl'!'$i6n pro�. pO".JtlYi
US-FDA �lln,¡
CloroqUIN ""'"'
Enl'trmeel.ct lrt"..KOO"A
0,,:1)6
<iUO
� coe1on 12 y 13 mutaciOn n1!91tiV•
CYPZD6 Mttal:IOll:.oot pobrt
�CWG6PO
00rprop1mie1, E.ricJocnnoK19{a <iUO Dtñótnci, G6PD
Cr"..,Platll'I OrcolOQIC. ll'MT TPMT �OOli:,CIOr imtrmtaiC> o poort
Ch.a�t•m �iqu••�ría CYPZC1t cr,zc1t MtU!>Qli:..oor poort
0,,:1)6 CYPZ.06 ""'-UOOli:AOOr poott
OoM:,m anc,, CVPZ.Ctt MtUOOl�OOt poort
....,.,.
NturOI.
Oomiptan'lll'lt �iquiaW C'm06 C'YPZ.06 MtUOOli:.aOO<' PoOl't
CJo9'0oOttt CYP.:c19 cv,z:ctt MttltOOtJ:.toor il\ttrMtOlo o poort
00:,p""
e.o.IN .,,,,..;.,.
�lqU\lltlfa CYr.06
0,,:06
CYPZOC MtUOOli:.oor pc,o,.
CYf'ZD6 MfQOOli:1oor u1ira-ri,:iioo
Oi.:otinlo
0tl)(Jr.f'IO
or.co1ogt,
Oftcol09� ...,.,
AJ. AU,. flfOl"Ofl'\IMlf"l.to 9t"
lfl.AI V600� MUtJción iw.,ttlv,
<iUO
"''°
�"''°
Of'lciond,
0,P:ON Dtrm1toto9'1 <iUO
fMtrmtO� ll'l'tcOOGli <iUO �ciJG6PO
O�t,niri °""''09� �A!ll Ctot'no""..om, l'il,atttii PY.itivo. TJ 151 muaci6n
Fármacos y
0"'°"'9f' «.PI\ bi>rr.iOr'I l)(Ottín.a po.iir.,
!Gf� e:�..on Jt Ot1toOn o tJO.n .: 1 �on
(LISG� pr..¡1r,0
biomarcadores
-- -�
....,.......,
f-°Amtp'l::CIII """°"'"""°9"
Oncol09'_.,
CVP2Ct9
l�!!IIJ
CV1>ZCl9 A,ttt�··oo, OOCW't
Hf.lU �bn on:,tf{!'l,I nf9''!J'IO
,�i1 lt�;otOf�po,i,vo
""'
�CDl'Ot���
-
�to\' P�ltron.t po-J1NO
s sugeridos por la
"'°�<'-IV>
Oncol09f4 °"°
°"°
o.notn(141 0,0
OtlkMnO,I �o
........"" cv,:o, CYP.:06�tu�poctt
-·
US-FDA
B,arDIOnYtnO C\'Pl:(9 cvP:C9 MfUOOCIOClt PCIOrt
""
lt""'!N�
-
n.r10X1fl'll!'\f
N'mhnt
.......
Onco109'4
CYP206
lS"1.�
CVP:ot�fU��
ltt<f9':.ot l'IOffl'IOnl WAl'f'O
cv,20, cv,,:c,t MNOOIJ:.AOot Po01'f
c;.�ricl, ,..oo1...og1, GUO -.0G6PO
.........
__
Glipc,u ,..oo1...og1, GUO -..GOPO
e:noocnl'10logt, GUO -.,G6PO
_
��tt,·,I
.......
90..A!t.1 OOtnosorN N.tatffl.l po:ttM:I
,OC.,ll lt�IO 9fl'\
--
..,.,,,.
PIIPJLl•POGPU ""' "' 40Gif'fto rusíon � (O o,a otld,}
__
LIW:ot
Loffil'"'.lp!CUI
º"'°'•
tnooo,l'IClio,',
t::A.1. PGIII
I.DU<
P,«tCl':Ot l'IOffl'ION po,::Í".NO
L0tA fflUUCion hOm O Cl ; O IO
!n•.,,.,,"°'° Íli'tt«W...,
""'"'""'
MtrQPlopul'IN 0"'°'°9'�
GUO
TPMT
Oriotnól G6PO
TPMT Mtuboc:tcrot i.rutmwcio o poatt
..., ,_
A..,_.
dt Mtt.�
M�iffilCli
,..,,,
nttnr.:OIIC)QC, GUO
CYl1!U-4
Ofr.otr.N G,6,0
tlAOW cfl'.iolno.t 0t0eromo os "1C!l.letr_.,
� CYP.?06 �J06 ,...,tu�OOt poort
-·- -��·�,o,• ��°"'
··�
l!IQ90fCÍON � f"Wal • ti!;. 1,.1,il
� ,pry;"
Collaboration in
---
� fl!W'.OS.<d.a!: � ..
...j-�. .....
,11,.. Nt,4 •ncfrJ q ¡ ,.�
- ..............
'*"""'°JI u ""'°'
� ce,i 1liil!J � � •
me. �4gdior,n
Jlll!•�tt;IJ(CIW .....;&IMQ.
�
M:pQ:.WWW--lllllfW........>>Cl!nNIO'i
nw:��e'N'OQ'
�.,.._....
-- - -
thlPf\MC,.C,,,,M,s NSO �.JiboÍfl.ali!íicl..., tMliN- aNtQ,. ...�p¡I�
.&tft�Q� � llll'ICllflO,..-,.. .......
e,.. ir ••• N10 °"'11 �"'*'6,,+.,..r.-11•.M_,.. ��
....... k lk !'tW"� - �«ID ....""""'-·'�
1000 fll"O"N'- � � ffl le
�pol'KOIIII�
...._,..,
J,,0,,;,¡o¡ OM•••in�e,� �11Mf41,11kf!#'
... .
- ,......�OOGIMS-�I·..
•........,__,, ........ UOll � .....--
"' �
....,.,ltil'l�OltflQll&l:CSl'I-J..Oo- �..,,
1'tiOS'h•� .......��
,.,._ .. SM't,�M.\S ��
-- -
a.:. • ..._ a1111 �•uc.,q ·�•
"'b'..-oc-we111NC11r-�o�pc,,
°""' -- ,
ll'W'I. --� .-
ftl'IIAIOM '"'"' '; 1
�
-
a.:.. O.. OltlHCalJ� do J!llprf.�
�:n.MOn
&r..-
� G,,iar;
* � ...j,...._
� - .......__,ffl �
M:pct."""""�
.-,
,uyy ,.... pr<t:I ., 114 � ....
-
h::.11tO*'•�Clfnocit.� �
--
�W""t ; Je4 ! IN�
._. .... ffl � _._....,.. �
This tlblf: aun, to seeve AS .t g.wc» to t..lp !M'i«t h best ttthno&ogy for ltw probWfn .al h.and. +-+- indirc1tbn,
tht � ICllft! on dv � .+- indlNie a good .!«ft... in:l� a Nd seeee. • • indlc-.a� the wON.I sciW
on lfw pw.mttm,.. Ocpmcbng on tfw: spocd"K pu.rpo5't. thr "'"°'ltiht ol h p.u-.unetien i.n th.l !Jielt>Clion ol
""'"l'f'"'PÑle l«hnology ...y 'M)·
,.... ,
PC,
WES wcs \\'CS
+¡..
+
+
+
•1-
+!-
• .. ++
.,.
++
.............. •1- NA NA
Co\a,g,tol
l'Cl- ,-..na,.on + .,. ++ +¡. ++ ++
+ + .,. ++
°"«tti:w\al
\MiM'IIJ
oubl6C'N .¡+ .¡+
ptt<itfinNI
......
s-1'6Nnl
+ +¡. •
.. • +¡.
••
' fbr �V ,-,.b. i1 a te • :..d lkv: dw VUW1b - fft'W"* in lhe � ,..uvm pinrl.. • A ..hort. tunwound tsmt"
N lfldowd by lfw + 1 l..owff CNb aft" ind..ic.tttJ by llw -..•
Tecnologías usadas • VeraCode ADME core panel (Illumina Inc. San
para la determinación Diego, CA, USA)
de genes asociados a
variaciones de • Consiste en 184 variante en 34 farmacogenes
respuesta a los
fármacos
Ensayo comerciales
Flgure 2: Fast, Slmplifled Workflow
Q) • Incubaban � 5 min
,.,_
--·
32DHA
....
S8mf)IH
•••• •• ••
•
....
•• .. ....••••••••••• .•••••.•••.••••••..
NOOH ....
••••
••••
••••
•
. •
•• Reerl�_
--,..•,::::
WMh
....
·-·
···••••
..• •••-..
::::
• •••
Pro-PCR (2 br 15 IIWI)
..... ••.••••••..
....
....
....
.... ... .
•••• . ... (9
- -
.... .::::�
.... •••• ... ......
.... ....
*-
seee
.
•••• .....
.... ...
-·· •••• ··-f
Posl4'CR (5 tw 15 mln)
U!iing 1tw Ve1-aCcde AOME Cor& Panel. 32 samplaa &r1 be pioc S?d ps n..n.. "'1 nllll tCU'1dd pnw ..:ena.o, • 1.-d 10 iarget f9f:IIO"I& ot inlln6t into
threeop11miled assa¡ pool! umng �ed pr.nw mulN, Pro:b:15 we mol::dM orm � � ftr a i58ll ..-C ....gpec:¡llc e,;l8nlllcn .-xi
lgabon k>lowed by� PCR wnpllflca1iort A tingle pl¡t_e ir...� •tvikd ffllllr9 IO VnCodl c-ia b t,,bu;taoon and acamang on the
BesdXpr...- Awlalr ll-e lD!.11 aSU'\' llllW ll <1;8 hcua wth 2.6 haln Ol *11ielf tara-on WN 0'1I t8ctndat an proQ111, w to fWO *9 � far
64 l.ln!PIOI,
Tecnologías usadas • A diferencia de los ensayos comerciales, los ensayo
para la determinación predeterminados están diseñados por grupos de
de genes asociados a expertos, que han desarrollados o modificado una
variaciones de metodología para un tipo de investigación especifica.
respuesta a los
fármacos • Es decir esto ensayos tienen su origen en el ámbito
de la investigación.
NGS
ES NECESARIO COMPLEMENTAR NGS CON
HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS PARA
PROCESAR DATOS.
NGS NEXT GENERATION SEQUENCING
-e D
.,,,.-
-
---
--- -
D
-----
,,
---
e -..,º...--
J \._
OTRAS TECNOLOGIAS Y CONSIDERACIONES
• NHS, 2021
Bibliografía
• Han, S.M.; Park, J.; Lee, J.H.; Lee, S.S.; Kim, H.; Han, H.; Kim, Y.; Yi, S.; Cho, J.Y.; Jang, I.J.; et al. Targeted Next-Generation Sequencing for
Comprehensive Genetic Profiling of Pharmacogenes. Clin. Pharmacol. Ther. 2017, 101, 396–405. [CrossRef]
• Hao, D.; Xiao, P.; Chen, S. Phenotype prediction of nonsynonymous single nucleotide polymorphisms in human phase II drug/xenobiotic
metabolizing enzymes: Perspectives on molecular evolution. Sci. China Life Sci. 2010, 53, 1252–1262. [CrossRef] [PubMed]
• National Institute of Health. AllofUs Research Program. Available online: https://allofus.nih.gov/ (accessed on 23 October 2020).
• Caspar, S.M.; Schneider, T.; Meienberg, J.; Matyas, G. Added Value of Clinical Sequencing: WGS-Based Profiling of Pharmacogenes. Int. J.
Mol. Sci. 2020, 21, 2308. [CrossRef] [PubMed]
• Qiao, W.; Yang, Y.; Sebra, R.; Mendiratta, G.; Gaedigk, A.; Desnick, R.J.; Scott, S.A. Long-Read Single Molecule Real-Time Full Gene
Sequencing of Cytochrome P450-2D6. Hum. Mutat. 2016, 37, 315–323. [CrossRef] [PubMed]
• Twist, G.P.; Gaedigk, A.; Miller, N.A.; Farrow, E.G.; Willig, L.K.; Dinwiddie, D.L.; Petrikin, J.E.; Soden, S.E.; Herd, S.; Gibson, M.; et al.
Constellation: A tool for rapid, automated phenotype assignment of a highly polymorphic pharmacogene, CYP2D6, from whole-genome
sequences. NPJ Genom. Med. 2016, 1, 15007. [CrossRef] [PubMed]
• Lee, Maaike van der, Marjolein Kriek, Henk Jan Guchelaar, y Jesse J. Swen. 2020. «Technologies for pharmacogenomics: A review». Genes 11(12): 1-16.
• https://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-98872017000400009&lng=en&nrm=iso&tlng=en
• https://www.illumina.com/documents/products/datasheets/datasheet_veracode_adme_core_panel.pdf
GENÉTICA Y NUTRICIÓN
Dra. Lourdes A. Pazmiño
• De acuerdo a autores, Bourges, “el estado nutricional es un fenotipo
resultado de la interacción entre la informaión genética de cada
persona, su medio físico, biológico, emocional y social. Los factores
ambientales involucrados en la homeostasis del organismo son varios,
desde la dieta (enfermedades crónicas)…..De esta manera, la salud o
1 la enfermedad dependen de la interacciónn entre la genética y el
medio, que da lugar al fenotipo”
'
'
• Los estudios del proyecto del Genoma Humano, el genotipado, la
transcriptómica, la proteómica y la metabolómica han permitido el
estudio y aplicación de la genética a la nutrición.
• Se puede hablar de bionutrientes.
• La influencia de los PM en el metabolismo de los nutrientes.
'
crónicas.
• La Nutrición Molecular: interacciones genes-nutrientes.
• La Genómica Nutricional se clasifica en Nutrigenómica y
Nutrigenética.
• La diferencia entre estas dos disciplinas es su objeto de estudio.
• El estudio de la influencia de los nutrientes en la expresión de genes:
1 NUTRIGENÓMICA.
• Conocer la influencia de las variaciones genéticas en la respuesta del
'
organismo a los nutrientes: NUTRIGENÉTICA.
'
• Los componentes de la dieta pueden incidir en cambios en la
expresión genómica de manera directa o indirecta.
• Pueden actuar como ligandos par ala activación de factores de
transcripción que permiten la síntesis de receptores.
• Intervenir en el metabolismo de rutas metabólicas para incidir en la
concentración de sustratos o intermediarios.
1 • Participar en las rutas de señalización de modo positivo o negativo.
'
'
• Los factores ambientales juegan un papel importante en el desarrollo
de enfermedades metabólicas, y se define como la
NUTRIEPIGENÓMICA, que permite ampliar los conceptos de
nutrigenómica y nutrigenética.
• Estudia los efectos de los nutrientes y los alimentos sobre la salud
humana a través de las modificaciones epigenéticas.
1 • Las alteraciones epigenéticas permiten cambios en la función y
expresión de los genes sin relacionarse a los polimorfismos.
'
'
• Los desequilibrios nutricionales o alteraciones metabólicas
(desarrollo) pueden producir cambios epigenéticos con cambios
permanentes en la expresión de ciertos genes que alteren la
estructurao función de tejidos y órganos, dando una predisposición a
la enfermedad.
• Los cambios epigenéticos pueden ser heredables y presentarse por
1 factores dietéticos y ambientales.
• Estas modificaciones son potencialmente reversibles.
'
• La detección precoz de estas improntas puede ayudar en la
'
prevención de la enfermedad.
NUTRICIÓN PERSONALIZADA
• Los macro como los micronutrientes influyen en los diferentes
procesos metabólicos, celulares y moleculares como el ADN y la
expresión génica.
• Esto permite, directa o indirectamente, el desarrollo o prevención de
enfermedades asociadas a la nutrición.
• La nutrigenómica analiza la capacidad de los nutrients para controlar
1 los mecanismos moleculares de la expresión de los genes, mientras
que la nutrigenética se refiere a los procesos en los cuales la
'
NUTRIGENÉTICA
• Se basa en el estudio de los efectos de las variaciones genéticas entre
individuos en respuesta a los nutrientes de la dieta.
• Estudia el comportamiento de nuestro cuerpo a los diferentes
nutrientes de acuerdo a nuestro perfil genético individual.
• Se basa en los polimorfirmos asociados a las enfermedades
relacionadas con la nutrición.
1 • Son ejemplos:susceptibilidad para metabolizar ciertos alimentos o a
desarrollar ciertas enfermedades.
'
• Se debe determinar el perfil genético nutricional del paciente.
'
• Se identifican y caracterizan las variantes genéticas asociadas con las
diferentes respuestas a los componentes de la dieta y con el riesgo de
producir enfermedades.
• Se han estudiado las respuestas de los SNPs, CNV, repeticiones de
nucleótidos, inserciones/deleciones, longitud de los telómeros.
• Tipificación de biomarcadores nutrigenéticos para una dieta
1 específica y estilo de vida adecuado (obesidad, resistencia a la
insulina, diabetes mellitus tipo 2, hiperlipidemias y enfermedades
'
• Los AG se metabolizan mediante la beta-oxidación y, cuando se
presenta una alteración en el balance energético intracelular se
puede alterar indirectamente la expresión genética a través de
cambios en la homeostasis del dinucleótido de niconinamida y
adenina (NAD) cuya reoxidación está ligada a la CTE e interviene en
1 las proteínas involucradas en la remodelación del cromosoma.
'
'
Gen MTHRF
• La variante polimórfica rs 1801133 del gen MTHRF, que codifica la
enzima: 5,10-metilentetrahidrofolatoreductasa (metaboliza al ácido
fólico y su variante con actividad reducida producida por el P).
• El ácido fólico descompone a la homocisteína.Produce un incremento
en la concentración de homocisteína
• Esto produce un incremento en el riesgo de cardiopatía inquémica.
1 • Es así que esta variante en homocigotos indica necesidades
nutricionales específicas.
'
'
NUTRIGENÓMICA
• Se refiere al estudio de los efectos que los nutrientes o componentes
de la dieta tienen sobre el genoma, el proteoma y el metaboloma.
• Estudia el conjunto de genes, proteínas y metabolitos del organismo.
• Considera la forma en la que los nutrientes de la dieta pueden afectar
a la expresión genética.
'
'
POLIMORFISMOS GENÉTICOS RELACIONADOS
CON LA INGESTA Y LA CONDUCTA ALIMETARIA
• Gen FTO
• Fat mass obesity associated gene.
• Está relacionado con la masa grasa y la obesidad; saciedad
• Se localiza en el cromosoma 16
• Codifica una proteína nuclear que es una desmetilasa de ácidos
nucleicos, para reparar el ADN y regulación del almacenamiento de
1 lípidos y del tejido adipose.
• Su polimorfismo está asociado con mayor índice de masa grasa
'
'
Gen de leptina
• Hormona sintetizada principalmente por el tejido apidoso.
• Modula el apetito.
• Mutación produce hiperfagia.
1
'
'
Gen SLC2A2
• Transportador de glucosa facilitado
• Produce el paladar dulce.
• Gen polimórfico
• Codifica la proteína GLUT4, transportador de glucosa regulado por la
insulina.
1
'
'
Gen Enzima AcetilCoA carboxilasa (ACC)
• Comen mucho y no engordan.
• Interviene en la síntesis de ácidos grasos.
• Los portadores de su PM tienen menos grasa, comen más y pesan
menos que quienes tienen el gen normal.
• La deficiencia de la ACC produce un aumento del malonilCoA que
1 bloquea el ingreso de los AG a la mitocondria, impidiendo su
oxidación.
'
• Estos genes pueden presentar diferentes PM o estén epigenetizados y
tengan efecto similar.
'
LA NUTRICIÓN PERSONALIZADA
A TRAVÉS DE LA EPIGENÓMICA
Resumen Abstract
En el futuro, la nutrición personalizada será una de las bases In the future, personalized nutrition will be one of the corners-
de la prevención y el tratamiento de las enfermedades. Hasta tones of prevention and treatment of metabolic diseases. Until
ahora se ha hecho mucho énfasis en los polimorfismos que now, much emphasis has been done on the polymorphisms that
incrementan el riesgo a sufrir alguna patología metabólica o increase the risk of suffering a metabolic or nutritional patholo-
nutricional. Sin embargo, la nutriepigenética podría ayudar a gy. However, nutriepigenetics could help to explain the mecha-
explicar los mecanismos no dependientes de la secuencia ge- nisms non-dependent of gene sequence by which nutrients and
nética por los que los nutrientes y otros factores ambientales other environmental factors contribute to modulate gene expres-
contribuyen a modular la expresión génica y el desarrollo de sion and disease development. The main epigenetic mechanisms
enfermedad. Los principales mecanismos epigenéticos son las are covalent modifications of histones, DNA methylation, and
modificaciones covalentes de las histonas, la metilación del non-coding RNAs, such as miRNAs. The epigenetic changes in-
ADN y los ARN no codificantes (como los miRNA). Estos duced by the environmental factors appear to be particularly
cambios epigenéticos inducidos por factores ambientales pa- important in the perinatal period, but they can also occur in
recen ser especialmente importantes en el período perinatal, the adulthood. They can also be inherited. Among the nutritio-
aunque también se dan en la edad adulta. También pueden nal factors that have been linked to epigenetic modifications we
ser heredados. Entre los factores nutricionales que han sido find methyl donors, diets with excessive or deficient amount of
vinculados a modificaciones epigenéticas, están los grupos proteins or calories, some fatty acids, minerals and vitamins, as
donantes de metilo, la ingesta excesiva o deficiente de proteí- well as plant compounds such as polyphenols, isothiocyanates,
nas y calorías, algunos ácidos grasos, minerales y vitaminas, isoflavones and catechins. One of the most interesting charac-
así como compuestos de origen vegetal, como polifenoles, teristics of the epigenetic marks is that they may be partially
isotiocianatos, isoflavonas y catequinas. Una de las carac- reversible. Therefore, one of the major goals in this field is the
terísticas más interesantes de las marcas epigenéticas es que development of drugs or dietary treatments (for example, the
podrían ser parcialmente reversibles. Por ello, uno de los prin- «epigenetic diet») that may slow or even reverse these epigenetic
cipales objetivos en este campo es el desarrollo de fármacos o changes and, therefore, prevent disease development. The other
la implementación de tratamientos dietéticos (por ejemplo, important objective here is to identify early biomarkers of di-
la «dieta epigenética») que podrían retrasar o incluso revertir sease that could be used to implement individualized preventive
estos cambios epigenéticos y, por lo tanto, evitar el desarrollo treatments in the subjects with higher metabolic risk.
de enfermedad. El otro objetivo importante en este campo
es la identificación de marcadores tempranos de enfermedad
que permitan implementar tratamientos preventivos indivi-
dualizados en los individuos de riesgo metabólico.
1. Nutrición personalizada
En los últimos años el concepto de nutrición «personalizada» está ganando relevancia en
el campo de la salud. La evidencia científica indica que tanto los macro como los micronu-
trientes son capaces de influir sobre diferentes procesos metabólicos, celulares y moleculares,
incluyendo la estructura del ADN y la expresión génica, lo que pueden contribuir, directa
o indirectamente, al desarrollo o la prevención de numerosas enfermedades asociadas a la
nutrición. Este campo es estudiado principalmente por la nutrigenómica, que analiza la capa-
cidad que tienen los nutrientes para modular los mecanismos moleculares, que subyacen a las
funciones fisiológicas del organismo, en especial la expresión de los genes.
Sin embargo, a la hora de avanzar hacia una nutrición personalizada, la mayor parte de la
investigación se ha centrado en el campo de la nutrigenética, que es un ámbito científico que
trata de comprender aquellos procesos donde la secuencia genética de un individuo influye en
su respuesta a la dieta. Esta ciencia se centra en la identificación y caracterización de las variantes
genéticas asociados con respuestas diferenciales a los nutrientes y con el riesgo a desarrollar
enfermedad. Entre estos cambios genéticos, aparte de los polimorfismos de nucleótido simple
(SNP), que afectan a una única base nucleotídica, también se encuentran las variaciones del
número de copias (CNV), repeticiones de nucleótidos, inserciones y deleciones, así como la
longitud de los telómeros. Un objetivo de este área de investigación es la tipificación de bio-
marcadores nutrigenéticos que permitirán promover una dieta y un estilo de vida óptimos para
cada individuo a la hora de prevenir el desarrollo de determinadas enfermedades, en especial
obesidad, resistencia a la insulina, diabetes mellitus tipo 2, hiperlipidemias y enfermedad car-
diovascular. Los estudios de asociación del genoma completo (GWAS en inglés) han permitido
identificar las variantes genéticas más estrechamente ligadas al desarrollo de enfermedades
(Bradfield, 2012; Hale, 2012). Sin embargo, estos estudios solo son capaces de explicar un
pequeño porcentaje de la variabilidad genética respecto a las enfermedades metabólicas.
Ante la evidencia del papel que juegan los factores ambientales en el desarrollo de estas
patologías, en los últimos años se ha acuñado un nuevo término, la nutriepigenómica, que
permite ampliar los conceptos de nutrigenómica (cómo los nutrientes influyen en la expresión
de los genes) y nutrigenética (cómo la secuencia genética condiciona la respuesta individual a
determinados nutrientes) y que estudia los efectos de los nutrientes y los alimentos sobre la
salud humana a través de las modificaciones epigenéticas. Estas modificaciones epigenéticas
son cambios heredables en la función y expresión de los genes, que se producen sin alterar la
secuencia primaria del ADN, es decir, sin asociarse a polimorfismos. Esta aproximación ha
demostrado que, si se producen desequilibrios nutricionales y alteraciones metabólicas durante
determinados momentos críticos del desarrollo, las alteraciones epigenéticas resultantes pue-
den dar lugar a cambios permanentes en la expresión de determinados genes que afecten a la
estructura o función los tejidos y órganos, predisponiendo así a la enfermedad. Aunque esos
cambios epigenéticos pueden ser heredables, hay tres conceptos que hacen muy interesante el
estudio de la epigenética:
1) El primero es que los fenómenos epigenéticos parecen representar uno de los meca-
nismos principales por el que los factores dietéticos y ambientales pueden alterar la
expresión de los genes y el metabolismo a largo plazo, explicando así algunos proble-
mas desarrollados en la edad adulta, cuyo origen procede de edades más tempranas o
incluso en comportamientos atribuibles a los padres o abuelos.
2) El segundo es que las modificaciones epigenéticas son potencialmente reversibles, lo
que abre la puerta a nuevas terapias dietéticas o farmacológicas enfocadas a su modi-
ficación, tanto en la infancia como en la edad adulta.
3) El tercero es que la detección precoz de esas marcas epigenéticas alteradas puede ayudar
a un diagnóstico precoz de la enfermedad o, aún mejor, a una temprana actuación
preventiva previa a su desarrollo. Esto último se representa en la Figura 1, junto con
los demás tipos de biomarcadores que se están abordando en nutrición.
Dieta
I
Nutrigenética
I
Nutriepigenética
I
Nutrigenómica
I
Proteómica
I
Metabolómica
I
Mategenómica
Biomarcadores
2. Modificaciones epigenéticas
Entre los mecanismos generales epigenéticos que regulan la expresión de los genes se
incluyen la impronta genética o imprinting, el efecto de la posición, marcadores de tipo book-
marking, la inactivación del cromosoma X, el silenciamiento de genes, la reprogramación,
algunos efectos maternos, la metilación del ADN, modificaciones covalente en las histonas,
cambios que afectan al plegamiento de la cromatina (eucromatina vs. heterocromatina) o a
la preservación de la estabilidad de los cromosomas, y, en general, todos aquellos fenómenos
que afectan a los patrones de expresión génica sin alterar o venir mediados la secuencia del
ADN (ARN no codificantes, transposones, chaperones, etc.). Los mecanismos más estudiados
son los ARN no codificantes, las modificaciones covalente en las histonas y la metilación del
ADN. Estos procesos son responsables de la mayoría de las diferencias observables entre geme-
los monocigóticos, o de explicar el modo en que las células o tejidos portadores de la misma
secuencia de nucleótidos pueden generar diferentes tipos celulares y diferentes respuestas bajo
la misma exposición a hormonas y nutrientes.
La bibliografía científica describe varios tipos de ARN no codificantes, entre los que se
encuentran los Long intervening noncoding RNAs (lincRNA), Long non-coding RNAs (lncRNAs)
o los Circular RNA (circRNA). Todos ellos tienen en común que no codifican para proteínas
y que, aunque sus funciones no son todavía bien conocidas, parecen jugar un papel en la re-
gulación de la expresión génica. Los más acreditados entre ellos son los microARN (miRNAs),
que son moléculas pequeñas de ARN no codificante (de alrededor de 22 nucleótidos) cuya
función es el silenciamiento del ARN mensajero y la regulación post-transcripcional de la
síntesis de proteínas. Numerosos estudios han encontrado que los miRNA desempeñan un
papel importante en el desarrollo de enfermedad (desde diversos tipos de cáncer hasta la en-
fermedad cardiovascular y la obesidad) y tienen gran potencial como biomarcadores e incluso
como agentes terapéuticos. Además, los factores dietéticos parecen desempeñar un papel muy
importante en la regulación de algunas de estas moléculas (Ross, 2014).
Las histonas, que son las proteínas encargadas del empaquetamiento del ADN y de for-
mar la cromatina, están sujetas a una amplia variedad de modificaciones postransduccionales
incluyendo la acetilación de lisinas, metilación de arginina y lisina, fosforilación de serina y
treonina, o ubiquitinación y sumoilación de lisina. Estas transformaciones ocurren princi-
palmente dentro de las colas amino-terminal de las histonas que sobresalen de la superficie
del nucleosoma, así como en la región del núcleo globular (Cosgrove, 2004). Estas modifi-
caciones de las histonas pueden afectar a la función de los cromosomas a través de al menos
dos mecanismos. El primer mecanismo sugiere que las modificaciones pueden alterar la carga
electrostática de la histona, resultando en un cambio estructural de las histonas o de su unión
al ADN. El segundo mecanismo implica que estas modificaciones son sitios de unión para
módulos de reconocimiento de proteínas, tales como los bromodominios o cromodominios,
que reconocen, respectivamente, a las lisinas acetiladas o metiladas. Ambos mecanismos in-
fluyen en la regulación de la expresión génica a través del reordenamiento de la cromatina y
la formación de heterocromatina.
La metilación del ADN tiene lugar en citosinas que se convierten en 5-metilcitosinas por
mediación de la enzima ADN metiltransferasa (DNMT). Los residuos de citosina modificadas
están generalmente situados junto a una guanina (dinucleótido CpG), lo que, dada la natu-
raleza de doble hebra del ADN, da lugar a dos residuos de citosina metilados que se sitúan en
diagonal, uno al lado del otro, al oponerse las hebras complementarias de ADN. Diferentes
miembros de la familia de enzimas DNMT regulan estos procesos, ya sea las DNMT de novo,
introduciendo el patrón inicial de grupos metilo sobre una secuencia de ADN donde antes
no había metilación, o las DNMT de mantenimiento, copiando el patrón de metilación de
una cadena de ADN pre-existente después de la replicación celular. En la actualidad no se
conoce bien la función exacta de la metilación en citosinas sobre la expresión génica, pero
parece que una adecuada metilación del ADN es esencial para la diferenciación celular y el
desarrollo embrionario, así como para la regulación de la expresión génica en los diferentes tipos
celulares. Algunos estudios sugieren que el grupo metilo puede interferir directamente con la
unión al ADN de los factores de transcripción que activan la transcripción. En la mayor parte
de los casos, los genes que están altamente metilados (especialmente en su región promotora)
tienden a estar más empaquetados, lo que conduce a una reducción de su expresión. Los genes
con menor mutilación tienden a exhibir un empaquetamiento más flexible, lo que facilita su
expresión. También la metilación del ADN en regiones no promotoras puede desempeñar
diversas tareas funcionales. Por ejemplo, la metilación del ADN de las regiones intragénicas
puede regular la expresión génica al funcionar como promotores alternativos. Sin embargo, la
correlación entre la metilación del ADN de las regiones intragénicas y la expresión de genes
no está clara, ya que se han obtenido resultados contradictorios en diferentes células y tejidos
(Esteller, 2002). El estudio de la metilación del ADN como origen o biomarcador de enfer-
medad está muy avanzado en cáncer. Por ejemplo, la hipermetilación de las islas CpG en las
regiones promotoras de los genes supresores de tumores es un evento que está en el origen de
muchos tipos de cáncer (Esteller, 2008).
Por desgracia, actualmente existe una baja correlación entre los marcadores epigenéticos
obtenidos a partir de diferentes plataformas o incluso desde la misma plataforma. La norma-
lización de estos ensayos es un reto para el futuro.
detectar los individuos con mayor riesgo; identificar los factores ambientales relacionados con
la obesidad, que podrían modular la expresión génica al afectar a los mecanismos epigenéticos;
y desarrollar nuevas estrategias terapéuticas basadas en agentes nutricionales o farmacológicos
que pueden modificar las marcas epigenéticas. En este sentido, las principales tareas serían
(Martínez, 2014):
Tomando como modelo los estudios de tipo GWAS, los estudios de asociación de epige-
noma completo o EWAS ofrecen la oportunidad de descubrir nuevos mecanismos moleculares
que influyen en la enfermedad humana. Un elegante estudio recientemente publicado en la
revista Lancet (Dick, 2014) ha mostrado que el incremento en el índice de masa corporal en
los adultos de origen europeo se asocia con un aumento de la metilación en el locus HIF3A
en las células sanguíneas y en el tejido adiposo. Estos hallazgos no solo permitieron identificar
con bastante certeza un marcador epigenético (la metilación de HIF3A), sino que sugieren que
la desregulación de la vía metabólica del factor de transcripción inducible por hipoxia (HIF)
podría tener un papel importante en la predisposición al incremento de peso en humanos.
Sin embargo, dado que las marcas epigenéticas pueden ser diferentes según el tipo celular
(incluso entre los diferentes tipos de leucocitos, por ejemplo) y a que además pueden variar
como consecuencia de la enfermedad (al contrario que ocurre en los GWAS), se aconseja
precaución con respecto a la inferencia causal de los cambios epigenéticos identificados, ya
que además no es posible comparar estudios realizados con diferentes tipos de muestra dada
la heterogeneidad celular del material de partida (Paul, 2014). El mejor enfoque, en este caso,
no sería comparar sujetos obesos frente a no obesos, o diabéticos frente a normoglucémicos,
ya que sería imposible determinar si dichas marcas son producto de la enfermedad o alguna de
sus complicaciones (hiperglucemia, inflamación, estrés oxidativo), de algunos nutrientes que
son más o menos frecuentes en la dieta de las personas con enfermedad (algunos ácidos grasos,
vitaminas, grupos donantes de metilo), debidos a la exposición a otros factores ambientales o a
la herencia. Lo ideal sería estudiar las marcas epigenéticas de un mismo individuo a lo largo de
su vida, tomando muestras en varios momentos de su vida, en la infancia y, sobre todo, antes
y después de desarrollar enfermedad, y asociando esas marcas a todos los factores ambientales
posibles. Un interesante ejemplo de esta orientación es un estudio que ha observado que el
estado de metilación del gen de la propiomelanocortina (POMC) en la sangre del cordón
umbilical puede ser un marcador predictivo precoz de desarrollo de síndrome metabólico en
el futuro. Tras estudiar los patrones de metilación de muchos genes en el ADN de la sangre del
cordón umbilical, los autores observaron que una alta metilación en POMC estaba asociada a
un menor peso al nacer y que, 7-9 años después, esos mismos niños presentaban niveles más
altos de triglicéridos y de insulina en sangre (Yoo, 2014).
sensibilidad a la insulina que persistió a través de dos generaciones a través de ambos linajes,
maternos y paternos (Dunn, 2011). Sin embargo, el examen de la progenie de la tercera ge-
neración reveló que solo las hembras mostraban el aumento de tamaño corporal y, que este
efecto se transmitió solo a través de la línea paterna, indicando que el efecto epigenético se va
diluyendo con el paso de las generaciones. Estos resultados sugieren que la mayor parte del
efecto transgeneracional se debe a que la dieta de la madre durante la gestación altera, no solo
las marcas epigenéticas de las células somáticas del hijo, sino también las marcas de las células
germinales del mismo, que de esa forma llegarán a pasar a los eventuales nietos.
En este sentido, se ha evidenciado una herencia de marcas epigenéticas por vía paterna.
Por ejemplo, el perfil epigenómico del hígado de ratones macho descendientes de padres que
consumieron una dieta baja en proteínas revela numerosos, aunque modestos, cambios en el
porcentaje de metilación del ADN, lo que podría estar relacionado con cambios en el metabo-
lismo del colesterol y los lípidos en la descendencia (Carone, 2010). En otro ensayo coetáneo
se demostró que, si los padres recibían una dieta con alto contenido en grasa, se producía una
disfunción en las células β de la descendencia femenina, que iba acompañada de alteraciones
en la expresión de 642 genes de los islotes pancreáticos en la edad adulta. Además, esta investi-
gación observó una hipometilación en el gen Il13ra2 que se correlacionaba con un aumento de
la expresión de dicho gen de 1,76 veces (Ng, 2010). En definitiva, estos estudios demuestran
que las marcas epigenéticas, que han sido modificadas en el transcurso de la vida, pueden ser
transmitidas a las siguientes generaciones tanto por vía materna como por vía paterna. Estos
resultados sugieren que sería interesante controlar la ingesta y los demás factores ambientales,
no solo en las madres, sino también en los padres, especialmente en el periodo de tiempo de
maduración de los espermatozoides que tienen posibilidad de fecundar a los óvulos.
se supone le esperan. Varios estudios describen que los mecanismos epigenéticos se pueden
modular en respuesta a factores dietéticos maternos y que, además, pueden estar implicados
en la susceptibilidad al desarrollo de obesidad y sus comorbilidades en la edad adulta (Zheng,
2014). Por ejemplo, el ácido fólico y otros agentes donantes de metilo, la cantidad y tipos de
grasa y proteínas y la energía total de la dieta materna inducen, en la descendencia, altera-
ciones en la regulación epigenética de genes específicos, que afectan a las interacciones entre
los nutrientes y el genoma, y que parecen estar relacionadas con modificaciones en el riesgo
a sufrir distintas enfermedades (Burdge, 2012). En un ejemplo muy ilustrativo en ovejas que
sufrieron desnutrición materna moderada, se demostró una disminución en los niveles de
metilación de los genes de POMC y del receptor de glucocorticoides en el hipotálamo fetal, lo
que potencialmente podría conducir al descontrol del balance energético a largo plazo. Estos
cambios se asociaron con una disminución de la actividad de la enzima ADN metiltransferasa
y alteraciones en la metilación y acetilación de las histonas (Begum, 2012). Hay muchos más
ejemplos que apoyan que los desequilibrios de la dieta materna inducen cambios epigenéticos
en la descendencia, que pueden durar hasta la edad adulta y que, incluso, pueden transmitirse
a las siguientes generaciones. Estos hallazgos sugieren que es necesario controlar aún más la
dieta de las madres durante el periodo de maduración del óvulo, el embarazo y la lactancia,
para tratar de que no se produzcan cambios epigenéticos, que puedan incrementar el riesgo a
sufrir enfermedades metabólicas en la descendencia. Sin embargo, al ser una época de difícil
intervención, hacen falta muchos más estudios en animales y mejorar los estudios observa-
cionales en personas.
de inducir inflamación local o sistémica de bajo grado (Solinas, 2010). Por otra parte, en la
mayoría de los estudios las personas con diabetes tipo 2, síndrome metabólico u obesidad
presentan respuestas inflamatorias más pronunciadas y duraderas en respuesta a un estrés me-
tabólico que los controles metabólicamente normales. El código epigenético implicado en la
regulación de la expresión génica se ve modificado durante la inflamación crónica (Milagro,
2013). La posibilidad de modular el estado de metilación de genes inflamatorios mediante la
ingesta de diferentes compuestos naturales está recibiendo mucha atención, como un medio
para proteger o mejorar enfermedades que cursan con un incremento de marcadores infla-
matorios. Sin embargo, existe preocupación por la posibilidad de que el uso de inhibidores
o activadores de enzimas epigenéticos (DNMT, metilasas y desmetilasas histonas, HDAC)
careciera de suficiente especificidad, especialmente en tratamientos a largo plazo, y podría
dar lugar a efectos secundarios indeseables. En este sentido, a fin de ampliar las posibilidades
de intervención terapéutica anti-inflamatoria, sería necesaria la búsqueda de nuevas dianas
epigenéticas destinadas a la modulación selectiva de la red de señalización inflamatoria en los
órganos afectados. En este sentido, los miRNA y lncRNA podrían ser candidatos prometedo-
res, especialmente porque muestran una clara especificidad por la secuencia diana y podrían
representar la conexión directa entre el genoma y el epigenoma.
Otro de los factores que en los últimos años parece haber adquirido gran importancia en
la predisposición a desarrollar enfermedades metabólicas es la composición de la microbiota
intestinal. En este sentido, cambios en la microbiota intestinal que llevan aparejados cambios en
los componentes de la pared celular, como los receptores de tipo Toll-like como TLR2 y TLR4,
están implicados en la regulación epigenética de las reacciones inflamatorias. Por ejemplo, los
niveles de metilación de ambos TLR se correlacionaron significativamente con el índice de masa
corporal en un estudio llevado a cabo en pacientes diabéticos y obesos (Remely, 2014). En ese
mismo estudio, la metilación de siete CpG en la región promotora de TLR2 fueron significa-
tivamente menores en los diabéticos de tipo 2 que en los obesos y los controles, mientras que
cuatro CpG en el primer exón de TLR4 mostraron menor metilación en los individuos obesos.
Estos datos sugieren que una dieta, dirigida a mejorar el equilibrio microbiano intestinal y a
inducir cambios epigenéticos en genes pro-inflamatorios de la mucosa intestinal, puede ser
eficaz en la prevención del síndrome metabólico y enfermedades intestinales.
Por otra parte, en la mayor parte de los tejidos de los sujetos obesos y diabéticos parece
existir un exceso de estrés oxidativo, que es resultado de un desequilibrio entre mecanismos y
agentes oxidantes y antioxidantes endógenos y exógenos. El estrés oxidativo no solo es causante
de daño en el ADN, sino que también aumenta la producción de la histona acetiltransferasa
p300 y provoca alteraciones en las histonas desacetilasas, incluyendo las de clase III o sirtui-
nas. Además puede provocar cambios importantes en los patrones de expresión de numerosos
miRNA, que podrían estar en el origen del desarrollo de complicaciones crónicas asociadas
a la obesidad y la diabetes (Feng, 2013). Por otra parte, estos ajustes podrían ser parte de un
círculo vicioso, ya que el mal funcionamiento de los mecanismos epigenéticos podría a su
vez resultar en un incremento del estrés oxidativo. En este sentido, diversos estudios están
analizando el posible papel protector de las moléculas antioxidantes a la hora de prevenir los
cambios epigenéticos inducidos por dietas nutritivamente desequilibradas.
Por último, el estrés mental y psicosocial se ha convertido en un rasgo típico de la socie-
dad moderna que implica la activación crónica de los sistemas neuroendocrinos, y que se ha
relacionado con el aumento de la prevalencia de obesidad (Iversen, 2012). Aunque hasta el
momento se han realizado pocos estudios epigenéticos en población adulta, los efectos del estrés
de la madre durante la época fetal o de lactancia han sido ampliamente analizados en modelos
animales. En muchos casos, se han encontrado importantes modificaciones epigenéticas en la
descendencia que, en ocasiones, persisten hasta la vida adulta. En este sentido, es evidente que
los factores de tensión materna producen un daño celular y hormonal y afectan a las respuestas
epigenéticas en la placenta, lo que compromete su función y conduce a consecuencias a largo
plazo para el desarrollo fetal (Gheorghe, 2010). Esta situación también se presenta durante la
infancia, habiéndose observado cambios epigenéticos que pueden ser achacables a los sucesos
traumáticos ocurridos en esas etapas iniciales de la vida.
En resumen, distintos procesos que suelen acompañar al desarrollo de las enfermedades
metabólicas crónicas son, a su vez, capaces de alterar los mecanismos epigenéticos encargados
de la regulación de la expresión génica. En este contexto, más estudios son necesarios para
conocer la importancia de cada uno de ellos, y poder así aplicarlos para prevenir o tratar al-
gunos de estos problemas.
8. Epigenética y nutrición
Entre los compuestos presentes en los alimentos que han sido vinculados a la aparición
de modificaciones epigenéticas, están los grupos dadores de metilo (ácido fólico, metionina,
colina, betaína, vitamina B12…), la ingesta excesiva o deficiente de calorías y proteínas, las
dietas ricas en grasa, los ácidos grasos de cadena corta (butirato, acetato y propionato), algunos
minerales y vitaminas antioxidantes (vitaminas A, E y C), así como diversos compuestos de
origen vegetal, como distintos polifenoles, catequinas, isoflavonas o isotiocianatos (Milagro,
2013). Hasta ahora, la mayor parte de los estudios se han centrado en los grupos donantes de
metilos, en particular en los compuestos que intervienen en el ciclo de la metionina: metionina,
folato, colina, biotina y vitaminas B2, B6 y B12. Estos nutrientes o compuestos son básicos para
regular los niveles de metilación del ADN y de las histonas, siendo la S-adenosín-metionina
o SAM la molécula encargada de ceder un grupo metilo a estas macromoléculas. De hecho,
una dieta deficiente en grupos donantes de metilo se considera un buen modelo de esteatosis
hepática en roedores, que pueden acabar desarrollando cirrosis y hepatocarcinoma, mientras
que la suplementación con esas mismas moléculas parece revertir la esteatosis mediante cambios
en la metilación de genes clave como la ácido graso sintasa (Cordero, 2013).
Ciertamente, las dietas desequilibradas pueden originar cambios epigenéticos que pueden
contribuir al desarrollo de complicaciones metabólicas. Por ejemplo, un estudio observó que, en
humanos, la ingesta de una dieta rica en grasa de forma aguda indujo cambios en la metilación
de 6.508 genes en el músculo esquelético (Jacobsen, 2012). Sin embargo, otro de los puntos
más interesantes de la nutriepigenética es saber si esos cambios pueden ser revertidos por dietas
saludables. En el caso del estudio mencionado, los cambios observados no fueron significati-
vamente revertidos tras 6-8 semanas de dieta normocalórica, sugiriendo que la reversibilidad
de las marcas epigenética puede ser lenta y que la acumulación de modificaciones puede con
el tiempo influir en los niveles de expresión de los genes. Este hecho podría estar detrás del
conocido como efecto «yo-yo», que se caracteriza por una dificultad cada vez mayor a adelgazar
tras cada episodio de tratamiento hipocalórico. Una prueba de la reversibilidad de algunas de
las marcas epigenéticas se ha descrito en un estudio en ratas, en las que se ha observado que la
ingesta de una dieta hipercalórica durante 20 semanas alteraba, en el tejido adiposo visceral, la
metilación de varios sitios CpG situados en el promotor del gen de la leptina (Uriarte, 2013).
Cuando la dieta hipercalórica fue sustituida por una dieta normocalórica y las ratas dejaron
de ganar aceleradamente peso (10 semanas), se revirtieron los niveles de metilación de algunos
de los sitios CpG del promotor de la leptina. Este estudio confirma la posible reversibilidad de
los cambios fenotípicos y epigenéticos inducidos por la ingesta de dieta hipercalórica, aunque
se necesitaría un seguimiento más largo y pormenorizado para asegurar que se pueden llegar a
alcanzar los niveles de metilación de antes de la dieta hipercalórica en todos los genes.
Los factores nutricionales que influyen en la modificación de las marcas epigenéticas,
junto con los metabólicos y los de estilo de vida, se representan en la Figura 2.
Modificaciones epigenéticas
Referencias bibliográficas
Begum, G.; Stevens, A.; Smith, E. B.; Connor, K.; Challis, J. R.; Bloomfield, F. y Whi-
te, A. (2012): «Epigenetic changes in fetal hypothalamic energy regulating pathways are
associated with maternal undernutrition and twinning»; FASEB J. (26); pp. 1694-1703.
Bradfield, J. P.; Taal, H. R.; Timpson, N. J.; Scherag, A.; Lecoeur, C.; Warrington,
N. M.; Hypponen, E.; Holst, C.; Valcarcel, B.; Thiering, E.; Salem, R. M.; Schu-
macher, F. R.; Cousminer, D. L.; Sleiman, P. M.; Zhao, J.; Berkowitz, R. I.; Vima-
leswaran, K. S.; Jarick, I.; Pennell, C. E.; Evans, D. M.; St Pourcain, B.; Berry, D.
J.; Mook-Kanamori, D. O.; Hofman, A.; Rivadeneira, F.; Uitterlinden, A. G.; Van
Duijn, C. M.; Van Der Valk, R. J.; De Jongste, J. C.; Postma, D. S.; Boomsma, D.
I.; Gauderman, W. J.; Hassanein, M. T.; Lindgren, C. M.; Mägi, R.; Boreham, C.
A.; Neville, C. E.; Moreno, L. A.; Elliott, P.; Pouta, A.; Hartikainen, A. L.; Li, M.;
Raitakari, O.; Lehtimäki, T.; Eriksson, J. G.; Palotie, A.; Dallongeville, J.; Das,
S.; Deloukas, P.; Mcmahon, G.; Ring, S. M.; Kemp, J. P.; Buxton, J. L.; Blakemore,
A. I.; Bustamante, M.; Guxens, M.; Hirschhorn, J. N.; Gillman, M. W.; Kreiner-
Møller, E.; Bisgaard, H.; Gilliland, F. D.; Heinrich, J.; Wheeler, E.; Barroso, I.;
O’rahilly, S.; Meirhaeghe, A.; Sørensen, T. I.; Power, C.; Palmer, L. J.; Hinney, A.;
Widen, E.; Farooqi, I. S.; Mccarthy, M. I.; Froguel, P.; Meyre, D.; Hebebrand, J.;
Jarvelin, M. R.; Jaddoe, V. W.; Smith, G. D.; Hakonarson, H.; Grant, S. F. y Early
Growth Genetics Consortium. (2012): «A genome-wide association meta-analysis
identifies new childhood obesity loci»; Nat Genet. (44); pp. 526-531.
Burdge, G. C.; Hoile, S. P. y Lillycrop, K. A. (2012): «Epigenetics: are there implications
for personalised nutrition?»; Curr Opin Clin Nutr Metab Care. (15); pp. 442-447.
Bygren, L. O.; Tinghög, P.; Carstensen, J.; Edvinsson, S.; Kaati, G.; Pembrey, M. E. y
Sjöström, M. (2014): «Change in paternal grandmothers’ early food supply influenced
cardiovascular mortality of the female grandchildren»; BMC Genet. (15); pp. 12.
Carone, B. R.; Fauquier, L.; Habib, N.; Shea, J. M.; Hart, C. E.; Li, R.; Bock, C.; Li, C.;
Gu, H.; Zamore, P. D.; Meissner, A.; Weng, Z.; Hofmann, H. A.; Friedman, N. y
Rando, O. J. (2010): «Paternally induced transgenerational environmental reprogramming
of metabolic gene expression in mammals»; Cell. (143); pp. 1084-1096.
Choi, S. W.; Claycombe, K. J.; Martínez, J. A.; Friso, S. y Schalinske, K. L. (2013):
«Nutritional epigenomics: a portal to disease prevention»; Adv Nutr. (4); pp. 530-532.
Cordero, P.; Gómez-Uriz, A. M.; Campion, J.; Milagro, F. I. y Martínez, J.A. (2013):
«Dietary supplementation with methyl donors reduces fatty liver and modifies the fatty
acid synthase DNA methylation profile in rats fed an obesogenic diet»; Genes Nutr. (8);
pp. 105-113.
Jacobsen, S. C.; Brøns, C.; Bork-Jensen, J.; Ribel-Madsen, R.; Yang, B.; Lara, E.; Hall,
E.; Calvanese, V.; Nilsson, E.; Jørgensen, S. W.; Mandrup, S.; Ling, C.; Fernan-
dez, A. F.; Fraga, M. F.; Poulsen, P. y Vaag, A. (2012): «Effects of short-term high-fat
overfeeding on genome-wide DNA methylation in the skeletal muscle of healthy young
men»; Diabetologia (55); pp. 3341-3349.
Keating, S. T. y El-Osta, A. (2012): «Chromatin modifications associated with diabetes»; J
Cardiovasc Transl Res (5); pp. 399-412.
Martin, S. L.; Hardy, T. M. y Tollefsbol, T. O. (2013): «Medicinal chemistry of the epi-
genetic diet and caloric restriction»; Curr Med Chem. (20); pp. 4050-4059.
Martínez, J. A.; Milagro, F. I.; Claycombe, K. J. y Schalinske, K.L. (2014): «Epigenetics
in adipose tissue, obesity, weight loss, and diabetes»; Adv Nutr. (5); pp. 71-81.
Milagro, F. I.; Miranda, J.; Portillo, M. P.; Fernandez-Quintela, A.; Campión, J.;
Martínez, J. A. (2013): «High-throughput sequencing of microRNAs in peripheral
blood mononuclear cells: identification of potential weight loss biomarkers»; PLoS One.
(8); pp. e54319.
Milagro, F. I.; Mansego, M. L.; De Miguel, C. y Martínez, J. A. (2013): «Dietary factors,
epigenetic modifications and obesity outcomes: progresses and perspectives»; Mol Aspects
Med. (34); pp. 782-812.
Ng, S. F.; Lin, R. C.; Laybutt, D. R.; Barres, R.; Owens, J. A. y Morris, M. J. (2010):
«Chronic high-fat diet in fathers programs β-cell dysfunction in female rat offspring»;
Nature. (467); pp. 963-966.
Norheim, F.; Gjelstad, I. M.; Hjorth, M.; Vinknes, K. J.; Langleite, T. M.; Holen, T.;
Jensen, J.; Dalen, K. T.; Karlsen, A. S.; Kielland, A.; Rustan, A. C. y Drevon, C.
A. (2012): «Molecular nutrition research: the modern way of performing nutritional
science»; Nutrients. (4); pp. 1898-1944.
Painter, R. C.; Osmond, C.; Gluckman, P.; Hanson, M.; Phillips, D. I. y Roseboom, T. J.
(2008): «Transgenerational effects of prenatal exposure to the Dutch famine on neonatal
adiposity and health in later life»; BJOG. (115); pp. 1243-1249.
Paul, D. S. y Beck, S. (2014): «Advances in epigenome-wide association studies for common
diseases»; Trends Mol Med. (20); pp. 541-543.
Remely, M.; Aumueller, E.; Jahn, D.; Hippe, B.; Brath, H. y Haslberger, A. G. (2014):
«Microbiota and epigenetic regulation of inflammatory mediators in type 2 diabetes and
obesity»; Benef Microbes. (5); pp. 33-43.
Ross, S. A. y Davis, C. D. (2014): «The emerging role of microRNAs and nutrition in mo-
dulating health and disease»; Annu Rev Nutr. (34); pp. 305-336.
GENÉTICA Y
GENÓMICA DEL
CÁNCER
111
Epidemiología.
Neopla.stic
(Monoclonal)
NEOPLASIA , . .. ��
!).�!'.:
Benlgn
......�..
........... ......
,_...
'•·•-"'r"'
. r-w,.., • ..,,...._
._....,.._ "
Jo......
.___........
, ..,,¡,...,,
-- ••r-
•...... . . . .__...,..-.....tr-•�
-...1....... .......,_.
*IQ'U.
•t..et,,.,.._ ,.,..,
............... ,,,,,
.........,.. .. - -w..., ........... ..,..,
.....-
Vias Genéticas Normales
A
'------------------cromo-y teltlmeloe
'---• l'Totelnes que COIIIIOl&n la aegregllCi()n de los
la........,de IOe
Alteraciones en una neoplasia
..,. ....•
•
•• • ••
•• ••
·.,·• :
•• .• : '-< Regu!adón lr•M1C1ipcional
•• •
L.... ··········-················
·····-····· .. ......_.___
--········-··•••••c,o.,www, la NC1'911Ml'+t de loa
••••• • .--,._,...._""" la Nf l lJAMd de lol lllbffllrol
Wilnlll o.w111-a-..
BASES GENÉTICAS DEL
111
CÁNCER
Proteína
* anormal
Cantidad
Mutación * excesiva
reguladora .- de proteína
Protooncogén
Proteína
' nueva
-c:::1111•1--
Cantidad
excesiva
de proteína
guardabarreras” (“gatekeeper”).
genes supresores de tumores que están mutados en el
proceso inicial del desarrollo tumoral.
las proteínas codificadas por estos genes actuarían como
barreras y, al estar mutados y funcionar de manera
anómala, facilitarían la aparición de mutaciones en otros
protooncogenes y genes supresores de tumores que
inducirían el desarrollo del tumor.
111
vigilantes (“caretaker”).
control en el desarrollo tumoral indirectamente al
asegurar la fidelidad de las secuencias del DNA a través
de los mecanismos de reparación del mismo.
la mayoría de los genes incluidos en este grupo son
genes que codifican proteínas que intervienen en los
procesos de reparación del DNA
Heterogeneidad celular
Mutación
Figura 15-4 Etapas en In evolución del cineer, El aumento del grado de aheroción se �socfa a una
pérdida secuencial de genes de supresión tumoral en varios cromosomas y a la activación de prorc,..
oncogenes, con o sin un defecto concomiramc en la reparación del DNA. Puede haber múltíplcs
linajes celulares portadores de mutaciones y de perfiles cpigcnómicos diferentes en el propio 111010!
primario, emre el rumor pnmo rio y las metástasis, así como entre distintos metástasis.
111 CÁNCER FAMILIAR
1. Aneuploidía y aneusomía
APLICACIÓN DE LA GENÓMICA A
LA INDIVIDUALIZACÓN DEL
TRATAMIENTO DEL CÁNCER
1. Determinación del perfil de expresión y
agrupamiento para la creación de patrones de
expresión génica
2. Perfil de la expresión génica en el pronóstico del
cáncer
3. Terapias dirigidas contra el cáncer
111
QUIZ
111 Complete… Neoplasia es
a. genes conductores
b. Mutaciones conductoras
c. Linfoma
Seleccione la respuesta
correcta
111
a. genes conductores
b. Mutaciones conductoras
c. Linfoma
ARTÍCULO ESPECIAL
Marcadores Tumorales
a
Médico Adjunto de Medicina RESUMEN
Interna. Responsable de
la Unidad de Continuidad Los marcadores tumorales son moléculas (generalmente glucoproteínas), que pueden estar ele-
Asistencial Primaria-Interna vadas en presencia de un cáncer, bien como reacción del huésped ante el tumor o bien como
(UCAPI). Complejo Hospitalario y producto del propio tumor. Estas moléculas, cuya concentración sérica también depende de la
Universitario de Albacete. variabilidad biológica del paciente, son detectables en diferentes fluidos biológicos. La utilidad
de los marcadores tumorales viene determinada por la sensibilidad y especificidad de cada uno
b
Médico Adjunto de Medicina de ellos. No existe un marcador tumoral 100% sensible y específico. Un marcador tumoral con
Interna. Complejo Hospitalario y una alta sensibilidad sería aquél que se encuentra elevado en la mayoría de los pacientes que
Universitario de Albacete. presentan una determinada neoplasia, mientras que la especificidad vendría dada por aquellos
c
Médico Adjunto de Medicina pacientes con niveles normales del marcador tumoral que no presentan ningún tipo de neopla-
Interna. Unidad de Medicina sia. Así, los marcadores con altos valores de sensibilidad y especificidad permitirían detectar
a los pacientes que padecen cáncer y diferenciarlos de individuos sanos o de pacientes que
Paliativa. Complejo Hospitalario y
presenten patologías benignas.
Universitario de Albacete.
Podemos decir que, en general, debido a la falta de una elevada sensibilidad y especificidad
d
Médico Adjunto de Medicina diagnósticas, los marcadores tumorales no sirven para la detección temprana de las neoplasias,
Interna. Hospital de Hellín. pero sí ayudan a la confirmación de un diagnóstico ya establecido por métodos más sensibles.
La mayoría de ellos tienen además un valor pronóstico en el momento del diagnóstico, ya que
e
Médico Adjunto de Medicina
su concentración se relaciona con el tamaño tumoral. Su verdadero valor clínico reside, sin
Interna. Hospital de Villarrobledo.
embargo, en el seguimiento de los pacientes, tanto para detectar una recidiva temprana, como
f
Médico Residente de Medicina para evaluar la efectividad del tratamiento instaurado.
Interna. Complejo Hospitalario y Nos proponemos en esta revisión hacer un repaso de los marcadores tumorales más utilizados
Universitario de Albacete. en nuestra práctica clínica y de algunas recomendaciones que se han consensuado sobre la
indicación de determinación de los mismos en diversos tumores.
Correspondencia: PALABRAS CLAVE: Marcadores Biológicos de Tumor. Cáncer. Diagnóstico. Screening pobla-
Ignacio Hermida Lazcano. cional.
Servicio de Medicina Interna,
Complejo Hospitalario y
Universitario de Albacete.
Albacete. ABSTRACT
El uso de los MT tiene algunas limitaciones: por un Un MT es toda aquella sustancia producida por
lado, la mayoría de los marcadores no son espe- las células tumorales o por el propio organismo en
cíficos de un tipo de tumor; en segundo lugar, no respuesta al tumor, cuya presencia puede ser de-
todos los pacientes con un mismo tipo de cáncer tectada en el suero o en otros líquidos biológicos
muestran un nivel elevado de un determinado mar- y que refleja el crecimiento o actividad tumoral y
cador asociado a ese tumor. Por último, hay algu- permite conocer la presencia, evolución o respues-
nas situaciones no cancerosas en las que puede ta terapéutica de un tumor maligno1,2. Los MT se
estar elevado alguno de los marcadores tumorales comportan, por tanto, como indicadores o seña-
conocidos. les a distancia de la presencia de una neoplasia.
Lamentablemente, estos marcadores no son es-
Desde hace ya tiempo se ha debatido mucho en la pecíficos de las neoplasias, y pueden encontrarse
literatura sobre las indicaciones y las implicaciones concentraciones apreciables en un gran número de
que conlleva la determinación sistemática de los situaciones fisiológicas o patológicas no tumora-
MT en diversas situaciones clínicas: pacientes con les. Por ello, el principal dato a tener en cuenta va
antecedentes familiares de patología tumoral, cri- a ser el cambio cuantitativo de los MT. La señal de
bado poblacional de ciertos cánceres prevalentes alarma aparece cuando existen incrementos anor-
a partir de una determinada edad o pacientes con males en la concentración de los mismos3.
procesos clínicos que conocemos habitualmente
como síndrome constitucional (astenia, anorexia, Existe una amplia variedad de sustancias que
pérdida de peso). Pero, a pesar de todo lo inves- pueden ser clasificadas como MT, que incluyen
tigado y publicado al respecto, el debate todavía antígenos asociados a tumores, enzimas, proteí-
no está cerrado y no han podido elaborarse guías nas específicas y metabolitos. Probablemente la
clínicas que recojan las indicaciones de uso de los primera referencia histórica a un MT se remonta
MT, salvo de algunos en determinados tipos de tu- al descubrimiento por Bence Jones en 1846 de
mores. un precipitado de la orina en pacientes afectados
de lo que antes se denominaba mellitis osseum
Nos proponemos en esta revisión hacer un repaso (osteomalacia), que más de 100 años después se
de los marcadores utilizados en nuestra práctica identificaron como cadenas ligeras monoclonales
clínica y de algunas recomendaciones que se han de inmunoglobulinas, cuyas concentraciones se
consensuado para determinados tumores. Revi- incrementan en los pacientes con mieloma múl-
sando la literatura de los últimos 25 años, sorpren- tiple y que hoy conocemos como “proteínas de
de ver que, a pesar de todo lo que se ha estudiado Bence Jones”. Sin embargo, a pesar de esta le-
al respecto, las principales recomendaciones no jana referencia, la historia de los MT arranca fun-
han variado. Como en tantos otros aspectos de la damentalmente en la segunda mitad del siglo XX;
medicina, no existe una receta mágica y habrá que hay que tener en cuenta que diversas sustancias
individualizar en cada caso, sin olvidar que, si bien que posteriormente se utilizaron como MT han
pueden ayudar en la detección, diagnóstico y ma- sido descubiertas hace relativamente poco tiempo:
nejo de algunos tipos de tumores, nunca pueden gonadotropina coriónica humana (HCG) en 1927,
alfa-fetoproteína (AFP) en 1963, antígeno carcino- clínica de la enfermedad, pero los estudios reali-
embrionario (CEA) en 1965. zados al respecto son controvertidos, con lo que
unos grupos de expertos se han mostrado a favor,
UTILIZACIÓN DE LOS MARCADORES TUMO- y otros en contra7.
RALES EN EL DIAGNÓSTICO Y SEGUIMIENTO
DE PACIENTES CON CÁNCER En la literatura se han publicado algunos estudios
que evidencian que los MT se solicitan frecuente-
De forma ideal, los MT deberían ser útiles para la mente de forma inadecuada. Así, una auditoría rea-
detección precoz de un cáncer, para establecer lizada en Irlanda del Norte8, encontró que, aunque
el pronóstico pretratamiento (estadiaje), el segui- el 80 % de las solicitudes de MT se relacionaban
miento postratamiento (respuesta a la terapia), pre- con el órgano implicado, un 54 % de los clínicos
decir las recurrencias, presentar una elevada sen- utilizaban los MT como cribado de patologías ma-
sibilidad, especificidad y valor predictivo positivo y lignas, con un bajo índice de sospecha en el 35 %
ser órgano-específicos y tumor-específicos. de los casos. Otra auditoría en un hospital inglés9
encontró que el 26 % de todas las solicitudes del
Sin embargo, en la práctica diaria, los MT son poco marcador 15.3 del cáncer de mama fueron para
específicos, ya que pueden aumentar en diferentes varones, pacientes a los que en ningún caso se
tumores y en procesos benignos, y son poco sen- les había practicado biopsias en el año del estu-
sibles en los estadios iniciales de la enfermedad. dio ni en los dos años previos. Lo mismo ocurrió
Su principal aplicación en la clínica radica en el en el marcador CA 125 del cáncer de ovario, que
seguimiento de los pacientes, tanto para detectar fue solicitado en un 17 % a varones. En un estu-
una recidiva temprana, como para evaluar la efec- dio griego10, solo un 20 % de los 10291 resultados
tividad del tratamiento instaurado4,5. revisados de forma retrospectiva en 1944 pacien-
tes resultaron ser en pacientes con cáncer. El nivel
Si bien los MT de los que disponemos no son es- más bajo de determinaciones apropiadas fue para
pecíficos de ningún cáncer, se ha sugerido que el CA 19.9 (1,9 %) y un 26 % de peticiones de CA
la valoración de algunas circunstancias añadidas 125 fueron solicitadas a varones. El marcador CEA
podría permitir mejorar su especificidad y discrimi- de tumor colorrectal fue más frecuentemente soli-
nar si una elevación en su concentración sérica se citado de forma correcta (27 %)7.
debe a la presencia de una enfermedad benigna o
maligna1. Los principales hechos a tener en cuenta CLASIFICACIÓN
son la concentración sérica del MT, la existencia
de enfermedades benignas asociadas que puedan Los MT pueden agruparse según dos criterios: uno
provocar falsos positivos y el control evolutivo. A basado en el origen y otro basado en su utilidad
todo ello nos referiremos más adelante. clínica, expresada en términos de sensibilidad y
especificidad.
Los MT, de forma aislada, no han demostrado ser
útiles en el diagnóstico precoz de neoplasias en Con base en su origen, clásicamente se han clasifi-
grandes poblaciones asintomáticas6. Solo en el cado en dos grupos: los producidos por las células
caso del PSA esta afirmación es controvertida. Sin tumorales, que se denominan “derivados del tu-
embargo, sí pueden contribuir al diagnóstico para mor”; y los inducidos por la presencia del mismo y
grupos seleccionados de pacientes, dependiendo producidos por el huésped, que se llaman “asocia-
de la prevalencia de la enfermedad en la población dos al tumor”3. Entre los primeros estarían la mayo-
y de la especificidad y sensibilidad del marcador. ría de los MT más conocidos: antígeno carcinoem-
Además, los MT pueden tener valor para estable- brionario (CEA), alfa-fetoproteína (AFP), antígeno
cer la extensión de la enfermedad, monitorizar la prostático específico (PSA), la subunidad beta de
respuesta al tratamiento, monitorizar la propia en- la hormona gonadotrofina coriónica humana (beta-
fermedad y predecir en muchos casos el pronósti- HCG), etc. Entre los segundos se incluyen proteí-
co del proceso tumoral. nas de fase aguda (PCR, ferritina) y moduladores
del sistema inmune (citocinas o interleucinas). Esta
La conveniencia de la determinación del PSA como clasificación tiene, sin embargo, escaso interés en
cribado de poblaciones asintomáticas es quizá la práctica clínica.
más dudosa. El cribado del cáncer de próstata me-
diante el PSA tiene potencial para determinar ma- El correcto uso de los MT y su aplicación clínica
lignidad al menos cinco años antes de la evidencia requiere el conocimiento preciso de los conceptos
En el segundo grupo se incluyen los MT con sensi- 3. Control evolutivo. El hallazgo de concentracio-
bilidad y especificidad bajas en los estadios inicia- nes elevadas de cualquier marcador, de forma
les, con valores séricos indistinguibles en la mayo- aislada, tiene un valor limitado. Es necesario
ría de los casos de los hallados en sujetos sanos realizar dos o tres determinaciones seriadas
o en pacientes con algunas enfermedades benig- con un intervalo superior a la semivida plasmá-
nas. Por el contrario, en los estadios avanzados, tica del marcador (tiempo que tarda una sus-
las concentraciones séricas de estos marcadores tancia en descender su concentración a la mi-
permiten asegurar que se trata de un tumor malig- tad) y estudiar estos resultados en conjunto12.
no. En este grupo se incluyen la mayoría de los MT En general debe transcurrir un plazo mínimo
utilizados en la práctica clínica: PSA, AFP, CEA, el de 15 días entre determinaciones y los incre-
antígeno carbohidratado 125 (CA 125), el antígeno mentos o decrementos han de superar el 20 %
carbohidratado 153 (CA 15.3), la enolasa neuronal para ser significativos. Si las cifras del marca-
específica (NSE) y el antígeno carcinoma de células dor sufren un incremento continuo, se puede
escamosas (SCC), entre otros. afirmar con bastante seguridad que el origen
es tumoral. Por el contrario, si los valores no
En el tercer grupo, esto es, el de los MT de baja es- se modifican o incluso tienden a descender,
pecificidad se incluyen los MT con una sensibilidad habrá que buscar el origen en otra patología.
dependiente del estadio, pero cuya especificidad
es baja, incluso en las fases avanzadas de la enfer- La mayoría de los MT no pueden por tanto ser em-
medad. Se incluyen aquí enzimas como la lactato pleados con fines diagnósticos. Sin embargo, tras
el diagnóstico se abre un nuevo periodo en el que tratamiento y para controlar las recaídas, ya que su
es necesario obtener la máxima información posi- incremento tras la normalización con el tratamiento
ble para establecer el pronóstico, fijar el tipo de tra- implica recurrencia o propagación.
tamiento adecuado, controlar la evolución clínica
y evaluar la eficacia del tratamiento. Y es precisa- Otras causas frecuentes de elevación del PSA son
mente en estas etapas donde los MT son de indu- la hipertrofia benigna de próstata, la prostatitis, los
dable utilidad y su correcta interpretación ayuda al infartos prostáticos y las manipulaciones de la vía
clínico a la toma de decisiones terapéuticas. urinaria, como las biopsias, cistoscopias o cirugías
prostáticas.
PRINCIPALES MARCADORES TUMORALES
Hasta el momento no hay evidencias para reco-
Los MT más utilizados en la práctica clínica y que mendar la determinación del PSA como método
a continuación describimos de una forma más am- de cribado poblacional en varones asintomáticos,
plia son: PSA, CEA, CA 125, CA 15.3, antígeno car- pero puede realizarse a pacientes que así lo de-
bohidratado 199 (CA 19.9), alfa-fetoproteína (AFP), manden, debiéndoles informar siempre de forma
gonadotropina coriónica humana (HCG), NSE y comprensible sobre los beneficios y riesgos de
SCC13-18. tal determinación, o en aquellos que tengan algún
factor de riesgo, como la existencia de dos o más
Antígeno prostático específico (PSA) familiares afectados de cáncer de próstata, raza
negra o por determinaciones previas dudosas. Al-
Es el marcador más ampliamente utilizado en el gunos autores recomiendan, sin embargo, realizar
cáncer de próstata. Se trata de una glucoproteína PSA y tacto rectal anual en varones a partir de 50
producida por el epitelio secretor prostático normal años.
y maligno, que se encuentra normalmente en con-
centraciones de 0,1-4 ng/ml en plasma. Se pue- Antígeno carcinoembrionario (CEA)
den realizar dos mediciones: el PSA total y el PSA
libre. El PSA total tiene una alta especificidad en Es una glucoproteína oncofetal asociada a tumores
patología prostática (98 %), y su límite de referen- del tracto gastrointestinal, que se encuentra eleva-
cia es de 4 ng/ml. El problema del PSA es que, en da frecuentemente en el cáncer colorrectal (CCR).
el rango de valores intermedios, que oscilan entre Puede encontrarse en otras enfermedades malig-
4 y 10 ng/ml, la especificidad para patología ma- nas y benignas o incluso en pacientes sin enfer-
ligna es baja, dado que se solapan pacientes con medad aparente. Su aclaramiento se realiza por vía
hipertrofia de próstata y pacientes con cánceres hepática, por lo cual suele estar aumentado en ca-
localizados. sos de metástasis en este órgano. Se consideran
valores normales por debajo de 2,5 ng/ml en no fu-
En estos casos, para evitar la realización de biop- madores y por debajo de 5 ng/ml en fumadores. El
sias innecesarias, se recomienda determinar el grado de elevación del CEA parece correlacionarse
PSA libre. El porcentaje de PSA libre es significati- con el estadio del tumor, de tal forma que valores
vamente inferior en pacientes con cáncer de prós- superiores a 20 ng/dl son indicativos de enferme-
tata. Un PSA libre inferior al 25 % puede conside- dad avanzada. Se ha establecido una asociación
rarse sospechoso de neoplasia. La velocidad de entre la elevación y el estadiaje del tumor.
incremento del PSA mayor de 0,75 ng/ml en un año
puede considerarse claramente anormal. Es nece- Aproximadamente la tercera parte de los pacientes
sario realizar por tanto varias determinaciones se- con recurrencias del CCR presentan elevaciones
riadas para considerar una elevación significativa. en las concentraciones de CEA antes de que co-
El PSA aumenta con la edad una media anual de miencen a desarrollar sintomatología.
0,04 ng/ml y también su aumento indica extensión
tumoral, así que para su interpretación hay que te- Diferentes estudios han demostrado una diferencia
ner presente la edad del paciente12. significativa en términos de supervivencia a favor
de los pacientes que realizan un seguimiento in-
Un nivel elevado de PSA, por sí mismo, no es indi- tensivo tras el tratamiento, siendo el CEA la prueba
cativo de cáncer; por lo tanto se deben hacer otras más importante para diagnosticar recidivas.
pruebas, como la biopsia prostática, para hacer un
diagnóstico correcto. Los niveles de PSA han de- Aunque este hecho sigue siendo controvertido, la
mostrado ser útiles para supervisar la eficacia del ASCO (Asociación Americana de Oncología Clíni-
ca) recomienda que se determine el CEA cada 2 o tadiaje del cáncer de mama. Está alterado en el 20
3 meses durante al menos los dos primeros años al 50 % de las pacientes con cáncer de mama y
tras el diagnóstico de CCR en estadio II o III. Se es un importante factor pronóstico, pues altas con-
recomienda la determinación del CEA antes de la centraciones de CA 15.3 preoperatorias se asocian
intervención quirúrgica y cada 2 o 3 meses en el a evolución adversa de la enfermedad.
seguimiento de una intervención con intención ra-
dical. También puede estar elevado en cáncer de ovario,
pulmón y próstata, y en el caso de enfermedades
Otros tumores que elevan este marcador son los benignas de la mama o del ovario, hepatitis, emba-
melanomas, linfomas, cáncer de mama, pulmón, razo y lactancia.
páncreas, estómago, cérvix, vejiga, riñón, tiroides,
hígado y ovario. También pueden presentar niveles En la actualidad, la aplicación clínica más importan-
aumentados de CEA pacientes con enfermedades te se encuentra en la monitorización de la terapia
no cancerosas como enfermedad inflamatoria in- en pacientes con enfermedad avanzada, junto con
testinal, pancreatitis y enfermedades hepáticas. El las pruebas diagnósticas necesarias y en la detec-
uso del tabaco también puede contribuir a elevar ción precoz de recidivas. Hay que tener precaución
los niveles de CEA. en la interpretación de la elevación del marcador
durante las primeras 4 a 6 semanas del inicio del
CA 125 tratamiento, ya que pueden producirse elevaciones
paradójicas, lo que implica una buena respuesta.
Es una glucoproteína de alto peso molecular que
se eleva comúnmente en los tumores ováricos epi- CA 19.9
teliales o del epitelio celómico no mucinosos. Su
determinación no está recomendada como mé- Es una glucoproteína sintetizada en diversos epi-
todo de despistaje en mujeres asintomáticas, ya telios, que se eleva típicamente en el suero de pa-
que puede estar elevado en otras situaciones o cientes con tumores de páncreas. Cifras inferiores
patologías. También suele estar elevado en pato- a 40 U/ml se consideran normales para ambos
logías benignas como la endometriosis, durante la sexos y no existen diferencias entre fumadores y
menstruación, en el primer trimestre del embara- no fumadores. Valores por encima de 300 U/l tie-
zo, en el postparto, en hepatopatías, pancreatitis, nen un valor predictivo positivo superior al 90 %.
insuficiencia renal, derrame pericárdico o pleural, Otros tumores (biliares, gástricos, de colon, híga-
sarcoidosis, tuberculosis, colagenosis, ascitis en do, ovario, endometrio, pulmón y urotelio), o diver-
cirróticos y en procesos quirúrgicos que provocan sos procesos benignos pueden cursar con CA 19.9
alteración del peritoneo. Sus niveles normales de- sérico elevado, con valores más moderados (hepa-
penden de la medición del laboratorio, pero por lo titis, cirrosis, colangitis, colecistitis, pseudoquiste
general niveles superiores a 35 U/ml se consideran pancreático, pancreatitis, fibrosis pulmonar, asma
anormales. También puede encontrarse elevado en bronquial, asbestosis, bronquiectasias, tuberculo-
otras neoplasias, como el cáncer de mama, endo- sis, insuficiencia renal, quistes mucinosos, hidro-
metrio, vejiga, pulmón, páncreas, hígado, melano- nefrosis, síndrome de Sjögren, artritis reumatoide,
ma y linfomas. Las variaciones en los valores de lupus eritematoso, dermato/polimiositis o arteritis
este marcador aportan información en cuanto a la de células gigantes).
respuesta al tratamiento quirúrgico y quimioterápi-
co y en la aparición de recidivas, actuando como Alfa-fetoproteína
un factor pronóstico.
Es una glucoproteína oncofetal homóloga a la al-
CA 15.3 búmina, que en condiciones normales se sintetiza
en el saco vitelino, hígado fetal y líquido amniótico.
Glucoproteína de alto peso molecular que se usa
principalmente para el control del tratamiento del Los niveles normales varían según los laboratorios,
cáncer de mama, sobre todo en sus formas avan- pero en general pueden considerarse normales va-
zadas (enfermedad metastásica). Se consideran lores de hasta 10 ng/ml. La AFP está elevada en el
valores normales aquéllos por debajo de 35 U/ml. 80 % de los tumores germinales no seminomato-
Dado que este marcador no suele elevarse en los sos y se relaciona con la diferenciación a tejido del
estadios iniciales de la enfermedad, no se reco- seno endodérmico o carcinoma embrionario. La
mienda su uso en el despistaje, diagnóstico ni es- elevación de este marcador excluye el diagnóstico
de tumor germinal seminoma puro, salvo que exis- dores de la serinproteasas. En adultos los valores
ta componente mixto. normales se sitúan por debajo de 2,5 ng/ml. Puede
estar aumentado en enfermedades ginecológicas
La AFP muestra valores muy elevados en casi un benignas (cérvix, vagina y vulva), en enfermedades
60 % de los pacientes con cáncer primitivo de hí- dermatológicas y en casi el 60 % de pacientes con
gado. insuficiencia renal. Se puede emplear como mar-
cador en pacientes con neoplasias de estirpe epi-
También pueden encontrarse valores elevados de dermoide, principalmente de pulmón y cérvix, y en
forma más moderada en situaciones no tumora- menor medida de localización urogenital, cutánea
les, como el embarazo, enfermedades hepáticas o esofágica.
(hepatitis, cirrosis, abscesos), así como en otras
neoplasias, como las metástasis hepáticas, adeno- Otros MT de uso más restringido a circunstan-
carcinoma de pulmón, estómago, páncreas, riñón cias clínicas concretas son:
e hígado.
—— Cromogranina A: es un marcador de tumores
Gonadotropina coriónica humana (HCG) neuroendocrinos.
—— CYFRA 21: relacionado con el cáncer de pul-
La HCG es una glicoproteína compuesta por dos
món.
subunidades, la alfa y la beta, que se produce en
condiciones normales en el sincitotrofoblasto de —— Tiroglobulina: carcinoma medular de tiroides.
la placenta durante el embarazo. La especificidad
—— CA 27.29: marcador de cáncer de mama.
de la beta-HCG como marcador sérico es muy
elevada, aunque existen falsos positivos en ulcus —— 5-hidroxi-indolacético: marcador de tumores
gastroduodenal, consumo de marihuana, cirro- carcinoides.
sis hepática y enfermedad intestinal inflamatoria,
—— Beta-2 microglobulina (B2M): su cuantificación
embarazos patológicos (extrauterino, molar). Se
es útil como marcador tumoral para determi-
consideran valores normales aquellos inferiores a
nados tipos de cáncer de células sanguíneas.
5 mlU/ml. La beta-HCG se encuentra elevada en
Valores menores de 2,5 mg/l, se consideran
la enfermedad trofoblástica, en el coriocarcinoma
normales. No es un marcador diagnóstico de
(100 % de los casos) y en el resto de los tumores
ninguna enfermedad específica, pero se asocia
germinales (seminomas puros en un 10-25 % de
a la cantidad de células cancerosas presentes
los casos y en los no seminomatosos en un 80 %).
(carga tumoral), y puede ofrecer información
adicional sobre el pronóstico. Concentraciones
Enolasa neuronal específica (NSE)
de B2M en sangre u orina elevadas son indica-
tivas de que existe un problema, pero no son
La NSE es una isoenzima glicolítica neuroespecífi-
diagnósticas o específicas de ninguna enfer-
ca de la enolasa. Se emplea en tumores de origen
medad concreta. Sin embargo, constituyen un
neuroectodérmico, tales como los carcinomas de
reflejo de la actividad de la enfermedad y del
pulmón indiferenciados de células pequeñas, los
crecimiento tumoral. La determinación de B2M
tumores carcinoides intestinales o los neuroblasto-
en sangre, y en algunas ocasiones en orina,
mas. Los valores normales están por debajo de 14
puede solicitarse como ayuda para determinar
ng/ml. Las muestras de sangre hemolizadas pue-
la severidad y estadio del mieloma múltiple,
den dar falsos positivos puesto que los hematíes
para evaluar el pronóstico en algunos cánce-
son ricos en enolasa. Aunque la NSE es un factor
res como el mieloma múltiple y el linfoma y en
pronóstico en este tipo de tumores, su principal
algunas ocasiones para evaluar la actividad de
aplicación está en valorar la respuesta a quimiote-
la enfermedad y la eficacia del tratamiento. En
rapia en pacientes con carcinoma de pulmón indi-
personas diagnosticadas de mieloma múltiple
ferenciado de células pequeñas.
o linfoma, el pronóstico de la enfermedad es
peor si la concentración de B2M está significa-
Antígeno a carcinoma de células escamosas
tivamente elevada.
(SCC)
En la tabla 1 exponemos en forma de resumen las
El antígeno SCC pertenece a la familia de inhibi- características de los principales marcadores tu-
< 2,5
Mama, pul- Tabaco, Elevado <
ng/ Sí. Cada 3-6 me-
món, estóma- úlcera pép- 25 % de
ml (no ses en pacientes
go, páncreas, tica, EEI, cáncer de colon
fuma- con estadio II o
Cáncer de cabeza y pancreatitis, en estadios
CEA dor) > 10 ng/ml No No III durante los 5 Sí
colon cuello, hígado, hipotiroidis- tempranos y
<5 años posteriores al
linfoma, mela- mo, cirrosis, en el 75 %
ng/ml diagnóstico de la
noma, medular obstrucción en estadios
(fuma- enfermedad
de tiroides biliar avanzados
dor)
Elevado 80-
Cáncer de Pancreatitis,
90 % cáncer
< 37 U/ páncreas, Colon, esófa- patología Masa pan-
CA 19.9 >1000 U/ml de páncreas, No No Sí
ml cáncer de go, hígado biliar, creática
60-70 % cáncer
tracto biliar cirrosis
biliar
Carcinoma
Elevado 80 %
hepato-
carcinomas Cirrosis,
celular, Cirrosis, Sí. Cada 1-2 me-
hepatocelulares masa hepáti-
< 5,4 tumores Estómago, bi- hepatitis ses durante 1 año,
AFP >500 ng/ml y 85 % tumo- No ca, tumores Sí
ng/ml de células liar, páncreas vírica, y luego con menos
res de células de origen
germinales embarazo frecuencia
germinales no desconocido
no semino-
seminomatosos
matosos
Tumores
de células Elevado en
Tumores de
germinales Hipogona- 85 % T de célu-
origen des-
<5 no semi- dismo, con- las germinales
Estómago conocido, Sí. Cada 6-12
B-hCG mIU/ nomatosos, sumo de >30mIU/ml no seminoma- No Sí
(raro) enfermedad meses
ml enferme- marihuana tosos (solo en el
trofoblástica
dad, tro- Embarazo 20 % en esta-
gestacional
foblastica dios iniciales)
gestacional
Mens-
truación,
embarazo,
Endometrio, quistes
trompas ováricos, Masa pél-
Elevado en Sí. Cada tres me-
de Falopio, inflamación vica, ascitis
85 % cáncer ses durante dos
< 35 U/ Cáncer de mama, pul- pélvica, maligna en
CA 125 >200 U/ml de ovario (solo No años, y con menos Sí
ml ovario món, esófago, ascitis cáncer de
50 % en esta- frecuencia a partir
estómago, cirrótica, origen des-
dios iniciales) de entonces
hígado, pán- derrame conocido
creas pleural y
pericárdico,
endome-
triosis
Hepato-
patías, Elevado en 20-
<35 U/ Cáncer de Ovario, pul- Tumoración Sí (junto con el
CA 15.3 insuficien- >100 ng/ml 50 % de cáncer No SÍ
ml mama món, próstata de mama CEA)
cia renal, de mama
embarazo
< 4 ng/
ml para
Prostatitis,
scree-
hipertrofia Adeno-
ning
benigna de Elevado en carcinoma
(inde- Sí. Cada 6 meses
Cáncer de próstata, más del 75 % de origen
PSA tecta- Ninguna >10 ng/ml Si ¿? durante 5 años, y Sí
próstata trauma de cáncer de descono-
ble tras luego anualmente
prostático, próstata cido, masa
pros-
tras eyacu- prostática
tatec-
lación
tomía
radical)
En cáncer
de cérvix, la
Tumores Insuficien- sensibilidad Masa
epidermoi- cia renal, se relaciona pulmonar,
<2,75 des, prin- Ano, laringe, psoriasis, con el estadio, lesión en
SCC > 5 ng/ml No Sí Sí
ng/ml cipalmente piel, urogenital pénfigo, oscilando entre cérvix sos-
de pulmón eccemas y el 16-31 % en pechosa de
y cérvix tuberculosis el estadio I y/o malignidad
del 90 % en el
estadio IV
Loi et al, en su publicación de 20045 sobre la ade- • Vigilancia después de un diagnóstico de cán-
cuación de utilización de los MT basada en la evi- cer (y tratamiento curativo previo):
dencia científica, establecen las siguientes reco-
mendaciones (excluyendo el PSA), que podrían ser —— En el caso del cáncer de ovario, el marcador
interesantes y que continúan vigentes: CA 125 es ampliamente utilizado; sin embar-
go no se conoce todavía si tratar una “recaí-
• Utilidad como cribado: da” de los MT antes de la recidiva clínica, in-
fluye en la historia natural de la enfermedad.
—— AFP: para el hepatocarcinoma en grupos de
alto riesgo, en asociación con la ecografía —— En el caso del CEA, está indicada su utiliza-
abdominal. ción en el seguimiento del cáncer colorrectal
en estadíos II o III, en combinación con el
—— CA 125: para el cáncer de ovario en pacien- TAC en pacientes susceptibles de resección
tes de alto riesgo, preferiblemente en cen- hepática.
tros familiarizados con su uso (centros espe-
cializados en cáncer familiar), y combinado —— Los MT de células germinales son útiles, ya
con una ecografía pélvica. que las recaídas precoces son potencial-
mente curables
• Como ayuda diagnóstica:
Posteriormente a esta publicación, y a lo largo de
Algunos estudios42,43 han concluido favorablemen- gicos. Química clínica. 2007; 26 (2): 77-85.
te en cuanto a la utilización de los MT como cri- 4. Martín Suárez A, Alonso Díaz L, Ordiz Álvarez I, Vázquez
bado de cáncer oculto tras un evento trombótico; J, Vizoso Piñeiro F. Utilidad clínica de los marcadores séri-
cos. Aten Primaria. 2003; 32 (4): 227-39.
en otros, la conclusión ha sido la contraria44, y en
5. Loi S, Haydon AMM, Shapiro J, Schwartz MA, Schneider
algún trabajo se ha concluido que la determinación
HG. Towards evidence-based use of serum tumor marker
de los MT, cuando estos son negativos, solo ten- request: an audit of use in a tertiary hospital. Int Med J.
dría utilidad como valor predictivo negativo44,45. 2004; 34: 545-50.
6. Bernabé Caro R, Moreno Nogueira JA. Valores de los mar-
En conclusión, parece que las recomendaciones cadores séricos tumorales en el diagnóstico precoz de las
actuales serían las de solicitar los MT con el mismo neoplasias y en los exámenes de salud a personas asinto-
criterio que en la población general. máticas. Rev Clin Esp. 2002; 202 (4): 212-4.
7. Sturgeon CM, Lai LC, Duffy MJ. Serum tumor markers: how
to order and interpret them. Br Med J. 2009; 339: 852-8.
CONCLUSIONES
8. McDonnell M. An audit of tumour marker requests in Nor-
thern Ireland. Ann Clin Biochem. 2004; 41 (5): 378-84.
• Los MT son en muy pocas ocasiones diag-
9. McGinley PJ, Kilpatrick ES. Tumour markers: their use and
nósticos y no pueden reemplazar a la biopsia
misuse by clinicians. Ann Clin Biochem. 2003; 40 (6): 643-
para establecer un diagnóstico de cáncer. Un 7.
resultado elevado de un MT no indica nece- 10. Ntaios G, Hatzitolios A, Chatzinikolau A, Karalazou P, Savo-
sariamente un determinado cáncer, pero pro- poulos C, Karamouzis M et al. An audit of tumour marker
porciona algún dato sobre su posibilidad. Los utilization in Greece. Eur J Intern Med. 2009; 20 (3): e66-9.
resultados dentro de límites normales no ex- 11. Trapé Pujol J, Molina Porto R. Aspectos generales de los
cluyen malignidad o progresión. marcadores tumorales. JANO. 2006; 1620: 45-8.
12. Ocampo Molano LF, Ocampo Molano L, Martínez Oviedo
• Como regla general, no se recomienda la medi- A, García Dinvier A, Gallardo Ganuza MC. Marcadores Tu-
ción de MT en pacientes con síntomas vagos, morales: revisión de la situación actual. Boletín Oncológico
cuando la probabilidad en la población es baja. del área sanitaria de Teruel. Disponible en: http://www.
boloncol.com/boletin-24/marcadores-tumorales-revision-
• El uso principal de los MT existentes está en de-la-situacion-actual.html.
la vigilancia postoperatoria y en la monitoriza- 13. Navarro Expósito F, Prieto Ríos B, Martín Angulo M, Ál-
varez-Mon Soto M. Indicación de solicitud y valor de los
ción tras la quimioterapia, terapia hormonal o
marcadores tumorales. Medicine. 2009; 10 (27): 1854-8.
radioterapia.
14. Perkins GL, Slater ED, Sanders GK, Prichard JG. Serum
Tumor Markers. Am Fam Physician. 2003; 68 (6): 1075-82.
• Los resultados de los MT resultan a menudo
método-dependientes; los pacientes deberían 15. Ocaña Pérez E, Aceituno Azaustre MI. Utilidad clínica de
los marcadores tumorales. Revista Médica de Jaén. 2014;
ser controlados siempre usando el mismo mé- 4: 2-12.
todo.
16. Pamies RJ, Crawford DR. Tumor Markers. An update. Med
Clin North Am. 1966; 80 (1): 185-99.
• Los resultados de los MT deben interpretarse
17. Contreras Carreto NA, Lugo Álvarez G, Martínez Quevedo
en el contexto de todas las informaciones dis-
JU. Introducción a los marcadores tumorales séricos. Mé-
ponibles, incluyendo los hallazgos clínicos, las dica Sur. 2006; 13 (3): 111-21.
pruebas de imagen y otros tests sanguíneos 18. Reiter MJ, Costello JE, Schwope RB, Lisanti CJ, Osswald
(función renal y hepática). MB. Review of commonly used serum tumor markers and
their relevance for image interpretation. J Compot Assist
Tomogr. 2015; 39 (6): 825-34.
BIBLIOGRAFÍA
19. Bast RC Jr, Ravdin P, Haydes DF, Bates S, Fritsche H Jr,
1. Teresa Romero G, Casado Vicente V, Jimeno Carrúez Jessup JM et al. 2000 update of recommendations for the
A. Utilización de marcadores tumorales en Atención use of tumor markers in breast and colorectal cancer: clini-
Primaria. Medifam [revista en la Internet]. 2002 [Con- cal practice guidelines of the American Society of Clinical
sultado 04 Ene 2016]. Disponible en: http://scielo. Oncology. J Clin Oncol. 2001; 19: 1865-78.
isciii.es/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1131- 20. Rustin GJ. The clinical value of tumour markers in the ma-
57682002000100003&lng=es. nagement of ovarian cancer. Ann Clin Biochem. 1996; 33:
2. Tumor Markers. National Cancer Institute [Consultado 284-9.
2016 Ene 16]. Disponible en: http://www.cancer.gov/ 21. Johnson PJ. Role of alpha-fetoprotein in the diagnosis and
about-cancer/diagnosis-staging/diagnosis/tumor-mar- management of hepatocellular carcinoma. J Gastroenterol
kers-fact-sheet Hepatol. 1999; 14 (Suppl): S32-6.
3. Fernández Suárez A, Martínez Peinado A, Gaspar MJ, File- 22. Duffy MJ, McGing. The Association of Biochemists in Ire-
lla X, Molina R, Ballesta AM. Marcadores tumorales seroló- land. Guidelines for the use of tumour markers. 4th ed.
2010. Disponible en: http://www.acbi.ie/Downloads/Gui- 35. Castro Marín. Marcadores Tumorales: utilidad clínica.
deline-tumour-markets-4th.pdf Form Med Contin Aten Prim. 1999; 6 (4): 223-8.
23. Sturgeon C. Practice Guidelines for Tumor Marker Use in 36. Prandoni P, Falanga A, Piccioli A. Cancer and venous
the Clinic. Clin Chem. 2002; 48 (8): 1151-9. thromboembolism. Review. Lancet Oncology. 2005; 6:
24. ASCO Clinical Practice Guidelines. Disponible en: http:// 401-10.
jco.ascopubs.org/site/misc/specialarticles.xhtml 37. Carrier M, le Gal G, Wells PS, Fergusson D, Ramsay T,
25. National Academy of Clinical Biochemistry Laboratory Me- Rodger MA. Systematic review: The Trousseau Syndro-
dicine. Practice Guidelines for Use of Tumor Markers in me Revisited: should we screen extensively for cancer in
Clinical Practice: Quality Requirements. Clin Chem. 2008; patients with venous thromboembolism. Ann Intern Med.
54 (8): e1-e10. 2008; 149: 323-3.
26. Amayo AA, Kuria JG. Clinical application of tumour mar- 38. Buller HR, van Doormaal FF, van Sluis GL, Kamphuisen
kers: a review. East Afr Med J. 2009; Suppl: S76-S83. PW. Cancer and thrombosis: from molecular mechanisms
to clinical presentations. J Thromb Haemost. 2007; 5 Suppl
27. Canil CM, Tannock IF. Doctor´s dilemma: incorporating tu-
1: 24-54.
mor markers into clinical decision-making. Semin Oncol.
2002; 29 (3): 286-93. 39. Blom JW, Doggen CJ, Osanto S, Rosendaal FR. Malig-
nancies, prothrombotic mutations, and the risk of venous
28. Mérida de la Torre FJ, Moreno Campoy EE, Martos Crespo
thrombosis. JAMA. 2005; 293 (6): 715-22.
F. Impacto de la aplicación de un protocolo para el uso
adecuado y seguro de marcadores tumorales. Med Clin 40. Monreal M, Lensing WA, Prins MH, Bonet M, Fernández-
(Barc). 2015. Disponible en: http://dx.doi.org/10.1016/j. Llamazarez J, Muchart J et al. Screening for occult cancer
medcli.2015.04.031 in patients with acute deep vein thrombosis or pulmonary
embolism. J Thromb Haemost. 2004; 2: 876-81.
29. Barneto Aranda IC, Morales Chamorro R, Rubio Pérez MJ.
Indicación y valoración de los marcadores tumorales en la 41. Piccioli A, Lensing A, Prins MH, Falanga A, Scannapieco
prevención y tratamiento de las enfermedades neoplási- L, Ieran M et al. Extensive screening for occult malignant
cas. Medicine. 2005; 9 (25): 1655-8. disease in idiopathic venous thromboembolism: a pros-
pective randomized clinical trial. J Thromb Haemost. 2004;
30. Moreno Campoy EE, Mérida de la Torre FJ, Martos Crespo
2: 884-9.
F, Plebani M. Diferencias de género en el uso de marcado-
res tumorales. Rev Calid Asist. 2015; 30 (6): 327-34. 42. Casco Aguilar C, Bravo Ruiz E, Izaguirre Loroño M, Esta-
llido L, de la Fuente Sánchez N, Barba Vélez Á. Neoplasia
31. Sturgeon CM, Duffy MJ, Stenman U, Lilja H, Brünner N,
oculta en pacientes con trombosis venosa profunda esen-
Chan DW et al. National Academy of Clinical Biochemistry
cial de las extremidades inferiores. Angiología. 2011; 63:
Laboratory Medicine Practice Guidelines for Use of Tumor
108-12.
Markers in Testicular, Prostate, Colorectal, Breast and
Ovarian Cancers. Clin Chem. 2008; 54: e11-e79. 43. García Gimeno M, Alonso Álvarez M, González Fueyo MJ,
Molo Benajes E, Fernández Morán MC, Ortega Martín JM
32. Sturgeon C, Duffy MJ, Hoffman, Lamerz R, Fritsche HA,
et al. Trombosis venosa y cáncer oculto. Angiología. 2001;
Gaarenstroom K et al. National Academy of Clinical Bio-
53: 301-9.
chemistry Laboratory Medicine Practice Guidelines for Use
of Tumor Markers in Liver, Bladder, Cervical, and Gastric 44. García Pelegrí S, Cussó Sorribas M, Romera Villegas A,
Cancers. Clin Chem. 2010; 56: e1-e48. Riera Mestre A, Vila Coll R. Utilidad de los marcadores tu-
morales como cribado de neoplasia oculta en enfermedad
33. Duffy MJ. Role of tumor markers in patients with solid tu-
tromboembólica. Angiología. 2013; 65 (2): 56-60.
mors: a critical review. Eur J Int Med. 2007; 18: 175-84.
45. Enguídenos MJ, Todolí JA, Saro E, Salvador G, Villar J,
34. Sociedad Valenciana de Medicina Familiar y Comunitaria.
Gómez Biedima S. Utilidad de los marcadores tumorales
Uso de los marcadores tumorales como ayuda al diagnós-
en diagnóstico de neoplasia asociada a trombosis venosa
tico de los tumores más frecuentes. [Consultado 02 Ene
profunda idiopática. An Med Interna. 2002; 19: 561-6.
2016]. Disponible en: http://www.svmfyc.org/fichas/f057/
ficha057.pdf
Preguntas farmacogenética
Grupo N°1
1. Complete: El concepto de ………………… considera que solamente una pequeña
fracción del genoma es tratable farmacológicamente, por tratarse de proteínas que
reúnen las características para unirse con alta afinidad a las moléculas de un fármaco
que modificará su actividad.
Respuesta: El concepto de Druggability considera que solamente una pequeña fracción del
genoma es tratable farmacológicamente, por tratarse de proteínas que reúnen las
características para unirse con alta afinidad a las moléculas de un fármaco que modificará su
actividad.
2. Indique si es Verdadero o Falso
El objetivo de la farmacogenética es prevenir la toxicidad y/o la ineficacia terapéutica de una
terapia farmacológica teniendo en cuenta la preferencia y afinidad que tenga el paciente por
los fármacos.
Respuesta: Falso. El objetivo de la farmacogenética es prevenir la toxicidad y/o la ineficacia
terapéutica de una terapia farmacológica teniendo en cuenta el perfil genético a quien se le
administra el fármaco.
3. Relacione los enunciados con sus correspondientes Actores principales de la
farmacogenética.
1) Enzimas que metabolizan los fármacos
2) Proteínas transportadoras de fármacos
3) Proteínas con efecto indirecto sobre la respuesta al tratamiento
4) Receptores de fármacos
a) Alteraciones en los genes que las codifican influyen en la absorción de fármacos, su
distribución, la excreción de estos y sus metabolitos.
b) Las alteraciones en los genes que codifican estas proteínas pueden influir en la sensibilidad
del medicamento a la diana farmacológica y, por tanto, condicionar la respuesta clínica.
c) Polimorfismos en los genes que codifican proteínas que no son dianas de fármacos ni están
involucradas en su farmacocinética/farmacodinámica, pero son capaces de producir una
alteración en la respuesta al tratamiento en determinadas situaciones.
d) Un paciente con mutaciones en los genes que codifican estas proteínas puede presentar
concentraciones muy elevadas del metabolito activo, disminuyendo la eficacia del tratamiento
u ocasionando efectos adversos.
Respuesta: 1d, 2a, 3c, 4b
4. Indique si es verdadero o Falso
-
La afirmación «A un 7% de la población el medicamento X puede producir mareos y dolor de
cabeza» representa un aspecto FARMACOGENÉTICO.
Respuesta: Falso. La afirmación representa un aspecto FARMACOLÓGICO.
-
genética como el punto clave que determina la eficacia y seguridad de la terapia
farmacológica en un paciente¨
Respuesta: Verdadero
-
Los factores genéticos intervienen en el 20-95 % de la variabilidad en la disponibilidad de un
fármaco y los efectos que este pueda producir.
Respuesta: Verdadero
7. Cuando existe una variación en la enzima Citocromo P-450 2D6 que sucede con
la metabolización de la codeína:
a. Disminuye su acción
b. Aumenta su acción
c. Pierde su acción
d. Mantiene su acción normal
-
9. Complete: La mayoría de las diferencias entre los individuos en su respuesta a los
fármacos son …. y …....
Respuesta: La mayoría de las diferencias entre los individuos en su respuesta a los fármacos
son multigénicas y multifactoriales.
10. Señale si el siguiente enunciado es correcto o falso.
-
Uno de los objetivos de la farmacogenómica consiste en seleccionar la dosis más adecuada
de un fármaco para un grupo determinado de pacientes con enfermedades similares.
Respuesta: Falso
11. Relacione los siguienes enunciados. Tipos de pruebas genéticas.
a. Pruebas predictivas
b. Pruebas farmacogenómicas
c. Pruebas diagnósticas
d. Pruebas reproductivas
e. Pruebas directas
f. Pruebas forenses
1. Pueden realizarse en casa para enviarlas a una compañía y recibir información acerca
de antepasados, parentesco, factores de estilo de vida y riesgo potencial de
enfermedad.
2. Ayudan a detectar el riesgo que tiene una persona para el trastorno específico que se
está analizando.
3. Se utilizan para confirmar o descartar un trastorno genético sospechoso.
4. Relacionadas a la decisión de iniciar una familia o tener más hijos.
5. Se llevan a cabo con fines legales y se pueden utilizar para identificar familiares
-
biológicos, sospechos y víctimas de crímenes o desastres.
6. Sirven para indicar como el individuo va a reaccionar a ciertos medicamentos.
Respuesta: a2, b6, c3, d4, e1, f5
12. Determine si el enunciado es verdadero o falso
Los efectos de los medicamentos presentados en un individuo están determinados por la
-
interacción de varios productos genéticos que influyen en la farmacocinética y
farmacodinámica de los fármacos.
Respuesta: Verdadero
GRUPO 2:
13. Seleccione el enunciado correcto.
A) Los polimorfismos SNP (Single nucleotide polymorphism) son los más estudiados en
lo refrentes a biomarcadores en farmacogenómica.
B) Los polimorfismos VNTR (variable number of tándem repetition) son los más
estudiados en lo refrentes a biomarcadores en farmacogenómica.
C) Los polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción son los más estudiados en
lo refrentes a biomarcadores en farmacogenómica.
-
D) Los polimorfismos SNP (Single nucleotide polymorphism) no son estudiados en lo
referente a biomarcadores en farmacogenómica.
Respuesta: A
14. Señale si el siguiente enunciado es correcto o falso.
Las herramientas comúnmente utilizadas en farmacogenómica son las clásicas de la
-
biología molecular como herramientas para el análisis de perfiles de expresión génica,
como los microarrays, la bioinformática es también un instrumento de importancia clave.
Respuesta: Verdadero
15. ¿Qué es un haplotipo?
A) Genoma característico de individuos que presentan metabolizadores ultra rápidos.
B) Numero de SNP identificados en una región cromosómica relacionada a la respuesta
relacionada a fármacos.
C) Conjunto de variaciones del ADN, o polimorfismos, que tienen a ser heredados juntos,
describe patrones comunes de variación genética entre las personas.
-
D) Estudio genético que utiliza microarrays para identificar polimorfismo VNTR de interés
para la farmacogenómica.
Respuesta: C
16. Complete el siguiente enunciado:
La genética interviene en el _____ de la variabilidad en la disponibilidad de un fármaco y
sus efectos.
A) 15-20%
B) 50-80%
-
C) 20-95%
D) 70-90%
Respuesta: C) 20-95%
17. Señale cuál opción NO corresponde a una limitación de la farmacogenómica:
A) Necesidad de identificación de nuevos biomarcadores de toxicidad de medicamentos
y su respuesta
B) Falta de directrices, garantías legales y éticas
-
C) Limitada descripción de los estándares de calidad
D) No existen pruebas de laboratorio para detectar biomarcadores genéticos.
Respuesta: D)
18. ¿A la respuesta de qué fármaco afecta el gen del receptor β-2-adrenérgico?
A) AINES
B) β-2-agonistas
-
C) IECA
D) β-2-antagonistas
Respuesta: B)
19. Los polimorfismos en los genes que codifican proteínas que no son dianas
directas de fármacos, ni se involucran en su farmacocinética o
farmacodinámica, pero son capaces de producir una alteración en la respuesta
al tratamiento, se conocen como:
A) Receptores de fármacos que condicionan la respuesta al tratamiento
B) Proteínas con efecto indirecto sobre la respuesta al tratamiento
-
C) Proteínas transportadoras de fármacos alteradas
D) Proteínas con efecto directo sobre la farmacoterapia.
Respuesta: B)
-
20. Indique verdadero o falso. De acuerdo con los estudios farmacogenéticos, en
estos se deben tomar en cuenta diferencias poblacionales y de origen étnico.
Respuesta: Verdadero
21.Que medicamento metaboliza la butilcolinesterasa
A) Omeprazol.
B) Fluconazol.
C) Succinilcolina
-
D) Acetaminofén.
Respuesta: C) succinilcolina.
22. ¿Cuál de las siguientes no es una reacción metabólica de fase II?
A) Conjugación.
B) Oxidación.
C) Sulfonación.
-
D) Acetilación.
Respuesta: B, oxidación.
23. En relación con los factores que causan la variabilidad entre la población en la
respuesta a los fármacos, ¿cuál es la subclasificación de los factores no genéticos?
A) Mutágenos, fisiológicos y patofisiológicos.
B) Estilo de vida, infecciones y fisiopatología.
C) Fisiológicos, patofisiológicos y medioambientales.
-
D) Medioambientales, nutricionales y fisiológicos.
Respuesta: C, Fisiológicos, pato fisiológicos y medioambientales.
24. La mayoría de las diferencias entre los individuos en su respuesta a los fármacos
son:
A) Debido a enfermedades renales crónicas
B) Multigénicas y multifactoriales
-
C) Relacionadas con la absorción y liberación del fármaco
D) Relacionadas con enfermedades gastrointestinales
Respuesta: B
GRUPO N°3:
25. ¿Qué es la farmacogenética?
a. Ciencia genómica que estudia los fármacos.
b. Ciencia genómica que estudia las acciones e interacciones de los metabolitos.
c. Ciencia genómica que estudia las acciones e interacciones entre los fármacos en cada
persona en función de sus genes.
-
d. Ciencia genómica que estudia cómo los xenobióticos interactúan con los fármacos en
función de los genes.
Respuesta: C
26. De las siguientes opciones, indique cual no es un actor principal de la
farmacogenética
a. Proteínas con efecto indirecto sobre la respuesta al tratamiento.
b. Receptores de fármacos.
-
c. Proteínas transportadoras de fármacos.
d. Fosfolípidos de membrana.
Respuesta: D
27. Indique qué enzima metaboliza los fármacos codeína, nortriptilina, esparteína
a. Citocromo P-450 2D6
b. Citocromo P-450 2C9
-
c. Citocromo P-450 2C19
d. Butilcolinesterasa
Respuesta: A
28. La albúmina es la proteína transportadora más abundante e interacciona con
muchos fármacos.
- R: Verdadero
29. Señale a la proteína transportadora de los fármacos básicos
a. Lipoproteínas
b. Albúmina
-
c. β-Globina
d. α-1-glicoproteína
Respuesta: D
-
30. Mencione un objetivo de la farmacogenómica
Respuesta: El principal objetivo de la farmacogenómica es definir un tratamiento
farmacológico individualizado basado en el perfil genético de cada paciente con el fin
de tener una baja toxicidad y una elevada eficacia.
31. Dentro de los factores no genéticos que condicionan la respuesta terapéutica de
los individuos mencione cuales son fisiológicos
a. Edad, sexo, peso
b. Función renal, sexo, tabaco
-
c. Contaminantes, alcohol, tabaco
d. Nutrición, dieta, suplementos dietéticos
Respuesta: A
-
32. Para qué se considere polimorfismo debe estar presente en un porcentaje <1% de
la población. Verdadero o falso
Respuesta: Falso
33. Los SNV panels: Current Clinical Practice son paneles de genes ya constituidos
-
que se sabe que corresponden a un cambio en la respuesta ante un fármaco además
que son los ensayos comunes y usados en la práctica. Verdadero o falso
Respuesta: Verdadero
34. Los ensayos predeterminados están diseñados por un grupo de expertos que han
-
modificado una metodología para un tipo de investigación específica por lo que tiene
su origen en el ámbito comercial. Verdadero o falso
Respuesta: Falso
35. El proyecto que busca relacionar variaciones en la secuencia de DNA humano con
genes asociados con la salud se llama:
a. Proyecto de los 1000 genomas
b. HapMap
-
c. Genovariacion
d. Proyecto Hugo
Respuesta: B
36. Cuál de los siguientes fármacos no es metabolizado por la enzima Citocromo P-450
− Warfarina
− Fenitoína
-
− Fluorouracilo
− Codeína
Respuesta: C
UNIVERSIDAD CENTRAL DEL ECUADOR
FACULTAD DE CIENCIAS QUÍMICAS
Bioquímica y Farmacia
Séptimo Semestre
Genética
Preguntas nutrigenómica
GRUPO N°1
1. Relacione los factores asociados con cambios epigenéticos con su respectivo
ejemplo.
A) Factores nutricionales
B) Factores metabólicos
C) Factores de estilo de vida
1) Microbiota intestinal
2) Estrés oxidativo
3) Donantes de metilo
RESPUESTA: A3, B1, C2; también puede ser relacionado como A3, B2, C1, porque los
factores metabólicos y de estilo de vida son los mismos.
2. Indique si es verdadero o Falso
Dentro de los biomarcadores que pueden ser utilizados para evaluar la ingesta alimentaria de
un individuo, un marcador que permite una detección y cuantificación robusta, rápida, simple,
exacta, reproducible, económica y que tenga una baja sensibilidad pero una elevada
especificidad clínica, se puede considerar un marcador ideal.
RESPUESTA: Falso. Un marcador ideal es aquel que permite una detección y cuantificación
robusta, rápida, simple, exacta, reproducible, económica y que tiene una elevada sensibilidad
y una elevada especificidad clínica.
GRUPO N°2
3. Seleccione cuál de las siguientes opciones NO corresponde a polimorfismos
relacionados con la ingesta y conducta alimentaria:
a) Gen FTO
b) Gen MC4R
c) Gen de leptina
d) Timidilato sintasa (TYMS)
a) No son heredables
b) Pueden ser heredables
c) Pueden presentarse solo por trastornos hereditarios
d) Pueden presentarse por factores dietéticos y ambientales.